Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Microbiologie
Microbiologie
INTRODUCERE
Obiectul de studiu al microbiologiei
Obiectul de studiu al microbiologiei este biologia microorganismelor, mai precis forma,
structura şi activitatea fiziologică a acestora.
Microorganismele sunt organisme mici, vizibile doar la microscop. Deoarece micros (gr.)
= mic, bios (gr.) = viaţă, logos (gr.) = ştiinţă, termenul de microbiologie ar însemna ştiinţa despre
organisme cu viaţă scurtă, provenind de la cuvântul „microb”, introdus de Sedillot (1878). Acest
termen se referă în special la microorganismele patogene şi, deşi frecvent folosit, nu este
ştiinţific.
Noţiunea de microorganism nu are semnificaţie taxonomică, deoarece reuneşte un grup
foarte vast, heterogen de organisme diferite ca poziţie sistematică, dar care prezintă o serie de
caractere comune:
- au dimensiuni microscopice, dimensiunile lor se exprimă în µm (10-6m), iar ale
organitelor lor în nm (10-9m) sau chiar în Å (10-10m);
- prezintă organizare în general unicelulară, sub două forme:
o celule de tip procariot
o celule de tip eucariot. Chiar dacă unele microorganisme formează asociaţii
pluricelulare, acestea nu prezintă diferenţiere celulară pentru a forma ţesuturi şi
organe, iar o celulă izolată din aceste asociaţii îşi păstrează viabilitatea, creşte, se
divide şi reface asociaţia;
- structura lor internă este în general simplă.
Heterogenitatea microorganismelor este definită prin alte caracteristici:
- poziţia sistematică diferită;
- activitatea biologică diversă;
- morfologia şi structura internă a diferitelor grupe de microorganisme sunt de asemenea
diverse.
În categoria microorganismelor intră:
- celule procariote:
o Eubacterii (bacterii adevărate)
o Cianobacterii (bacterii albastre-verzi)
o Actinomicete (bacterii filamentoase, cu organizare de tip micelial)
o Arhebacterii (microorganisme foarte asemănătoare din punct de vedere
morfologic şi structural cu bacteriile adevărate, care se găsesc în medii de viaţă
variate şi corespund bacteriilor extremofile)
- celule eucariote:
o Fungi microscopici, care includ:
levuri (drojdii)
mucegaiuri (fungi filamentoşi, cu organizare pluricelulară)
o Alge microscopice
o Protozoare.
Microbiologia studiază şi virusurile şi entităţile moleculare infecţioase cu organizare
subvirală (viroizii şi prionii), deşi acestea nu sunt microorganisme şi nu au structură celulară.
Diviziunile microbiologiei
Diversitatea proceselor fiziologice bacteriene, rolul lor esenţial în ecosistemele naturale,
capacitatea de a sintetiza substanţe utile sau dea produce procese infecţioase la organismele
superioare au determinat diversificarea domeniilor de studiu al microorganismelor.
Clasificarea diferitelor domenii se poate face după criterii taxonomice (bacteriologie,
virologie, algologie, micologie, protozoologie), după criterii funcţionale (fiziologia, biochimia,
ecologia, genetica microorganismelor), după mediul din care provin microorganismele
(microbiologia solului, hidromicrobiologia, geomicrobiologia) şi după aplicaţiile practice ale
diferitelor categorii de microorganisme (microbiologie industrială, medicală, biotehnologia).
Ecologia microorganismelor studiază legităţile generale de evoluţie şi interacţiune a
microorganismelor în natură, interacţiunile dintre microorganisme şi interrelaţiile
microorganismelor cu macroorganismele.
Genetica microorganismelor studiază substratul molecular al eredităţii şi variabilităţii
microorganismelor şi mecanismele de transfer al materialului genetic la bacterii.
Microbiologia solului studiază ansamblul microorganismelor din sol, rolul lor în
fertilitatea solului şi în circuitul elementelor biogene în natură, precum şi interacţiunile dintre
aceste microorganisme şi plante.
Hidromicrobiologia studiază microorganismele din mediile acvatice şi rolul lor în
lanţurile trofice.
Geomicrobiologia studiază în principal microbiologia petrolului, având un pronunţat
caracter utilitar. Studiază rolul microorganismelor în geneza petrolului şi a zăcămintelor minerale,
posibilitatea utilizării acestora în exploatarea, biodegradarea sau recuperarea petrolului şi
zăcămintelor.
Microbiologia insectelor studiază relaţiile dintre microorganisme şi artropode, care pot
avea un rol important ca vectori în patologia umană, animală şi vegetală.
Microbiologia industrială s-a dezvoltat pornind de la descoperirea proceselor
fermentative de către Louis Pasteur. Ea studiază utilizarea diferitelor microorganisme
producătoare de substanţe utile pentru alimentaţie, terapeutică sau industrie.
Microbiologia medicală studiază microorganismele patogene pentru om şi animale,
patogenitatea şi virulenţa acestora, factorii care condiţionează virulenţa, modul lor de transmitere
şi modalităţile de combatere.
Microbiologia generală este o ştiinţă biologică fundamentală, care studiază
particularităţile organizării structurale şi funcţionale ale celulei bacteriene, biologia şi sistematica
bacteriilor, răspândirea lor în natură, relaţiile lor ecologice cu alte microorganisme sau cu
macroorganismele, originea şi evoluţia lor, fenomenele de ereditate şi variabilitate microbiană.
Este o ştiinţă de sinteză şi se bazează pe date din domeniile aplicative ale microbiologiei.
Cunoaşterea principiilor fundamentale ale microbiologiei generale este o necesitate pentru orice
biolog, indiferent de domeniul său de activitate.
Istoricul microbiologiei
Descoperirea microorganismelor datează din 1676, când olandezul Anton van
Leevenhoek a examinat picături de apă din diferite surse naturale, picături de salivă, picături de
puroi cu ajutorul unui un aparat optic propriu de mărire a imaginii. Cu ajutorul acestui microscop
special, care mărea de 270 de ori, el a observat o lume fascinantă, într-o mişcare perpetuă. În
descrierile sale, printre alte organisme, se recunosc şi bacteriile, pe care Leevenhoek le-a denumit
animalcule, considerându-le nişte „pui” ale animalelor acvatice mai mari. El nu a sesizat noutatea
lumii pe care a văzut-o, de aceea, deşi 24 aprilie 1676 este considerată ziua de naştere a
microbiologiei, Leevenhoek nu este considerat întemeietorul microbiologiei ca ştiinţă.
Botanistul Carl Linaeus, în lucrarea sa „Systema naturae” (1735), grupează sistematic
toate vieţuitoarele cunoscute, introducând microorganismele în categoria „chaos”.
Întemeietorul microbiologiei ca ştiinţă este considerat Ferdinand Cohn (1875), cercetător
care a intuit caracterele aparte ale microorganismelor, iar lucrările lui Louis Pasteur (1822 - 1895)
au avut o importanţă deosebită pentru evoluţia acestei ştiinţe.
Pasteur a înfiinţat primele laboratoare de cercetare microbiologică şi a studiat procesele
fermentative. A demonstrat că fermentaţiile sunt procese biologice produse de acţiunea unor
microorganisme facultativ anaerobe, fiecare fiind determinată de o categorie specifică de
germeni. A studiat bolile fermentaţiilor, cauzate de contaminarea acestora cu organisme străine
care le deviază cursul normal şi a pus la punct o metodă de evitare a contaminării fermentaţiilor
cu agenţi nedoriţi (pasteurizarea).
A înlăturat concepţia generaţiei spontanee care data din antichitate, conform căreia
vieţuitoarele ar putea să apară spontan din materie organică. Prin experimentele sale cu baloane
de sticlă prevăzute cu un tub în formă de gât de lebădă, a demonstrat că de fapt vieţuitoarele
„apărute spontan” erau contaminanţi din aer şi apă.
Pasteur a pus la punct teoria originii microbiene a bolilor infecţioase studiind
îmbolnăvirea viermilor de mătase şi a deschis era prevenirii bolilor infecţioase prin vaccinarea
antibacteriană şi antivirală, practică medicală de o importanţă deosebită, ce a dus la crearea unui
domeniu nou, imunologia.
