Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Editura EUROBIT
- 2020 -
ISBN 978-973-132-299-5
Cursul 1
5
▪ Elucidarea structurii moleculare a acizilor nucleici (Crick, Wilkins şi
Watson, 1953)
▪ Descoperirea interferonului, o proteină produsă în corpul animalelor în
cazul infecţiei virale (Isacs şi Linderman, 1957)
▪ Fundamentarea sistematicii bacteriene de către Bergey şi Krasilnikov;
▪ Au fost descoperiţi agenţi infecţioşi de natură exclusiv proteică,
responsabili ai bolilor degenerative a sistemului nervos: boala Kuru,
scrapia, boala vacilor nebune.
▪ În 1995 Craig Venter, Hamilton Smith şi Claire Fraser au descifrat
complet primul genom al unui microorganism – Haemophilus
influenza.
▪ Alte cercetări în domeniu au ca scop identificarea sistemelor
microbiologice cu potențial util (sisteme fotosintetizatoare, organisme
care pot metaboliza deșeuri, enzime care pot mari randamentul unor
procese industriale, biocombustibili,etc.). Aplicaţiile actuale sunt dintre
cele mai diverse: agenţi coagulanţi in industria brânzeturilor, înălbirea
hârtiei, îndepărtarea rujului de pe pahare, schimbarea aspectului
ţesăturilor, antiaglutinogeni in industria alimentara.
▪ Human Genome Project (HGP) a fost iniţiat in 1990 in SUA de către
Department of Energy (DOE) si National Institutes of Health (NIH),
beneficiind de o finanţare considerabila (3 miliarde $), programul a fost
estimat să se desfăşoare pe 15 ani.
Intrebari
1. Care sunt principalele categorii de microorganisme?
2. Ce reprezintă carantina si in ce epocă de dezvoltare a microbiologiei a
fost ea folosită?
3. Cine a descoperit microorganismele?
4. Cine este considerat parintele microbiologiei ca stiință?
5. Ce ramuri fac parte din microbiologia generală?
6. Ce discipline cuprinde microbiologia specială?
6
Cursul 2.
I.2. VIRUSOLOGIE
7
I.2.2. Formele virusurilor si clasificarea acestora
8
I.2.3. Morfologia şi organizarea particulei virale
Virionii pot avea forme diferite: cilindrică (VMT, virusurile insectelor), sferică
(virusul gripal, adenovirusurile), paralelipipedică (v. variolic), forma
asemănătoare unui glonţ (v. rabic) sau formă de mormoloc, spermatozoid sau
cireaşă - majoritatea bacteriofagilor ( fig 1.2.)
nucleocapsida
coada
9
simetrică: după o simetrie helicală (spiralată) cubică (de obicei icosaedrică,
numită şi pseudosferică) sau binală (care combină simetria helicală şi cubică.
Simetria icosaedrică oferă avantaje majore deoarece asamblarea capsomerelor
se realizează cu o mai mare economie de proteine, eficienţa sistemului
dovedindu-se în timpul replicării virusului. Acidul nucleic şi capsida
alcătuiesc nucleocapsida.
▪ peplosul numit şi anvelopă, este un înveliş care păstrează stabilitatea
nucleocapsidei şi asigură fixarea virionului pe celulele gazdă,
determinând astfel infecţia celulei gazdă. Peplosul este specific numai
pentru virusurile zoopatogene. Unităţile morfologice ale peplosului sunt
peplomerele. Dacă peplomerele sunt constituite numai din proteine
virale peplosul se numeşte homopeplos iar dacă peplomerele sunt
constituite din proteine virale, lipide şi lipoproteine provenind de la
celula infectată se numeşte heteropeplos
În general, virusurile fără peplos sunt rezistente la eter, iar cele cu
peplos sunt sensibile. Rezistenţa la eter indică în general absenţa peplosului iar
sensibilitatea denotă prezenţa acestuia.
O categorie aparte de virusuri ARN (ribovirusuri), sunt aşa numitele
virusuri catenare divizate (segmentate), pe care Fulton (1980) le-a numit
“virusuri multicomponente”, deoarece materialul genetic este distribuit în două
sau mai multe particule nucleoproteice, pentru infecţii fiind toate necesare.
Aceste tipuri de virusuri sunt capabile de variaţii frecvente prin reasortarea
unor segmente genomice provenind de la virusuri diferite, mecanism numit
pararecombinare. Prin acest fenomen virusurile înving mecanismele de
rezistenţă ale celulei gazdă provocând uneori mari epidemii, aşa cum se
întâlnesc frecvent în cazul gripei, prin schimbarea unor segmente genomice cu
virusul asemănător aviar sau porcin etc.
Simetria helicala este definita de asezarea capsomerelor în jurul unui ax, supus concomitent
unei mişcări de rotaţie si unei mişcări de translaţie paralela cu un ax.
Simetria icosaedrica (cubica). Icosaedrul este un poliedru regulat cu 20 fete, toate în forma
de triunghi echilateral, 30 de muchii (creste) si 12 vârfuri.
10
În prima fază, virionul se adsoabe (se fixează) pe celula gazdă.
Urmează faza a doua, în care virionul sau AN viral pătrunde în celula gazdă
(infecţie). În faza a treia are loc multiplicarea propriu-zisă a virionului.
Virusul aflat în curs de multiplicare se numeşte virus vegetativ.
Multiplicarea propriu-zisă este rezultatul a patru procese:
replicarea AN viral;
sinteza proteinelor virale;
asamblarea virionilor progeni (formarea din constituenţii virali a
virionilor compleţi, maturi;
eliberarea virionilor progeni din celula gazdă.
11
I.2.5. Particule subvirale. Viroizi şi prioni
Virusurile nu sunt cele mai mici entităţi infecţioase, există agenţi
infecţioşi mai mici. S-a calculat că pentru a codifica o proteină acidul nucleic
trebuie să aibă o greutate moleculară de peste un milion de daltoni.
În 1967 Diener a descris şi a prezentat fotografii ale unor agenţi
infecţioşi cu greutate moleculară de 80-90 000 daltoni pe care i-a numit viroizi.
Aceştia provoacă boli degenerative la plante (boala tuberculilor fusiformi la
cartof, nanismul hameiului şi a crizantemelor, excortismul lămâilor şi a
portocalilor). Modul de replicare al viroizilor nu este complet cunoscut,
informaţia lor genetică poate oferi numai o proteină foarte mică formată din
70-80 aminoacizi iar replicarea viroidului se pare că este condiţionată de un
virus ajutător “helper”, care furnizează o parte a informaţiei genetice.
Prioni sunt proteine infecţioase a căror descoperire a reusit să răstoarne
dogma centrală a biologiei moleculare care susţinea existenţa exclusivă a
agenţilor infecţioşi având în constituţia lor acid nucleic.
În 1967 radiologul Alper şi colaboratorii au atras atenţia asupra unui
agent infecţios responsabil de transmiterea boli numite scrapie la oi , agentul
dovedidu-se foarte rezistent la tratamentele care distrug acizii nucleici, razele
UV, radiaţiile ionizante, sugerând faptul ca acest agent ar putea fi o proteină cu
proprietăţi diferite.
În 1980 Stanley Prusiner de origine americană foloseşte pentru prima
dată termenul de prion pentru o categorie de agent infecţios cu greutate
moleculară între 27000-30000Da de natură strict proteică, care nu conţine acid
nucleic ( notată PrPsc).
Proteina infecţioasă s-a dovedit a fi foarte asemănătoare cu o proteină
normală din creier (notată PrPc). Diferenţa între cele două tipuri de proteine se
datorează dispoziţiei spaţiale diferite a catenelor, fapt care face ca proteina
anormală să nu se supună acţiunii fagocitare. Drept urmare această proteină se
acumulează în membrana neuronilor, creierul dobândind un aspect spongios,
determinându - se apariţia unui efect neurotoxic.
Proprietăţile prionilor:
▪ Rezistenţă la radiaţiile UV şi cele ionizante;
▪ Rezistenţă la temperaturi ridicate
▪ Rezistentă la proteinaza K (enzimă responsabilă de distrugerea proteinei
PrPc)
Caracteristicile principale ale bolilor prionice sunt:
1. afectează sistemul nervos central producînd encefalopatii
spongifoeme la om şi animale;
2. au o perioadă foarte lungă de incubaţie de la câteva luni la 30-40
ani;
12
3. au evoluţie lentă dar letală.
S-a reuşit identificarea a 12 boli prionice, din acestea şase afectează
omul şi şase diferite animale ( Israil Michaela, 2005). Transmiterea bolilor
prionice are loc pe cale orală, excepţie fac suinele la care s-a reuşit
experimental transmiterea prionului numai pe cale parentală, prin consumarea
de ţesut nervos (măduvă, creier), prionul fiind rezistent la acţiunea sucului
gastric.
Acelaşi prion este capabil de a infecta specii diferite producând boli
diferite. Prionul scrapiei la oi determină apariţia encafalopatiei spongiforme la
bovine, cunoscută sub denumirea de boala vaci nebune (ESB), boala Jakob
Creutzfeldt (CJ) la om. Se pare că răspândirea ESB la bovine provine din
utilizarea în hrana vitelor a făinii de carne şi oase provenind de la oi bolnave de
scapie. Infectarea a fost posibilă începând cu 1981-1982 când s-a simplificat
tehnologia de prelucrare şi obţinere a extractului de carne şi oase destinate
consumului furajer animalier.
În prezent, inactivarea agentului scrapiei se realizează printr-o tehnică
ce combină căldura cu presiunea: la temperatură de 1330C şi presiune de 3 bari
timp de 20 minute. Este singura metodă admisă de prelucrare a reziduurilor
animaliere în ţările Uniunii Europene.
Intrebări autoevaluare:
1. Care sunt formele în care se poate afla particula virală?
2. Ce tip de acid nucleic conțin virusurile
3. Care sunt părţile componente ale unui virion?
4. Din ce este constituită capsida si care este rolul acesteia?
5. Ce este nucleocapsida?
6. Cum se numesc virusurile în functie de tipul celulei pe care o
infectează?
7. Care este unitatea structurală a peplosului.
8. Ce sunt virioni?Ce celule infectează?
9. Ce este un prion si ce particularităţi prezintă?
13
Curs 3
14
microscopice), Fungi (ciupercile microscopice, mucegaiuri). Regnurile Plantae
si Animalia nu cuprind microorganisme.
II.1.BACTERIILE
Caractere generale
Bacteriile sunt microorganisme unicelulare, de tip procariot, care au
metabolism propriu cu următoarele caractere generale:
- morfologia celulara este foarte diferită (polimorfism accentuat)
- nucleul bacterian nu este delimitat de existenta membranei nucleare, fapt
pentru care el este numit „nucleoid” de unde si denumirea de – procarion -
- citoplasma are consistenta de gel ceea ce nu implica existenta membranelor
pentru delimitarea formațiunilor celulare bacteriene
- materialul genetic este organizat într-un singur cromozom dispus circular,
cu numeroase răsuciri si super răsuciri. In citoplasma pot exista si alte
materiale genetice accesorii (plasmide, episomi)
- sunt microorganisme mobile prin existenta formațiunilor de deplasare de
tip cili sau flageli. In lipsa lor bacteriile alunecă prin glisare.
*
prezentarea face referire la bacteriile adevarate numite si eubacterii
15
• micrococi (mikros grec= mic)- la sfârşitul procesului de diviziune,
celulele noi se separă între ele, formând coci simpli (ex. Micrococcus ureae);
• diplococi (diplos grec= dublu), câte doi, diviziunea se realizează într-un
singur plan şi celulele rezultate nu se separă (Azotobacter chroococcum);
• streptococi (streptos grec.împletit), înlănțuiți - cocii continuă să se
dividă în planuri paralele rezultând un lanț de coci (Streptococcus lactis);
• tetracoci (tetra grec =patru), diviziunea celulelor se face în două planuri
perpendiculare între ele, succesive formându-se grupe de patru celule cocice
(Micrococcus luteus).
• sarcina-diviziunea se face în trei planuri perpendiculare succesive
rezultând grupuri de câte 8 celule. Acestea rămân strânse în pachete
asemănătoare unor cuburi (Sarcina flava).
• stafilococi (staphilos grec. ciorchine)- diviziunea se face în planuri
diferite, fără nici o regularitate, formând grupe de celule asemănătoare
boabelor de struguri pe ciorchine (Staphylococcus aureus).
