Sunteți pe pagina 1din 264

Biochimia proteinelor

Selenocisteina
 Selenocisteina este un aminoacid neobişnuit prezent în
câteva enzime fiind util pentru activitatea lor
 Nu este sintetizat ca urmare a prelucrărilor
posttranslaţionale. O modificare a serinei apare când aceasta
se leagă la tARN-ul unic, formând selenocisteinil-ARNt.
Selenocisteina este ulterior inserată într-o proteină cu care va
fi sintetizată.
Proteine
Proteine
Proteine
 Proteinele sunt substanţe azotate complexe prezente în
toate celulele animale sau vegetale
 Roluri:

 1. structural- arhitectura celulară


 2. funcţional- enzime, hormoni, receptori, represori,
contractil, transport gaze sangvine, coagulare
 3. fizico-chimic- menţinerea presiunii osmotice şi a
echilibrului acido-bazic
 4. energetic- proteine de rezervă (caseina, ovalbumina
pentru creşterea embrionului) sau eliberare de energie
(4,5kcal/g proteine oxidate)
Proteine
Proteine
Proteine
Structura primară a proteinelor
 Unicitatea proteinelor este dictată de secvenţa
lineară de aminoacizi, denumită structură
primară.
Structura primară a proteinelor
 Numărul proteinelor a căror structură primară se cunoaşte
este de ordinul zecilor de mii. Insulina (51 aminoacizi),
ribonucleaza (124 aminoacizi), hemoglobina (catenele α
cu 141 aminoacizi, cele β cu 146 aminoacizi), mioglobina
(453 aminoacizi), citocromul c (204 aminoacizi),
gamaglobulina (1320 aminoacizi)

 Structura proteică primară determină gradul de pliere şi


modul de interacţiune cu alte molecule intracelulare astfel
încât proteina să-şi poată exercita funcţia. Structurile
primare ale tuturor proteinelor sunt sintetizate pornind de
la cei 20 aminoacizi care se succed într-o secvenţă lineară
determinată de codul genetic.
Structura primară a proteinelor
 Codul genetic este secvenţa de
trei baze (nucleotide) din ADN,
conţinând informaţia secvenţei
lineare de aminoacizi din lanţul
polipeptidic (structura primară)
 O genă este porţiunea din ADN
care codează produsul
funcţional precum lanţul
polipeptidic. Mutaţiile care sunt
modificări în nucleotidele genei
determină alterarea produsului
codificat de genă.
Structura primară a proteinelor
 La nivelul ribozomilor se realizează translaţia
informaţiei genetice de la ARNm în lanţul polipeptidic

 În nucleu, ARNm copiază informaţia genetică de la


ADN nuclear iar apoi migrează în citoplasmă. Fiecare
moleculă de ARNt posedă la mijlocul lanţului său un
anticodon a căror 3 baze consecutive se pot asocia prin
legături de hidrogen cu 3 baze complementare de un
codon ARNm. Pe baza acestui anticodon aminoacizii
vor fi poziţionaţi conform mesajului genetic din ARNm.
Această poziţionare a aminoacil-ARNt se realizează la
suprafaţa ribozomului la nivelul a două situsuri
stereospecifice: situl "P" (peptidil) şi situl "A"
(aminoacil), situate la suprafața subunităţilor.
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
 Substituţia unui singur aminoacid modifică funcţia proteinei
sau conferă un avantaj specific unui anumit ţesut sau unui
set de circumstanţe. Multe proteine precum hemoglobina pot
prezenta polimorfisme sau variante genetice ale structurii
primare

 La acelaşi individ, structura primară a proteinelor diferă în


funcţie de stadiul de dezvoltare, fiind prezentă ca izoforme
fetale şi adulte ca în cazul hemoglobinei. Structura primară a
creatin-kinazei variază în funcţie de ţesut (izoforme specific
tisulare) sau în cadrul aceluiaşi ţesut, în funcţie de
localizarea intracelulară. Separarea electroforetică a
izoenzimelor tisular-specifice este utilă în localizarea injuriei
tisulare
Structura primară a proteinelor
 Înafara aminoacizilor codificaţi genetic şi care
formează structura primară, mai există şi
aminoacizi specifici modificaţi prin fosforilare,
oxidare, carboxilare sau prin alte tipuri de reacţii

 Când aceste reacţii sunt catalizate enzimatic,


modificările sunt denumite post-translaţionale.
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor

 Proteinele sunt polipeptide


rezultate prin condensarea
AA, cu eliminarea unei
molecule de apă între
gruparea –COOH a unui
AA şi gruparea –NH2 a
AA următor
Structura primară a proteinelor
Secvenţa AA într-un lanţ polipeptidic:
 de la capătul N-terminal spre C-terminal
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
 Stabilirea secvenţei de AA dintr-un lanţ polipeptidic:
prin metode chimice sau enzimatice-
“TRADIŢIONALE”

 Etape:
 1. Determinarea AA de la capetele N- ;C-terminale
 2. Stabilirea secvenţei de AA din interiorul lanţului pp
 3. Separarea lanţurilor în cazul proteinelor oligomere,
urmată de parcurgerea primelor etape
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
 Prima etapă în stabilirea structurii primare a unui
polipeptid constă în identificarea şi cuantificarea
aminoacizilor constituienţi.

O probă purificată din polipeptidul de analizat este iniţial


hidrolizată prin tratare cu un acid tare la 110ºC timp de
24ore

 Această procedură induce clivarea legăturilor peptidice


şi separarea aminoacizilor individuali care pot fi detectaţi
cu ajutorul cromatografiei prin schimb ionic.
Structura primară a proteinelor
 În cadrul acestei metode, amestecul de aminoacizi este plasat
într-o coloană formată din granulele unei răşini sintetice care
conţine grupări electronegative.

 Aminoacizii din amestec aderă la coloană cu afinităţi


diferite, în funcţie de încărcarea electrică, caracterul
hidrofob, etc.

 Prin creşterea treptată a pH-ului şi a concentraţiei ionice în


soluţiile apoase eluante, aminoacizii migrează în coloană cu
viteze diferite, iar eluantul este colectat în fracţii mici.

.
Structura primară a proteinelor
 Aceste fracţiuni care conţin aminoacizi sunt analizate
cantitativ cu ajutorul reacţiei cu ninhidrină, un reactant
care prin încălzire reacţionează cu majoritatea
aminoacizilor, cu amoniacul, cu aminele şi formează
compuşi roşu-violet

 Determinarea cantitativă a fiecărui aminoacid se


realizează prin spectrofotometrie, care măsoară
cantitatea de lumină absorbită de derivatul ninidrinic.
Procedura descrisă se realizează cu ajutorul
analizorului de aminoacizi.
Structura primară a proteinelor
Structura primară a proteinelor
 Determinarea secvenţei de aminoacizi a peptidelor

 Secvenţierea reprezintă un proces etapizat de identificare a


aminoacizilor constituienţi ai unui lanţ peptidic începând de
la capătul N-terminal al acestuia. Fenilizotiocianatul,
cunoscut şi ca reactiv Edman, reacţionează cu gruparea
amino terminală a peptidului în condiţii de pH uşor alcalin

 Rezultă un derivat feniltiohidantoinic care produce


instabilitatea legăturii peptidice la capătul N-terminal, iar
aceasta poate fi hidrolizată selectiv, fără clivarea celorlalte
legături peptidice.
Structura primară a proteinelor
Derivatul aminoacidic rezultat poate fi separat şi
identificat ulterior
Structura primară a proteinelor
 Avantajul metodei este că restul lanţului peptidic rămâne
intact după îndepărtarea aminoacidului N-terminal, iar
reactivul Edman este utilizat în mod repetat asupra
lanţului peptidic scurtat în urma testării anterioare până la
identificarea tuturor resturilor de aminoacizi

 Prin degradarea Edman se poate identifica o secvenţă de


pînă la 30 aminoacizi, cu o eficienţă de 98%/aminoacid.
Un alt avantaj ar fi cantitatea de numai 10-100 picomoli
de peptidă necesari pentru determinare.
Structura primară a proteinelor
 Clivarea lanţurilor polipeptidice în fragmente mai
mici

 Numeroase polipeptide au o structură primară alcătuită


din peste 100 de aminoacizi. Astfel de molecule nu pot
fi secvenţiate direct, de la un capăt la celălat. În
schimb, aceste molecule mari sunt clivate în anumite
locuri cu secvenţierea ulterioară a fragmentelor
rezultate

 Se pot folosi doi sau mai mulţi agenţi de clivare


Structura primară a proteinelor
 Metode de analiză cu enzime:

 1. Bromura de cianogen scindează lanţul pp: Met-X


 2. Etilamina: transformă cisteina în aminoetil-cisteină
 3. Tripsina scindează şi legăturile Cys- X
 4. Tripsina: Lys-X, Arg-X
 5. Chimotripsina: Phe-X, Tyr-X, Trp-X
 6. Carboxipeptidazele: X-Phe, X-Lys
Structura primară a proteinelor
 După scindarea proteinei cu obţinerea mai multor
peptide mai mici se definitivează succesiunea lor
utilizând tehnica peptidelor suprapuse

 Lanţul polipeptidic iniţial se scindează prin


metode diferite, iar prin compararea seturilor de
peptide obţinute se stabileşte integral secvenţa
iniţială
Structura primară a proteinelor
 Tripsina:
Glu-Met-Leu-Gly-Arg
 Val- Tyr-Lys
 Ala-Ser-Asp
 BrCN: Leu-Gly-Arg-Ala-Ser-Asp
 Val-Tyr-Lys-Glu-Met

 Secvenţa finală??????
Structura primară a proteinelor

 Val-
Tyr-Lys-Glu-Met-Leu-Gly-Arg-Ala-
Ser-Asp
Structura primară a proteinelor
 Determinarea structurii primare a unei
proteine prin secvenţiere ADN
 Secvenţierea nucleotidelor dintr-o regiune ADN
codificatoare a proteinelor identifică secvenţa de
aminoacizi a unui polipeptid
 Dacă secvenţa de nucleotide este stabilită, pe baza
informaţiilor referitoare la codul genetic are loc
traducerea secvenţei de nucleotide în secvenţa de
aminoacizi corespunzătoare polipeptidului studiat.
Structura primară a proteinelor
 Determinarea structurii primare a unei proteine
prin secvenţiere ADN
 Acest procedeu, deşi utilizat de rutină pentru a preciza
secvenţa de aminoacizi din componenta proteinelor,
este limitat de faptul că nu poate preciza poziţiile
legăturilor disulfidice la nivelul lanţurilor pliate,
precum şi de faptul că nu identifică aminoacizii cu
modificări post-translaţionale
 Secvenţierea directă a proteinelor constituie un
instrument important în stabilirea exactă a structurii
primare.
Variaţii ale structurii primare
 Deşi aproape fiecare aminoacid din structura proteică
primară contribuie la realizarea conformaţiei sale (structura
tridimensională), structura primară a proteinei diferă în
funcţie de specie.
 În cadrul aceleiaşi specii există diferenţe ale secveţei de
aminoacizi la nivelul individului, în funcţie de ţesut sau de
stadiul de dezvoltare. Aceste diferenţe ale proteinelor
funcţionale sunt tolerate în măsura în care aparţin unor
regiuni „necritice” denumite variabile, dacă sunt substituţii
conservative (înlocuirea unui aminoacid cu altul de structură
similară) sau îi conferă un avantaj
 Dacă mai mulţi aminoacizi sunt toleraţi în aceeaşi poziţie,
regiunea este denumită hipervariabilă.
Variaţii ale structurii primare
 În contrast, regiunile care formează situsuri de legare sau
sunt critice în formarea structurii tridimensionale funcţionale
sunt frecvent invariabile şi au exact aceeaşi secvenţă de
aminoacizi la toţi indivizii, ţesuturile sau speciile

