Re elele neuronale artificiale pentru procesare datelor de

spectroscopie fluorescenta n diagnosticarea cancerului de

piele
L Lenhardt, I Zekovic, T Dramicanin and M D Dramicanin
Institute for Nuclear Sciences Vinca, University of Belgrade, PO Box 522, !! Belgrade, Ser"ia
#$%ail& dra%ican'vinca(rs
)eceived 25 *ugust 2!2
*cce+ted for +u"lication , -anuary 2!.
Pu"lis/ed 5 Nove%"er 2!.
Online at stac0s(io+(org1P/ysScr12531!,!53
*"stract
4e$a lungul anilor diverse te/nici s+ectrosco+ice o+tice au fost utili5ate +e scar6 larg6 ca
instru%ente de diagnosticarea 7ndiscri%inarea %ultor ti+uri de "oli %aligne ( )ecent , s+ectrosco+ie
fluorescent6 sincrona 8 S9S : cu+lat6 cu c/e%o%etrici a fost a+licat 7n diagnosticarea cancerului(
;etoda S9S i%+lic6 scanarea si%ultana a e%isilor si a excitatiei lungi%ilor de und6
undeintervalul lungi%ilor de und6 a fost %entinut constant8 %odul constant $ lungi%e de und6 : sau
frecven a 8%od constant de energie:, 7ntre ele( *ceast6 %etod6 este ra+id6 , relativ
ieftin6 , sensi"il6 si non$ inva5iv6 ( 2oate %ostrele de S9S de +iele nor%ale, nevus i %elano% au fost
folosite ca in+ut +entru for%area de re ele neuronale artificiale( 4ou6 ti+uri diferite de re ele neuronale
artificiale au fost instruite , cea cu /arta auto$ organi5area i cea cu re ele neuronale feed$
for<ard8control$inainte: (
)e5ultatele /isto+atologice ale %ostrelor de +iele investigate au fost utili5ate ca standard de aur
+entru re eaua de ie ire ( Pe "a5a clasific6rii o" inute
rata de succes a re elelor neuronale , a% a=uns la conclu5ia c6 cele dou6 re ele furni5au o sensi"ilitate
ridicat6 cu erori de clasificare 7ntre 2 i , > (
1 Introducere
?ancerul de +iele este una dintre cele %ai co%une afectiuni %aligne la nivel %ondial ( 4etectare
t@r5ie ofer6 rate ridicate de %ortalitate , dar daca este diagnosticat 7n stadii inci+iente , este una dintre cele
%ai trata"ile for%e de cancer( Au@nd aceast6 +ro"le%6 7n considerare , 7n curs de de5voltare de noi
%etode +entru diagnosticarea cancerului este de o i%+ortan 6 crucial6 ( Bn ulti%ele decenii , 7n do%eniul
diagnosticului de cancer , s+ectrosco+ie de fluorescenta sa dovedit a fi un do%eniu foarte +ro%itatoare
2e/nica 8 *lfano i cola" CD3, Steren"org et al CC, , Pal%eret al 2!!.: ( esuturi u%ane sunt un
a%estec co%+lex de diferite %olecule i unele dintre aceste %olecule , nu%ite endogen fluorofori ,care
au ca+acitatea de a a"sor"i i e%ite lu%in6 de diferite lungi%i de und6 ( ?oncentra ia i distri"u ia
diverse fluorofori ale +ielii , cu% ar fi nicotina%id adenin dinucleotid6 8 N*4E : , adenin6 dinucleotid6
flavine 8 9*4 : , 0eratina , colagen , elastina , a%inoaci5i , li+ide i
+orfirine sunt funda%entale +entru discri%inare 7ntre cancer i tesut
nor%al de s+ectrosco+ie de fluorescenta (
Bn ulti%ii ani, s$a de%onstrat c6 s+ectrosco+ie de fluorescen 6
sincron6 8 S9S : +oate fi folosit cu succes 7n detectarea cancerului 8 Vo
F 4in/ 2!!!, Vengadesan i al ii, 2!!2 , 4ra%iGcanin et al 2!!5 ,2!!H ,
2!: ( *ceast6 %etod6 i%+lic6 scanarea si%ultan6 de lungi%i de und6
at@t de e%isie i excita ie +6str@nd 7n acela i ti%+ intervalul de lungi%i
de und6 8%od constant $ lungi%e de und6 : sau frecven e 8%od constant
de energie :, 7ntre ele constant (*vanta=ul unui s+ectru sincron +este