FigA-diplococi; B- streptococi;
2.1. Diferite C- stafilococi
forme si moduri de grupare la coci
D- cocobacili nesporogeni; E- coci simpli; J- tetracoci
*
Metodă de colorare diferită a bacteriilor descoperită în 1884 de Cristian Gram care se bazează
pe reacţia diferită la solvenţi organici de tipul alcoolului sau acetonei , care determină o
18
acest punct de vedere bacteriile se împart în Gram pozitive (G +), Gram
negative ( G - ) şi acidorezistente.
Peretele celular al bacteriilor G – este mult mai complex, din punct de
vedere chimic, deoarece conţine cantităţi mari de lipide ( 8 – 30 %) sub formă
de lipopolizaharide şi lipoproteine asociate cu mureină, mureină a cărei
pondere nu depăşeşte însă 10% din greutatea peretelui celular.
Peretele celular al bacteriilor acidorezistente conţine, pe lângă mureină
dispusă în monostrat, substanţe de natură ceroasă care conferă bacteriei
rezistenţă sporită la variaţia factoriilor abiotici (temperatură, umiditate,
substanţe chimice dezinfectante). Aşa, se explică rezistenţa excepţională si
păstrarea viabilităţii speciei Mycobacterium tuberculosum, specie
acidorezistentă, pe perioade îndelungate de luni sau chiar ani de zile.
Unii constituenţi ai mucopeptidelor parietale sunt caracteristici pentru
procariote aparţinând domeniului Bacteria, de exemplu: acidul muramic este
prezent numai în peretele celulei bacteriene, acidul diaminopimelic este întâlnit
numai la bacterii şi alge albastre iar acizii teichoici (polimeri de ribitol fosfat
sau de glicerolfosfat) sunt prezenţi numai la bacteriile Gram pozitive.
decolorare rapidă a becteriilor Gram negative în timp ca Gram pozitivele sunt rezistente la
decolorare.
19
Această dispunere, conform modelului mozaicului fluid; conferă
membranei calitatea de semipermeabilitate, fiind impermeabilă pentru
substanţele hidrosolubile dar permeabilă pentru cele liposolubile, fapt ce face
ca membrana citoplasmatică să ocupe o poziţie cheie în nutriţie şi secreţie, prin
controlul exercitat asupra pătrunderii sau ieşirii substanţelor din celulă. La
nivelul membranei citoplasmatice sunt localizate numeroase enzime aparţinând
metabolismului respirator, ceea ce indică şi o funcţie respiratorie, similară cu a
mitocondriilor din celulele eucariote. Pe lângă funcţia respiratorie membrana
citoplasmatică participă la sinteza cromatoforilor (cazul bacteriilor
fotosintetizante), a capsulei şi împreună cu mezozomii la sinteza peretelui
celular.
Citoplasma- reprezintă conţinutul celulei bacteriene. În interiorul ei se găsesc:
nucleoidul, plasmidele, ribozomii, incluziile, vacuolele, mezozomul şi
cromatoforii (la bacteriile fotosintetizante). Ea este un sistem coloidal, având
consistenţa unui gel, lipsită de curenţi plasmatici, conţine o mare cantitate de
ARN şi din acest motiv are afinitate pentru coloranţi bazici, fapt evidenţiat la
celulele tinere care de colorează uniform. La celulele senescente, pe măsură ce
cultura se învecheşte citoplasma îşi pierde treptat afinitatea tinctorială, se
retractă centripet, îndepărtându-se de peretele celular evidenţiindu-se cu o
structură granulară, cu vacuole obsevabile la microscopul electronic.
perete
mezozom capsula celular nucleoid
corp bazal
flageli
ribozomi
Incluziuni
citoplasmatice
pili membrana citoplasma
citoplasmatică
Fig 2.3 Structura generală a unei bacterii (după Zarnea Gh., 1970)
20
Nucleoidul – omolog nucleului din celula eucariota dar se deosebește de acesta
prin faptul că nu prezintă membrană nucleară. Ca atare, denumirea uzitată este
cea de nucleoid, acesta reprezentând până la 5-16% din volumul celulei.
Poziţionarea este, în cele mai multe cazuri, centrală, nucleoidul fiind legat de
membrana citoplasmatică prin intermediul mezozomului. Nucleoidul constituit
dintr-un singur cromozom în care ADN-ul se prezintă ca o moleculă bicatenară
helicală, circulară (inelară) având o greutate de aprox 2,8x10 9 daltoni. Această
moleculă are o lungime care depăşeşte de 1000 ori pe cea a celulei ce-l conţine,
ceea ce presupune plierea moleculei de cel puţin 1000 ori, formând în medie
circa 50 de bucle /cromozom.
Cromozomul bacterian este constituit din ADN 80 %, ARN mesager şi
ribozomal cu câte 10%. Se mai găsesc polipeptide bogate în doi aminoacizi:
lizină şi alanină dar lipsesc alţi doi aminoacizi precum cisteină şi triptofan, ce
se regăsesc în cromozomul eucariotelor.
Diviziunea nucleului bacterian este mitotică, nucleoidul separându-se
de-a lungul axului longitudinal în două părţi fără schimbarea observabilă a
morfologiei sale. Reduplicarea ADN este semi - conservativă, deci fiecare din
cele două molecule bicatenare de ADN nou-formate va conţine câte o catenă
veche şi una nou sintetizată.
22
b. Incluziuni lipidice (acid poli β hidroxibutiric) pot fi evidenţiate la
microscopul fotonic datorită afinităţii lor mari pentru coloranţi liposolubili de
tipul negrului de Sudan. În celulele vii, ele apar ca picături rotunde, foarte
refringente, cu dimensiuni variabile, care dau citoplasmei, în funcţie de
numărul şi dimensiunile lor, un aspect granular sau vacuolar.
c. Incluziunile proteice, au formă bipiramidală evidenţiindu-se numai la
Bacillus thuringiensis în timpul sporulării. Aceste incluziuni au capacitate
patogenă pentru larvele diferiţilor dăunători agricoli, ceea ce a condus la
utilizarea bacteriei în combaterea biologică.
După 1996, în SUA, s-a reuşit prin tehnici de inginerie genetică
transferul genelor implicate în sintetizarea proteinei respective la diferite
specii vegetale cultivate obţinându-se hibrizi de porumb, cartof, bumbac şi soia
modificaţi genetic ce posedă în materialul genetic şi gene bacteriene – Bt.
Hibrizii respectivi au dobândit rezistenţă la atacul dăunătorilor agricoli a căror
daune se datorează atacului larvelor defoliatoare.
Incluziunile anorganice, în această categorie intră:
a. Incluziuni de polifosfat anorganic (metafosfat anorganic polimerizat),
ce formează prin depozitarea lor în citoplasmă entităţi subcelulare cunoscute
sub denumirea de granule de volutină, corpusculi Babeş-Ernst sau granulaţii
metacromatice, deoarece se colorează în violet-roşu cu albastru de toluidină
sau cu albastru de metilen. După unii autori aceste granulaţii ar conţine şi
ARN, fiind în realitate constituite dintr-un complex ARN-metafosfat.
b. Incluziuni anorganice simple - sunt alcătuite din granulaţii de
carbonat de calciu sau din granulaţii de sulf coloidal. Se formează la bacteriile
sulfuroase crescute în medii bogate în H2S. În esenţă ele constituie o rezervă
de sulf deoarece dispar dacă bacteriile sunt transferate într-un mediu sărac în
H2S.
Vacuolele - sunt formaţiuni sferice cu diametrul de 0, 3 – 0, 5 , mai
puţin refringente decât citoplasma, care apar în celula bacteriană în perioada ei
de creştere activă. Numărul lor este variabil în raport cu mediul de cultură (6
– 20 de vacuole într-o celulă ). Ele conţin diferite substanţe organice şi
anorganice dizolvate în apă şi sunt delimitate de un înveliş lipoproteic
unistratificat numit tonoplast. Această membrană, întâlnită şi la
microorganismele eucariote, este semipermeabilă şi cu selectivitate accentuată.
Recent s-au descris vacuole cu conţinut gazos, conţinând probabil azot provenit
din aer sau rezultat din metabolism. Vacuolele pline cu lichid îndeplinesc rolul
de reglatori ai presiunii osmotice în raport cu mediul extern, iar cele care
conţin gaze permit celulelor menţinerea la suprafaţa mediilor lichide,
asigurând astfel contactul permanent cu oxigenul.
23
Cromatoforii - sunt prezenţi la bacteriile fotosintetizante (cianobacterii).
Ponderea lor poate ajunge până la 40-50% din greutatea uscată a celulei. Forma
şi structura cromatoforilor variază la diferite bacterii fototrofe. La unele specii
ei au aspectul unor vezicule sferice sau alungite, mărginite de o membrană,
fiind denumiţi cromotofori, datorită prezenţei pigmenţilor fotosintetizanţi.
Ulterior au primit denumirea de thylakoizi, datorită formei lor de pungă (
thylakos grec. pungă ). La alte specii bacteriene cromatoforii se prezintă ca
nişte discuri aşezate în straturi (lamele). Ei sunt sintetizaţi de către membrana
citoplasmatică, rezultând din invaginarea şi creşterea acesteia.
Endosporul bacterian este o celulă specială care are capacitatea de a
păstra în stare latentă toate caracterele genotipice ale celulei bacteriene
vegetative (active) din care provine. Endosporii bacterieni sunt forme de
rezistenţă, de conservare a speciei şi nu au o funcţie de reproducere. Celula
bacteriană vegetativă care va forma un endospor se numeşte sporangiu.
Endosporul nu este incapabil de diviziune. Într-un sporangiu se formează un
singur endospor. El se formează intracelular la formele bacteriene de formă
bacilară iar poziţionarea endosporului variază în funcţie de gen (fig. 2.4.) La
genul Bacillus endosporul poate fi poziţionat central, subterminal sau terminal,
diametrul sporului fiind mai mic decât diametrul transversal al sporangiului. La
genul Clostridium diametrul endosporului este mult mai mare decât diametrul
sporangiului determinând deformarea acestuia şi apariţia formelor apiculate
(asemănătoare unor lămâi) la dispunerea centrală sau a formei plectridiale
asemănătoare beţelor de chibrit) în cazul dispunerii terminale a endosporului.
a. b c. d.
Intrebări autoevaluare
1. Care sunt diplococii? Dar diplobacilii?
2. Ce este o sarcină?
3. Care sunt subtipurile formei curbate a bacteriilor?
4. Ce sunt peptidoglicanii? Unde se găsesc?
5. Din ce este constituită membrana citoplasmatică? Ce rol îndeplineste
în celula bacteriană
6. Ce rol îndeplineşte mezozomul în celula bacteriană?
7. Ce tip de ribozomii se gasesc în celula bacteriană? Ce rol
îndeplinesc?
8. Ce este tonoplastul?
25
Curs 4
26
a. b. c. d.
5 6
Fig.2.8. Numărul şi dispunerea flagelilor la bacterii
28
un tip dat, lungimea lor este variabilă, chiar la aceeaşi celulă, fiind cuprinsă
între 1 şi 20 m.
Prezenţa pililor este controlată genetic de gene situate pe epizomii de
sex. Prin mutaţii genetice la nivelul epizomilor pilii pot fi pierduţi, dar aceasta
modificare nu afectează viabilitatea celulelor.
Au fost descrise două tipuri de pili:
- Pilii de tip I , scurţi, rigizi şi numeroşi. La capătul acestora se găseşte
o glicoproteină ce permite aderarea bacteriei la receptorii glicolipidici de pe
suprafaţa celulei gazdă sau la suprafaţa diferitelor obiecte. În plus cu ajutorul
pililor celulele bacteriene se unesc în masă între ele determinând formarea unor
pelicule de bacterii care plutesc pe suprafaţa mediilor lichide. Prin acest mijloc
în natură se favorizează creşterea celulelor bacteriene saprofite, strict aerobe,
din apele stagnante.
Ca urmare, pilii de tip I asigură celulelor un avantaj biologic faţă de
formele nepiliate (P-), conferindu-le posibilitatea de a creşte mai bine la
concentraţii mici de O2 şi de a continua să se multiplice în faza de declin a
culturii, când densitatea celulelor este maximă.
pili de
sex
29
- Pilii de tip F servesc pentru transferul ARN fagic de la un bacteriofag
la celula bacteriană. Acest proces este posibil datorită formei tubulare a pililor
F. De asemenea pili F îndeplinesc rolul de cale transportoare (canal de
conjugare) pentru transferul de material genetic (ADN) de la celula donatoare
masculă (F+) la o celulă receptoare femelă (F-). Procesul se numeşte conjugare,
fiind o cale de asigurare a variabilităţii în cadrul populaţiilor bacteriene.