 Polimorfismul în structura proteinelor


 La nivelul populaţiei umane, structura primară a proteinei ar
putea să difere puţin interindividual. Variaţiile apar din
mutaţiile ADN transmise generaţiei următoare. Mutaţiile pot
fi punctiforme şi rezultă prin substituţia unei baze în
secvenţa de ADN sau sunt deleţii/ inserţii de baze.
Polimorfismul în structura proteinelor
 Pentru majoritatea alelelor, aceste schimbări au consecinţe
fenotipice distincte determinând disfuncţii obiective ( boli
congenitale sau genetice) sau creşteri ale susceptibilităţii
pentru anumite boli

 O proteină defectivă diferă de majoritatea alelelor printr-un


singur aminoacid care reprezintă o substituţie
nonconservativă (înlocuirea unui aminoacid cu altul de
polaritate diferită sau de mărime diferită) într-o regiune
invariabilă

 Asemenea mutaţii ar putea afecta capacitatea proteinelor de


a-şi exercita funcţia, de a cataliza o anumită reacţie. Pentru
alte proteine variaţiile nu au semnificaţie.
Polimorfismul în structura proteinelor

 Variantele unei alele care apar cu o frecvenţă


semnificativă în populaţie sunt considerate
polimorfisme
 Când acea variaţie a unei alele creşte în populaţie
la o frecvenţă de 1% este considerată stabilă
 Siclemia este un exemplu de mutaţie punctiformă
stabilă în populaţia umană. Persistenţa sa este
probabil atribuită presiunii selective asupra
fenotipului mutant heterozigot ce conferă o
anumită protecţie în malarie.
Exemple
Exemple

 1. WS este un băiat de 17 ani care s-a prezentat în urgenţă cu


dureri lombare severe, dureri abdominale şi ale membrelor
care au debutat după două zile de greţuri şi vărsături cauzate
de gastroenterită

 La vârsta de 3 ani a fost diagnosticat cu siclemie şi a fost


internat de nenumărate ori pentru asemenea episoade
Exemple

 La internare:

 nivelul Hg serice a fost 7,8 g/dL (IBR: 12-


16g/dL);
 Ht era 23,4% (IBR: 41-53%);
 Bil serică totală (un pigment ce rezultă din
degradarea Hb) era 2,3 mg/dL (IBR: 0,2-1 mg/dL)
 Radiografia abdominală a evidenţiat calculi
radiopaci în vezica biliară.
Exemple
 Din cauza hemolizei cronice (distrucţia hematiilor)
cantitatea de hem degradată la bilirubină este crescută.
Calculii sunt rezultatul excreţiei unei cantităţi crescute de
bilirubină din ficat în bilă cu formarea depozitelor de cristale
de bilirubinat în lumenul vezicii biliare

 Termenul de „calcul” este folosit pentru a descrie orice


depunere anormală ca un precipitat a sărurilor minerale.
Aproape întotdeauna se formează în organele cavitare
(rinichi) sau în lumenul unor ducte (duct biliar comun).
Exemple

 Pacientul are siclemie produsă de o mutaţie


punctiformă a a ADN care modifică al 6-lea
aminoacid din lanţul globinic β al hemoglobinei
prin care glutamatul este înlocuit cu valina

 Ce diferenţe apar în modul de realizare a


legăturilor chimice în cazul celor doi aminoacizi?
Exemple

 Glutamatul prezintă la pH-ul fiziologic o sarcină negativă în


radical stabilind legături ionice sau de hidrogen cu apa sau
cu alte catene laterale. Valina este un aminoacid hidrofobic
ce tinde să interacţioneze cu ale lanţuri hidrofobice pentru a
exclude apa, modificându­se structura cuaternară

 Înlocuirea glutamatului cu valina în lanţul β permite


separarea HbS de Hb adultă normală prin electroforeză. În
acest caz, pacienta era homozigotă pentru HbS şi avea o
cantitate crescută de Hb fetală, HbF. Heterozigoţii pentru
HbS prezintă atât HbA cât şi HbS, precum şi cantităţi mici
de HbF
Exemple
 Laindivizii heterozigoţi pentru siclemie, alela celulei S oferă
o oarecare protecţie împotriva malariei, boală cauzată de
Plasmodium falciparum care îşi petrece o parte din ciclul de
viaţă în hematie

 Hematia infectată la indivizii cu Hb adultă normală dezvoltă


protruzii care se ataşează la endoteliul capilar. Această
legare blochează vasele şi oxigenul nu mai ajunge în
regiunea afectată, rezultând moartea celulară

 La heterozigoţi, HbS în celulele afectate se adună în fibre


lungi, care determină distorsionarea celulei. Aceste celule
distorsionate conţinând parazitul sunt recunoscute
preferenţial de splină şi sunt rapid distruse, încetând viaţa
parazitului.
Exemple
 La indivizii homozigoţi cu siclemie,
hematiile iau frecvent forma de seceră în
special în condiţii de presiune scăzută a
oxigenului.

 Rezultatul este apariţia crizelor vaso-


ocluzive în care celulele distorsionate
blochează capilarele şi împiedică
oxigenarea cu apariţia durerii

 Distrugerea crescută a hematiilor


modificate în splină determină anemie.
Structura primară a insulinei
 Insulina este un hormon polipeptidic ce s-a conservat
puternic la nivelul diferitelor specii, presentând câteva
substituţii ale aminoacizilor niciuna în regiunile care să-i
afecteze activitatea.
Structura primară a insulinei
 Prezintă 51 aminoacizi şi este alcătuită din lanţuri
polipeptidice. Este sintetizată iniţial ca lanţ polipeptidic unic
(proinsulina), dar este clivată în trei puncte înaintea secreţiei,
formând peptidul C şi molecula de insulină activă conţinând
lanţurile A şi B diferite

 Prin clivare se îndepărtează câţiva aminoacizi şi peptidul C


al aminoacidului 31 ce leagă lanţurile A şi B

 Structura tridimensională corectă a lanţurilor A şi B este


favorizată de prezenţa legăturilor disulfidice: o legătură
intracatenară şi două legături intercatenare formate de
reziduurile de cisteină.
PEPTIDELE
 Produşii reacţiei de condensare a două sau mai multe
molecule de aminoacizi formează peptidele

 Lanţul peptidic rezultat poate fi mai scurt sau mai lung în


funcţie de numărul resturilor de aminoacizi participanţi

 Peptideleformate dintr-un număr mic de aminoacizi


 (12 < n< 20) se numesc oligopeptide, iar cele cu un număr
mai mare de resturi de aminoacizi (n>20) sunt polipeptide
(unde n= număr de aminoacizi).
Peptide naturale mai importante
 Glutationul ( γ-glutamil-cisteinil-glicina)
 Este un tripeptid atipic deoarece legătura peptidică între
acidul glutamic şi cisteină se formează prin condensarea
grupării carboxil din poziţia γ a acidului glutamic şi
gruparea aminică a cisteinei:

 În celulele animale, glutationul funcţionează ca un


sistem redox, putând exista în forma redusă (GSH) şi/sau
oxidată (GSSG).
Peptide naturale mai importante
 Glutationul participă la procesele redox din majoritatea
ţesuturilor (în special în hematii) şi este activator al
sistemelor enzimatice

 Rolul glutationului este conferit de prezenţa în


molecula sa a grupării tiolice (-SH)

 Oxidarea glutationului se poate realiza neenzimatic, în


prezenţa ionilor de cupru şi fier:

 2GSH  G-S-S-G + 2 H+ + 2e-


Peptide naturale mai importante
 În forma sa redusă glutationul serveşte la
descompunerea apei oxigenate (H2O2) cât şi a
peroxizilor de natură lipidică (R-OOH) în prezenţa
glutation peroxidazei (GSH-Px), protejând
membranele celulare de acţiunea oxidantă a
acestora:

 R-OOH + 2GSH  R-OH + HOH + G-S-S-G


Peptide naturale mai importante
 GSH-Px (glutation peroxidaza) este o enzimă ce oferă
protecţie eficientă faţă de reacţia de peroxidare deoarece:

 ►combină capacităţile antioxidante ale tiolilor şi seleniului;


 ► descompune H2O2 cu mai multă eficienţă decât catalaza;
 ► produşii de reacţie nu sunt radicali liberi ci substanţe
hidrosolubileş
 ►acţionează asupra tuturor peroxizilor existenţi în mediile
biologice
Peptide naturale mai importante
 Dintre cele două forme ale glutationului forma redusă
reprezintă forma activă

 Posibilitatea de interconversiune a glutationului constituie


mecanismul său de acţiune prin care cedează şi acceptă H+,
intrând în categoria transportorilor de hidrogen

 Reducerea formei oxidate a glutationului se face în prezenţa


enzimei glutation reductază (NADPH-dependentă) astfel:

 G-S-S-G + NADPH + H+ 2GSH + NADP+


Peptide naturale mai importante
 Alte roluri ale glutationului:

● transformarea methemoglobinei în hemoglobină


 ● inactivarea insulinei prin desfacerea legăturilor disulfurice
din structura acesteia
 ● participarea, alături de alţi compuşi, la neutralizarea unor
substanţe nocive endogene şi exogene
 ● în procesul de biosinteză a acidului ascorbic şi a
leucotrienelor
Peptide naturale mai importante
 Alte roluri ale glutationului:

 previne oxidarea grupărilor –SH din centrul activ al unor enzime


 reacţionează cu peroxinitritul (ONOO -) formând un nitrozotiol
(GSNO) care se descompune regenerând NO∙

 Dacă un ţesut este supus unui aflux mare de agenţi peroxidanţi


consumul de glutation creşte, o serie de enzime încep să se
inactiveze, inclusiv cele implicate în sinteza proteică, proces
important pentru viabilitatea celulelor. Se explică astfel obstinaţia
celulelor în păstrarea concentraţiei GSSG cât mai mică.
Peptide naturale mai importante
 Hormonii hipofizei postrioare: oxitocina şi vasopresina (nonapeptide)

 Oxitocina exercită acţiune contractilă asupra musculaturii netede


uterine, iar vasopresina participă şa homeostazia osmolarităţii şi
volumului fluidului extracelular.
Peptide naturale mai importante

 Hormonii hipotalamici (factorii de inhibare sau de eliberare a


hormonilor hipofizari) sunt peptide mici, uneori cu structură
atipică (TRH este piroglutamil-histidil-prolinamida)

 Parathormonul şi calcitonina sunt peptide ce participă la


reglarea metabolismului calciului

 ACTH (corticotropina) este un peptid ce controlează


dezvoltarea cortexului glandelor suprarenale.
Peptide naturale mai importante
 Angiotensina II este un peptid antihipertensiv
 Endorfinele şi encefalinele sunt peptide de mărimi
variabile, sintetizate în crecer cu roluri deosebite
în somn, memorie, învăţare, durere, comportament

 Peptidele antibiotice sunt sintetizate de


microorganisme. Au o structura peptidică, uneori
ciclică şi pot conţine D-aminoacizi.
Exemple
 AM este un băiat de 18 ani care a fost adus la şcoală de
mama lui pentru o durere severă în în flancul stâng, cu
iradiere în jurul spre partea stângă în zona pubiană

 Urina era colorată în roşcat-portocaliu, iar la examinarea


sedimentului urinar s-a evidenţiat prezenţa mai multor
globule roşii. După acidifiere cu acid acetic s-au observat
grămezi de cristale hexagonale transparente.
Exemple
 Radiografia abdominală a evidenţiat calculi radioopaci în
ambii rinichi. Nu există un istoric familial pozitiv pentru
litiază renală.

