Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
SUBSTANȚELOR ÎN NATURĂ
1. Microorganismele
Notiunea de microorganism se refera la un grup vast si eterogen de organisme, diferite din punct
de vedere morfologic, al activitatii biologice sau al pozitiei sistematice, reunite de cateva
caractere comune:
- dimensiuni reduse ,care le fac invizibile cu ochiul liber, si vizibile doar la microscopul optic sau
electronic;
- virusi: entitati corpusculare infectioase, incapabile de existenta autonoma in afara unei celule
vii;
- alge microscopice;
- protozoarele.
Notiunea de ciclu natural al unui element este frecvent utilizata in ecologie si stiintele
naturii sub titulatura de ciclu biogeochimic sau ciclu de nutrienti. In definitie, un astfel de ciclu
este o cale prin care un element chimic sau o molecula circula prin compartimentele biotice si
abiotice ale ecosistemului planetar. In esenta, elementul este reciclat, dar, in anumite cicluri
exista compartimente (denumite rezervoare) unde elementul respectiv se acumuleaza si este
stocat pentru o perioada indelungata de timp. In acest context, se vorbeste de rezervoare
propriu-zise, in care elementul respectiv este stocat, el fiind disponibil intr-o masura mai mare
sau mai mica, si asa numitele „imperfectiuni accidentale”, respectiv cantitati de materie scoase
din circuit prin depunere in forme stabile, pentru intervale mari de timp.
Elementele chimice, compusi chimici, precum si alte forme de materie sunt transmise de
la un organism la altul si de la o parte a biosferei la altul prin intermediul acestor cicluri
biogeochimice.
Cele mai cunoscute si studiate cicluri biogeochimice trateaza circuitul apei, carbonului,
oxigenului, sulfului, azotului, fosforului si hidrogenului in ecosistem, datorita dimensiunilor mari si
a cantitatii mari de materie si energie implicate, dar si a utilitatii informatiei din punct de vedere
al societatii umane. Activitatea microorganismelor este in legatura cu toate aceste cicluri, poate
doar cu exceptia celui al apei, independent in mare masura de activitatea biologica a acestui
grup.
Ciclul oxigenului cuprinde, de asemenea, componente ale tuturor geosferelor, dar este
desfasurat predominant prin intermediul atmosferei si biosferei, si poate fi descris schematic prin
doua procese antagonice: fotosinteza si respiratie. Oxigenul este stocat in trei rezervoare:
litosfera si mantaua (99,5% din oxigen, blocat in roci care contin silicati sau alti oxizi), biosfera si
hidrosfera.
Ciclul sulfului in natura este complicat si nu este cunoscut in intregime. Sulful este
raspindit in sistemele biologice, el intrind in componenta a doi aminoacizi: metionina si cisteina.
Rolul biologic al sulfului este legat de facilitarea transformarilor oxidoreducatoare, care joaca
rolul principal in formarea structurilor cuaternare ale proteinelor si in restructurarea lor
conformationala, dar si de importanta acestui element in lantul transportor de electroni. Ciclul
cuprinde eliberarea sulfului in atmosfera, fie ca hidrogen sulfurat, eliberat din procese de
descompunere, fie ca oxizi de sulf, emisi de catre instalatiile industriale, fie ca dimetilsulfit si
dimetildisulfura sau alti compusi eliminati de organismele vii, de unde este preluat de catre
organismele capabile de procesare fie din aer, fie de pe sol sau din apa.
Ciclul hidrogenului este denumirea sub care este cunoscuta reactia scindarii si reformarii apei,
avand ca produs intermediar hidrogenul, folosit, de regula, ca sursa energetica. Definirea este
incompleta, dat fiind faptul ca exista si alte modalitati de reactie ce implica prezenta acestui
element , modalitati care contribuie la circulatia generala a hidrogenului in ecosistem si care sunt
duse la indeplinire prin intermediul unor grupe de microorganisme. Pentru evitarea confuziilor,
traseul biogeochimic al acestui element va fi numit circuitul hidrogenului. In cadrul acestui
circuit, rezervorul principal de hidrogen este apa.
