Modelul pentru evaluarea genetica a animalelor (Model Mama). Presupunem ca avem urmatoarele date pentru 3 vaci de lapte: Vaca | _Numarul lactatiei Anul fatarii Prod. lapte (kg) > 1993 6410 : 2 1994 7250 1 1994 6590 2 Z 1995 7070 om 3 1 1995 6540 _ Modelut de ecualie Cu care se pomeste este ‘urmatorul: Yow = 1 +5 + C+ Bin unde: Yin = Observatiile privind productia de lapte; L, = efectul numarului lactatiei, productia vacilor crescénd odata cu marirea numarului de ordine a lactatiei; J, = efectul anului de fatare, conditiile de mediu fiind, de regula, diferitéin fiecare an. Ratiile pot fi schimbate, precipitatiile pot fi mai abundente, conditiile de depozitare a furajelor pot fi diferite etc; C, = efectul vacii; Ey = efectul rezidual care contine factorilor pe care nu fi lam in considerare in acest model. Consideram ca aceste efecte sunt intimplatoare pentru fiecare observatie si, deci, media lor este zero. Efectele reziduale sunt de obicei destul de mari si perfectiuonarea modelului incearca sa reduca importanta lor. Etapele necesare pentru construirea ecuatiei modelului mixt sunt urmatoarele: 1). Lista parametrilor modelului si calculare sumei observatiilor. Elementele modelului Observatiile Total lotafiil L, - Lactatia 1 6410, 6590, 6540 | 50, 7070 14320 L, - Lactatia 2 7250, 7 Li. no} J Anul 1993 | 6410 6410 J, - Anul 1994 J, - Anul 1995 7250, 6590 13840 Yo 7070, 6540 C, - Vaca 1 6410, 7250 C, - Vaca 2 6590, 7070 C, - Vaca 3 6540 6540 2). Construim matricea inijiala:=< oie Jiiste + Ho} S o|-ocly Ec vuedsblo Sud ; x kK = BOA Piola 2 ose 2 Dore SyNotatiile | L | Lf | st | bh pa} al a Total iL. 3 | of 1 1 1 1 1 1 19540 ie o | 2 0 1 1 1 1 0 14320 a! h 1 0 1 0 0 1] ol] 0 6410 hk 1 1 o | 2 0) 1 1 0 13840 iy 1 1 o |} 0 2 0 1 1 13610 Gi 1 1 1 1 0 2 0 0) 13660 G 1 1 0 1 1 0 2 | 0 13660 G 1 0 o | 0 1 o | 0 1 6540 cum, aceste numere pot we ° ecorooH oH 0 ee eee Pere ae. an ao eS oO no corooror corHon Fee pes fa oneronone ee onooee T scrise intr-o matrice, objnan cunoastem sub numele de "ecuatiile patratului celui mai mic" ("LS equations"). Ecuatiile "LS", in cazul nostru, sunt urmatoarele: He reonooee cone eere enoeweoere & aRo-- Oo K cod » recHtoco- coHrocoe I+ | SPS S Ki a na 19540 14320 6410 13840, 13610 13660 13660 6540 19540 14320 6410 13840 13610 13660, 13660, 6540 7) ccuatiile pe care Te196} pantaaba 3). Adaugam valoarea lui k la diagonala parti ZZ a matricii.&= vase a Ee, ok ed k = (1- h/t? = (1 - 0,25)/0,25 = 0,75/0,25 = 3 variation gone! Noile ecuatii (MME) sunt: povs ped ole Lap bet 30111111 02011110 10100100 wii lozo110) 11002011 11110500 11011050 10001004 4). Rezolvam ecuatiile. Presupunem ca L, = 0. in acest caz este necesar sa marim ecuatia prin adaugarea unei linii si a unei coloane la matricea W, care ne spune ce solutii se fac nule, asa cum se observa la @). 301l11itiit * 19540, 020111100]]%1 |14320 Wetmore, Cui 101001000|/%| | 6a10 Ter mmateiian tolewh eo 110201100/|4] |13840 pi] Mek Goan 11002011 0/}4,)=|13610|@) y-ty.x 2AM me 111105000 C, L1O110500)¢ TON 0'D GO OL Loo0oo00g|¢ — LS 3 aa (adaugat la W) (adaugat la b) (adaugat la t) Aceasta ultima ecuatie este numita "Factor Lagrange " sau "Lagrange Multiplier" (LM). Solutiile pe computer, folosind programul MATLAB, sunt urmatoarele: 02,8; C, = 7,2; ©, =-14,4; S111; C =,7,2 Explicatia solutiilor obtinute este urmatoarea: L, = 595 este o estimata a diferentei