Stimați studenți,

În acest moment începeți o nouă disciplină, numită Bioinformatica, care se definește ca

un domeniu interdisciplinar care dezvoltă metode și instrumente pentru înțelegerea datelor
biologice (‘interdisciplinary field that develops methods and … tools for understanding
biological data’, https://en.wikipedia.org/wiki/Bioinformatics). Însă astăzi mai există și alt trend
în expansie, precum conceptul Medicinei Personalizate, care se referă “la un model medical care
utilizează profilarea moleculară pentru elaborarea strategiei terapeutice corecte pentru persoană
corespunzătoare la momentul de timp potrivit, și/sau să determine predispoziția către o boală
și/sau să asigure prevenția oportună și țintită” (https://www.permed2020.eu/_media/2014-03-
27_PerMed_EC_presentation.pdf).
Dar, precum vă amintiți din cursul de Genetică umană, fenotipul este determinat de
interacțiunea dintre genotip și mediul înconjurător. Una din problemele este că e dificil de
estimat efectul contribuției mediului înconjurător și genotipului în majoritatea caracteristicelor
care un doctor poate verifica în pacienți. Ca rezultat, încă o tendință important de menționat este
Big Data, reprezentând combinația dintre Tehnologii Informaționale și Informatică cu aplicația
asupra colecțiilor de date a pacienților, înțelegerii, analizei și transformării acestor în cunoștințe
care pot fi aplicate de către medici în personalizarea tratamentului pacienților
(https://www.biomedeurope.org/images/pdf/events/2017-annual-
meeting/4._ICPerMed_Alliance_for_Biomed_Research_Nov_2017_MOD.pdf).
În acest context, cursul dat o să vă ofere înțelegeri ce reprezintă datele moleculare și unde
acestea pot fi identificate, care informații pot fi identificate suplimentar în surse diferite și unele
instrumente, utile pentru un medic. În același timp, aceasta poate servi ca un început pentru a
stimula interesul vostru în domeniul dat, astfel încât o să puteți dezvolta capacități individuale în
domeniul de activitate profesională.
Totodată, acest curs fiind unul integrativ necesită un anumit nivel de abilități de utilizare
a calculatorului, Internetului, cunoștințe în statistică. De aceea, urmând link-ul de mai jos,
completați următorul chestionar
https://forms.gle/HMTzdLi9UA458dba6
sau
https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdPlDMJakhdY9IghwZZEWU6XCWHMV
xI86iPpIBJxbyhDp64dA/viewform?usp=sf_link
 Pentru început, vi se propune să analizați sursele de literatură pentru ca să vă creați o
imagine generală despre conceptul Medicinii Personalizate, a instrumentelor corespunzătoare
bazate pe tehnologii ”-omice”, precum Medicina Genomică și impactul mediului înconjurător
(de ex., a factorilor de risc), evidențiind rolul cheie al Bioinformaticii:
1. Maojo V, Kulikowski CA. Bioinformatics and medical informatics: collaborations on the road to
genomic medicine?. J Am Med Inform Assoc. 2003;10(6):515-22.
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC264428/)
2. Manrai AK, Cui Y, Bushel PR, et al. Informatics and Data Analytics to Support Exposome-Based
Discovery for Public Health. Annu Rev Public Health. 2016; 38: 279-294.
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5774331/)
3. Stingone JA, Buck Louis GM, Nakayama SF, et al. Toward Greater Implementation of the Exposome
Research Paradigm within Environmental Epidemiology. Annu Rev Public Health. 2017;38:315-327.
(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5664945/)
4. Misra BB, Langefeld C, Olivier M, Cox LA. Integrated omics: tools, advances and future approaches.
Journal of Molecular Endocrinology, 2019: 62, R21-R45
5. Kellogg RA, Dunn J, Snyder MP. Personal Omics for Precision Health. Circular Research, 2018; 122:
1169-1171