Cicluri biogeochimice similare fosforului si sulfului sunt proprii si altor elemente chimice
care se afla in compozitia oricarui organism. Datele oferite de geochimie si biologia
contemporana nu sunt insa in aceeasi masura de bogate pentru aceasta categorie de elemente.
Ciclurile biogeochimice insumeaza caile de circulatie ale elementelor in natura, si, desi in mod
conventional sunt prezentate separat, ele sunt interconectate si interdependente, realizand, in
ansamblu circuitul global al materiei in natura. In cadrul fiecarui circuit deosebim doua
compartimente: rezervorul si compartimentul de ciclare. Un model simplificat al unui circuit
biogeochimic surprinde, in general, alternanta organic anorganic. In realitate exista numeroase
etape intermediare, reactii fizice (solubilizari, precipitari, volatilizari), chimice (oxidari, reduceri,
hidrolize) si activitati biologice (mineralizari, biosinteze), care concura la realizarea circuitelor
biogeochimice complexe.
Organismele vii preiau constant din litosfera, sol, apa si atmosfera cantitati mari de elemente pe
care le folosesc pentru sinteza de constituenti celulari sau pentru obtinerea energiei necesare
manifestarilor vitale . Organismele fototrofe (plante si bacterii fototrofe), ca punct de pornire al
ciclului, au capacitatea de a sintetiza substante organice, avand ca baza doar dioxidul de carbon
atmosferic si apa cu substante minerale din sol; o parte dintre aceste minerale au rol biologic
primordial, altele fiind necesare doar in cantitati reduse. Aceste substante incorporate in forme
organice traverseaza lanturile si retelele trofice, si se reintorc in sol dupa moartea ocupantilor
diferitelor nivele, dar intr-o forma care le face inutilizabile de catre fototrofe. In acest mod, se
produce o saracire constanta a mineralelor din sol, care completeaza pierderile produse de
eroziune, prin intermediul carora materia ajunge final in mediile oceanice, unde e depusa dupa
procesare ca sediment.
Circuitul azotului este mult mai complex decat al celorlalte elemente biogene, si este influentat
de rezerva uriasa de azot liber din atmosfera. Fitofiziologii impart ciclul biogeochimic al azotului
in doua sectiuni:
- ciclul mic, in care circulatia azotului se desfasoara intre organisme si sol, fara participarea
fondului de rezerva.
In plus, hifele ciupercilor din sol ofera suport pentru formarea agregatelor de sol, care contribuie
determinant la fertilitatea solurilor, iar activitatea lor metabolica ofera produsi de tipul
polizaharidelor, glomalinului sau lipidelor, cu rol in stabilitatea acestor agregate
In mod natural, azotul se gaseste in cantitati mari in atmosfera, dar sub forma inaccesibila a
azotului molecular N2, a carei tripla legatura plantele nu o pot desface. Fixarea biologica a
oxigenului este realizata de organisme denumite diazotrofe, dupa reactia:
Azotul fixat biologic reprezinta 65% din azotul fixat total, restul provenind din surse antropice
(sub forma de NH3) sau naturale.
Organismele implicate in fixarea azotului sunt numeroase, ele fiind clasificate in doua categorii:
- organisme care fixeaza liber azotul atmosferic, cum sunt reprezentanti ai genurilor bacteriene
Azotobacter, Azospirillum, Beijerinckia, Chromatium, Clostridium, Desulfovibrio, Klebsiella,
Paenibacillus, Pseudomonas, Rhodopseudomonas, Rhodosospirillum, Thiobacillus etc. dintre
arhee fixeaza azot doar membrii grupul Euryarchaeota in aceasta categorie sunt incluse
organisme care populeaza medii extrem de diverse: sol, apa, suprafata rocilor etc.
