• Strategii de cautare a informatiei • Evaluarea validitatii articolelor stiintifice Redactarea unei lucrari stiintifice medicale Lucrare științifică = studiu scris asupra unui anumit subiect sau pentru a defini o operă artistică sau ştiinţifică (DEX). Principalele tipuri de lucrări ştiinţifice din domeniul medical sunt: articolul original, articolul didactic, studiul de specialitate, cartea/monografia, teza de doctorat, teza de disertaţie, lucrarea de licenţă. Structura unei lucrări: 1. Titlul lucrării 2. Introducerea/background 3. Scopul lucrării 4. Material și metodă 5. Rezultate 6. Discuții 7. Concluzii 8. Acknowledgments – aprecieri 9. Anexa – appendices 10. Referințele bibliografice Redactarea unei lucrari stiintifice medicale 1. Titlul lucrării - scurt și fără ambiguități, să conțină cuvintele cheie care să descrie clar conținutul lucrării. 2. Introducerea/background stabileste contextul în care a apărut studiul discuta elementele relevante găsite în literatura de cercetare (cu citații) prezinta un sumar al cunoștintelor și înțelegerii curente (de la debutul studiului) în ceea ce privește problema investigată include justificările pt alegerea tipului de experiment și meritele științifice ale modelui particular prezentat 3. Material și metodă constă în explicarea clară a modului în care s-a desfășurat studiul, protocolul de colectare a datelor si modul de analiză a datelor Redactarea unei lucrari stiintifice medicale 4. Rezultate - cuprinde o prezentare obiectivă a rezultatelor cheie ale studiului, fără interpretare, într-o ordine și o secvență logică utilizând atât text, cât și materiale ilustrative (Tabele și Figuri). Raportarea trebuie să furnizare cât mai multă informație posibilă despre natura diferențelor sau a relațiilor (direcționalitate și magnitudine). Se raporteaza si rezultatele negative (rezult. diferite de ceea ce v-aţi aşteptat) 5. Discuții - cuprinde interpretări ale rezultatelor obținute şi explicații privind noua viziune sau nivel de înţelegere asupra problemei Redactarea unei lucrari stiintifice medicale 4. Concluzii cuprinde o prezentare scurtă, succintă și obiectivă a rezultatelor studiului. 5. Acknowledgments – aprecieri cuprinde recunoașterea ajutorului primit. 6. Anexa – appendices conține informații care nu sunt esențiale pentru înțelegerea lucrării dar care clarifică un punct de vedere. 7. Referințele bibliografice - Literatura citată conține o listă alfabetică a referinţelor citate în lucrarea dumneavoastră. Pași în crearea unei lucrări științifice 1. Organizarea (liste, notițe, etc.) 2. Analiza literaturii primare de cercetare (baza pentru secțiunile ”Introducere” și ”Discuții”, căutări on-line cu motoare de căutare) 3. Redactarea secțiunii ”Introducere” 4. Proiectarea şi desfăşurarea experimentului 5. Redactarea secțiunii ”Material și metodă” 6. Analiza şi interpretarea rezultatelor (colectarea datelor rezumarea datelor, teste statistice pentru verificarea concluziilor, redactarea tabelelor şi figurilor) 7. Redactarea secțiunii de ”Rezultate” 8. Redactarea secțiunii ”Discuții” (interpretarea rezultatelor obținute referitor la problema studiată și revizuirea literaturii de specialitate) 9. Redactarea secțiunii ”Rezumat” și a ”Titlu”-lui 10. Autorevizuirea lucrării – self revise 11. Revizuirea colegilor sau a superiorilor - PEER REVIEW 12. Redactarea proiectului final Programe/pachete de programe utilizate în crearea unei lucrări științifice Proiectarea şi desfăşurarea experimentului precum și analiza şi interpretarea rezultatelor au la bază: • programele tip baze de date (Microsoft Access, Visual FoxPro, DBase), • programe de calcul tabelar (Microsoft Excel, Quattro Pro,Lotus 1-2-3) • programe de analiză statistică (Statistica, Systat, SPSS, EpiInfo etc). Redactarea proiectului final utilizează mai multe tipurile de aplicații: • documentarea informatizată - motoare de căutare pe Internet • redactarea secțiunilor - programele de tehnoredactare de tip procesor de texte (Microsoft Word, Corel, Word Perfect, Lotus WordPro, Adobe AcrobatReader etc), programe de grafică (CorelDraw, Macromedia Freehand), programe pentru prelucrarea imaginilor (Adobe Photoshop, Corel Photopaint) sau editoare HTML (Netscape Composer, FrontPage) Autorevizuirea lucrării științifice și de revizuirea