s+ectre de e%isie nor%ale este fa+tul c6 are de %ulte ori %ai %ulte
caracteristici i ofer6 %ai %ulte infor%a ii ( 4atele o" inute sunt de o"icei foarte corelate cu diferente
su"tile intre anor%al i esuturile nor%ale , i 7n acest sco+ re ele neuronale artificiale 8 *NN :, +ot fi
foarte utile +entru a construi un %odel diagnostic( *NN este un siste% ada+tiv care %odific6 structura +e
"a5a constat6rilor de intrare +entru a genera ie ire ro"ust6 ( "eneficiul de aceast6 %etod6 este
consecven a i o"iectivitatea sa din cau5a li+sa de o"oseal6 u%ane i +6rtinire (
Bn aceast6 lucrare , dou6 ti+uri diferite ti+uri de *NN au fost instrui i , /arta auto $ organi5are
8 SO; : i a re elei neuronale feed$for<ard ( SO; este unul dintre cele %ai %ulte re ele neuronale
+o+ulare care transfor%6 relatii statistice neliniare de grad inalt 7n rela iile si%+le geo%etrice 7ntr$un %od
nesu+raveg/eat 8 Io/onen 2!!: (
S+re deose"ire de SO;, retele neuronale feed$for<ard este instruit 7n un %od su+raveg/eat cu o
cunoa tere +reala"il6 a gru+ului unui e antion de %e%"ru +rin introducerea datelor de la intr6rile care
trece +rin straturi de neuroni +@n6 c@nd acesta a=unge la ie irile f6r6 nici infor%a ii de feed"ac0 7ntre
straturi 8-iang et al 2!!.:(
*NN sunt adesea instrui i +entru a fi utili5at 7n continuare ca de clasificare %odele 8)/ee et al
2!!5, 4ra%iGcanin et al 2!!C:(Sco+ul al acestei lucr6ri a fost de a investiga +osi"ilitatea de a construi o
cancer de +iele %etod6 de diagnostic +rin for%are *NN utili5area total6 S+ectrele de fluorescen 6 de
diferite ti+uri de le5iuni ale +ielii(
! Materiale i metode
S+ectrele de fluorescen 6 sincron6 de 5! de +ro"e de +iele 8 2 %elano% , D nev i 2! de +ro"e or%ale
de +iele : au fost %6surat6 ex vivo utili5@nd un s+ectrofoto%etru de fluorescen 6 8 Per0in #l%er AS,5 : 7n
%od constant $ lungi%e de und6 (S+ectrele au fost colectate la o vite56 de scanare de 2!! n% %in $ 7n
Ja%a de excita ie ..!$55! n% i lungi%ea de und6 co%+ensa ga%6 K .!$2! n% i auto%at
nor%ali5at la excita ie de instru%ent( Pro"ele au fost o"tinute de la +acienti u%ani la scurt ti%+ du+a
re5ectia c/irurgicala ,/isto+atologic identificat i a+oi %6surat +rin instru%ent la te%+eratura ca%erei (
Pentru a reduce di%ensionalitate s+ectrelor o" inute , co%+onent +rinci+al *nali5a 8 *P?: a fost a+licat (
Pentru for%are , P?* calculat6 ?o%+onentele au fost introduse 7n SO; i feed$ for<ard re ele
neuronale( Pentru a evalua eroare de clasificare , acestea au fost testate cu noi +ro"e necunoscute la
a%"ele *NN (
" Re#ultate i discutii
9igura +re5int6 s+ectre de fluorescenta total6 sincron 7n su" for%6 de diagra%e de contur ale diferitelor
%ostre de +iele &+iele nor%ala , nev i %elano% ( %odele de e%isie reflecte s+ecificitatea de fluorofori
endogene i lor %icro%edii 7n +iele (
Se +oate o"serva cu claritate
c6+rinci+alele diferen ele
defluorescen 6 le5iunilor cutanate
sunt o"serva"ile 7n %ai %ulte regiuni
s+ectrale ( Pri%a regiune se 7ntinde
de excita ie lungi%e de und6 ..!$
,!! n% iintervalul sincron .!$55
n% ( Proteine structurale ale
extracelular %atrice , colagen i
elastin6 au excita ie %axi%6 7n acest
regiune 8 )a%anu=a% 2!!!: ( * doua
i a treia s+ectrale regiuni
aco+er6intervalul de lungi%i de und6
de excita ie de la ,.! la
,D! n% , 7ntre .5! i ,!! n%, iar
intervalul de la sincron .! +@n6 la 5!
