La reptile, sistemul digestiv are segementele mai bine diferentiate.

Cavitatea bucala este bine

delimitata, iar mandibula este astfel articulata incat ii permite deschiderea larga. Dintii se dezvolta nu
numai pe falci, ci si pe alte oase ale cavitatii bucale. Forma si structura lor variaza foarte mult si se
deosebesc de cei ai pestilor si amfibienilor printr-o relativa specializare. La unii serpi si soparle dintii
prezinta santuri prin care circula veninl elaborat de glandele veninoase. Pestii, amfibienii si reptilele
prezinta trei sau mai multe generatii de dinti. La cele mai multe soparle si serpi, limba este subtire si
bifurcata la varf, musculoasa si mobila, putand fi mult proiectata in afara. Ea este prinsa in regiunea
faringelui si libera in partea anterioara. Faringele scurt se continua cu un esofag foarte lung la
crocodili. El este extrem de extensibil la serpi, deoarece acestia consuma prada intreaga. Enzimele
secretate digera si oasele prazii.
La crocodili stomacul muscular este asemanator pipotei pasarilor, iar stomacul propriu-zis
contine numeroase glande care secreta sucul gastric. Intestinul este diferentiat in intestin subtire si
gros (colon). Intestinul subtire prezinta ansa duodenala, la nivelul careia se deschid canalele
hepatice si pancreatice. Mucoasa intestinala contine glande care secreta sucul intestinal. Intestinul
gros, larg si rectiliniu, se deschide in cloaca. Ficatul este foarte voluminos si prezinta doua canale
hepatice, iar vezica biliara este mica. Pancreasul prezinta diferite grade de dezvoltare. La reptilele
carnivore acesta este mai dezvoltat decat la cele erbivore. Digestia este strans dependenta de
temperatura mediului ambiant. Astfel, la vipera, absorbtia nutrimentelor se face numai la temperaturi
de peste 15C. In zonele reci, unde ziua temperatura ridicata este de scurta durata, reptilele consuma
animale mici, usor digerabile.