Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Acizi nucleici
Acizi nucleici –sunt polinucleotide,
alcătuite din mononucleotide, unite
prin legături 3’, 5’-fosfodiesterice.
1. ADN - acidul dezoxiribonucleic;
2. ARN - acidul ribonucleic.
ADN
Localizarea:
a. 97-99% - concentrat în nucleu
b. 1-3% - situat în mitocondrii.
Rolul: păstrează şi transmite
informaţia genetică de la ADN
parental la ADN fiică sau ARN.
ARN
Localizarea:
50% - în ribosomi
24% - în hialoplasmă
15% -în mitocondrii
11% - în nucleu
Deosebim:i:
1. ARN mesager
2. ARN ribozomal
3. ARN de transport
ARN mesager (mARN) constituie 25% din
totalul ARN-lui.
Localizat -în nucleu şi citozol.
Prezintă copia sectorului de ADN şi conţine
informaţia despre structura catenei
polipeptidice a proteinei.
Rolul:Transmite informaţia de la ADN spre
ribozomi, sediul de sinteză a proteinei.
ARN ribozomal (rARN) constituie 60% din
totalul ARN-ului.
Localizat- în ribozomii citoplasmei.
Rolul - formează scheletul ribozomilor.
ARN de transport (tARN) constituie
15% din totalul ARN-lui.
Localizat: în citoplasmă, ribosomi,
mitocondrii.
Rolul: participă la activarea şi
transportul AA spre ribozomi şi
asamblarea lor în polipeptide.
Structura chimică a AN
La hidroliză AN degradează în
mononucleotide, care la rândul lor, la
hidroliza completă degradează în BA,
pentoze şi acid fosforic.
ADN----A; G; C; T+dR+H3PO4
ARN----A; G; C; U+ R+H3PO4
Bazele azotate
BA se clasifică în :
1. majore: purinice: A, G şi pirimidinice: C,T,U
2. minore:purinice (2metil A; 1 metilG) şi
pirimidinice (5 metil C;5 hidroximetil C)
Molecular Biology
C1 Nucleic Acid Structure-1
Bases
Bicyclic
Purines
:
Monocyclic
pyrimidine:
Rest al Nucleozid
acidului
c
Nucleotide - Rolul
1. Element structural al AN
2. Intermediari energetici
(ATP- purtătorul energiei
chimice în organism)
3. Intră în componenţa Co
4. Servesc ca mesageri
secunzi intracelulari ai
hormonilor (AMPc;
GMPc)
Structura chimică
Structura primară a AN
Reprezintă secvenţa
mononucleotidelor în lanţul
polinucleotidic liniar, legate între ele
prin legăturile 3' - 5' fosfodiesterice
Catenele au două capete:
5‘ – nucleozid tri fosfatul;
3‘ – gr. OH liberă
Structura secundară a ADN
Watson şi Crick (1953) au
postulat modelul
structural al moleculei de
DNA - dublul helix
(spirală dublă)
Caracteristicile dublei
spirale:
1. 2 lanţuri
polidezoxiribonucleotidice se
răsucesc helicoidal în jurul unui
ax comun, formând o dublă
helice cu orientare spre
dreapta;
Structura secundară a ADN
2. lanţurile sunt antiparalele (unul are direcţia
5’3’, altul 3’5’)
3. complimentaritatea (A îi corespunde T; iar
G-C).
4. Stabilitatea dublului helix este asigurată de
legăturile de hidrogen între BA (A=T
formează 2 legături de hidrogen, iar G ≡C
trei legături).
5. Spirală este regulată (fiecare spiră cuprinde
10 nucleotide). Distanţa dintre BA
învecinate este de 0,34 nm.
6. La pH=7 grupele fosfat sunt ionizate, poarta
sarcini negative, deaceia DNA prezintă acid
puternic.