colegilor sau superiorilor utilizează instrumentele Internet (browsere: Netscape Comunicator, Microsoft Internet Explorer, poştă electronică: Netscape Messenger, Microsoft Outlook Express, Lotus Notes) Prezentarea lucrării utilizează programe de prezentare (Microsoft PowerPoint, Harvard Graphics). Exemplu - Titlu Lucrare ce raportează legătura dintre nivelurile serice ale interleukinei-2 şi distrugerea hepatică în infecţia cronică cu virusul hepatitei C . Titlu nepotrivit: ”Liver Injury in Chronic Hepatitis C Infection” !! foarte general Titlu potrivit: ”Relationship between Serum Levels of Interleukin-2 and Liver Injury in Chronic Hepatitis C Virus Infection before Interferon Treatment” !! elemente cheie: o relație intre imunitate și apariția unei infecții pe o subpopulație de pacienți (pacienți cu hepatita C) Exemplu - Introducere Descrierea problemei si istoricul: Hepatitis C virus (HCV) is a ubiquitous virus infection. It has been estimated that about 3% of the world’s population have chronic HCV infection. It is a major cause of chronic liver disease. Chronic hepatitis C has been a public health concern during the last decade in most developed countries (1). Host immune mechanisms are involved in chronic infection. The reason for the hepatocellular injury in chronic HCV infection is still unknown. Several studies have suggested that T-cell immunoregulatory cytokines play a key role in both HCV viral persistence and in extent of liver damage. Motivarea alegerii temei: Factors involved in the progression to liver disease in HCV infected patients are not well characterized. Little is known about the production of IL-2 in chronic HCV infection. The IL- 2 production by T cells is part a complex network in which a discrete alteration is capable of disrupting the whole system (2, 3). Problema cercetata: In this study, we aimed to investigate the immune response to HCV through expression of IL-2 in the serum of 15 chronically HCV infected patients compared to normal controls and also its association with inflammatory indicators. Exemplu – Material și Metodă Populatie investigată: Fifteen patients (6 male, 9 female, age: 47.35±10.78 years) with chronic HCV infection and 14 healthy subjects (6 male, 8 female; age: 35.00±15.45 years) were included in this study. Locația și momentul: Patients were consecutively recruited from the “Matei Bals“ Institute Infectious Diseases Division from April 2010-October 2010. Design-ul experimentului și protocol: All of the patients and controls provided written informed consent. All of the patients underwent a complete medical and laboratory evaluation and a liver biopsy. The inclusion criteria for this study were as follows: a confirmed HCV infection, a positive PCR for HCV-RNA, increased levels of alanine aminotransferase (ALT) and a liver biopsy confirming chronic HCV infection. Measurement of serum IL-2 was performed for the cases and controls using ELISA (R&D Systems). Serum samples were tested twice for IL-2. Metode statistice: ”Comparisons of proportions between the patients and controls were assessed by Fisher’s exact test. Continuous data were compared by Mann-Whitney rank sum test. The Spearman’s rank coefficient was used to assess correlation between the continuous variable. The results were statistically analyzed by Student t test and a p<0.05 (95% CI) was considered statistically significant. ” Exemplu – Rezultate The mean of alanine aminotransferase (ALT) levels were increased (the range was 63 to 160 IU/L). The majority of patients (80%) were infected with HCV genotype I and 86% had an HCV RNA viral load greater than 850.000 IU/mL. An increased expression of IL-2 has been documented in the serum of chronically HCV infected patients before interferon therapy (385±41.2 vs.126±15.4 pg/mL; p<0.001). The serum levels of IL-2 were higher in male compared with female but the differences were not significant (p>0.05). The highest level of IL-2 was detected in patients lower than 32 years old. However, these differences were not significant (p>0.05). There was correlation between serum IL-2 levels and histological activity index scores (r=0.746; p<0.001) and serum ALT levels (r=0.714; p<0.001). Exemplu – Discuții Compararea rezultatelor studiului cu alte rezultate