Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
ENZIME
Organismele vii, mono- i pluricelulare sunt caracterizate prin unele activiti ca: micare, producere de energie, lumin etc., activiti care au la baz reacii chimice. Organismele vii sunt supuse primului principiu al termodinamicii, adic legii conservrii masei i energiei. Energia pentru sinteza moleculelor complexe din elemente sau molecule mai mici este furnizat prin degradarea moleculelor complexe n intermediari i compui mai simpli. n consecin este necesar cuplarea celor dou aspecte ale metabolismului (anabolism i catabolism) printr-un transfer de energie. O reacie chimic de forma
A+B C+D
poate avea loc cnd o parte din moleculele A i B se gsesc ntr-o stare de energie ridicat, stare activat (stare de tranziie) n care exist o mai mare probabilitate ca legturilor din compuii A i B s se rup i s se formeze produii C i D. starea de tranziie este o barier nalt de energie care delimiteaz reactanii de produii de reacie. Viteza unei astfel de reacie este proporional cu moleculele aflate n stare de tranziie (activat). Exist dou posibiliti de accelerare a reaciei chimice: - creterea temperaturii ce favorizeaz agitaia molecular, creterea numrului de molecule activate i accelerarea vitezei de reacie care n cele mai multe reacii este aproximativ dubl pentru o cretere a temperaturii cu 10oC; - utilizarea catalizatorilor. Catalizatorul se combin temporar cu reactanii determinnd scderea energiei de activare. Cu ct energia de activare va fi mai mic cu att catalizatorul va fi mai eficace. De exemplu, descompunerea apei oxigenate: 2 H2O2 2 H2O + O2 Necatalitic, are loc cu un consum de energie, G = 18 Kcal/mol; n prezena catalizatorului de Pt coloidal, G = 13 Kcal/mol; iar n prezena enzimei, catalaza, numai 2 kcal/mol. O reacie chimic este endergonic (endoterm) dac variaia energiei libere este pozitive, deci necesit un aport de energie i exergonic (exoterm) cnd variaia energiei libere va fi negativ, deci va rezulta energie. n timpul unei reacii, catalizatorul sufer o serie de modificri, dar odat reacia terminat, acesta revine la starea iniial. Enzimele sunt catalizatori proteici pentru reaciile chimice care se petrec n sistemele biologice. n absena enzimelor, majoritatea reaciilor din celula vie s-ar petrece cu viteze foarte mici. Spre deosebire de catalizatorii neproteici (ioni metalici, H+, OH-) fiecare enzim catalizeaz un numr mic de reacii, de cele mai multe ori, una singur. Exist un numr foarte mare de enzime; pentru fiecare compus organic, ct i pentru muli compui anorganici, exist mcar o enzim capabil s reacioneze cu acesta i s catalizeze o anumit modificare chimic.
Biochimie-ENZIMELE 2011
Biochimie-ENZIMELE 2011
Biochimie-ENZIMELE 2011
ureaza
2 NH3 + CO2
Aceast enzim este total inactiv fa de compui foarte asemntori structural tioureea H2N-CSNH2. De asemenea, arginaza enzima care catalizeaz hidroliza L-argininei la uree i ornitin nu poate cataliza hidroliza esterul metilic al argininei sau scindarea agmatinei, amina rezultat prin decarboxilarea argininei. Specificitatea relativ. Multe enzime sunt specifice numai pentru anumite tipuri de legturi chimice indiferent de structura moleculelor respective. Din acest grup fac parte esterazele care fac posibil scindarea mono-, di- trigliceridelor i chiar ali esteri cu structur chimic mult mai complicat. De exemplu, acetilcolinesteraza, specific pentru acetilcolin, poate scinda i ali esteri ai colinei cu acizii propionic, butiric etc. Butiril-colina pare a fi substratul de elecie, fiind hidrolizat mai rapid dect ali esteri ai colinei. Enzimele proteolitice care hidrolizeaz legturile peptidice din proteine i din ali compui neproteici, fac parte tot din acest grup. Specificitatea optic. Enzimele catalizeaz transformarea numai a unui stereoizomer; specificitatea optic este de obicei absolut, cellalt antipod optic rmnnd neschimbat. Excepie fac racemazele care catalizeaz interconversiunea antipozilor optici. Enzimele care recunosc substrate cu izomeri geometrici au o specificitate geometric. Fumaraza, de exemplu, permite hidratarea acidului fumaric (izomer trans) i nu a acidului maleic (izomer cis) cu formarea acidului malic ca produs final:
Biochimie-ENZIMELE 2011