Medicul german Robert Koch a avut contribuţii importante la dezvoltarea domeniului
bacteriologiei, fiind considerat fondatorul acestei ramuri microbiologice. Este cel care a introdus
în practica de laborator folosirea mediilor solide pentru cultivarea tulpinilor bacteriene.
A descoperit mai multe specii de bacterii patogene, printre care bacilul tuberculozei şi
vibrionul holerei.
În urma cercetărilor pe animale de laborator a elaborat principiile generale prin care un
anumit germen poate fi considerat agentul etiologic al unei boli (cele 4 postulate ale lui Koch): 1.
Microorganismul trebuie să fie găsit cu regularitate în leziunile bolii respective; 2.
Microorganismul trebuie să fie izolat de la gazda infectată şi cultivat într-o cultură pură; 3.
Inocularea culturii pure obţinute în laborator la un animal sensibil trebuie să reproducă boala; 4.
Microorganismul trebuie să se regăsească din nou cu regularitate la noua gazdă în leziunile
caracteristice bolii.
Microbiologul rus Ilia Ilici Mecinikov (1845 - 1916) a studiat digestia intracelulară a
particulelor de carmin la echinodermele marine la Institutul Pasteur de către celule pe care le-a
denumit fagocite şi a emis ipoteza că astfel de celule există şi în organismele umane şi animale.
Prin descrierea fenomenului de fagocitoză a pus bazele teoriei imunităţii celulare.
Biologul rus Dimitri Ivanovski (1864 - 1920) a descoperit în 1892 virusul mozaicului
tutunului (VMT), întemeind ştiinţa numită virusologie. Natura particulară a virusurilor a fost
intuită în 1897 de către Martinus Willem Beijerinck, microbiolog şi botanist olandez, care le-a
denumit „contagium vivum fluidum”.
Alexander Fleming a descoperit în 1921 lizozimul şi în 1929 penicilina, antibiotic produs
de Penicillium notatum, care a fost ulterior purificată de către savanţii britanici Florey şi Chain
(1940). Cei trei cercetători au primit în 1945 Premiul Nobel pentru medicină pentru descoperirea
acestui antibiotic.
Winogradski este considerat întemeietorul microbiologiei solului.
La noi în ţară, realizări de marcă în domeniul microbiologiei au aparţinut lui Victor
Babeş (1854 - 1926), care a lucrat la Institutul Pasteur din Paris şi a fost colaborator al lui Robert
Koch. El a studiat numeroase boli (lepra, holera, tuberculoza, turbarea, febra tifoidă), descoperind
peste 50 de microbi.
Împreună cu Victor Cornil a scris în 1885 primul tratat de bacteriologie din lume, intitulat
„Les bactéries et leur rôle dans l'anatomie et l'histologie pathologiques des maladies
infectieuses”. A descris corpusculii Babeş-Negri în creierul animalelor moarte de turbare,
importanţi pentru diagnosticul bolii, precum şi corpusculii Babeş-Ernst din citoplasma unor
bacterii Gram pozitive.
Ioan Cantacuzino (1863 - 1934), întemeietorul Institutului din Bucureşti care îi poartă azi
numele, a fost elev al lui Mecinikov, studiind imunitatea şi fagocitoza la nevertebrate, dar şi
numeroase boli ca scarlatina, holera, tuberculoza, difteria, producând numeroase seruri şi
vaccinuri pentru prevenirea diferitelor boli infecţioase.
A emis prima lege sanitară din România (1910) şi a avut contribuţii importante la
dezvoltarea învăţământului medical românesc.
În sistemul de clasificare a lumii vii propus de Aristotel, erau precizate două regnuri,
Plantae (în care se încadrau şi Virophyta, Bacteriophyta şi Fungi) şi Animalia (care cuprindea şi
protozoarele).
Ulterior Hogg (1860) şi Haeckel (1866) au propus împărţirea în 3 regnuri: Protista,
Plantae şi Animalia. Clasificarea protistelor în două categorii (inferioare - procariote şi superioare
- microeucariote), a fost propusă de Stanier (1864).
Copeland a propus în 1938 sistemul celor 4 regnuri: Monera (bacterii şi cianobacterii),
Protista (organismele eucariote inferioare, de regulă unicelulare: microalge, fungi, protozoare),
Plantae şi Animalia.
În 1969 Whittaker a propus un nou sistem de clasificare, în 5 regnuri:
- Monera (organisme unicelulare, cu organizare de tip procariot: bacterii, cianobacterii,
actinomicete);
- Protista (microorganisme eucariote: alge microscopice, fungi acvatici flagelaţi,
protozoare);
- Fungi (organisme eucariote imobile, ce formează spori);
- Plantae (plante nevasculare şi vasculare);
- Animalia (organisme pluricelulare, cu nutriţie de tip ingestiv).
Ulterior, Bergey a schimbat numele regnului Monera în cel de Procaryota.
Criteriile de clasificare în 5 regnuri se bazau pe trei niveluri de organizare: procariot,
eucariot unicelular şi eucariot pluricelular, dar şi pe modalităţile de nutriţie: fotosintetică,
absorbtivă, ingestivă. Acest sistem de clasificare evidenţiază heterogenitatea microorganismelor.
Rezultatele cercetărilor la nivel molecular au arătat că sistemul de clasificare a lumii vii în 5
regnuri nu este corect din punct de vedere filogenetic, cele două regnuri de microorganisme
eucariote (Protista şi Fungi) fiind artificiale. Deoarece o primă divizare a lumii vii trebuie să se
facă în procariote şi eucariote, sistemele moderne de clasificare rezervă bacteriilor o poziţie
sistematică aparte.
Virusurile constituie o categorie aparte de agenţi infecţioşi. Ele sunt entităţi moleculare
infecţioase fără organizare celulară şi nu se pot încadra alături de celelalte microorganisme.
CONCEPTUL DE BACTERIE
MORFOLOGIA BACTERIILOR
Forma celulelor bacteriene
La bacteriile Gram pozitive peretele celular este gros (15 – 30 nm), rigid;
componenta sa esenţială, care reprezintă 80 – 90% din structura peretelui şi asigură
rigiditatea peretelui, este mureina (murus = perete), denumită şi peptidoglican,
glicopeptid, mucopeptid, glucozaminopeptid. Stratul de mureină este sensibil la acţiunea
enzimei lizozim, care atacă legăturile chimice din structura sa.
Mureina este alcătuită din două componente, componenta glicanică (glucidică) şi
componenta peptidică.
Componenta glicanică este formată din lanţuri paralele polizaharidice alcătuite
prin legarea alternativă a două zaharuri aminate: N-acetil-D-glucozamină şi acidul
N-acetilmuramic.
Componenta peptidică este un tetrapeptid, cu o compoziţie în aminoacizi
variabilă în funcţie de specie, care conţine L-alanină, D-alanină, D-glutamină, L-lizină.
Tetrapeptidele se prind pe lanţurile glicanice. Tetrapeptidele dintre două lanţuri
adiacente se leagă între ele prin legături interpeptidice. Cu cât numărul acestor legături
este mai mare, cu atât creşte rigiditatea peretelui celular. Se formează astfel o reţea care
înconjoară structurile celulare.
La acest nivel sunt localizate două tipuri de enzime ce contribuie la creşterea
peretelui celular: murein-hidrolazele, care atacă legăturile chimice ale mureinei şi
murein-sintetazele, care realizează noi constituenţi structurali pe care îi inseră în dreptul
rupturilor create.
Numai bacteriile Gram pozitive prezintă la exteriorul stratului de mureină acizii
teichoici (teichos (gr.) = zid), polizaharide specifice, sub forma unor molecule polimerice
lungi, flexibile, cu aspect tubular. Din punct de vedere chimic acizii teichoici sunt
polimeri de tipul poliribitol-fosfat şi 1,3 poliglicerol-fosfat, legaţi covalent de stratul de
mureină.
