Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Cu titlu de manuscris
C.Z.U.: 582.998.2:575.222.78:004.421
LEVIŢCHI ALEXEI
ESTIMAREA HETEROZISULUI
LA FLOAREA-SOARELUI (Helianthus annuus L.)
ÎN BAZA ALGORITMILOR INFORMAŢIONALI
03.00.15 – Genetică
Autoreferat
al tezei de doctor în biologie
Chişinău 2008
Teza a fost elaborată în Laboratorul Securitate biologică (LSB), Catedra
Biologie Vegetală a Universităţii de Stat din Moldova
Conducător ştiinţific:
Referenţi oficiali:
Secretar Ştiinţific
al Consiliului Ştiinţific
Specializat, Dr., COTENCO Eugenia
Conducător ştiinţific,
Dr. hab., prof. univ., DUCA Maria
2
INTRODUCERE
3
(SIB), care reprezintă un instrument util, cu vaste posibilităţi de rezoluţie, ce facilitează
cercetările teoretice şi practice în biologie şi cele ce ţin de ameliorarea plantelor.
A fost elaborat un procedeu de extragere şi separare electroforetică a
heliantininei dintr-o singură seminţă pentru estimarea purităţii biologice (brevet de
invenţie nr. 3324) şi gradului de hibridare. S-au evidenţiat o serie de marcheri SSR
care pot fi utili pentru estimarea gradului de hibridare, dar şi pentru genotiparea
materialului ameliorativ utilizat în selecţia la heterozis.
Aprobarea rezultatelor. Rezultatele investigaţiilor au fost prezentate la:
Conferinţa Ştiinţifică Internaţională „Interconexiuni în contextul globalizării” (2004,
Chişinău), Conferinţa Ştiinţifică Internaţională în memoria prof. V.A. Zolotarevschi
“Ecuaţii Integrale şi Modelarea Problemelor Aplicative” (2006, Chişinău), Conferinţa
„Învăţământul superior şi cercetarea – piloni ai societăţii bazate pe cunoaştere” (2006,
USM), a 55-a Expoziţie Internaţională a Inovaţiilor, Cercetărilor şi Tehnologiilor Noi
EUREKA (2006, Brussels), Seminarul ”Perspectives and Opportunities for Youth in
Informational Technologies in Moldova” (2007, Chişinău), Salonul Internaţional al
Invenţiilor, Cercetării Ştiinţifice şi Transferului Tehnologic ECOINVENT 2007, Ed.
XIII (Iaşi, România), Expoziţia de Invenţii Ştiinţifice INFOINVENT-2007.
Publicaţii. Rezultatele investigaţiilor sunt reflectate în 11 lucrări ştiinţifice
publicate şi 1 brevet de invenţie la tema de cercetare.
Structura şi volumul lucrării. Teza este expusă pe 112 pagini, inclusiv 26
tabele şi 52 figuri şi constă din 6 capitole şi 272 surse bibliografice.
Cuvinte cheie: floarea-soarelui, ameliorare, heliantinină, heterozis, SIB.
4
др., 1992; Statistica 6.0 User Manual, 2005). La prelucrarea rezultatelor experimentale
au fost utilizate o serie de programe: MS Excel XP, Statistica 6.0, Adobe Photoshop
CS2, CorelDRAW 12, ImageJ 1.37v, Densitogram Builder 1.0, Cadifra UML Editor
1.3. Sistemul SIB a fost elaborat cu aportul tehnologiei informaţionale avansate .NET
Framework (Corporaţia Microsoft). În calitate de sistem de gestiune a bazelor de date
a fost utilizat Microsoft SQL Server, iar structura şi funcţiile acestuia fiind reprezentate
prin aplicarea Cadifra UML Editor 1.3.
REZULTATE ŞI DISCUŢII
5
M Hel Pornind de la prelucrarea materialului
67 vegetal, aplicarea proprietăţilor fizico-chimice în
A purificarea extractului primar, selectarea gradului
B optimal de salifiere pentru separarea heliantininei
C şi precipitarea extractului proteic s-a reuşit
43 elaborarea procedeului eficient de extragere a
acestei dintr-o singură sămânţă care prezintă un şir
Figura 1. Subunităţile de avantaje: asigură extragerea unei cantităţi mai
identificate ale heliantininei. mari de proteină (cca 1 mg), este mai rapidă (1-2
M – marcherul, kDa; Hel – profilul zile) şi mai econoamă, comparativ cu altă metodă
heliantininei; A, B, C - subunităţi
(Анисимова, 1987).