Legităţile lui Chargaff
1. Conţinutul adeninei este egal cu al
timinei, iar al guaninei cu al citozinei
(A=T, iar G=C)
2. În orice preparat de DNA independent
de specie suma bazelor purinice este
egală cu cea a bazelor pirimidinice
(A+G=T+C)
3. Preparatele de DNA separate din diferite
ţesuturi a uneia şi aceeiaş specie de
organisme sunt absolut identice.
4. dacă A+T este mai mare decît G+T avem
DNA de tip AT
5. dacă G+T este mai mare decît A+T avem
DNA de tip GT
Structura terţiară
Reprezintă superspiralizarea dublului helix
la care participă proteinele histonice şi
formează cromatina
Unitatea structurală a cromatinei este
nucleosomul
Nucleosomul – este un octamer histonic
(2H2A; 2H2b; 2H3; 2H4) înfăşurat de
aproximativ de 2 ori de dublul helix.
Între 2 nucleosmi se conţin porţiuni de
ADN alcătuit din 20-60 perechi de
nucleotide asociate cu H1
Compactizarea
DNA cromatinei
Firul de
cromatină?
~ 1,000
30 nm Solenoid ~40 / 50
Nucleosoma
= оctamer de
histone
H2a, H2b, H3, H4 Cromosoma metafazică/
146 / 200 bp DNA cromatina interfazică
Compactizare ~ 10,000
~10 ori
Structura secundară şi terţiară a
ARNm
ARNm – fiecărei gene îi corespunde
molecula sa de ARNm, de aceea el este
foarte heterogen
Elementul de codificare al ARNm este
tripletul nucleotidic – numit codon. Fiecare
codon corespunde unui anumit AA
Structura tARN
1. Primară – succesiunea nucleotidă în
catena polinucleotidică (în medie 95
nucleotide)
2. Secundară – în forma “foiii de trifoi”
3. Terţiară – în forma “literei L”
Structura secundară a ARNt
Structura terţiară a ARNt
ARNr
Structura secundară – e prezentată
prin sectoare spiralate unite între ele
cu ajutorul unei catene curbate
Structura terţiară – prezintă
scheletul ribosomului. Are forma unui
bastonaş sau ghem pe suprafaţa
căruia sunt înfăşurate proteinele
ribosomului.
Denaturarea şi renaturarea
Denaturarea –sub acţiunea temperaturii, mediului
PH, substanţelor chimice are loc ruperea
legăturilor de ce stabilizează structura
secundară şi terţiară a DNA.
La denaturare DNA îşi pierde proprietăţile
biologice.
La răcirea treptată catenele din nou se reunesc
după principiul complementaritătii, formînd
spirala dublă nativă. Acest fenomen se numeşte
renaturare .
Obiectivele:
Dogma centrală a geneticii moleculare. Concepţia: o
genă - un polipeptid.
Replicarea ADN- mecanismul, substratele, matricea,
enzimele şi factori proteici, etapele biosintezei ADN.
Telomeraza. Rolul şi structura..
Reparaţia ADN.
Transcripţia sau biosinteza ARN: matricea,
substratele, enzimele, mecanismul
Trsanscripţia inversă.
Biosinteza ARN pe matrice de ARN
Modificările posttranscripţionale (processing)
Inhibitorii sintezei acizilor nucleici.
Ingeneria genetică şi semnificaţia ei practică. Sinteza
anticorpilor
Dogma centrală a geneticei
moleculare
Postulatul de bază a geneticei moleculare a fost
formulat de Watson şi Crick (Meselson, Stahl):
este transmiterea informaţiei genetice de la ADN la
proteină. Sînt încluse trei procese:
replicarea;
transcripţia;
translaţia.
Primele două procese au loc în nucleu, iar al treilea – în
citozol.
Procesul de transcripţie este reversibil. Enzima care
catalizează transcripţia inversă se numeşte revertaza
(reverstranscriptaza) şi a fost descoperită la oncoviruşi.
