Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Biochimie
Profesor MIRELA MARIANA SOARE
Biochimie 2013
INTRODUCERE
Biochimia este o tiin modern, cu caracter complex, care are drept material de studiu materia vie i fenomenele specifice acesteia, din punct de vedere al organizrii, compoziiei i structurii biomoleculelor componente, precum i al proceselor complexe de transformare a acestora, n corelaie cu efectele energetice asociate reaciilor metabolice. Cunoaterea substratului biochimic al materiei vii, i a mecanismelor reaciilor biochimice ofer cheia nelegerii tiinifice a fenomenelor particulare lumii vii cum ar fi: procesele fiziologice normale sau patologice, formarea speciilor, variabilitatea, ereditatea, reproductibilitatea, adaptabilitatea etc., i proiectarea posibilitilor de intervenie i de aplicare a unor alternative optime.
Biomoleculele organice
Moleculele compuilor ce alctuiesc materia vie poart denumirea de biomolecule . Aceste biomolecule condiioneaz organizarea biochimic structural i funcional specific tuturor organismelor vii.
Biochimie 2013 Ele pot fi : Anorganice : apa i srurile minerale Organice : proteinele, lipidele, glucidele, enzimele i hormoni. n toi compuii materiei vii C joac rol predominant datorit configuraie sale electronice ce i permite s realizeze combinii att cu elemente electronegative ( O, S, N, P, Cl ) ct i cu elemente electropozitive ( H ) , dar C se poate combina i cu el nsui rezultnd edifici moleculare foarte complexe . Atomii de H i O alturi de atomul de C formeaz primi constituienii elementari ai materiei vii (HO i CO ). Atomul de N este, de asemenea, un elemente esenial, pentru c alturi de C, H i O intr n compoziia substanelor proteice (compuii ce reprezint structurile moleculare cele mai importante ale materiei vii ). Atomii de C, H, O i N au o proprietate comuna aceea de a lega legaturi covalente prin distribuirea de perechii de electroni. Elementele mai puin abundente ( P, S, Ca, Mg ) iau parte ca elemente de construcie n alctuirea moleculelor ce intr n formarea organismelor vii, iar CL, Na i K sunt i ele indispensabile vieii . Elemetele rare particip n concentrai extrem de mici n procesele metabolice celulare fundamentale, n calitate de componeni ai enzimelor sau activatori a acestora. Absena lor determin perturbri grave ale metabolismului celular. Cea mai mare parte din compuii atomilor sunt ru condutori de cldur i electricitate i au o cldur specific ridicat , de aici rezult c compui celulari sunt instabili, instabilitate necesar desfurrii proceselor metabolice.
Biomoleculele anorganice A. Apa B. Srurile minerale A. Apa este cel mai important lichid pentru via !
Este important nu doar pentru c e principalul constituent din punct de vedere cantitativ al organismului viu ci i pentru faptul c ia parte la organizarea structural a sistemelor biologice i la activitatea metabolic a acestora. Are o serie de proprietii fizico- chimice proprice vieii : 1. Capacitate caloric mare face s i pstreze timp ndelungat temperatura constant, util proceselor metabolice. 2. Formeaz cu uurin legturi de hidrogen ( disociaz uor n (HO) i (HO) ) 3. Particip n calitate de component de baz la formarea structurilor intracelulare i determin activitatea acestora. 4. Un excelent solvent pentru unii componenii celulari Rolul apei n organism - particip la procese de morfogenez - prezint mare capacitate de solubilizare - produce hidratarea numeroaselor substane - asigur mediul optim de desfurare a reaciilor metabolice - reprezint un mijloc de transport al substanelor n sistemul circulator - asigur meninerea echilibrului acido-bazic, osmotic, coloid-osmotic n organism - particip la procesul de termoreglare