dintre L, si L,. Aceasta arata ca vacile aflate in lactatia a Tl-a au avut o productie medie de lapte, mai mare cu 595 kg faja primipare; J, = 6402,8 este o estimata a relatiei p + J, + L, (media primei lactatii a vacilor careau fatat in anul 1993; J, = 6626,1 este o estimata a relatiei « + J, + Ly (media primei lactatii a vacilor care au fatat in anul 1994; J, = 6511,1 este 0 estimata a relatiei p + J, + L, (media primei lactatii a vacilor care au fatat in anul 1995; Valorile de ameliorare calculate sunt urmatoarele: C, = 7,2 Kg si reprezinta estimata valorii de ameliorare (EBV) pentru vaca I: -14,4 Kg si reprezinta estimata valorii de ameliorare pentru vaca 2; 7,2 kg si reprezinta estimata valorii de ameliorare pentru vaca 3 G Model pentru evaluarea reproducatorilor (Model Tata). Sa presupunem ca avem urmeloarele informatfi privind descendents a trei reprodyeatori in doua ferme: esstqul enic pentru ckscenclnta a hei ceton’ im obud ferme. i Reprodu- Ferma | Forma? —_| Total 1 Poteet el gee ee fe den) ! 4 480d” & 840 | yoyo yo | __ 1320. 2 50 6250 0 0 50. 6250 3 50 7250 50. 100 14000 Total 2 104 13980 6 160 21570 felul ideal pentru datele respective este urmatorul Yu = HEH +S, + ey unde: = media totala; H, = efectul fermei; S, = efectul reproducatorului, reprezentind 1/2A, (As = valoarea de ameliorare); ey = efectul rezidual (E + 1/2A,). Pentru construirea ecuatiilor modelului mixt, trebuie sa parcurgem urmatoarele etape: 1, Lista elementelor modelului si calcularea sumei observatiilor. Elementul Suma Natatia X 21570 y H, 13980, yp H, 7590 & Yan Ss, 1320 Ye S. 6250 Ya Ss in 14000 You2. Reluam fiecare total si scriem urmatorul model. Notatii a H, H, S, Ss. 8, Total H 160 104 56 10 50 100 | 21570 H, 104 |) 104 o | 4 50 50 13980 H, 56 | 0 56 | 6 0 50 7590 S 10 4 6 10 Oe ee 2) Si 50 50 0 0 50 0 6250 S, 100 50 50 0 0 100 14000 ——— ‘onstruim matricile modelulut ecuatiilor mixte, 160 104 56 10 50 100] [*] [21570 104 104 0 4 50 50] |} | 13980 56 0 56 6 0 50] |/4}_ | 7590 10 4 6 10 0 0} |S) | 1320 50 50 0 0 50 OJ} 5) | 6250 100 50 50 0 0 100]|5 a0 Ostrich abe 4A Las Te) eee 4, fn cazul testului descendentei, k = (4- ht) / ht = 3,75/0,25 = 15 Ate,rS pres % Ape 5. Adaugam valoarea lui k la diagonala corespunzatoare lui S,, Ecuatiile modelului mixt vor fiz tos 104004 = 50 50 | J) J 13980 56 0 56 6 0 50 |] 4] | 7590 10 4 6 10415 0 0 1320 50.50 0 0 s0¥is 0 |] s,] | 6250 0 100415 160 104 56 10 50 100 21570 100 50 50 06. Pentru a obtine solutiile, este necesar sa introducem un algoritm. Daca luam H, = 0, ecuatiile sunt urmatoarele: ms 0 104 104 0 4 50 50 1 536 0 566 0 500 10 4 6 20 0 offs 50 50006 00 100 50 50 0 0 115 0 0. i 160 104 56 10 50 100 21570 o 1000 0 Dupa rezolvarea ecuatiilor pe computer, utilizind programul MATLAB, solutiile obtinute sunt urmatoarele: 4 = 134,54 = x +H, S, = 0,2672 = 1/2Ay H, = 0 S, = -7,3394 = 1/2 Ae H, = -5,3487 = w-H, S, = 7,0722 = 1/2 As Exercitii de rezolvat: Model mama Vaca__| _Numaral lactatiei Anul fatarii Prod. lapte (kg) 1 1996 6300 ! 2 1997 6550 1 1997 6210 2 2 1998 6450 3 1 1997 6280 2 1998 6400 4 I 1998 6360 “Model tata Reprodu- Ferma | Ferma 2 Ferma 3 Total 1 catorul nr. | suma | nr. | suma| or. | suma | nr. | suma 1 10 | 1300 | 15 | 2100] 5 | 630 | 3 2 8 | 1150 | 6 | 820 | 24 | 3160 | 33 3 35_| 6250 | 0 | oO | 12 | 1550 [4% 4 25 | 3250 | 28 | 3700| 0 o (53 Total2 | 73 | 1980 Ica / -