Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
CONCEPTUL DE BACTERIE
Primele bacterii au fost evideniate i descrise de ctre A. Leeuwenhoek n 1675. Recunoaterea lor ca grup distinct a fost fcut n perioada 1850-1875 de ctre Cohn, pe baza proprietilor grupului omogen al eubacteriilor. Stanier i Lwoff (1973) consider c F. Cohn este adevratul fondator al bacteriologiei ca ramur a biologiei. Descoperirea diferitelor grupuri de bacterii (actinomicete, spirochete, mixobacterii etc.) a scos n eviden multe caractere care nu sunt unitare, de exemplu: au fost derscrise bacterii imobile sau mobile prin unul sau mai muli flageli, prin alunecare, trre sau prin contracia unui folament axial; s-a evideniat c multiplicarea se poate face prin diviziune, nmugurire sau formare de celule specializate (spori), sau prin segmentare i fragmentare (la actinomicete); unele bacterii (actinomicetele) prezint, datorit structurii lor miceliene, analogii frapante cu grupul fungilor n care au fost ncadrate mult vreme; mixobacteriile prezint un ciclu de dezvoltare complex, care include un stadiu de cretere vegetativ i unul de fructificaii policelulare, adesea cu dimensiuni macroscopice ca protistele amoeboide.
Conceptul de bacterie a fost definit n perioada 1960-1964, oferind posibilitatea de a grupa pe criterii obiectiv-tiinifice, discriminatorii, microorganismele reunite pn atunci numai pe baz de acord pur convenional. Stanier (1962, 1964, 1967) a demonstrat primul c diversificarea prin evoluie a lumii bacteriene are la baz un caracter comun celula procariot. Conceptul de bacterie, n forma sa actual poate fi definit n funcie de aceast organizare procariot i prin antitez cu tipul de organizare eucariot.
Celua procariot, mai puin complex, este unitatea de structur a bacteriilor sensu lato i a algelor albastre-verzi. Celula eucariot, mai complex, este unitatea de structur a tuturor celulelor animale, a plantelor vasculare, a briofitelor, a fungilor i a tuturor celorlalte grupuri de alge. Divergena fundamental care separ bacteriile i algele albastre-verzi de toate celelalte organisme, corespunznd diferenei dintre tipul procariot i eucariot, reprezint cea mai mare discontinuitate evolutiv prezent azi n lumea vie. Nu se cunosc intermediari ntre procariote i eucariote, adic nu se cunosc organisme cu o structur celular de tranziie. Dodge (1965, 1971), pornind de la observaia c dinoflagelatele au unele caracteristici ale procariotelor i altele aparinnd eucariotelor propune includerea lor ntr-un grup intermediar Mesokariota. Cercetrile de microscopie electronic i cele de biologie molecular au dezvluit i accentuat discontinuitatea dintre procariote i eucariote i au dus la acumularea unui numr important de caractere discriminatorii, care permit s se stabileasc ceea ce este realmente tipic i ceea ce este numai aparent i superficial similar, pentru ncadrarea pe baze tiinifice a diferitelor entiti ntr-un grup sau altul.
faptului c nu exist nici o cale bun pentru a separa organismele eucariote inferioare de cele superioare, ci numai diferite alternative de opiune, cu dificulti i incnveniente diferite. Lund drept criteriu nivelul de difereniere tisular, apartenena algelor i a fungilor superiori la regnul Protista este o consecin imediat, care atrage dup sine o a doua, eterogenitatea lui. Linia de demarcaie ntre Protista, pe de o parte, i plantele i animalele superioare, pe de alta, este trasat, n primul rnd de gradul de difereniere tisular situaie care creeaz o delimitare destul de neclar. n fapt, regnul Protoctista reprezint mai curnd o confederaie de organisme excluse din celelalte trei regnuri (Monera, Plantae, Animalia), care cuprinde o foarte larg gam de organisme cu diferite niveluri intermediare de organizare, superioare n raport cu procariotele, dar inferioare plantelor vasculare i animalelor superioare. Sistemul celor cinci regnuri, propus de Whittacher (1969), ncearc s ocoleasc deficienele sistemelor precedente, utiliznd urmtoarele criterii de grupare: 1. Stabilirea a trei niveluri de organizare: a) procariot; b) eucariot unicelulur; c) eucariot multicelular; 2. Existena a trei modaliti principale de nutriie, determinante a trei direcii majore de evoluie, care la nivelul multicelular (multinuclear) se exprim prin divergenele evolutive ale celor tri regnuri superioare: a. nutriia fotosintetic (secundar absorbtiv) caracteristic plantelor; b. nutriia ingestiv tipic pentru animale; c. nutriia absorbtiv caracteristic fungilor. Consecinele adoptrii acestor criterii sunt n esen pe lng unele restructurri ale grupelor mai mici urmtoarele: 1. apariia regnului Fungi ca al treilea regn de organisme superioare, alturi de plante i animale; 2. trecerea algelor verzi n regnul Plantae, alturi de plantele verzi superioare; 3. plasarea liniei de demarcalie dintre organismele superioare i protiste la trecerea de la unicelular la multicelular multinuclear. n acord cu aceste principii, sistemul celor cinci regnuri elaborat de Whittaker are urmtoarea structur: 1. Regnul Monera include organisme unicelulare de tip procariot, corespunznd bacteriilor, organisme cu existen unicelular-solitar sau unicelular-colonial, cu excepia actinomicetelor care au organizare de tip micelial. Modul de nutriie este predominant absorbtiv, iar metabolismul de tip foto- sau chimiosintetic. Reproducerea se face prin diviziune asexuat, mai rar prin nmugurire. Rar, prezint fenomene de protosexualitate. Imobile sau mobile (prin flageli simpli, de tip special, sau prin alunecare-trre). 2. Regnul Protista include organisme primar unicelulare sau unicelular-coloniale de tip eucariot. n unele cazuri sunt prezente stadii de via cu structur simpl sau multinuclear. Modul de nutriie este diferit de la un grup la altul (absorbie, ingestie, fotosintez sau combinaii ale acestor tipuri). Reproducerea este, de asemenea, de tip diferit, incluznd diviziunea asexuat (la nivel haploid) i procese sexuale adevrate, cu cariogamie i meioz. Sunt imobile sau mobile prin flagel de tip superior sau prin alte mijloace. 3. Regnul Plantae include organisme multicelulare cu celule eucariote, care au peretele celular celulozic, frecvente vacuole n citoplasm i pigmeni fotosintetici n plastide. Modul principal de nutriie este cel fotosinteic; unele linii au devenit absorbtiive. Esenial imobile, triesc ancorate pe un substrat. Prezint difereniere structural care duce la apariia unor organe de fotosintez, ancorare i de sprijin (suport), iar la formele superioare la formarea unor esuturi specializate fotosintetice, vasculare i de acoperire. Reproducerea este 3
n primul rnd sexuat, cu cicluri de generaii alternative, haploide i diploide, primele fiind progresiv reduse spre membrii superiori regnului. 4. Regnul Fungi. Exceptnd subregnul Gymnomycota, include organisme multinucleare, cu nuclei de tip eucariot, dispersai ntr-un sinciiu micelial, acoperit de un perete celular, adesea septet, caracterizate prin lipsa plastidelor i a pigmenilor fotosintetici. Nutriia este de tip absorbtiv. Diferenierea somatic este absent sau limitat; n schimb, diferenierea esutului reproductiv i complicare ciclului de via sunt foarte marcate la formele superioare. n primul rnd imobile (dar cu flux citoplasmatic n miceliu), triesc nclavate n mediu sau n sursa de hran. Prezint cicluri reproductive tipice, incluznd procese sexuale i asexuale. Micelii, cel mai des haploide la formele inferioare i dicariotice la multe forme superioare. 5. Regnul Animalia include organisme multicelulare de tip eucariot, fr perete celular, fr plastide i fr pigmeni fotosintetizani. Nutriia este n primul rnd de tip ingestiv, cu digestie ntr-o cavitate intern; unele forme sunt absorbtive; la unele grupuri lipsete cavitatea digestiv intern. La formele superioare nivelul de organizare i de difereniere tisular depete de departe celelalte regnuri, ducnd la apariia a diferite sisteme senzoriale neuromotorii. Motilitatea organismelor sau a prilor lor (la formele sesile) se bazeaz pe existena unor fibrile contractile. Reproducerea predominant sexuat; stadiile haploide, diferite de cele ale gameilor, aproape lipsesc la organismele situate deasupra filumurilor inferioare. Sistemul lui Whittaker, dei foarte recent creat, este agreat de un mare numr de specialiti, care consider c el reprezint cel mai bine relaiile dintre organisme, att n ceea ce privete nivelurile de organizare ale lumii vii, ct i modul de nutriie care afecteaz tipul de organizare. El are avantaje evidente n sensul unei mai pregnante coerene a regnurilor, ca uniti de clasificare decurgnd din precizarea mai net a caracterelor lor definitorii, dar i o serie de limitri care sunt evideniate chiar de Whittaker, dar care nu sunt legate de lumea bacteriilor.
1. Bacteriile sferice (cocii) au form sferic, ovoidal, elipsoidal, reniform, uneori neregulat, sau parial poliedric, diametrele celulei fiind aproximativ egale. Deoarece aceast form este adesea modificat de diferii factori de mediu este discutabil dac n stare vie celula este realmente sferic. n funcie de poziia celulelor-fiice dup diviziune, cocii prezint urmtoarele ase subtipuri morfologice: a) cocul simplu sau izolat, la care celulele rezultate din diviziune rmn independente; b) diplococul, la care diviziunea se face dup planuri succesive paralele, celulele rezultate rmnnd grupate cte dou (Streptococcus pneumoniae); c) streptococul la care diviziunea se face dup planuri succesive paralele, dar celulele rezultate formeaz lanuri de lungimi variabile, ca un irag de mrgele (Streptococcus pyrogenes); d) tetracocul sau tetrada, la care planurile succesive de diviziune sunt perpendiculare unele fa de altele, iar celulele rezultate sunt dispuse n grmezi de patru elemente (Micrococcus tetragenes); e) sarcina, la care planurile de diviziune sunt orientate n trei direcii diferite, perpendiculare unul pe alrul (al doilea pe primul, i al treilea pe primele dou), de unde rezult o grupare n cuburi sau pachete (Sarcina flava, S. aurantiaca); f) stafilococul la care planurile succesive de diviziune sunt dispuse n cteva direcii, iar organismele rezultate se aranjeaz n grupri neregulate n form de ciorchine (Staphylococcus aureus). Lampropedia are forma unor celule rotunde sau aproape cubice, grupate n iruri regulate, formnd tablete rectangulare de 16, 32 sau 64 de celule agregate, datorit unei matrice extracelulare. Celulele care formeaz tablete, avnd n interior incluziuni refringente strlucitoare, sunt acoperite de un nveli structurat complex, distinct de peretele celular, care nu nconjur celulele individuale, ci numai ansamblul gruprii lor. Izolat din rumen, ape mloase, stagnante, Lampropedia formeaz pelicule pe suprafaa mediilor lichide. 2. Bacteriile cilindrice cunoscute mai ales sub denumirea comun de bacili, au form de bastonae. Raportul dintre cele dou axe variaz mult, unele bacterii putnd lua form aproape sferic-oval (cocobacili); acestea din urm fiind greu difereniate de coci, dar n culturi pure exist mereu cteva celule suficient de lungi, pentru a identifica natura lor cilindric. Bacilii sunt drepi sau uor ncurbai la mijloc sau la una din extremiti. Capetele pot fi tiate drept (Bacillus antracis) sau rotunjite ca la majoritatea celorlali. Marginile laterale ale celulei sunt de obicei paralele, dar pot fi i apropiate la extremiti, n firm de suveic (Fusiformis fusiformis), sau ndeprtate i rotunjite la una sau ambele extremiti, n form de mciuc sau de picot (Corynebacterium). Bacilii pot fi grupai: cte doi (diplobacili); n lanuri cu lungimi variabile (streptobacili); n palisad ca scndurile unui gard, celulele rmnnd apropiate i paralele n sensul axului lung, aezarea fiind rezultatul unei micri de basculare a celuleifiice, avnd ca punct de sprijin peretele transvers recent separat; sub form de rozet sau de stea (Agrobacterium stellulatum, Ag. radiobacter, Phyllobacterium stappi).