n% , H5$C! n% , res+ectiv( fluorescen 6 de aceste regiuni +rovine de la %ai %ulte fluorofori , cu% ar
fi co$ en5i%e N*4E i 9*4 (
O %etod6 de cancer de +iele de diagnostic "a5ate +e %6sur6tori de S9S i un %odel de
clasificare construit folosind dou6 ti+uri diferite *NN a fost de5voltat in %ai %ulte eta+e ( Bn
+ri%ul r@nd reducerea di%ensionalitate a fost necesar6 din cau5a di%ensiunii %ari a adunat
S9S (
Bn acest sco+, *P? a fost a+licat +e date S9S i un %odel de *P? de cinci co%+onent6 a
fost ac/i5i ionat ( P?* este o %etod6 statistic6 nesu+raveg/eat folosit +entru a distinge i
identifica %odele 7n date i le ex+ri%a 7ntr$o %anier6 ca +entru a su"linia ase%6n6rile i
deose"irile lor ( *ceast6
%etod6 transfor%6 un nu%6r
de varia"ile , eventual,
corelate 7n
un nu%6r %ai %ic de
varia"ile necorelate nu%ite
+rinci+al co%+onente , care
re+re5int6 cea %ai %are din
varian a varia"ile o"servate (
*cest lucru ne$a +er%is de a
ex+lora datele noastre i
+entru a deter%ina +entru
care lungi%ea de und6 a
co%+ensa valoarea 8 K : cel
%ai "un
se+arare 7ntre gru+uri a fost atins (
4u+6 exa%inarea re5ultate din *P? , sa a=uns la conclu5ia c6 cea %ai "un6 diferen iere
7ntre clase este de K L 3! n% , figura 2 ( Bn figura . o se +oate vedea o distinc ie evident6 7ntre
clase ( de a lua acest 7n
considerare , scoruri *P? 25 de
+ro"e M +entru K L 3! n% au
fost utili5ate +entru a instrui i
SO; re ele neuronale feed$
for<ard (
Bn sco+ul de a %6ri nu%6rul de
e antioane +entru for%are
*NN , a% creat un set distri"uit
7n %od nor%al de date "a5ate
+e valoare i devia ia standard
de 25 de +ro"e utili5ate +entru
7nse%na for%are ( ?u un nou
set de date de 2!!! de +ro"e
ne$a% antrenat at@t *NN (
SO; 7nva 6 s6 date de gru+ "a5ate +e si%ilaritate i to+ologie , i ca ur%are se atri"uie acelea i
indicii +entru fiecare clas6 ( *cesta este utili5at +entru reducerea di%ensionalit6 ii i clustering
date ( *% introdus o N 5 %atrice 2!!! 8 2!!! de +ro"e i 5 Para%etrii care descriu fiecare +ro"6 : +entru
a so% cu . neuroni 8 di%ensiune N . : , figura , , i a 7nce+ut de for%are cu 5! de itera ii ( Prin toate
acestea , SO; nu au avut nici infor%a ii des+re a+artenen a la un gru+ e antion 8de 7nv6 are
nesu+raveg/eat : ( c@nd instruit , SO; a fost testat cu 25 de noi +ro"e necunoscute de re ea i de eroare
de clasificare a fost ac/i5i ionat6 ( acest +roces de for%are SO; i testare a fost re+etat de %ai %ulte
ori , de fiecare dat6 , folosind o co%"ina ie diferit6 de date +entru instruire i testare ( 96c@nd acest lucru
a% o" inut o %ai +recis6 Privire de ansa%"lu asu+ra eficien ei acestei %etode ( )e ele de ali%entare
7nainte , figura 5 , con in serie de straturi (Pri%ul strat o" ine datele de intrare de re ea , i fiecare
ulterioar6 strat este conectat lastratul anterior 7n ti%+ ce stratul final6 da re ea de ie ire ( #le sunt de
o"icei utili5ate +entru intrare la ie ire cartografiere ( *% folosit re eaua de feed$for<ard cu un ascuns
strat +entru a construi un %odel de clasificare , d@ndu$i dre+t de intrare 2!!! N 5 %atrice , aceea i %atrice
utili5at +entru for%area SO; , i %atricea cu infor%a ii de clas6 %e%"ru a tuturor 2!!!
