Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
POLITEHNICA
TIMIŞOARA
MASTER SIIS
Sisteme Informatice în Îngrijirea
Sănătății
1
www.medinfo.umft.ro/dim/
bioinformatica.htm
2
BIOINFORMATICA
Prof Dr George I Mihalaş
UMF Victor Babeş
3
CURSUL 4
BIOLOGIE CELULARĂ
ȘI MOLECULARĂ
4
Planul cursului
• Compoziția materiei vii
• Structura celulei
– Componente
– Membrana celulară: structură, transport pasiv și activ
– Citoplasma
– Nucleul celular
– Organite celulare: mitocondria, ribozomii
• Diviziunea celulară
– Mitoza
– Meioza
– Replicarea ADN
• Sinteza proteinelor
– Transcripția
– Codul genetic, ARN de transport
– Translația
• Controlul sintezei proteinelor
• Semnalizare (inter)celulară
5
Structura celulei
6
Structura celulei umane
7
Structura celulei • Membrana celulară
– Structura mozaic
umane (Singer-Nicholson, 1972)
– Strat dublu fosfolopidic
• Memebrana – Proteine
• Citoplasma • Intrinseci
– Traversează membrana
• Nucleu » Canale
• Organite » Pompe
celulare – Parţial inglobate
» receptori
• Extrinseci
8
Membrana celulară (3-10 nm)
9
Membrana celulară
-Structura fosfolipidelor
-Proprietatile fizice ale
citoplasmei
10
Membrana
celulară
11
Membrana celulară - rol
• Menţinere compoziţie celulară
• Transport prin membrană
– Pasiv – conform gradientului electrochimic
• Difuziune liberă (gaze, subst. solubile în lipide)
• Difuziune facilitată – cu transportor (ex. glucoza)
• Canale – voltaj dependente / ligand dependente
– Canalul de Na, canalul de K
– Activ – contra gradient (consum energetic)
• Primar – Pompe ionice
• Secundar – ioni+molecule (simport, antiport)
– Endocitoză - exocitoză
• Sediul potențialului de membrană
• Semnalizare - transfer informaţii
– Receptori
• Apoptoză
12
Transportul pasiv prin canale ionice
• Canalele de Na+ și K+
– 30-500 / μm2
– diam. ~ 3-5 Å
13
Structura canalelor ionice
• Canalul de potasiu • Canalul de sodiu
14
Potențialul de membrană
15
Transport pasiv și activ
16
Structura celulei umane
• Memebrana • Nucleu
• Citoplasma – Membrană nucleară (în cont. RE)
• Nucleu – Nucleol
• Organite – Acizi nucleici
celulare • ADN – cromatină (cromozomi)
• ARN – pe membrana nucleară
– Proteine nucleare
• Enzime
• Proteine de control
17
Nucleu
• Ø ~ 6 μm
• Stochează informaţia
• Rol:
– în diviziunea celulară
– în sinteza proteinelor
18
Transportul prin membrana nucleară
• Pori – molecule mici
• ARN, proteine – transport activ (“cargo” GTP-aza)
19
Structura celulei umane
• Memebrana • Organite celulare
• Citoplasma – Reticulul endoplasmatic
• Nucleu – Ribozomi – sinteza proteinelor
• Organite – Mitocondrii – producere ATP
celulare – Aparat Golgi
– Lizozomi
– Centrioli
– Microtubuli, microfilamente
– Vacuole, vezicule
20
Mitocondria
21
Mitocondria
• Pompa de protoni (teoria chemiosmotica)
22
Structura celulei umane
• Memebrana • Organite celulare
• Citoplasma – Reticulul endoplasmic
• Nucleu – Ribozomi – sinteza proteinelor
– Mitocondrii – producere ATP
• Organite
– Aparat Golgi
celulare
– Lizozomi
– Centrioli
– Microtubuli,
microfilamente
– Vacuole, vezicule
25
Diviziunea celulară
• Mitoza
– Celule somatice
– Diploide (2 x 23 cromozomi)
• Meioza
– Celulele sexuale
– Haploide (23 comozomi)
26
Diviziunea celulară
• Mitoza
• Meioza
27
Replicarea ADN
28
Replicarea ADN
29
30
31
Sinteza proteinelor
32
Mecanismul sintezei
proteinelor
• Dogma centrală
• Transcripţia
• Translaţia
• Codul genetic
• Paşii mecanismului de sinteză
33
34
Sinteza proteinelor
35
Transcripţia
36
Transcripţia – ARN polimeraza
37
Codul genetic (codoni)
20 AA 3 baze = codon
38
Mecanismul sintezei proteinelor
39
Schema
40
Tipuri
de ARN
41
Structura ribozomilor şi a ARN-t
42
Activarea aminoacizilor
43
Translaţia
44
Sinteza proteinelor - paşi
• STEP 1: The first step in protein synthesis is the transcription of mRNA from a DNA
gene in the nucleus. At some other prior time, the various other types of RNA have
been synthesized using the appropriate DNA. The RNAs migrate from the nucleus
into the cytoplasm.
• Prior to the beginning of the protein synthesis, all of the component parts are
assembled in the ribosome which is the brown/tan structure in the left graphic.
45
• STEP 2: Initiation:
• In the cytoplasm, protein synthesis is actually initiated by the AUG codon on mRNA.
The AUG codon signals both the interaction of the ribosome with m-RNA and also
the tRNA with the anticodons (UAC). The tRNA which initiates the protein synthesis
has N-formyl-methionine attached. The formyl group is really formic acid converted
to an amide using the -NH2 group on methionine (left most graphic)
• The next step is for a second tRNA to approach the mRNA (codon - CCG). This is
the code for proline. The anticodon of the proline tRNA which reads this is GGC.
The final process is to start growing peptide chain by having amine of proline to bond
to the carboxyl acid group of methinone (met) in order to elongate the peptide.
46
• STEP 3: Elongation:
• Elongation of the peptide begins as various tRNA's read the next codon. In the
example on the left the next tRNA to read the mRNA is tyrosine. When the correct
match with the anticodons of a tRNA has been found, the tyrosine forms a peptide
bond with the growing peptide chain .
• The proline is now hydrolyzed from the tRNA. The proline tRNA now moves away
from the ribosome and back into the cytoplasm to reattach another proline amino
acid.
47
• Step 4: Elongation and Termination:
• When the stop signal on mRNA is reached, the protein synthesis is terminated. The
last amino acid is hydrolyzed from its t-RNA.
• The peptide chain leaves the ribosome. The N-formyl-methionine that was used to
initiate the protein synthesis is also hydrolyzed from the completed peptide at this
time.
• The ribosome is now ready to repeat the synthesis several more times.
48
49
Schema – evenimente in Sinteza Proteinelor
50
Controlul sintezei proteinelor
Teoria Jacob-Monod (operon), Nobel 1965
• Gene de control
– g. operatoare
– g. regulatoare
• Feedback negativ
– lactoza = inductor
• Mecanism de reglare
• Model valabil la procariote
51
Controlul sintezei proteinelor
Modele cu feedback pozitiv
• Introni şi exoni
– (exonii exprimă prot)
• Starea normală
– Genă “silent”
• Iniţierea sintezei
– Exon’ shuffling
52
Semnalizare celulară
• G proteins are important signal
• Alfred Gilman & Martin Rodbell – pr. transducing molecules in cells
Nobel 1994 – proteina G
• The human genome encodes
roughly 950 G protein-coupled
receptors
• Approximately 150 of the GPCRs
found in the human genome have
unknown functions
53
PAUZA
54