Analiza electroforetică în gel de poliacrilamidă (GPAA) de 14% (comparativ
cu gelul de 12,5 şi 16,0%) la o intensitate de 25-26 mA timp de 4-4,5 ore permite
separarea cea mai relevantă a spectrelor polipeptidice ale heliantininei şi evidenţierea
adecvată a polimorfismului proteic.
Astfel, în condiţii native are loc disocierea incompletă a heliantininei, însă clar
sunt puse în evidenţă trei subunităţi ale acesteia, notate în literatura prin A (Mr 57,0
kDa), B (Mr 55,0 kDa) şi C (Mr 51,5 kDa) (fig. 1, fig. 2a), iar în condiţii denaturante
în gel au fost constatate 19-26 polipeptide, specifice proteinelor de rezervă ale florii-
soarelui (fig. 2b). Profiluri similare ale componentelor de bază ale heliantininei au fost
depistate la toate genotipurile estimate.
6
patern Xenia şi Valentino F1 s-au caracterizat prin polipeptida cu masa moleculară mai
mică, pe când toate celelalte genotipuri – prin polipeptida cu Mr mai mare.
La nivelul lanţului α a fost relevată o uniformitate deplină a polipeptidelor
pentru toate cele nouă genotipuri analizate, iar la nivelul polipeptidelor lanţului β –
doar genotipul patern al hibridului Valentino s-a caracterizat prin prezenţa a trei
polipeptide, în timp ce celelalte genotipuri au pus în evidenţă câte cinci polipeptide.
a b
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 2 3 4 5 6 7 8 9
93,0
67,0 A Gr. I
43,0
B Gr. II
30,0
C
Gr. III
20,1
14,4
Figura 2. Analiza electroforetică a extractelor de heliantinină a diferitelor
genotipuri de floarea-soarelui.
M – marcherul maselor moleculare, kDa; a – condiţii native; b – condiţii denaturante; 1 – Xenia ♀; 2 –
Xenia ♂; 3 – Xenia F1; 4 – Valentino ♀; 5 – Valentino ♂; 6 – Valentino F1; 7 – Drofa ♀; 8 – Drofa ♂;
9 – Drofa F1. A, B, C – subunităţile heliantininei
7
♀ ♂ F1
DROFA
T At T T T At
♀ ♂ F1
VALENTINO
T At T T T T
♀ ♂ F1
XENIA
T At T T T At
Figura 3. Spectre tipice (T) şi atipice (At) la nouă genotipuri de floarea-soarelui.
Săgeţile indică prezenţa benzilor minore.
etalon (Анисимова, 1987; Анисимова, Гаврилюк, 1989), iar spectrele atipice conţin
polipeptide cu frecvenţa mai joasă de 10% (Конарев, 1993) şi se caracterizează prin
scăderea intensităţii componentelor de bază sau chiar prin lipsa lor.
Reieşind din numărul total de polipeptide, poziţia şi frecvenţa lor, numărul
polipeptidelor de bază şi al celor minore, s-a constatat că puritatea materialului
biologic variază în limitele de 76 – 100% (tab. 1).
Tabelul 1
Evaluarea purităţii genetice în baza spectrului polipeptidic al heliantininei
8
Cel mai redus nivel al omogenităţii s-a constatat la genotipurile materne şi
cele hibride Drofa şi Xenia, care variază de la cca 76 până la 97%. Toate genotipurile
paterne au manifestat un singur tip de spectru polipeptidic al heliantininei şi s-au
caracterizat prin omogenitate de 100%.
9
Ampliconii 321 pb au fost identificaţi şi la genotipurile hibride, care au servit în
calitate de martor pozitiv şi care fiind creaţi în baza sistemului ASC-Rf, demonstrează
atât prezenţa genei orfH522, transmisă de la forma maternă, cât şi rolul funcţional al
genei Rf la nivel de expresie a acesteia (fig. 4).
0,5
0,3 321pb
A M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16
0,5
0,3
321pb
B M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
0,5
0,3 321pb
C M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
Figura 4. Electroforeza în gel de agaroză 1,5% a ampliconilor.
Xenia (A) ♀- 1-14; F1-15; ♂-16; Drofa (B) ♀- 1-11; F1-12; ♂-13; Valentino (C) ♀- 1-9; F1-10; ♂-11.
