Sunteți pe pagina 1din 39

2/4/2016

PRELUCRAREA IMAGINILOR
BIOMEDICALE

2015/2016
Prof. Dr. Ing. Constantin VERTAN
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Cursul
1

Chestiuni administrative
Aplicatii ale PAI
- nemedicale
-biomedicale
Notiuni fundamentale
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

Chestiuni administrative
Cod curs: 14.S.08.O.111 - 4 p
puncte credit
Curs:
2 ore/ saptamana
Laborator: 2 ore/ saptamana, cu subgrupa
Punctare: 40 puncte lucrare verificare 12 aprilie
40 puncte lucrare verificare 17 mai
20 puncte colocviu
l i de
d llaborator
b
(20 test laborator
0 puncte prezenta laborator)
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Chestiuni administrative
Laborator (B138):
S.l. Dr. Ing. Marta ZAMFIR

Birou (B139)

http://alpha.imag.pub.ro/cursuri
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

Chestiuni administrative:
Bibliografie
tiparit:
C. Vertan, M. Ciuc:
Tehnici fundamentale de
Prelucrarea si Analiza Imaginilor,
Ed. MatrixROM, Bucuresti, 2007.

on-line:

http://alpha.imag.pub.ro/cursuri
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Aplicatii ale PAI


Imagini
g de consum
Imagistica satelitara
Supraveghere
Aplicatii industriale
Protectia proprietatii intelectuale
si multe altele
Domeniul bio-medical
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

Aplicatii ale PAI:


imagini de consum
Corectia
C
ti imaginilor
i
i il in
i aparatul
t l foto:
f t
ochi rosii
iluminare
puncte defecte si praf
Gestiunea colectiilor de imagini

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Corectia iluminarii

2/4/2016

Corectia automata a
efectului de ochi rosii

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Infrumusetare
automata

2/4/2016

Infrumusetare automata

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Detectia automata a
continutului sensibil:
family filter

Renoir :
Nud
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

Gestiunea colectiilor de imagini

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Rezultatul cautarii de imagini


Examplu: nufar galben

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

Aplicatii ale PAI:


imagini satelitare
I t
Interpretarea
t
automata
t
t a imaginii
i
i ii
Compresie
Gestiunea continutului

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

2/4/2016

IKONOS

QuickBird

2/4/2016

Imagistica satelitara
SPOT (1: 1986, 5: 2002) : 2.5m panchromatic
10m multispectral
60Km x 60 Km
IKONOS (1999) : 1m pan/ 4m multispectral
EROS (2001) : 0.67m hyperesantionat panchromatic
9Km x 9 Km
QuickBird (2001) : 0.61m pan/ 2.4m multispectral
16.5Km x 16.5 Km
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Aplicatii ale PAI:


supraveghere
Securitatea incintelor
Prevenirea furtului la statiile de benzina
Prevenirea copierii la examene ?
Biometrie
Protectia persoanei
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

10

2/4/2016

Identificarea persoanelor

Iris

Amprenta digitala

Fata

01110010111..
Recunoastere ?
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Eye tracking and


measurement
eye surgery
driver fatigue detection
media and publicity

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

11

2/4/2016

Aplicatii ale PAI:

sky is the limit....

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Aplicatii ale PAI:


imagistica medicala
Parte
P
t a modului
d l i de
d obtinere
bti
a imaginii;
i
i ii
diferite modalitati imagistice
Interpretarea automata a imaginii

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

12

2/4/2016

Raze X

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

13

2/4/2016

LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Osteoporosis screening
PACS

Calcaneal X-ray

decision
<=10% MD
<=15% FA

ROI 0
ROI 1
ROI 2

augmented
MPEG-7
description

supervised
classification

LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

14

2/4/2016

Mamografii standard din baza MIAS.

normal

mase chistice maligne

Radiological characterization of
breast masses (BI-RADS) (Univ. of Calgary)

15

2/4/2016

Content-based retrieval and analysis:


benign mass example

Content-based retrieval and analysis:


malignant tumor example

16

2/4/2016

X-ray CT

17

2/4/2016

NMR tomograhy

Rezonanta magnetica
nucleara RMN

RMN

18

2/4/2016

Ultrasunete

1 - 18 MHz
300 16 m (lungime de unda)
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

19

2/4/2016

Spectru
vizibil

750nm

350nm

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Timpan

20

2/4/2016

Melanoame de piele
Descrierea automata: criteriul ABCD
A - asimetrie
B - bordura
C - culoarea
D - diametrul

Problema : stabilitatea achizitiei


culorii
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Retina

21

2/4/2016

Iris

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

22

2/4/2016

Limba

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Histologie

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

23

2/4/2016

Radiatie
termica

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Imagini termografice

24

2/4/2016

FLIR One

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR

25

2/4/2016

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR

26

2/4/2016

Cursul
1

Notiuni fundamentale

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

27

2/4/2016

Tentative de definire
Image
g processing
p
g holds the possibility
p
y of
developing the ultimate machine that could
perform the visual functions of all living beings.
(Anil K. Jain, 1989)