Biochimie 2013 - particip la transportul transmebranar. Cuantumul apei n organism - organismul adult: 60-66% - variaii n raport cu virsta: fetus de 3 luni 94% nou nscut 68-74% brbatul adult 60-65% femeia adult 52% o 0 6 luni 72,2% o 0,5 2 ani 69,5% o 2 7 ani 63,1% o 7 16 ani 58,4% o 22 58 ani 51,7% o 71 84 ani 50,8% coninutul n ap a diferitelor esuturi piele 72% schelet 28% muchi 70% esut adipos 23% ficat 71% inima 79% creier 75% plasma sanguin 90% smalul dentar 0,2% bilanul apei n organism
1300 ml Apa potabil APA 850 ml 350 ml Alimente Metabolism DIN Aer expirat Piele Fecale 400 ml 500 ml 100 ml Urina 1500 ml
pH = - lg H
Valorile pH-ului pentru diferite fluide biologice - plasma sanguin 7,35 7,45 - lichid intracelular 6,90 - saliva 6,40 7,00 - suc gastric 1,50 3,00
Biochimie 2013 - lapte matern 7,40 - urina 5,00 8,00 Sistemele tampon fiziologice - sistemele tampon primare prezente n plasma: H2CO3 / NaHCO3 este considerat cel mai important datorit dinamicii constituirii i desfacerii componentelor. Menine pH-ul sanguin constant la nivel pulmonar. NaH2PO4 / Na2HPO4 H proteina / Na proteina - sistemele tampon secundare prezente n hematii: Hb oxidat / Hb redus KH2PO4 / K2HPO4 H- Hb / K- Hb
B. Srurile minerale sunt prezente n organism att sub form de molecule ct i de ioni :
1. Cationi : Na , K , Ca2 , Mg2 2. Anioni : Cl , NH , fosfai i proteinele Srurile minerale nu constituie o surs de energie pentru organism dar ele sunt indispensabile vieii. Ele reprezint 4% din greutatea corpului. Srurile minerale sunt eliminate zilnic prin urin deci ele trebuie readuse zilnic n organism prin alimente. Rolul compuilor minerali n organism: Contribuie la procese de morfogenez (esut osos, esut cartilaginos, esut conjunctiv etc.); Activatori n diferite reacii enzimatice; Inhibitori ai unor reacii enzimatice; Meninerea strii fizico-chimice normale a coloizilor din organism i a presiunii coloid-osmotice; Formarea sistemelor tampon fiziologice; Realizarea sistemelor bioelectrice; Intr n compoziia unor efectori chimici: Co n vitamina B12, iodul n hormonii tiroidieni etc Clasificarea elementelor minerale: Macroelemente: C, O, H, N, Ca, P Oligoelemente 0,05-0,75%): K, Na, Mg, S, Cl Microelemente: Invariabile (indispensabile) : Fe, Cu, Zn, Co, Mo, Mn, Cr, F, I i variabile: Ni, Cd, V, Se, Si, B Repartiia elementelor minerale : - Intracelular coninut mai ridicat de K+, Mg2+, H2PO4-, HPO42Extracelular coninut mai ridicat de Na+, Ca2+, Cl-, HCO3CALCIUL Este un constituent major al oaselor i dinilor, joac un rol important n coagularea sngelui, contracia muscular i funcionarea muchiului cardiac. Dozele recomandate de aport alimentar sunt de 400 1200 mg/zi. Cantiti crescute de calciu sunt necesare n perioada de cretere, de graviditate i de lactaie. Doze recomandate pe grupe de vrst sunt prezentate n tabelul urmtor.
Surse alimentare de calciu sunt prezentate n tabelul urmtor Tabelul Coninutul n calciu al unor alimente Alimentul mg% produs Alimentul mg% produs comestibil comestibil Lapte praf 1300 Fasole alb, 180 boabe Brnz burduf 922 Ciocolat cu lapte 175 Brnz schweitzer 900 Smochine 186 Cacavaluri 720-750 Brnz de vaci 164 Telemea de oaie 388 Glbenu de ou 145 Frunze de 325 Ceap verde 135 ptrunjel Alune 240 Lapte de vac 125 Migdale 239 Hrean 119 FOSFORUL Alturi de calciu, intr n compoziia oaselor i dinilor. Intervine i n absorbia i transformarea anumitor nutrieni. ~ 80 % din fosforul prezent n organism se concentreaz n oase i dini sub form de: fosfat tricalcic (hidroxiapatit) fosfat de magneziu fosfat de sodiu, potasiu. Dozele de fosfor recomandate prin aport alimentar la diferite categorii de vrst sunt prezentate n tabelul III.