 Pacienta a eliminat o piatră cu localizare renală, cu liniştirea


durerii din flanc. Componenta majoră a fost cistina. În mod
normal, aminoacizii sunt filtraţi prin capilarele glomerulare
renale în tubii renali, dar aproape întreaga cantitate este
reabsorbită în sânge cu ajutorul proteinelor transportoare din
celulele tubulare proximale renale.
Exemple
 Cistinuria este o boală genetică ce se caracterizează printr-o
substituţie a aminoacizilor în proteina de transport care, în
mod normal, reabsoarbe cistina, arginina şi lizina din
lumenul renal în celulale tubulare renale

 Astfel, urina va conţine cantităţi crescute din aceşti


amoniacizi. Cistina, cel mai puţin solubil dintre aceştia,
precipită în urină sub formă de calculi.
Structura secundara a proteinelor
 Este legată de numele lui Pauling şi a colaboratorilor săi
care, începând din 1930 au realizat studii de cristalografie
cu raze X şi au măsurat unghiurile şi distanţele
interatomice din aminoacizii constituienţi

 S-a stabilit că atomii Cα adoptă poziţii rigide faţă de


planul dublei legături şi că în peptidele naturale se
întâlneşte numai configuraţia trans mai stabilă decât cis.
Structura secundara a proteinelor
Configuraţia trans a unei legături peptidice
Structura secundara a proteinelor
 Flexibilitatea lanţului polipeptidic se păstrează
prin rotaţia liberă în jurul legăturilor:
Structura secundara a proteinelor
 Structura secundară a proteinelor se datorează în
exclusivitate legăturilor de hidrogen care se stabilesc între
grupările –CO- aparţinând unei legături peptidice şi –NH- de
la alta

 Conjugarea p-π accentuează această proprietate

 Un lanţ peptidic, în solutie, ar putea adopta o infinitate de


conformatii prin rotatii in jurul legăturilor ―CH(R1)― N şi
―CH(R2)―CO. Unele din aceste conformatii vor fi mai
stabile dacă permit realizarea de punţi de hidrogen între
gruparile peptidice.
Structura secundara a proteinelor
 Plecând de la principiul că aranjamentul cel mai stabil este
acela în are se realizează el mai mare număr de punţi de
hidrogen, Pauling si Corey (1951) au postulat 2 structuri
secundare pentru lanţurile peptidice: α-helixul şi
 conformaţia β în foi pliate

 O structură helicoidală diferită de cea descrisă de Pauling este


întâlnită la colagen, proteina majoră a matricei extracelulare cu
o compozitie particulară în aminoacizi.
Structura secundara a proteinelor
 α - HELIXUL
 Legăturile de hidrogen. Lanţul polipeptidic se răsuceşte la
nivelul legăturilor simple pentru ca grupările O=C şi NH să
devină adiacente stereochimic pentru a forma punţi de H. Se
obţine astfel o structură repetitivă helicoidală în care toate
unităţile se află în raporturi spaţiale identice cu unităţile vecine

 O grupare NH formează o punte de hidrogen cu gruparea CO


aparţinând celui de-al 4 lea rest aminoacidic din secvenţa
liniară. În acest fel, toate gruparile CO şi NH sunt unite prin
punţi de hidrogen.
Structura secundara a proteinelor
Legătura de hidrogen
este o interacţiune slabă
necovalentă între
hidrogenul unei molecule
şi atomul mai
electronegativ al unei
molecule acceptoare.
Structura secundara a proteinelor
 Stabilitatea α-helixului este dată de numărul mare al
legăturilor de hidrogen realizate intralanţ

 Acestea se extind ascendent între două spire consecutive


ale helixului, paralel cu axa lui longitudinală

 Datorită acestei particularităţi structurale, toate legăturile


peptidice din lanţul polipeptidic (cu excepţia primei şi a
ultimei) participă la formarea legăturilor de hidrogen
intralanţ

 Considerate individual, legăturile de hidrogen sunt slabe,


dar considerate global, conferă stabilitate helixului.
Structura secundara a proteinelor
 Numărul de aminoacizi per spiră

 Fiecare spiră a unui α-helix conţine un număr mediu de 3,6


aminoacizi. Resturile de aminoacizi separate de 3 sau 4 aminoacizi
în cadrul secvenţei primare, ajung în stare de proximitate spaţială
după plierea în structura α-helixului

 Stereochimia grupării peptidice, unghiurile de legătura, distanţele


interatomice, coliniaritatea punţilor de hidrogen, apartenenţa
aminoacizilor helixului seriei optice (seria L) determină o anumită
geometrie a α-elicei:
Structura secundara a proteinelor
 - cu fiecare rest aminoacidic se avansează pe
 verticală cu 1,47 Å;
 - pasul elicei, distanta între două puncte echivalente pe verticală
este de 5,21Å şi cuprinde 3,6 resturi aminoacidice ;
 - diametrul elicei, diametrul suprafeţei cilindrice în care se află
atomii Cα este de 10,1 Å;
 - sensul răsucirii lanţului polipeptidic este de la stânga la dreapta
(helix spre dreapta);
 - radicalii R ai tuturor aminoacizilor sunt orientaţi spre exteriorul
elicei, configuratia atomilor Cα este aceeaşi pentru toţi
aminoacizii;
 - toate gruparile NH şi C=O formează punţi de hidrogen.
Structura secundara a proteinelor
 Aminoacizii care destabilizează α-helixul

 Lungimea şi repartizarea segmentelor de α- helix în


cuprinsul moleculei este diferită de la o proteină la alta,
în funcţie de distribuţia factorilor stabilizatori şi
destabilizatori ai elicei în structura primară

 Structura secundară se referă la forma şi la lungimea


lanţurilor polipeptidice, proprietăţi induse de legăturile
de hidrogen.
Structura secundara a proteinelor
 Cele mai întîlnite tipuri de structuri secundare sunt:
 alpha helixul şi lanţurile beta

 Helixul α se formează prin rotaţia unui lanţ polipeptidic în


jurul propriei axe

 Alte helixuri cum ar fi helixul 310 şi helixul π sunt, din


punct de vedere energetic, favorabile formării legăturilor de
hidrogen, dar sunt rareori observate în proteinele naturale
exceptînd părţile terminale ale helixului α în timpul formării
scheletului proteic (de obicei centrul helixului).
Structura secundara a proteinelor
 Aminoacizii care destabilizează α-helixul

 Aminoacizii au un comportament diferit vis-a-vis de


posibilitatea formării structurii secundare

 Prolina şi glicina sunt cunoscuți ca "helix breakers"


(spărgători de helix), deoarece afectează configurația
scheletului proteic; ambii aminoacizi au abilităţi
conformaţionale neobişnuite şi, de regulă, se găsesc în
colţurile scheletului proteic.
 
Structura secundara a proteinelor
 Aminoacizii care preferă să adopte conformaţia helixului
proteic fac parte din aşa numita serie MALEK (codurile
formate din prima literă a aminoacizilor: metionină,
alanină, leucină, acid glutamic şi lizina);

 în schimb, aminoacizii aromatici precum triptofanul,


tirozina şi fenilalanina, dar şi aminoacizii cu legare prin
carbonul beta (izoleucina, valina și treonina), adoptă
configurația β.
Structura secundara a proteinelor
 Prolina destabilizează α-helixul deoarece gruparea
amino secundară a acesteia nu este compatibilă din
punct de vedere geometric cu spirala dextrogiră a α-
helixului.

 Ea crează o deformare a lanţului polipeptidic ce


perturbă structura helicoidală netedă a acestuia.
Resturile prolil, prin geometria lor particulară,
împiedică răsucirea helicodală a lanţurilor
polipeptidice. La nivelul unui rest de Pro, lanţul se
îndoaie cu un unghi de 130 grade.
Structura secundara a proteinelor
 Prezenţa unui număr mare de aminoacizi ionizaţi
 (glutamat, aspartat, histidină, lizină sau arginină) produce o
discontinuitate a α-helixului din cauza apariţiei legăturilor ionice
sau a forţelor de respingere electrostatică între aceşti aminoacizi

 Aminoacizii care au catene laterale voluminoase precum


triptofanul sau aminoacizii cum ar fi valina sau izoleucina,
treonina, care se ramifică la nivelul Cβ ( primul carbon al
radicalului R, legat de carbonul α ) pot perturba formarea α-
helixului dacă sunt prezenţi în număr crescut, şi dacă aceste R
ajung adiacente in elice.
Structura secundara a proteinelor
 Resturile glicil, fără catenă laterală, conferă lanţurilor
polipeptidice flexibilitate şi adesea, la nivelul resturilor Gly,
structura secundară α este întreruptă, lanţul schimbându-şi uşor
direcţia

 Serina, prin capacitatea de a forma punţi de hidrogen la nivelul


grupării alcoolice destabilizează elicea

 Resturile de cisteină când formează punţi disulfurice leagă


covalent, rigid, porţiuni ale lanţului polipeptidic şi în vecinătatea
acestor regiuni răsucirea helicoidală nu mai poate avea loc.
  
Structura secundara a proteinelor
 Structura α- helicoidală a lanţurilor polipeptidice
postulată de Pauling si Corey a fost găsită, în
proporţie mai mare sau mai mică, în diverse proteine.
 
Proteina % helix α
 
Mioglobina 70
Insulina 38
Ovalbumina 31
Serumalbumina 46
Pepsina 31
Ribonucleaza 16
Chimotripsina 15
Structura secundara a proteinelor
 Stuctura secundară α se întâlneşte în diverse proporţii
 atât în proteinele fibrilare cât şi în cele globulare

 O proteină fibrilară cu structură secundară α în


proporţie de aproximativ 100٪ este keratina, proteină
abundentă în păr, piele, unghii

 Este alcatuită din lanţuri polipeptidice lungi cu


structură de α-helix, asociate câte două şi
superâncolăcite . Prin asocierea acestor dimeri se
realizează fibrile şi fibre rezistente
Structura secundara a proteinelor
 În aceste fibrile, grupările R pot interacţiona prin valenţe
secundare în cele mai bune condiţii. În plus, structura
superhelicoidală este stabilizată şi prin punţi disulfurice
intercatenare, keratina avand un conţinut ridicat în cisteină

 Mioglobulina şi hemoglobina au un procent mare (70٪) de


structură secundară α . În aceste cazuri, segmentele de α- helix
sunt scurte, ele fiind întrerupte de porţiuni nehelicoidale. La
nivelul acestora din urmă, lanţul polipeptidic işi schimbă direcţia
sub diverse unghiuri, permiţând realizarea unei structuri compacte.
 .
Structura secundara a proteinelor
 O altă structură secundară a lanţurilor polipeptidice în care se
realizează potenţialul maxim de legare prin punţi de hidrogen a
grupărilor C=O şi NH ale legăturii peptidice este structura β sau
structura în foaie pliată

 În acest caz punţile de hidrogen sunt intercatenare, lanţurile


polipeptidice se aşează în foi. Cea mai stabilă interacţiune se
obţine dacă lanţurile evoluează unul de la capatul N–terminal spre
cel C-terminal şi celălalt în sens invers.
Structura secundara a proteinelor
Spre deosebire de α-helixuri, foile β sunt
alcătuite din două sau mai multe lanţuri
peptidice (lanţurile β) sau din segmente de
lanţuri polipeptidice, care sunt aproape
complet întinse

Legăturile de hidrogen sunt


perpendiculare pe scheletul polipeptidic.
Datorită rigidităţii legăturii peptidice şi
coplanarităţii grupului

― CH ― NH ― CO ― CH ―

se realizează structuri asemănătoare unei


foi plisate. Radicalii R mari sunt orientaţi
alternativ, de o parte şi de alta.
Structura secundara a proteinelor
 Foile paralele şi antiparalele
 Aranjamentul β poate fi alcătuit din două sau mai multe
lanţuri polipeptidice separate sau din segmente de lanţuri
polipeptidice orientate paralel (lanţurile se desfăşoară în
aceeaşi direcţie) sau antiparalel (lanţurile se desfăşoară în
direcţii opuse)