3. Bacteriile spiralate sau elicoidale cuprind trei subtipuri morfologice: a) vibrionul, n form de virgul (Vibrio cholerae); b) spirilul, n form de spiral cu mai multe ture de spiral rigide (Spirillum volutans); c) spirocheta, n form de spiral cu mai multe ture flexibile, care se pot strnge sau relaxa (Borrelia, Treponema i Leptospira). 4. Bacteriile filamentoase au ca prototip actinomicetele, microorganisme cu asemnri morfologice asemntoare cu fungii, avnd particularitatea de a forma hife ramificate (de unde aspectul de miceliu). n unele cazuri aspectul filamentos este determinat de aezarea celulelor individuale n lanuri de celule reunite printr-o teac delicat cu perete neted, care n condiii favorabile pot acumula hidroxid de fier sau mangan. 5. Bacteriile ptrate evideniate n apa hipersalin din unele bli din Peninsula Sinai (Walsby, 1980) au forma unor ptrate cu latura de 1,5-11 m i o grosime inegal (0,1 m sau chiar mai mic n regiunea central i 0,2-0,5 m la periferie, Parkes, 1981). Uneori formeaz placarde de 8-16 ptrate la care se vd net planurile de diviziune. Celulele conin vacuole cu gaze, care dispar la presiune, situate frecvent de-a lungul marginilor ptratelor. n unele cazuri sunt dispersate la ntmplare n celul. Multiplicarea se face prin diviziune. n unele cazuri, fiecare bacterie ptrat crete pn ia forma unui dreptunghi, care se divide n dou ptrate egale. Alteori, diviziunea se face n dou planuri ce alterneaz n unghi drept iar celulele rezultate din diviziune formeaz placarde. Bacteriile ptrate au fost ncadrate n genul Quadra aparinnd probabil grupului Archaebacteria (Parkens i Walsbz,1981).
n afara acestor cinci tipuri morfologice de baz exist bacterii cu forme particulare, rezultate din gruparea lor ntr-un trichom, prezena unor prelungiri celulare (prostec), a unor aprndice acelulare etc. Bacteriile care formeaz trichoame. Trichomul este o grupare de celule sub forma unui filament multicelular, uniseriat, rezultat din diviziune, n care celulele adiacente au o suprafa relativ mare de contact strns i sunt meninute ntr-un nveli parietal comun (Starr,1973) (Leucothrix, Beggiatoa, Caryophanon latum, Sphaerotilus natans). Bacteriile prostecate. Unele bacterii prezint o complicaie morfologic prosteca (gr. = adaos, apendice, coad) sub forma unui apendice semirigid, situat n continuarea unei celule procariote i avnd totdeauna un diametru mai mic dect cel al celulei mature. Funciile prostecii: - implicat n reproducerea bacteriilor care nmuguresc; - mrete suprafaa celulei i implicit a membranei plasmatice, permind sporirea activitilor asociate (respiraia i absorbia de sunbstane nutritive); - are rol de fixare (Caulobacter), dei frecvent a fost gsit i la celule plutitoare.
Bacteriile cu apendice acelulare. Bacteriile prezint un aspect filamentos datorit unor apendice acelulare, formate din substane secretate sau excretate de ele, nedelimitate de perete celular. Gallionella ferruginea, prezent n ape feruginoase, are forma unui bob de fasole de 0,5x1,2 m i este situat la extremitatea unui apendice filamentos acelular, format dintr-un produs secretat de ea nsi prin porii situai pe partea sa concav.
Celulele bacteriene miniaturale (minicelulele). Minicelulele sunt corpusculi mici, aproximativ sferci, care nu cresc i sunt formai printr o septare neobinuit, n apropierea uneia dintre extremitile unei bacterii cilindrice. Au cel mai adesea un diametru mai mic dect al unei celule bacilare parentale. Sunt lipsite de material nuclear sau deficiente n ADN. De aceea sun incapabile de cretere i diviziune. Au fost descrise ca un proces de diviziune inegal (asimetric) la Escherichia coli, Salmonella, Bacillus subtilis, Haemophilus influenzae, Erwinia amylovora .a.
este de 0,342, respectiv de 84 146 ori mai mic dect la Bacillus megaterium, de 239 233 ori mai mic dect la Escherichia coli, i de 850 611 ori mai mic dect la Mycoplasma Datorit raportului foarte mare dintre suprafaa i volumul bacteriilor, comparativ cu alte organisme, asemntor aceluia al particulelor de substane n state de dispersie coloidal, o cantitate mic de bacterii, de exemplu 1 g de Escherichia coli, care conine 1,8 x 1012 celule nsumeaz o suprafa total de contact cu mediul de circa 56 000 cm2; pentru comparaie menionm c 1 g celule de drojdie conine 8,3 x 109 celule, care au o suprafa de 9 100 cm2. Mrimea considerabil a acestei suprafee reactive de la interfaa celular mediu este deosebit de important, deoarece, practic toate substanele care intr i ies din celul trec prin aceast zon. Teoretic, pe baza unor considerente de ordin biologic i biochimic, limita inferioar de mrime a unei celule bacteriene este determinat de posibilitatea ei de a conine toi constituenii necesari pentru cretere i diviziune, respectiv un numr minim de enzime diferite (probabil cteva sute), aflate fiecare ntr-un numr variabil de molecule, acizi nucleici, glucide, lipide etc. Cea mai mic bacterie vizibil la microscopul fotonic are dimensiuni foarte apropiate de aceast limit molecular necesar pentru meninerea funciilor celulare. Celulele cu dimensiuni mai mici nu ar fi fizic suficient de cuprinztoare pentru a conine ntreg echipamentul enzimatic i moleculele necesare pentru via. n cazul microorganismelor eucariote, limita cea mai mic de mrime este determinat de limitri structurale: cele mai mici protiste eucariote sunt algele din genul Micromonas (M. pulsatilla 1-1,5 m) cu un singur cloroplast i o singur mitocondrie, care alturi de nucleu ocup ceaq mai mare parte din celul. Orice reducere de dimensiuni dincolo de aceast limit nu se poate face dect prin eliminarea unui organit celular, fr de care ns funciile metabolice ar nceta de ndat. Ca regul general, celulele eucariote sunt ns mai mari dect cele procariote i conin structuri absente la procariote. Celulele procariote nu pot depi anumite limite de mrime i, n general, nu pot ajunge la dimensiunile foarte mari ale celulelor eucariote. Limita superioar de mrime a unui organism unicelular este posibil corelat cu raportul suprafa/volum, avnd n vedere c toi nutrienii trebuie s ptrund n celul, iar produii de catabolism s fie eliminai. Pe msur ce dimensiunile unei celule cresc, volumul ei crete mult mai rapid dect suprafaa (volumul crete la cub n raport cu raza celulei, n timp ce suprafaa crete cu raza la ptrat). Cnd raza celulei crete de trei ori, volumul crete de 27 de ori (33), iar suprafaa de numai 9 ori (32). n prezena acestui dezechilibru, celula nu poate ngloba nutrieni i elimina substane reziduale n acord cu necesitile crescute ale volumului celular mrit (Nester i colab., 1973). Celulele eucariote mari au rezolvat aceast problem fie prin modificarea adecvat a formei (aducnd astfel prileinterne ale celulei aproape de suprafa), fie, mai ales, prin prezena curenilor citoplasmatici care asigur circulaia nutrienilor i a produilor de uzur dintr-o zon n alta. Ca o regul general, valabil la toate nivelele de complexitate biologic, rata metabolismului este invers proporional cu mrimea organismului, iar rata de cretere (determinat n special de rata global a metabolismului) crete pe msur ce dimensiunile celulare scad n corelaie cu raportul suprafa/volum. Dimensiunile mici ale bacteriilor apar ca o condiie esenial pentru creterea i multiplicarea lor rapid, n comparaie cu celulele eucariote, ceea ce le confer un mare avantaj biologic n natur, asigurnd supravieuirea lor n competiie cu alte organisme. Celulele mai mari au nevoie de mult timp pentru ca nutrienii s ptrund n celul i s fie metabolizai pentru a asigura creterea acesteia. Un alt factor care pare s determine o limit superioar de mrime a celulelor bacteriene este dificultatea de meninere a unei reglri satisfctoare i de coordonare a 9
activitii metabolice ntr-o celul mare cu organizare de tip procariot. Unele bacterii foarte mari, Spirillum volutans, Thiospirillum jenense etc., nu pot fi cultivate dect extrem de greu, n contrast cu bacteriile mici din acelai grup fiziologic (Stanier, 1970). Explicaia const n faptul c la aceste bacterii condiiile fizico-chimice necesare dezvoltrii sunt foarte restrnse, iar capacitatea de reglare a funciilor metabolice eseniale pentru a le conferi flexibilitatea adaptativ la modificri minore ale mediului foarte limitat.
10
11
Peretele celular al bacteriilor Gram-pozitive apare la microscopul electronic ca un strat unic, relativ omogen, dei frecvent pot fi deosebite mai multe structuri contigue, foarte rar bine definite. Componentul major este peptidoglicanul (80-90% din greutatea uscat), care apare foarte net dup colorare cu sruri ale metalelor grele i poate fi degradat dup tratare cu lizozim. n afar de peptidoglican, peretele celular al bacteriilor Gram-pozitive mai conine proteine i polizaharide care includ acizii teichoici, teichuronici, neteichoici i polizaharide neutre. Peptidoglicanul (sin. murein), glicopeptid, mucopeptid, glicozaminopeptid, mucocomplex este un component parietal caracteristic i comun tuturor bacteriilor, cu excepia genului Mycolasma, a formelor L i a bacteriilor halofile extreme. Este unu heteropolimer compus dintr-o poriune glican i o component peptidic. Poriunea glicanic -foarte uniform- are structura unor lanuri lineare formate din resturile alternente a dou N-acetilhexozamine diferite, legate ntre ele prin legturi -1,4. Componenta peptidic conine ca unitate de construcie un tetrapeptid. Unitile tetrapeptidice aparinnd lanurilor de glican adiacente sunt legate prin intermediul unor puni specializate, interpeptidice. Astfel alctuit sacul peptidoglicanic este n esen o molecul unic, gigant i rigid, avnd o structur de reea tridimensional care formeaz n jurul protoplastului bacterian o reea ca o plas rigid cu ochiuri mici. Peptidoglicanul poate fi atacat de lizozim i de penicilin. Acizii teichoici sunt molecule polimere lungi i flexibile (formate din 1,5-poli ribitolfosfat i 1,3-poli glicerofosfat) localizate exclusiv n peretele celular, membrana plasmatic i straturile capsulare ale bacteriilor. Sunt prezeni numai la bacteriile Gram-pozitive i aparin la trei categorii: acizii teichoici parietali (la suprafae celulei), legai covalent de stratul peptidoglicanic al peretelui celular; acizi teichuronici legai de peretele celular; acizii teichoici membranari (sau lipoteichoici) legai covalent de fraciunea glicolipidic a membranei plasmatice, formnd o reea ntre membrana plasmatic i peretele celular. Acizii teichoici confer bacteriilor Gram-pozitive o serie de proprieti importante: au rol esenial n meninerea unei concentraii de ioni metalici, n particular Mg2+ la suprafae extern a membranei plasmatice, important pentru activarea unor sisteme enzimatice membranare dependente de cationi; au rol arhitactural; joac un rol important ca determinani de patogenitate (inhib fagocitoza i protejeaz bacteriile contra efectului bactericid al fagocitozei); leag i controleaz activitatea autolizinelor cu rol n creterea i diviziunea peretelui celular; acizii lipoteichoici acioneaz ca receptori de fag i de colicine, crend avantaje adaptative bacteriilor Gram-pozitive. Peretele celular al bacteriilor Gram-negative este mai subire dect al bacteriilor Gram-pozitive, este distinct stratificat, are o structur mai complex datorit prezenei membranei externe, care apare cu o structur similar membranei plasmatice (triplustrat). Este alctuit din urmtoarele structuri:
12
1. Complexul peptidoglican-lipoprotein care este situat n zona median a peretelui, are o grosime de 1,5-3,0 nm i este electronodens; stratul peptidoglicanic reprezint 2,410% din greutatea peretelui celular. La bacteriile Gram-negative sacul mureinic poate fi conceput ca o reea bidimensional sau ca un monostrat molecular, cu structur relativ constant. 2. Membrana extern a peretelui celular (numit astfel pentru c este situat la exterior fa de stratul peptidoglicanic i de membrana plasmatic) are o grosime de 6-20 nm. Membrana extern este alctuit din fosfolipide (35%), care formeaz un strat intern continuu, proteine (15%) i lipopolizaharide (50%), care sunt asociate cu stratul extern.