Biochimie 2013 Tabelul III Doze recomandate de fosfor Vrsta (ani) 0,0 0,5 Sugari 0,5 1,0 1 3 Copii 4 6 7 - 10 11 14 15 18 Brbai 19 24 25 50 51+ 11 14 15 18 Femei 19 24 25 50 51+ graviditate lactaie
mg/zi 300 500 800 800 800 1200 1200 1200 800 800 1200 1200 1200 800 800 1200 1200
Unii autori recomand la copiii mici un aport de calciu mai ridicat dect cel de fosfor (raportul Ca/P supraunitar) iar la aduli un aport de fosfor mai ridicat dect cel de calciu (raport Ca /P subunitar). Surse alimentare (tabelul IV): Tabelul IV Coninutul n fosfor al unor alimente Alimentul mg% produs Alimentul mg% produs consumabil consumabil Lapte praf 1000 Ciocolat 445 Brnz burduf 624 Arahide 400 Brnz Schweitzer 750 Nuci 360 Cacao praf 619 Creier 336 Brnz Olanda 520 Ficat 320 Glbenu de ou 500 Mazre boabe 303 Cacavaluri 480 505 Peti 204 220 Migdale 465 Pine neagr 164 Alune 460 Ptrunjel frunze 128
Biochimie 2013 MAGNEZIUL Alturi de sodiu, magneziul este cationul intracelular cel mai important. n organismul uman exist 20 30 g magneziu, din care ~ 60% este prezent n oase, 26% n muchi iar restul n esuturi moi i lichide fiziologice. Magneziul activeaz enzime care intervin n sinteza de proteine, n metabolismul glucidic i lipidic. Deprim excitabilitatea neuro-muscular. Este implicat n procesul de coagulare. Doze recomandate de aport alimentar pentru magneziu sunt prezentate n tabelul V. Tabelul V Doze recomandate de aport de magneziu Vrsta (ani) mg/zi 0,0 0,5 40 Sugari 0,5 1,0 60 1 3 880 Copii 4 6 120 7 - 10 170 11 14 270 15 18 400 brbai 19 24 350 25 50 350 51+ 350 11 14 280 15 18 300 Femei 19 24 280 25 50 280 51+ 280 graviditate 300 Lactaie 1-6 luni 355 6-12 luni 340 Surse alimentare Magneziul intr n structura clorofilei de aceea cele mai bogate surse de Mg sunt legumele verzi (salata, spanacul, ceapa verde, frunzele de mrar, ptrunjel, leutean etc). Alte surse sunt: alte legume, fructe, derivate de cereale cu grad mare de extracie (pine neagr i intermediar, mlai), leguminoase uscate, fructe de mare, ciocolat. Mai srace n Mg sunt: carnea i derivatele sale, petele. SODIUL, CLORUL I POTASIUL ndeplinesc roluri fiziologice eseniale: n meninerea echilibrului acido-bazic, osmotic, hidric, n reglarea permeabilitii membranelor, n excitabilitatea neuromuscular (stimulatoare ale tonusului muscular). Din coninutul total de elemente minerale din organismul uman: - Sodiul reprezint 2% - Clorul 3% - Potasiul 5%
Biochimie 2013 Aceste elemente sunt distribuite n toate celulele i esuturile organismului, sodiul i clorul fiind prezente mai ales n lichidele extracelulare iar potasiul n lichidele intracelulare. Sodiul favorizeaz reinerea apei n organism. Potasiul contribuie la eliminarea renal a sodiului i stimuleaz diureza. Clorul particip la fixarea i cedarea la nivelul hematiilor a oxigenului i a CO 2, fiind un element necesar la formarea de HCl din sucul gastric, n eliminarea prin rinichi a produilor de catabolism azotat, n activarea unor enzime. Principala surs de Na i Cl: sarea (NaCl), a crui consum variaz foarte mult de la o persoan la alta. Se recomand - un consum de sodiu de 2300 mg/zi pentru persoane adulte, inndu-se seama c absorbia sodiului este de 90-95%. - Pentru potasiu, un aport identic cu cel al sodiului, respectiv 2300 mg/zi. Surse alimentare Sodiul: adus n alimentaia zilnic mai ales sub form de sare. Potasiul: este larg rspndit n alimente de natur animal i vegetal: carne, pete, legume, fructe (n special banane), pine intermediar i neagr, leguminoase uscate. Cantiti mai mici conin laptele i derivatele lactate. SULFUL Este necesar pentru asigurarea unei bune funcionri a celulelor i esuturilor. Este un component fundamental al unor proteine, hormoni, vitamine etc. n organismul uman se gsete cca 150 g sulf sub form de compui anorganici (sulfai, sulfocianai) i compui organici (aminoacizi, proteine, hormoni, vitamine, lipide etc.) Necesarul de sulf este estimat la 1,3 g/zi. Surse alimentare de sulf sunt carnea, laptele, unele legume etc. FIERUL Este un element important al respiraiei celulare; este element constitutiv al globulelor roii. Organismul uman conine 3-5 g fier. Dozele recomandate sunt prezentate n tabelul 5-VI.