 Legăturile de hidrogen formate între scheletele axiale ale


celor două lanţuri polipeptidice sunt denumite intercatenare.
Aranjamentul β poate fi constiruit şi dintr-un singur lanţ
polipeptidic retropliat, legăturile de hidrogen fiind
intracatenare în acest caz.
Structura secundara a proteinelor
 Structura secundară β în foaie pliată este întâlnită în proporţie de
aproape 100٪ în proteina din mătase, fibroina

 Lanţurile polipeptidice antiparalele sunt întinse şi asociate prin


legături de hidrogen, dând naştere unei foi pliate. Aceste foi se
aşează în straturi, iar între straturi se stabilesc numeroase legături
între grupările R, care proemină de o parte şi de alta a fiecării foi

 Datorită unei structuri primare speciale cu multe resturi Gly şi Ala


alternante, distanţele dintre foi sunt mici (3,5Å si 5,7Å alternativ).
Această structură conferă fibroinei rezistenţă la întindere şi
flexibilitate.
Structura secundara a proteinelor
 Structurile β sunt motive structurale întâlnite
frecvent în proteinele globulare. Cel mai simplu
element din structura β constă dintr-un lanţ
polipeptidic îndoit care realizează două segmente
antiparalele, denumit β-turn :
Structura secundara a proteinelor
 În cazul proteinelor globulare, foile β prezintă întotdeauna o
torsiune sau o răsucire dextrogiră faţă de scheletul
polipeptidic cu 180º, contribuind la apariţia formei globulare

 Structura buclei este stabilizată prin formarea unei legături


de hidrogen între primul şi al treilea aminoacid

 Secvenţa aminoacizilor care formează acest tip de structură


cuprinde de obicei resturi de glicină şi prolină.
Structura secundara a proteinelor
 Glicina, datorită volumului său mic, este cel mai uşor
adaptabilă la modificările sterice
 Prolina, care are atomul de azot peptidic prins în structura sa
ciclică, favorizează modificarea direcţiei axului catenei
polipeptidice
 Frecvent, foile β răsucite constituie nucleul structural al
proteinelor globulare
 Mai multe catene polipeptidice, de regulă 6 dar şi mai multe
pot adopta structura β cu foi pliate
 Domeniile structurale ale imunoglobulinelor ş ale proteinelor
din aceeaşi superfamilie cuprind un motiv structural major β.
Structura secundara a proteinelor
 Structurile secundare nerepetitive

 Aproximativ jumătate din masa unei proteine globulare


este organizată sub formă de structuri repetitive, de tip
α-helix şi/sau foi pliate β
 Restul lanţului polipeptidic prezintă o conformaţie
curbată sau spiralată
 Aceste structuri secundare nerepetitive nu sunt deloc
întâmplătoare, ci doar prezintă o conformaţie mai puţin
regulată comparativ cu structurile descrise anterior.
Structurile suprasecundare
 Proteineleglobulare sunt combinaţii de elemente structurale
secundare ( α-helixuri, foi β, secvenţe nerepetitive) care
formează în principal regiunea centrală sau interiorul
moleculei

 Acestestructuri sunt interconectate prin porţiuni curbate (de


exemplu, lanţurile β) la suprafaţa proteinelor

 Structurile suprasecundare apar prin compactarea catenelor


laterale ale elementelor structurale secundare adiacente.
Proteinele care se leagă de ADN conţin unul sau mai multe
tipuri bine definite de mozaicuri
Structurile suprasecundare
 Mozaicul în deget de zinc este frecvent întâlnit în
structura proteinelor care au rol de factori de
transcripţie
 În proteinele „zinc finger” aminoacizii (cel mai
frecvent cisteina şi histidina) se dispun în deget de
mânuşă la baza cărora se fixează un ion de zinc
Structurile suprasecundare
 Proteinele helix-buclă-helix prezintă un domeniu de
fixare la ADN ce conţine un motiv structural format din
două α-helixuri separate printr-o buclă scurtă

 Acest model structural este întâlnit la factorii de


transcriere care stimulează sinteza de imunoglobuline.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Structura terţiară a proteinelor reprezintă un nivel superior


de organizare ce înglobează structura secundară şi care se
referă la modul în care sunt asamblate α-helixul şi foaia
pliată β

 Structura primară a unui lanţ polipeptidic determină structura


terţiară a acestuia

 Adjectivul „terţiar” se referă atât la plierea domeniilor


(unităţile structurale şi funcţionale de bază) cât şi la
aranjamentul final al domeniilor în structura unui polipeptid.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Interacţiunile
dintre radicalii R distanţaţi în secvenţa liniară
determină o anumită conformaţie a lanţului polipeptidic

 Structura tridimensională a unei proteine native în mediul


său fiziologic este accea pentru care energia liberă a
sistemului este minimă

 În soluţie apoasă, structura proteinelor globulare este


compactă, cu o densitate mare de atomi în centrul moleculei.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Catenele laterale hidrofobe sunt dispuse în interiorul
moleculei, în timp ce grupările hidrofile sunt dispuse în
general, pe suprafaţa moleculei

 Interacţiunile necovalente sunt factori decisivi ai


structurii terţiare

 Indiferent de structura secundară (α sau β) căreia îi


aparţin resturile R din structuira lanţului polipeptidic,
aceştia, prin interacţiunile pe care le stabilesc, participă
la edificarea structurii terţiare
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Structura terţiară a proteinelor globulare este
stabilizată prin următoarele patru tipuri de
interacţiuni:

a.legătura
peptidică;
b.legătura ionică;
c.punţi de hidrogen;
d. interacţiuni
hidrofobe;
e.punţi disulfidice
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Legăturile disulfidice sunt legături de tip covalent
între grupările sulfhidril (-SH) ale resturilor de cisteină
cu formarea unui rest de cistină
 Cele două molecule de cisteină pot fi separate prin mai
mulţi aminoacizi din structura primră a polipeptidului
sau pot fi localizate pe cele două lanţuri polipeptidice
diferite
 Plierea lanţurilor polipeptidice apropie resturile de
cisteină şi facilitează formarea unei legături covalente
între catenele laterale ale ale acestora.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Legăturile disulfidice
conferă stabilitate structurii
tridimensioanale a
moleculei proteice
prevenind denaturarea
acesteia în mediul
extracelular

 Imunoglobulinele secretate
de celulele sangvine sunt
proteine care conţin un
număr crescut de legături
disulfidice.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Interacţiunile hidrofobe
 Aminoacizii cu catene laterale nepolare tind să se localizeze în
interiorul moleculei polipeptidice, unde se asociază cu alţi
aminoacizi hidrofobi

 În schimb, aminoacizii care conţin catene laterale polare sau


ionizate tind să se localizeze la suprafaţa moleculei, în contact cu
solventul polar.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
 Legăturile
GLOBULARE
de hidrogen

 Catenele laterale ale aminoacizilor care conţin legături


oxigen-hidrogen sau azot-hidrogen, cum ar fi radicalii alcool
ai serinei şi ai treoninei, pot forma legături de hidrogen cu
atomii bogaţi în electroni- atomul de oxigen al grupării
carboxil sau carbonil din componenţa unei legături peptidice

 Formarea legăturilor de hidrogen între radicalii polari de pe


suprafaţa proteinelor şi solventul apos determină creşterea
solubilităţii proteinelor.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Interacţiunile ionice

 Radicalii încărcaţi negativ cum ar fi


gruparea carboxil din catena laterală a
aspartatului sau a glutamatului, pot
interacţiona cu radicalii încărcaţi
pozitiv, cum ar fi gruparea amino din
catena laterală a lizinei.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Plierea proteinelor
 Interacţiuniledintre catenele laterale ale aminoacizilor
influenţează modul de pliere a lanţului polipeptidic în
forma tridimensională specifică proteinei funcţionale
 Plierea proteinelor, care se desfăşoară în decurs de
secunde sau minute în interiorul celulelor se realizează
prin atragerea sau respingerea catenelor laterale ale
aminoacizilor în funcţie de proprietăţile chimice ale
acestora
STRUCTURA TERŢIARĂ A
PROTEINELOR GLOBULARE
 Radicalii încărcaţi pozitiv vor fi atraşi de cei încărcaţi
negativ, catenele încărcate cu acelaşi tip de ionizare se
resping

 Procesul de pliere depinde şi de legăturile de hidrogen,


interacţiunile hidrofobe şi legăturile disulfidice

O proteină pliată corect prezintă în- cărcătură electrică


redusă, fenomenele de atracţie fiind predominante.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Rolul chaperonelor în plierea proteinelor
 Prin convenţie, se acceptă că informaţia necesară unei plieri
corecte se găseşte în structura primară a polipeptidelor. Este
dificil de explicat faptul că proteinele denaturate nu revin
automat la conformaţia nativă în condiţii de mediu adecvate

 Plierea nu are loc la finalul sintezei unui lanţ proteic, ci


etapizat. Acest fenomen limitează configuraţiile alternative
de pliere a lanţurilor peptidice mari. În plus, o clasă specială
de proteine, denumite „chaperone” are rolul de a asigura
plierea corectă a multor alte clase de proteine
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Configurarea spaţială
a proteinelor este
controlată de proteine
chaperon, heat shock
proteins
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 „Chaperonele” denumite şi proteine de „ şoc termic” ( heat


shock proteins) a căror sinteză este crescută când
temperatura creşte sau

 în alte stări de stress celular (variaţii de pH sau osmolaritate)


sau proteine însoţitoare interacţionează cu polipeptidele în
diverse etape ale procesului de pliere
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Unele dintre chaperone au rolul

 de a stabiliza configuraţia nepliată a proteinelor până la


finalizarea sintezei acesteia sau

 potavea rol de catalizator prin accelerarea etapelor finale ale


procesului de pliere

 Alte chaperone protejează proteinele în cursul plierii,


prevenind blocarea regiunilor vulnerabile ale acestora în
legături neproductive.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 În mod curent, se utilizează denumirea prescurtată Hsp


la care se adaugă o cifră corespunzătoare masei
moleculare exprimată în kDa (exemplu Hsp- 70)

O altă categorie de proteine de stress este reprezentată


de „glucose-regulated proteins” (GRP) a căror sinteză
creşte în condiţiile privării de glucoză sau aminoacizi a
celulei
STRUCTURA TERŢIARĂ A
PROTEINELOR GLOBULARE
 Un exemplu de chaperonă care intervine în
definitivarea structurii unei proteine celulare este
GRP 70= BIP (binding immunoglobulin protein)

 Lanţurile H şi L ale imunoglobulinelor sunt


sintetizate şi apoi fixate de BIP şi în lumenul
reticulului endoplasmic sunt asamblate cu ajutorul
BIP sub formă oligomerică H2L2.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR GLOBULARE

 Domeniile proteice sunt unităţi funcţionale şi structurale


tridimensionale fundamentale ale polipeptidelor

 Lanţurile polipeptidice cu un număr mai mare de 200


aminoacizi conţin două sau mai multe domenii

 Centrul unui domeniu este alcătuit din combinaţii de


elemente structurale suprasecundare (mozaicuri)
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Plierea lanţului polipeptidic la nivelul unui


domeniu se desfăşoară independent de plierea care
are loc la nivelul altor domenii

 Fiecare domeniu are caracteristicile unei proteine


globulare mici, compacte, care din punct de vedere
structural este independentă de restul domeniilor
unui lanţ polipeptidic.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE

 Denaturarea proteinelor

 Este un proces care determină deplierea şi dezorganizarea


structurilor secundară şi terţiară ale acestora, procese care nu
se însoţesc de hidroliza legăturilor peptidice

