Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Doctorat1 Modificat
Doctorat1 Modificat
Pacientii au fost impartiti in doua loturi : lotul A, a fost format din 26 de pacienti la care
trasorul a fost albastru ..., si lotul B, format din 34 de pacienti la care trasorul a fost verde...
Criterii de includere :
Criterii de excludere :
A doua directie de cercetare a fost identificarea unor asocieri dintre caracteristicile tumorale
(stadiu, grading, tip ..) si o serie de parametrii umorali (CEA, CA 19-9, fibrinogen..),
endpointurile principale fiind valoarea acestor parametrii, raportata la caracteristicile
tumorale.
A treia directie de cercetare a fost o analiza de supravietuire la toti pacientii din studiu, cu
identificarea unor factori demografico-clinici care pot influenta supravietuirea, endpointul
principal fiind OS (overall survival – supravietuirea globala).
Nivelul de semnificatie α din studiu a fost 0.05, astfel ca valorile p mai mici de 0.05 au fost
considerate semnificative statistic.
Analiza statistica descriptiva, pentru variabilele continue au fost calculate media, mediana,
deviatia standard (SD) si minimul si maximul distributiilor, iar pentru variabilele categoricale
au fost calculate frecventele absolute si relative :
Lot A Lot B Global
Variabila (N=26) (N=34) (N=60)
Varsta
Medie (SD) 67.7 (12.5) 67.4 (9.58) 67.6 (10.8)
Mediana [Min, Max] 69.0 [35.0, 83.0] 68.0 [47.0, 84.0] 68.5 [35.0, 84.0]
Sex
F 14 (53.8%) 13 (38.2%) 27 (45.0%)
M 12 (46.2%) 21 (61.8%) 33 (55.0%)
Mediu
Rural 8 (30.8%) 8 (23.5%) 16 (26.7%)
Urban 18 (69.2%) 26 (76.5%) 44 (73.3%)
Metoda
Ex vivo 10 (38.5%) 0 (0%) 10 (16.7%)
In vivo 16 (61.5%) 34 (100%) 50 (83.3%)
Fibrinogen
Medie (SD) 424 (129) 487 (158) 460 (148)
Mediana [Min, Max] 409 [158, 757] 434 [318, 1100] 423 [158, 1100]
RDW
Medie (SD) 48.1 (10.1) 46.2 (8.83) 47.0 (9.37)
Mediana [Min, Max] 45.1 [31.8, 74.4] 44.4 [31.0, 68.3] 44.6 [31.0, 74.4]
MPV
Medie (SD) 8.32 (0.933) 8.08 (0.758) 8.18 (0.839)
Mediana [Min, Max] 8.45 [7.00, 9.89] 8.05 [6.90, 10.6] 8.10 [6.90, 10.6]
PLT
Medie (SD) 303 (103) 339 (109) 324 (107)
Mediana [Min, Max] 303 [147, 507] 329 [139, 596] 315 [139, 596]
Ca
Medie (SD) 8.26 (1.11) 7.60 (1.88) 7.88 (1.61)
Mediana [Min, Max] 8.25 [5.14, 9.80] 8.49 [3.82, 9.58] 8.35 [3.82, 9.80]
CEA
Medie (SD) 16.8 (22.0) 7.69 (10.3) 11.8 (17.0)
Mediana [Min, Max] 7.20 [1.49, 84.1] 2.84 [0.760, 40.7] 5.70 [0.760, 84.1]
Lipsa 5 (19.2%) 8 (23.5%) 13 (21.7%)
CA 19-9
Medie (SD) 35.9 (44.5) 30.7 (54.6) 33.1 (49.7)
Mediana [Min, Max] 18.7 [0.800, 180] 14.6 [0.800, 264] 17.6 [0.800, 264]
Lot A Lot B Global
Variabila (N=26) (N=34) (N=60)
Lipsa 5 (19.2%) 10 (29.4%) 15 (25.0%)
Localizare
Colon Drept 14 (53.8%) 10 (29.4%) 24 (40.0%)
Colon Stang 6 (23.1%) 17 (50.0%) 23 (38.3%)
Rect 6 (23.1%) 7 (20.6%) 13 (21.7%)
Tip
Inel cu Pecete 1 (3.8%) 3 (8.8%) 4 (6.7%)
Mucinos 8 (30.8%) 4 (11.8%) 12 (20.0%)
NOS 17 (65.4%) 27 (79.4%) 44 (73.3%)
Grading
G1 3 (11.5%) 3 (8.8%) 6 (10.0%)