Biochimie-ENZIMELE 2011 valoare limit (vmax). Dac [S] continu s creasc, curba capt o inflexiune i pentru valori mari de S, viteza nu mai crete, curba tinde asimptotic ctre o valoare maxim (vmax). Crescnd n continuare concentraia substratului viteza reaciei rmne constant deoarece nu mai exist enzim liber. Transformarea substratului n produs (produi) de reacie are loc cu formarea, pentru scurt timp, a unui complex enzim-substrat. Ipoteza formrii complexului ES a fost emis prima dat de Michaelis. Existena acestui complex a fost demonstrat practic prin analiza spectrelor de absorbie n ultraviolet, vizibil, rezonan magnetic nuclear, fluorescen sau prin dializ. K1 K3 E + S ES E ^ P (1) K2 Cantitatea de produs P format depinde direct de concentraia complexului ES, care depinde de viteza de descompunere a compusului ES n E + S. Aplicnd legea aciunii maselor pentru reaciile de echilibru se obine relaia: Cnd toat enzima a fost fixat sub form de [E] [S] K2 = complex ES, se atinge viteza maxim a reaciei. (2) [ES] KM = [S] (3) care a primit numele de constanta Michaelis, definit drept concentraia substratului pentru care se atinge jumtate din viteza maxim. Cnd numai jumtate din enzim este trecut n form [ES] i [E] =[ES] se atinge jumtate din viteza maxim vmax.
Exist microorganisme termofile care triesc n ap la 70oC 80oC i a cror enzime sunt active la aceast temperatur. La 0oC unele enzime i nceteaz reversibil activitatea, aceast temperatur constituind temperatura de conservare pentru unele enzime.
Influena pH-ului
Variaiile de pH pot avea efecte att la nivelul enzimei, ct i la nivelul substratului. Astfel, se poate modifica gradul de ionizare a unor grupri funcionale de pe enzim a cror sarcin pozitiv sau negativ este necesar fie formrii complexului enzim-substrat, fie meninerii conformaiei tridimensionale native a protein-enzimei. De asemenea, la nivelul substratului poate fi modificat gradul de ionizare mpiedicnd sau favoriznd formarea complexului enzim-substrat. Valoarea pH-ului la care reacia enzimatic se desfoar cu vitez maxim se numete pH optim. pH-ul optim pentru cele mai multe enzime are valori cuprinse ntre 6 i 8. Excepie fac enzimele digestive, pepsina (pH=1,5-2), arginaza (pH= 9,5-10).
ES E
E + P X P
EI
Este clar c enzima angajat n complexul EI nu poate funciona ca un catalizator, numai complexul ES va permite formarea produilor de reacie. Inhibiia depinde de concentraia substratului, inhibitorului, de afinitatea enzimei pentru substrat i pentru inhibitor. La adugarea de cantiti mari de substrat inhibitorul este deplasat din centrul catalitic al enzimei, care va fi ocupat de substrat, iar viteza de reacie va reveni la valoare maxim ca i n absena inhibitorului. Inhibiia competitiv are numeroase aplicaii practice, n special n terapeutic. Exemplul clasic este cel al sulfamidelor, analogi structurali ai acidului para-aminobenzoic:
H2N
COOH
H2N
Sulfamidele intr n competiie cu acidul p-aminobenzoic i inhib producerea de acid folic necesar creterii bacteriilor. Chimioterapia anticanceroas face apel la numeroi antimetabolii, n general analogi structurali ai bazelor purinice sau pirimidinice, permind inhibiia biosintezei acizilor nucleici i blocarea diviziunii celulare. - Inhibitorii necompetitivi se fixeaz fie pe enzim (dar ntr-un loc diferit de locul activ), fie pe complexul ES pentru a forma un complex ESI, fie pe amndou. Locul activ ale enzimei i pierd capacitatea de a reaciona cu substratul datorit unui fenomen de mpiedicare steric. Gradul de inhibiie depinde de concentraia inhibitorului i de afinitatea enzimei pentru inhibitor. Exemple de inhibitori necompetitivi sunt cianurile, care se combin cu unele metale necesare activitii enzimei (Fe2+, Fe3+) cu care formeaz complexe inactive asemntoare cu fero- sau fericianurile. Unele metale grele (Hg, Pb, Cu, Ag) sunt inhibitori deoarece se combin cu gruprile SH ale enzimei formnd mercaptide Enzim-SH + Ag+ Enzim-S-Ag + H+ Agenii chelatani de tipul acidului etilendiaminotetraacetic (EDTA) leag Mg2+ sau Ca2+. Efectori alosterici Activitatea catalitic a enzimelor poate fi alterat i de compui care se fixeaz pe enzim n locuri ndeprtate de centrul activ (loc alosteric). Aceti compui pot crete activitatea catalitic i se numesc efectori pozitivi, sau pot reduce activitatea catalitic i se numesc efectori negativi. Enzimele alosterice au o structur cuaternar, oligomer, formate dintr-un numr variabil de monomeri legai prin legturi necovalente. n afara situsului catalitic unde se fixeaz substratul, aceste enzime posed unul sau mai multe situsuri alosterice, care pot fi situate pe acelai lan polipeptidic unde se afl i centrul activ dar n zone diferite.