 Exemple de agenţi denaturanţi sunt: căldura, solvenţii


organici, acizii şi bazele tari, detergenţii şi ionii metalelor
grele, cum ar plumbul şi mercurul
STRUCTURA TERŢIARĂ A
PROTEINELOR GLOBULARE
 Denaturarea proteinelor
 Denaturarea poate fi reversibilă (în condiţii ideale)
situaţie în care proteina se repliază pentru a ajunge
în forma sa nativă, biologic activă, după
îndepărtarea agentului denaturant
 Cu toate acestea, majoritatea proteinelor, odată
denaturate, rămân definitiv depliate. Proteinele
denaturate sunt frecvent insolubile, precipitând în
soluţie.
STRUCTURA TERŢIARĂ A PROTEINELOR
GLOBULARE
 Solubilitatea proteinelor

 Proteinele globulare sunt solubile în apă, iar cele fibrilare nu


sunt. Soluţiile unor săruri ale metalelor uşoare influenţează
solubilitatea proteinelor (NaCl, Na2SO4, MgCl2,
(NH4)2SO4

 Soluţiile saline diluate enumerate anterior sunt favorabile


dizolvării globulinelor. La concentraţii mari ale sărurilor din
soluţie poate avea loc precipitarea globulinelor
STRUCTURA TERŢIARĂ A
PROTEINELOR GLOBULARE
 Solubilitatea proteinelor
 Un exemplu clasic şi utilizat în laboratoarele
clinice este cel al salifierii (reacţia cu sulfat de
amoniu) albuminelor şi globulinelor

 Globulinele precipită când soluţia este semiaturată


cu sulfat de amoniu, iar albuminele când soluţia
este aproape saturată.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 Reprezintă nivelul cel mai înalt de organizare structurală şi
apare la proteinele alcătuite din mai multe lanţuri
polipeptidice, de regulă un număr mic şi par. Se formează o
unitate de sine stătătoare numită proteină oligomeră, cu o
structură spaţială bine definită

 Subunităţile (lanţurile polipeptidice individuale) sunt


denumite protomeri şi sunt asamblate prin legături slabe,
necovalente de tip van der Waals, legături de hidrogen,
interacţiuni hidrofobe şi în mai mică măsură prin legături
ionice.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 Protomerii pot fi identici sau diferiţi, fiecare având propria
structură primară, secundară, terţiară. Protomerii separaţi nu
au funcţiile specifice ale proteinei oligomere din care fac
parte. Asocierea subunităţilor este o trăsătură comună pentru
organizarea macromoleculară în biologie

 Structura cuaternară se referă la modul în care se unesc


subunităţile proteice. Enzimele care catalizează asamblarea
acestor subunităţi poartă denumirea de holoenzime, în care o
parte poartă denumirea de subunităţi reglatoare şi
subunităţi catalitice.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR

 Vedere 3 D a hemoglobinei. Cele 4 subunităţi:


roşu şi galben, iar unitatea hemică: verde

 Numele de hemoglobină provine de la hem şi


globină, denumire ce denotă faptul că
hemoglobina are la bază proteine globulare
cuplate cu o grupare hem

 .
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 Subunităţile pot funcţiona
independent sau pot coopera ca în
cazul hemoglobinei când ataşarea
unui atom de oxigen la una dintre
subunităţile tetramerului induce
creşterea afinităţii pentru oxigen a
celorlate subunităţi
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 Proteine care au structură cuaternară sunt: hemoglobina,
ADN polimeraza, canalele ionice, dar şi nucleosomii şi
nanotubulii, care sunt complexe multiproteice

 Fragmentele proteice pot suferi transformări în structura


cuaternară care se reflectă fie în structurile individuale fie în
reorientările subunităţilor proteice

 Numărul subunităţilor din proteinele oligomere sunt


denumite prin adăugarea sufix-ului -mer (grecescul pentru
subunitate), precedat de numele subunităţii.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 Multe enzime intracelulare sunt oligomeri şi pot hetero-sau homomultimerice
(tubulina este un dimer, hemoglobina este un tetramer)

Proteina Numărul de subunităţi


Alcool dehidrogenaza 2
Imunoglobulina 4
Superoxid dismutaza 2
Triozofosfat izomeraza 2

Glicogen fosforilaza 2
Fosfataza alcalină 2
Glutation reductaza 2
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
Proteine oligomere

Proteina Numărul de subunităţi


Lactat dehidrogenaza 4
Piruvat kinaza 4
Hemoglobina 2+2
Insulina 6
Ceruloplasmina 8
Glutamin sintetaza 12
Apoferitina 24
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR

 Asocierea subunităţilor în structura cuaternară a


proteinelor oligomere prezintă o serie de avantaje
structurale şi funcţionale:

 1. Economisirea materialului genetic şi eficienţa se referă


la cantitatea de ADN care este utilizată pentru codificarea
unei subunităţi constituente evident mai mică pentru o
unitate decât pentru „ n” subunităţi necesară pentru o
proteină homomultimerică. Informaţia genetică
referitoare la legarea subunităţilor se află încsrisă tot în
materialul genetic ce codifică monomerul.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 2. Stabilitatea
 Organizarea proteinelor în structura cuaternară
prin asocierea subunităţilor unui oligomer este
favorabilă reducerii raportului suprafaţa
proteinei/volum

 Interacţiunea suprafeţei unei proteine cu apa este


deseori nefavorabilă energetic, ceea ce înseamnă
că scăderea raportului suprafaţă proteină/volum
este situaţia în care o proteină este mai stabilă.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 3. Formarea situsului activ pentru unele
enzime

 Unele enzime sunt proteine oligomere şi devin


mai active numai atunci când subunităţile
oligomerului se asociază

 Monomerii individuali sunt inactivi

 De exemplu triptofan sintaza este un tetramer


de forma α2β2.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR
 In vitro, s-a demonstrat cu enzimă purificată că subunitatea α
catalizează reacţia:

 Indol glicerol fosfat  indol + gliceraldehid 3-


fosfat

 Subunitatea β catalizează reacţia:


 indol + serină  triptofan
 Produsul reacţiei catalizate de subunitatea α, devine reactant
pentru subunitatea β, deci cele două subunităţi nu pot fi
biologic active dacă nu sunt asociate în oligomer.
STRUCTURA CUATERNARĂ
A PROTEINELOR

 4. Cooperativitatea

 Prin intermediul structurii cuaternare


funcţionează mecanisme fine de reglare a
activităţii proteinelor.
Erori de pliere a moleculelor
 Plierea moleculelor proteice constituie un proces complex
bine controlat, dar supus erorilor care poate genera molecule
proteice pliate incorect

 De obicei, proteinele cu erori de pliere sunt reperate şi


distruse în interiorul celulei

 Totuşi, acest sistem de control calitativ nu este perfect,


proteinele cu defecte de pliere acumulându-se intracelular sau
extracelular odată cu înaintarea în vârstă

 Depozitele de proteine cu defecte de pliere se asociază unui


număr important de afecţiuni, din care fac parte amiloidozele
Erori de pliere a moleculelor
 Erorile de pliere pot fi generate spontan sau pot fi
rezultatul unei mutaţii la nivelul unei gene, mutaţie
capabilă să conducă la sinteza unei proteine
aberante

 În urma unei clivări proteolitice anormale, anumite


proteine aparent normale dobândesc o conformaţie
unică, urmată de apariţia unor structuri fibrilare
lungi asamblate sub formă de foi pliate β
Erori de pliere a moleculelor
 Acumularea acestor agregate spontane de proteine, denumite
amiloizi, este implicată în multe afecţiuni degenerative,
boala neurodegenerativă Alzheimer.

 Componenta principală a plăcii amiloidice care se


acumulează în maladia Alzheimer este reprezentată de
amiloidul β (Aβ), un peptid alcătuit din 40-42 resturi de
aminoacizi
Erori de pliere a moleculelor

 Cristalografia cu raze X şi spectroscopia în infraroşu


certifică prezenţa unei conformaţii caracteristice de foi
pliate β în fibrile neramificate

 Amiloidul este neurotoxic şi reprezinta evenimentul


patogenic central care produce deficienţa cognitivă
caracteristică maladiei Alzheimer
Erori de pliere a moleculelor

 Peptidele Aβse agregă, generând amiloidul din


parenchimul cerebral şi din jurul vaselor sangvine
Erori de pliere a moleculelor

 Un alt factor biologic implicat în patogenia


maladiei Alzheimer constă în acumularea de
complexe neurofibrilare în ţesutul cerebral

 Una dintre componentele principale ale


complexelor fibrilare este o formă aberantă a
proteinei τ (tau)
Erori de pliere a moleculelor
 Varianta normală a acestei proteine intervine în asamblarea
structurilor microtubulare, fiind aparent blocată proteina τ
aberantă

 Ghemurile neurofibrilare patologice din interiorul neuronilor


sunt constituite din agregate de proteină "tau", datorită unui
proces de hiperfosforilare
Erori de pliere a moleculelor
Beta-amiloidul
este o peptidă ce rezultă dintr-o proteină precursoare,
Amyloid-Precursor-Protein (APP), inserată pe membrana celulară
Erori de pliere a moleculelor
 Beta-amiloidul, în formă oligomerică insolubilă,
este citotoxic şi alterează homeostazia ionilor de
calciu, inducând astfel procesul de apoptoză
(moarte celulară programată)

 Acest peptid depozitat anormal în structurile


cerebrale este un derivat format prin clivarea
proteolitică a unui precursor amiloidic mai mare ,
o proteină transmembranară unică exprimată la
suprafaţa celulelor cerebrale şi din alte ţesuturi.
Erori de pliere a moleculelor
Bolile prionice
 Denumirea de prioni provine de la „particula
proteică infecţioasă” considerată a fi agentul
infecţios în encefalopatiile transmisibile (TSE), de
exemplu boala Creutzfeldt-Jakob, encefalopatia
„scrapie” la ovine şi encefalopatia spongiformă a
bovinelor

 Toate TSE sunt invarabil letale şi nu există


tratament capabil să modifice evoluţia acestora
 Această proteină are o structură cu numeroase
regiuni de tip α-helix şi este susceptibilă a fi
degradată de proteinaza K
Bolile prionice
 Prionul normal poate fi convertit in vitro fără
modificări de legături covalente, la o formă ce
conţine numeroase porţiuni pliate de tip β şi care
este rezistentă faţă de proteinaza K

 Una dintre încălcările dogmei centrale a geneticii


o reprezintă, fără îndoială, modul de viață al
particulelor infecţioase proteice, numite, generic,
prioni (proteinaceous infectious particles).
Bolile prionice
 Aşa cum virusurile pot pătrunde în organismul
gazdă, unde se multiplică şi determină alterarea
acestuia, tot la fel şi aceste particule infectează
organismele superioare

 Diferenţa majoră însă o constituie faptul că prionii


nu au niciun fel de material genetic convențional
(ADN sau ARN). Se presupune că informaţia lor
genetică este stocată în structura terţiară a
proteinei.
Bolile prionice
 Proteina infecţioasă denumită proteina prionică
(PrP) este rezistentă la degradarea proteolitică, iar
în forma infecţioasă tinde să formeze agregate
fibrilare insolubile, similare acumulării de amiloid
din alte afecţiuni cerebrale

 Forma neinfecţioasă a PrP care are aceeaşi


secvenţă de aminoacizi şi aceleaşi secvenţe genice
ca şi forma infecţioasă este prezentă în mod
normal în ţesutul cerebral al mamiferelor, pe
suprafaţa neuronilor şi a celulelor gliale. PrP
reprezintă o proteină parazit.
Bolile prionice
 Între forma infecţioasă şi neinfecţioasă a PrP nu
au fost identificate diferenţe ale structurii primare
şi nici modificări posttranslaţionale
 PrP devine infecţioasă în urma modificării
conformaţiei sale tridimensionale
 Mai multe α-helixuri din componenţa formei
neinfecţioase a PrP sunt substituite prin foi β în
forma infecţioasă, această particularitate
conformaţională asigurând rezistenţă relativă la
degradarea proteolitică a prionilor infecţioşi
 Agentul infecţios reprezintă o variantă aberantă a
unei proteine normale
Bolile prionice
Multiplicarea prionilor în organismul gazdă.