În continuare va urma o serie de sarcini. Vă rog, să citiți cu atenție explicațiile înainte de

a începe realizarea acestor sarcini. Acestea vor fi împărțite în trei seturi, însă pentru oricare din
ele utilizați cerințele tehnice expuse mai jos.
Pe pagina următoare este prezentată foaia de titlu a raportului final, necesar de a fi
elaborat pentru finisarea cu succes a cursului de Bioinformatică. Completați doar locurile
marcate în GALBEN.
Textul integral TREBUIE să fie elaborat prin aplicarea următoarelor parametric: TIMES
NEW ROMAN, size 12, distanța între rânduri 1,15. Pentru elaborarea rapoartelor în baza
sarcinilor puteți utiliza Microsoft Word, LibreOffice Writer, OpenOffice Writer, GoogleDocs etc.
Numărul total de pagini va fi de cca 20-30 pagini.
NOTA: Vă rog, să urmăriți cerințele tehnice; altfel raportul POATE FI RESPINS.
Utilizați denumirea însărcinărilor pentru a structura expunerea datelor și informațiilor
colectate.
Cînd aveți sarcinile îndeplinite, transmiteți raportul ce include toate trei însărcinări într-un
singur fișier, la adresa mea electronică: alexei.levitchi@usmf.md. Denumirea fișierului trebuie să
fie elaborată în modul următor
GROUPNUMBER_STUDENTSNAME_GENENAME.doc, e.g.:
M1500_Petru Vasile_AP1.doc

Însărcinările trebuie să fie îndeplinite în următoarele două săptămâni.

MOSTRĂ Pagina titlu

BIOINFORMATICA

Denumirea genei

Grupa # ________
Numele studentului

Chisinau, 2019
 Vizualizați tabelul de mai jos pentru a identifica numele Dstră și gena pentru care o să
efectuați însărcinările și raportul final.
NOTA: Modificarea denumirii genei name nu este acceptată!!! În cazul în care
raportul final va conține informații din alt raport sau informațiile sau datele vor fi falsificate,
lucrarea va fi transmisă la decanat, cu recomandarea pentru exmatricularea studentului din motiv
de lipsă de Integritate Academică.