- organisme care fixeaza azotul in urma unor procese legate de simbioza cum sunt reprezentanti
ai genurilor bacteriene Rhizobium, Sinorhizobium, Mesorhizobium, Azorhizobium, Allorhizobium,
etc., sau al cianobacteriilor din genurile Frankia, Nostoc sau Anabaena , care fac parte din
rizosferele aferente radacinilor plantelor superioare, sau bacterii prezente in nodozitatile de pe
frunze, cum este cazul cu Mycobacterium rubiaceum la Rubiaceae.
Procesul de fixare a azotului este strans legat de enzima denumita nitrogenaza, productia ei fiind
coordonata de un set de gene denumite gene nif, identificate la peste o suta de specii , izolata
prima data la clostridii . Cercetarile in domeniu au aratat ca circa 10% din genurile bacteriene
chemotrofe contin nitrogenaza, avind, deci, capacitatea de a fixa azot atmosferic , iar dintre cele
fototrofe, 92% contin enzima. Marele dezavantaj al acestei enzime este sensibilitatea ei la
actiunea oxigenului , astfel ca microorganismele diazotrofe sunt, in mare parte anaerobe si sunt
incapabile de fotosinteza, cele doua functii – fixarea azotului si fotosinteza – fiind considerate
incompatibile.
Totusi, un grup de cianobacterii pot realiza ambele procese, fiind printre putinii reprezentanti ai
lumii vii capabili de acest fenomen: speciile respective formeaza, in lipsa azotului extern fixat,
celule denumite heterochisti, folositi pentru fixarea azotului, in timp ce celulele normale vor
asigura functia fotosintezei; aceasta metoda este folosita tocmai pentru a proteja nitrogenaza de
actiunea oxigenului . Un mecanism similar apare la cianobacterii filamentoase , care diferentiaza
anumite celule ale filamentului pentru fixarea azotului, eliminand din aceste celule reactiile
producatoare de oxigen ale fotosintezei.
Anumite cianobacterii fara heterocisti, cum sunt unii membrii ai genurilor Trichodesmium sau
Katagnymene, sunt capabile, de asemenea, de ambele procese: dat fiind ca oxigenul si
nitrogenaza sunt incompatibile, cianobacteriile opereaza alternativ cele doua aspecte, fotosinteza
si fixarea azotului, ultima in absenta luminii . In fine, Streptomyces
streptomicetul
thermoautotrophicus dispune de o nitrogenaza speciala, puternic oxid-dependenta, toleranta la
oxigen, fiind singura specie la care a fost identificata o astfel de substanta.
Acest dezavantaj este rezolvat usor de microorganismele „asociate” cu plantele, care sunt
prezente in nodozitati care ofera izolare fata de mediul extern, protejandu-le de concurenta cu
speciile prezente in sol, dar protejand si nitrogenaza de actiunea oxigenului. Din cauza eficientei
ridicate, fixarea azotului prin acest mecanism are o pondere mult mai ridicata, fixarea libera a
azotului fiind considerata sporadica, dificila si cu rol extrem de redus in fertilitatea solului.
Azotul din materia organica moarta (proteine, aminoacizi, acizi nucleici) este degradat de
microorganisme la amoniac, proces denumit amonificare sau mineralizare, valabil si pentru alte
substante organice cu continut de azot ajunse pe sol. La acest aspect contribuie un larg numar
de microorganisme, denumite in mod generic saprofite sau descompunatori, care au importantul
rol in circuitul elementelor de a mineraliza toate categoriile de elemente chimice, pentru a le face
accesibile din nou organismelor fototrofe. Rolul acestor organisme nu se reduce la circuitul
azotului, ele fiind in egala masura importante si pentru circuitul celorlalte elemente chimice.