Proteina prionică acţionează ca o matriţă


după care proteina iniţială este
reîmpachetată, printr-un proces facilitat de
o altă moleculă proteică.
Bolile prionice
 În ceea ce priveşte multiplicarea prionilor în
organismul gazdă, există multiple teorii, dintre
care cea mai acceptată este aceea a transformării
prin contact

 În mod obişnuit, în creierul mamiferelor, există


proteina PrPc. Aceasta este o proteină membranară
implicată în interacţiunea cu ioni metalici (Cu2+),
în susţinerea activităţii sinaptice, în asigurarea
neuroprotecţiei prin interacţiunea cu alte proteine
membranare.
Bolile prionice
 Experimental, s-a constatat că şobolanii care nu
prezintă această proteină în creier nu par să
prezinte modificări patologice, însă nu manifestă şi
nu transmit nicio boală prionică, în ciuda inoculării

 În urma infecţiei cu proteina prionică (PrPsc),


proteina iniţială este alterată şi transformată în
proteină prionică, aceasta având, la rândul său,
capacitatea de a transforma altă proteină.
Nivele superioare de organizare
structurală
 Se întâlnesc la enzime care se asociază alcătuind
ansamble multimoleculare sau multienzimatice

 Complexul multienzimatic al piruvat


dehidrogenazei (PDH), care produce
decarboxilarea oxidativă a acidului piruvic
 Cuprinde 3 enzime:
 Piruvat-dehidrogenaza
 Lipoatacetiltransferaza
 dihidrolipoildehidrogenaza
Rezumat
 1. Pentru a descifra structura proteinelor este
necesară înţelegerea conceptului de conformaţie
nativă care reprezintă structura complet pliată şi
funcţională a unei proteine (enzimă activă sau o
proteină structurală)

 2. Structura tridimensională unică a conformaţiei


native este determinată de structura primară a
proteinei respective.
Structura proteinelor

 3. Interacţiunile dintre catenele laterale ale


aminoacizilor direcţionează plierea lanţului
polipeptidic pentru a genera structurile secundară,
terţiară şi cuaternară care conlucrează la
stabilizarea conformaţiei native a unei proteine

 4. În plus, o clasă specială de proteine denumite


„chaperone”, intervine în plierea corectă a multor
tipuri de proteine.
Structura proteinelor
 4. Denaturarea proteinelor determină deplierea
şi dezorganizarea structurilor proteice, dar nu
produce hidroliza legăturilor peptidice.
Denaturarea poate fi reversibilă sau, mult mai
frecvent, ireversibilă

 5. Disfuncţiile apar atunci o proteină aparent


normală capătă o formă citotoxică, aşa cum se
întâmplă în maladia Alzheimer şi în encefalopatiile
spongiform transmisibile (TSE), inclusiv boala
Creutzfeldt-Jakob
Structura proteinelor
 6. În maladia Alzheimer, proteinele normale, după
o procesare chimică aberantă, dobândesc o
conformaţie unică ce permite constituirea unor
agregate proteice neurotoxice, alcătuite din foi
pliate β

 În TSE, agentul infecţios este reprezentat de


varianta aberantă a unei proteine prionice normale,
care acţionează asemeni unui „tipar” în sensul
convertirii moleculelor de proteină normală în
forma infecţioasă patogenă.
Proteine înrudite ce evidenţiază
relaţia structură-funcţie

HEMOPROTEINE
Proteine înrudite ce evidenţiază relaţia
structură-funcţie
Proteine globulare
Proteine înrudite ce evidenţiază corelaţia
structură-funcţie
 Hemoproteinele globulare constituie o clasă de
proteine specializate care conţin hem- o grupare
prostetică stabilă. Din această categorie fac parte:
 Mioglobina şi hemoglobina, proteine implicate
în transportul şi depozitarea oxigenului;
 Citocromii, proteine transportoare de electroni,
componenţi ai lanţului respirator mitocondrial şi
din reticulul endoplasmic
 Unele oxidaze şi peroxidaze
Proteine globulare
 Rolul grupării hem este condiţionat de mediul pe
care îl generează structura tridimensională a
proteinei
 De exemplu, gruparea hem din structura unui
citocrom funcţionează ca un transportor de
electroni, care poate fi oxidat şi redus
 În schimb, hemul din catalaze este o componentă a
porţiunii active a enzimei şi participă la
descompunerea apei oxigenate
 În structura hemoglobinei şi a mioglobinei, două
din cele mai frecvente hemoproteine întâlnite în
organismul uman, hemul are rolul de a lega
reversibil atomii de oxigen.
Structura şi funcţia Hb, Mb
Structura şi functia Hb
 Hemul reprezintă un complex biochimic constituit din protoporfina IX şi
un ion de fier divalent (Fe 2+)
 Atomul de fier este menţinut în centrul moleculei hem prin intermediul
unor legături cu toţi cei patru atomi de azot ai inelului porfirinic
In ce compusi gasim gruparea Hem?
Structura, functia si metabolismul Hb
 Pe lângă aceste patru legături fierul hemului poate
forma două legături suplimentare de fiecare parte a
inelului porfirinic care este un plan

 În structura mioglobinei şi a hemoglobinei una


dintre aceste legături suplimentare se realizează cu
catena laterală a unui rest de histidină din
componenţa globinei, iar cealaltă legătură se face
cu oxigenul.
Structura, functia si metabolismul Hb
histidina distală (E7)
nu interacţionează direct
cu gruparea hem,
dar contribuie direct
la stabilizarea legăturii
oxigenului cu Fe2+.

histidina proximală (F8)


se leagă direct
de atomul de fier al hemului.
Structura şi functia Hb
Structura şi functia Hb
Structura şi functia Hb
 Protoporfirina IX are
următorii substituienţi:

 1, 3, 5, 8: grupări
metil (M), -CH3
 2, 4: grupări vinil (V),
-CH=CH2
 6, 7: grupări propionil
(P), -CH2-CH2-
COOH (P)
Structura şi functia Hb
 Hemoglobina se găseşte numai în hematii şi are
rolul de a transporta oxigenul la nivel pulmonar în
capilarele tisulare

 Hemoglobina A, tipul dominant al adultului, este


constituită din patru lanţuri polipeptidice, două
lanţuri α şi două β, unite prin legături necovalente

 Fiecare subunitate catenară conţine segmente α-


helicale şi o unitate de legare a hemului similară
celei descrise în cazul mioglobinei.
Structura şi functia Hb
 Cu toate acestea, molecula tetramerică a
hemoglobinei este mult mai complexă decât
mioglobina

 Hemoglobina poate transporta ionii H+ şi


moleculele de CO2 de la ţesuturi la plămâni şi
poate transporta patru molecule de oxigen de la
plămâni la nivel celular

 Capacitatea hemoglobinei de a lega oxigenul este


reglată de interacţiunea cu efectorii alosterici.
Structura şi functia Hb
 Obţinerea oxigenului direct din atmosferă, prin
simplă difuziune este limitată

 Sistemele circulatorii înlătură acest neajuns fiind


necesară prezenţa unor molecule cu rol
trasnportor, de exemplu hemoglobina, deoarece
solubilitatea oxigenului în soluţii apoase (precum
sângele) este destul de redusă.
Structura şi functia Hb
 Structura cuaternară a hemoglobinei
 Tetramerul hemoglobinic poate fi imaginat
ca o asociere a doi dimeri identici (αβ)1 şi
(αβ)2

 Cele două lanţuri polipeptidice din


componenta fiecărui dimer stabilesc
legături puternice în principal prin
interacţiuni hidrofobe

 Resturile de aminoacizi hidrofobi sunt


localizate nu numai în interiorul moleculei
ci şi în regiuni specifice de pe suprafaţa
fiecărei subunităţi.
Structura şi functia Hb
 Interacţiunile intercatenare de tip hidrofob
constituie legături puternice între subunităţile α şi
β ale dimerilor

 Legăturile ionice şi punţile de hidrogen se


stabilesc şi între componentele fiecărui dimer în
parte. Cei doi dimeri se pot mobiliza unul în raport
cu celălalt deoarece sunt uniti în principal prin
legături polare.
Structura şi functia Hb
 Legăturile slabe dintre aceşti dimeri mobili permit
modificările poziţiei relative ale acestora în structura
deoxihemoglobinei comparativ cu oxihemoglobina

 Legarea oxigenului la fierul hemului induce coborârea


Fe2+ în planul grupării hem

 Deoarece atomul de fier este legat şi de histidina


proximală (F8), se înregistrează o mişcare a lanţurilor
globinei care modifică interfaţa dintre dimerii αβ.
Structura şi functia Hb

 Forma T. Deoxihemoglobina este denumită şi forma „T”


sau forma întinsă, „tensionată” a hemoglobinei.

 Cei
doi dimeri interacţionează prin intermediul unei reţele
de legături ionice şi punţi de hidrogen care reduc
mobilitatea lanţurilor polipeptidice.

 Forma T reprezintă varianta de hemoglobină cu afinitate


redusă pentru oxigen.
Structura şi functia Hb

 Forma R. Legarea oxigenului la hemoglobină


determină ruperea anumitor legături ionice şi punţi
de hidrogen dintre dimerii αβ

 Apare o structură denumită forma „R” sau


relaxată a hemoglobinei, în cadrul căreia lanţurile
polipeptidice au o libertate de mobilizare mai
mare. Forma R reprezintă varianta de hemoglobină
cu afinitate crescută pentru oxigen.
Structura şi functia Mb

 Mioglobina se găseşte în muşchiul cardiac şi striat,


având rol de rezervor şi transportor de oxigen,
asigurând rata de difuziune a oxigenului în fibra
musculară

 Este o hemoproteină formată dintr-o globină


specifică şi hem
Structura şi functia Mb
 Globina este un peptid cu un singur lanţ care
conţine 153 aminoacizi şi care este asemănător din
punct de vedere structural cu subunităţile
polipeptidice catenare din molecula hemoglobinei

 Această omologie biochimică permite utilizarea


mioglobinei ca model pentru interpretarea
anumitor proprietăţi complexe ale hemoglobinei
Structura şi funcţia Mb
 Componenta α-helicală

 Mioglobina este o moleculă compactă al cărei lanţ


polipeptidic este pliat în proporţie de 80%, în opt
segmente α-helicale, marcate prin litere, A- H

 Acestea au la capătul terminal fie prolină, al cărei


inel pentaatomic nu poate fi integrat într-o
structură de tip α-helix, fie pliuri β şi spirale
stabilizate prin punţi de hidrogen şi legături ionice.
Structura şi funcţia Mb
 Localizarea aminoacizilor polari şi nepolari
 Interiorul moleculei mioglobinice este alcătuit aproape în
exclusivitate din aminoacizi nepolari

 Aceştia sunt asamblaţi compact şi constituie o structură


stabilizată prin interacţiunile hidrofobe dintre aceste resturi
compactate

 Aminoacizii polari sunt localizaţi aproape exclusiv la


suprafaţa moleculei, unde pot forma punţi de hidrogen atât
între ei cât şi cu moleculele de apă.
Structura şi funcţia Mb
 Legarea hemului
 Hemul mioglobinic este localizat într-o crevasă a
moleculei delimitată de aminoacizi nepolari, cu
excepţia a două resturi de histidină. Unul dintre
acestea este histidina proximală (F8) care se leagă
direct de atomul de fier al hemului