+ro"e 8 su+raveg/eat de 7nv6 are : ( Procesul de testare a fost aceea i ca i +entru SO; , %ai %ulte
%odele au fost construite i testate cu a=utorul diferite co%"ina ii de date iclasificarea %edie
eroare +entru toate %odelele a fost calculat ( Pe "a5a erorilor de clasificare o" inute de neuronale
re elelor , a% constatat c6 a%"ele re ele oferi de 7nalt6sensi"ilitate cu erori de clasificare 7ntre 2 i , > (
+entru diferite date de intrare de eroare de clasificare SO; a fost 7ntre 2 i . > , 7n ti%+ ce +entru
re eaua de feed$for<ard a fost 7ntre . i , > (
$ %onclu#ie
Bn aceast6 lucrare , a% folosit anali5e statistice i *NN +entru a clasifica date de s+ectre de
fluorescen 6 sincron cu sco+ul de a de5voltarea unei %etode de diagnostic +entru diagnosticarea
cancerului de +iele (S+ectrele de fluorescen 6 a trei ti+uri diferite de le5iuni ale +ielii , %elano% ,
nev i +ielea nor%ala , diferen ele relevat 7ntre ele datorit6 diferen elor de concentra ie de
diferite
fluorofori i %icro%edii lor ( *+licarea *P? a furni5at date cu varia ii %6rite 7ntre e antion
gru+uri ( Se arat6 c6 at@t SO; i neuronale feed$for<ard re elelor a dat re5ultate +ro%itatoare ,
cu un esut succes CH$CD > )ata de clasificare ( ;ai %ult dec@t at@t ,%etoda +re5entat6 este
ra+id, sensi"il , ieftin i non$ distructive ( Pe "a5a acestor desco+eriri , +ute% conclu5iona c6
S9S co%"inat cu clasificare neurala +e "a56 de re ea are un "un +otential in diagnosticarea
%elano%elor (
confir%are
*ceasta lucrare a fost sustinuta de ;inisterul s@r" al tiin ei
i de5voltare te/nologic6 8 nu%6r de +roiect i 3.!,C
,5!2! : (
References
*lfano ) ), 2ang J ?, Prad/an *, Aa% O, ?/oy 4 S - and O+/er #
CD3 9luorescence s+ectra fro% cancerous and nor%al /u%an
"reast and lung tissues IEEE J. Quantum Electron. !" D!HF
4ra%iPcanin 2, 4i%itri=eviPc B and 4ra%iPcanin ; 4 2!
*++lication of su+ervised self$organising %a+s in "reast
cancer diagnosis "y total sync/ronous lu%inescence
s+ectrosco+y Appl. Spectrosc. &' 2C.F3
4ra%iPcanin 2, 4ra%iPcanin ; 4, 4i%itri=eviPc B, -o0anoviPc V and
Au0iPc S 2!!H 4iscri%ination "et<een nor%al and %alignant
"reast tissues "y sync/ronous lu%inescence s+ectrosco+y Acta
Chim. Slov. '" ,,,FC
4ra%iPcanin 2, 4ra%iPcanin ; 4, -o0anoviPc V,
Ni0oliPc$Vu0osavl=eviPc 4 and 4i%itri=eviPc B 2!!5
2/ree$di%ensional total sync/ronous lu%inescence
s+ectrosco+y criteria for discri%ination "et<een nor%al and
%alignant "reast tissues Photochem. Photobiol. (1 55,FD
4ra%iPcanin 2, Qe0oviPc I, 4i%itri=eviPc B, )i"ar S and
4ra%iPcanin ; 4 2!!C O+tical "io+sy %et/od for "reast
cancer diagnosis "ased on artificial neural net<or0
classification of fluorescence landsca+e data Acta Phys. Pol. *
11& HC!F2
-iang R and Oa/ * E I S 2!!. ?onstructing and training
feed$for<ard neural net<or0s for +attern classification Pattern
Recognit. "& D5.FH3
Io/onen 2 2!! Self-rgani!ing "aps .rd edn 8Berlin& S+ringer:
Pal%er J ;, Ieely P -, Breslin 2 ; and )a%anu=a% N 2!!.
*utofluorescence s+ectrosco+y of nor%al and %alignant
/u%an "reast cell lines Photochem. Photobiol.
)( ,H2FC
)a%anu=a% N 2!!! Encyclope#ia of Analytical Chemistry
8?/ic/ester, NS& Oiley: ++ 2!F5H
)/ee - I, Aee I I, Ii% ? I, Si% S S, ?/ung S O, Oei - and
Bellgardt I E 2!!5 ?lassification of t<o$di%ensional
fluorescence s+ectra using self$organi5ing %a+s
$iochem. Eng. J. !! .5F,,
Steren"org E - ? ;, ;ota%edi ;, Oagner ) 9, 4uvic ;,
2/o%sen S and -acTues S A CC, In vivo fluorescence
s+ectrosco+y and i%aging of /u%an s0in tu%ours %aser "e#.
Sci. * CF2!
Vengadesan N, *n"u+ala% 2, Ee%a%alini S, #"ene5ar -,
;ut/velu I, Iotees<aran 4, *runa P ) and Janesan S ?
2!!2 ?/aracteri5ation of cervical nor%al and a"nor%al tissues
"y sync/ronous lu%inescence s+ectrosco+y Proc. SPIE
$&1" .F3
Vo$4in/ 2 2!!! Princi+le of sync/ronous lu%inescence 8SA:
tec/niTue for "io%edical diagnostics Proc. SPIE "*11 ,2FC
,