Amoniacul astfel produs poate fi fixat in argile sau sol, poate fi asimilat ca atare de plante sau
microorganisme, se poate evapora, sau poate fi convertit la nitrat printr-un proces in doua faze
denumit nitrificare:
in prima serie de reactii, amoniacul este oxidat la nitrit, cu NH 2OH ca produs intermediar:
Nitrificarea este extrem de importanta in circuitul azotului, deoarece aduce substantele azotate
din mediu la forma lor cu cea mai mare accesibilitate pentru plante.
In ultima etapa a acestui ciclu, azotul este eliberat sub forma moleculara in atmosfera, si ciclul
este reluat. Etapa este realizata pe doua cai: o cale aeroba, denumita denitrificare, constand in
reducerea nitratilor la azot, si o cale anaeroba, care ocoleste nitrificarea, transformand direct
amoniacul in azot molecular, cunoscuta ca oxidare anaeroba a amoniacului sau annamox.
In mod indirect anumite organisme pot influenta circulatia azotului, cum este cazul bacteriilor din
genul Azospirillium‚ fixatoare de azot, deci cu rol direct in circuit, dar care produc hormoni
similari cu ai plantei, influentand cresterea mai puternica a radacinii, si, deci, formarea unui
sistem de absorbtie si de fixare a azotului mai eficient. In plus, anumite specii de
microorganisme (bacterii, arhee, fungi) prezinta mecanisme de rezistenta la poluarea cu metale
grele sau alte substante nocive, si isi desfasoara in conditii aproximativ normale functiile, putand
mobiliza substantelor din sol pentru consumul plantelor, ceea ce constituie un avantaj pentru
acestea din urma in propria dezvoltare .
Circulatia carbonului, este strans legata de activitatea energetica a biosferei, reducerea lui
chimica la compusii organici constituind modul principal de inmagazinare si transfer ale energiei
de catre sistemele vii. Ciclul biogeochimic al carbonului releva faptul ca cea mai mare parte
(95%) din acest element se afla depozitat in litosfera, sub forma de carbonat de calciu si alti
carbonati, deci intr-o forma mai putin accesibila.
Producatorii primari consuma anual aproximativ 105 miliarde tone de dioxid de carbon, din care
32 miliarde tone se reintorc relativ repede in atmosfera datorita respiratiei acelorasi organisme.
Cea mai mare contributie la reintoarcerea dioxidului de carbon in atmosfera o au celelalte
categorii de organisme, care elimina anual in atmosfera circa 73 miliarde tone.
Carbonul ocupa un loc deosebit in biosfera deoarece serveste ca material de constructie pentru
viata organica si reprezinta o sursa de energie ce se elibereaza in procesul respiratiei. Cantitatea
de carbon din biosfera este aproximativ 9% raportat la cel atmosferic. La fel de important este si
rolul carbonului anorganic: CO 2 din atmosfera contribuie la reglarea climei iar sistemul CO 2 -
carbonat regleaza permanent pH-mediului acvatic.
se formeaza anual 2,3x1011 t substanta organica uscata si 2,5x1011 t O2. Aproape toata aceasta
cantitate de oxigen este folosita in procesele de respiratie si fermentatie a substantelor organice
de catre organismele heterotrofe, nefotosintetizatoare, in special bacterii. In urma acestei
activitati bioxidul de carbon se intoarce in atmosfera si este folosit de catre plante la fotosinteza.
Se apreciaza ca cea mai mare parte, daca nu chiar intreaga cantitate de oxigen liber prezent an
atmosfera este de origine biogena, iar intreaga cantitate de materie organica din biosfera actuala
este rezultatul fotosintezei.
Cele doua mari circuite biogene sunt in mare masura interdependente, iar acest lucru este cel
mai bine reprezentat de ecuatia reactiei fotosintezei, procesul major la care cele doua elemente
participa:
Prin aceasta reactie chimica se asigura circulatia ambelor elemente si se produc substantele
functionale necesare vietuitoarelor. In mod invers, prin procesul de respiratie, dar si prin
procesele de descompunere a materie organice moarte, oxigenul si carbonul sunt reunite sub
forma de CO2, si ciclul se reia. Intregul proces este mediat de ionii de hidrogen, care fac parte,
pe rand, din moleculele organice si din cele de apa, astfel ca cele trei cicluri biogeochimice sunt
puternic legate unul de celalalt .