Fig.1. Reprezentarea schematic a nveliuilor celulare, evideniind structura membranei externe a peretelui celular i raporturile cu spaiul periplasmic i membrana citoplasmaric. (G. Zarnea, 1983, dup DiRienzo i Inouye, 1980)
13
Conine enzime autolitice capabile s atace structura glicopeptidului, active n momentul sporulrii, al eliberrii sporului prin liza sporangelui, al germinrii, ca i n biosinteza peretelui celular i n reglarea acestui proces. La bacteriile Gram-negative, prezena membranei externe i a constituenilor ei confer bacteriilor respective proprieti deosebite n raport cu mediul nconjurtor: acioneaz ca barier impermeabil pentru molocule hidrofobe, mpiedicnd intrarea n celul a diferitelor substane potenial nocive i pierderea unor metabolii necesari; funcioneaz ca o sit molocular asigurnd trecerea unor oligopeptide, oligozaharide i a unor substane hidrofile; transportul pasiv este mediat de molecule proteice transmembranare, numite porine care formeaz adevrate canale moleculare prin membrana extern; membrana extrn reine n spaiul periplasmic enzimele degradative sintetizate n celul, dup ce au traversat membrana plasmatic, precum i o varietate de molecule nutritive; prin aceast funcie activitile enzimatice eseniale pentru celul, dar potenial duntoare pentru constituenii citoplasmatici, au loc n afara membranei plasmatice, iar degradarea moleculelor nutritive mari la monomeri simpli este efectuat n apropierea proteinelor de legare i a permeazelor specifice care permit transportul selectiv n celul a unor molecule mai mari de 700 daltoni; este sediul unor sisteme de transport specifice: pentru vitamina B12, maltoz, maltodextrine, ioni ferici i nucleozide); este implicat n adsorbia unor fagi.
14
Semnificaia biologic
Membrana extern a peretelui celular las s treac n regiunea periplasmatic numeroase substraturi hidrofile (echivalente cu tetra- i pentamere de aminoacizi, dimeri i trimeri de carbohidrai). Funcia principal a enzimelor periplasmice (fosfataze, sulfataze, amidaze etc.) este de a pregti chimic substanele care difuzeaz prin membrana extern pentru trecerea lor prin membrana plasmatic n citoplasm. Prin acest mecanism, bacteriile Gram-negative prin intermediul enzimelor degradative acioneaz asupra unei largi varieti de substraturi ntlnite n natur, convertind substanele care difuzeaz n spaiul periplasmic n molecule transportabile n celul, unde sunt accesibile imediat proteinelor de legare i permeazelor. Acest aspect confer bacteriilor Gram-negative un deosebit avantaj biologic. De aceea bacteriile adaptate la viaa n mri, ruri, lacuri etc. sunt n majoritatea lor Gramnegative. Spre deosebire de bacteriile Gram-negative, cele Gram-pozitive elibereaz cea mai mare parte a enzimelor lor extracelular, n mediu. Acest mecanism este avantajos pentru bacteriile care triesc n condiii de mare concentraie de substrat i de mare densitate populaional, deoarece produii de digestie ai enzimelor extracelulare, neasociate cu peretele celular, sunt accesibili tuturor celulelor aflate n vecintatea locului lor de producere.
15
Modelul de structur acceptat n unanimitate modelul mozaicului fluid (SingerNicolson, 1972) propune o aezare caracteristic a componentelor specifice ale membranei reprezentate de lipide, proteine i glucide n acord cu proprietile lor, satisfcnd exigenele termodinamice i furniznd o explicaie satisfctoare a proprietilor generale ale biomembranelor. Dup acest model fosfolipidele formeaz un film fluid, discontinuu, n care plutesc proteinele globulare, n timp ce glucidele interacioneaz fie cu unele fie cu altele.
Fig.2. Evidenierea structurii internea membranei plasmatice, prin tehnica de nghearefracturare de-a lungul planului central al stratului dublu lipidic (G. Zarnea, 1983, dup Staehlin i Hull, 1979) Lipidele sunt reprezentate de fosfolipide molecule amfipatice cu structur complex, avnd o extremitate polar, hidrofil (hidrosolubil n stare izolat), alctuit dintr-o grupare fosfat (PO-4) i ali constitueni, legai printr-o molecul de glicerol care formeaz un fel de punte de cozile moleculei, reprezentate de doi acizi grai, ce constitue regiunea nepolar, hidrofob (insolubil n ap) a moleculei. n contact cu apa gruprile polare poart de regul sarcini electrice. Deoarece cele dou extremiti ale moleculelor lipidice au solubiliti incompatibile, n suspensie apoas ele se organizeaz spontan pentru a forma un dublu strat de molecule, discontinuu i fluid-vscos, n care moleculele sunt aranjate coal-la-coad n aa fel nct capetele ionice polare (hidrofile) sunt expuse spere soluia apoas de ambele pti ale membranei, iar lanurile nepolare (hidrofobe) ale acizilor grai sunt orientate n direcia opus contactului cu apa. n felul acesta, cele dou monostraturi de molecule formeaz mpreun dou straturi hidrofile periferice separate de poriunea central hidrofob. Aceast modalitate de aranjare reprezint configuraia de minim energie posibil pentru o suspensie de lipide n ap i este, n acelai timp, foarte adecvat pentru funcia de barier ntre dou soluii apoase (cun sunt interiorul celulei i mediul extern). Structura de dublu strat fosfolipidic explic proprietile de permeabilitate ale membranei, deoarece acest strat este impermeabil fa de particulele ncrcate i fa de ioni i uor penetrabil de moleculele liposolubile. Fiecare dublu strat este un lichid bidimensional n care moleculele lipidice difuzeaz lateral, schimbndu-i poziia pn la un milion de ori pe secund. n schimb deplasarea unei molecule de pe un monostrat pe altul (trenziia flip-flop) se face foarte rar (cel mai des o dat pe lun pentru o molecul dat). Raritatea deplasrilor flip-flop ale lipidelor i proteinelor permite meninerea compoziiei membranei i a structurii ei caracteriestice. Dublul strat fosfolipidic trebuie s fie suficient de fluid pentru a permite micarea liber a proteinelor membranare implicate n procesele de transport activ. 16
Fosfolipidele formeaz matricea structural a membranei i sunt rspunztoare de integritatea structural a acesteia. Prin structura caracteristic a dublului strat, ele confer membranei impermeabilitatea la cele mai multe molecule hidrosolubile, care sunt insolubile n regiunea uleioas a prii de mijloc a membranei. Proteinele, n raport cu poziia lor n structura membranei, sunt de dou tipuri: proteinele integrate (intrinsece); proteinele de suprafa (periferice sau extrinsece). Proteinele integrate, n general insolubile n ap, nu pot fi ndeprtate fr ruperea dublului strat lipidic. Au o orientare fix: fiecare protein de acelai tip este ndreptat n aceeai direcie. Cele mai multe strbat toat grosimea membranei celulare (proteinele transmembranare) dar unele pot fi expuse fie numai pe suprafaa intern (citoplasmatic), fie spre suprafaa extern. Regiunile lor dirijate spre interior i/sau spre exterior au caracter hidrofil, ceea ce mpiedic tranziia lor tip flip-flop. Proteinele de suprafa, neinserate n dublul strat lipidic, sunt n general hidrosolubile i situate fie pe suprafaa intern, fie pe cea extern, de regul legate de proteinele integrate. Din punct de vedere funcional, proteinele de membran pot fi: enzime care fac biosinteza nveliurilor celulare (membrana plasmatic, polimeri parietali, extraparietali), proteine de transport care asigur transportul moleculelor solubile din mediu n celul i invers; citocromi i alte proteine aparinnd sistemului transportor de electroni; proteine cu activitate adenozinfosfatazic (ATP-aza); proteine implicate n turnover-ul lipidelor i al proteinelor membranare (fosfolipaze, proteaze, peptidaze).
Fig. 3. Membrana plasmatic reprezentarea schematic a unui model tridimensional (G. Zarnea, 1983, dup Lodish i Rothman, 1979) Glucidele reprezint componentul cel mai slab reprezentat n structura membranei i se regsesc sub forma unor polizaharide legate de proteine (glicoproteine) sau interacionnd cu anumite lipide (glicolipide).
17
Semnificaia biologic
Membrana plasmatic reprezint singura suprastructur citoplasmatic permanent a celulei bacteriene, avnd rolul de a delimita spaiul intracelular. Ea formeaz un compartiment nchis, dar nu reprezint o grani fizic inert a celulei, ci o structur funcional capabil s asigure o deosebire net ntre interiorul i exteriorul acesteia. Aceast proprietate este consecina faptului c membrana plasmatic prezint o asimetrie funcional, cu importan esenial pentru viaa celulei, n sensul c suprafaa intern funcioneaz diferit de cea extern. Astfel un ion sau o molecul pompat la interior printr-un punct al membranei ar putea fi eliminat n altul cu o cheltuial inutil de energie. Aceast asimetrie funcional are la baz o asimetrie de structur molecular, manifestat pe mai multe ci: cele dou monostraturi lipidice includ proporii variate ale diferitelor tipuri de molecule lipidice; carbohidraii sunt prezeni numai pe suprafaa extern a membranei, n timp ce proteinele periferice sunt situate aproape ntotdeauna pe faa intern; fiecare tip de protein integrat are o orientare definit, care este aceeai pentru fiecare molecul de acelai tip. Membrana plasmatic este asociat cu toate funciile (transport, fosforilare), care la organismele superioare sunt legate de structuri difereniate. Membrana plasmatic poate s-i mreasc suprafaa, furniznd mai mult spaiu pentru diferite activiti celulare (respiraie, fotosintez) prin invaginare, formnd sisteme de membrane, care uneori se ramific n citolpasm, sau se pot detaa, formnd entiti virtual independente. Funcioneaz ca o barier osmotic, dotat cu impermeabilitate cvasitotal fa de multe tipuri de mlecule, permind trecerea nestnjenit a altora. Ea asigur n acest fel schimburile necesare i selective ntre mediul extern i cel intracelular, meninnd constant compoziia chimic i ionic a celulelor, care, la rndul lor, influeneaz critic numrul enorm de reacii interdependente ce au loc n citoplasm. Proprietile de permeabilitate ale membranei plasmatice pot fi sintetizate astfel: substanele uor solubile n solvenii lipidelor, ca i unii anioni (ex. Cl-) traverseaz uor biomembranele; unii ioni ca Na+, K+, glucidele i proteinele, nu o pot traversa uor, celula recurgnd la mecanisme speciale de transport. Membrana plasmatic bacterian i structurile derivate din ea formeaz baza structural a sinergonului fotosintezei i a celui respirator, reprezentnd prin aceasta un echivalent funcional al cloroplastelor, respectiv al mitocondriilor din celulele eucariote. Este implicat n mobilitatea bacterian, datorit faptului c una din structurile corpului bazal al flagelului este strns legat de structura sa. Unele proteine legate de membran sau aflate n contact lax cu ea (fiind localizate n spaiul periplasmic) joac rolul de chemoreceptori. Particip la formarea i eliminarea unor proteine, ca enzimele i exotoxinele, care pot fi sintetizate n membrana plasmatic, sau pe suprafae ei extern. n primul caz, trecerea lor extracelular s-ar realiza fie printr-un mecanism de tipul pinocitozei inverse, fie datorit unei poriuni glucidice legate, care ar facilita eliberarea. n al doilea caz, moleculele sintetizate ar difuza liber n mediu.
3.5. Mezosomii
Mezosomii (Fitz James, 1967) au fost descrii iniial sub denumiri diferite: membrane intracitoplasmatice (Hopwoord, 1960), corpi periferici (Chapman, 1953), condrioizi (Van Iterson, 1961) sau plasmalemasomi (Edwards, 1963).