Tabelul 5-VI Dozele recomandate de fier Vrsta (ani) 0,0 0,5 Sugari 0,5 1,0 1 3 Copii 4 6 7 - 10 11 14 15 18 Brbai 19 24 25 50 51+ 11 14 15 18 Femei 19 24 25 50 51+ mg/zi 6 10 10 10 12 12 10 10 10 10 15 15 15 15 10 Profesor- SOARE MIRELA MARIANA
Biochimie 2013
graviditate Lactaie 1-6 luni 6-12 luni 30 15 15
Surse alimentare (tabelul VII): Tabelul VII Coninutul n fier al unor alimente Alimentul mg/100 g produs consumabil Alimente de natur animal Ficat 8-14 Rinichi 10 Carne de vit 3,5 Carne de porc 3,0 Carne de gin 1,5 Pete 0,5-2 Mezeluri 2-2,5 Stridii 56 Glbenu de ou 7 Ou integral 2-2,5 Lapte vac, iaurt 0,05-0,1 Brnzeturi 0,5-0,8 Alimente de natur vegetal Mazre, fasole, linte, soia 5,3-8,5 Pine neagr 2,5 Pine alb 1,5-1,7 Spanac 3,0 Salat verde 2,0 Nuci, alune 3,0 IODUL Intr n compoziia hormonilor tiroidieni. n organismul adult se gsete o cantitate de 20-30 mg iod din care peste 75% este concentrat n glanda tiroid; restul se gsete n glanda mamar, mucoasa gastric, snge. Dozele recomandate de iod prin aport alimentar sunt prezentate n tabelul VIII. Tabelul VIII Doze recomandate de iod Vrsta (ani) g/zi 0,0 0,5 40 sugari 0,5 1,0 50 1 3 70 copii 4 6 90 7 - 10 120 11 14 150 15 18 150
10
Biochimie 2013 brbai 19 24 25 50 51+ 11 14 15 18 19 24 25 50 51+ graviditate Lactaie 1-6 luni 6-12 luni 150 150 150 150 150 150 150 150 175 200 200
femei
Surse alimentare Iodul necesar organismului provine, n proporie de 80 90% din alimente. Cele mai bogate surse de iod sunt fructele de mare i petii cu un coninut de 300 3000 g iod/ kg. Concentraia de iod n laptele de vac, carne i ou variaz n funcie de dieta animalelor iar cea din plante (usturoi, ceap, ridichi, fasole verde) depinde de concentraia lui din sol. Creterea aportului de iod se face prin sarea de buctrie ( adaos de iodur de poatsiu sau iodat de potasiu). La noi n ar se practic adugarea de iodat de potasiu n concentraii de 15 25 mg/kg.. Aportul de iod prin apa potabil este redus. FLUORUL Fluorul apare n organism n concentraii mici fiind localizat, aproape n totalitate, la nivelul oaselor i a dinilor sub form de fluorapatit. Fluorul este un factor de protecie al dinilor fa de agenii cariogeni. Influeneaz dinamica iodului, calciului i fosforului. Excesul de fluor duce la apariia unor stri patologice: osteofluoroza i fluoroza dentar (boala ptat a dinilor). Doza toxic este apropiat de doza terapeutic de aceea se recomand pruden n suplimentarea cu fluor a apei potabile sau a altor alimente. Dozele recomandate de aport alimentar de fluor sunt prezentate n tabelul IX. Surse alimentare Sursa cea mai important de fluor este apa potabil. Concentraia optim de fluor n apa potabil este de 1mg/dm3. Alimentele conin puin fluor; o alimentaie obinuit aduce o cantitate de 0,25 -0,50 mg/zi. Alimentele asigur 1/4 - 1/3 din cantitatea total de fluor pe zi. Alimentele cele mai bogate n fluor sunt petii (n special cei de ap srat), fructele de mare, frunzele i mugurii arborelui de ceai. Tabelul IX Doze recomandate de fluor Vrsta (ani) Sugari 0,0 0,5 0,5 1,0 Copii 1 3 i adolesceni 4 6
11
ZINCUL Se gsete n organism n cantitate de 2-3 g din care 60% intr n structura masei musculare, 20% este situat la nivelul oaselor i pielii iar 20% n restul organismului (ficat, pancreas, hipofiz, hematii, leucocite etc.). Intr n compoziia unor enzime i joac rol n sinteza proteinelor. Zincul joac rol important n numeroase afeciuni dermatologice: accelereaz cicatrizare plgilor, a arsurilor, a ulcerelor varicoase; are o aciune antiimflamatoare asupra acneei; favorizeaz, n anumite cazuri regenerarea prului. n tabelul X sunt prezentate dozele recomandate de aport alimentar. Tabelul X Doze recomandate de zinc
Vrsta (ani) 0,0 0,5 sugari 0,5 1,0 1 3 copii 4 6 7 - 10 11 14 15 18 brbai 19 24 25 50 51+ 11 14 15 18 femei 19 24 25 50 51+ graviditate Lactaie 1-6 luni 6-12 luni mg/zi 5 5 10 10 10 15 15 15 15 15 12 12 12 12 12 15 19 16
Surse alimentare Principalele surse alimentare de zinc sunt fructele de mare, petele, carnea, glbenuul de ou, brnza, cerealele, drojdia de bere. CUPRUL Este prezent n organism n cantiti mici (100-150mg) concentrndu-se n ficat creier, rinichi, inim, mduva osoas, muchi. El are rol n sinteza proteinelor i a globulelor roii. Dozele recomandate de aport alimentar de cupru sunt prezentate n tabelul XI.