11
Tabelul 3
Variabilitatea locilor SSR depistaţi în cadrul familiei Valentino
Genotip Genotip Genotip Genotip
Primer Alela Primer Alela Primer Alela Primer Alela
♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1 ♀ ♂ F1
1 + + + 1 + + + 1 + + 4 + +
ORS203
2 + + 2 + + + ORS163 2 + + 5 + +
ORS31 3 + + 3 + + 3 + + 1 + + +
4 + + 4 + + ORS166 1 + + + 2 + +
ORS78 ORS204
5 + + 5 + + 1 + + 3 + +
1 + + 6 + + + 2 + + 4 + +
2 + + 7 + + + 3 + + 1 + +
ORS53 ORS176
3 + + 8 + + 4 + + ORS216 2 + + +
4 + + 1 + + 5 + + 3 + +
1 + 2 + + 6 + + 1 + +
ORS123 ORS240
2 + 3 + + 1 + + 2 + +
3 + 4 + + 2 + + 1 + +
ORS254
4 + 1 + 3 + + 2 + +
ORS134
5 + 2 + + 4 + + 1 + +
ORS188
6 + 1 + + 5 + + 2 + + +
ORS70 ORS258
7 + 2 + + 6 + + 3 + + +
8 + ORS135 3 + + 7 + + 4 + + +
9 + + 4 + + 8 + + 1 + +
10 + + 5 + 1 + + 2 + +
ORS261
11 + + ORS158 1 + + + ORS203 2 + + 3 +
12 + + 3 + + 4 +
Valentino hibrid
Valentino F1 Drofa patern
Drofa patern
Xenia patern
Xenia p Xenia patern
Xenia patern
Xenia Xenia
hibridF1 Drofa Drofa
hibridF1
Drofa patern
Drofa p XeniaXenia
matern
matern
Drofa Drofa
hibrid
F 1 Xenia Xenia
hibrid F1
38 40 42 44 46 48 50 52 54 56 58 0,0 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1,0
Distanţa
Distan ta estimată
estimata Distanţa
Distanta estimată
estimata
Figura 5. Dendrograma variabilităţii genotipurilor de floarea-soarelui elaborată
în baza parametrilor morfologici (a) şi spectrului polipeptidic al heliantininei (b)
Cea de-a doua este alcătuită de formele hibride Drofa şi Xenia şi de linia ♀ a
hibridului Xenia. Grupa a treia corespunde familiei Valentino, care se distinge puternic
de celelalte genotipuri.
Compararea rezultatelor clusterizării în baza parametrilor morfologici şi în baza
spectrului polipeptidic al heliantininei demonstrează că genotipurile parentale ale
hibridului Valentino în ambele cazuri se situează separat de alte familii. Hibridul dat
după parametrii săi morfologici se aseamănă cu forma ♀ a hibridului Drofa. S-a
demonstrat şi o anumită asemănare dintre Drofa F1 şi forma maternă a hibridului
Xenia – atât în baza parametrilor morfologici, cât şi în baza spectrului heliantininei,
care în ambele cazuri au fost membrii unei grupe. Separarea genotipurilor parentale a
hibridului Xenia în diferite grupe a fost relevată în ambele cazuri de clasificare.
Evaluarea performanţei hibrizilor, efectuată în baza distanţei Mahalanobis
între genotipurile parentale, a clasat genotipurile hibride în strictă concordanţă cu
valoarea productivităţii acestora (Valentino – 29 chintale/ha, Drofa – 25 chintale/ha,
Xenia – 21 chintale/ha) (Rotaru, 2007).
14
90 80 90
80 80
70
70 70
60
60 60
50
Nr. de obs .
Nr. de obs.
Nr. de obs.
50 50
40
40 40
30
30 30
20 20
20
10 10 10
0 0 0
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100
Masa seminţei, g
Masa semintei, g Masa
Masaseminţei,
semintei, g g MasaMasa
seminţei,
semintei, g
g
45
100 60
40
35 50
80
30
40
Nr. de obs.
Nr. de obs.
Nr. de obs.
60 25
20 30
40
15
20
10
20
10
5
0 0 0
0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 5 15 25 35 45 55 65 75 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 70 75
Masa miezului, g
Masa miezului, g
MasaMasamiezului,
miezului, g
g MasaMasa
miezului,
miezului, g
g
15
Coeficienţii de corelare între indicii cercetaţi, în cadrul familiilor analizate a
permis să punem în evidenţă anumite asocieri specifice în raport cu productivitatea
(fig. 7).