- Activatorii alosterici se fixeaz la locul alosteric determinnd o modificare a conformaiei enzimei, numit tranziie alosteric, care antreneaz o modificare a conformaiei la nivelul situsului catalitic. Acest situs determin o conformaie mai propice pentru fixarea substratului, crescnd afinitatea enzimei pentru substrat. Legarea unui inhibitor alosteric produce o modificare conformaional care mpiedic legarea substratului la locul activ (locul activ este deformat) i enzima este inhibat.
X activator alosteric
E1
E2
E3
G inhibitor alosteric
Activare Inhibi]ie Transformarea substratului A n produsul final G are loc printr-o succesiune de reacii catalizate de diferite enzime. Acumularea de produs G n exces, n celule, determinnd inhibiia enzimei E 1 care catalizeaz transformarea substratului A n produsul B, considerat etap limitant a succesiunii de reacii enzimatice. Acest tip de inhibiie se numete inhibiie prin produs final, inhibiie feed-back sau retroinhibiie.
Reglarea covalent
Un grup mare de enzime i regleaz activitatea prin adiia sau ndeprtarea unei grupri fosfat la un rezidiu de serin, treonin, tirozin. Fosforilarea se face pe baza ATP-ului, n prezena unei familii de enzime, denumite kinaze, iar defosforilarea se face n prezena apei i a unor fosfataze. Rspunsul la fosforilare este diferit funcie de enzima fosforilat. Astfel, n urma fosforilrii, unele enzime se activeaz (glicogen fosforilaza), iar altele sunt inhibate (glicogen sintetaza). n metabolismul glicogenului, n momentul fosforilrii, sunt fosforilate simultan dou enzime:
ATP
Kinaz\
ADP
Enzim\ ser OH
Enzim\ ser O O P O _ O
_ HPO4
fosfataze
H2O
glicogen fosforilaza, care este activat i declaneaz scindarea glicogenului; glicogen sintetaza, care este inhibat i mpiedic reformarea glicogenului.
Transformarea pre-enzimelor n enzime active are loc printr-un proces de proteoliz limitat catalizat fie de enzime proteolitice, fie de H+, ca de exemplu:
pepsinogen tripsinogen H ^ sau pepsin\ tripsin\ sau enterokinaz\ tripsin\ pepsin\ tripsin\ chimotripsin\
chimotripsinogen
Transformarea pepsinogenului i tripsinogenului poate fi catalizat de nsi forma activ a enzimei, printr-un proces de autocataliz. Alte procese de transformare n forme active se ntlnesc la enzimele implicate n coagularea sngelui i fibrinoliz.
protrombin\ plasminogen
trombin\ plasmin\
Procesul de activare prin proteoliz limitat implic hidroliza unor legturi peptidice, ndeprtarea unor peptide de clivare i demascarea centrului activ al enzimei. Fenomenul se ntlnete i la unii hormoni proteici. Reglarea sintezei de enzime reprezint un aspect particular al sintezei de proteine i se afl sub controlul aparatului genetic al celulelor, realizndu-se prin procese de inducie sau represie. Inducia se refer la sinteza de novo a unei proteine ca rspuns la semnalul transmis de o molecul de inductor care, de multe ori, este chiar substratul enzimei (de exemplu lactoza induce sinteza de beta-galactozidaz). Represia reprezint reprimarea sintezei de novo a unei proteine ca rspuns la prezena din mediu a unui represor. De multe ori produii reaciei catalizate de o anumit enzim acioneaz n calitate de represori limitnd sinteza respectivei enzime.
10
11