Dintre microorganisme, participantii la acest complex de cicluri biogeochimice fac parte
doua mari categorii:
- microorganismele saprofite, grup din care fac parte arhee, bacterii, fungi, care redau carbonul
si oxigenul sub forma de CO2 circuitului natural; activitatea acestor organisme se realizeaza in
doua medii principale: pe sol si, mai ales, in sol, unde exista microorganisme capabile sa
descompuna materia organica, de la substante simple, de tipul glucidelor sau amidonului, la
structuri chimice mai dificile, cum sunt celulozele si hemicelulozele, pectina, cutina sau chitina, si
in mediile acvatice, unde o parte importanta din materia organica descompusa este transformata
in CaCO3, depozitat pe fundul bazinelor oceanice, el fiind redat circuitului in proportie redusa prin
respiratie sau eruptii vulcanice subacvatice.
Cu un rol mai restrans in circuitul carbonului si al hidrogenului sunt circa 50 de specii de arhee
anaerobe, apartinand grupului Euryarcheota, care sunt cunoscute ca metanogene, din cauza
faptului ca au ca produs metabolic metanul, ca urmare a folosirii hidrogenului ca agent reducator
si a dioxidului de carbon ca sursa carbonatica.
Spre deosebire de oxigen, hidrogen si azot, al caror fond de rezerva se afla in atmosfera sau in
hidrosfera, in cazul fosforului, fondul de rezerva se afla in litosfera. Principalele rezerve de fosfor
sunt reprezentate prin roci de tipul apatitelor si depozitelor de guano, de animale fosilizate. In
concentratii diferite sunt dispersate pe toata suprafata uscatului. Prin descompunere si spalare
de catre ape, rocile cedeaza fosfor biocenozelor din ecosistemele terestre. Absorbit de catre
plante, fosforul intra in alcatuirea compusilor macroenergetici si a acizilor nucleici, conditionand
desfasurarea transferurilor de energie si informatie in sistemele vii. Prin intermediul lanturilor
trofice, compusii fosforului sunt transferati animalelor consumatoare si descompunatorilor .
Ciclul fosforului este relativ simplu din punct de vedere chimic, elementul fiind preluat ca fosfat
anorganic solubil din sol de catre microrganisme si plante, si incorporat in forma organica prin
esterificarea ionului fosfat. Dupa moartea organismelor, fosfatul organic eliberat este reconvertit
in forma anorganica, pe tot acest parcurs elementul ramanand parte a gruparii fosfat, iar
circulatia lui in ecosistem se produce in aceeasi stare de oxidare.
- utilizarea directa de catre unele microorganisme a circa o treime din fosfatul tricalcic prezent in
mediu, cu eliberarea fosforului la moartea organismului intr-o forma accesibila plantelor.
Fosforul organic, sub forma de dejectii animale si tesuturi animale si vegetale moarte ajunse pe
sol, este redat circuitului biologic printr-un proces in doua faze:
- scindarea lui cu formare de acid fosforic, sub actiunea bacteriilor levurilor sau microfungilor ,
acid legat imediat de bazele din sol, trecand in saruri insolubile pentru plante;
- dizolvarea sarurilor de catre bacterii nitrice, thiobacterii si chiar unii amonificatori , cu formare
de fosfati tri-, di- si monocalcic, care inchis ciclul.