18
Greenawalt (1975) consider mesozomii structuri membranoase intracitoplasmatice, caracterizate prin trei particulariti definitorii: deriv ultrastructural din membrana celular ca o invaginare n form de sac sau pung, care conine corpi membranoi; pot fi extrudai din sacul mezosomal n spaiul dintre membrana plasmatic i peretele celular prin agitare, ndeprtarea peretelui celular sau dup plasmoliz; sunt asociai fizic i/sau topografic cu replicarea i segregarea cromosomului, cu formarea septului de diviziune i cu sporularea. Structurile membranare care nu ntrunesc aceste condiii trebuie numite membrane intracelulare (intracitoplasmatice) sau structuri similare mezosomilor (mezosome-like). La microscopul electronic apar sub forma unor structuri cu form, mrime, localizare i complexitate foarte diferite, n general putnd varia nu numai n funcie de starea fiziologic a celulei, ci i de calitatea i natura tehnicilor de prfixare i fixare, precum i de unghiul de secionare.
Fig. 4. Structura schematic a mezosomului bacterian, evideniind modul de ptrundere a citoplasmei n structura acestuia, ntr-un spaiu care nu este conectat nici cu cisternele tubululor, nici cu mediul extern. Tubulii din sacul mezosomal apar pe seciunea transversal circulari. Situsul de legare al genomului este localizat pe faa citoplasmatic a sacului mezosomal (G. Zarnea, 1983, dup Reusch i Burger, 1973).
Au fost descrise trei tipuri morfologice de mezosomi, dup unii autori interconvertibile: lamelari (formai prin plierea membranei invaginate ntr-un aranjament n spiral ncolcit ca un ghem); veziculari sau saciformi (vezicule aproape sferice); tubulari (de forma unor tubuoare lungi). Dup localizare mezosomii pot fi: septali; periferici; nucleari.
19
Mezosomii au caracteristicile structurale ale membranei plasmatice din care deriv (structura triplustratificat i grosimea de 7,5 8,0 nm). Sunt mai numeroi i mai bine dezvoltai la bacteriile Gram-pozitive, n timp ce la bacteriile Gram-negative sunt relativ mai greu de observat, fiind n general rudimentari, slab dezvoltai ca mrime i mai puini ca numr. Prin expunere n medii hipertonice, mezosomii sunt extrudai n spaiul dintre membran i peretele celular sub forma unor filamente, ca un irag de mrgele, care poate ajunge la dimensiunea de 20 nm.
Fig. 5. Reprezentarea schematic a stadiilor de formare a mezosomilor. A, B. Dezvoltarea unui mezosom sacular turtit, dintr-un mezosom sferic (vezicular). x i y reprezint punctele terminale ale sacului i situsurile poteniale de cretere ale membranelor intracelulare. C. Pentru simplificare diagrama ilustreaz numai dezvoltarea n punctul x printr-o secven de sgei i vezicule, dei procesul are loc i n punctul y. D. Mezosom cu structur complex multilamelar, format prin creterea i plierea sacului turtit prin extinderea lui x la x` i a lui y la y`. (G. Zarnea, 1983).
20
sintetizate care se adaug membranei invaginate. Concomitent cu creterea n complexitate apare posibilitatea unui grad mai mare de compartimentare a constituenilor citoplasmatici, chiar n mezosomi, care apar la microscopul electronic sub forma unor canale rezultate din invaginrile secundare. Nu se cunoate natura stimulilor implicai n invaginare i nici a celor care determin modificri de form, localizare i complexitate.
Semnificaia biologic
Mezosomul nu este o structur static ci este un organit influenat permanent de dinamica proceselor celulare. Morfologia mezosomului este influenat de condiiile de prelucrare premergtoare examinrii la microscopul electronic (prefixare, calitatea i natura fixrii chimice etc.), care afecteaz tipul, forma i poate chiar localizarea n celul. Unii autori consider mezosomii ca fiind structuri vestigiale sau redundante, versatile (instabile) i multifuncionale, neeseniale pentru viabilitatea bacteriilor, avnd o deosebit plasticitate structural, ca un rspuns la nevoi specifice, variate. Formarea mezosomilor este modalitatea prin care celula bacterian are posibilitatea de a-i mri, prin invaginare i pliere, suprafaa membranei plasmatice, ca rspuns la condiiile de mediu, de aceea, se consider c nu ar avea funcii diferite sau suplimentare fa de cele ale membranei plasmatice. Rolul mezosomilor n replicarea genomului bacterian a fost demonstrat pe baze morfologice, genetice i biochimice. Fiind legat de membrana plasmatic, ct i de materialul nuclear are un rol important n controlul replicrii cromosomului i al plastidelor bacteriene, prin transmiterea semnalului biochimic care ia natere la suprafaa celulei. La B. subtilis, n faza iniial, fiecare nucleosom este legat de un mezosom, pentru ca pe msur ce celula crete i se apropie de diviziune mezosomul s se divid, iar formaiunile rezultate s migreze spre extremitile celulei, antrennd cromosomii bacterieni progeni. Fora care realizeaz aceast deplasare este reprezentat de sinteza i ncorporarea de constitueni noi de membran celular. Mezosomii particip la reacii de fosforilare, oxidoreducere i transport de electroni, care au loc ns cu o pndere mai mic dect n membrana plasmatic. Conin fosfataze acide, esteraze etc. i ar putea funciona ca organite subcelulare degradative, asimilabile funcional cu lizosomii din celulele eucariote (Revsch, 1972). Au rol n unele procese secretorii ca, de exemplu, n producerea i eliberarea unor exoenzime ca penicilinaza. Mezosomii ar fi implicai n sinteza nveliurilor celulare, n mod particular a membranei plasmatice, a peretelui celular i a septului transversal care separ celulele dup diviziune. Tichy i Landman (1969) consider c ar reprezenta o regiune specializat prin care, n cursul transformrii genetice, ADN transformat ar ptrunde n celul.
3.6. Citoplasma
Citoplasma bacterian este, n general, considerat ca un sistem coloidal complex format din proteine, glucide, lipide, ap i substane minerale, sistem n care apa i compuii dizolvai n ea acioneaz ca faza extern a unui sol (Lamanna, 1949). Deoarece n citoplasm coexist strile de emulsie i de soluie, aceasta poate fi considerat ca un complex de stri fizice ntr-o continu transformare. Se caracterizeaz prin meninerea permanent a strii de gel ceea ce are ca rezultat o imobilitate a coninutului (lipsa curenilor citoplasmatici) i reprezint o condiie indispensabil a meninerii nemicibilitii nucleului cu citoplasma, avnd n vedere absema unor membrane intracelulare.
21
Citoplasma bacterian nu are o organizare definit, similar celulei eucariote, care conine organite difereniate i delimitate de membrane. La celulele tinere i n condiii normale de dezvoltare, citoplasma ader la peretele celular i se prezint ca o mas dens, omogen i intens colorabil. La celulele btrne citoplasma i pierde treptat afinitatea tinctorial, se retract centripet ndeprtndu-se de perete i capt o structur granular cu vacuole din ce n ce mai evidente la microscopul electronic. La bacteriile examinate pe seciuni mai puin fine (~ 50 nm), zona citoplasmatic apare ca fiind plin de agregate de ribosomi, aspect rezultat din suprapunerea acestor structuri cu de 10 nm. Pe seciuni extrem de subiri citoplasma apare ca mas amorf i lipsit de particule structurale, cu ribozomi rari. n interiorul citoplasmei se gsesc materialul nuclear, incluziunile, vacuolele i ceilali constitueni ai protoplastului. O caracteristic a citoplasmei bacteriene este prezena unei mari cantitpi de ARN, ceea ce explic bazofilia ei intens, mai evident la celulele tinere. Celulele moarte se coloreaz mai puin intens, ca i celulele btrne, la care sinteza ARN a ncetat, iar cel existent a fost folosit ca surs de N i P.
3.7. Nucleul
Spre deosebire de celulele eucariote care au un nucleu cu structur bine definit, mrginit de o membran i coninnd un numr definit de cromozomi capabili de diviziune mitotic, nucleul bacterian reprezint o form primitiv de organizare, lipsit de membran (de tip procariot), inclavat direct n citoplasm, n mod obinuit n partea central a celulei i care nu sufer modificri de tip mitotic n cursul ciclului de diviziune. Datorit caracterelor sale particulare, aceast structur a fost desemnat cu numeroi termeni ca: nucleoid, nucleosom, material nuclear, nucleoplasm, echivalent nuclear sau "nucleu" prin analogie funcional cu structura echivalent a celulelor eucariote. Deoarece citoplasma bacterien este puternic bazofil ca urmare a prezenei ARNului, nu este posibil diferenierea la microscopul fotonic cu colorani bazici a materialului nuclear constituit din ADN, la fel de bazofil. Evidenierea corpului cromatic bacterian la microscopul fotonic nu se poate face prin colorare selectiv dect dup ndeprtarea ARN-ului citoplasmatic prin hidroliz acid (tehnica Robino i Feulgenw) sau enzimatic (tehnica Boivin, cu ribonucleaz). Cu aceste tehnici materialul nuclear apare sub diferite forme (granule sferice sau ovalare, halter, bastonae izolate sau dispuse n V, filament axial etc.), reprezentnd 5-16% din volumul celulei. Materialul nuclear este localizat n mod obinuit n partea central a celulei. El se prezint ca o zon mai clar, cu o densitate medie mai mic dect aceea a citoplasmei nconjurtoare, astfel c la bacterii contrastul dintre structurile intracelulare este inversat n raport cu acela caracteristic celorlalte celule, la cere nucleul este mai dens dect citoplasma. Acest aspect este determinat de densitatea neobinuit de mare a citoplasmei bacteriene. Pe seciuni ultrafine se observ c regiunea nuclear este plin cu fibrile fine cu ntre 2,0 i 5,0 nm, uneori aranjate n iruri ondulate, paralele, care dispar dup digestia cu dezoxiribonucleaz, ceea ce arat c sunt formate din ADN i corespund cromosomului bacterian. Cromosomul bacterian denumit i lineom, nucleosom sau genofor, s-a dovedit a fi alctuit dintr-o singur molecul de ADN, de form circular (extremitile sunt reunite), cu o lungime de 1 400 m i un de 2,5 nm, corespunznd diametrului moleculei de ADN dublu catenar.
22
Fig. 6. Modelul lui Worcel i Burgi (1072) pentru plierea cromosomului la E. coli. Cromosomul formeaz ~ 50 bucle superhelicale n jurul unei structuri celulare format din ARN. Trastarea cu DN-az, care produce incizii monocatenare, elibereaz bucle individuale i reduce progresiv valoarea constantei de sedimentare (S) del la 1500 S laa 155 S. Tratarea cu ribonucleaz depliaz complet cromosomul, dndu-i form care sedimenteaz mai lent (G. Zarnea, 1983).
Fig. 7. Modelul lui Pettijohn (1974) de mpachetare a cromosomului bacterian. A. Cromosom circular nepliat cu 350 m. B. Cromosom pliat cu 7 bucle. n realitate, ar exista 40-80 domenii de pliere, corespunznd unui de 30 m. C. Cromosom pliat n care buclele au suferit transformare superhelicat. Dac pasul suprahelici este de 11 nm, nucleului este de 2 m. Modelul bidimensional devine tridimensional prin plierea zonelor superhelicale deasupra i dedesubtul planului hrtii. DNaza produce incizii monocatenare i desface superhelicea n bucla respectiv, fr a afecta structura superhelical a altor domenii (D). E. Secionarea a dou molecule de ARN ale unor domenii adiacente unete cele dou domenii fr pierderea structurii lor superhelicale (G. Zarnea, 1983). 23
Pettijohn i Hecht (1974) au elaborat un model n acord cu care ADN din cromosomul de E. coli ar fi condensat ntr-o structur compact printr-un proces de pliere i formare de superhelice, n care structura condensat a ADN este meninut de molecule de ARN, ce leag i stabilizeaz buclele de pliere. Pentru a menine starea condensat a ADN este necesar o sintez continu de ARN, fapt care explic asocierea ARN-polimerazei. Rouviere-Yaniv (1975) a izolat de la E. coli o protein specific, proteina HU, asociat cu ADN i implicat n plierea lui n celul. n mod nomal, bacteriile aflate n faza de repaus n culturi staionare i vechi au un singur cromosom, astfel c sunt unicelulare. n faza de cretere activ, n culturi tinere pe medii optime, ele apar ca multinucleate, avnd 2-4 cromosomi, care sunt genetic identici, deoarece provin din replicarea dintr-un singur cromosom parental. De aceea, indiferent de aspectul morfologic al materialului nuclear, din punct de vedere genetic, bacteriile sunt organisme haploide, astfel nct chiar atunci cnd celula primete un aport de material nuclear exogen prin procese de transfer genetic diploidia nu este dect parial i tranzitorie. Apariia bacteriilor multinucleate este n mod obinuit rezulatul unei lipse de sincronizare ntre ritmul de cretere i ritmul de diviziune celular.