G2 19 (73.1%) 27 (79.4%) 46 (76.7%)
G3 4 (15.4%) 4 (11.8%) 8 (13.3%)
Invazie Limfo-Vasculara
Absenta 13 (50.0%) 18 (52.9%) 31 (51.7%)
Prezenta 13 (50.0%) 16 (47.1%) 29 (48.3%)
Invazie Perineurala
Absenta 20 (76.9%) 13 (38.2%) 33 (55.0%)
Prezenta 6 (23.1%) 21 (61.8%) 27 (45.0%)
Stadiul T
1&2 5 (19.2%) 3 (8.8%) 8 (13.3%)
3 16 (61.5%) 21 (61.8%) 37 (61.7%)
4 5 (19.2%) 10 (29.4%) 15 (25.0%)
Stadiul N
0 17 (65.4%) 17 (50.0%) 34 (56.7%)
1 5 (19.2%) 11 (32.4%) 16 (26.7%)
2 4 (15.4%) 6 (17.6%) 10 (16.7%)
Stadiu TNM
1 4 (15.4%) 1 (2.9%) 5 (8.3%)
2 13 (50.0%) 16 (47.1%) 29 (48.3%)
3 9 (34.6%) 17 (50.0%) 26 (43.3%)
Complicatii Dindo-Clavient
0 8 (30.8%) 16 (47.1%) 24 (40.0%)
1 17 (65.4%) 14 (41.2%) 31 (51.7%)
2 0 (0%) 2 (5.9%) 2 (3.3%)
3 1 (3.8%) 2 (5.9%) 3 (5.0%)
Deces
Nu 22 (84.6%) 32 (94.1%) 54 (90.0%)
Lot A Lot B Global
Variabila (N=26) (N=34) (N=60)
Da 4 (15.4%) 2 (5.9%) 6 (10.0%)
Perioada Urmarire
Medie (SD) 34.8 (11.8) 11.7 (8.54) 21.8 (15.3)
Mediana [Min, Max] 34.0 [5.00, 52.0] 11.0 [1.00, 28.0] 22.0 [1.00, 52.0]
Ganglioni Examinati
Medie (SD) 17.6 (8.00) 19.3 (10.5) 18.6 (9.47)
Mediana [Min, Max] 17.0 [2.00, 33.0] 18.0 [4.00, 45.0] 18.0 [2.00, 45.0]
Ganglioni Invadati
Medie (SD) 1.62 (3.53) 2.35 (5.56) 2.03 (4.77)
Mediana [Min, Max] 0 [0, 14.0] 0 [0, 25.0] 0 [0, 25.0]
Ganglioni Santinela
Medie (SD) 0.923 (0.845) 0.853 (1.21) 0.883 (1.06)
Mediana [Min, Max] 1.00 [0, 3.00] 0 [0, 4.00] 1.00 [0, 4.00]
Ggl. Santinela Invadati
Medie (SD) 0.346 (0.689) 0.735 (1.11) 0.567 (0.963)
Mediana [Min, Max] 0 [0, 2.00] 0 [0, 4.00] 0 [0, 4.00]
Rezultatul testului ne arata ca nu au existat diferente cu semnificatie statistica intre cele doua
loturi (p > 0.05)
Analiza pentru numarul de ganglioni evidentiati care au fost invadati :
valoare
Variabila N Lot A, N = 26 Lot B, N = 34 Diferenta (95% CI) 1,2
p
1
Tip HP 47
Inel cu Pecete —
Grading 47
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 47
Absenta —
Invazie Perineurala 47
Absenta —
Stadiul T 47
2 —
Stadiul N 47
0 —
Stadiu TNM 47
1 —
Tipul HP al neoplasmului, cu tipul NOS avand asociate valori mai mici cu 12 ale CEA, in
raport cu neoplasmul cu celule cu inel pecete, de asemenea valoarea CEA pentru tipul
mucinos este apropiata de valoarea CEA in cazul neoplasmului cu celule in inel cu pecete;
acest efect este reprezentat in graficul urmator :
Stadiul tumoral T, cu CEA pentru stadiile T4 mai mare cu 17 fata de stadiul 2, valoare CEA
pentru tumorile in stadiul 3 fiind cu 3.6 mai mare fata de cele in stadiul 2 (in stadiul 2 a fost
considerata si singura tumora din studiu aflata in stadiul 1) :
Analiza pentru valoarea CA 19-9 :
Tip HP 45
Inel cu Pecete —
Grading 45
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 45
Absenta —
Invazie Perineurala 45
Absenta —
Stadiul T 45
2 —
Stadiul N 45
0 —
Stadiu TNM 45
1 —
Au fost evidentiate 2 efecte cu semnificatie statistica si un efect care are asociata o valoare p
marginal nesemnificativa.