Fosforul organic este cel cu importanta majora in circuit, datorita cantitatii reduse a acestui
element in scoarta terestra, astfel ca disponibilitatea fosforului este redusa in sol, datorita, in
principal, reactiei rapide a formei organice cu aluminiu, calciu si fier, si vitezei reduse de
metabolizare a sarurilor formate; din acest motiv, microorganismele pot intra in competitie cu
plantele pentru fosfor, in conditii vitrege, pentru a sustine continutului ridicat de acizi nucleici din
celula lor .
Circuitul sulfului se aseamana, in multe privinte, cu cel al fosforului . Sulful parcurge un circuit
activ sub forma redusa (H2S) sau oxidata strabatand cu intensitate variata toate invelisurile
exterioare ale Pamantului. Cantitatea antrenata in acest circuit este evaluata la 185 x 10 6 tone .
In forma redusa, acest circuit este explicat de transformarile dintre cel mai redus element,
sulfura, si cel mai oxidat, sulfatul, transformari in care microorganismele joaca un rol important;
in plus, sulful este important in constructia celulara, putand ajunge la 1% din greutatea uscata.
- reducerea formelor oxidate, prin procesele de reducere asimilatorie, realizata pentru folosirea
acestora ca sursa de sulf de microorganisme nespecializate si de reducere dezasimilatorie,
realizata de bacteriile din genul Desulfovibrio, care utilizeaza compusii sulfului in respiratie,
producind cantitati mari de H2S;
- oxidarea sulfului, fie de catre bacterii sulfooxidante fotosintetizante, care depun in celula sulf
elementar pentru a-l folosi in lipsa elementului din
mediu, fie de catre bacterii sulfooxidante chemosintetizante , care folosesc energia eliberata prin
oxidarea sulfului pentru reducerea CO2.
Cicluri biogeochimice similare fosforului si sulfului sunt proprii si altor elemente chimice
care se afla in compozitia oricarui organism. Datele oferite de geochimie si biologia
contemporana nu sunt insa in aceeasi masura de bogate pentru aceasta categorie de elemente.
Resursele de elemente metalice variaza in limite extrem de largi, reprezentand fie componente
esentiale ale masei terestre, fie concentratii infime in alcatuirea acesteia.
Anumite specii bacteriene au capacitatea de a transforma fierul din forma solubila in forma
insolubila si invers . Solubilizarea compusilor organici ai fierului este produsa de o micoflora
heterotrofa nespecifica (microorganisme proteolitice si amonificatoare), care duce la precipitarea
fierului in forma organica, cu un rol mult mai important decat activitatea microorganismelor
specifice (idem). Acestea din urma transforma compusii minerali ai fierului, fiind cuprinse in
aceasta categorie forme acvatice ca bacteriile Spaerotilus natans, Leprothrix ochracea sau
Crenothrix polispora, care formeaza filamente acoperite de o teaca mucilaginoasa impregnata cu
hidroxid feric si hidroxid de mangan, Gallionela ferruginea sau Caulobacter blastocaulis, forme
pedunculate, al caror peduncul poate fi impregnat cu hidroxid de fier, sau bacterii anaerobe sau
facultativ anaerobe care reduc sau oxideaza succesiv cele doua forme ale fierului.
Rolul fierului in rizosfera este important, datorita cantitatii mici existente, elementul stand la
baza unei competitii intre plante si microorganisme, dar si intre diferitele specii de
microorganisme, competitie care a dus la crearea unor strategii de absorbtie rapida, care implica
acidifieri locale, chelatii, reactii de reducere etc.
Microorganismele au un rol important in eliberarea din roci a unor elemente cum sunt Ca, Fe,
Mg, K, fie prin mecanisme fizice: hife si filamente introduse in fisuri, fie prin mecanisme chimice:
eliberare de enzime, acizi, polizaharide, care slabesc rezistenta rocii. In fine, anumite specii de
halobacterii acumuleaza KCl pentru a compensa salinitatea, avand un rol restrans in mobilitatea
K.
Bibliografie
2. www.wikipedia.org
4. www.annamox.com
5. www.enviroliteracy.org