Semnificaia biologic
Cromosomul bacterian poart n structura sa toat informaia genetic esenial, necesar pentru existena unei celule, respectiv setul de determinani genetici reprezentnd acel minimum necesar pentru ca o bacterie s poat ocupa poziia s-a ecologic normal: gene necesare pentru metabolismul energetic, pentru biosintez, cretere i diviziune i, n acelai timp, pentru reglarea activitilor celulare. El determin i arhitectura celulei bacteriene, ereditatea i capacitatea de evoluie a acesteia.
3.6. Ribosomii
Sunt particule nucleoproteice intracitoplasmatice de form aproximativ sferic. Au diametrul de aproximativ 20 nm. Pot fi caracterizai dup constanta de sedimentare la ultracentrifug (uniti Svedberg S) i prin apacitatea d a participa la sinteza proteinelor in vitro. La procariote se gsesc n citoplasm 15 000-10 000 particule ribozomale, cu constanta de sedimentare 70 S cu tendina de a se disocia rapid n dou subuniti inegale cu constantele de sedimentare de 30 S i 50 S. 2+ + Mrimea i stabilitatea lor este n funcie de concentraia ionilor Mg i K . Subunitatea mic 30 S (g.m. 900 000 dal) este alctuit din 21 molecule de proteine diferite, notate de la S1 la S21 i o molecul de ARNr, notat 16 S. Subunitatea ribosomal mic are trei regiuni: capul (1/3 din subunitatea mic), baza (formeaz restul de 2/3) i platforma, care este separat de cap printr-o scobitur numit fisur sau despictur. Subunitatea mare 50 S (g.m. 1 000 000 dal) este alctuit din 34 de proteine diferite, notate de la L1 la L34 i ou molecule de ARNr, una de 23 S i cealalt de 5 S. Moleculele 16 S i 23 S aleARNr nu sunt transcrise separat, ci deriv din degradarea catabolizat de o nucleaz a unui precursor mare de 30 S (pre-ARNr). Modelul de structur al subunitii mari include o protuberan central, flancat de cte o prelungire de fiecare parte, cea mai extins fiind denumit peduncul,iar cealalt creast, ntre ele avnd o vale.
24
Cnd cele dou subuniti sunt asociate, pedunculul subunitii mari are baza aproape de constricia de pe o subunitate mic, iar capul nei subuniti mici i protubrana subunitii mari sunt aproximativ aliniate.
Semnificaia biologic
Ribosomii sunt componeni eseniali ai sistemului de traducere a informaiei genetice, reprezentnd adevrate fabrici de proteine.
Fig. 9. Rolul poliribosomilor n biosinteza proteinelor (G. Zarnea, 1983). La nivelul lor se desfoar ciclul ribosomal care determin iniierea, creterea i terminarea lanului polipeptidic, n care interacioneaz cu ARNm, pentru a lega specific moleculele de aminacizi, asigurnd formarea moleculei de protein. Aceast activitate are loc
25
numai cnd cele dou subuniti sunt asociate i combinate cu ARNm, ca i cu ali componeni neribosomali ca ARNt i unele proteine. n cursul procesului de biosintez a proteinelor ribosomii individuali au tendina de a se grupa n iruri lineare de 4-50 de elemente formnd polisomi (poliribosomi sau ergosomi). Mrimea acestora este determinat de lungimea moleculelor de ARNm. Poliribosomii se deplaseaz de-a lungul moleculei de ARNm, permimd ca lanil polipeptidic s creasc progresiv n lungime, pe msur ce ribosomii se deplaseaz spre extremitatea terminal a secvenei de baze traduse, fapt care confer o eficien mult mai mare procesului de biosintez a proteinelor.
26
4. METABOLISMUL MICROORGANISMELOR
Metabolismul microorganismelor reprezint totalitatea reaciilor biochimice implicate n activitatea lor biologic, prin intermediul crora energia i elementele biogene sunt preluate din mediu i utilizate pentru biosintez, degradare i cretere, ca i pentru activiti fiziologice secundare (mobilitate, luminescen etc.). Ca urmare a acestor reacii substanele din mediu sunt transformate n constitueni celulari, energie i produi de metabolism. Diferitele reacii ale metabolismului ndeplinesc patru funcii eseniale pentru viaa celulei: eliberarea de energie i stocarea ei sub form de ATP i ali compui macroergici. producerea subunitilor folosite pentru construcia constituenilor celulari, pornind de la substanele nutritive. activarea subunitilor de construcie monomere, pe seama energiei de legtur din compuii macroergici i formarea constituenilor celulari macromoleculari, prin asamblarea monomerilor. formarea i degradarea biomoleculelor necesare anumitor funcii specializate ale celulei. Aceste funcii sunt realizate printr-o reea complex i variat de ci metabolice, care funcioneaz perfect coordonat datorit interveniei unor reacii speciale (pace marker reactions, Krebs i Kornberg, 1957). Cile metabolice sunt secvene de reacii chimice, catalizate enzimatic, care permit organismelor vii s obin din nutrieni, att compuii necesari pentru sinteza constituenilor celulari, ct i energia necesar pentru aceste sinteze, ca i pentru alte procese care necesit consum de energie. Au fost descrise patru tipuri de ci metabolice: cile catabolice; cile anabolice; cile amfibolice; cile anaplerotice.
27
Ex.: hexozele pot fi metabolizate pe ci diferite (calea glicolizei, calea Entner-Doudoroff sau cale hexozomonofosfatului), dar produii obinui final nu sunt foarte diferii, reprezentnd, cu excepia CO2, intermediari ai cilor metabolice centrale sau precursori ai lor. Aminoacizii pot fi utilizai pe ci diferite, dar catabolismul lor duce la formarea de acetil-CoA sau intermediari ai ciclului acizilor tricarboxilici (ciclul Krebs). Caracteristica esenial a acestei faze decurge din faptul c dei exist o mare varietate de ci catabolice, acestea conduc transformarea surselor primare de carbon la un numr redus (~12) de intermediari ai cilor metabolice centrale. Faza a III-a are o evoluie diferit n funcie de natura microorganismului studiat. n cazul microorganismelor aerobe, care pot metaboliza substraturile nutritive integral (pn la CO2 i H2O), calea major de desfurare a acestei faze i eliberare de energie este cea a ciclului acizilor tricarboxilici (ciclul Krebs), cuplat cu fosforilarea oxidativ. Microorganismele care nu pot efectua conversia complet a surselor de C la CO2 i H2O realizeaz aceast faz prin reacii de fermentaie (alcoolic, lactic, butiric, propionic, acetonobutilic etc.), n care produii cilor catabolice servesc direct sau indirect - ca donori, respectiv acceptori de H, n secvene de reacii de oxidoreducere cuplate. n aceste cazuri, cantitatea de energie util pentru celul este mult mai sczut, n raport cu cea eliberat n cursul respiraiei aerobe, prin mecanismul fosforilrii oxidative (Kornberg, 1965).
28
Cile catabolice i cele anabolice funcioneaz simultan n celule, sub forma unor secvene de reacii catalizate de enzime i nsoite, la fiecare treapt, de o modificare caracteristic, energetic. n felul acesta, de exemplu, ntre catabolismul unui substrat organic i procesele de biosintez se stabilesc, la modul general, dou legturi biochimice distincte: 1. n anumite trepte specifice ale cilor catabolice se elibereaz o parte din energia chimic a metaboliilor pentru a fi conservat sub form de ATP, n timp ce n anumite trepte ale anabolismului, energia din ATP este utilizat pentru biosinteze. 2. Produii cilor de catabolism funcioneaz nu numai ca intermediari n eliberarea treptat de energie, ci sunt punctul de plecare al unor reacii de biosintez n care reprezint precursori ai componenilor celulari. n felul acesta, calea de catabolism al unui substrat organic funcioneaz, cel puin parial, ca o cale de iniiere a unor reacii de biosintez. Ciclul Krebs, spere exemplu, reprezint nu numai o cale de oxidare total a acetil CoA, ci, n acelai timp, i o surs important de intermediari (-cetoglutarat, oxalilacetat, succinat) pentru cile de biosintez. Datorit acestui fapt, el nu funcioneaz, niciodat, n ciclu nchis, deoarece anumii intermediari trec direct n cile de biosintez.
29
Bacteriile sulfatreductoare (Desulfovibrio desulfuricans) nu utilizeaz ca surs de C dect un numr limitat de compui organici (lactat, piruvat i acizi dicarboxilici cu C4) i spre deosebire de majoritatea bacteriilor, nu metabolizeaz nici un glucid i nici un aminoacid, cu excepia cisteinei. Diferitele grupuri sistematice de bacterii se caracterizeaz deci prin anumite particulariti metabolice, n aa fel nct, n afara unor substane folosite de toate microorganismele (ap, CO2, sruri minerale etc.), unele specii sau grupuri fiziologice de specii au nevoie i de anumite substane nutritive specifice, indispensabile pentru realizarea metabolismului celular. Plasticitatea metabolismului microorganismelor este o alt particularitate, decurgnd din capacitatea acestora de a se adapta la tipul i cantitatea de nutrieni diferii, prezeni n mediu. E. coli, de exemplu, utilizeaz nu numai glucoza i NH3 ca surs de C i N, ci i o gam larg de nutrieni, incluznd diferite alte glucide, glicerol, etanol, acetat etc., respectiv purine, pirimidine, aminoacizi, datorit echipamentului enzimatic complex, care asigur conversia tuturor acestor substane n compui care pot intra n cile metabolice centrale. Diversitatea mecanismelor enzimatice i a produilor. Microorganismele pot utiliza acelai substrat nutritiv pe mai multe ci distincte sau parial intricate, fiecare dintre ele putnd s duc, n funcie de natura microorganismului, la formarea de produi diferii. Diferitele ci metabolice pot coexista n acelai microorganism i se pot substitui una celeilalte, n funcie de condiiile fiziologice i/sau de mediu. Intensitatea metabolismului bacterian. Una din caracteristicile distinctive ale activitilor metabolice microbiene este intensitatea lor excepional comparativ cu aceea a activitilor omologe ale organismelor superioare. Astfel, activitatea respiratorie a unui gram (raportat la greutatea uscat) de bacterii aerobe este de cteva sute de ori mai intens dect aceea a omului, iar potenialul metabolic al microorganismelor din 25 cm superficiali ai solului, pe o suprafa de un hectar, este echivalent cu cel la ctorva zeci de mii de oameni. Un gram de bacterii lactice hidrolizeaz circa 178-14 890 g lactoz pe or. Pentru a atinge un asemenea nivel de activitate metabolic organismul uman ar avea nevoie de mai multe mii de tone de alimente pe or. O celul de E. coli, care se divide la un interval de o or, sintetizeaz pe secund 4 000 de molecule de lipide, aproximativ 1 000 tipuri de proteine (fiecare avnd 300 de aminoacizi) i 4 molecule de ARN (Nester, 1973).
30
5. NUTRIIA MICROORGANISMELOR
Microorganismele, ca toate organismele vii, au nevoie pentru cretere i multiplicare, ca i pentru toate celelalte manifestri ale activitii lor biologice, de prezena n mediul nconjurtor a unor substane nutritive, care s conin, pe de o parte, elementele chimice necesare pentru sinteza constituenilor celulari, pentru activitatea enzimelor i sistemelor de transport, iar, pe de alt parte, s le furnizeze substanele necesare pentru producerea de energie biologic util. Din cauza caracterului foarte heterogen al mediilor naturale i dificultilor de a pune la punct tehnici de identificare i dozare a diferitelor substane prezente n jurul celulelor bacteriene se cunosc foarte puine date referitoare la procesele lor de nutriie n natur. Mediile de cultur utilizate n practic conin, ntr-o form adecvat tipului de nutriie al fiecrui microorganism, nutrienii eseniali pentru sinteza de material celular i pentru producerea de energie in vitro, care condiioneaz procesul de cretere i multiplicare. Ele includ n mod obligatoriu, pe lng o serie de ioni anorganici, diferii compui ai C, H, O, N, P, S etc.