Lista studenților și a denumirilor genelor corespunzătoare pentru efectuarea

exercițiilor practice
Nr Grupa ID Nume Prenume Patronimic Gene
1 M1501 10150379 Furculiţa Victor Valeriu CETP
2 M1501 10150449 Hubencu Cristina Andrei LDLR
3 M1501 10150530 Mîţu Alexandru Mihai SORT1
4 M1501 10150627 Perebicovschi Anastasia Iurie APOA1
5 M1501 10150607 Placinta Ana Veaceslav APOC3
6 M1502 10150428 Gruşca Lia Ion APOA4
7 M1503 10150287 Clipii Olga Vitalii APOA5
8 M1503 10150713 Ioniţa Ludmila Vladimir GCKR
9 M1503 10150495 Lungu Cristina Andrei LPL
10 M1503 10150562 Rojniţa Sorina-Mihaela Boris LIPC
11 M1503 10150675 Tăetu Ion Gheorghe APOB
12 M1503 10150361 Tuz Ana Iacob APOE
13 M1503 10150356 Ungureanu Iraida Victor CELSR2
14 M1504 10140132 Butucel Ana Grigore PSRC1
15 M1504 10150365 Dunaievschi Vasile Serghei APOC2
16 M1506 10150252 Căpăţină Victoria Andrei APOC1
17 M1506 10150616 Pădure Cătălina Catalin TRIB1
18 M1509 10150193 Amoaşii Anastasia Dumitru MLXIPL
19 M1509 10150338 Dedin Gloria-Cezara Dumitru ANGPTL3
20 M1509 10150434 Guţu Costel Grigore HMGCR
21 M1509 10150538 Movila Mihaela Aurel CILP2
22 M1509 10150555 Nichiforeac Dmitria Dumitru ABCG8
23 M1509 10150412 Tighineanu Nicoleta - Ionica Octavian ABCG5
24 M1510 10150330 Viţa Andrian Veaceslav LCAT
25 M1511 10150411 Gorea Alexandru Oleg LIPG
26 M1514 10150550 Neghină Cristina Andrei LPA
27 M1517 10150194 Andruh Irina Vasili DOCK7
28 M1517 10140368 Gulica Tudor Gheorghe PPP1R3B
29 M1517 10150475 Lavric Diana Valeriu GALNT2
30 M1518 10150718 Ivanes Igor Igor HPR
31 M1519 10150348 Ursu Magdalena Ion TIMD4
32 M1520 10150228 Boţoc Maria Petru PLTP
33 M1520 10150580 Burlacu Evghenia Serghei FADS1
34 M1520 10150289 Cojocari Nina Boris FADS2
35 M1520 10150505 Machidon Natalia Vasilii FADS3
36 M1520 10150516 Mării Elena Vladimir PCSK9
37 M1520 10150830 Shahady Mohammad Khaled CSPG3
38 M1521 10150863 Abu Arar Falah Youseef PBX4
39 M1521 10150861 Abu Arar Sabri Sami ABO
40 M1521 10150235 Buga Dan Grigore HNF4A
41 M1521 10150705 Cigoreanu Gheorghe Emil ABCA1
42 M1521 10150329 Cuşniriuc Irina Iurie APOC
43 M1521 10150714 Ilia Ana Igor APOA
44 M1521 10140163 Petrov Anastasia Ion ZNF259
45 M1524 10150869 Abu Aneam Muhamad Taib BUD13
46 M1524 10150200 Badia Nadejda Gheorghe SCARB1
47 M1524 10150239 Burca Petru Anatoli TCF7L2
48 M1524 10150711 Dumbrăveanu Liuba Vasile DSCAML1
49 M1524 10150471 Latescu Constantin Mihail LRP4
50 M1524 10150473 Latescu Cristina Mihail HAVCR1
51 M1524 10150594 Pricop Ana Vladimir APOC4
52 M1526 10150679 Supostat Alina Constantin MGC13125
53 M1526 10150335 Vicol Grigore Valeriu NLRC5
54 M1529 110615 Rotaru Ana-Maria Marcel SLC12A3
55 M1531 10141173 Bada Panoraia HERPUD1
56 M1531 10150226 Botezatu Diana Vasile LILRA3
57 M1531 10150288 Cocioban Alina Boris MYL2
58 M1531 10150386 Gavriliţa Natalia Iurie HP
59 M1531 10150601 Popa Cristina Stanislav DHX38
60 M1531 10150418 Tataru Constantin Constantin TBL2
61 M1532 10150213 Berlinschi Dinu Mihail BCL7B
62 M1532 10150422 Grama Mariana Boris HLA
63 M1532 10140364 Grosu Stanislav Valerii HNF1A
64 M1532 10150610 Pînzari Radu Igor ST3GAL4
65 M1532 10151355 Ranga Doina Iacob ZNF648
66 M1532 10150370 Ţurcanu Gheorghe Iurie CMIP
67 M1533 10150191 Agachie Lia-Mirela Iurie TTC39B
68 M1533 10150223 Bondareva Daria Ruslan TOMM40
69 M1533 10151356 Dede Egor Vladimir TOP1
70 M1533 10150487 Lepota Anastasia Igor KLHL8
71 M1533 10150525 Mîndru Maxim Iurie NR1H3
72 M1533 10150589 Pşeniţa Anastasia Veaceslav PABPC4
73 M1533 10150735 Terzi Artiom Ivan UBE2L3
74 M1566 10150249 Caldari Pavel Igor IRS1
75 M1566 10150279 Ciobanu Ludmila Ion MYLIP

Fiți precauți să îndepliniți sarcinile la timp, deoarece uneori accesul la bazele de date sau
instrumente poate fi limitat pentru lucrări de mentenanță timp de cîteva zile.