din litaratura: Host immune response is important in determining the outcome of chronic HCV infection. Results of our study showed elevated serum levels of ALT (4). The immunopathogenesis of chronic hepatitis C virus (HCV) infection is a matter of great controversy. It has been demonstrated that T cells play a role in HCV clearance in HCV infected patients. Helper T cells (Th) help in the functions of the immune system as the major regulator and also help to destruct antigen and to reinforce antibody production. We found that there was a greater expression of IL-2 compared to the controls. IL-2 reflects the degree of histological and biochemical activity of chronic HCV infection (5, 6). Noul nivel de înțelegere al problemei studiate: Immune-mediated mechanisms are believed to play an important pathogenetic role in HCV infection. It is thought that cytotoxic T lymphocyte responses early in infection may be important for viral clearance. Several cytokines and chemokines induced by viral infection play directly or indirectly roles in antiviral defense. Cytokines are key mediators of inflammation, apoptosis, necrosis and fibrosis and they are actively involved in the regeneration process of liver tissue after injury. Th1 cytokines, such as IL-2, interferon gamma (IFN-γ), and tumor necrosis factor-alfa (TNF-α) are required for host antiviral immune responses. Exemplu – Discuții IL-2 is considered to be a Th1 type cytokine and is involved in enhancing the proliferation and activation of most T lymphocytes, NK cells and B-lymphocytes. Liver sinusoidal and inflammatory cells have been reported to be sources of IL-2 and no consensus exists on the predictive value of this cytokine (7). Apparently, expression of IL-2 is associated with a more advanced stage of disease. There was a correlation between ALT levels and IL-2 expression. The level of expression of type 1 cytokines, such as IL-2 and IFN-γ, is correlated with the degree of histologic injury. IL-2 levels may contribute to the role of innate immunity in stimulating the adaptive immune responses (8, 9). Urmatorul pas in studiu: Further studies are warranted on the role of IL-2 in chronic HCV infection. Exemplu – Concluzii Prezentare scurtă si succintă a rezultatelor studiului: IL-2 may exert a pro-inflammatory activity. Serum IL-2 levels increase due to chronic HCV infection, and the amount of increase corresponds to the degree of inflammation.
Exemplu – Acknowledgement Sursa de finanțare: This paper was supported by CNCSIS-UEFISCSU, PNII 1165/2009.
Exemplu – Referințe bibliografice
Lista alfabetică a referințelor: 1. Alter MJ. Epidemiology of hepatitis C virus infection. World J Gastroenterol.2007; 13: 2436-41. 2. Gramenzi A, Andreone P, Loggi E, Foschi FG, Cursaro C, Margotti M, Biselli M, Bernardi M. Cytokines profile of peripheral blood mononuclear cells from patients with different outcomes of hepatitis C virus infection. J Viral Hepat.2005; 12: 525-30. 3. Tilg H, Kaser A, Moschen AR. How to modulate inflammatory cytokines in liver diseases. Liver Int.2006; 26: 1029-39. ........ Strategii de cautare a informatiei Pentru formularea unei strategii de căutare a literaturii deja publicate se va avea in vedere: (a) Structurarea întrebarii într-un mod corect și relevant, în acord cu problema clinică identificată - formatul PICO/R; (b) Informatiile pot fi incomplete: întrebările pot fi recente; studiile pot concluziona că sunt necesare aprofundari; lipsa metodologiilor de validare a procesului de evaluare; informatiile pot fi accesate restricționat; (c) Utilizarea revizuirilor sistematice și a meta-analizelor care au in vedere studii recente dar si anterioare (d) Identificarea sursele de eroare sistematică: eroarea sistematică de confuzie, de publicare, de selecție, de disponibilitate, erori întâmplătoare de colectare a unor date inițiale sau de raportare a unor rezultate, eroarea statistică prin aplicarea eronată a metodelor și instrumentelor statistice, precizarea conflictului de interese. Strategii de cautare a informatiei (a) Definirea scopului căutării și a întrebării clinice (format PICO/R) si definirea criteriilor de includere și excludere (se obtine un sir de termeni) •Pacientul si/ sau problema clinica (boala sau bolile de care sufera) •Interventia