Prezenţa pililor de tip F este foarte importantă în cazul bacteriilor Hfr
(hight frecvency recombination). Acestea au un fragment de ADN (epizom)
inclus în cromozomul bacterian si prin procesul de conjugare îl pot transfera de
la o bacterie F+ la una F-. Dacă pe respectivul fragment se află localizate gene
care determină sinteza anumitor substanțe cu rol bioactiv atunci prin transferul
fragmentului se induce această capacitate de sinteză la bacteria F- .
Întrebări curs 4:
1. Ce înțelegeți prin formațiuni extraparietale. Care sunt acestea?
2. Care este rolul capsulei pentru celula bacteriană?
3. Cum se numesc bacteriile fără cili?
4. Ce sunt bacteriile peritriche?
5. Ce deosebire exista între pili si cili?
6. Care este rolul pililor?
30
Curs 5.
31
Exigenţele foarte mici ale metabolismului bacterian faţă de elementele
nutritive, reprezintă cea de-a doua caracteristică a acestuia. Într-adevăr
începând de la cele mai simple substanţe azotul molecular, bioxid de carbon,
hidrogenul sulfurat până la substanţele organice mai complexe, parafine, petrol,
cauciuc, toate sunt accesibile metabolismului bacterian.
32
• fototrofe (fotosintetizante), utilizează lumina ca unică sursă
energetică.
• chimiotrofe (chimiosintetizante), îşi obţin energia necesară
proceselor vitale din reacțiile de oxidare a substanţelor exogene.
Nutriţia fototrofă
Bacteriile fototrofe, utilizează radiaţiile luminoase ca sursă de energie,
utilizată pentru reducerea compuşilor anorganici cu carbon, respectiv CO2.
Fotosinteza se desfășoară la nivelul cromatoforilor, ponderea acestora
într-o bacterie fotosintetizantă fiind de până la 40% din greutatea celulei.
Cromatoforii conţin numai clorofila (bacteriile sulfuroase verzi, purpurii şi
nesulfuroase purpurii, vezi tabelul 4.2) sau clorofilă şi pigmenți carotenoizi
(bacteriile sulfuroase purpurii şi nesulfuroase purpurii).
Este important de reținut că clorofila bacteriană se deosebeşte ca
conţinut de cea a plantelor, ea numindu-se bacterioclorofilă (vezi tab 4.2.)
Tabel 4.2
Tipuri de bacterioclorofile la bacteriile fotosintetizante
Tip clorofilă Grupa bacterii Observaţie
Bacterioclorofila a Bacterii purpurii Conţin şi pigmenţi carotenoizi
Bacterioclorofila b Bacterii purpurii care le conferă culoarea roşie
33
Bacterioclorofila g Heliobacterium chlorum Culoare verde - brun
hλ
CO2+ 2H2S (C H2 O) + H2O + 2S
cond anaerobe
hλ
CO2+ 2H2 (C H2 O) + H2O
cond anaerobe
hλ
3CO2+ 2S +5H2O 3(C H2 O) + 2H2SO4
cond anaerobe
Nutriţia chimiotrofă
Bacteriile chimiotrofe (chimiosintetizante), utilizează energia chimică
rezultată în diferite reacţii de oxidare. Se disting următoarele subtipuri de
nutriţie:
1. chimiolitoautotrofă;
2. chimioorganoautotrofă
3. chimiolitoheterotrofă
4. chimioorganoheterotrofă
35
- sulfobacteriile nepigmentate oxidează H2S, S, Na2S2O3 (tiosulfati) cu formare
de acid sulfuric sau sulfaţi. Sunt răspândite în ape (îndeosebi cele termale)
formele filamentoase. Ele sunt alcătuite din celule dispuse în lanţuri numite
trichomi. Reprezentant: genul Beggiatoa.
În soluri se găsesc reprezentanţi ai genului Thiobacillus, respectiv T.
thiooxidans - este rezistent la aciditate mare, T. denitrificans – în condiţii
anaerobe foloseşte nitraţii realizând denitrificarea în soluri şi T. ferrooxidans –
acesta pe lângă compuşi reduşi cu sulf îi poate oxida si pe cei cu fier.
- ferobacteriile, oxidează fierul bivalent la trivalent, sunt răspândite în ape, mai
rar în soluri, au formă filamentoasă formând trichomi înconjuraţi de o teacă
mucilaginoasă impregnată cu hidroxid de fier sau mangan. Uneori filamentele
pot avea ramificaţii false. Reprezentant - Sphaerotilus natans. Ferobacteriile
nefilamentoase sunt bacilare sau reniforme cu peduncul în care se depune Fe
(OH)3. Reprezentanţi: Gallionella ferruginea, Ferobacillus ferooxidans
- hidrogenbacteriile, oxidează hidrogenul şi cu energia produsă reduc
carbonaţii. Nu sunt microorganisme obligat autotrofe putând utiliza şi diferite
substanţe organice ca surse de carbon, de aceea aceste bacterii fac trecerea la
chimioorganoheterotrofe. Se găsesc răspândite în soluri, nămoluri.
Reprezentanţi Methanobacterium
36
compuşi organici, excepţie fac reprezentanţii genului Cytophaga care pot folosi
un spectru redus de carbohidraţi, respectiv celuloza, glucoza şi alte zaharuri.
C + O2 CO2
- proces de pierdere de hidrogen, (care decurge în absenţa oxigenului) :
37
- Strict anaerob, care nu are nevoie de oxigen pentru dezvoltare, prezenţa
acestuia fiind chiar dăunătoare (în prezenţa oxigenului se formează compusi de
tipul peroxizilor care sunt descompuşi sub influenţa catalazei şi peroxidazei,
enzime care lipsesc cu desăvârşire la aceste microorganisme)- Clostridium
pasteurianum, Clostridium botulinum, Clostridium perfringens.
- Facultativ aerob sau anaerob, metabolismul bacterian modificându-se în
funcţie de prezenţa sau absenţa oxigenului- Escherichia coli, Staphylococcus
sp, Streptococcus sp
- Microaerofil, au nevoie de o tensiune mică de oxigen datorită
sensibilităţii mărite a unor enzime la condiţii de oxidare puternică -
Helicobacter pylori, Lactobacillus acidophilus.
La bacterii, ca la orice celulă vie, cantitatea de energie eliberată în
cursul proceselor aerobe de respiraţie este mult mai mare decât cea degajată în
condiţii anaerobe.
De asemenea, valoarea energetică a unei substanţe depinde de gradul de
oxidare pe care îl suferă: cu cât oxidarea este mai completă, cu atât va fi mai
mare şi cantitatea de energie eliberată. Spre exemplu, în cazul glucozei
cantitatea cea mai mare de energie se produce printr-o oxidare completă numai
în condiţii aerobe.
c. oxidare anaerobă:
38
este folosit în respiraţie, restul (cca. 50%) fiind asimilat şi convertit în
constituenţi specifici celulari, ceea ce are ca rezultat o creştere celulară intensă
însoţită de multiplicare activă. După epuizarea mediului în substanţe nutritive
procesele metabolice se realizează la nivel scăzut, caracteristic celulelor în
repaus.
În cursul respiraţiei anaerobe, substanţele nutritive din mediu sunt
utilizate în proporţie de doar 5% pentru formarea de constituenţi celulari.
Restul substanţelor sunt degradate în vederea obţinerii de energie, energie a
cărei cantitate este mult mai redusă în lipsa oxigenului, după cum s-a arătat
anterior. În schimb se acumulează în mediu o cantitate apreciabilă de produşii
organici intermediari, rezultaţi din degradarea parţială, a căror concentraţie
ridicată devine toxică chiar pentru microorganismul care i-a generat.
40
durată de timp necesară multiplicării în jur de 20 minute, după aproximativ 7
ore de incubare, de la o celulă iniţială se ajunge la un 16 x 106celule. În această
fază se înregistrează o viteză de diviziune caracteristică speciei. În colonie
predomină celule tinere, omogene, care se colorează bine (conţin mult ARN)
fiind cele mai potrivite pentru cercetări de genetică şi fiziologie.
Ritmul de creştere a bacteriilor este însă discontinuu, datorită răspunsului
diferit al celulelor la variațiile factorilor de mediu, variație care are ca rezultat o
desincronizare şi încetinire a ritmului de creştere a celulelor în cadrul aceleiași
colonii. Dacă nu s-ar înregistra acest fenomen, există posibilitatea ca dintr-o
bacterie, în 48 ore, să rezulte 22 x 1043 celule bacteriene însumând o greutate
apreciabilă. (de 4000 ori mai mare decât masa pământului).
Faza de multiplicare exponențială încetează atunci când se atinge
densitatea 0,1-1 miliard celule la 1 ml mediu sau aproximativ 1 g substanță
uscată la 1 litru mediu.
Faza staţionară sau de plafon. Aceasta începe cu scăderea progresivă a
vitezei de multiplicare. Numărul de celule viabile rămâne constant, există un
echilibru între multiplicarea şi mortalitate. Durata fazei depinde de cantitatea
de nutrienţi din mediu. În această fază celulele au înfăţişarea caracteristică
speciei, afinitate normală pentru coloranţi, citoplasma celulară este mai puţin
omogenă datorită apariţiei de incluziuni, apar endosporii la speciile sporogene.
Faza de declin. Ca urmare a epuizării mediului în substanţe nutritive
numărul de celule în cultură se diminuează, celulele nu se mai multiplică.
Predomină polimorfismul celular, cu apariţia de celule deformate, umflate,
alungite, care nu sunt caracteristice speciei Se semnalează frecvente fenomene
de liză (distrugere) a celulelor cu formarea masivă a sporilor, la celulele care
posedă această proprietate.
41
Fig 3.2.Evoluţia, pe faze, a culturii bacteriene.
Întrebări curs 5:
42
Curs 6
1. perete celular
2. membrana citoplasmatică
3. strat nucleoproteic
4–5 mitocondrii
46
celula fiică se separă de celula mamă pe suprafaţa peretelui celular se observă o
cicatrice.
Reproducerea sexuată, este întâlnită la bacteriile din genul Saccharomyces şi
constă în unirea a două celule haploide, procesul purtând denumirea de
conjugare, rezultând zigotul. Zigotul se poate multiplica în continuare prin
înmugurire sau se poate transforma în într-o celulă specială, ască în care se
diferenţiază prin diviziune reducţională, patru ascospori. Ascosporii se unesc
rezultând din nou o celulă diploidă.
Drojdiile au valoare practică întrucât sunt implicate în procesele
fermentative din industria alcoolului, a berii, a vinului, a panificaţiei, pentru
producţia de biomasă celulară, utilizată în obţinerea drojdiei furajere, obţinerea
de acizi, substanţe organice şi substanţe biologic active (aminoacizi, vitamine
din grupul B, -carotenul şi provitamina D2).
47
• partea aeriană este alcătuită din hife groase, lungi, mai puţin
ramificate, rezistente, care poartă formaţiunile de fructificare ale mucegaiului.
În ciclul de dezvoltare a mucegaiurilor se disting două faze:
- Faza vegetativă în care mucegaiurile îşi formează sistemul hifal şi
nu se pot diferenţia taxonomic.
- Faza reproducătoare în care mucegaiurile îşi formează elementele
de reproducere şi pot fi diferenţiate taxonomic.
Mucegaiurile sunt caracterizate prin toleranţă mai mare faţă de
condiţiile nefavorabile, în raport cu bacteriile. Astfel ele suportă mai uşor lipsa
umidităţii, se pot dezvolta la o reacţie uşor acidă dar tolerează şi valori ale pH
de 3 sau 9. Temperatura optimă de dezvoltare 22-32˚C. Sunt capabile să
sintetizeze substanţe antibiotice pe care le elimină în mediul de cultură cu
scopul de aîmpiedica sau a stăvilii cresterea microorganismelor sensibile.
Structura internă este asemănătoare levurilor, mucegaiurile fiind
microorganisme de tip eucariot. Sterolii sunt compusii specifici din compoziţia
peretelui celular al mucegaiurilor, ergosterolul fiind considerat predominant.
E
D I
C
C D G
B
B H
F
48
LEGENDA
A – rizoizi
B – sporangiofori
C – sporange
D – spori
E – columela
F – conidiofori
ASPERGILLUS
G – metule
Fig 4.2.Diferite tipuri de mucegaiuri
H – sterigme
I – conidii
Metabolismul. Sunt microorganisme heterotrofe caracterizate prin
folosirea ca sursă de carbon a hidraţilor de carbon de tipul glucidelor, alcooli,
acizi organici iar ca sursă de azot compusi organici de azot de tipul peptone,
aminoacizi sau compusi minerali cu azot: amoniac, uree, nitraţi. Pot metaboliza
şi substanţe mai greu biodegradabile ca lignină, celuloză, chitină.