 Celălalt, histidina distală (E7) nu interacţionează


direct cu gruparea hem, dar contribuie direct la
stabilizarea legăturii oxigenului cu Fe2+
Structura şi funcţia Mb
 Legarea hemului

Componenta globinică sau proteică a


mioglobinei creează un mediu favorabil
hemului care permite legarea reversibilă a unei
molecule de oxigen, proces denumit oxigenare

Cedarea simultană de electroni de către Fe2+,


process denumit oxidare are loc foarte rar.
Legarea oxigenului la mioglobină şi
hemoglobină
 Mioglobina poate lega o singură moleculă de oxigen
deoarece conţine o singură grupare hem

 Hemoglobina poate lega patru molecule de oxigen, câte


una la nivelul fiecăruia din cele patru grupări hem

 Gradul de saturaţie (Y) al acestor situsuri de legare a


oxigenului din componenţa moleculelor de mioglobină
sau hemoglobină poate varia între zero (situsuri goale în
toatalitate) şi 100 % (situsuri ocupate în totalitate).
Legarea oxigenului la mioglobină şi
hemoglobină
 Afinitatea pentru oxigen a mioglobinei
comparativ cu hemoglobina este mult
100% mai mare, la toate valorile pO2
 Presiunea parţială a oxigenului
necesară atingerii nivelului mediu de
50% saturaţie la nivelul situsurilor de legare
a oxigenului (P50) este de aproximativ
1 mmHg pentru mioglobină şi de 26
mmHg pentru hemoglobină
 Cu cât afinitatea pentru oxigen este mai
mare (cu cât oxigenul este legat mai
puternic) cu atât scade valoarea P50.
Legarea oxigenului la Mb şi Hb

 Curba de saturare cu
oxigen a mioglobinei are
formă de hiperbolă
Mb

 Acest fapt reflectă faptul


că mioglobina leagă
reversibil o singură
moleculă de oxigen
Mb

Legarea oxigenului la Mb şi Hb
 În consecinţă, între mioglobina oxigenată (MbO2) şi
deoxigenată (Mb) se stabileşte o relaţie de echilibru:
Mb + O2  MbO2
 Acest echilibru este deviat de o parte şi de alta în funcţie de
în funcţie de adaosul sau extracţia de oxigenului din sistem.
 Mioglobina este special concepută să lege oxigenul eliberat
de hemoglobină la valori reduse ale pO2 la nivel muscular.
Pe de altă parte, mioglobina cedează oxigenul celulei
musculare în condiţiile unui necesar crescut de oxigen.
Legarea oxigenului la Mb şi Hb

 Curba de disociere a
oxigenului în cazul
hemoglobinei are formă
Hb sigmoidală, fapt care relevă
cooperarea subunităţilor
structurale în procesul de
legare a oxigenului.
Hb
Legarea oxigenului la Mb şi Hb

 Legarea coactivă a oxigenului de către cele patru subunităţi


ale Hb înseamnă că ataşarea unei molecule de oxigen la
nivelul unei grupări hem induce o creştere a afinităţii pentru
oxigen la nivelul celorlalte grupări hem din componenţa
aceleiaşi molecule de hemoglobină

 Acest efect este denumit interacţiune hem-hem. Legarea


primei molecule de oxigen la Hb este mai dificilă, legarea
următoarelor molecule de oxigen decurgând cu o afinitate
crescută în intervalul de 20-30 mmHg.
Legarea oxigenului la Mb şi Hb
 Efecte alosterice. Reglarea transportului de O2

 Capacitatea hemoglobinei de a lega reversibil


oxigenul este influenţată de următorii efectori
alosterici (cu tropism diferit):

 pO2
 pH-ul mediului
 pCO2
 2,3-DPG (bifosfoglicerat) disponibil
Legarea oxigenului la Mb şi Hb

 Interacţiunea acestora cu un situs al moleculei de


hemoglobină afectează procesul de legare a
oxigenului la grupările hem cu localizare moleculară
diferită

 Capacitatea de legare a oxigenului de mioglobină nu


este influenţată de efectori alosterici.
Legarea oxigenului la Mb şi Hb
 1. Interacţiunile hem-hem (Cooperativitatea)
 Aspectul sigmoidal al curbei de legare a O2
reflectă modificările structurale specifice iniţiate
la nivelul unei grupări hem şi transmise succesiv
şi celorlate grupări hem din componenţa
tetramerului de hemoglobină

 Efectul net constă în faptul că afinitatea Hb


pentru ultima moleculă de oxigen legată este de
aproximativ 300 ori mai mare decât afinitatea
pentru prima moleculă de oxigen legată
Legarea oxigenului la Mb şi Hb
 Procesul de legare coactivă a O2 îi permite Hb să
livreze ţesuturilor o cantitate mai mare de oxigen
ca răspuns la modificări relativ reduse ale presiunii
parţiale a oxigenului

 La nivel pulmonar, concentraţia oxigenului este


crescută şi hemoglobin aeste saturată cu oxigen. În
ţesuturile periferice, oxihemoglobina cedează cea
mai mare parte a oxigenului, urmând ca acesta să
fie utilizat în cadrul metabolismului oxidativ al
ţesuturilor.
Legarea oxigenului la Mb şi Hb

Interpretarea aspectului
Mb Hb sigmoidal
al curbei de disociere
a oxigenului

 Panta abruptă a curbei de disociere a oxigenului reflectă direct gradientul


O2 între plămâni şi ţesuturi care facilitează transportul şi livrarea eficientă a
O2 din medii cu pO2 crescut în medii cu pO2 scăzut
 O moleculă care prezintă o curbă de disociere a O2 cu aspect de hiperbolă,
cum este Mb nu are aceeaşi capacitate de cedare a oxigenului în intervalul
valoric al pO2 menţionat. În acest interval presional, afinitatea Mb pentru
O2 ar fi maximală şi capacitatea de cedare a O2 către ţesuturi ar fi egală cu
zero
Legarea oxigenului la Mb şi Hb
 2. Efectul Bohr  Efectul Haldane
 Afinitatea Hb pentru O2  Afinitatea Hb pentru O2
scade în mediul acid scade atunci când CO2
(ţesuturile periferice) creşte în ţesuturile
periferice

ţesuturi
plămâni

ţesuturi
plămâni
Efect Bohr
Legarea oxigenului
la Mb şi Hb
 2. Efectul Bohr
 Disocierea oxigenului de pe molecula de Hb este
accelerată de scăderea pH-ului sau de creşterea PpCO2
 În ambele situaţii are loc scăderea afinităţii Hb pentru
oxigen cu devierea la dreapta a curbei de disociere a
oxigenului, ambele efecte stabilizând forma T a
hemoglobinei
 Această modificare a capacităţii de legare a oxigenului
este denumită efect Bohr. Creşterea pH-ului sau scăderea
concentraţiei CO2 determină creşterea afinităţii Hb
pentru O2 cu devierea la stânga a curbei de disociere a
oxiHb.
Legarea oxigenului
la Mb şi Hb
 3. Acţiunea 2,3 DPG. Este un metabolit al glicolizei
format în hematii, iar legarea de Hb determină, indirect
eliberarea O2 la ţesuturi.


Legarea oxigenului
la Mb şi Hb
 3. Acţiunea 2,3 DPG. Se află în cantităţi
semnificative în hematii (fosfatul anorganic),
cantitatea de Hb şi 2,3DPG fiind echivalentă.
Concentraţia este de aproximativ 4,5mM.

 Reduce afinitatea pt O2 a Hb legându-se la deoxiHb


nu şi la oxiHb şi stabilizând forma T a Hb.

 HbO2 + 2,3 BPG Hb-2,3BPG + O2

oxiHb deoxiHb
3. Acţiunea 2,3 DPG
 Situsul de legare a 2,3 DPG
 O singură moleculă de 2,3 DPG se ataşează la
nivelul unei nişe, constituită din două lanţuri beta
globinice, chiar în tetramerul deoxiHb

 Această nişă conţine un nr de AA cu sarcină


electrică pozitivă care formează legături ionice cu
grupările fosfat electronegative din componenţa
2,3 DPG

 2,3 DPG este îndepărtat în cursul procesului de


oxigenare a Hb.
3. Acţiunea 2,3 DPG
 După decuplarea 2,3 DPG, Hb are o afinitate
crescută pt O2

 Prezenţa în hematie reduce semnificativ afinitatea


Hb pentru O2 şi determină devierea la dreapta a
curbei de disociere a O2

 Afinitatearedusă permite disocierea eficientă a O2


de Hb la presiunea scăzută a O2 din ţesuturi
2,3 DPG

 În hipoxia cronică (BPOC sau altitudine), anemii


cronice:
 [2,3 DPG] în hematii creşte Hb nu primeşte o
cantitate suficientă de O2
 Nr redus de hematii nu asigură necesarul de O2

 Creşterea [2,3 DPG] induce scăderea afinităţii pt


O2 a Hb şi permite cedarea unei cantităţi mai mari
de oxigen în capilarele tisulare
2,3 DPG
 În cazul sângelui transfuzat, conservarea sg pe
suport de citrat determină scăderea 2,3 DPG în
hematii

 Sg prezintă o afinitate anormal de mare pt O2 si nu


cedează eficient oxigenul către ţesuturi.
 Hb = “capcana” pt O2
 Hematiile transfuzate îşi refac rezervele de 2,3
DPG în 24-48 ore
 HbF leagă slab 2,3BPG; afinitate crescută pt O2 a
HbF ce favorizează transferul O2 spre eritrocitele
fătului
2,3 DPG

 Statusul pacienţilor cu afecţiuni severe poate fi


grav compromis în urma administrării unei
cantităţi crescute de sânge spoliat de 2,3 DPG

 Scăderea concentraţiei de 2,3 DPG poate fi


împiedicată prin adaosul unor substraturi speciale,
inozina, în soluţia conservantă
 Inozina (hipoxantin-riboza) este o moleculă
neionizată ce penetrează hematia eliberând miezul
de riboză ce va fi fosforilat intrând în ciclul
hexozomonofosfatului fiind convertit la 2,3 DPG.
Legarea oxigenului Mb şi Hb
Izoformele hemoglobinei
 La acelaşi individ sunt sintetizate în stadiile fetale şi
embrionare diferite izoforme sau izoenzime ale unei
proteine care pot fi prezente în diferite ţesuturi sau în
localizări intracelulare specifice. Toate izoenzimele au
aceeaşi funcţie

 Izoenzimele sunt enzime cu structură primară diferită


care catalizează aceeaşi reacţie şi care sunt codificate
de gene diferite. O parte dintre ele rezultă din splicing-
ul alternativ al pre-mARN formând diferite mARN-
uri. mARN este matriţa finală a acidului nucleic
utilizată în sinteza proteică.
Izoformele Hb
 Izoformele hemoglobinei reprezintă un exemplu de
modificare apărută în perioada embrionară şi fetală

 Hemoglobina fetală HbF este exprimată în ultimul


trimestru de sarcină până la naştere când este
înlocuită de HbA

 HbF este formată din două lanţuri polipeptidice α şi


două γ în comparaţie cu HbA ce conţine două lanţuri
α şi două β.
Izoformele Hb
 În stadiile de dezvoltare embrionară sunt produse
lanţuri polipeptidice α ε şi ζ cu o compoziţie diferită
în aminoacizi

 Diferenţele apar din cauza mutaţiei unei gene α


duplicate, rezultând lanţul ζ

 Atât Hb fetală cât şi cea embrionară prezintă afinitate


mai mare pentru O2 faţă de HbA, acest fapt fiind un
avantaj în condiţiile unei presiuni mici a O2 la care
este supus fătul. În diferite stadii de dezvoltare sunt
exprimate şi traduse genele globinei specifice etapei
Izoformele Hb
 Pentru HbF, valoarea presiunii
parţiale a oxigenului la care
proteina este saturată în proporţie
de 50%, P50 este de 19mmHg, în
timp ce în cazul HbA este de
aproximativ 26,8mmHg

