Genetica molecular

Structura i funciile acizilor nucleici

Virusul mozaicului tutunului (VMT)
Genom viral (ARN)
Capsida proteic
Structura chimic a
acizilor nucleici



Acizii nucleici sunt substane
macromoleculare alctuite din uniti
structurale care se repet nucleotide

Nucleotida
baz azotat
zahr
radical fosforic
baze purinice
baze pirimidinice
riboza n ARN
dezoxiriboza n ADN
(pentoz)
N
N
N
N
H
N
N
N
N
NH
2
H
N
N
N
N
OH
H
2
N
H
Baze purinice derivai de la purin
Purina
Adenina (A)
(6 aminopurina)
Guanina (G)
(hidroxiaminopurina)

N
N
N
N
OH
CH
3
HO
N
N HO
NH
2
N
N HO
OH
Baze pirimidinice derivai de la pirimidin
Pirimidina
Uracil (U)
Citozin (C) Timin (T)
C
C C
C
O
OH
OH OH
CH
2
HO
H
H
H
H
C
C C
C
O
OH
OH H
CH
2
HO
H
H
H
H
Riboza Dezoxiriboza
Zaharul
N
N
N
N
NH
2
H
N
N
N
N
NH
H
H
Tautomeria este capacitatea unor substane de
a se afla n forme diferite (izomeri de poziie)
datorit legturilor chimice conjugate pe care le
conin.
N
N
N
N
H
2
N
OH
H
N
N
N
N
O
HN
H
H
H
Nucleotida
PO
4
Zahr
Baza azotat
H
2
O 2
C
C C
C
O
H
H
H
OH
CH
2
H
O
P O
OH
OH
H
N
N
N
N
NH
2
C
C C
C
O
H
H
H
OH
CH
2
H
H
OH
HO
N
N
N
N
NH
2
H
OH
P O
OH
OH
C
C C
C
O
H
OH
H
OH
CH
2
H
H
OH
HO
OH
P O
OH
OH
N
N
O
NH
H
H
H
2
O
2
C
C C
C
O
H
OH
H
OH
CH
2
H
H
OH
OH
O P
O
N
N
O
NH
H
Nucleotidele se leag ntre ele prin intermediul
radicalului fosforic formnd catene
C
C C
C
O
H
H
H
O
CH
2
H
H
OH
O
O P
O
N
N
O
NH
H
OH O P
O
Nucleotidele se leag ntre ele prin intermediul
radicalului fosforic formnd catene
C
C C
C
O
H
H
H
O
CH
2
H
H
OH
O
O P
O
N
N
O
NH
H
O
P O OH
H
H
CH
2
O
H
H
H
O
C
C C
C
N
N
N
N
NH
H
Structura primar a acizilor nucleici
Este o structur monocatenar rezultat n
urma polimerizrii nucleotidelor;
Caracteristica unei structuri primare este
dat de ordinea nucleotidelor
5'
3'
Structura secundar a ADN
A fost stabilit n 1953 de J.D. Watson,
F.H.C. Crick i M.H.F. Wilkins (premiul
Nobel pentru medicin i fiziologie n
1962)
molecula de ADN este format din dou
catene, complementare, antiparalele, care
formeaz un dublu helix (spiral dubl)
N
N
N
N
N H
H
H
CH
3
O
O
N
N
A T
N
N
N
N
H
N H
H
H
H
N
N
N
O
O
G C
Tipuri de ADN
Tipul A este ntlnit n cazul unor concentraii
saline mari i n cazul unor deshidratri pariale;
este prezent la hibrizii ADN-ARN precum i n
poriunile bicatenare ale ARN.
Tipul B reprezint structura general a
macromoleculei de ADN n regiunile active
metabolic (tipul clasic).
Tipul Z este singurul tip cu rsucire spre stnga,
ntlnit in vitro.
Denaturarea ADN
Prin nclzire sau prin meninerea la o concentraie
ridicat de sruri, legturile de hidrogen dintre cele
dou catene se desfac. Procesul se numete
denaturare, rezultnd ADN denaturat (monocatenar).
Dac soluia este rcit brusc, cele dou catene nu
se mai reunesc (nu se mai refac punile de hidrogen).
Dac soluia se rcete lent, punile de hidrogen se
refac i catenele se reasociaz, rezultnd ADN
renaturat.
Se pot obine hibrizi ADN-ARN sau ADN-ADN cu
catene provenind de la specii diferite.
Tipuri de ARN
ARN viral (ARN-v) este material genetic
(genom viral) la ribovirusuri: VMT, virusul
gripal etc.
ARN nuclear mic(ARN-nm sau ARN-sn)
formeaz ribonucleoproteine, avnd rol n
iniierea sintezei proteice i n maturarea
ARN-m
ARN mesager (ARN-m) copiaz informaia
genetic a unei catene de ADN i o transfer n
citoplasm, unde se desfoar sinteza
proteinelor. Este sintetizat n procesul de
transcripie, cu ajutorul enzimei ARN
polimeraza, proces care reprezint prima etap
a sintezei proteice.
ARN de transport sau ARN solubil (ARN-t,
ARN-s) are rolul de a transporta aminoacizii la
locul sintezei proteice (pe ribozomi), n procesul
de translaie a informaiei genetice, cea de-a
doua etap a sintezei proteice.
puni de hidrogen
locul de ataare al aminoacidului
bucla D
bucla TC
A U A
anticodon
ARN-m
U A U
codon
ARN ribozomal (ARN-r) intr n alctuirea
ribozomilor, unde este asociat cu
proteinele.
Ribozomii sunt particule
ribonucleoproteice de form relativ sferic,
prezente la procariote i eucariote. Se
gsesc i n mitocondrii i cloroplaste,
organite celulare de origine
endosimbiont. Unitatea ribozomal
prezint trei locusuri (regiuni): A,P i Ex.
Locusul A (aminoacil) este locul unde se
ataeaz iniial molecula de aminoacid.
Locusul P (polipetid) este locul unde are
loc formarea unei legturi dipeptidice ntre
doi aminoacizi alturai.
Locusul Ex (exit) este locul unde catena
polipeptidic sintetizat se desprinde de
ribozom.
Funcia autocatalitic a ADN
Const n procesul de replicare a materialului genetic
(biosinteza);
Are loc n faza S a ciclului celular;
n prima faz are loc sinteza nucleotidelor, urmat de
polimerizarea acestora;
Replicarea ADN se realizeaz dup modelul
semiconservativ;
Conform acestui model, iniial are loc ruperea punilor
de hidrogen, rezultnd ADN monocatenar;
Ulterior fiecare caten veche servete drept model
pentru sinteza unei catene noi;
Vor rezulta dou molecule de ADN, fiecare avnd o
caten veche i o caten nou sintetizat;
Funcia heterocatalitic a ADN
ADN ARN Proteine