5.1. Bioelementele
Microorganismele au nevoie pentru cretere de aceleai bioelemente ntlnite n structura oricrui sistem biologic. Bioelementele majore (macroelementele) i anume C, O, H, S, P, K, Mg, Ca i Fe, sunt necesare n concentraii relativ mari (> 10-4 M). Dintre acestea C, O, H, N, S i P formeaz ~95% din greutatea celular uscat a bacteriilor i reprezint, ca atare, constituenii majori ai biomasei celulare a microorganismelor. Macroelementele ndeplinesc funcii cu semnificaie esenial n metabolism i, n general, n viaa microorganismelor. Astfel, sulful este necesar pentru sinteza unor aminoacizi (cistein i metionin) i a unui numr de coenzime; fosforul intr n structura acizilor nucleici, a fosfolipidelor, a acizilor teichoici, precum i n structura unor nucleotide ca ATP, GTP, NAD+ i FAD. K, Mg, Ca, i Fe sunt ioni metalici necesari pentru activitatea enzimelor sau intr, ca elemente, n compoziia complexelor metalice. Spre exemplu, fosfolipidele peretelui celular bacterian sunt chelate cu ioni de magneziu. Calciul intr n structura unor coenzime; ionii feros i feric fac parte din structura unor purttori redox, cum sunt citocromii i proteinele FeS. Bioelementele minore (microelementele sau micronutrienii, trace elements) Zn, Mn, Na, Cl, Mo, Se, Co, Cu, W, i Ni sunt necesare n cantiti foarte mici, unele (Zn i Mn) ca elemente eseniale pentru toate microorganismele, n timp ce altele (Se, Mo, Co, Cu, i W) numai pentru unele activiti metabolice speciale: zincul este necesar pentru c ADN-polimerazele i ARN-polimerazele sunt metaloproteide cu zinc; molibdenul intr n constituia nitrogenazei, enzim esenial pentru procesul de fixare biologic a azotului; cobaltul particip la efectuarea reaciilor metabolice dependente de vitamina B12; cuprul intr n structura unor enzime care transfer electroni de la nivelul unui substrat la oxigen. Nevoia de ioni minerali variaz cantitativ i calitativ de la un microorganism la altul, n primul rnd, datorit diferenelor de constituie enzimatic i de eficacitatea mecanismelor de concentrare activ a lor din mediu.
31
32
5.5. Oxigenul
Oxigenul este furnizat microorganismelor, n primul rnd, de diferii nutrieni i de apa din constituia mediilor de cultur. Din cauza solubilitii sale sczute, oxigenul aflat n soluie este utilizat foarte repede de bacteriile aerobe, chiar n cazul unor populaii puin numeroase. De aceea, frecvent, densitatea atins de o cultur este adesea limitat de rata de difuzie a O2 prin interfaa aer-ap, chiar cnd culturile sunt bine aerate.
33
n culturile aerate prin simpla rotaie a flacoanelor creterea unor bacterii aerobe este adesea limitat la ~1-2 mg greutate uscat/ml. Creterea mai abundent necesit tehnici speciale, care mresc aria interfeei lichidaer, ca, de exemplu, barbotarea rapid cu aer printr-un filtru poros, sau prin recircularea culturii. Pentru necesiti de ordin practic, pe baza efectului pe care oxigenul l exercit asupra creterii i metabolismului, microorganismele pot fi grupate n patru categorii: 1. Microorganismele strict sau obligatoriu aerobe (de exemplu, Bacillus anthracis, B. subtilis, Mycobacterium tuberculosis), care au nevoie absolut de prezena oxigenului molecular i sunt incapabile s triasc n anaerobioz. 2. Microorganismele strict sau obligatoriu anaerobe (de exemplu, Clostridium tetani, C. botulinum, Welchia perfringens etc.), care nu se pot dezvolta n prezena oxigenului molecular i, ca urmare, pot fi cultivate numai n medii srcite n O2, deoarece chiar la presiuni joase, de ordinul a 10-5 atm, pot avea efect inhibitor. n practic, se folosesc nglobri n medii ale unor substane care favorizeaz creterea bacteriilor anaerobe, de exemplu tioglicolatul de sodiu 0,1%, care reduce O2 din mediu. Alte procedee: adugarea unui strat de ulei de parafin; utilizarea de agar semisolid (0,20,3%), pentru a diminua difuzia O2; cultivarea n recipiente (anaerostate) din care oxigenul a fost ndeprtat sau nlocuit cu un amestec controlat de alte gaze. 3. Microorganismele microaerofile (de exemplu, Spirochaetales, Thiobacteriales etc.) cresc cel mai bine la presiuni de oxigen mai mici (~0,2 atm) dect n aerul atmosferic. Aceast particularitate reflect prezena unor enzime care sunt inactivate n condiii de oxidare puternic i pot fi meninute n stare funcional numai la presiuni joase de O2. 4. Microorganismele anaerobe, facultativ aerobe (E. coli, Staphylococcus, Streptococcus etc.) au capacitatea de a se dezvolta deopotriv n prezena sau n absena O2. unele dintre ele (de exemplu bacteriile lactice) desfoar n esen un metabolism de tip fermentativ, chiar n prezena aerului, fr a fi sensibile la O2. Altele, cum sunt levurile, E. coli i Enterobacteriaceae-le, n general, sunt capabile s-i orienteze metabolismul spre respiraie sau spre fermentaie, n funcie de condiiile de mediu, respectiv de disponibilitile de O2. n esen nevoia de O2 reflect mecanismul molecular prin care microorganismele i satisfac nevoile energetice.
34
6. AUTOTROFIA
n concepia clasic, autotrofia reprezint tipul de metabolism caracteristic organismelor capabile s creasc n absena oricrui compus organic. Microorganismele autotrofe utilizeaz CO2 ca surs unic sau major de carbon celular i N sub form de NH3, nitrat sau chiar N molecular, diferite sruri minerale i apa, de la care i construiesc numeroasele substane organice caracteristice organismelor vii. Microorganismele autotrofe folosesc aceeai surs de C, adic CO2. Ele se deosebesc, n raport cu natura sursei de energie care asigur creterea, putnd fi difereniate n: o fotoautotrofe, care pot obine toat energia necesar pentru cretere de la lumin, oxidnd compui anorganici compui ai sulfului sau So; o chimioautotrofe, care i obin energia necesar din oxidarea unor compui anorganici redui ca NH3, nitrii, compui ai S, Fe sau H2. Sub raportul capacitii lor de biosintez, autotrofele pot fi considerate ca microorganisme complete, deoarece posed sistemele enzimatice cele mai complexe, care asigur producerea tuturor componenilor celulari de la CO2, pe seama oxidrii unor substane anorganice. Au fost descrise urmtoarele categorii de microorganisme autotrofe: Microorganisme autotrofe obligate, care fixeaz CO2 ca principal surs de C, pe calea Benson-Calvin (calea ribulozodifosfatului), utiliznd o substan anorganic redus ca surs de energie, sau, dac sunt fototrofe, ca donator de electroni. Ele sunt de dou tipuri: 1. microorganisme chemolitotrofe obligate, obin toat energia necesar pentru cretere i pentru asimilarea C prin oxidarea specific (n absena luminii) a unor compui anorganici ai S, ai ionilor NH4+, nitrit i fier feros sau a H molecular; 2. microorganisme fotolitotrofe obligate, utilizeaz energia luminoas, asociat cu oxidarea compuilor redui ai S sau H2. Microorganisme autotrofe facultative, care au o mult mai mare adaptabilitate metabolic, incluznd specii (Acidithiobacillus novelus, Hydrogenomonas etc.) ale cror particulariti fiziologice merg de la capacitatea de a se dezvolta autotrof, pn la cea de cretere heterotrof. Chemolitotrofele facultative pot crete fie autotrof (n medii cu sruri minerale, utiliznd substane anorganice ca surs de C i energie), fie heterotrof, folosind substane organice.
35
3. numeroase microorganisme, considerate convenional ca heterotrofe, oxideaz anumite substane anorganice, ceea ce demonstreaz c oxidarea compuilor anorganici redui nu este o proprietate limitat la autotrofe i nici un caractercheie obligatoriu pentru autotrofie; 4. exist bacterii care nu cresc n absena luminii sau a unor surse anorganice de energie; nici una nu este ns autotrof obligat. Aceste date demonstreaz c principalele categorii de autotrofe descrise n literatura de specialitate nu acoper toate categoriile nutriionale care pot fi considerate ca autotrofe. Rezult c este preferabil s se menin o separare net ntre metabolismul energetic i cel al carbonului, deoarece este evident c producerea de energie de la un substrat anorganic nu trebuie cuplat obligatoriu cu autotrofia. n felul acesta, exist posibilitatea clasificrii fiziologice precise: o n funcie de sursa de energie (litotrof sau organotrof); o n funcie de tipul de nutriie cu C (autotrof sau heterotrof). n timp ce termenul clasic de autotrof poate implica sau nu utilizarea unui donator anorganic de electroni, termenul chemolitoautotrof este precis i nseamn organism care fixeaz CO2, utiliznd energia eliberat prin reacii chimice din oxidarea unor donatori anorganici de electroni. n acest context conceptul de autotrofie include: 1. organismele considerate ca autotrofe i n concepia clasic, organisme care asimileaz CO2 pe calea circuitului Calvin; 2. organismele care folosesc ali compui de tip C1 i calea ribulozomonofosfatului, calea serinei sau alte ci specifice.
6.2. Mixotrofia
Mixotrofia este capacitatea microorganismelor chemolitotrofe facultative de a combina utilizarea surselor de energie i/sau de C autotrofe, cu folosirea substraturilor organice. Termenul de mixotrofie a fost introdus de Pfeffer (1897) pentru a descrie tipul de metabolism n care compuii organici sunt fie necesari, fie stimulatori pentru creterea anumitor plante, iar Pringsheim (1967) l-a utilizat pentru a caracteriza bacteriile (de exemplu, Beggiatoa) a cror cretere autotrof este mult stimulat de prezena unor compui organici specifici. n accepiunea actual, mixotrofia implic producerea concomitent de energie, prin mecanisme alternative, chemolitotrofe i chemoorganotrofe sau utilizarea concomitent de mecanisme autotrofe i heterotrofe. Dei nutrienii mixotrofi nu au efect beneficial cnd sunt n exces, pot oferi un avantaj deosebit n condiii de limitare nutriional. ntruct n natur condiiile mixotrofe se ntlnesc foarte frecvent, microorganismele mixotrofe au un avantaj selectiv evident fa de heterotrofe i autotrofe, a cror cretere este limitat de cantitile insuficiente de substane organice, respectiv anorganice. Datorit acestui fapt, este probabil c mixotrofia reprezint modul de existen principal al microorganismelor chemolitotrofe facultative n natur. Exemplu: La Acidithiobacillus intermedius rata de cretere este mai mare n condiii de mixotrofie (mediu cu tiosulfat i glucoz), dect n condiii autotrofe sau heterotrofe. La A.novellus ns nutriia mixotrof (mediu cu tiosulfat i glucoz) nu prezint nici un avantaj, ba chiar este stnjenitoare, dimiunund rata de utilizare a glucozei, ct i rata de cretere.
37
6.3. Sintrofia
Studiindu-se bacteria Haemophilus influenzae s-a pus n eviden un fenomen general: microorganismele capabile s-i sintetizeze constituenii celulari de la compui simpli din mediu excret adesea mici cantiti de vitamine, aminoacizi sau ali factori de cretere, n afara celulei lor, unde pot fi folosii de alte organisme auxotrofe pentru substanele respective. Acest fenomen permite dezvoltarea pe medii de cultur solide, n jurul coloniilor excretoare de substane organice, a unor colonii satelite formate din microorganisme mai pretenioase (auxotrofe), care gsesc astfel substanele eseniale pentru cretere. Exemple: H. influenzae pe geloz-snge formeaz colonii mici, punctiforme i translucide. n vecintatea coloniilor de Staphylococcus, care contamineaz n mod accidental mediul de cultur, coloniile de H. influenzae devin mai mari, mai voluminoase, deoarece stafilococul este capabil s fac sinteza de NAD+ pe care n excret n mediu, permind bacteriei H. influenzae s se dezvolte mult mai abundent dect este posibil n prezena cantitilor mici de NAD+ coninut n snge. Bacteriile metanogene nu pot utiliza glucoza ca surs de C i energie, dar pot crete uor pe seama produilor finali formai prin degradarea glucozei de ctre bacteriile anaerobe, capabile s fermenteze acest compus.
