Intestinul reprezintă partea cea mai lungă a tractului digestiv, cu
aspectul unui tub încolăcit care formează numeroase anse suprapuse. Începe de la orificiul pilor și se termină la anus având lungimea cca 38 m la bovine, cca 30 m la cabaline, 32-33 m la ovine și caprine, cca 24 m la suine, 2-7 m la carnivore și se împarte în două porțiuni: intestinul subțire și intestinul gros. Intestinul subțire este un conduct cu un calibru constant și relativ redus sistematizat în trei porțiuni: - duoden porțiunea în care se deschid canalul coledoc, oficiul de deschidere al canalului pancreatic, iar la unele specii și orificiul canalului pancreatic accesoriu; - jejunul porțiunea cea mai întinsă care formează numeroase anse suspendate de plafonul cavității abdominale de ligamentul marele mezenter; - ileonul porțiunea terminală cu pereții organului mai groși decât restul intestinului. Intestinul subțire are musculoasa formată din două straturi musculare netede, unul extern longitudinal și unul circular la interior. Mucoasa de culoare roșiatică prezintă pliuri transversare și longitudinale ce prezintă pe suprafața organului vilozități intestinale (15-20/ mm2) cu rol în absorbția intestinală. Epiteliul prismatic simplu acoperă vilozitățile și este format din trei tipuri de celule. - Absorbtive (enterocite) prismatice, abundente, cu platou striat alcătuit din microvilozități la polul apical; - Caliciforme care sunt glande mucoase unicelulare, secretă mucus; - Endocrine care secretă serotonină, secretină și hormoni polipeptidici. Intestinul gros este mai scurt decât cel subțire, cu forma variate în funcție de specie, se întinde de la ileon până la anus și cuprinde trei porțiuni: cecum, colon și rect. Cecum-ul are forma unui diverticul saciform foarte dezvoltat la cal, cu pereții netezi sau cutați (boselați). Colonul este porțiunea cea mai întinsă fiind sistematizat prin analogie cu colonul omului în: colonul ascendent, transvers și descendent. La speciiile cu colonul cutat musculatura longitudinală externă este dispusă în benzi. Rectul este porțiunea finală a intestinului gros, situată în cavitatea pelvină, cu traiect drept, necutat și comunică cu exteriorul prin deschiderea anală sau anusul. Musculatura anusului formează un sfincter intern și unul extern, iar la unele specii (carnivore și iepure) în jurul anusului sunt situate glandele anale alcăror produs are un miros caracteristic cu rol în atracția sexuală.