Sporii sexuaţi – apar prin fuziunea dintre doi gameţi sau prin
diviziunea unei celule care rezultă în urma unui asemenea proces de fuziune.
Sporii sexuaţi sunt de patru tipuri: ascospori, basidiospori, oospori şi
zigospori.
• Ascosporii iau naştere prin fuziunea a două prelungiri tubulare ale două
celule vecine de pe acelaşi miceliu sau de pe micelii diferite. Prin fuziune
rezultă zigotul care se transformă într-o ască în care se diferenţiază ascosporii.
50
• Bazidiosporii se formează la exteriorul unui organ numit bazidie. O
bazidie este de fapt extremitatea unei hife unde se diferenţiază o celulă
binucleată. Cele două nuclee fuzionează rezultând un nucleu unic care se
divide succesiv formând patru nuclee fiice. În partea apicală a bazidiei se
formează patru sterigme (prelungiri), în fiecare migrând câte un nucleu, care
vor evolua ulterior în bazidiosporii. La maturitate aceştia sunt eliberaţi.
• Oosporii rezultă prin unirea unui gamet femel cu un gamet mascul,
ambii diferenţiaţi pe hife vecine.
• Zigosporii rezultă din fuziunea a două hife identice, numite gametangii,
formând zigosporul acoperit cu un perete gros de culoare neagră. În condiţii
favorabile de mediu sporul germinează şi emite un tub filamentos germinativ
din care apar hifele vegetative.
Mucegaiurile au capacitatea de a sintetiza substanţe antibiotice,
aminoacizi, lipide, pigmenţi, acizi organici. Unele sunt patogene pentru om,
plante şi animale producând boli numite micoze. De asemenea pot contamina
alimentele producând micotoxine periculoase pentru om sau produc pagube
prin degradarea pieilor şi a hârtiei.
5.4. PROTOZOARELE
Întrebări:
1. Ce sunt drojdiile?
2. Argumentați importanța practică a drojdiilor.
3. Ce tip de respirație au drojdiile?
4. Organizarea morfologică a mucegaiurilor
5. Care sunt fazele formării si creşterii unui miceliu?
6. Unde sunt încadrate protozoarele din punct de vedere a organizării
materialului genetic?
7. Care este factorul limitativ in functionarea protozoarelor?
8. Care sunt clasele de protozoare intalnite in soluri?
53
Curs 7
55
termofile
mezofile
psihrofile
psihrotrofe
56
Efectul letal al temperaturilor supramaximale stă la baza procesului de
sterilizare cu ajutorul căldurii, sterilizarea fiind determinată de nivelul
temperaturii şi de durata de acţiune. Astfel, timpul necesar unei sterilizări
eficiente poate fi scurtat prin ridicarea nivelului temperaturii, pe când
sterilizarea la o temperatură mai puţin ridicată presupune o durată mai mare de
timp.
Efectul temperaturilor subminimale asupra microorganismelor. În
general microorganismele sunt mai rezistente la acţiunea temperaturilor
subminimale decât cele supramaximale. Începând de la temperatura de 5ºC la
0ºC microorganismele mezofile şi termofile nu se mai înmulţesc. Acest lucru
stă la baza conservării produselor la rece.
Mecanismul acţiunii îngheţului asupra microorganismelor.
La temperatura de 0ºC apa începe îşi modifice starea de agregare de la
lichid la solid, respectiv să se cristalizeze. Cristalele de gheaţă formate, atât
cele intracelulare cât şi extracelulare, sunt nocive ducând la deshidratare şi în
final la lezarea structurii celulei.
Dacă îngheţul de face lent atunci, îngheaţă mai întâi apa extracelulară
determinând o creştere a presiunii osmotice extracelulare, ieşirea apei din
celula microbiană şi instalarea fenomenului de plasmoliză. Dacă îngheţul se
instalează rapid, cristalizează mai întâi apa intracelulară iar celula va fi distrusă
prin leziuni fizice.
Dacă coborârea temperaturii sub 0ºC, până la -300C, se face foarte
rapid atunci se înregistrează mai puţine celule distruse decât în cazul când
îngheţul survine lent. Principiul stă la baza conservării culturilor microbiene
prin liofilizare (procedeu de conservare a culturilor prin îngheţare rapidă la -
70ºC concomitent cu deshidratare rapidă sub vid ).
57
3. Presiunea osmotică
Presiunea osmotică a celulei microbiene este uşor mai mare decât
concentraţia mediului de cultură. Acest lucru permite pătrunderea apei din
mediu în celulă cu scopul egalizării concentraţiilor. Dacă concentraţia
mediului extern este mai mare decât cea din interiorul celulei bacteriene,
(soluţia e hipertonică), are loc o ieşire masivă a apei din celulă, fenomen numit
plasmoliză. Dimpotrivă, dacă concentraţia externă este mai mică (se numeşte
hipotonică), apa năvăleşte în celulă, se umflă şi plesneşte, fenomenul numindu-
se plasmoptiză).
Concentraţia optimă care permite dezvoltarea microorganismelor este
cea a soluţiei izotonice, a cărei presiune osmotică este echivalentă cu a
mediului intracelular. Există şi microorganisme care pot rezista la presiuni
osmotice ridicate (sunt osmofile), ex: microorganismele halofile ( suportă
concentraţii mari de sare). Acestea, la rândul lor pot fi:
- halofile facultative, cresc la o concentraţie sub 2% NaCl, din această
categorie fac parte majoritatea speciilor microbiene;
- halofile obligate, care cresc numai la o concentraţie mai mare de 2% NaCl,
dar nu depăşesc 12%, ex microorganismele marine (Micrococcus
halodenitrificans).
- halofile extreme, pot creşte numai la concentraţii mai mari de 12% NaCl, ex:
Halobacterium .
In solurile sărăturate se întâlnesc specii halofile facultative apartinând genurilor
Micrococcus si Bacillus care poseda mecanisme adaptative la concentratii mari
de sodiu schimbabil, săruri solubile si pH puternic alcalin, reprezentanţii
genurilor fiind comuni pentru solurile normale cu pH neutru.
Microorganismele care trăiesc la concentraţii mari de zahăr, din
dulceţuri, gemuri, siropuri, se numesc zaharofile şi pot suporta concentraţii de
peste 50% zahăr.
58
bazează utilizarea lămpilor UV în sterilizarea aerului încăperilor, a sălilor de
operaţie şi a laboratoarelor farmaceutice.
Radiaţiile X şi γ aplicate în doze mari pot avea efect mutagen sau
microcid asupra microorganismelor. Acţiunea acestor radiaţii este ionizantă
prin faptul că lovesc anumiţi atomi ai celulei rezultând formarea de ioni,
radicali liberi. Acţiunea indirectă a radiaţiilor, asupra microorganismelor, se
manifestă prin intermediul ozonului şi a apei oxigenate, care se formează sub
influenţa lor.
Radiaţiile ionizante se pare că acţionează asupra ADN-ului, înlăturând
punţile de hidrogen dintre cele două catene cu legături mai stabile, blocând în
acest fel diviziunea. Pentru ca radiaţiile ionizante să acţioneze, ele trebuie să
atingă anumite puncte sensibile din celula microbiană: cu cât intensitatea
iradierii este mai puternică acest fenomen are şanse mai mari de a se produce
(“teoria ţintei”).
Radiaţiile au fost utilizate în sterilizarea alimentelor însă, au
dezavantajul că lasă un miros neplăcut acestora, de aceea metoda este puţin
utilizată.
Bacteriile şi alte microorganisme s-au dovedit mai rezistente la radiaţii
decât omul şi celelalte mamifere. Astfel DL la om este de 500r ( Rontgen); DL
la Escherichia coli 10 000 r; DL, la levuri este 30 000 r; DL la Paramecium
caudatum 300 000r. Cea mai rezistentă bacterie la radiaţii γ este Deinococcus
radiodurans. Aceasta dispune de un mecanism special de anulare a efectului
radiaţiilor. Bacteria suferă grave leziuni ale ADN, la fel ca celelalte organisme
vii, însă încetează de a se multiplica timp de 6 ore, interval în care remediază
aceste leziuni.
Tabelul 3.1
Agenţi chimici sterilizaţi de uz curent (după Grozav şi Trif,1990)
Denumirea substanţei Scop
Sublimat coroziv (sol clorură Dezinfecţia mobilierului de
mercurică) 1‰ laborator;
Dezinfecţia pipetelor
Formol soluţie 3-5% Dezinfecţie sticlărie, faianţă,
metal;
Inactivare culturi microbiene.
Fenol soluţie 5% Dezinfecţie sticlărie, faianţă,
metal;
Conservare seruri (0,5%)
Hidroxid de sodiu 2-3% Dezinfecţie mobilier,
pardoseli, cuşti animale
Alcool medicinal Dezinfecţie mâini
Cloramina sol 1-5% Dezinfecţie mobilier;
Dezinfecţie mâini
60
Dezinfectant cationic , sol 1- Dezinfecţie suprafeţe netede;
3‰ Dezinfecţie mâini
Apa oxigenetă Dezinfecţie mucoase
63
Curs 8
64
3.2.1.Metode bazate pe principiul biozei
Bioza este principiul prin care se asigura pastrarea functiilor vitale ale
celulelor, astfel alimentele conservate prin acest principiu îşi păstrează
proprietăţile vitale, inclusiv mecanismele de rezistenţă la infecţii. Pentru
microorganisme acest principiu asigură efecte microstatice, în acest sens viteza
de multiplicare a microorganismelor este diminuată datorită temperaturilor
scăzute de 4-50C si asigurarea ventilaţiei. Metoda se aplică fructelor şi
legumelor conservate în stare proaspătă, acestea păstrându-şi în depozite
capacitatea de respiraţie şi de maturizare (coacerea merelor sau a bananelor are
loc în silozuri) şi capacitatea naturală de rezistenţă la infecţii.
65
- uscarea permite conservarea alimentelor prin lipsa apei. Metoda constă în
deshidratarea alimentului la un conţinut de apă sub 12%. La această valoare se
împiedică schimburile osmotice la nivelul celulei şi se sistarea metabolismului
microbian.
- sărarea sau zaharisirea determină mărirea concentraţiei de substanţe din
mediu şi creşterea presiunii osmotice ceea ce va avea ca efect moartea
microorganismelor. Cu toate acestea alimentele pot fi supuse alterării de către
microorganismele halofile extreme (Halobacterium) sau zaharofile ( în general
ciuperci).
Metode de conservare ce presupun folosirea agenţilor chimici se
bazează pe cenanabioză şi antibioză. Ambele se pot induce pe cale naturală sau
artificială.
Cenanabioza presupune modificarea pH- ului alimentului prin
activitatea microorganismelor fermentative acidotolerante împiedicându-se
creşterea şi multiplicarea microorganismelor de putrefacţie. Metodele bazate pe
acest principiu sunt:
- Murarea, se bazează pe acţiunea microorganismelor saprofite utile care
produc acid lactic. Se aplică legumelor, fructelor, nutreţurilor verzi pentru
conservare ca siloz. Pentru a se favoriza procesul fermentativ
microorganismelor implicate trebuie să li se faciliteze accesul la conţinutul
celular al produselor vegetale.
Acest lucru se realizează prin sărare ( legume) sau prin strivire (silozuri).
- Marinarea sau conservarea în acid acetic (oţet) constă adiţionarea oţetului
într-o concentraţie între 4% şi 6% .
Există însă specii microbiene care sunt acidofile, îndeosebi specii de
mucegai şi drojdii care s-au dovedit tolerante la aciditatea ridicată. De aceea
pentru a se asigura o conservare sigură se recomandă folosirea acţiunii
combinate a acidului cu a căldurii.
Antibioza se bazează pe folosirea substanţelor antibiotice. În funcţie de
antibioticul utilizat se permite creşterea unei anumite categorii de
microorganisme utile în conservare. Rezultate remarcabile se obţin prin
combinarea antibiozei cu a căldurii.
În regiunile tropicale se uzitează metoda de injectare cu antibiotic a
animalelor care urmează a fi sacrificate pentru a prevenii alterarea cărnii.
În prezent sunt utilizate furaje combinate aditivate cu antibiotice în
creşterea intensivă a animalelor de carne, ca o măsură profilactică în
răspândirea bolilor.
66
3.2.3. Metodele bazate pe principiul abiozei
Intrebari:
1. In opinia dumneavoastra care ar fi cea mai sigura metoda de
conservare pentru legume. Argumentaţi?
