Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
peptidice diferite
– Conformaţia cea mai stabilă pe care o adoptă o proteină
în soluţie este cea la care se stabilesc cel mai mare
număr de legături de hidrogen
– Legăturile de hidrogen se pot realiza fie în cadrul aceleiaşi
catene polipeptidice (legături intracatenare), fie între
două sau mai multe catene (legături intercatenare)
Structura secundară
• Pauling şi Corey (1951) au postulat că există
două structuri posibile pentru lanţurile
polipeptidice:
– Structura α - helix
– Structura β - foaie pliată (plisată)
Structura α-helix
• Un lanț polipeptidic se răsucește la nivelul legăturilor
simple în jurul unui ax imaginar, pentru ca grupările
și –NH– să devină adiacente stereochimic și să
formeze legături de hidrogen
• Un aminoacid formează deci 2 legături de hidrogen;
gruparea –NH– de la aminoacidul 1 formează o
legătură de hidrogen cu gruparea de la cel de-
al cincilea aminoacid, ș.a.m.d, astfel
încât toate grupările formează legături de hidrogen
• Legăturile de hidrogen sunt paralele cu axul moleculei
Structura α-helix
• Lanțul polipeptidic are aspectul unei elice, cu o
geometrie bine definită:
– Sensul răsucirii este de la stânga la dreapta (elice dreaptă)
– Pasul elicei (distanța între 2 puncte echivalente pe
verticală) este de 5,4 Å și cuprinde 3,6 aminoacizi
– Diametrul elicei este de 10,1 Å
– Radicalii aminoacizilor sunt orientați spre exteriorul
helixului
– Miezul helixului este strâns împachetat, atomii fiind legați
prin legături van der Waals
Structura α - helix
Structura α - helix
• Unii aminoacizi întrerup α-helixul, împiedicând răsucirea
catenei: prolina și hidroxiprolina datorită rigidității
ciclului; în plus, lipsa hidrogenului la gruparea aminică,
nu le permite formarea legăturilor de hidrogen
• Resturile glicil, lipsite de catenă laterală, conferă
flexibilitate lanțurilor polipeptidice, acesta schimbându-
și ușor direcția (întrerup structura secundară)
• Radicalii voluminoși (Ile, Val, Leu) sau încărcați electric
(Asp, Glu, Arg, Lys), destabilizează elicea, aceasta
pierzându-și forma ordonată
Structura α - helix
• Structura se află în diferite proporții atât la
proteinele fibrilare, cât și la cele globulare.
• Singura proteină cu structura α-helix 100%
este keratina
Structura β – foaie plisată
• Legăturile de hidrogen se stabilesc între catene
polipeptidice diferite (2-12 catene, având în medie până la
15 aminoacizi) sau segmente ale aceleiași catene, dispuse
paralel
• Legăturile de hidrogen sunt perpendiculare pe axul
moleculei
• Radicalii sunt orientați alternativ de o parte și de alta a
structurii
• Cea mai stabilă structură este aceea în care lanțurile
evoluează antiparalel (unul de la capătul N-terminal spre
capătul C-terminal și celălalt invers)
Structura β – foaie plisată
Structura cu lanţuri paralele Structură cu lanţuri antiparalele – mai
stabilă
Structura β antiparalelă
Structura β – foaie plisată
• Se poate realiza și în cadrul unui singur lanț
polipeptidic, dacă acesta se întoarce cu 180⁰
• Se mai numește și structura β-turn sau “în ac de
păr”
• Structura este stabilizată prin formarea unei
legături de hidrogen între primul și al treilea
aminoacid
• În general secvențele care conțin prolină și
glicină pot forma astfel de structuri
Structura β – foaie plisată
Structura β – foaie plisată
• Singura proteină cu structură β 100% este
fibroina, din mătase