Bacteriile Gram negative prezintă perete celular subţire, cu un strat fin de mureină
sensibil la lizozim, de 0,01µ grosime. La aceste bacterii mureina reprezintă doar
2,5 – 10% din greutatea uscată a peretelui. Sacul mureinic este un monostrat molecular,
cu structură similară cu cea a bacteriilor Gram pozitive şi nu prezintă acizi teichoici.
Componenta peptidică a peretelui bacteriilor Gram negative conţine acid
diaminopimelic (derivat al lizinei), punţile transversale interpeptidice reunind gruparea
NH2 a acidului diaminopimelic cu gruparea –COOH a D-alaninei de pe alt lanţ glicanic.
Stratul de peptidoglicani este aderent la membrana citoplasmatică formând
împreună cu aceasta membrana internă. La exterior stratul de peptidoglicani prezintă o
membrană externă, cu o grosime de 6 – 20nm, care nu este sensibilă la lizozim, ci la
EDTA (etilen-diamino-tetraacetat) 30%. Între cele două membrane se delimitează spaţiul
periplasmic, care cuprinde stratul de peptidoglicani.
Membrana externă are în compoziţia sa chimică fosfolipide (35%), proteine
(15%), lipopolizaharide (50%) şi o structură similară cu cea a membranei citoplasmatice.
Fosfolipidele sunt în dublu strat, cu grupările hidrofile către exteriorul membranei şi cele
hidrofobe către interiorul acesteia. Proteinele sunt inclavate în acest dublu strat. Unele
proteine (numite porine) străbat complet membrana externă, asigurând trecerea unor
substanţe din mediu în celule. Lipopolizaharidele (LPS) prezintă trei porţiuni: lipidul A,
legat de stratul de fosfolipide; componenta oligozaharidică numită porţiunea centrală R,
care este legată covalent de lipidul A şi componenta polizaharidică (antigenul somatic O),
variabilă ca structură şi compoziţie chimică, ce determină specificitatea antigenică a
celulei bacteriene.
În spaţiul periplasmic, situat între membrana internă şi cea externă, se găsesc
proteine enzimatice de tipul fosfatazelor, ribonucleazelor şi proteine neenzimatice,
implicate în transportul substanţelor prin membrane, numite proteine de legare.
Mezosomii
Mezosomii (mezos (gr.) = mijloc, soma (gr.) = corp) sunt structuri derivate din
membrana plasmatică, ce au deseori poziţie mediană în celulă. Ei se mai numesc şi corpi
de mijloc, plasmalemasomi.
Sunt structuri intracitoplasmatice membranare, derivate prin invaginarea
membranei, a căror semnificaţie biologică a fost controversată.
Au fost descrise trei tipuri morfologice de mezosomi: tubulari, veziculari
(sacciformi) şi lamelari. Într-o celulă bacteriană pot exista mai mulţi mezosomi, mai
numeroşi, cu structură complexă şi mai bine dezvoltaţi la bacteriile Gram pozitive, mai
puţini şi mai greu de observat la bacteriile Gram negative. Structura moleculară a
mezosomilor este identică cu cea a membranei plasmatice din care provin, cu o grosime
de 7 – 10nm şi un dublu strat fosfolipidic în care sunt inclavate proteine structurale şi cu
rol enzimatic.
Mezosomii îşi au originea în membrana plasmatică, ce creşte şi se invaginează
datorită faptului că peretele celular rigid creşte mai încet decât membrana. Invaginarea
membranei plasmatice duce iniţial la formarea unor mezosomi tubulari, apoi la mezosomi
veziculari, în final ajungând la aspectul lamelar. Sunt structuri dinamice, care se
formează atunci când sunt necesari bacteriei.
Semnificaţia biologică a mezosomilor
Unii autori consideră mezosomii ca structuri vestigiale, fără semnificaţie
biologică esenţială. Alţii consideră că mezosomii au funcţii multiple în celula bacteriană:
- Au rol în replicarea şi segregarea genomului bacterian şi în individualizarea
celulelor;
- Au rol în controlul replicării cromozomului bacterian şi plasmidelor, prin
transmiterea semnalului biochimic de iniţiere a replicării materialului genetic;
- Fiind derivaţi din membrana plasmatică, reprezintă împreună cu aceasta sediul
sinergonului respirator, fiind consideraţi echivalentul funcţional al mitocondriei;
participă la reacţii de fosforilare, oxidoreducere, transport de electroni;
- La nivelul lor se găsesc enzime degradative, astfel încât pot fi consideraţi
echivalentul funcţional al lizozomilor;
- Au rol în procesele secretorii ale celulei, contribuind la producerea şi eliberarea
unor exoenzime celulare;
- Sunt asociaţi cu procesele de biosinteză a învelişurilor celulare (membrană
plasmatică, perete celular, sept transversal de diviziune);
- Unii autori (Tichy şi colab., 1969) consideră că mezosomii ar reprezenta regiuni
specializate de pătrundere în celula bacteriană a fragmentelor de ADN exogen în
timpul transformării genetice bacteriene.
Cu toate aceste funcţii multiple, unii cercetători (Nanninga, 1985) contestă
existenţa mezosomilor, considerând că ei sunt artefacte (structuri artificiale) care apar în
timpul pregătirii materialului celular pentru examinarea la microscopul electronic şi că
prin modificări ale tehnicilor folosite s-ar putea induce producerea de mezosomi tubulari,
veziculari, lamelari, după bunul plac.
Citoplasma bacteriană
Citoplasma celulelor bacteriene este un sistem coloidal complex, care din punct
de vedere fizic corespunde stării de gel şi este formată din proteine, glucide, lipide, apă şi
substanţe minerale.
Starea de gel permanent are ca rezultat o imobilitate a conţinutului celular în lipsa
curenţilor citoplasmatici şi reprezintă o condiţie indispensabilă a nemiscibilităţii
nucleosomului cu citoplasma, având în vedere lipsa membranelor intracelulare.
Citoplasma bacteriilor nu prezintă organite citoplasmatice diferenţiate şi
delimitate de membrane (de tipul mitocondriilor şi cloroplastelor).
Aspectul citoplasmei variază în funcţie de vârsta celulei bacteriene şi de condiţiile
de cultivare. Astfel, la celulele tinere (din culturi de 24 – 48 ore) şi în condiţii favorabile
de mediu, citoplasma aderă strâns de membrana citoplasmatică şi se prezintă ca o masă
densă, omogenă, fin granulară, intens colorabilă cu coloranţi de anilină (coloranţi bazici)
datorită conţinutului ridicat de acizi nucleici.
La celulele îmbătrânite şi în condiţii nefavorabile de mediu, citoplasma îşi pierde
treptat afinitatea pentru coloranţii bazici, se îndepărtează de învelişul celular şi capătă un
aspect granular, neomogen, cu multiple vacuole.
În citoplasmă se găsesc: materialul nucleosomal, mezosomii, ribozomii, incluziile
şi vacuolele. Ribozomii sunt responsabili de structura granulară a citoplasmei, prezentând
două topografii diferite: cei care participă la sinteza proteinelor celulare şi a
constituenţilor citoplasmatici sunt dispuşi omogen în masa citoplasmei, iar cei care
contribuie la sinteza proteinelor care vor fi secretate sau excretate la exteriorul celulei
sunt grupaţi pe faţa internă a membranei plasmatice. Citoplasma este foarte bogată în
ARN, în special ARN ribozomal (ARNr, 80%), ARN de transfer (ARNt, 10 – 20%) şi
ARN mesager (ARNm, 2%), ceea ce explică bazofilia ei intensă la celulele tinere, cu
sinteze proteice intense. Celulele îmbătrânite se colorează mai puţin intens, deoarece
sinteza de ARN ribozomal încetează şi cel existent este folosit ca sursă de azot şi fosfor.
Nucleosomul bacterian
Ribozomii
Ribozomii sunt particule nucleoproteice intracitoplasmatice, de formă
aproximativ sferică şi cu un diametru de 20nm; pot fi caracterizaţi prin constanta lor de
sedimentare la ultracentrifugare în gradient de concentraţie (concentraţie de sucroză de
5 – 25%). Ribozomii eucariotelor sunt de tip 80S, iar ribozomii procariotelor sunt de tip
70S.