principala (tratament, test diagnostic) •Interventia de Comparat (tratament, test diagnostic) •Rezultatul/cOnsecintele/Obiectivul clinic urmarit •Tratament: treatment use (tratamentul), number need to treat (NNT – numarul necesar a fi tratat), risk reduction (RA - diferenta riscurilor), relative risk (RR – riscul relativ), hazard ratio (HR – raportul hazardelor), survival/mortality (supravietuire/mortalitate) •Preventie: number need to treat, risk reduction, relative risk, hazard ratio •Diagnostic: sensitivity (sensibilitatea), specificity (specificitate), predictiv value (valoare predictiva) •Prognostic: risk (riscul), relative risk (riscul relativ), odds ratio (raportul cotelor) (b) Metodologia de filtrare în procesul de căutare ; (c) Surse bibliografice relevante pentru cercetare Strategii de cautare a informatiei (a) Definirea scopului căutării și a întrebării clinice (format PICO) (b) Metodologia de filtrare în procesul de căutare Sirul de termeni obtinut la pasul (a) poate conține operatori booleeni (AND, OR şi NOT) cu au rolul de a îngusta sau lărgi domeniul de căutare, metacaractere (creșterea eficienței activității de interogare), sinonime, acronime, abrevieri, ortografii alternative etc Operatori: OR – largeste cautarea (sunt extrase mai multe documente – documente care contin cel putin unul din termeniii legati cu acest operator), util pt termenii sinonimi AND – restrange cautarea (sunt extrase documente care contin in acelasi timp toti termenii legati cu acest operator) NOT – restrange cautarea (sunt extrase documente care contin un termen, cu excluderea acelora care nu contin, in acelasi timp, termenii introdusi dupa NOT). Cautarea exclude termenii irelevanti. () – permite cautarea tuturor termenilor inclusi intre paranteze, in ordinea scrierii lor (se rezolva mai intai parantezele apoi restul singtagmei) Metacaractere: ….. (c) Surse bibliografice relevante pentru cercetare Strategii de cautare a informatiei (a) Definirea scopului căutării și a întrebării clinice (format PICO) (b) Metodologia de filtrare în procesul de căutare Sirul de termeni obtinut la pasul (a) poate conține operatori booleeni (AND, OR şi NOT) cu au rolul de a îngusta sau lărgi domeniul de căutare, metacaracte (creșterea eficienței activității de interogare), sinonime, acronime, abrevieri, ortografii alternative etc Metacaractere: .ti, .ab, au restrictioneaza cautarea doar la termenul din titlu, rezumat sau numele autorului ? se foloseste in interiorul sau la sfarsitul unui termen pentru a inlocui una sau mai multe litere (util in extragerea termenilor cu ortografie diferita) $ sau * utili in truncherea sau inlocuirea a mai multor caractere adj termeni alaturati, inclusiv cei separati prin cratima / va extrage termenul exact & este echivalent cu operatorul AND <,>,= mai mic, mai mare, egal cu (c) Surse bibliografice relevante pentru cercetare Strategii de cautare a informatiei (a) Definirea scopului căutării și a întrebării clinice (format PICO) (b) Metodologia de filtrare în procesul de căutare (c) Surse bibliografice relevante pentru cercetare (1) Baze electronice de date nefiltrate (PubMed Central, Medline, OvidEMBASE, TRIP UK, ISI Web of Science, CINAHL, National Guidelines Clearinghouse, PsycINFO, Google Scholar, Google(5). (2) Bazele de date filtrate (Cochrane Library: CENTRAL - Cochrane Central Register of Controlled Trials, CDSR - Cochrane Database of Systematic Reviews). (3) Literatura „gri” (lucrări nepublicate, necomerciale, produse de agenții guvernamentale, mediul academic sau consilii de experți. (4) Articole, rezumate, postere tipărite cu ocazia manifestărilor științifice medicale. (5) Ghiduri de diagnostic și tratament (UKCRN, NICE, ADA, EHA, ESC, etc) sau baze de date cu lucrări provenite din cercetarea academică (PROSPERO/care găzduiește CRD). (6) Reviste medicale de specialitate (SpringerLink, ProQuest, Wolters Kluver, Elsevier, Thomson Reuters). (7) Bibliografia lucrărilor deja publicate. (8) Lucrările cercetătorilor consacrați în domeniul investigat. Strategii de cautare a informatiei Exemplu: Problema clinică (scopul căutării): Statinele previn boala coronariană la adulții cu dislipidemie. Întrebarea: Sunt statinele mai eficiente decât alte intervenții în prevenția primară a evenimentelor cardiovasculare