Semnificaia biologic.
Microorganismele oligotrofe acioneaz n natur ca ultimi utilizatori ai substanelor organice care rmn n urma activitii mineralizatorilor copiotrofi. Inhibarea creterii bacteriilor oligotrofe n medii bogate n nutrieni pare s fie datorat efectului toxic al produilor de metabolism i, n special, peroxidului de hidrogen, care se acumuleaz n mediu i determin liza celulelor.
38
Difuzia pasiv
Se realizeaz ca urmare a unui gradient de concentraie, posibil cnd n exteriorul celulei concentraia este superioar celei din interiorul acesteia. Difuzia pasiv este procesul de trecere liber a substanelor solubile prin membrana plasmatic, fr a interaciona cu moleculele din structura acesteia i fr consum de energie. Moleculele cu grad ridicat de solubilitate n lipidetraverseaz mai uor regiunea hidrofob a membranei. Deorece concentraia celor mai muli metabolii este mai mare n interiorul dect n afara celulei, difuzia pasiv este restrns, pe lng ap, la un mic grup de substane (unele gaze ca O2 i CO2, acizii grai i substanele liosolubile, anumii ioni). Difuzia pasiv se produce lent i nespecific i nceteaz cnd compusul respectiv ajunge n aceeai concentraie att n interiorul, ct i n afara celulei.
Difuzia facilitat
Se realizeaz ca urmare a prezenei n biomembrane a unor proteine receptoare denumite permeaze, localizate la nivelul plasmalemei sau n spaiul periplasmic. Aceast difuzie este stereospecific i se realizeaz fa de un gradient de concentraie, iar celula nu consum energie pentru acest transfer.
Transportul activ
Are urmtoarele particulariti: transportul n celul este asigurat chiar n absena gradientului de concentraie i se realizeaz cu consum de energie. Acest transport a fost demonstrat n cazul drojdiilor care pot acumula intracelular o cantitate de glucide i de aminoacizi mai mare dect cea existent n mediul de cultur. Se admite c o molecultransportor, care consum o cantitate de energie pentru a se activa i a produce o legtur instabil cu molecula nutrientului printr-o reacie catalizat enzimatic, transfer nutrientul i l elibereaz n interior. Transportorul se activeaz ca urmare a energiei eliberate prin transformarea ATP.
Translocaia de grup
Este un transport activ ntlnit la drojdii i mucegaiuri, n care intervine un sistem enzimatic complex de transferaze i transfosfataze, ce permit ptrunderea glucidelor prin
39
membrane sub forma esterilor fosforici. Astfel, fosfoenol-piruvatul se poate combina cu molecula de glucid din exteriorul celulei i se transform n piruvat i esterul fosforic al glucidului transportabil n interior.
n cazul microorganismelor acvatice (protozoare), exist sistemul de endocitoz sau pinocitoz prin care nutrientul din exterior este nglobat n interior, aprnd stadiul de pictur suspendat i eliberarea n interiorul celulei. Numeroase microorganisme, mai ales bacteriile, pot folosi pentru transportul intracelular aa-numitul gradient protonic" rezultat n urma transportului de protoni i ioni, care acioneaz permanent n celula vie ca o pomp electrochimic.
Difuzie pasiv
Difuzie facilitat
Transport activ
40
41
Q1 ADP Pi ATP
Q2 ADP Pi ATP
Substratul oxidat poate servi drept precursor sau, dac nu este util celulei, se poate elimina n mediu sub form de catabolit. Cantitatea de energie obinut prin catabolism poate fi obinut direct n biosintez, iar energia excedent este stocat n compui macroergici prin procesul de fosforilare, denumit astfel deoarece componenta macroergic, care stocheaz energia rezultat, conine grupri fosfat. Se consider compus macroergic un compus capabil s elibereze o cantitate de energie mai mare sau egal cu 30 kj/mol. Principalii compui macroergici sunt: ATP-ul, acetil fosfatul (Acetat~P), ADP-ul, fosfoenolpiruvatul, compui care pot disponibiliza cantiti variabile de energie, prin ruperea legturii macroergice. Fosforilarea poate fi de trei tipuri: fotosintetic, ntlnit la bacteriile din diviziunea Photobacteria care folosesc energia radiant; oxidativ, cnd formarea compuilor macroeregi cu fosfor are loc prin nmagazinarea energiei eliberate prin reacii de oxidare, n procesele de respiraie aerob sau anaerob; de substrat, n urma formrii de compui macroergici prin reacii de oxidoreducere, prin care glucidele sunt transformate, prin procese de fermentaie anaerob, n compui intermediari, acceptorul de H sau electroni fiind un compus organic. La fosforilarea oxidativ eliberarea energiei poteniale din diverse substraturi de natur organic se realizeaz prin procese de oxidare, care se pot desfura astfel: reacii de oxidare prin pierdere de electroni, caz n care are loc un transfer de electroni de la substane cu potenial de oxidoreducere negativ (maxim 0,41 pentru hidrogen), la substane cu potenial de oxidoreducere pozitiv (maxim +0,82 pentru oxigen); reacii de oxidare prin transfer de hidrogen (electroni i protoni): acest tip de oxidare este folosit de unele microorganisme anaerobe i aerobe i transferul este realizat de enzime active la diferite valori ale potenialului de oxidoreducere. Enzimele implicate n reaciile de oxidoreducere sunt dehidrogenazele aerobe (aldehid-dehidrogenaza) i anaerobe (alcooldehidrogenazele), care au drept coenzime NAD-ul sau NADP-ul i care preiau atomii de hidrogen trecnd din forma oxidat (NAD+) n forma redus (NADH + H+);
42
reacii de oxidare prin ctig de O2, cnd, n prezena enzimelor care acioneaz la un potenial de oxidoreducere pozitiv, are loc transferul de H la O2 provenit din aer i se formeaz apa; aceast reacie de oxidare este caracteristic microbiotei aerobe.
Respiraia aerob este un metabolism oxidativ dependent de oxigenul din aer, iar produsele finale sunt CO2 i apa, ntreaga energie a substratului oxidat eliberndu-se prin produsele finale ale respiraiei. Respiraia aerob este din punct de vedere energetic foarte avantajoas pentru celula microbian; de aceea, atunci cnd se urmrete obinerea de celule n cantiti mari (drojdie comprimat) sau de substane intracelulare, cultivarea se face n condiii de aerare. Microorganismele aerobe dispun de o caten respiratorie diversificat, n componena creia intr dehidrogenaze, citocromi, citocrom-oxidaze, oxidaze. Numeroase bacterii pot oxida hidrogenul (Pseudomonas), amoniacul pn la NO2 (Nitrosomonas), sulful i H2S pn la sulfit (Acidithiobacillus thiooxidans), sau Fe2+ la Fe3+ (Acidithiobacillus ferrooxidans), reacii cu rol important n ciclul natural al elementelor. Respiraia anaerob este un metabolism oxidativ n care substratul este transformat pn la CO2, iar electronii sunt cedai prin oxidare unor compui anorganici. Acest tip de respiraie este ntlnit la bacteriile strict anaerobe. Astfel, bacteriile denitrificatoare pot transforma NO3 la azot molecular, bacteriile metanogene pot transforma dioxidul de carbon n metan, bacteriile acetogene ale genului Clostridium pot transforma dioxidul de carbon n acid acetic. Aceste bacterii obin o cantitate mic de energie i pot crete n absena oxigenului molecular, la un potenial de oxidoreducere de 0,2...-0,3 V. innd cont c mediile care vin n contact cu O2 au un potenial redox de +0,2...+0,4 la un pH= 7, pentru a asigura dezvoltarea anaerobilor, n mediu se adaug substane cu caracter reductor ca: tioglicolat de sodiu, cistein-SH, sulfur de sodiu. Substanele reductoare menin un potenial oxidoreductor sczut, care permite dezvoltarea anaerobilor n plci, chiar cnd mediul vine n contact cu aerul. Pentru cultivarea anaerobilor se pot folosi i vase speciale numite anaerostate, n care O2 este legat chimic, sau cultura se menine n atmosfer de gaze inerte (CO2, N2). Metabolismul oxidativ anaerob poate fi ntlnit i la microorganisme facultativ anaerobe. Aceste microorganisme au capacitatea de a crete aerob, utiliznd oxigenul din aer (respitaie aerob), sau anaerob, utiliznd compui organici ca acceptori finali ai electronilor produi prin catabolism. n condiii aerobe microorganismele facultativ anaerobe i adapteaz echipamentul enzimatic pentru procese de oxidare pn la produi finali, utiliznd preferenial oxigenul, cnd este disponibil, datorit cantitii mai mari de energie rezultat prin respiraie aerob (36 moli ATP/mol glucoz asimilat, fa de 2-3 moli ATP/mol glucoz fermentat).
Celula microbian prelucreaz nutrienii obinnd energie i diferii compui, iar produii de catabolism sunt eliminai. n cursul acestor prelucrri metabolice, n funcie de faza de cretere a celulei, rezult produi de metabolism, care pot fi mprii astfel: produi primari, care se formeaz n faza de cretere exponenial a celulelor (trofofaza) i sunt produi eseniali pentru celul; produi secundari, care sunt formai n faza de declin a crterii celulelor (idiofaz) i nu sunt eseniali celulei (toxine, alcaloizi).
43
Fermentaii
Fermentaii anaerobe i produse de fermentaie Alcoolic (alcool etilic i CO2) Lactic (acid lactic, diacetil) Propionic (acid propionic, acid acetic, CO2) Butiric (acid butiric, CO2, H2) Microorganisme selecionate Saccharomyces sp. Lactobacillus sp. Lactococcus sp. Propionibacterium Fermentaii oxidative i produse de fermentaie Acetic (acid acetic, H2O) Gluconic (acid gluconic) Citric (acid citric) Oxalic, fum aric Microorganisme selecionate Acetobacter sp. Gluconobacter Aspergillus niger Aspergillus niger
Clostridium sp.
Aspergillus sp.
Fermentaii anaerobe
Fermentaia alcoolic Fermentaia alcoolic este un proces anaerob prin care glucidele fermentescibile sunt metabolizate prin reacii de oxidoreducere, sub aciunea echipamentului enzimatic al drojdiei, n produi principali (alcool etilic i CO2) i produi secundari (alcooli superiori, acizi, aldehide ,a.). Agenii tipici ai fermentaiei sunt drojdiile genului Saccharomyces care, prin fermentarea glucidelor, pot s produc mai mult de 8o alcool etilic. Fermentaia alcoolic este un proces ntlnit i la alte microorganisme: Bacillus macerans, Clostridium acetonoetilicus, Zygomonas mobilis, dar acestea produc prin fermentare cantiti mai reduse de alcool etilic comparativ cu drojdiile i nu sunt considerate ageni tipici. Fermentaia lactic Fermentaia lactic este un proces anaerob prin care glucide le fermentescibile sunt metabolizate sub aciunea echipamentului enzimatic al microorganismelor n acid lactic ca produs principal i produse secundare, cum ar fi: diacetil, aceton, acid acetic, alcool etilic i CO2. Bacteriile lactice homofermentative: Streptococcus lactis, Pediococcus acidilactici, Lactobacillus bulgaricus, L.leichmanii, L. casei, L. acidophilus, L. jensenii fermenteaz glucoza la acid lactic, cu producere numai de urme ale altor produi. Bacteriile lactice heterofermentative: Leuconostoc mesenteroides, L. lacti, Lactobacillus fermenti, Lactobacillus brevis produc fermentaie mixt n care numai 1/2 din glucoz este convertit la acid lactic, restul fiind utilizat cu formare de alcool, formiat, acetat i CO2.