Ribozomii sunt structuri dinamice, care au capacitatea de a disocia în cele două
subunităţi componente, care se reasociază când ribozomii sunt funcţionali. Asocierea şi
disocierea componentelor ribozomale sunt corelate cu variaţiile concentraţiei ionilor de
magneziu: asocierea este favorizată de creşterea concentraţiei ionilor de magneziu, iar
disocierea e corelată cu scăderea acestei concentraţii.
Numărul ribozomilor în celula bacteriană este corelat cu activitatea ei fiziologică,
fiind mic în celulele aflate în repaus şi mare în celulele fiziologic active. El variază între
15000 – 100000/celulă. Unii ribozomi se găsesc liberi în citoplasmă şi determină
structura granulară a acesteia, mai ales la celulele tinere. Alţii se găsesc pe faţa internă a
membranei citoplasmatice, la nivelul lor având loc sinteza proteinelor care vor fi
eliminate la exteriorul celulei.
Ribozomii bacterieni 70S au două subunităţi: o subunitate mare, 50S, care are
formă de fotoliu şi o subunitate mică, 30S, care are formă de halteră asimetrică, aşezată
orizontal pe braţele şi spătarul fotoliului. Ribozomii 70S conţin în total 55 molecule de
proteine şi 3 molecule de ARN ribosomal. Subunitatea mare are greutatea moleculară
de 16000000 Da, cu 34 molecule diferite de proteine, notate de la L1 la L34 (de la large =
mare) şi două molecule de ARNr, una foarte mare, 23S, alta mică, 5S. Subunitatea mică
are greutatea moleculară de 900000 Da, cu 21 molecule proteice, notate de la S1 la S21 (de
la small = mic) şi o moleculă de ARNr, cu o constantă de sedimentare 16S.
Subunitatea mare are formă de fotoliu, iar subunitatea mică are aspect de halteră
asimetrică, rezemată orizontal pe braţele şi spătarul fotoliului. Între cele două subunităţi,
mai precis între scobitura fotoliului şi gâtul halterei, rămâne un canal lung şi îngust, prin
care trece ARN mesager, purtătorul informaţiei genetice necesare sintezei proteinelor.
O celulă de Escherichia coli în plină creştere sintetizează aproximativ 500
ribozomi/minut, acest proces implicând sinteza coordonată a moleculelor proteice şi a
ARNr, precum şi asamblarea lor funcţională. Celulele bacteriene au o capacitate de a
sintetiza ribozomi într-un ritm accelerat, o capacitate de biosinteză proteică rapidă şi
eficientă, astfel încât se pot multiplica rapid, pentru a supravieţui în natură.
Ribozomii sunt constituenţi esenţiali ai sistemului de traducere a informaţiei
genetice, reprezentând adevărate fabrici de proteine. La nivelul lor se desfăşoară un
ansamblu de reacţii care formează ciclul ribozomal, ce determină iniţierea, creşterea şi
terminalizarea lanţului polipeptidic, în care ribozomii interacţionează cu ARN mesager
pentru a lega specific moleculele de aminoacizi aduşi cu ajutorul ARN de transfer,
asigurând formarea proteinelor. Ribozomii se asociază în polisomi (poliribozomi),
grupări funcţionale formate din 4 – 50 unităţi ribozomale. Dimensiunile poliribozomilor
variază în funcţie de lungimea ARNm. Polisomii se deplasează în lungul moleculei de
ARNm şi permit sinteza concomitentă a mai multor molecule proteice pe aceeaşi
moleculă de ARNm.
Rolul ribozomilor în sinteza proteică
În faza de creştere logaritmică a culturii bacteriene, la temperatura optimă,
cromozomul bacterian este transcris cu o rată de 60 nucleotide/secundă. La procariote
ribozomii au relaţii spaţiale strânse cu ADN, deoarece transcrierea şi traducerea
informaţiei sunt două procese intim coordonate, care se desfăşoară aproape concomitent.
După ce a citit integral informaţia ARNm, ribozomul se desprinde, eliberând în
acelaşi timp polipeptidul sintetizat. Polisomul este ataşat fizic de cromozomul bacterian
pentru o perioadă scurtă de timp. Transcrierea moleculei de ARNm durează circa un
minut. Rata traducerii este corelată cu rata transcrierii.
Pe medii nutritive bogate, ribozomii celulelor bacteriene (ataşaţi de suprafaţa
internă a membranei citoplasmatice) sintetizează exoproteine, care sunt eliminate la
exterior. Unele proteine de acest fel nu apar niciodată în citoplasma celulelor bacteriene,
sugerând că ele sunt eliminate pe măsură ce sunt sintetizate. Ele sunt molecule relativ
mici, lipsite de rigiditate.
Incluziile bacteriene
Incluziile bacteriene sunt formaţiuni structurale inerte, care apar în citoplasma
bacteriilor aflate la sfârşitul perioadei de creştere activă, de regulă în condiţii de
abundenţă a surselor nutritive şi în prezenţa unui dezechilibru între carbon şi azot. Ele
reprezintă rezerve intracelulare pentru microorganisme, care dispar după trecerea
celulelor respective în medii sărace în nutrienţi.
Mărimea, forma, conţinutul şi numărul incluziilor diferă. Ele pot fi:
- incluzii anorganice simple (sulf coloidal, carbonat de calciu);
- polimeri anorganici (incluzii de polimetafosfat care constituie volutina);
- polimeri organici polizaharidici (amidon, glicogen), lipidici
(polibetahidroxibutirat) sau proteici (incluziile parasporale de la Bacillus
thuringiensis).
După criterii structurale, se disting incluzii delimitate de membrane (de exemplu
cele de polibetahidroxibutirat) sau nedelimitate de membrane (de exemplu cele de
glicogen, de volutină).
La microscopul optic apar ca structuri granulare, de formă neregulată, refringente,
cu dimensiuni între 50 – 100nm.
Granulele de volutină (corpusculii Babeş Ernst) sunt polimeri de polifosfaţi care
au fost evidenţiate la Spirillum volutans şi care se formează în condiţiile deficitului
oricăruia dintre nutrienţi. Ele reprezintă o rezervă de fosfor şi de energie intracelulară.
Incluziile de sulf anorganic sunt structuri refringente, localizate
intracitoplasmatic sau la nivelul unor pliuri ale membranei citoplasmatice. Se întâlnesc la
bacteriile sulfuroase purpurii (Chromatiaceae) care folosesc în fotosinteză H2S ca donor
de electroni şi la bacteriile filamentoase autotrofe nefotosintetizante (Beggiatoa), care
oxidează H2S. După epuizarea H2S din mediu, sulful depozitat în celule este oxidat la
sulfat.
O categorie aparte de incluzii e reprezentată de magnetosomi, incluzii ce conţin
magnetită (Fe3O4), răspunzătoare de fenomenele de orientare descrise la bacterii sub
influenţa câmpurilor magnetice slabe sau a câmpului magnetic al pământului
(magnetotaxie). Bacteriile magnetotactice au fost izolate din sedimentele marine şi de apă
dulce, ca de exemplu Aquaspirillum magnetotacticum, singura obţinută în cultură pură.
Aceste bacterii au o importanţă deosebită în studiile asupra câmpului magnetic al
pământului.
Incluziile proteice parasporale se sintetizează odată cu formarea sporilor.
Vacuolele bacteriene
Sunt formaţiuni sferice cu diametrul de aproximativ 0,3 – 0,5µm, mai puţin
refringente decât citoplasma. În funcţie de mediul de cultură numărul lor într-o celulă este
între 6 şi 20. Vacuolele conţin substanţe dizolvate în apă şi sunt delimitate de un înveliş
lipoproteic unistratificat, cu grosimea de 3nm, numit tonoplast.