 Ca urmare, curba de saturaţie în


oxigen este orientată spre stânga în
cazul HbF în comparaţie cu cea
pentru HbA.
Diferenta dintre Mb, HbA si HbF
Izoformele Hb
 Tratamentul siclemiei
 După oprirea producţiei de HbF după naştere
copiii încep să producă HbA

 Lacei cu siclemie, începe producerea de HbS care


modifică forma hematiilor care vor bloca vasele de
sânge, cauzând episoade ocluzive dureroase
specifice bolii.
Izoformele Hb
 Tratamentul siclemiei
 Dacă HbF rămâne forma predominantă de Hb după naştere,
numărul episoadelor ocluzive se reduce la aceşti pacienţi

 Hidroxiurea stimulează producerea HbF şi poate fi utilizată în


tratamentul siclemiei

 Reducerea severităţii bolii cu ajutorul HbF se explică prin


capacitatea acesteia de a inhiba formarea agregatelor de Hb în
celulele roşii care conţin şi HbS

 Tratamentul combinat hidroxiuree-eritropoietină recombinantă este


mult mai eficient decât hidroxiureea, crescând nivelul de HbF şi
favorizând dezvoltarea celulelor F conţinând HbF.
Liganzi ai Hb
Liganzi ai Hb
1) CO (carboxi-Hb)
• Afinitatea sa pentru hem este de 200 ori mai mare faţă
de cea a oxigenului
• Deplasabil cu un amestec de 95%O2/ 5%CO2

2) CO2 (carbamino-Hb)
• Hb fixează CO2 pe un aminoacid al extremităţii C-
terminale al unui lanţ , favorizând forma T
3) NO
• Moleculă vasodilatatoare cu o afinitate pentru Hb de
8000 ori mai mare faţă de cea a oxigenului.
Sistemul tampon al Hb

Hematie
Sistemul tampon al Hb
 Hb este bogată în His (33/ moleculă)
• AA are un pKa de 7,3, foarte apropiat de pH plasmatic
• La pH fiziologic există 50% din fiecare formă a His
• Abundenţa de Hb din sânge şi nr mare de molecule de
His = sistem tampon foarte eficace

Globina Globina
Hemoglobinopatii
 Afecţiuni genetice cauzate de:
 1. sinteza unor Hb anormale
 2. sinteza de cantităţi insuficiente de Hb
 3. ambele

 Anemia falciformă (HbS), hemoglobinopatia C


(HbC) şi sindroamele talasemice sunt afecţiuni
care pot avea evoluţie clinică gravă
Hemoglobinopatii
 Hemoglobinopatii:
 prin deficit calitativ- hemoglobine patologice (S, C)
 prin deficit cantitativ- talasemiile

1. HbS: înlocuirea Glu cu Val, crize vasoocluzive


2. HbC:Glu cu Lys, anemie hemolitica cronica; nu
necesită tt specific
3. Methemoglobinemiile: Hb nu leagă O2 (Fe3+);
hipoxie tisulară (cefalee, anxietate, dispnee); tt cu
albastru de metilen care este oxidat in paralel cu
reducerea ionului de Fe 3+
Hemoglobinopatii
 Talasemiile- afecţiuni hemolitice ereditare cauzate de un
dezechilibru în sinteza lanţurilor de globină

 Beta-talasemiile (minora sau majora): deficit de sinteza a


lanţului beta
 Lanţurile alfa nu pot forma stabili tetrameri şi precipită
determinând moartea prematură a precursorilor eritrocitari.
Tt: transfuzii, transplant medular
 Alfa-talasemiile- tetrameri beta ce nu stabilesc interactiuni
hem-hem; curba cu aspect hiperbolic
 Anemie hemolitica de gravitate variabila
IMUNOGLOBULINELE
 Sunt proteine plasmatice din clasa gamma-
globulinelor cu rol de anticorpi
 Sintetizate de limfocitele B activateca raspuns
la prezenta unor Ag straine organismului sau
care au suferit modificari
 Ac+Ag= complex imun Ag-Ac

 Grp chimice ce decl. sinteza unui Ac=


determinanti antigenici
 4 lanturi peptidice:
 - 2 l grele H (heavy) identice: δ,α, μ, δ, ε
 -5 clase: IgG, A, M, D, E
 - 2 l usoare L (light) identice: κ, λ
IMUNOGLOBULINELE
 Lanturile sunt legate prin punti disulfurice
 Ig sunt glicoproteine (2-12% continut glucidic)
 Tetrameri H2L2 cu doua regiuni:

 Variabile (V): capetele N-terminale ale l grele si


usoare cu secventa de AA variabila; regiuni
hipervariabile
 Constante (C) :secventa de AA este aproape ct pt
fiecare clasa de Ig
IMUNOGLOBULINELE
 Între Ag si
Ac au loc
interactiuni:
 Hidrofobe
 Necovalente
 Legaturi de
hidrogen
 cu grad inalt
de
specificitate
IMUNOGLOBULINELE
5 clase Ig:
 -IgA: plasma, secretii intestinale, lacrimi; prima linie
de aparare; nu activeaza C
 -IgE: pe Le bazofile plasmatice si pe mastocitele din
peretii vaselor; reactii alergice (secretia de histamina)
 -IgD: in plasma integrate in mb limfocitelor B
 -IgG: constituie fractiunea majora a Ig plasmatice;
activeaza celulele fagocitare cat si C; in aparare
infectioasa; RI secundar
 -IgM: RI primar; Ac infectiosi
Proteine fibrilare
COLAGENUL
COLAGENUL
COLAGENUL- distribuţia în ţesuturi
COLAGENUL- structura
COLAGENUL- structura
COLAGENUL- structura
COLAGENUL-biosinteza
 Formarea superhelixului de colagen. Etape:

 1. Sinteza lanturilor alfa; Hyp si Hyl nu corespund


codonilor din mARN transcrisi din AND
 2. In prezenta enzimelor lizil-hidroxilaza si prolil-
hidroxilaza, O2, Fe, acid ascorbic (activator) si alfa-
cetoglutaric are loc hidroxilarea; se formeaza helixul
poliprolinei
 3. asocierea celor 3 lanturi pp-triplu helix= procolagen
intact; glicozilarea in pozitia 5 a Hyl in prezenta
transferazelor
COLAGENUL- formarea hidroxiprolinei
COLAGENUL-biosinteza
 Procolagenul intact contine la capetele N-si C-
terminale extensii polipeptidice numite si
telopeptide;

 lacapatul C-terminal extensiile sunt unite prin punti


disulfurice, care au rolul de a alinia lanturile alfa in
vederea formarii superhelixului.
COLAGENUL- condensarea Allys
COLAGENUL-biosinteza
 4. procolagenul format la nivelul RE ajunge in
aparatul Golgi pe calea veziculelor de secretie la MC,
iar prin exocitoza in spatiul extracelular
 5. extracelular intervin procolagen-peptidazele N-si
C-terminale care indeparteaza extensiile de la ambele
capete rezultand tropocolagen (T), forma solubila a
colagenului.
 6.T se asambleaza si formeaza fibrilele de colagen;
moleculele se aliniaza cap la coada si lateral; se
suprapun ¾ din lungime, fiind decalate cu ¼ din L
Formarea microfibrilei de colagen
Formarea microfibrilei de colagen
 Aceste spatii sunt diferite la tesuturile dure (au exact
volumul necesar pt a patrunde ionii de calciu si fosfat
necesari mineralizarii) si cele moi (depunerea de ioni
de calciu si fosfat nu e posibila, mineralizarea
neavand loc).

 Schematic, biosinteza colagenului poate fi redata


astfel:
Sinteza colagenului

Prolil şi lizil
hidroxilaze

Transferaze

Procolagen
intact

Tropocolagen Procolagen peptidaza

Lizil oxidaza
Tipuri de colagen

V. (alfa1V), alfa2- continut crescut de Hyl, in cantitati mici in tesuturi


COLAGENOZE
Alte boli ale colagenului
Alte boli ale colagenului
Keratina
Keratina-structura
Keratina-structura
Keratina-formarea micro-şi
macrofibrilelor
Keratina
Elastina- structura şi rol
Elastina- structura şi rol
 Reticularea se realizeaza pe 2 cai:

 Prin oxidarea unor resturi de lizina si allizina sub


actiunea unor oxidaze cu formarea de aldimine
prin condensare cu gruparea ε a lizinei

 Condensarea a 3 resturi de allizina cu o grupare ε a


lizinei nemodificate. Se formeaza desmozina, un
nod molecular ce mentine in echilibru patru lanturi
de elastina.
Rolul α1- antitripsinei în
degradarea elastinei

α1- antitripsina
Proteaze
Intrebari
 Femeie 30 ani, cu dispnee progresiva. Neaga
consumul de tigarete. Antecedentele familiale
releva o boala pulmonara necunoscuta la una din
surorile pacientei.

 A. Deficit de prolil-hidroxilaza
 B. deficit de alfa1-antitripsina
 C. carenta alimentara de vitamina C
 D. scaderea activitatii elastazei
 E. cresterea activitatii colagenazei
Intrebari
 Deficitul de alfa1-antitripsina= afectiune genetica ce det.
emfizem pulmonar in absenta fumatului. Activitatea
elastazei creste; elstina din peretii alveolari se ditruge

 Deficitul de alfa1-antitripsina tb suspectat la pacientii cu


BPOC < 45 ani, fara antecedente de bronsita cronica sau
consum de tutun sau cand exista mai multi membri ai
aceleiasi familii cu patologie pulmonara obstructiva cu
debut la varsta tanara.
Intrebari
2. Care dintre urmatoarele afirmatii caracterizeaza regiunile alfa-
helix proteice?

A. Toate au aceeasi structura primara


B. Sunt formate in principal prin legaturile de hidrogen dintre
atomul de oxigen al gruparii carbonil al unei grupari peptidice si
hidrogenul amidic al unei alte legaturi peptidice
C. formate prin legaturile de hidrogen dintre atomul carbonil al
unei legaturi si atomii de hidrogen ai radicalilor unui alt AA
D. formate prin legaturile de hidrogen dintre 2 AA adjacenti ai
structurii primare
E. au un continut ridicat in prolina si glicina
Intrebari
 Care dintre urmatoarele afirmatii referitoare la proteinele
globulare sunt adevarate?

 A.Aa hidrofili tind sa fie in interior


 B. AA hidrofobi sunt la exterior
 C. structura tertiara e formata prin interactiuni hidrofobe si
electrostatice intre AA precum si din legaturi de H intre AA
si intre AA si apa
 D. structura secundara rezulta in principal prin interactiunile
hidrofobice dintre aa
 E. puntile disulfidice covalente
Intrebari
 O proteina prezinta un domeniu transmembranar compus in
intregime dintr-o structura secundara tip alfa-helix. Care
dintre urmatorii AA pot fi gasiti in acest domeniu?

 A. prolina
 B. Glutamat
 C. Lizina
 D. Leucina
 E. Arginina
Intrebari
 La autopsia unui pacient cu boala Alzheimer s-au evidentiat
agregate proteice si placi in diferite regiuni ale creierului. Aceste
placi necesita coloratia specifica amiloidului. Care dintre
urmatoarele structuri sunt mai carateristice acestora?

 A. un continut ridicat in foia beta pliata


 B. un continut ridicat in alfa-helix
 C. un continut ridicat de bucle intamplatoare
 D. punti disulfidice intre lanturile polipeptidice
 E. conformatia nativa cu energie minima

S-ar putea să vă placă și