la adulții cu dislipidemie? Descriere PICO prin introducerea unor criterii de includere și de excludere P Adulti diagnosticati cu boala coronariana (includere: adulti cu hipercolesterolemie, hipertrigliceridemie, dislipidemie; excludere: factori de risc precum obezitatea, supraponderalitatea, fumat, sindrom metabolic, strs, sedentarism, dieta nesanatoasa) I Statine (includere: atorvastatin, fluvastatin, lovastatin, pravastatin, rosuvastatin, simvastatin; excludere: nu se includ denumiri comerciale) C Oricare (includere: placebo sau alte statine din lista de mai sus, excludere: nu sunt excluse nici un fel de comparatii) O/R Preventie primara sau secundara a evenimentelor cardio-vasculare (includere: preventia bolii coronariene; excludere: -) Strategii de cautare a informatiei Exemplu: Căutare in baza electronică de date MEDLINE folosind platfoma PubMed Central (31 august 2017) pentru perioada 2010 – 2017 : 111 referinte. Initial fara filtru adult*, NOT child$ s-au obtinut 1814 referinte. Folosirea filtrului a redus la o treime numărul referintelor. Filtrarea suplimentară a bazei de date cu anul publicării articolelor a redus numărul final de lucrări la 111 (un număr rezonabil pentru a verifica titluri și rezumate pentru selecția finală). Acest proces de căutare a literaturii, deși laborios, ne permite să evităm așa- numita “la nimereală”, adică alegerea fără o strategie și criterii clare de interogare. Alegerea unor lucrări oarecare nu ne poate sprijini în interpretarea critică a rezultatelor în vederea susținerii sau respingerii unei interventii sau tratament. Evaluarea validitatii articolelor stiintifice Trialuri clinice Criterii principale 1. Alocare randomizata in grupurile de tratament (Da/Nu) 2. Alocarea a fost de tipul blid (cel care a introdus subiectii in grupuri nu stie ce interventie va primi pacientul) (Da/Nu/Nu se stie) 3. Subiectii au fost urmariti o perioada de timp suficient de lunga astfel incat efectul tratamentului sa poata aparea (Da/Nu) 4. Subiectii pierduti din studiu sunt in numar mic astfel incat sa se poata evita aparitia unor erori sistematice (<20% din subiecti au fost pierduti din studiu) 5. In grupurile randomizate au fost analizati toti pacientii? (Analiza de tipul “intentia de a trata”) (Da/Nu) 6. A existat un grup martor pentru comparatie? (Da/Nu) Criterii secundare 1. Grupul urmarit si de control sunt comparabile (Da/Nu) 2. A fost folosita metoda blind pentru: i. pacienti (Da/Nu) ii. medici curanti (Da/Nu) iii. invertigatorul care urmareste rezultatul (Da/Nu) 3. Daca ipoteza nu a fost demonstrata in studiu, puterea testului este suficient de mare (Da/Nu) Evaluarea validitatii articolelor stiintifice Studii prognostice (cohorta si caz martor) Criterii principale 1. Esantionul a fost reprezentativ (Da/Nu) 2. Esantionul a fost clar definit (criterii de includere/excludere) (Da/Nu) 3. Boala a fost bine definita (Da/Nu) 4. In studiile de cohorta pacientii au fost identificati inainte de aparitia rezultatelor urmarite (Da/Nu) 5. Subiectii au fost urmariti o perioada de timp suficient de lunga astfel incat efectul tratamentului sa poata aparea (Da/Nu) 6. Subiectii pierduti din studiu sunt in numar mic astfel incat sa se poata evita aparitia unor erori sistematice (<20% din subiecti au fost pierduti din studiu) Criterii secundare 1. Rezultatele urmarite au fost evaluate prin metoda blid (Da/Nu) 2. Criteriile pentru rezultatele urmarite sunt obiective (Da/Nu) 3. A fost aplicata o ajustare pentru factorii prognostici importanti (Da/Nu) Evaluarea validitatii articolelor stiintifice Studii diagnostice (cohorta si caz martor) Criterii principale 1. Standardul de referinta este acceptabil (Da/Nu) 2. Noul test si standardul de referinta au fost evaluate independent (Da/Nu/Ne se stie) 3. A fost folosita metoda blid (Da/Nu/Ne se stie) 4. Testul a fost evaluat pe un spectru de pacienti corespunzator (Da/Nu/Nu se stie) Criterii secundare 1. Testul standard a fost aplicat indiferent de rezultatul noului test (Da/Nu/Nu se stie) 2. Metodele de realizare a noului test au fost descrise suficient de detaliat pentru a permite replicarea (Da/Nu) 3. Aspectul vizat este o boala/anormalitate a carei prezenta are utilitate clinica (Da/Nu) 4. Noul test este fezabil (accesibil, cost, riscuri …) (Da/Nu)