Funcia heterocatalitic a materialului
genetic arat circuitul informaiei
genetice n celul.

ADN
ARN-m
Proteine
Informaia genetic
Informaia genetic
Prima etap transcripia are loc n nucleu.
Informaia genetic din ADN este transcris
ntr-o secven complementar de ARN-m.
A doua etap translaia are loc n
citoplasm. Informaia genetic din ARN este
utilizat pentru sinteza unei catene proteice.
Excepie retrovirusurile care au material
genetic ARN pe care l convertesc n ADN cu
ajutorul enzimei revers-transcriptaza, care
transcrie informaia genetic invers, de la
ARN-v la ADN. Ex. HIV
Gena
ADN
ADN Transcripia
ARN-m
ARN-m precursor
Maturare
ARN-m matur
ARN-m
ribizom
proteine
ADN din nucleu
conine gene ce
codific proteine
specifice
Prin transcripie
informaia genetic
din aceste gene este
copiat n ARN-m
Se sintetizeaz o
molecul de
ARN-m precursor
ARN-m precursor
sufer un proces
de maturare i ARN-m
matur este transferat
n citoplasm
La nivelul ribozomilor are
loc decodificarea
informaiei genetice din
ARN-m i se sintetizeaz
o caten proteic
Translaia
Codul genetic - legtura care se stabilete
ntre acizii nucleici i proteine.

Este alctuit din uniti de codificare numite
codoni.
Codonul este o secven de 3 nucleotide din
molecula de ARN-m care determin
introducerea unui aminoacid n catena
proteic.
Codul genetic este alctuit din 64 codoni,
reprezentnd combinaii de cte 3 ale celor 4
tipuri de nucleotide.
P
r
i
m
a

n
u
c
l
e
o
t
i
d

A doua nucleotid
A

t
r
e
i
a

n
u
c
l
e
o
t
i
d

Caracteristicile codului genetic
Colinearitatea reprezint corespondena
dintre secvena nucleotidelor din molecula de
ADN sau ARN-m i secvena aminoacizilor din
catena proteic.
Codul genetic este nesuprapus ntre doi
codoni vecini nu sunt nucleotide comune.
Codul genetic este fr virgule ntre doi
codoni vecini nu sunt nucleotide libere.
Codul genetic este degenerat adic un
aminoacid poate fi codificat de doi sau mai
muli codoni.

Codul genetic este universal i are origine
foarte veche aceiai codoni determin
introducerea aceluiai aminoacid la
organisme diferite, cu vechime filogenetic
diferit.
Codul genetic a evoluat n timp, dovad fiind
unele excepii de la codul genetic ntlnite la
organisme foarte vechi sau la codul genetic
de la mitocondrii. Aceste excepii se refer la
codonii stop, care iniial au avut rol n
determinismul unor aminoacizi.
Biosinteza proteinelor
Transcripia informaiei genetice const n
transferul informaiei genetice din secvena
de nucleotide a unei catene de ADN (3'-5')
ntr-o molecul de ARN-m. Se realizeaz cu
ajutorul enzimei ARN-polimeraza.
Unitatea de transcripie este o poriune din
molecula de acid nucleic care conine
informaia genetic pentru sinteza unei
molecule de ARN-m, fiind diferit la eucariote
i procariote
La procariote o unitate de transcripie
conine mai multe gene, (operon), fiind
implicat n sinteza mai multor catene
polipeptidice.