Sinteza ARN-ului pe baza ARN se numeşte replicarea ARN,
ea are loc la viruşi, care nu au ADN. Procesul de translaţie
este ireversibil.
Realizarea informaţiei genetice
Mecanismul:
subunitatea 30 S
subunitatea 50S
Ribozomul va avea constanta de sedimentare 70S la
procariote si 80S la eucariote.
S – este coeficientul de sedimentare Svedberg, care
depinde de forma, densitatea şi dimensiunea
particulelor.
Centrele catalitice ale ribosomilor
Situsul A - aminoacil – responsabil de unirea
complexului aminoacil- ARNt
Situsul P – peptidil – găzduieşte ARNt legat de
un lanţ polipeptidic deja sintetizat
Situsul E – e responsabil de eliminarea ARNt
Translaţia
Translaţia sau biosinteza proteinelor propriu
zisă.
Bazele moleculare ale translaţiei:
1. m-RNA ca matriţă genetică, programul căreia
determină succesiunea AA în proteină;
2. aminoacil – tRNA;
3. ribozomii ca maşini moleculare pentru unirea
succesivă a AA în catena polipeptidică conform
programului mRNA;
4. GTP ca sursă de energie;
5. “factorii” proteici care vin în ajutor în diferite
etape ale asamblării proteinei în ribozomi;
Etapele
se realizeaza in 5 etape:
Activarea AA.
eliberarea acestuia.
Prelucrări post traducere ale
proteinei sintetizate.
Activarea AA
Se desfăşoară în două etape:
ATP PPi
1. NH2-CH-COOH NH2-CH-CO –O-AMP
I I
R R Aminoacil Adenilat
Aminoiacil ARNt
sintetaza
2. NH2-CH-CO –O-AMP+ARNt NH2-CH-CO –O-RNAt +AMP
I I
R R
Aminoacil RNAt
Translaţia propriu zisă
Citirea ARNm se face în direcţia 5‘- 3'
30S
P 50S A
FE-T
E-PT
FE-T
Terminarea
are loc cînd sunt întîlniţi codonii UAA, UGA,
UAG şi factorii proteici de terminare: R1,
R2, S.
Nici un tRNA nu se poate lega cu codonii
de terminare.
La formarea unei legături peptidice
se consumă patru legături
macroergice:
2 în etapa de activare a AA (ATP) şi
la nivelul replicării:
1. Mitomicina –împiedica separarea
catenelor de ADN
2. Acid nalidixic –inhiba ADN giraza
la nivelul transcriptiei:
- Actinomicina D - se fixeaza pe ADN
– Rifampicina - inhiba ARN polimeraza
Inhibitorii sintezei proteinei
la nivelul translatiei:
Streptomicina –inhiba legarea ARNt initiator la
subunitatea 30S, interferă cu legarea formil-Met-
ARNt la locul de iniţiere.
Cloramfenicol -inhiba peptidil transferaza
Tetraciclina - inhiba legarea ARNt la ribozomi
Eritromicina,Azitromicina – blocheaza subunitatea
50S
Puromicina – blocheaza elongarea inhibând
competitiv ARNt
Neomicina, Kanamicină - erori în reproducerea
codului genetic
Toxina difterică - inhibă translocaza
Reglarea sintezei proteinelor
Sinteza proteinelor nu e constantă – ea trebuie
să se adapteze cerinţelor vitale
Celulel dispun de 2 tipuri de enzime :
1. Constitutive - se sintetizează în celulă cu o viteză
constantă.
2. Inductibele - sunt E a căror concentraţie depinde
de prezenţa sau absenţa din mediu a unui
compus denumit inductor. Sunt implicate în căile
catabolice,
Teoria lac-operonului
Schema reglării biosintezei proteinei la procariote a fost descrisă în 1961
de către Jacob şi Monod - poartă denumirea de teoria lac-operonului .
Modelul e bazat pe studiul reglării mtabolismului lactozei în Escheria coli.