Unii autori consideră că vacuolele se formează ca urmare a pătrunderii unei
cantităţi mari de apă în celulă. În apa aflată în exces se dizolvă produşi de metabolism
hidrosolubili, iar lipidele şi proteinele acumulate în jurul picăturilor de apă formează
tonoplastul. Rolul vacuolelor ar fi acela de reglatori ai presiunii osmotice în raport cu
mediul extern, precum şi de depozite de substanţe de rezervă în perioada premergătoare
formării incluziilor.
Un tip special de vacuole este reprezentat de veziculele gazoase, numite
aerosomi. Ele sunt întâlnite la bacteriile acvatice fotosintetizante imobile, ca de exemplu
cianobacterii şi bacterii fotosintetizante verzi şi roşii. Sunt structuri refringente cu aspect
ovalar, compartimentate, membranele fiind constituite din proteine hidrofobe.
Aerosomii conferă bacteriilor o densitate mai mică decât a apei şi permit
deplasarea celor acvatice imobile într-o coloană verticală de apă în zone favorabile
fotosintezei. De asemenea, joacă un rol protector pentru bacterii, dispersând lumina şi
apărând structurile fotosensibile de acţiunea nocivă a ultravioletelor. Aerosomii sunt
numeroşi la cianobacteriile care cresc cu o rată mare şi produc fenomenul de „înflorire a
apelor”.
Endosporul bacterian
Anatomia bacteriilor permite adaptarea lor la habitate diverse. Dintre toate
structurile microorganismelor, endosporul este cel mai performant din punct de vedere al
rezistenţei la condiţiile ostile de mediu, care facilitează supravieţuirea.
Sporul bacterian este o formă primitivă de diferenţiere celulară, care constă în
formarea în celula vegetativă a unui nou tip de celulă, cu ultrastructură, compoziţie
chimică şi enzimatică diferită.
Există cel puţin 10 tipuri diferite de spori, caracteristice anumitor grupuri
sistematice de bacterii, cu particularităţi structurale şi biologice. Cea mai comună formă
de spor este endosporul, care poate fi considerat sporul tipic. El este frecvent întâlnit la
bacteriile Gram pozitive cilindrice (de exemplu la genurile Bacillus, Clostridium) şi în
mod excepţional la bacterii sferice (Sporosarcina).
Endosporul are formă sferică sau ovalară, cu dimensiuni între 0,5 - 1µm pentru
axul mic şi între 1 – 1,5µm (3µm) pentru axul longitudinal. Are o refringenţă deosebită şi
e foarte greu colorabil datorită învelişurilor impermeabile pentru coloranţi. Se poate
colora însă după permeabilizarea învelişurilor prin tehnici speciale energice.
În funcţie de aşezarea în celula bacteriană, sporul poate fi terminal, subterminal
sau ecuatorial (central), iar în funcţie de diametrul său comparativ cu cel al celulei în care
se formează, sporul poate fi nedeformant (terminal, subterminal, central) sau deformant
(terminal, ecuatorial).
În general sporii sunt unici în celula bacteriană, dar există şi excepţii, când în
celule se formează câte doi spori (celule bisporulate) sau chiar mai mulţi (celule
polisporulate).
Ultrastructura endosporului
Sporul este alcătuit dintr-o porţiune centrală, ce reprezintă protoplastul sporal,
format din: perete sporal, citoplasmă granulară denumită sporoplasmă, în care se găsesc
ribozomii şi materialul nuclear inclus în nucleoplasmă. Protoplastul sporal este
înconjurat de o zonă transparentă, mai puţin densă, numită cortex, alcătuită din
peptidoglican modificat, acoperit de un înveliş sporal lamelar cu 3 straturi suprapuse: la
interior este situată intina bistratificată, urmează un strat mijlociu şi apoi exina
multistratificată. La unele bacterii există în jurul sporului un exosporium, uneori
multistratificat, ancorat de spor prin filamente suspensoare. Unii spori au la una dintre
extremităţi un smoc de apendici sporali, de aproximativ două – trei ori mai lungi decât
sporul, cu aspect tubular şi cu striaţii orizontale sau în formă de pană. Rolul acestor
apendici ar fi acela de a facilita dispersarea sporilor în natură, precum şi nutriţia sporului
în cursul sporogenezei sau germinării, prin preluarea nutrienţilor din mediu.
Compoziţia chimică a sporului
Sporul conţine toate categoriile de molecule necesare reluării creşterii celulei
bacteriene. Lipsesc componentele celulare instabile (ARNm şi nucleozidtrifosfaţi), dar
există precursorii lor mai stabili (nucleozid mono- şi difosfaţi). În spor nu se realizează
deci sinteze proteice.
Sporii conţin proteine structurale specifice, codificate de gene care sunt active
numai în spori, numite gene sporale. De asemenea, conţin enzime noi, în general
proteaze, lipsindu-le enzimele importante în metabolismul celulelor bacteriene (ca de
exemplu cele ale ciclului Krebs). Le lipsesc şi sistemele transportatoare de electroni, care
în celula vegetativă sunt localizate la nivelul membranei.
Enzimele sporale au o greutate moleculară mult mai mică decât enzimele
celulare. Unele dintre ele provin din enzimele celulei vegetative prin digestia proteolitică
a acestora, realizată de proteaze codificate de enzimele sporale. Ele reprezintă doar
situsul activ al enzimelor celulare, sunt mai termorezistente şi sunt stabilizate prin
legături intramoleculare.
Sporii conţin o cantitate mare de ioni de calciu şi magneziu, în raport cu celula
vegetativă. Ionii de calciu sunt legaţi cu o cantitate echivalentă de acid dipicolinic, ce
reprezintă între 10 - 15% din greutatea uscată a sporului. Acidul dipicolinic este implicat
în termorezistenţa crescută a sporilor.
Concentraţia de ATP este foarte scăzută în spori.
Iniţial s-a considerat că sporul se formează prin deshidratarea celulei vegetative,
ceea ce ar explica lipsa metabolismului la spor. Cercetările ulterioare au evidenţiat că
deosebirile dintre spor şi celula vegetativă nu sunt de ordin cantitativ, ci calitativ,
referindu-se la starea apei. Apa liberă din spor este în cantitate foarte redusă, între
3 – 10%, iar restul de 90 – 97% este în stare legată de constituenţii celulari. Apa legată
nu este implicată în procese metabolice. Sporul este în stare vie, dar este o viaţă latentă
(criptobioză), fără metabolism sau cu un metabolism extrem de redus, nedecelabil. În
celula vegetativă 70% din apă este în stare liberă, implicată în diverse procese
metabolice.
Particularităţile de structură şi compoziţie chimică a sporilor determină
termorezistenţa acestora, deosebita rezistenţă la substanţele chimice (antiseptice,
dezinfectanţi), rezistenţa la radiaţii.
Sporogeneza este procesul de formare a sporilor, care se desfăşoară în 6 – 7 stadii
succesive şi durează aproximativ 8 ore. Este declanşată de lipsa unui nutrient esenţial
pentru celula bacteriană (sursa de azot, sursa de carbon). Apar modificări ultrastructurale,
biochimice şi biologice, în sensul creşterii rezistenţei la factorii nefavorabili de mediu.
Procesul este complex şi din punct de vedere genetic, implicând participarea a cel puţin
50 de gene, constând în blocarea activităţii genelor funcţionale în celula vegetativă şi
activarea genelor sporale.
Germinarea sporilor este procesul de conversie a sporului în celula vegetativă şi
are loc atunci când sporul întâlneşte condiţii favorabile de mediu. Se realizează printr-o
serie de etape succesive, care în general reproduc în ordine inversă fenomenul de
sporogeneză. Sporul se hidratează, apa legată trecând în stare liberă, volumul sporului se
măreşte, are loc gelificarea învelişurilor sporale, după care celula vegetativă părăseşte
învelişul sporal.
Semnificaţia biologică a sporilor
Sporogeneza este o formă primitivă de diferenţiere celulară, dar şi o modalitate
de adaptare a celulei la condiţii de mediu nefavorabile. Mecanismele criptobiozei nu
sunt cunoscute. Unul dintre ele ar putea fi starea specială a enzimelor, care sunt inactivate
în mod reversibil.