La eucariote o unitate de transcripie conine
informaia genetic a unei singure gene, fiind
implicat n sinteza unei singure catene
polipeptidice. Gena la eucariote conine
secvene informaionale numite exoni i
secvene noninformaionale numite introni.
n urma procesului de transcripie la
eucariote se formeaz ARN-m precursor,
care conine att introni ct i exoni.

Procesul de maturare a ARN-m se realizeaz
n nucleu i const n eliminarea intronilor i
asamblarea exonilor cu ajutorul unor enzime
(endonucleaze i ligaze)


Translaia informaiei genetice const n
transferul informaiei genetice din secvena
de nucleotide a ARN-m n secvena de
aminoacizi din catena polipeptidic.

Mesajul genetic este tradus dintr-o
secven de nucleotide ntr-o secven de
aminoacizi.
Translaia se desfoar n citoplasm, la
nivelul ribozomilor;

Gena
ADN
ADN Transcripia
ARN-m
ARN-m precursor
Maturare
ARN-m matur
ARN-m
ribozom
proteine
ADN din nucleu
conine gene ce
codific proteine
specifice
Prin transcripie
informaia genetic
din aceste gene este
copiat n ARN-m
Se sintetizeaz o
molecul de
ARN-m precursor
ARN-m precursor
sufer un proces
de maturare i ARN-m
matur este transferat
n citoplasm
La nivelul ribozomilor are
loc decodificarea
informaiei genetice din
ARN-m i se sintetizeaz
o caten proteic
Translaia
Subunitate mic
Subunitate mare
Subunitate mare
Subunitate mic ARN-m
A P
Locusul de
ataare al ARN-m
Locusul P leag ARN-t
care transport catena
polipeptidic
Locusul A leag ARN-t
care transport urmtorul
aminoacid
Iniierea
codon
anticodon
ARN-m
Ribozomul
recunoate
secvena
Locusul P Locusul A
start
Subunitatea mic a ribozomului recunoate
codonul start (AUG) din secvena de
ARN-m iar ARN-t care transport
aminoacidul metionin se altur cu
anticodonul, completnd complexul de
iniiere.
5' 3' 5' 3'
Subunitatea mare a
ribozomului se altur
complexului de iniiere, ARN-t
care transport aminoacidul
metionin ocupnd locusul P.
Elongarea
Recunoaterea codonului Recunoaterea codonului Elongare Elongare
Locusul P Locusul A
ARN-t
Anticodon
Se formeaz
legatura peptidic:
Pro se leag de Met
Se formeaz o
nou legtur
peptidic: Tyr se
leag de Pro i
alungete catena
peptidic.
ntrerupere
Factorul de
eliberare se altur
complexului cnd
codonul stop
ajunge n locusul A
Factorul de eliberare
desprinde catena
polipeptidic de ARN-t
din locusul Exit
polipeptid
Componentele
rmase se separ
ARN-t
subunitatea mic
5' 3' 5' 3'
subunitatea mic
subunitatea mare
ARN-m
ARN-t
http://www.youtube.com/watch?v=D5vH4Q_tAkY&feature=related
Modificri post-translaionale
n urma sintezei proteice rezult o caten
polipeptidic, n care aminoacizii se afl ntr-o
succesiune caracteristic ce formeaz structura
primar, de obicei inactiv.
Catenele polipeptidice se pot rsuci sau plia
formnd structura secundar;
Forma tridimensional a polipeptidelor rsucite
sau pliate constituie structura teriar;
Relaiile structurale dintre catenele polipeptidice
componente ale unei proteine formeaz
structura cuaternar;

Pentru a deveni activ catena polipeptidic
poate fi modificat astfel:

Fosforilarea enzimatic implic adugarea
uneia sau mai multor grupri fosfat;

Glicozilarea enzimatic adugarea uneia
sau mai multor grupri carbohidrat;

Digestia parial sub aciunea unor
peptidaze
Ex. n celulele ale pancreasului endocrin, n
urma sintezei proteice rezult pre-proinsulina.
Conversia acesteia n insulin activ se
realizeaz n dou etape:
n prima etap are loc eliminarea secvenei
semnal, situat la captul catenei B, rezultnd
proinsulina alctuit din trei catene polipeptidice
(A,B i C);
n a doua etap are loc eliminarea peptidei C i
formarea a dou legturi disulfurice
intercatenare, rezultnd insulina activ, alctuit
din 51 aminoacizi.

secvena semnal
secvena semnal
preprosinsulina
proinsulina
insulina
peptida
ADN
ARNm precursor
ARNm matur
nucleu
citoplasma
ribozom
controlul
transcripiei
controlul
maturrii
ARNm
controlul
transportului
ARNm
controlul
stabilitii
ARNm
ARNm inactiv
controlul
translaiei
controlul
modificrilor post-
translaionale
proteina activ
ARNm matur