Fermentaia acetic Fermentaia acetic este un proces aerob prin care substratul (alcoolul etilic) este oxidat n prezena oxigenului din aer, sub aciunea echipamentului enzimatic al bacteriilor actice, n acid acetic ca produs principal al fermentaiei.
44
Caracterele morfologice i fiziologice ale bacteriilor acetice. Bacteriile acetice sunt bacterii strict aerobe, sub form de bastonae, gram-negative, grupate n perechi sau lanuri, cu dimensiuni variabile (0,5-0,8)x(80,9-4,2) m. Pot fi imobile sau mobile, cu cili polari sau peritrichi. n mediu acid, n timp, pot aprea forme de involuie, ramificate, care i pierd capacitatea de reproducere. n medii lichide (staionar) se dezvolt sub forma unui voat fragil care, cu creterea n dimensiuni, ascensioneaz pe pereii vasului (Acetobacter ascendens, A. aceti). Alte specii, A.xylinum, A. xilinoides formeaz, n vin oeit sau n oet, un strat gelatinos de natur -glucanic (coloidal i fibros). o Bacteriile acetice sunt mezofile (temperatura optim 30 C) i produc fermentaia o acetic ntr-un domeniu larg de temperaturi, 0...35 C. Au o termorezisten sczut n mediu lichid cu pH acid, inactivitatea lor avnd loc la 60 oC ntr-un minut, n timp ce bacteriile reinute pe suporturi solide (doage de lemn) sunt inactivate la temperaturi mai ridicate (100 oC).
Fermentaia gluconic Fermentaia gluconic este un proces oxidativ simplu prin care glucoza, n prezena oxigenului din aer i a sistemului enzimatic al microorganismelor selecionate, este transformat n acid gluconic ca produs principal. Agenii tipici ai fermentaiei gluconice sunt bacteriile din genurile Gluconobacter (Acetomonas) i Moraxella i mucegaiurile din genurile Aspergillus (A. niger, A. phoenicis, A.Wentii) i Penicillium (P. chrysogenum, P. luteum).
Fermentaia citric Fermentaia citric este un proces oxidativ complex prin care substratul glucidic (zaharoza) este metabolizat la compui intermediari de oxidare, cu acumulare n mediu a acidului citric ca produs principal. Ageni tipici ai fermentaiei citrice sunt tulpinile selecionate ale speciei Aspergillus niger care produc activ citrat sintetaz. Acidul citric se poate obine cu un bun randament (52 g/dm3) i prin cultivarea tulpinilor de drojdii din specia Candida oleophilla pe medii cu parafine.
45
Descompunerea amidonului i a glicogenului Descompunerea acestor polioze au loc datorit unor microorganisme ce produc enzime extracelulare, care produc hidroliza acestor compui macromoleculari la molecule simple (glucoz, maltoz) transportabile prin membran i folosite n nutriie. Dintre enzimele microbiene care hidrolizeaz amidonul fac parte: -amilaza, amilaza i glucoamilaza, enzime extracelulare elaborate de bacterii, mucegaiuri i drojdii. Bacteriile genului Bacillus (B.subtilis, B.subtilis var. amyloliquefaciens, B.licheniformis, B.macerans, B.sthearothermophillus sunt productoare de -amilaz, enzim zaharogen care, prin hidroliza legturilor 1-4 glucozidice, elibereaz molecule de maltoz. Mucegaiurile Aspergillus, Mucor, Rhizopus produc mai ales -amilaz i glucoamilaz. Aspergillus niger i A. oryzae produc -amilaze. Mucegaiurile A.awamori, A.usami, A.niger i Rhizopus delemar produc glucoamilaz. Se cunosc peste 100 de specii de drojdii care produc -amilaz i glucoamilaz, dintre care mai importante sunt cele din genurile Saccharomycopsis (S.bispora, S.fibuligera), Schwanniomyces, Trichosporon i Candida. Hidroliza enzimatic a amidonului cu enzime vegetale (din mal) sau cu enzime microbiene, cu formare de glucide fermentescibile, este folosit n biotehnologia spirtului, a berii, a panificaiei sau pentru obinerea siropurilor dulci, a dextrinelor, a maltozei, a glucozei cristalizate .a.
Descompunerea celulozei i hemicelulozei Celuloza este un poliglucid rspndit n materiile prime de origine vegetal (aproximativ 1/3) i n structura pereilor celulari ai fungilor. Celuloza ajuns n sol i n ape este transformat n timp, sub aciunea microorganismelor care produc enzime celulozolitice: micromicete-ageni ai putrezirii, bacterii aerobe i anaerobe. Produii intermedieari de hidroliz sunt metabolizai n mod difereniat, n funcie de natura microorganismelor i de prezena/absena oxigenului din aer. Degradarea aerob a celulozei se caracterizeaz prin formarea din celobioz sau glucoz, n prima etap, a hidroxiacizilordin care, prin oxidare, se elibereaz CO2 i H2O. Dintre bacteriile aerobe care asimileaz celuloza fac parte bacterii cu forme spiralate aparinnd genurilor: Cytofaga, Cellvibrio, Cellulomonas. Importan industrial o au bacteriile din genul Cellulomonas, care pot fi cultivate aerob pe deeuri vegetale, pe hrtie .a., iar biomasa rezultat prin nmulire este valoroas prin coninutul ridicat n proteine (46,2%). Dintre micromicete au activitate celulozolitic superioar specii ale genurilor: Botryotinia, Fusarium, Mucor, Rhizopus, Trichoderma i Tricothecium. Tulpini selecionate de micromicete ale genurilor Trichoderma i Aspergillus sunt bune productoare de celulaze i sunt folosite industrial ca surse de enzime. Degradarea anaerob a celulozei are loc permanent n sedimente i n mlul apelor, la fermentarea compostului, n rumenul ierbivorelor, n profunzimea solului, n soluri inundate, lacuri termale. n transformarea celulozei se pot distinge trei etape, n funcie de natura produselor de fermentaie. Dup hidroliza celulozei la compui simpli, sub aciunea unei microbiote heterogene alctuite din bacterii anaerobe i facultativ anaerobe din familiile Enterobacteriaceae, Bacillaceae (genul Clostridium), se acumuleaz alcooli, acizi, CO2 i H2. Produsele rezultate n acest stadiu sunt folosite de bacteriile acetogene productoare de acid acetic pe cale anaerob, n a doua etap.
46
n etapa a treia, denumit metanogen, sunt active bacteriile metanogene strict anaerobe din genul Methanobacterium cu speciile M.ruminantium, M.formicicum, M.mobilis, M.farkeri .a. Bacteriile anaerobe pot folosi acidul acetic ca surs energetic i produc metan. Se apreciaz c 73% din metan dezult din acidul acetic format n faza acetogen:
Methanosar CH3-COOH cina CH4 + CO2 bar ker i
Methanobacteriile pot forma metan prin reacia: 4CO + 2H2O Methanosarcina CH4 + 3CO2 thermoautotrophicum
n afara acestor procese naturale, care explic formarea zcmintelor de metan, n ultimele decenii a luat amploare metanogeneza dirijat n scopul obinerii de biogaz, prin prelucrarea microbiologic a dejeciilor animale, cnd se realizeaz concomitent protecia mediului i valorificarea energetic a metanului i a hidrogenului.
47
48
depinde de compoziia mediului i de capacitatea de reglare a metabolismului propriu. Durata fazei de lag poate fi redus la limite imperceptibile n cazurile n care se folosete un inoculum mare de cultur n faz logaritmic, iar transplantarea se face ntr-un mediu de cultur bogat, identic cu cel n care au fost cultivate bacteriile din inoculum. o Faza de iniiere a creterii, sau faza de accelerare a ritmului de cretere ( ), cnd are loc o cretere n dimensiuni a celulelor prin mrirea mai rapid a volumului n raport cu suprafaa celular, ceea ce favorizeaz declanarea procesului de diviziune; o Faza de cretere logaritmic sau de multiplicare exponenial, care reprezint faza n care creterea masei de celule poate fi determinat cantitativ prin dublarea numrului de celule n unitatea de timp (pentru drojdii i bacterii), sau ca dublare a biomasei / t pentru microorganismele filamentoase (streptomicete i fungi). Prin exprimarea acestor valori pe o scar semilogaritmic rezult o dreapt. Dac unghiul pantei acestei drepte este mic aceasta se datoreaz condiiilor de cretere, care nu sunt din cele mai favorabile. Dei celulele produc o modificare a mediului de cultur prin asimilare de compui nutritivi i eliberarea compuilor de catabolism, n faza logaritmic, rata de cretere rmne constant. Rata de cretere este independent de concentraia n nutrieni atta timp ct acetia se afl n exces. Rata de cretere n biomas X(g x dm-3) este corelat cu rata specific de cretere , n timp ce rata de cretere a numrului de celule este corelat cu rata specific de cretere i densitatea celulelor N. Rata specific de cretere , este dependent de trei parametri: - concentraia substratului limitativ S; - rata maxim de cretere m; - constanta specific dependent de substrat Ks, conform ecuaiei stabilit de Jaques Monod: = m S
Ks + S
Constanta Ks este concentraia substratului la care se obine din rata specific maxim de cretere ( = 0,5 m ) i este echivalent cu constanta Michaelis n cinetica enzimatic. Dac exist un exces al tuturor nutrienilor, atunci = m i cultura se afl deci n faza logaritmic la rata maxim de cretere. Dac unul dintre nutrienii preferai, de exemplu glucoza, s-a epuizat, n prezena altor surse de carbon se observ aa-numitul fenomen de diauxie cnd se poate, dup o nou faz lag, s aib loc metabolizarea noului substrat i creterea exponenial a celulelor. La sfritul fazei logaritmice se acumuleaz o cantitate maxim de biomas, substratul este rapid epuizat i cultura trece n faza staionar de cretere. Rata specific de cretere maxim m, are o importan considerabil n procesele industriale n care se urmrete obinerea de celule i este dependent de natura microorganismului i de condiiile de cultivare. De exemplu, pentru mucegaiuri, aceasta poate s varieze ntre 0,090 i 0,61 h-1. La cultivarea lui Aspergillus niger pe un mediu cu glucoz la 30oC s-au obinut o rat maxim de cretere m = 0,2 i un timp de dublare al biomasei de 3,46 h. Bacteriile aflate n faza logaritmic au o citoplasm omogen, nu conin substane de rezerv i au o mare afinitate pentru coloranii bazici, datorit coninutului lor mare de ARN. Mrimea lor este constant, depind ns dimensiunile caracteristice speciei. o Faza de ncetinire a creterii corespunde perioadei n care, ca urmare a epuizrii treptate a nutrienilor, reducerea concentraiei n oxigen i acumularea de compui de catabolism ce pot avea efect inhibitor asupra celulelor, creterea ia toate valorile intermediare ntre creterea cu o rat maxim i 0. o Faza staionar de cretere, cnd se stabilete un echilibru ntre numrul de celule care se formeaz prin reproducere i cel al celulelor care se autolizeaz. Cantitatea de biomas
49
poate rmne constant, dei se schimb compoziia celulelor. Datorit lizei unor celule se elibereaz noi substraturi care vor servi drept nutrieni pentru celulele viabile. Aceast faz poate fi prelungit atunci cnd urmrim pstrarea culturii pure, prin modificarea unor factori care scad viteza de metabolism celular; o Faza de declin sau curba de distrugere i inactivare metabolic a celulelor, are loc ca urmare a urmtorilor factori: o lipsa surselor de nutriie i energie; o denaturarea componentelor celulare n prezena substanelor acumulate (alcooli, acizi, .a.); o procentului de celule autolizate. Consecina acestor aciuni conduce, n final, la sterilizarea mediului i, deci, la moartea tuturor celulelor, respectiv la pierderea culturii.
Culturi continue
Anumite procese experimentale de laborator sau de producie industrial necesit prezena unor bacterii n faz exponenial de cretere, ceea ce nu se poate realiza timp ndelungat n condiiile obinuite de cultivare, ntr-in spaiu nchis, respectiv ntr-un volum fix de mediu nerennoit, n care faza exponenial are un numr limitat de generaii, iar unele condiii de mediu devin limitante. Obinera culturilor continue se realizeaz cu ajutorulunui dispozitiv numit chemostat baza pe principiul diluiei ontinue n volum constant.
50