Endosporul este şi o formă de conservare viabilităţii celulelor şi deci a speciei,
nefiind o formă de multiplicare. Are rol în diseminarea celulelor bacteriene în natură,
deoarece pot fi răspândiţi la distanţe foarte mari şi au o longevitate deosebită.
Sporogeneza poate fi asociată cu unele procese biologice importante.
Componentele extraparietale
Capsula bacteriană
Capsula bacteriană reprezintă o structură accesorie, care acoperă de jur împrejur
celula bacteriană. Este alcătuită dintr-un material macromolecular, gelatinos, vâscos,
inegal dezvoltat de la o specie bacteriană la alta. Se întâlnesc mai multe forme de capsulă:
1. Microcapsula este forma cea mai simplă, reprezentată de o peliculă fină, cu o
grosime mai mică de 0,2µm, care acoperă de jur împrejur peretele celulei
bacteriene.
2. Macrocapsula este o structură organizată, aderentă de celulă, cu o grosime mai
mare de 0,2µm, demonstrabilă prin metode citologice.
3. Stratul mucos este o masă amorfă neorganizată, ale cărei componente vâscoase
se dispun fără o semnificaţie anatomică în jurul celulei bacteriene, cu o grosime
mult mai mare de 0,2µm.
4. Zoogleea (zoon = animal; glee = substanţă vâscoasă) constă din acelaşi material
ca şi stratul mucos, dar cuprinde mai multe celule bacteriene, formând o asociaţie
bacteriană mucilaginoasă.
La unele bacterii din mediul natural se întâlneşte un glicocalix adevărat, care are
caracter adaptativ şi conferă celulei un avantaj selectiv, dispărând dacă bacteria este
trecută pe medii artificiale. Acesta este constituit dintr-o reţea de filamente polizaharidice
şi glicoproteice, legate de lipopolizaharidele membranei externe la bacteriile Gram
negative sau de mureina bacteriilor Gram pozitive. Formează o structură pericelulară
dezordonată, ca o pâslă, prin care celulele se ancorează de diferite substraturi.
Flagelul bacterian
Flagelii sunt structuri extracelulare, care reprezintă organite de motilitate, cu o
structură rudimentară în raport cu flagelul eucariotelor. Flagelii se mai numesc şi
undulipode (undula = undă mică, podos = picior).
Au originea în celula bacteriană, străbat învelişurile celulare şi prezintă un
filament extracelular. Acest filament are o grosime constantă pe toată lungimea lui, egală
cu 20nm. Lungimea flagelului este variabilă, de la 4 - 5µm până la 15µm, ajungând
uneori până la 70µm, flagelii fiind mult mai lungi decât celula bacteriană. Flagelii nu se
pot observa direct la microscop, prezenţa lor poate fi dedusă pe baza mobilităţii
accentuate a bacteriilor, care se deplasează în câmpul microscopic la întâmplare, în
diferite direcţii. În funcţie de prezenţa sau absenţa flagelilor, numărul şi gruparea lor, au
fost descrise mai multe tipuri de bacterii:
- bacterii atriche (fără flagel)
- bacterii monotriche (cu un singur flagel) - A
- bacterii amfitriche (cu doi flageli, situaţi de obicei apical) - C
- bacterii lofotriche (cu un smoc de flageli la unul din poli) - B
- bacterii peritriche (cu flageli de jur împrejurul celulei) - D
Flagelul poate fi situat polar sau subpolar, smocul de flageli poate fi dispus
ecuatorial.
- faza de lag (de latenţă, de creştere bacteriană 0) este cuprinsă între momentul iniţierii
culturii şi începerea multiplicării bacteriene; numele ei vine de la to lag (engl.) = a
întârzia; numărul celulelor bacteriene din inoculul iniţial rămâne relativ neschimbat;
deşi considerată fază de latenţă, este în realitate o fază activă, în care celulele se
pregătesc pentru multiplicarea ce va urma (îşi refac structurile şi sistemele enzimatice
necesare, cresc în dimensiuni, prezintă un metabolism intens). Această fază are o
durată diferită în funcţie de vârsta inoculului folosit: dacă inoculul provine dintr-o
cultură tânără, faza de latenţă este scurtă; dacă inoculul provine dintr-o cultură mai
veche sau aflată în condiţii de mediu total diferite de mediul cel nou, faza de latenţă
este de mai lungă durată, celulele fiind într-o fază activă de adaptare la noile condiţii
de cultivare.
- faza staţionară a creşterii este caracterizată printr-un număr de celule viabile maxim
şi constant pentru o perioadă de timp care depinde de specia bacteriană; se consideră
că în timp ce unele celule bacteriene mor, dispariţia lor este compensată de
multiplicarea lentă a altor celule, astfel încât, în ansamblu, numărul de celule viabile
este acelaşi. Această fază corespunde celulelor bacteriene mature, cu morfologie
considerată normală, tipică unei specii date; celulele din această fază se folosesc
pentru coloraţii. Spre sfârşitul fazei staţionare încep să apară primele incluzii
bacteriene, vacuole şi chiar spori;
- faza de început al declinului este aceea în care numărul celulelor viabile începe să
scadă ca rezultat al morţii unora dintre celule; ulterior scade şi densitatea celulară,
deoarece intervin procese de autoliză, produse de enzime proteolitice endogene;
- faza de declin şi moarte celulară este faza în care se intensifică reducerea numărului
de celule viabile şi fenomenele de autoliză bacteriană; este foarte variabilă ca durată,
de la 24 – 48 ore până la săptămâni şi chiar luni de zile; celulele bacteriene au o
morfologie alterată, apar forme filamentoase, spiralate, ramificate, necaracteristice
speciei; celulele au afinitate pentru coloranţii acizi, conţin substanţe de rezervă, se
întâlnesc mulţi spori.
Viteza de multiplicare a celulelor bacteriene se măsoară prin durata unei generaţii
şi se numeşte timp de generaţie. El este intervalul de timp scurs între două diviziuni
succesive. În general, acest timp este mai mic la bacterii decât la macroorganisme,
existând bacterii care se multiplică foarte rapid (Bacillus subtilis – 9-10 minute), altele
mai puţin rapid (Lactobacillus – 100 minute), iar altele foarte lent (Mycobacterium
tuberculosis – 1600 minute).
Deşi au un potenţial imens de multiplicare, bacteriile nu şi-l realizează în practică,
întrucât intervin factori de mediu nefavorabili, ce limitează acumularea unui număr imens
de celule bacteriene. De exemplu, în condiţii aerobe obişnuite de cultură în laborator,
numărul maxim de celule care se acumulează este de 200 milioane de celule/ml mediu. În
condiţii de agitare, care favorizează aerarea şi contactul celulelor cu nutrienţii, se poate
atinge un număr de 5 miliarde celule/ml.
Un coc cu o greutate de 5x10-13 g, cu un timp de generaţie de 20 minute, poate
determina după 132 de diviziuni formarea unei mase celulare cu greutatea de 6x1027g.
VIRUSURILE
MULTIPLICAREA VIRUSURILOR
Multiplicarea virusurilor (replicarea virală) are loc exclusiv în celula gazdă vie,
care le furnizează materialul de construcţie (aminoacizi, baze nucleice, polizaharide) şi
dispozitivul celular de biosinteză (ribozomi, sisteme generatoare de energie, ARNt).
Această comportare corespunde parazitismului absolut pe care virusurile îl exercită
asupra celulei gazdă.
Virusul invadant introduce în celula gazdă informaţia specifică a genomului său şi
deviază metabolismul celulei, pe care îl foloseşte pentru propriile biosinteze. Replicarea
virusurilor este rezultatul activităţilor celulei infectate, care urmează programul genetic
adus de virus.
Replicarea decurge într-o serie de etape succesive:
- Adsorbţia şi fixarea reversibilă a virusurilor pe celulă este o consecinţă a
ciocnirilor întâmplătoare între virusuri şi celulă, proces nespecific, reversibil. Este
determinată de atracţia ionică, eficienţa procesului fiind dependentă de numărul de
virioni din suspensia virală.