VALENTINO
MsxLu
♀ MsxLă F1
MsxMc
MsxMc LuxLă ♂
LuxMc
McxMm LuxMm
LuxMc McxMm
DROFA
MsxLu
♀ MsxLă F1
MsxMc
MsxMc LuxLă ♂
McxMm LuxMm
LuxMc
LuxMc McxMm
XENIA
MsxLu
♀ MsxLă F1
MsxMc
MsxMc LuxLă ♂
McxMm LuxMm
LuxMc
LuxMc McxMm
16
interdisciplinare şi implicării metodelor şi tehnologiilor din diverse ramuri ale ştiinţei
în explicarea mecanismelor şi funcţiilor vitale. Volumul în creştere al informaţiei din
domeniul biologiei necesită a fi analizat şi sistematizat, lucru care poate fi realizat prin
aplicarea Tehnologiilor Informaţionale.
Produsul program SIB elaborat permite prelucrarea datelor stocate pe un
calculator plasat la distanţă şi conectat într-o reţea locală. În sistemul SIB realizarea
interfeţei utilizatorului final şi prelucrarea datelor are loc cu aportul tehnologiei
informaţionale avansate .NET Framework (Corporaţia MICROSOFT). În calitate de
sistem de gestiune a bazelor de date este utilizat Microsoft SQL Server 2000.
Baza de date (BD) include parametrii:
• morfologici (masa seminţei, masa cojii, masa miezului, lungimea seminţei,
lăţimea seminţei, înălţimea plantei, diametrul inflorescenţei);
• biochimici (heliantinina);
• moleculari (amplificarea genei orfH522, SSR markeri).
BD a sistemului SIB este normalizată până la forma a doua, ce reprezintă de
fapt un compromis între simplicitatea reprezentării datelor şi gradul de redundanţă a
bazei de date. Această formă normalizată solicită, ca datele în toate coloanele non-
cheie să fie complet dependente de cheia primară a tabelei.
Baza de date propusă (fig. 8) reprezintă un model de Sistem informaţional
suport (SIS), care poate fi modificată şi completată la solicitarea biologilor şi
amelioratorilor în funcţie de destinaţie şi aspectele de cercetare şi poate fi utilizată
separat sau în complex cu SIB.
Baza de date
Parametrii morfologici Parametrii Parametrii
Masa seminţei biochimici moleculari
Lungimea seminţei Heliantinina Locii SSR amplificaţi
Masa miezului
Lăţimea seminţei
Masa cojii
Înălţimea plantei Ampliconii genei
Diametrul inflorescenţei orfH522
17
• indicii MPH şi BPH;
• gradul de hibridare în baza locilor SSR
şi indirect, prin determinarea:
• caracterului variaţiei parametrilor la formele parentale şi influenţei lor asupra
manifestării parametrilor respectivi la genotipurile hibride;
• coeficienţilor de corelare seminţei dintre parametrii estimaţi în condiţii de câmp
la formele parentale şi cele hibride;
• funcţiei de calitate şi distanţei Mahalanobis dintre formele parentale;
• gradului de puritate în baza parametrilor morfologici ai seminţei şi în baza
spectrului polipeptidic al heliantininei;
• distanţei genetice în baza similarităţii genetice;
• gradului de sterilitate în baza primerilor specifici pentru gena mitocondrială
orfH522.
DATE PROCESARE REZULTATE
Clasificarea
Măsurări a parametrilor Funcţii de Clusterizarea
morfologici, fiziologici,
estimare Estimarea
Prelucrarea
biochimici
statistică
indicilor
Imaginile gelurilor MPH, BPH; Puritatea
electroforetice a Distanţa biologică
parametrilor biochimici Mahalanobis;
(heliantinina) sau Procesarea Gradul de
moleculari (locii imaginilor DG; sterilitate
amplificaţi prin SSR- SG; Gradul de
PCR) FQ hibridare
18
SINTEZA REZULTATELOR
Cercetările efectuate în cadrul lucrării au permis să identificăm o serie de
indici morfo-fiziologici şi moleculari, care se asociază cu vigoarea hibridă şi gradul de
hibridare. Metodologiile elaborate au demonstrat un grad înalt de rezoluţie şi claritate,
fiind recomandate pentru utilizare la diferite etape ale programelor de selecţie. În baza
cercetărilor a fost creat un Sistem Informaţional Biologic, care serveşte drept sistem
suport de decizii în estimarea calităţilor biologice a materialului ameliorativ, inclusiv a
polimorfismului genetic, purităţii liniilor parentale, gradului de sterilitate a liniilor
materne, gradului de hibridare etc. în evaluarea vigorii hibride şi efectului de
heterozis.