2. Ce presupune marinarea?
3. Dati exemplu de trei metode de conservare bazate pe principiul
anabiozei folosind metode fizice.
4. Ce presupune o metoda combinată de conservare? Dati exemple
67
Curs 9
Bacteriile
Cele mai numeroase microorganisme din sol (9/10 din totalul microflorei)
sunt bacteriile. Ele sunt reprezentate în solurile agricole numai de specii
aparţinând domeniului bacteria (Eubacteria). Numărul lor variază în funcţie de
abundența substanţelor organice, tipul de sol, anotimp, planta de cultură şi
metoda de determinare utilizată, oscilând între 1 milion până la 1miliard de
70
bacterii/gr sol uscat. Numărul mare de bacterii corelează pozitiv cu numărul
protozoarelor, pentru care ele constituie principala sursă de hrană.
Numărul bacteriilor scade pe profilul solului, deoarece scade cantitatea de
materie organică şi concentraţia de oxigen ceea ce determină direct creşterea şi
multiplicarea micropopulaţiei heterotrofe aerobe. De asemenea, existenţa unei
cantităţi mari de apă în sol determină perturbarea echilibrului apă/aer, cu efect
asupra bacteriilor strict aerobe care, fiind private de prezenţa oxigenului, îşi
încetează activitatea.
De asemenea, în cazul unui conţinut ridicat de argilă, creşte fracţia
micropopulaţiei bacteriene absorbite la suprafaţa acesteia, fenomen bazat pe
atracţia particulelor cu sarcini contrare (lamelele argiloase au sarcină pozitivă,
pe când la suprafaţa celulelor sarcinile sunt negative), determinările numerice
fiind în acest caz afectate de numeroase erori.
Reacţia acidă sau alcalină, chiar cu valori de 6,5 sau 7,5 -8, are influenţă
negativă asupra populaţiei bacteriene care nu suportă modificări ale
echilibrului ionic din soluţia solului.
Activitatea bacteriilor este legată de mineralizarea compuşilor organici
din sol şi transformările diferitelor substanţe minerale în sol. Din punct de
vedere al nutriţiei majoritatea sunt chimioorganoheterotrofe excepţie fac
bacteriile nitrificatoare, sulfatreducătoare care sunt chimioautotrofe.
Cele mai importante bacterii în sol sunt:
a. Bacteriile care participă la procesele implicate în circuitul azotului din
sol: nitratbacteriile (Nitrobacter, Nitrococcus, Nitrospira) şi nitritbacteriile
(Nitrosomonas, Nitrosococcus, Nitrosospira), bacteriile simbiotice (Rhizobium,
Bradyrhizobium) şi nesimbiotice fixatoare de azot (Azotobacter, Beijerinckia),
proteolitice, amonificatoare (Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter etc),
bacteriile denitrificatoare (Thiobacillus denitricans, Bacillus denitrificans).
b. Bacteriile care descompun carbohidraţii din compoziţia resturilor
vegetale, îndeosebi celulozolitice, pectice (Cellulomonas, Cellfacicula,
Cellvibrio, Clostridium sp., Bacillus sp).
c. Bacteriile implicate în descompunerea altor compuşi, inclusiv cei de
sinteză. Datorită activităţii lor se evită fenomenele de acumulare, asigurându-se
circuitul elementelor în
natură. Din această categorie fac parte actinomicetele precum şi reprezentanţi
ai genului Pseudomonas (este considerată bacteria cea mai omnivoră, speciile
genului având capacitatea de a accede din punct de vedere metabolic în jur de
200 compuşi diferiţi, de provenienţă naturală sau sintetică).
71
Bacteriile filamentoase. Actinomicetele
Cianobacteriile
72
Cu toate că sunt microorganisme procariote, cianobacteriile sunt
caracterizate de o mare variabilitate genotipică, ceea ce le permite ocuparea şi
creşterea pe o arie întinsă şi diversă din punct de vedere a temperaturii (de la
temperaturi de peste 400C până în ţinuturile arctice), al disponibilităţii apei (
ecosisteme acvatice până la cele aride) şi a salinităţii (medii hiposaline la
hipersaline).
Fiind microorganisme cu nutriţie fototrofă, au pigmenţii asimilatori
precum clorofila şi ficobilina, cu cele două componente ficocianina, care
asigură culoarea albăstruie, sau ficoeritrina, pentru culoarea roşie. Materialul
de rezervă este reprezentat de amidon cianofitic sau proteine specifice precum
cianoficina. Cianobacteriile sunt organizate în clasa Cyanophyta,
reprezentative pentru sol sunt genurile: Nostoc, Anabaena, Nodularia,
Oscillatoria, Phormidium, Rivularia.
Importanţa cianobacteriilor din sol derivă din faptul că fac parte din
categoria producătorilor primari. Având cele mai modeste pretenţii nutriţionale,
cu posibilitate de a popula rocile golaşe alături de algele verzi, sunt
responsabile de iniţierea proceselor de pedogeneză. Această realizare se
datorează capacităţii de a fixa azotul gazos. Specii precum Anabaena
variabilis, Nostoc punctiforme, Nostoc muscorum, cu posibilităţi de fixare
biologică a azotului atmosferic, realizează îmbogăţirea cu azot a orezăriilor.
Algele edafice
73
Senedesmus. Clasa Bacillariophyceae, cuprinde diatomeele, alge
unicelulare, având peretele celular impregnat cu silice. Celula e formată
din două jumătăţi care se închid precum o cutie. Reprezentanţi:
Pinnularia, Pleurotaenium.
- Clasa Chrysophyceae cuprinde alge brun gălbui, unicelulare sau în
colonii, ce conţin clorofila a, c1 şi c2 precum şi caroten. Reprezentanţi:
Chromulina, Chrysolepidomonas
- Clasa Euglenophyteae cuprinde alge verzi flagelate, nutriţia fiind mixtă.
La lumină se hrănesc autotrof iar în lipsa ei heterotrof. Reprezentant
Euglena gracilis.
Datorită procesului de fotosinteza, algele îmbogăţesc soluţia solului în oxigen,
favorizând astfel creşterea sistemului radicular al plantelor şi a
microorganismelor aerobe în condiţiile unui exces de umiditate în sol.
Înmulţirea algelor se realizează prin fragmentarea filamentelor, când sunt în
colonii sau prin diviziunea celulei. Se pot înmulţii şi sexuat prin contopirea a
două celule diferite, din a căror unire rezultă zigotul.
Unele alge trăiesc în simbioză cu ciupercile formând lichenii care cresc
pe suprafaţa rocilor.
Ciupercile microscopice
74
formarea structurii solului, deoarece hifele lor strâng ca nişte curele particulele
de sol, făcându-le
favorabile pentru creşterea plantelor superioare. Hifele au proprietăţi hidrofuge
ceea ce implică un rol protector faţă de acţiunea distructivă a apei.
Mucegaiurile au şi capacitate de a produce antibiotice, dar şi aşa numitele
micotoxine, substanţe cu înalt caracter cancerigen şi mutagen. Rolul ecologic
al micotoxinelor este puţin cunoscut în vreme ce antibioticele asigură
mucegaiurilor un avantaj în concurenţa cu specii bacteriene cu creştere rapidă.
Fig 6.1. Principalele mucegaiuri din sol, după Paul şi Clark, 1988
75
IV.1.3. Ultramicropopulaţia solului
76
Întrebari autoevaluare:
77
Curs 10
78
b) capacitatea superioara de supravieţuire la condiţii nefavorabile,
capacitate care este mai mare la organisme ce au organe speciale de rezistenţă
(spori şi chişti la bacterii) supor-tând astfel abateri mai mari de la media
factorilor de mediu (temperatură, umiditate, aeraţie aciditate, cazul ciupercilor).
c) pretenţii reduse pentru creştere, microorganismul poate supravieţui şi
creşte când elementele necesare vieţii sunt în cantităţi minime în mediul
înconjurător. Exemplu: microorga-nismele capabile de a-şi sintetiza singure
vitaminele specifice (factorii de creştere) sunt mai competitive, comparativ cu
cele care au nevoie de prezenţa acestora în mediul de cultură.
d) capacitatea de a învinge mecanismele de rezistenţa (biotice sau abiotice)
din mediu.
Amensalismul sau suprimarea unui microorganism de către un factor toxic
produs de un altul. Factorul toxic poate fi anorganic sau organic, un acid sau un
antibiotic. Exemplu acidul lactic şi acidul butiric, produşi ai bacteriilor de
fermentaţie lactică sau butirică, împiedică dezvoltarea bacteriilor de
putrefacţie. Tot aici trebuie menţionat şi fenomenul de antibioză când
antibioticul
produs de un microorganism (mucegaiuri) împiedică dezvoltarea altor tipuri de
microorganisme (bacterii).
Un alt tip de relaţii antagonice sunt cele de parazitism, respectiv de
parazitare a unui organism din sol de către altul. Parazitul poate trăi pe
organismul parazitat numindu-se în acest caz ectoparazit sau în interiorul
acestuia, cazul endoparaziţilor. Parazitismul poate fi obligat, cazul microfagilor
(bacteriofagi sau micofagi) când parazitul nu se poate multiplica decât în celula
gazdă sau facultativ, precum unele micoplasme.
În funcţie de evoluţia relaţiei gazdă-parazit se diferenţiază mai multe tipuri de
parazitism:
- distructiv, când acţiunea parazitului determină distrugerea celulei sau a
organismului gazdă. Exemplu: acţiunea bacterio-fagului lizogen care
parazitează bacteriile Rhizobium determi-nând decelarea numărului de fixatori
simbiotici din rizosfera plantelor leguminoase. Din familia Baculoviridae face
parte granulovirusul GV, care parazitează viermele merelor Cydia pomonela, în
final determinând moartea larvei. Fenomenul prezintă importanţă practică
majoră deschizând perspectiva utilizării acestor virusuri ca măsură de
combatere ecologică în plantaţiile de meri.
- nedistructiv, ca în cazul bacteriofagilor temperaţi, care pătrund în celula
bacteriană, se înmulţesc şi coexistă cu ea fără a o distruge.
79
Unele microorganisme, ciuperci si bacterii parazitează dăunători ai
plantelor agricole: insecte, nematozi şi ciuperci fitopatogene. Aceste specii au o
mare însemnătate practică fiind folosite în combaterea biologică sau ca metodă
preventivă de protecţie a plantelor de cultură Ex: Pasteuria penetrans este o
bacterie sporogenă ce parazitează nematozii penetrându-le epiderma.
Predaţia, alt tip de relaţii antagonice prin care un microorganism vânează activ
un altul, care-i serveşte ca hrană. Exemplu: protozoarele, sunt microorganisme
tipic prădătoare care se hrănesc cu bacterii dar există şi bacterii prădătoare (de
exemplu Bdelovibio bacteriovorum) sau ciuperci prădătoare.
Urmare a relaţiilor antagonice în sol este cunoscut fenomenul de autopurificare
a solului (prin eliminarea unui microorganism inoculat într-un sol normal).
Fenomenul este larg favorabil omului, căci datorită lui sunt eliminate în timp
relativ scurt organisme patogene pentru om, animale şi plante. Totuşi datorită
autopurificării din sol sunt eliminate şi organisme benefice inoculate de om în
sol, spre exemplu aplicarea culturilor de Rhizobium selecţionate sau aplicarea
preparatelor biologice pe bază de Bacillus thuringiensis. Totuşi această regulă
are şi excepţii determinate, după Ghinea L.2002, de:
- rezistenţa excepţională a unor substanţe biologice (sporii unor bacterii cum
sunt cele producătoare de tetanos şi antrax, sporii unor ciuperci fitopatogene);
- pătrunderea organismelor inoculate în zone în care microorganismele din
sol nu au acces (de exemplu pătrunderea bacteriilor din genul Rhizobium în
rădăcinile leguminoaselor);
- slăbirea relaţiilor concurenţiale în sol (de exemplu prin încorporarea de
material nutritiv);
- slăbirea capacitaţii concurenţiale a microflorei solului (de exemplu în solul
uscat);
- protecţia microorganismelor nou inoculate prin adsorbţie pe coloizi
minerali existenţi în mod natural în sol sau încorporaţi de către om (Ladd si
colab., 1990; Heigen şi colab, 1990);
- protejarea microorganismelor inoculate (de pilda cu antibiotice la care ele
sunt rezistente, dar nu şi microflora concurentă).