Prelucrarea si analiza imaginilor reprezinta un


ansamblu de metode de transformare si
interpretare a informatiei vizuale, reprezentate
in forma digitala.
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Vizualizare
A hi iti
Achizitie

Grafica pe
Calculator

Prelucrarea Imaginilor
Multimedia

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

28

2/4/2016

Notiuni fundamentale
Sistemul tipic de PAI
Pixelul
Clasificari

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Sistemul tipic de PAI


Compunere
p
la nivel fizic :

- senzor (traductor)
- esantionare si cuantizare
- sistem de calcul
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

29

2/4/2016

Sistemul tipic de PAI

Compunere la nivel logic


(in sistemul de calcul):
Imbunatatire

Restaurare

Segmentare

Analiza

Compresie
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Compresie

Compresia:
Reducerea cantitatii de informatie (date) necesara
stocarii/ transmiterii imaginii.
Compresie
p
JJPEG;
Raport compr.=50

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

30

2/4/2016

Imbunatatire

Restaurare

Segmentare

Analiza

Imbunatatirea:
Reducerea degradarilor perceptuale si/ sau aleatoare
ale imaginii

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Imbunatatire

Restaurare

Segmentare

Analiza

Restaurarea:
Reducerea degradarilor
deterministe ale imaginii:
- focalizare
- compensarea miscarii
- defecte de optica .
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

31

2/4/2016

Imbunatatire

Restaurare

Segmentare

Analiza

Segmentare:
Descompunerea
imaginii (scenei)
in partile sale
constituente.

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Imbunatatire

Restaurare

Segmentare

Analiza

Analiza:
Descrierea partilor (obiectelor) din imagine si a
relatiilor dintre ele; decizii/ clasificari
De la obiecte la numere (functii, schite, ...):
011 000 111 .

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

32

2/4/2016

Cursul
1

Definitii si Clasificari

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Ce este imaginea ?
Imaginea este un ansamblu de valori plasate
dupa o forma spatiala de dimensiune supra-unitara
( l volum,
(plan,
l
... dar
d nu o dreapta).
d
t )
Simplist, imaginea poate fi interpretata ca un
tablou sau matrice.

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

33

2/4/2016

Elementul de baza al unei imagini


picture element = pixel
O mica analogie :
Imagine = mozaic sau puzzle
Pixel = pietricica din care se construieste mozaicul

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Caracteristicile pixelului
pozitie : linie, coloana
k

valoare

imagine
dimensiune
legatura cu realitatea fizica
forma
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

34

2/4/2016

Dimensiunea pixelului
Ce dimensiune are in scena reala obiectul care
in imagine are 1 pixel ?
Dimensiune pixel = 1/ Rezolutie

Ex: un document scanat


1 pixel = 1/ 300

300 dpi

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Forma pixelului
Esantionare
Problema acoperirii planului.

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

35

2/4/2016

Ce fel de valori sunt in imagine ?


Valori digitale: numere reprezentate cu un numar
finit de biti, dupa un format standard pentru un
calculator [digital].
Digital Numeric
Rezultatul oricarui calcul este numeric, dar nu
orice numar este digital.
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Clasificarea imaginilor dupa tipul valorilor


Imagini scalare
Orice valoare e un scalar:
imagini monocrome (binare)
imagini alb-negru (cu nivele de gri)
Imagini vectoriale
Orice valoare este un vector; imaginea vectoriala
este un sandwich de imagini scalare.
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

36

2/4/2016

Imagini vectoriale
Imagini color: vectori de 3 componente
(R, G, B) - reprezentare tipica, dar nu unica

Imagini satelitare: vectori de 3 - 200 componente


Imagini termografice: vectori de 2 - 5 componente
in banda de infrarosu
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Clasificarea imaginilor dupa semnificatia valorilor


Imagini de intensitate
Valorile sunt direct proportionale cu marimea
fi i masurata in
fizica
i scena.
Imagini indexate
Valorile NU proportionale cu marimea fizica
masurata in scena.
Valorile sunt indici (adrese) intr-un tabel asociat
imaginii, in care se gaseste informatia de intensitate.
C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

37

2/4/2016

LUT - Look Up Table (mecanismul de indexare)


0
1

imagine

vk1, vk2 vkN

tabel asociat
numar de
d li
linie
i
(adresa/ index)

valori de
intensitate

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

Imagini color indexate

imagine

Imagine

0
1

k Rk, Gk, Bk

tabel de culoare
tabela de culoare

Afisare

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

38

2/4/2016

Valoarea pixelului vs. conventii de afisare


Imaginea ce se vede pe un ecran nu este neaparat informatia reala
achizitionata din scena investigata.
In general, imaginilor li se adauga si conventiile de afisare a valorilor,
ce sunt stabilite de utilizator.
Aceste conventii sunt deci subiective si independente de continutul
imaginii.
Actiunea este de modificare a perceptiei vizuale a imaginii, si nu
a continutului imaginii.

C. VERTAN
LABORATORUL DE ANALIZA I PRELUCRAREA IMAGINILOR - LAPI

39