- Fixarea ireversibilă a virusurilor pe celulă este un proces ireversibil,
datorat diferitelor grade de specificitate a fixării virusului pe celula gazdă; este
determinat de complementaritatea geometrică şi electrostatică între structurile de pe
suprafaţa virusurilor şi receptorii specifici de virus de pe suprafaţa celulelor, care
recunosc aceste structuri. Cea mai mare specificitate de fixare există între
bacteriofag şi bacterie, cea mai mică între virusul vegetal şi celula vegetală (aceasta
nu are receptori pentru virus). Virusurile animale prezintă citotropism pentru
anumite tipuri de celule, pe care le infectează.
- Pătrunderea virusurilor în celulă se face diferit: virusurile animale pătrund
integral prin endocitoză (viropexie) sau fuziune; virusurile vegetale pătrund prind
leziunile mecanice ale peretelui celular; bacteriofagii îşi injectează genomul în
interiorul celulei bacteriene. Endocitoza este un proces similar pinocitozei.
Faza solidă a solului, care reprezintă aproximativ 1/2 din volumul acestuia, e
alcătuit din:
- substanţe minerale: roci vulcanice (granit, bazalt), roci sedimentare (gresie,
marnă, şisturi argiloase, calcare), roci metamorfice (şisturi cristaline);
- substanţe organice: resturi organice neanimate, provenite din litieră, lemn,
rădăcini, organisme şi microorganisme, dar şi fragmente aflate în diferite
grade de descompunere.
Diferitele substanţe cu rol de nutrienţi se găsesc în stare solubilă, insolubilă sau
sunt adsorbite pe diferite substraturi.
Faza gazoasă corespunde aerului prezent în porii liberi din sol şi are faţă de aerul
atmosferic mai mult CO2 şi mai puţin O2.
Factorii de mediu care influenţează numărul, activitatea şi natura
microorganismelor din sol sunt:
- apa şi umiditatea asigurată de aceasta; solurile foarte uscate şi cele foarte
umede limitează dezvoltarea microorganismelor. Bacteriile devin inactive
când solul argilos conţine mai puţin de 12% apă. Fungii sunt mai rezistenţi la
uscăciune (de aceea unele boli fungice sunt limitate la anumite regiuni);
- aerarea nu este uniformă în sol, de aceea solul este o colecţie de
microhabitate aerobe şi anaerobe;
- temperatura este variabilă în straturile de la suprafaţa solului, datorită razelor
solare, prezentând variaţii diurne şi sezoniere;
- pH-ul solului este cuprins între 4,8 – 8,5 şi este influenţat de activitatea
microorganismelor din sol (de exemplu degradarea litierei poate determina un
pH acid);
- adâncimea solului influenţează densitatea microorganismelor prin variaţia
concentraţiei de O2, CO2, a nutrienţilor, a umidităţii. Frecvenţa
microorganismelor în sol scade cu adâncimea, cele mai multe se găsesc în
stratul de suprafaţă.
Bacteriile sunt cele mai mici, mai numeroase şi mai diverse microorganisme din
sol (ca formă, modalitate de nutriţie, condiţii de supravieţuire). Predomină bacteriile
Gram negative. Bacteriile prezintă un pleomorfism accentuat faţă de morfologia descrisă
drept clasică. Valorile medii determinate prin diverse metode ar fi de 10 6–109 celule/g sol
uscat prin tehnica de cultivare a celulelor viabile, ajungând până la 1010 celule prin
determinarea numărului total de celule (vii şi moarte).
De cele mai multe ori, bacteriile se găsesc sub formă de microcolonii pe diferite
resturi vegetale, adsorbite pe argile şi pe humus. Tehnicile de apreciere a numărului de
bacterii din sol prin cultivare în laborator reflectă în general numai 1 – 10% din situaţia
reală, deoarece nici un mediu de cultură nu poate satisface enorma diversitate a
exigenţelor lor nutriţionale (Mihăescu, 2000).
În sol se găsesc bacterii implicate în circulaţia carbonului, azotului
(Nitrosomonas, Nitrobacter, Azotobacter, Rhizobium), fosforului (Bacillus megaterium),
sulfului (Thiobacillus thiooxidans, Desulfovibrio), fierului (Gallionella, Siderocapsa),
bacterii implicate în formarea şi degradarea humusului, în solubilizarea compuşilor
organici şi anorganici, inaccesibili plantelor. La acestea se adaugă microorganisme
heterotrofe, relativ constante în toate solurile: Acinetobacter, Achromobacter,
Agrobacterium, Alcaligenes, Arthrobacter, Bacillus, Brevibacterium, Cellulomonas,
Chromobacterium, Clostridium, Corynebacterium, Flavobacterium, Micrococcus,
Mycobacterium, Pseudomonas, Sarcina, Staphylococcus, Streptococcus, Xanthomonas.
Bacteriile din sol participă la procesele de mineralizare, esenţiale pentru nutriţia
plantelor şi asigurarea fertilităţii solului. Prin polizaharidele extracelulare participă la
agregarea particulelor de sol şi la formarea humusului.
Actinomicetele sunt în număr de 105 – 108 celule/g sol şi sunt prezente în sol de
regulă sub formă de spori, fiind mai numeroase în straturile de la suprafaţa solului. Sunt
filamentoase, nu se dezvoltă dacă pH-ul scade sub 5,0; preferă solurile bogate în
substanţe organice. Actinomicetele se caracterizează printr-o rezistenţă deosebită la
uscăciune.
Se dezvoltă lent, heterotrof, utilizând surse de carbon simple sau complexe
(glucide, acizi organici, polizaharide, hidrocarburi alifatice, aminoacizii, peptonele).
Degradează celuloza (Streptomyces violaceus, Streptomyces cellulosae), lignina, chitina,
parafinele, fenolii. Cele mai frecvente specii aparţin genurilor: Actinomyces,
Actinoplanes, Nocardia, Streptomyces.
Actinomicetele au rol în mineralizarea compuşilor rezistenţi la acţiunea bacteriilor
şi fungilor (chitina), contribuie la formarea humusului şi produc o gamă largă de
substanţe antibiotice (streptomicină, kanamicină, micostatină), contribuind într-o mare
măsură la echilibrul microbian al solului. Unele dintre ele sunt fitopatogene.
Cianobacteriile se dezvoltă în stratul superior, iluminat al solului. Se pot
dezvolta şi la întuneric, chemoorganotrof, transformând compuşi organici simpli,
esenţiali pentru fertilitatea solului. Dintre cianobacterii, mai frecvent întâlnite în sol sunt
cele din genurile: Anabaena, Calothrix, Chrococcus, Nodularia, Nostoc, Oscillatoria,
Phormidium, Plectonema, Scytonema.
Fungii reprezintă o parte importantă din biomasa microbiană din sol, datorită creşterii
hifale, dar numărul lor este mai mic decât cel al bacteriilor. Se apreciază că numărul unităţilor
fungice variază între 20.000 şi 1.000.000/g de sol. După unii autori, fungii din sol aparţin la peste
600 de specii, din clasele Phycomycetes, Ascomycetes, Fungi Imperfecti; foarte frecvenţi sunt cei
din genurile: Mucor, Rhizopus, Pythium, Chaetomium, Morchella, Alternaria, Aspergillus,
Cladosporium, Fusarium, Penicillium.
Ciupercile sunt microorganisme cu metabolism predominant aerob, adaptate să trăiască
pe substraturi cu un conţinut relativ mare de substanţă bogată în energie şi conţinut redus de azot
mineral. Sunt microorganisme libere sau asociate cu rădăcinile plantelor. Degradează o gamă
largă de substanţe organice (proteine, celuloză, lignină), printr-un proces mai lent decât cel
bacterian, desfăşurat în mai multe etape. Când nutrienţii lipsesc, trec în stare de latenţă. Preferă
mediile neutre sau acide. Unele ciuperci sintetizează antibiotice active asupra bacteriilor,
ciupercilor, chiar şi substanţe toxice sau cancerigene. Alte ciuperci sunt patogene pentru plante.