Modificarea asociaţiilor de microorganisme într-un mod adecvat
intereselor omului se obţine cel mai uşor prin modifi-carea condiţiilor lor de
nutriţie. Cel mai simplu se realizează, în cazul biocenozelor solului, printr-o
fertilizare organică adecvată, prin care se modifică raportul C/N. Aceasta este
metoda cea mai eficace de a controla Rizoctonia solani , greu de controlat altfel
(Jaeger şi Nelvis, 1983).
80
În acelaşi mod se modifică microflora intestinală a omului, favorizând
înmulţirea bifidobacteriilor, cu rol binefăcător în sănătate, prin ingerarea aşa
numitelor bifidofibre, produse din sfeclă şi care conţin 83% zahăr şi 17% un
anumit tip de fibre.
IV.2.2.Relaţiile de neutralism
IV.2.3.Relaţiile sinergice
81
celuloza este descompusă în sol mai uşor în culturi microbiene mixte, ionii de
mangan sunt oxidaţi mai uşor de asocierea a două bacterii din sol
(Corinebacterium-Chromobacterium) insecticidul paration este de asemenea
mai uşor descompus de asocierea a două bacterii.
- obligat, caz în care este denumit simbioză. Cazul cel mai important de
simbioză este acela dintre plantele leguminoase şi bacteriile din genul
Rhizobium, planta leguminoasă furnizează bacteriilor parte din alimentul
energetic necesar, pe care ea îl obţine prin fotosinteză, în vreme ce bacteria
aprovizionează planta cu azot care provine din azotul molecular din atmosferă.
Un alt exemplu: simbioza dintre actinomiceta Frankia si plante superioare
aparţinând angiospermelor.
82
În rizosferă domină în general bacteriile mici care nu formează spori,
Gram-negative precum Arthrobacter, Flavobacterium, Achromobacter,
Agrobacterium. Cel mai des întâlnit este genul Pseudomonas cu 3 specii care
produc pigment fluorescent: P. fluorescens, P. chlororaphis şi P. putida,
caracterizate printr-o înalta capacitate competitivă. În rizosfera altor plante se
dezvoltă cu preponderenţă Rhizobium, Azotobacter sau Azo-spirillum. În zona
de sol neinfluenţată de rădăcinile plantelor, respectiv în edafosferă, predomină
actinomicete, micromicete şi bacterii care formează endospori.
Bacteriile care trăiesc în asociaţie simbiotică cu rădăcina alcătuiesc
bacterioriza plantei respective. Ex populaţiile de Rhizobium, Bradyrhizobium
alcătuiesc bacteriorize. Ciupercile care trăiesc în simbioză cu plantele
generând relaţii probiotice de întrajutorare alcătuiesc micorize. Ex Glomus sp.
, Gigaspora sp. Pe langă bacteriorize si micorize exista si actinorize. Ele sunt
asociaţii intre rădăcinile plantelor cu actinomicete si se formează numai în
solurile deficitare în azot mineral sau organic, prezenta azotului constituind un
factor inhibitor al acestor tipuri de simbioze. Datorită acestui fapt actinorizele
au un deosebit rol ecologic susţinând creşterea plantelor in ecosisteme silvice,
pe nisipuri sau pe halde miniere la restaurarea ecologică a acestora. Cea mai
cunoscută şi populară actinomiceta ce determina formarea de actinorize este
Frankia alni. Ea este o bacterie filamentoasă, gram pozitivă care are
posibilitatea de a fixa azotul molecular. Simbioza se concretizează prin apariţia
de nodozităţi, asemănătoare celor de la leguminoase dar mai mari si cu
suprafata încretiță. In regiunea temperata a țării noastre un exemplu elecvent il
reprezinta cătina (Hippophaea rhamnoides), plantă care creste ușor pe soluri
nestructurate, sărace in elemente nutritive dar aerisite.
Intrebari autoevaluare
83
Curs 11
84
fusca, C. mucosa, Cellvibrio ochraceus, C. flavescens cu un optim situat în jur
de 200C şi mixobacterile cu temperatura optima intre 18-22oC. În ţara noastră a
fost determinată o repartiţie sezonieră a microorganismelor celulolitice astfel:
primăvara când solul este mai rece predomină bacteriile din genul Cellvibrio,
în prima parte a verii dominante sunt ciupercile, apoi spre toamă apar şi
bacteriile celulolitice cele mai active Cytophaga şi Sporocytophaga (Ghinea L.,
2003).
Microorganismele celulozolitice sunt în marea majoritate aerobe, ca
urmare activitatea acestora depinde de starea de afânare a solului. În solurile
afânate celulozoliza se desfăşoară aerob şi energic cu mineralizarea totală a
celulozei până la CO2 şi apă. În solurile tasate ea are loc lent, predominând
procese anaerobe. Descompunerea anaerobă a celulozei se produce în cazul
unui exces de umiditate sau la tasarea solului. În ce priveste umiditatea,
celulozoliza se desfăşoară în sol numai la umidităţi ce depăşesc coeficientul de
ofilire, fiind maximă atunci când umiditatea solului este egală cu 60% din
capacitatea de câmp pentru apă.
În solurile acide, cu o valoare a pH sub 5,5, procesul de descompunere
a celulozei este asigurat în special de ciuperci. Între 5,5 şi 6,5 pe lângă ciuperci
apar şi reprezentanţi ai genului Cytophaga. La pH peste 6,5 resturile vegetale
celulozice sunt descompuse de ciuperci şi actinomicete.
Degradarea microbiană a celulozei are loc sub acţiunea a trei enzime
secretate de microorganisme, ce actioneaza succesiv si alcătuiesc sistemul
enzimatic celulozolitic. Tinând cont de faptul că enzimele nu sunt altceva decat
proteine functionale, este de înțeles de ce microorganismele celulozolitice au
nevoie ridicata fata de azot pentru biodegradarea celulozei.
85
Enzima C1 este absolut necesară pentru ca sistemul Cx să poată acţiona
asupra celulozei iar ulterior să o transforme în celobioză. În lipsa ei se pot
utiliza diferiţi agenţi fizici sau chimici (tratament termic, pretratamente cu acizi
sau baze). Numai microorganismele celulozolitice obligate deţin atât enzimele
C1 şi Cx, în timp ce microorganismele celulozolitice facultative au numai
enzimele Cx. Pe parcursul degradării celulozei iau naştere compuşi
hidrocarbonaţi solubili şi oxiacizi. Apariţia lor stimulează intens dezvoltarea
fixatorilor de azot liberi care îmbogăţesc conţinutul de azot organic din sol.
Lignina este un alt compus natural important ce ajunge in soluri odata cu
resturile vegetale (cantitatea cea mai ridicata o lasa plantele lemnoase) şi este
importantă deoarece este principalul precursor al sintezei humusului*.
Ligninele se întâlnesc numai la plantele superioare intr-o enormă
biodiversitate, ele diferenţiindu-se structural de la moleculă la moleculă. Ele
constituie compusul natural cel mai rezistent la degradare biologică, având cea
mai mică viteză de biodegradare. Microorganismele ligninolitice sunt ciuperci
precum Phanerochaete chrysosporium, Poliporus versicolor, Armilaria vera,
Ganoderma applanatum. Procesul de alterare a ligninelor este început prin
mărunţirea mecanică a resturilor vegetale, în acest stadiu jucând un rol
important fauna solului, în special acarienii prezenţi în mare număr în frunzişul
mort al pădurilor, în resturile rămase după recoltarea vegetaţiei ierboase.La
descompunerea ligninelor participă enzime ca lignin-peroxidaza şi laccaza.
Amidonul este un polizaharid foarte răspândit la plante şi unele
microorganisme. Descompunerea amidonului are loc mai rapid decât a
hemicelulozei, celulozei şi a pectinei si este realizată de numeroase
microorganisme nespecifice care se numesc amilolitice.
Resturile organice rămase în sau pe sol sunt constituite pe lîngă
zaharuri simple (glucoză) complexe (amidon, celuloză, lignina) si din alti
compusi. Astfel, pectinele sunt inactivate cu ajutorul unor enzime
(protopectinaza, poligalacturonidaza şi pectin-esteraze), prezente la cca. 2%
din microorganismele solului.
Suberul (pluta) este greu metabolizat numai de ciuperci din sol
precum Nectria, Leptosphaera, Fomes, Fusarium.
Chitina, un polizaharid azotat care acoperă corpul unor insecte şi
ciuperci, este metabolizată de unele actinomicete. Lipidele şi cutina sunt
descompuse de către bacterii.
*
substanţa organica proprie solului care confera acestuia fertilitate naturală
86
Fenolii sunt de asemenea oxidaţi de către microorganismele din sol,
fenomenul fiind legat concomitent şi de sinteza humusului. Taninurile sunt
apropiate ca structură de fenoli, toxice în general pentru microorganism, pot fi
descompuse în sol de către ciuperci filamentoase precum Penicillium si
Aspergillus.
Descompunerea resturilor are loc mai rapid dacă acestea vor fi
încorporate în sol, în acest fel asigurându-se un contact direct cu populaţia
microbiană a solului.
Vitaza de biodegradare a resturilor este dependentă de raportul dintre
azot /carbon. Dacă resturile vor conţine o parte azot la 25 părţi carbon (rezultat
din produsul 1/5 substanţă organică folosită în sinteză x 1/5 părţi N raportat la
C) întreaga cantitate de azot va fi utilizată în sinteză microbiană. În cazul când
resturile organice folosite vor conţine 1 parte N la mai puţin de 25 părţi C
atunci în sol se acumulează azot mineral, iar dacă vor conţine o parte azot la
mai mult de 25 părţi C, microorganismele celulozolitice vor utiliza azot din
zestrea minerală a solului, generându-se fenomenul "foamea de azot" a
culturilor agricole. Fenomenul poate fi prevenit dacă pentru fiecare tona de
paie incorporate se administrează si 50 kg azot s.a sub forma de îngrăşăminte
minerale.
87
genurilor: Aspergillus, Penicillium, Mucor, Rhizopus, bacteriile fiind lipsite de
aceste enzime.
- În etapa a doua, peptidele şi peptonele sunt descompuse sub acţiunea
peptidazelor secretate de bacteriile de putrefacţie. Foarte active sunt genurile:
Clostridium, Bacillus, Pseudomonas, Proteus, Serratia şi Sarcina. În final se
formează aminoacizii.
proteinaze peptidaze
Proteine peptide, peptone Aminoacizi
mucegaiuri bacterii
Procesul prin care are loc oxidarea ionului amoniu la nitriţi, ulterior la nitraţi
poartă numele de nitrificare. Fenomenul are loc sub acţiunea unui grup de
bacterii autotrofe chimiotrofe (vezi tabel), care utilizează diferiţi carbonaţi ca
sursă de carbon pentru reducerea cărora utilizează energia rezultată din
oxidarea amoniacului.
88
Bacterii chemoautotrofe care oxidează azotul
Genul Specia Habitatul
Bacterii care oxidează amoniacul la nitriţi
Nitrosomonas europaea sol, apă, canal
Nitrosospira briensis sol
Nitrosococcus nitrosus mare
oceanus mare
mobilis sol
Nitrosovibrio tenuis sol
Bacterii care oxidează nitriţi la nitraţi
Nitrobacter winogradski sol
agilis sol, apă
gracilis mare
mobilis mare
89
Denitrificarea este un procesul care inchide a circuitului azotului in sol
deoarece are ca rezultat formarea compuşilor reduşi cu azot precum NO, N2O
sau azot molecular acesta putând fi utilizat în fixare biologică de către
bacteriile fixatoare. S-a demonstrat că denitrificarea este un proces prin care
microorganismelor solului îşi satisfac necesarul de oxigen, în condiţii de
anaerobioză, deoarece în lipsa nitraţilor din sol microorganismele vor reduce
alti compuşii oxidaţi cu mangan şi fier sau sulf. Ca urmare denitrificarea este
un proces de respiraţie, prin care unele specii microbiene utilizează nitraţii sau
alţi compuşi oxidaţi ai azotului mineral, ca acceptori finali de H.
Microorganismele denitrificatoare sunt împărţite în două grupe (Pamfil D,
1999):
a. Bacterii denitrificatoare facultative, care pot folosi în condiţii de
anaerobioză diferite substraturi oxigenate între care şi nitraţii (Aerobacter
aerogenes).
b. Bacterii denitrificatoare obligate care se pot dezvolta în anaerobioză
numai în prezenţa nitriţilor sau nitraţilor (Micrococcus denitrificans, Bacillus
denitrificans, Vibrio denitrificans, Thiobacillus denitrificans)
Rata accelerata a procesului denitrificării se întâlneşte în cazul solurilor
cu umiditate ridicată, bogate în substanţe organice dar si in zona de rizosfera
plantelor unde fluxul de carbon organic este ridicat.