12
Biochimie 2013 Tabelul XI Doze recomandate de cupru Vrsta (ani) Sugari 0,0 0,5 0,5 1,0 Copii 1 3 i adolesceni 4 6 7 - 10 11+ Aduli
Surse alimentare Alimentele cele mai bogate n cupru sunt fructele de mare, crustaceele, ficatul, rinichii, alunele, ciocolata, legumele i fructele uscate, cerealele. SELENIUL Seleniul este considerat antioxidant biologic. El acioneaz n prezena vitaminei E. Necesarul de seleniu este: copii i sugari de 10-30 g/zi, aduli de 50-70 g/zi, n graviditate i lactaie de 65-75 g/zi. Seleniul se gsete n cerealele complete, carne, pete, laptele i derivatele lactate etc. CROMUL Este considerat ca un factor de toleran la glucoz. Faciliteaz captarea insulinei de ctre receptorii tisulari specifici. Intervine n metabolismul lipidic avnd rol n prevenirea aterosclerozei. Necesarul zilnic de crom este estimat la 50-200 g. Se gsete n special n carne cereale, uleiuri rafinate, drojdia de bere. Asigurarea necesarului de elemente minerale se face printr-o raie alimentar echilibrat. De aceea se impune cunoaterea cuantumului diferitelor elemente minerale din diferite alimente de natur vegetal i animal.
13
Biochimie 2013
METABOLISMUL
n organismul uman au loc numeroase reacii chimice ce dau natere la cldur, energie i la metabolismul necesar vieii. Metabolismul = motorul biochimic al organismului.
- sinteza unui compus complex dintr-unul sau mai multi compusi simpli - degradarea unui compus pana la obtinerea de compusi finali. Pentru a obtine molecule complexe se cheltuie o cantitate foarte mare de energie, aceasta fiind obtinuta din degradarea unor alte molecule complexe, cu recuperarea unei parti din energia stocata. Catabolism = reactii de degradare prin care molecule mari (in care este stocata energia) sunt transformate in molecule mici. sunt reactii oxidative cu pierdere de electroni se caracterizeaza prin eliberarea de energie in cursul reactiei exemple: glicoliza, ciclul Krebs, beta-oxidarea acizilor grasi (degradarea acizilor grasi) Anabolism = reactii de sinteza a macromoleculelor din molecule (unitati) mai mici. se caracterizeaza frecvent prin reactii de reducere (aditie de electroni) necesita consum de energie ( din ATP (acidul adenozintrifosforic), NADH, NADPH, FADH2) exemple : gluconeogeneza, sinteza acizilor grasi, sinteza de ADN sau ARN. Cai amfibolice : sunt succesiuni de reactii in care se intalnesc deopotriva cai anabolice si catabolice . Exemplu : ciclul Krebs.
METABOLISMUL BAZAL
Reprezint energia necesar unui organism ( om ) aflat n stare de veghe, n repaus fizic i psihic la cel puin 14 ore de la ultima mas i 24 ore de la ultima mas de proteine, la o temperatur de 20 21 . Metabolismul bazal = 9 cal/ cm/ zi.
METABOLISMUL APEI
Apa reprezint o component important a materiei vii. Necesarul de ap este acela pentru toate vieuitoarele chiar dac difer de la o specie la alta. n structura organismului uman apa reprezint 60% din greutatea corporal la brbai ( adult ) i 50% la femei ( adult ). La nou-nscut apa total corporal poate ajunge pn la 75 % din greutatea corporal. Necesarul de ap e exprimat prin senzaia de sete. Necesarul de ap = 1 cal = 1 ml = 2600 ml ap.
14
Biochimie 2013 - 2 principalii cationi intracelulari : K i Mg - Iar anioni intracelulari sunt fosfatul i proteinele.
Schimbul de ap
Schimbul de ap i electroliii ntre vasul de snge i sectorul interstiial se face de la concentraie mare la concentraie mic. Deplasarea apei i a electroliilor din celule n interstiiu se face prin consum de energie . Presiunea hidrostatic reprezint presiunea sngelui dat de inim i exercitat de lichid . Ea are o valoare de 35 mmHg i tinde s scoat apa din vasele de snge. Presiunea coloid-osmotic reprezint presiunea dat de prezena proteinelor n vasul de snge, cu o valoare de 25 mmHg i ia tinde s rein apa n vasul de snge.