CONCLUZII
19
7. Sistemul Informaţional Biologic elaborat serveşte drept sistem suport de decizii
în estimarea calităţilor biologice ale materialului ameliorativ, inclusiv a: polimorfismului
genetic, purităţii liniilor parentale, gradului de sterilitate a liniilor materne, gradului de
hibridare etc. în evaluarea creşterii vigorii hibride.
RECOMANDĂRI
Pentru stabilirea calităţii materialului semincier a liniilor de floarea-soarelui
se propune procedeul de extragere a heliantininei dintr-o singură seminţă şi de
estimare a purităţii biologice.
Metodele bazate pe aplicarea tehnicii PCR cu utilizarea primerilor specifici
pentru gena orfH522 şi a celor SSR sunt propuse pentru estimarea gradului de
sterilitate şi, respectiv, a gradului de hibridare.
Strategia de prelucrare statistică a parametrilor morfologici se recomandă
pentru estimarea directă şi indirectă a productivităţii seminţelor şi manifestării
heterozisului la floarea-soarelui.
Sistemul Informaţional Biologic elaborat este oferit amelioratorilor în calitate
de sistem suport pentru automatizarea parţială a etapelor de estimare şi control a
materialului ameliorativ, precum şi pentru estimarea şi prognozarea efectului de
heterozis la floarea-soarelui.
20
LISTA PUBLICAŢIILOR
Articole recenzate
1. Leviţchi A. Informatizarea şi globalizarea în ştiinţă. Conferinţa Internaţională Ştiinţifică
dedicată a 10 ani de la fondarea Facultăţii de Relaţii Internaţionale, Ştiinţe Politice şi
Administrative Interconexiuni în contextul globalizării, 20-21 Noiembrie, 2004, Chişinau,
p. 186-189
2. Leviţchi A. Aspectele prognozării heterozisului la floarea-soarelui. Lucrările Ştiinţifice ale
Simpozionului Ştiinţific Internaţional, Universitatea Agrară de Stat din Moldova, vol. 13,
AGRONOMIE, Chişinău, 2005, p. 131-134
3. Duca M., Glijin A., Port. A., Leviţchi A. Studiul manifestării heterozisului la floarea-
soarelui în baza unor parametri biochimici şi fiziologici. Analele Ştiinţifice ale Universităţii
de Stat din Moldova, Ştiinţe chimico-biologice, Chişinău, 2005, p. 337-341
4. Leviţchi A. Analiza corelativă a unor indici biochimici şi fiziologici la floarea-soarelui.
Analele Ştiinţifice ale Universităţii de Stat din Moldova, Ştiinţe chimico-biologice,
Chişinău, 2005, p. 350-353
5. Leviţchi A., Palade E., Nichitina C. Perspective de modelare a creşterii pentru
pronosticarea fenomenului de heterozis. Studia Universitatis, Ştiinţe ale naturii, 2007, nr. 1,
p.88-91
6. Duca M., Leviţchi A., Rotaru T. Posibilităţi de estimare a purităţii genetice la floarea-
soarelui. Studia Universitatis, Ştiinţe ale naturii, 2007, nr. 7, p. 62-67
7. Duca M., Port A., Leviţchi A., Rotaru T. Aspecte privind estimarea gradului de sterilitate a
liniilor de floarea-soarelui. Studia Universitatis, Ştiinţe ale naturii, 2007, nr. 7, p. 54-61
8. Duca M., Lapteva N., Leviţchi A. Elaborarea procedeului de extragere a heliantininei din
seminţele de floarea-soarelui. Studia Universitatis, Ştiinţe ale naturii, nr. 7, 2007 p. 50-53
BREVET DE INVENŢII
1. M.Duca, A.Leviţchi, N.Lapteva, A.Căpăţână. Metoda de determinare a purităţii genetice
a florii-soarelui. Cerere de brevet nr. A20060194 din 21.07.2006; Hotărâre de acordare nr.
5087 din 2007.03.26
21
ABSTRACT
22
АННОТАЦИЯ
23