Intrebari autoevaluare
1. Cum se numeste procesul de biodegradare a celulozei?
2. Cum se numesc microorganismele care descompun celuloza?
3. Care sunt factorii ce afectează desfasurarea celulozolizei in sol?
4. In ce conditii apare foamea de azot si cum poate fi evitată?
5. Cum se numeste procesul de biodagradare a proteinelor?In ce etapa
are loc eliberarea de azot amoniacal?
6. Ce presupune nitrificarea, în ce conditii decurge în parametri
optimi?
90
Curs 12
Azotul din sol se poate afla sub formă organică sau anorganică, minerală,
constituind principala formă pe care o absorb plantele.
Azotul organic. Din cantitatea totală de azot organic din sol,
aproximativ 70% este cuprinsă în compuşi uşor hidrolizabili, deci cu
posibilităţi mărite de utilizare a acestora în nutriţia vegetală. Restul este
conţinut în complexe greu hidrolizabile, heterociclice formate în cursul
descompunerii ligninelor, regasindu-se în substanţele humice.
O altă formă a azotului organic e reprezentată de aminoacizi proveniţi
fiind din proteoliza diferitelor substanţe proteice ca consecinţă a activităţii
microorganismelor. O categorie aparte de combinaţii organice cu azot o
reprezintă hexozaminele: glucozamina şi galactozamina, a căror origine se
datorează acţiunii exclusiv a microorganismelor.
Azotul mineral este reprezentat de săruri minerale de amoniu, nitraţi,
nitriţi, la care se adaugă forme gazoase în cantitate redusă: protoxid de azot,
monoxid de azot, dioxid de azot şi azot molecular. Azotul amoniacal se poate
afla sub formă schimbabilă sau neschimbabilă. Forma schimbabilă şi solubilă
se găseşte în soluţia solului fiind accesibilă plantelor sau bacteriilor
nitrificatoare. Forma neschimbabilă a amoniului se găseşte reţinută în silicaţii
primari sau între foiţele argiloase, datorită dimensiunilor reduse (2,98Å).
91
Nitraţii se găsesc liberi în soluţia solului. Cantitatea de nitraţi variază
foarte mult în funcţie de aeraţie, aplicarea îngrăşămintelor organice sau
minerale, de capacitatea de mineralizare- nitrificare a solului, umiditate.
Nitriţii au o existenţă scurtă în solurile agricole, bine aerate, cu
umiditate optimă, ei fiind rapid oxidaţi la nitraţi. Cantitatea lor este mai mare în
solurile calcaroase, la temperaturi reduse, pH ridicat.
93
Fixarea simbiotică a azotului
94
mari, la R.meliloti sau pe cromozomul bacterian la Bradyrhizobium japonicum.
Nodozităţile formate pot avea creştere nedeterminată (lucernă, mazăre, trifoi)
sau determinată (soia, fasole, arahide, ghizdei). Ele au forme şi mărimi
specifice fiecărei leguminoase, mai sferice sau ovale (soia), alungite (trifoi,
lucernă, mazăre, măzăriche), ramificate, coraliforme (lupin, salcâm).
Numărul maxim de nodozităţi ce se pot forma pe o plantă este
determinat ereditar, ca şi tipul de distribuire a nodozităţilor. De asemenea între
numărul de nodozităţi şi volumul acestora există o relaţie inversă. Dezvoltarea
nodozităţilor este controlată de către plante în vreme ce bacteriile posedă
echipamentul enzimatic necesar fixării. Eficienţa fixării necesită însă şi o
enzimă specială leghemoglobina (hemoglobină specifica leguminoaselor) care
apare în stadiul activ al fixării azotului, cea ce corespunde cu faza de
transformare a celulelor de Rhizobium în bacteroizi. Leghemoglobina fixează
oxigenul şi-l îndepărtează din zona de activitate a nitrogenazei.
Intrebari autoevaluare
95
Curs 13
IV.3.5. Activitatea microbiotei si circuitul fosforului in sol
96
Un rol important in asigurarea nutriţiei cu fosfor a plantelor îl au asociaţiile
simbiotice cu ciuperci micorizante, ciuperci care nu se pot izola pe medii de
creştere deoarece ele depind de aportul nutritiv al plantei gazdă. Legătura, sau
asocierea, este de tip mutualist obligat fiecare partener îndeplinind un rol bine
determinat în evoluţia relaţiei de tip micoriza.
97
formarea reţelei Harting care, în decursul a câtorva ani devine foarte densă şi
se numeşte trufă.
Clasificarea cea mai frecventă a micorizelor se bazează pe localizarea
interrelației dintre hifele fungice şi celulele corticale ale rădăcinii. Pe baza acestui
criteriu, micorizele aparţin următoarelor tipuri:
- ectomicorize (micorize ectotrofe), în care fungii colonizează suprafata
rădăcinilor (colonizare intercelulară). Fungii de ectomicorize aparţin
claselor: Basidiomycetes evoluate (ciuperci cu pălărie), Ascomycetes
(trufe) şi Phycomycetes: Amanita muscaria, Boletus edulis, Lactarius
deliciosus sp., Russula sp., Tuber sp., etc. Ectomicorizele sunt asociate
unui mare număr de plante din genul: Pinaceae, Salicaceae,
Betulaceae şi Fagaceae.
- endomicorize (micorize endotrofe), cu localizare intraradiculară a hifelor
(colonizare intracelulară). Endomicorizele pot fi produse de fungi cu hife
septate şi neseptate din genurile: Glomus, Sclerocystis, Gigaspora,
Acaulospora. În prezent este recunoscut faptul că cei mai mulţi fungi de
endomicoriza au un spectru larg pentru gazdă. Ciupercile neseptate
formează aşa numitele “micorize vezicular-arbusculare” (VAM) fiind
prezente la muşchi, ferigi, gimnosperme şi angiosperme
- ecto-endomicorize, includ ambele tipuri de infecţie, atât intra căt si
intercelulară. Ectoendomicorizele sunt mai rar întâlnite, după unii autori
fungul invadează celulele pomilor tineri din pepiniere (plop şi
mesteacăn) şi la replantare asocierea apare ca o ectomicoriză tipică.
Tipurile de micorize sunt determinate genetic de partenerul plantă,
aceasta stabilind gradul de intimitate ce le este permis hifelor fungice să
invadeze structura rădăcinii.
98
se găseşte abundent în solurile cernoziomice, conferindu-le calităţi agricole
superioare. Are o vechime de 1000 - 2000 ani
- acidul fulvic fracţie brun-gălbuie, moleculă cu greutate moleculară sub 10
000, solubil în soluţii minerale alcaline. Provine din resturile veg lemnoase,
caracteristic mai ales solurilor acide. Are vechime între 50 –250 ani
- humina, fracţie insolubilă în soluţii alcaline formată din substanţe cu
moleculă mare, descrisă ca fiind cea mai persistentă în sol cu vechimea cea mai
mare de 5 00 –10 000 ani.
Procesul de humificare in soluri decurge în trei etape, doar două dintre
ele au importanță din punct de vedere microbiologic. In prima etapă
microorganismele contribuie la formarea unităţilor structurale ale humusului,
respectiv a radicalilor fenolici şi chinonici ce provin din descompunerea
ligninelor şi respectiv a celulozei. Plecând de la acesti compusi organici săraci
în azot, cu raport C/N=80-85, prin humificare se ajunge la un compus stabilizat
cu continut îmbogăţit in azot în care raportul C/N se situează în jurul valorii de
10. Acest fenomen este posibil datorită activității fixatorilor liberi de azot care
prin relația comensuală alături de microflora implicată în degradare contribuie
la asigurarea azotului necesar in procesul biodegradării ligninei si celulozei.
In etapa a treia se desfasoară polimerizarea produşilor de condensare,
etapă care nu implică acţiunea microorganismelor. Ea depinde de acţiunea
factorilor abiotici, procesul fiind favorizat de clima caldă, uscată când se
întrunesc condiţii optime pentru polimerizarea şi condensarea compuşilor
prehumici. În condiţiile unei umidităţi ridicate resturile vegetale rămân
nehumificate sau humificate slab, cu humus de slabă calitate, fără rol nutritiv,
caracteristic turbăriilor.
Sinteza microbiană a compuşilor humici se realizează atât în aerobioză
cât şi în anaerobioză.
Sinteza aerobă a compuşilor humici se realizează în straturile superficiale ale
solului şi este efectuată de bacterii şi ciuperci microscopice. Acizii humici
rezultaţi nu sunt toxici pentru microorganisme, deoarece sunt neutralizaţi de
NH3 care rezultă în cursul procesului de humificare.
Sinteza anaerobă este rezultatul acţiunii microorganismelor asupra substanţelor
organice acumulate în profunzimea solului.
Calitatea humusului rezultat depinde în mare măsură de calitatea
resturilor vegetale supuse humificării şi de condiţiile climatice în care are loc
procesul. De aceea, un humus de calitate, precum cel din solurile cernoziomice,
se formează doar în stepă unde vegetaţia ierboasă oferă resturi celulozice
99
complexe pentru procesele de descompunere şi ulterior sinteză, iar perioadele
lungi, uscate şi calde oferă condiţii pentru condensarea componentelor humice.
100
2. faza termofilă. Ca urmare a lizării populaţiei mezofile o nouă
micropopulatie, de aceasta data termofilă, creşte si se multiplică pe seama
biomasei microbiene mezofile. Temperatura optimă pentru activitatea
microbiană este cuprinsă între 50-650C, ea începe să scadă peste 700C si
încetează spre 800C. Mentinerea temperaturii in compost in intervalul 50-700 C
timp de 1-2 zile este importantă deoarece asigura inactivarea populatiei
microbiene fitopatogene si a semintelor de buruieni. Dupa doua zile
temperatura trebuie scazută prin aerisirea grămezii. Microoganismele
termofile, active in faza a doua a compostării sunt Bacillus stearothermophilus,
actinomicete celulozolitice termofile precum si ciuperci: Rhizomucor pusills,
Chaethomium thermophile, Humicola insolens, Humicola lanuginosus,
Thermoascus aurabtiacus şi Aspergillus fumigatus. Aceasta microfloră e
răspunzătoare de descompunerea compusilor polimerizaţi, complecşi de tipul
celuloză, pectină, suber, lipide, ceruri.
3. faza staţionară - temperatura se află la nivel ridicat, microflora este
termofilă, se instalează starea de echilibru între cantitatea de căldură ce se
produce si cea care se pierde.
4. fază de maturare - este caracterizată de scăderea temperaturii în grămadă,
compostul se inchide la coloare, se reactivează micropopulatia mezofilă,
îndeosebi actinomicetele care imprimă mirosul caracteristic de pământ reavăn
prin sinteză de geosmin. Procesul de biodegradare continuă dar cu viteză mai
redusă.
Intrebari autoevaluare:
1. Ce sunt micorizele? Enumerati minim 3 avantaje/beneficii pe care le
asigura plantelor.
2. Cate tipuri de micorize se cunosc?
102
3. Care este compusul organic specific solurilor? Din ce se formează?
4. Ce este compostarea?
5. Enumerati 3 produse care nu se pot composta (conform anexei cursului)
103
Curs 14
Tab 5.1.
Microorganisme utilizate în biotehnologie
Grupa microorga- Specia implicată Produse utilizate
nisme
104
Bacillus thuringiensis bioinsecticide (turinghina,
dendrobacilina)
Escherichia coli hormoni (insulina,
somatostatina), interferon
Azotobacter chroococcum îngrăşăminte bacteriene
şi Rhizobium sp. (azotobacterina, nitragina)
Drojdii Saccharomyces cerevisiae pâine, vin, etanol
Sac. carlsbergensis bere uşoară
Candida utilis proteine monocelulare din
petrol
Eremothecium ashbyii vitamina B2
Mucegaiuri Aspergillus sp. enzime (pectinaze, pro-
teaza)
Trichoderma reesii enzime (celulaza)
Aspergillus niger acizi organici (citric, glu-
conic)
Penicillium chrysogenum antibiotice (penicilina)
Bauveria sp. bioinsecticide (boverina)
Penicillum roquefortii brânza de tip Roquefort
Penicillum camembertii brânza de tip Camembert
Alge microscopice Spirulina sp. proteine monocelulare,
Chlorella sp. carotină,
Scendesmus sp glicerină, pigmenţi
Botryococcus braunii biocombustibil
Fermentaţia alcoolică
Fermentaţia alcoolică este produsă de multe microorganisme, dar în
industrie se folosesc numai drojdii. În mod normal drojdiile suportă 9-10%
alcool, însă drojdiile special selecţionate pentru vinurile licoroase, mai tari,
suportă până la 16% alcool. Reacţia biochimică ce stă la baza fermentaţiei
alcoolice se prezintă astfel:
105
C6H12O6 = 2 CH3-CH2-OH + 2 CO2 + 22 Kcal
Glucoză Alcool etilic
106
- floarea vinului este produsă de Mycoderma vini . Se dezvoltă la
suprafaţa vinului când vasele nu sunt umplute complet iar vinul are un conţinut
redus de alcool.