15
Biochimie 2013
16
Biochimie 2013 Deficitul de ap Aportul sczut de ap este frecvent ntlnit in practica medical la vrstnici sau pacieni incontieni. Simptomele deficitului de ap sunt nespecifice: confuzie, sete i gur uscat. La analizele de laborator vom ntlni creterea concentraiei de sodiu plasmatic, oligurie i osmolaritate crescut a urinei. Deficitul de ap l tratam prin administrare de ap oral sau administrare i.v. de glucoz 5 % . Excesul de ap Cea mai frecvent cauz n practica medical este secreia de ADH din traume, infecii ale sistemelor respirator si nervos i datorit insuficienei glandei corticosuprarenale. Excesul de ap deci apare cand apare o afectare a excreie. Apa se acumuleaz att n compartimentul extracelular ct i n cel intracelular. Simptomele care apar sunt cauzate de edemul cerebral: tulburri de comportament , dureri de cap, confuzie, convulsii i com . Tratamentul se efectueaz n formele uoare prin restricia ingerri de ap i n cele severe prin administrare i.v. de soluii saline hipertone pt a crete concentraia de Na. Mai sunt i alte tipuri de edeme ca de exemplu: Edemul cardiac: se datoreaz creteri presiuni hidrostatice n capilarul venos determinnd retenia apei n interstiiu. Edemul hepatic: se datoreaz scderi proteinelor plasmatice (n foamete, sindrom de subnutriie, hepatit cronic) i se reine apa n organ i anume n interstiiu. CELULA caracteristici biochimice corelate cu caracteristici structurale CELULA = unitatea fundamentala a activitatii biologice la nivelul unui organism. Celula eucariota prezinta mai multe fractii subcelulare (organite) : 1. Nucleu: are membrana dubla cu pori, contine majoritatea ADN-ului organizat in cromosomi si un nucleol. 2. Mitocondrii au membrane dubla (externa si interna; cea interna este impachetata sub forma de creste) 3. Reticulul endoplasmatic: o retea de cisterne (tuburi) cu ribozomi pe suprafata 4. Ribozomi: liberi sau atasati RE, contin ARN si proteine specifice 5. Aparat Golgi 6. Lizozomi 7. Peroxizomi 8. Elemente ale citoscheletului 9. Membrana plasmatica Toate acestea se pot studia separat urmand un protocol pentru izolarea lor : extractie omogenizare centrifugare diferentiata (fractionare subcelulara)
17
Biochimie 2013 Fiecare dintre compartimentele celulare poseda de regula un marker enzimatic. Organite celulare Nucleu Mitocondrie Ribozomi Functia majora (calea metabolica) Sinteza de ADN si ARN (transcriere) Ciclul Krebs, beta oxidarea acizilor grasi (AG) Sinteza proteinelor ( translatia ARN) Marker enzimatic ADN sintetaza Glutamat-DH ARN G-6-P-aza (Glucozo-6-Phosfat-aza) Hidrolaze Gal-transferaza Catalaza LDH (Lactat DeHidrogenaza) Na, K, ATP-aza 5-nucleotidaza
Reticul endoplasmatic Sinteza lipidelor Lizozomi Aparat Golgi Peroxizomi Citoplasma Membrana plasmatica Reactii de degradare Reactii de glicozilare Degradarea AG, aminoacizilor, producerea si degradarea H2O2. Glicoliza, sinteza AG Transportul moleculelor prin membrane Adeziunea intercelulara
18
Biochimie 2013 Substantele exogene absorbite sunt folosite pentru: biosinteza de subst. cu rol plastic depunerea ca atare sau transf. in subst. de rezerva transf. in alte subst. fiziologic active transf. in alte subst. in scopul obtinerii de energie transf. in alte subst. ce urmeaza a fi eliminate sau excretate
Procese celulare endergonice Biosinteza, prin care se realizeaz lucru chimic, este cel mai important proces celular care se desfoar cu consum de energie. Contracia i motilitatea, care sunt forme ale lucrului mecanic i transportul activ, care este o reflectare a lucrului osmotic sau de concentraie, sunt celelalte trei procese celulare care necesit energie.
Oxidarea biologica
are rol important in primul rand pentru transformarile care se produc in scopul eliberarii de energie. Mecanisme speciale de oxidare = reactii consecutive, majoritatea reversibile, cu degradarea prorgresiva a substantelor oxidate si eliberarea treptata de energie, in cantitati mici, pt. functii vitale si biosinteza subst. endergonice.
19
Biochimie 2013
Respiratia celulara
1. In general oxigenul nu vine in contact cu substratul, intre cele 2 substante plasandu-se o serie de substante intermediare (hidrogenul substratului nu se combina direct cu oxigenul, ci trece la acesta prin intermediul unor transportori de hidrogen, respectiv de electroni) 2. Oxidarea se face prin dehidrogenare (DH) 3. Carbonul nu se combina direct cu oxigenul, ci numai indirect, cu oxigenul din apa, iar CO2 apare in urma unor reactii de decarboxilare
20
Biochimie 2013
O H C H 3C
O H 3C
H N C C C C N CH2 HC HC HC H2C OH OH
C C C H
e + H+
e + H+
OH O O P O-
FMN
FMNH
FMNH2
FMN (FAD), legata de centrul activ al unor enzime, poate accepta 1 e- formand un radical semichinonic, pe jumatate redus. Semichinona poate accepta al 2 lea e-, formand FMNH2 (FADH2). Putand sa accepte/doneze 1 sau 2 e-, FMN (FAD) au un important rol in medierea transporului de e- intre purtatori care transfera 2e- (de ex., NADH) si cei care accepta doar 1e- (de ex. Fe+++).