Exprimarea GS (conţin informaţia cu privire la biosinteza E impicate în
utilizarea lactozei:-galactozidaza, permeaza şi transacetilaza –1,2,3)
Genă reglatoare (GR) - codifică represorul (R).
R se leagă de un fragment de ADN denumit operator (O).
Legarea R la O blochează accesul ARN – polimerazei la promotor avînd
ca rezultat suprimarea transcrierii GS.
Reglarea sintezei proteinei prin inducţie
În prezenţa lactozei:
Inductorul (în acest caz lactoza) se leagă specific la R, ca
urmare are loc desprinderea acestuia de la operator.
Ilustrarea mecanismului de reglare
a sintezei proteinei prin represie
REZUMĂM:
GR controlează exprimarea anumitor GS prin
intermediul unei proteine – R
Represorul (R)– suprimă sinteza de ARNm, deci
de proteine; R inactivat – permite transcrierea GS
şi sinteza proteinei
E inductibile – R– nu are loc transcrierea. Când în
mediul apare I – R se inactivează – are loc
sinteza ARNm- proteinei
Reglarea sintezei la eucariote
Atât la nivelul transcripţiei cât şi la nivelul
translaţiei
Reglarea hormonală (cortizol- sinteza E
gluconeogenezei; estrogenii, androgenii, vitamina
D – sinteză de proteine specifice)
Reglarea exspresiei genetice prin moleculele
proteice legate de ADN (histonele) – sinteza ARN
pe ADN e inhibată prin adaosul de histone
Reglarea proteinei la nivelul translaţiei – e
posibilă prin acţiunea factorilor proteici, care
contribuie iniţierea, elongarea, terminarea.
Ingineria genetică
ştiinta, preocupată de crearea noilor fenotipuri
prin transplantarea genei unui organism în
genomul altuia în scop de a lichida defectele
ereditare ale genomului, adică tratarea
afectiunilor ereditare (gena întrodusă nu
gurează în patrimoniul ereditar al genomului -
gazdă)
Se obtin molecule hibride (himerice)
În linii marl procedura include etapele:
1. Căpătarea genei
2. Căpătarea ADN-ului recombinat
3.Clonarea ADN-ului recombinat
Căpătarea genei:Stiind structura primară a proteinei
în laborator se poate obline gena respectivă.
Randamentul sintezei bacteriene este
impresionabil: Ex- 100 celule E.Coli produc
prin clonare 5 mg somatostatină
(cantitate, ce se obţine prin prelucrarea a
100 tone de creier de bovine).
Prin tehnica ingineriei genetice s-au
obtinut cantităţi mari de insulinâ
(Humulună), Interferon, vaccine.
Mutaţiile.
Modificările genomului organismului, care se
păstrează şi se transmit prin ereditate
se transmit apoi de la o generaţie la alta.
Modificările pot interesa o pereche de baze
(mutatii punctiforme) sau un grup de baze pe
una sau pe ambele catene ale unei molecule de
DNA.
Mutaţiile.
Mutatiile punctiforme: pot decurge prin:
l. substitutie (misens mutatii, unde deosebim 2 tipuri):
a. Tranzitie - o BA purinică este înlocuită
tot cu una purincă, una pirimidinică -tot cu una pirimidinică.
b.Transversie - o pereche de baze
purinice este înlocuită cu una pirimidinică sau invers.
2. Inserţie - acest mecanism constă în întroducerea unei
perechi de baze suplimentare în catena de DNA.
3. Deleţia constă în excluderea unei perechi de baze în aşa mod ca
ea nu mai poate fî complementară şi la replicare apare "golul" în
ambele catene. Unele modificări în secventa nucleotidică pot duce
la formarea codonului sinonim şi succesiunea aminoacizilor nu se
va schimba (mutatii benigne).
La afectarea segmentelor mari de genă apar mutatii întinse. In
dependentă de consecinţele modificărilor deosebim mutaţie
benignă, neutră, nocivă.