- Oţetirea vinului este produsă de bacteriile acetice din genul Acetobacter
care se dezvoltă pe vinurile dulci, cu conţinut redus de alcool şi păstrate la
temperatură ridicată (20˚C).
- Borsirea vinului este produsă de Bacillus intermedium şi Bacillus
gracillis, în cazul vinurilor albe, alterarea constând în tulbureală,gust acru,
miros de bors.
Fermentaţia lactică
Fermentaţia acetică.
108
Fermentaţia pectică şi topitul biologic al plantelor textile
Obţinerea antibioticelor
După ce Sir Alexander Fleming a obţinut primul antibiotic (1929) au
fost necesari 12 ani pentru a se pune la punct procedeul de purificare a
penicilinei şi de producerea industrială a acestora. A fost elaborată o tehnologie
de obţinere a penicilinei în instalaţii speciale - fermentatoare (bioreactoare), a
fost găsit un mediu de cultură ieftin şi eficient (conţinând lactoză, faină de
rapiţă, extras apos de porumb, săruri minerale), o metodă de control continuu al
procesului. Metoda odată elaborată a putut fi aplicată - cu mici variaţii - la
numeroase alte antibiotice.
Antibioticele sunt substanţe chimice de origine biologică sau sintetică, care
distrug selectiv unele microorganisme sau le împiedică multiplicarea. Ele se
obţin de la diferite grupe de microorganisme: ciupercile filamentoase
(Penicillium, Cephalosporium) şi actinomicetele (Streptomyces) – 70,3%, ba-
cilii (Bacillus) – 7%, pseudomonadele (Pseudomonas) – 1,3%, alte bacterii –
1,7%. O parte din antibiotice au provenienţa vegetală (alina, sativina – din
ceapă, usturoi) sau animală (ecmolina – din ficatul peştilor)
www.ournet.md/~biochim/ ghid/microbio.html.
Producerea vaccinurilor
Culturile de virusuri şi bacterii sau toxinele unor bacterii pot fi folosite
în elaborarea vaccinurilor cu o acţiune specifică sau complexă (contra
poliomielitei, tuberculozei ş.a.). Vaccinurile (culturi inactivate de agenţi ce
110
provoacă diferite boli sau toxinele lor) sunt menite să sporească imunitatea
organismului – să micşoreze receptivitatea lui la boli infecţioase.
Producerea microbiologică de vaccinuri se realizează în două direcţii:
1. obţinerea de biopreparate vii (preparate inactivate de bacterii sau
virusuri, agenţi ai diferitor boli infecţioase): Ex vaccinuri bacteriene (vaccinul
contra tuberculozei, vaccinul contra pestei); vaccinuri virotice (vaccinul contra
poliomielitei, vaccinul contra variolei); vaccinuri complexe.
2. obţinerea de biopreparate în baza toxinelor inactivate (toxina contra
difteriei).
În procesul de obţinere a vaccinurilor se ţine cont de particularităţile suşelor
implicate (intensitatea multiplicării, virulenţa, capacitatea de a forma toxine
etc.), de condiţiile de cultivare (natura substratului nutritiv, prezenţa sau lipsa
aeraţiei etc.) şi de produsul final (purificarea, extragerea etc.).
1. Ce este un biopreparat?
2. Care sunt utilizările practice ale fermentaţiei alcoolice?In ce
condiţii se acumulează alcool in vin?
3. Care este utilitatea practică a fermentatiei lactice?
4. Ce sunt antibioticele?
111
Anexa 1
212 112
Referințe bibliografice
1. Alic, M., Letzring, C., Gold, M.H. 1987. Mating system and basidiospore
formation in the lignin-degrading basidiomycete Phanerochaete
chrysosporium. Applied and Environ. Microb. 53: 1464−1469.
2. Avarvarei I., Davidescu V., Mocanu R., Goian M., Cramete C., Rusu M.,
1997, Agrochimie, Ed. Sitech,pg 451.
3. Borlan Z., Hera C., 1973, Metode de apreciere a stării de fertilitate a
solului, Ed. Ceres, Bucureşti.pg 87, 99
4. Borlan Z., Hera C., Dornescu D., Kurtinecz P., Rusu M., Buzdugan I.,
Tănase Gh., 1994 – Fertilitatea şi fertilizarea solurilor (Compendiu
De Agrochimie ),Ed. Ceres, Bucureşti, pg 40.
5. Bremner J.M. Mulvaney C.S., 1982, Nitrogen total. In: PAGE Al
(ed)Methods of soil Analisis. ASA and SSSA Madison, pg 595-624
6. Broadbent F. E. , 1968, În “Matiere organique et fertilite du sol”, Pontifical
Academie Vatican, pg 61.
7. Coleman D.C., Wall D.H., 2007, Fauna: the engine for microbial activity
and transport, in Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry ,
Eldor A. Paul editor, Elsevier,pg169
8. Davidescu D., Davidescu Velicica, 1972, Testarea stării de fertilitate prin
plantă şi sol. Ed. Academiei RSR pg 322, 418
9. Davidescu D., Davidescu Velicica, 1981, Agrochimia modernă, Editura
Acad. RSR,110;
10. Debeleac Lucia,Popescu- Drânda M.C., Microbiologie, Ed. Medicală
Amaltea, 2003.
11. Dorneanu a., 1976, Solul parte constitutivă a mediului de viaţă pentru
plante, în Dirijarea fertilităţii solului. Ed. Ceres,pg 27-95.
12. Drăgan Bularda M, Kiss St, 1986-Microbiologia solului, Universitatea
Cluj Napoca, pg 132;
13. Dumitrescu Marin, Biologia pe înţelesul tuturor, Ed Stiinţifică şi
Enciclopedică, Bucureşti 1989
14. Eliade Gh.,Ghinea L., Stefanic Gh., 1975, Microbiologia solului, Ed. Ceres
, Bucureşti.
15. Enescu I., Microbii, fiinţe cu însuşiri uimitoare. Ed Ceres, Bucureşti 1988
16. Hera C., Eliade GH., Ghinea L., Popescu Ana,1984, Asigurarea azotului
necesar culturilor agricole, Ed Ceres, Bucureşti, p 220.
17. Ghinea L., Viaţa în sol ,1987, Ed Ceres, Bucureşti;
213 113
18. Ghinea Lucian , 1991, Circuite naturale- o lecţie de economie, Editura
Enciclopedică, Bucureşti, pg 36, 62
19. Ghinea L., 1997, Curs de Ecotoxicologie şi bioremediere, Editura
Agroprint Timişoara
20. Ghinea L., 2002, Curs Biologia şi microbiologia solului, Ed. Agroprint
Timişoara, pg 118-119
21. Heritage J., Evans E.G.V., Killington R.A., Microbiology in action,
Cambridge Unicversity Press, 1999;
22. Ionescu M. , Biochimia agricolă, Ed Ceres, Bucureşti, 1970, pg 45-46.
23. Irina Vintilă ,Z Borlan, C Răuţă, D. Daniliuc, Letiţia Ţigănaş ,1984 –
Situaţa agrochimică a solurilor din România. Ed. Ceres, Bucureşti.
24. Israil Anca Michaela, Prioni şi prionoze, prezent şi perspective, Ed
Humanitas, Bucureşti, 2005;
25. Kiss Stefan, Microbiologie generală I şi II, Universitatea Babeş Bolyai,
Facultatea de Biologie –Geografie, Cluj 1975;
26. Kiss, St., Ştefanic, Gh., Paşca Daniela, Drăgan Bularda M., Zborovschi E.,
Crişan R., Enzimologia mediului înconjurător, Ed Ceres, 1991;
27. Moldoveanu Dumitru, Militaru Costin, Moldoveanu Iulia, Microbiologie şi
inginerie genetică, Editura Fiat Lux, Bucureşti, 2001;
28. Papacostea P.,1976, Biologia solului, Ed Ştiinţifică şi Enciclopedică,
Bucureşti, pg 81-259, 261
29. Papacostea P.,1981, Problemele lumii contemporane şi implicaţiile lor în
agricultură, în Agricultura biologică, Ed Ceres, Bucureşti, pg 9-11;
30. Pamfil D., 1999, Microbiologie, Ed. Genesis, pg 157 şi 161;
31. Paul E.A. şi Clark F.E., 1989, Soil Microbiology and Biochemistry.
Academic Press, Inc. san Diego,California, pg 133;
32. Păun L., Bioterorismul şi armele biologice, Ed. Amaltea, Bucureşti, 2003;
33. Powell J., Klironomos J.,2007 The ecology of plant-microbial Mutualisms,
în Soil Microbiology, Ecology and Biochemistry , Eldor A. Paul
editor, Elsevier, 258-259
34. Rugină V., Din secretele proceselor fermentative ( de la vin ..la antibiotice),
Ed Tehnică, Bucureşti, 1992;
35. Sylvia, D.M., P. Hartel, J. Fuhrmann, and D. Zuberer, 2005. Principles and
Applications of Soil Microbiology. Second Edition. Prentice Hall,
Upper Saddle River, NJ;
36. Schäffler A., Altekrüger J., Microbiologie medicală şi imunologie, Ed
ALL, Bucureşti, 1994;
37. Stefanic Gh, Proteina direct din azotul atmosferic, Ed Stiinţifică şi
Enciclopedică, Bucureşti, 1983
38. Stefanic Gh, Săndoiu I.D., 1994, Biologia solului, Lito USAMVB,
Bucureşti, pg 6-22.
214 114
39. Stefanic Gh, Săndoiu I.D., 1994, Biologia solului, Lito USAMVB,
Bucureşti, pg 6-22.
40. Şumălan Renata Maria, Teza de doctorat, 2003
41. Şumălan Renata Maria, 2008, Biologia si microbiologia solului, Eurobit
Timisoara.
42. Şumălan Renata, 2004, Microbiologie, Eurobit Timisoara
43. Zarnea Gh, 1970, Microbiologie generală, Ed. Didactică şi pedagogică,
Bucureşti
44. Zarnea G.,1994, Tratat de microbiologie generală, vol V, Editura
Academiei Române, pg 976-980;
45. *** Metode de cercetarea solului, 1964, Ed Academiei RPR, pg 431,435.
Webografie
215 115
27. http://biology.clc.uc.edu/fankhauser/Labs/Microbiology/Micro_handouts.h
tm
28. http://www.science-projects.com/safemicrobes.htm
29. http://www.mastercomposter.com/
30. http://www.micotoxinas.com.br/
31. http://www.micotoxinas.com.br/altertoxins.htm
32. http://www.mold.ph/aspergillus.htm
33. http://www.pjms.com.pk/issues/octdec207/article/article9.html
34. http://www.schimmel-schimmelpilze.de/alternaria-alternata.html
35. http://invam.wvu.edu/index.html
36. http://mycorrhiza.ag.utk.edu/
37. http://mycorrhizas.info/vam.html#intro
38. http://www.bio-organics.com/Mycorrhizae_Products.html
39. http://www.composttea.com/myc.htm
40. http://www.mycorrhiza.eu/e/home-e
41. http://www.mycorrhizae.com/tools-tips-products
42. http://www.mycorrhizae.eu/
43. http://www.mycosym.com/EN/mycorrhizaEN.html
44. http://www.urbancreeks.org/Biofertilizers_Mycorrhizae.pdf
45. http://soils.usda.gov/sqi/publications/publications.html#biology
46. https://www.fibl-shop.org/english/shop/publicationtypes.php
47. http://bashanfoundation.org/gmaweb/pdfs/
48. http://www.microbial-ecology.at/
49. http://www.biocombustibil-tm.ro/obiective.html
50. http://www.biology.duke.edu/bio265/ajm21/molecular.html
51. http://www.uclan.ac.uk/facs/science/erg/sampling.htm
52. http://www.animalia.go.ro/Annelida/Oligochaeta/Lumbricidae.html
53. http://www.scribd.com/doc/8057787/10-Steps-in-Compost-Production
216 116