A fost evidentiata o asociere intre valoarea CA 19-9 si tipul HP de cancer, tumorile cu celule
in inel cu pecete avand asociate cele mai mari valori de CA 19-9, tumorile cu celule
mucinoase avand valori CA 19-9 cu 70 mai mici fata de forma cu celule cu inel cu pecete, in
vreme ce forma NOS a avut valori cu 114 mai mici fata de forma cu celule cu inel cu pecete,
efectul fiind prezentat in graficul urmator :
Un alt efect cu semnificatie statistica, a fost in cazul stadiului tumoral T, cu tumorile in T4 cu
valori ale CA 19-9 cu 75 mai mare fata de tumorile in stadiul T2, tumorile in T3 avand valori
CA 19-9 similare cu cele din stadiul T3, efectul fiind redat in graficul urmator :
Un efect pentru care nu au fost dovezi suficiente (valoare p marginal nesemnificativa, p =
0.09) a fost cel legat de stadiul tumoral N, cu tumorile in stadiul N2 cu valori CA 19-9 cu 36
mai mari fata de cele in stadiul N0 (tumorile in stadiul N1 au avut valori CA 19-9 similare cu
cele in N0), efectul fiind redat in graficul urmator :
Tip HP 60
Inel cu Pecete —
Grading 60
Predictor N Beta (95% CI) 1
valoare p
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 60
Absenta —
Invazie Perineurala 60
Absenta —
Stadiul T 60
2 ___
Stadiul N 60
0 —
Stadiul TNM 60
1 —
Tip 60
Inel cu Pecete —
Grading 60
G1 —
Invazie
60
LimfoVasculara
Absenta —
Invazie Perineurala 60
Predictor N Beta (95% CI) 1
valoare p
Absenta —
Stadiul T 60
2 —
Stadiul N 60
0 —
Stadiul TNM 60
1 —
Tip HP 60
Inel cu Pecete —
Grading 60
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 60
Absenta —
Invazie Perineurala 60
Absenta —
Stadiul T 60
2 —
Stadiul N 60
0 —
Stadiul TNM 60
1 —
Tip HP 60
Inel cu Pecete —
Grading 60
Predictor N Beta (95% CI) 1
valoare p
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 60
Absenta —
Invazie Perineurala 60
Absenta —
Stadiul T 60
2 —
Stadiul N 60
0 —
Stadiul TNM 60
1 —
Tip 60
Inel cu Pecete —
Grading 60
G1 —
Invazie Limfo-Vasculara 60
Absenta —
Invazie Perineurala 60
Predictor N Beta (95% CI) 1
valoare p
Absenta —
Stadiul T 60
2 —
Stadiul N 60
0 —
Stadiul TNM 60
1 —
1
R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R
Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL https://www.R-project.org/.
2
Therneau T (2020). _A Package for Survival Analysis in R_. R package version 3.2-3,
<URL: https://CRAN.R-project.org/package=survival>
3
Terry M. Therneau, Patricia M. Grambsch (2000). _Modeling Survival Data: Extending the
Cox Model_. Springer, New York. ISBN 0-387-98784-3.
4
Alboukadel Kassambara, Marcin Kosinski and Przemyslaw Biecek (2020). survminer:
Drawing Survival Curves using 'ggplot2'. R package version 0.4.8. https://CRAN.R-
project.org/package=survminer
5
Daniel D. Sjoberg, Michael Curry, Margie Hannum, Joseph Larmarange, Karissa Whiting
and Emily C. Zabor (2021). gtsummary: Presentation-Ready Data Summary and Analytic
Result Tables. R package version 1.4.2. https://CRAN.R-project.org/package=gtsummary
6
Benjamin Rich (2021). table1: Tables of Descriptive Statistics in HTML. R package
version 1.4.2. https://CRAN.R-project.org/package=table1
7
Sarkar, Deepayan (2008) Lattice: Multivariate Data Visualization with R. Springer, New
York. ISBN 978-0-387-75968-5
8
John Fox and Sanford Weisberg (2019). An R Companion to Applied Regression, 3rd
Edition. Thousand Oaks, CA http://tinyurl.com/carbook
9
John Fox, Sanford Weisberg (2018). Visualizing Fit and Lack of Fit in Complex Regression
Models with Predictor Effect Plots and Partial Residuals. Journal of Statistical Software,
87(9), 1-27. URL https://www.jstatsoft.org/v087/i09
10
John Fox (2003). Effect Displays in R for Generalised Linear Models. Journal of Statistical
Software, 8(15), 1-27. URL http://www.jstatsoft.org/v08/i15/.