NAD(P)+/NAD(P)H Perechile conjugate NAD+/NADH au un rol principal in transferul de electroni specific catabolismului, iar NADP+/NADPH in transferul electronilor de la intermediari ai catabolismului la intermediari ai biosintezei. Concentraia total a perechilor conjugate redox se menine la un nivel practic constant, ca urmare a reaciilor la care acestea particip n cadrul catabolismului (NAD+/NADH) i n cadrul anabolismului (NADP+/NADPH). Transferul de electroni prin legarea covalenta a oxigenului Oxigenul se combin cu un reactant i este ncorporat prin legare covalent n produsul de reacie:
21
Biochimie 2013
4. Coenzima Q (ubichinona)
Este o coenzima liposolubila, care participa la transportul electronilor de la substratele organice la oxigen in lantul respirator al mitocondriei.
O CH3O CH3
CH3
CH3 CH3O O (CH2 CH C CH2)nH
H 2C
C H
CH2
coenzyme Q
isoprene
Coenzima Q (CoQ, Q, ubichinona) este foarte hidrofoba. Se dizolva in miezul hidrocarbonat al membranei mitocondriale. Contine o catena isoprenoida lunga, formata din mai multe unitati izoprenice, in celulele umane n = 10. Catena isoprenoida este mai lunga decat latimea bistratului lipidic al membranei celulare. Se poate plia formand o structura mai compacta care se gaseste in mijlocul membranei, intre 2 monostraturi lipidice.
5. Citocromii
Sunt proteine transportoare de electroni avnd ca grup prostetic hemul, n centrul cruia atomul de fier se poate afla n form oxidat (Fe +III) sau n form redus (Fe +II). S-au evidentiat 3 clase de citocromi a, b si c, care difera intre ei prin substituentii de pe nucleul porfirinic si prin pozitiile caracteristice ale benzilor lor de absorbtie in vizibil. Intre atomii de fier din hemul diferitilor citocromi se poate realiza transferul unui singur electron: FeIII + e- FeII Diferiii citocromi au valori diferite ale potenialului reductor standard, dar toi au ca grupare prostetic hemul, cu Fe acceptor sau donor de electroni, acceptnd electroni de la purttorii flavinici de joas energie, electroni pe care i transfer altui citocrom i n final i doneaz oxigenului molecular, care se transform astfel n oxigen ionic i se combin cu ionii de hidrogen formnd apa.
Citocromii absorb lumina la lungimi de unda caracteristice. Absorbanta se modifica in functie de starea oxidata sau redusa a fierului din hem. Unii citocromi fac parte dintr-un complex integrat membranar, fiecare constand in mai multe polipeptide si includzand purtatori multiplii de electroni. Unele grupe prostetice hem pot fi desemnate separat ca citocromi, chiar in cadrul aceleiasi proteine. De exemplu, hemul a si a3 care sunt parti ale complexului IV din lantul respirator sunt deseori mentionati ca cyt a si a3. Citocromul c este o proteina mica, solubila in apa, cu un singur hem. Fierul din hem poate realiza o tranzitie de 1 e- intre starea ferica si feroasa: Fe+3 + e- Fe+2 Nucleul porfirinic este plan. Fe din hem este legat de obicei de 2 liganzi axiali, (X,Y) in plus fata de cei 4 atomi de N porfirinici. Liganzii axiali pot fi atomi de S sau N ai catenelor laterale ale aminoacizilor.
22
Biochimie 2013
Liganzii axiali in cyt c sunt Met S (galben) si His N (albastru).
PDB file 5CYT
PDB file 5CYT
PDB 5CYT
Cytochrome c heme
His
Met
Lys13
Heme in cytochrome c
Heme in cytochrome c
Lys 72
X N Fe N Y N N
complex IV
cyt. c
Resturile de Lys (lizina) incarcate pozitiv (in magenta) inconjoara, la suprafata, crevasa hemului din citocromul c. Ele pot interactiona cu resturile anionice ale complexelor membranare de care se leaga citocromul c, cand se accepta sau cedeaza un electron.
Grupele prostetice Fe-S contin 2, 3 , 4 sau 8 atomi de fier, complexati prin intermediul unor atomi de S elementar sau din cisteina. 4-iron Fe-S Grupele Fe-S cu 4 atomi de Fe, au o structura tetraedrica cu atomii de Fe si S alternand in colturile unui cub. Resturile de cisteina furnizeaza S ca ligand pentru fier si tin grupele prostetice legate de proteina. 2-iron Fe-S Proteinele transportoare de electroni pot contine mai multi centrii Fe-S. Centrii Fe-S transfera doar un electron, chiar Two iron-sulfur centers from complex I daca ele contin 2 sau mai multi atomi de Fe, S Cys Fe S Cys daorita proximitatii atomilor de Fe. S Fe S S Fe Ex.: un centru cu 4-Fe poate trece in S Cys Cys Fe S urmatoarele stari redox : S
Cys S Fe Cys S S S Fe S Cys S Cys
Iron-Sulfur Centers
23
Biochimie 2013
CATABOLISMUL
Catabolismul cuprinde toate procesele degradative pe care le sufer moleculele nutritive (glucide, lipide, proteine) provenite din alimente sau din rezervele celulare. Degradarea principiilor alimentare se caracterizeaz prin convergen i se realizeaz n mai multe stadii: Stadiul I nutrienii sunt descompui n unitile constituente caracteristice; Stadiul al-II-lea unitile de baz (aminoacizi, glucoz, acizi grai) sunt degradate la un compus unitar, mai simplu, acetilCoA; Stadiile al-III-lea i al IV-lea reprezint respiraia celular i cuprinde procesele prin care acetilCoA este transformat n dioxid de carbon i ap. Prin transformrile realizate se formeaz cea mai mare parte din energia celular sub form de ATP. Pe lng amoniac, dioxid de carbon, ap, ca produi finali ai catabolismului mai rezult acid lactic, uree, acid uric, creatinin, etc.