Algele sunt abundente în habitatele umede şi iluminate de la suprafaţa solului şi până la
adâncimea de câţiva centimetri. Activitatea lor e puţin semnificativă pentru transformările
biochimice din sol. Algele verzi sunt mai frecvente în solurile acide (Chlorella, Chlamydomonas,
Pleurococcus, Ulothrix). Unele specii sunt specifice pentru sol (de exemplu Chlorococcus
humicola).
Dezvoltarea intensă a algelor pe suprafaţa solului umed îl îmbogăţeşte în materie
organică rezultată prin fotosinteză.
Protozoarele din microbiota permanentă sunt prezente mai ales la suprafaţa solului umed
şi în stratul superficial (până la 15 cm). Numărul lor variază între 10.000 – 3.000.000/g sol, dar ca
biomasă sunt mai importante decât bacteriile. Pot prezenta fluctuaţii mari de la o zi la alta, în
funcţie de temperatură, umiditate, disponibilitatea nutrienţilor. Unele protozoare utilizează
compuşi organici solubili, altele au nutriţie de tip animal, ingerând materie organică complexă
(bacterii, alge sau chiar protozoare).
Cele mai răspândite protozoare din sol fac parte din clasa Sarcodina (Acanthamoeba,
Amoeba, Nuclearia), clasa Flagellata (fitomastigofore şi zoomastigofore) şi din clasa Ciliata
(Balantidium, Colpidium, Oxytricha, Vorticella). Protozoarele au rol în menţinerea echilibrului
biologic al solului, corelat cu capacitatea lor de a ingera şi distruge o serie de bacterii.
Zona de interacţiune între rădăcinile plantelor şi sol este reprezentată de
rizosferă. Rizosfera este definită cu ambiguitate, drept regiunea din sol care conţine
rădăcinile unei plante şi microorganismele care le însoţesc.
Rizosfera se poate extinde cu 2 cm de la suprafaţa rădăcinii în teritoriul bogat în
nutrienţi (aminoacizi, glucide, vitamine) pentru care competiţionează microorganismele
permanente din sol. Limitele rizosferei depind de cantitatea de substanţe exudate din
rădăcini, de proprietăţile fizice şi chimice ale solului, care influenţează numărul şi natura
microorganismelor. Rizosfera este o regiune periradiculară care conţine un gradient de
microorganisme şi de activităţi mai importante în solul adiacent sistemului radicular,
diminuând progresiv pe măsură ce distanţa faţă de acesta creşte.
În rizosferă are loc o intensă activitate microbiană, care influenţează creşterea
plantelor. Frecvent bacteriile de pe rădăcinile plantelor sunt asociate cu hifele fungilor.
Rădăcinile plantelor eliberează un exudat cu o compoziţie complexă, cu efect stimulator,
descris sub denumirea de efect de rizosferă. Cele mai frecvente substanţe din exudat sunt
glucidele (glucoză, fructoză, xiloză, maltoză, rafinoză, arabinoză, zaharoză), aminoacizii
(alanină, acid aspartic, glicocol, leucină, valină, serină, fenilalanină, cisteină, metionină,
lizină, triptofan, treonină), acizii organici (acetic, propionic, butiric, oxalic, citric, tartric,
fumaric, glicolic, malic, succinic), vitaminele (biotină, tiamină, niacină, acid pantotenic,
piridoxină, mezoinositol), factorii de creştere (auxine). Prezenţa microorganismelor
stimulează producerea de exudate. Rizosfera stimulează multiplicarea bacteriilor şi
fungilor.
Bacteriile din rizosferă sunt reprezentate predominant de bacili Gram negativi şi
de un număr mic de coci, bacili şi bacterii pleomorfe Gram pozitive. Numărul bacteriilor
din rizosferă este estimat la 5x106 – 1x109 celule/g sol.
Microorganismele exercită asupra plantelor numeroase efecte, unele benefice,
altele negative.
Diferitele grupe de microorganisme din sol produc variate procese biochimice,
care au o influenţă directă asupra productivităţii şi dezvoltării plantelor.
Microorganismele facilitează absorbţia nutrienţilor din sol, mai ales atunci când aceştia
sunt factori limitanţi pentru creştere. Desfăşoară permanent o acţiune de reciclare şi
solubilizare a nutrienţilor minerali. În ceea ce priveşte activitatea biochimică a bacteriilor
din sol, pot fi descrise următoarele procese biochimice:
- descompunerea aerobă şi anaerobă a celulozei, de către bacterii
celulozolitice;
- descompunerea aerobă şi anaerobă a substanţelor proteice şi a altor
compuşi organici azotoşi este realizată de bacterii şi ciuperci din sol; se
realizează de către bacteriile nitrificatoare (nitribacterii şi nitratbacterii);
- reducerea azotaţilor la azot molecular este realizată de către bacterii
denitrificatoare şi are un efect negativ asupra plantelor, deoarece azotul
asimilabil se transformă în azot atmosferic inaccesibil plantelor; pentru
evitarea acestui proces solul trebuie bine lucrat;
- fixarea azotului atmosferic este produsă de bacteriile fixatoare de azot,care
folosesc drept sursă de carbon substanţe organice fără azot, fixând azotul din
atmosferă şi utilizându-l pentru sinteza diferitelor componente celulare. O
parte din azotul fixat este eliberat în mediul ambiant, iar o parte este
mineralizată, după moartea bacteriilor, de către bacteriile de putrefacţie şi
trece într-o formă accesibilă plantelor superioare. Rolul bacteriilor fixatoare
de azot în bilanţul compuşilor azotoşi este deosebit de mare. Bacteriile
fixatoare de azot pot fi bacterii libere (Azotobacter, Clostridium) sau
simbiotice (Rhizobium).
- formarea şi descompunerea substanţelor humice din sol se realizează în
urma activităţii vitale a diferitelor microorganisme din sol (bacterii,
actinomicete, ciuperci), care determină nu numai structura solului, ci şi
rezervele humice din sol.
- transformările compuşilor sulfului şi fosforului sunt realizate în general de
bacterii, care descompun proteinele eliberând sulf sub formă de hidrogen
sulfurat şi fosfor sub formă de acid fosforic. Aceşti compuşi pot fi oxidaţi de
sulfobacterii şi de tiobacterii, transformând hidrogenul sulfurat toxic în sulfaţi
accesibili plantelor.
- oxidarea hidrocarburilor se realizează sub acţiunea microorganismelor până
la CO2 şi apă;
- metabolizarea polizaharidelor se realizează sub acţiunea a numeroase
enzime; bacteriile secretă la exterior enzime care scindează polizaharidele în
molecule mai mici, metabolizate apoi intracelular (amidonul sub acţiunea
amilazelor extracelulare este transformat în maltoză, iar aceasta, sub acţiunea
maltazei, în glucoză). Enzimele capabile să descompună mono şi
oligozaharidele sunt frecvente în lumea microbiană, mai rar se întâlnesc
enzimele capabile să descompună polizaharidele. De exemplu, amidonul este
descompus de către o microbiotă nespecifică, în care bacteriile anaerobe din
genul Clostridium sunt foarte active.
Interacţiunile nutriţionale cele mai cunoscute dintre plante şi microorganisme sunt
cele de tipul simbiozelor (simbioze fixatoare de azot şi micorize). Fungii din micorize
exercită un efect benefic asupra plantelor prin stimularea creşterii şi ramificării
rădăcinilor, creşterea rezistenţei la infecţii, explorarea unui volum mai mare de sol prin
dezvoltarea hifelor.
Microorganismele pot exercita efecte negative asupra plantelor atunci când intră
în competiţie cu acestea pentru factorii nutritivi minerali sau pentru oxigen, când
intensifică activitatea unor agenţi patogeni sau produc substanţe fitotoxice.
Rolul microorganismelor este determinat nu atât de greutatea lor, cât de suprafaţa
lor activă, care vine în contact cu solul.
Simbioza