24
Biochimie 2013
25
Biochimie 2013
Metabolismul glucidelor
Rolul glucidelor 1) energetic principala sursa de energie pentru organismele animalelor superioare 2) plastic sub forma de mucopolizaharide, glucoproteide, heterozide 3) de rezerva glicogenul Observatie: Excesul de glucide se transforma in gliceride si se depoziteaza ca atare. Catabolismul glucozei Ci de obinere a energiei i metaboliilor pentru cretere Glicoliza (calea Embden Meyerhof Parnas) degradarea oxidativa a glucozei, fara interventia oxigenului) Metabolismul piruvatului Ciclul acizilor tricarboxilici Calea pentozofosfatilor (degradarea oxidativa a glucozei in prezenta oxigenului) Importanta glucozei Glucoza pozitie centrala in metabolismul plantelor, animaleleor si al multor microorganisme. Este relativ bogata in energie potentiala un bun combustibil. Oxidarea glucozei la CO2 are loc cu o modificare a energiei libere standard de -2,840 kJ/mol. Prin stocarea glucozei sub forma de polimeri cu masa moleculara mare ca amidon sau glicogen, celulele depoziteaza cantitati mari de surse de unitati de hexoze, mentinandu-si o osmolaritate relativ joasa a citosolului. Cand nevoia de energie creste, glucoza este eliberata din polimerii sub forma carora e stocata si folosita pentru a produce ATP pe cale aeroba sau anaeroba. Glucoza = remarabil precursor pentru un mare numar de intermediari pentru reactiile de biosinteza. Caile majore de utilizare a glucozei
CICLUL KREBS Ciclul Krebs reprezint calea catabolic final n transformarea glucozei, aminoacizilor i acizilor grai rezultai prin hidroliza principiilor alimentare dup metabolizarea specific la acetil CoA (Coenzima A). Un proces in 9 etape care transforma acetatul din acetil coenzima A in CO Totodat unii intermediari ai ciclului Krebs sunt precursori importani n biosinteza unor compui cu activitate biologic, ciclul Krebs avnd i un rol anabolic.
26
Biochimie 2013
a) Citratul poate s ias din mitocondrie n citoplasm unde genereaz acetilCoA necesar biosintezei acizilor grai i steroizilor. b) -cetoglutaratul i oxaloacetatul particip la reacii de transaminare, fcnd legtura cu metabolismul proteic; c) SuccinilCoA este precursorul protoporfirinei IX din structura hemului; d) Unii intermediari ai ciclului Krebs sunt verigi importante n metabolismul aminoacizilor Principiul de funcionare a ciclului lui Krebs
Acetil CoA intra in ciclu si se combina cu oxalacetatul pentru a forma citrat. Urmatoarele 8 etape participa la conversia citratului inapoi la oxalacetat. In acest proces, acetatul este oxidat la 2 CO2. La sfarsitul ciclului se reface oxalacetatul si se obtine ATP si alti compusi macroergici. Oxalacetatul reintra in ciclu.
27
Biochimie 2013
ATP- AdenozinTriPhosfat
Este compusul care constituie rezervorul de energie al celulelor vii. Prin hidroliza celor dou grupe fosfat terminale ale ATP, se elibereaz 12 000 cal per grup, n timp ce hidroliza AMP (adenozinmonofosfat) conduce la doar 1 500 cal. Aceasta se datoreaz faptului c legturile dintre grupele fosfat adiacente din ATP i ADP (adenozindifosfat) sunt legturi de tip anhidrid care au o energie liber standard de hidroliz mult mai mare dect a legturii esterice dintre riboz i acid fosforic din AMP. Cantitatea de energie eliberat depinde de condiiile de hidroliz, pH, concentraiile reactanilor. n condiiile fiziologice, se consider c valoarea energiei eliberate este de ordinul de mrime menionat. Dei ATP conine dou legturi fosfat de energie mare, de regul, dar nu chiar ntotdeauna, n reaciile enzimatice este implicat numai gruparea fosfat terminal.
28