Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs 1 - 2 - Biochimie - 2023
Curs 1 - 2 - Biochimie - 2023
BIOCHIMIE
- note de curs-
2 ore curs +
2 ore laborator/seminar
Laboratorul se face în sedințe de câte 4 ore timp de 7 saptămâni
Examen scris – 70 %
Laborator (obligatoriu) – 30 %
Credite examen - 4
Recuperările - pe parcursul semestrului.
BIBLIOGRAFIE
1. Atanasiu V., Mohora M., Duta C., Gilca M., Muscurel C., Popa C., Virgolici B., Biochimie medicala,
Partea I, Editura Universitatea Carol Davila, 2017, București, ISBN 9789737089953,
2. Lîsîi L., Biochimie medicală, Universitatea de Stat de Medicină şi Farmacie “N. Testemițanu”,
Chișinău 2007
3. Anghel A., Şeclăman E., Tămaş L., Sîrbu I.-O., Marcu A., Biochimie medicală pentru studenţii
facultăţilor de medicină. Materia vie – structură şi compoziţie, Editura Victor Babeş 2016,
Timişoara, ISBN 978-606-786-016-0.
4. Dinu V., Truția E., Popa-Cristea E., Popescu A., Biochimie medicală: mic tratat- Editura medicală,
București, 1998, ISBN 973-39-0299-3.
5. *** BIOCHIMIE MEDICALĂ – material suport de curs în format electronic pentru studenţii
Facultăţilor de Medicină şi Asistenţă Medicală.
Evaluare
Pondere din
Tip de activitate Criterii de evaluare Metode de evaluare
nota finală
Corelarea aspectelor structurale cu cele funcționale.
Curs Examen scris 70%
Rigoarea științifică a limbajului
Corelarea cunoștințelor dobândite la curs cu aspectele
practice Examinare practica
Seminar/laborator Prezentarea corectă a principiilor analizelor de laborator (oral) + Portofoliu de 30%
Efectuarea lucrărilor practice și interpretarea corectă a lucrări practice
rezultatelor.
Standard minim de performanţă
Pentru obținerea notei 5 la examenul scris, studentul trebuie să fie capabil să identifice clasa de compuşi din care face
parte o structură particulară biochimică dată, să cunoască principalii compuşi biochimici din fiecare clasă şi
proprietățile/rolurile lor biologice, să cunoască principalele căi metabolice din metabolismul glucidic, lipidic şi proteic,
noţiuni fundamentale de energetică biochimică, mecanismele de acţiune şi rolurile biologice ale principalelor clase de
hormoni.
Pentru obținerea notei 5 la examinarea practică, studentul trebuie: să recunoască aparatura folosită în laboratorul de
biochimie, să stie să o folosească,să efectueze toate lucrările de laborator și să elaboreze/prezinte portofoliul de lucrări
practice.
Recuperarea laboratoarelor şi se poate face in regim de consultaţii in timpul semestrului. In cazuri bine motivate (boală),
recuperarea orelor de laborator se mai poate face prin prezentarea de către student a portofoliului complet de lucrări
practice - in ultima saptămână din semestrul I.
Curs 1
• Obiectul biochimiei. Noţiuni introductive. Corelația cu alte
științe.
• Compoziţia chimică generală a organismului uman.
• Apa. Proprietățile apei.
Biochimia. Originile biochimiei
• Bios – viaţă (în limba greacă)
• Biochimia - ştiinţa care studiază bazele moleculare ale vieţii.
• 1828, F. Wöhler: sinteza in vitro a ureei (sinteza Wöhler).
• 1833, descoperirea primei enzime, amilaza, de către chimistul francez Payen.
• 1897, cercetătorii germani Eduard si Hans Buchner: fermentaţia fără celule
• Termenul biochimie a fost aplicat pentru prima dată în 1903, de către Carl Neiberg.
• 1926, J. Sumner a cristalizat ureaza
• 1944, Colin, McLeod şi McCarty au demonstrat că acizii nucleici de tipul dezoxi sunt
factorul determinant în transformănrile extractului de pneumococi III
• 1953, Watson şi Crick - structura tridimensională a DNA
• 2003, secvențierea genomului uman - “Human Genome Project”
Biomolecule
Repartiția apei în organism (după Gamble) • Din sectorul extracelular mai fac parte limfa (interstițială și
din vasele limfatice), fluidele din țesuturile conjunctive,
fluidele din oase și fluidele transcelulare.
La adult, apa extracelulară reprezintă 20% din greutatea corporal, fiind depozitată în mai multe
compartimente: intravascular, interstiţial, transcelular, şi cel din ţesutul conjunctiv dens - cartilaje şi vase.
a) Compartimentul intravascular: conţine plasma sanguină şi limfa. Acesta reprezintă 5% din greutatea
corporală cantitatea lor poate fi determinată fie cu ajutorul unor substanțe colorante (albastru Evans, rosu de
Congo) fie cu ajutorul albuminei marcate.
b) Compartimentul interstiţial: reprezintă adevăratul “mediul intern” al organismului. Este vorba de un
ultrafiltrat plasmatic, care scaldă celulele, separat de compartimentul intravascular prin membranele capilare.
Acestea permit o circulaţie hidroelectrolitică liberă, dar se opun ieşirii proteinelor din vase. Cantitatea de apă
din compartimentul interstiţial este dedusă prin scăderea volumului plasmatic din cel extracelular. Se admite
ca ea reprezintă 15% din greutatea corporală.
c) Compartimentul transcelular: se referă la lichidul cefalorahidian, la mediile lichidiene oculare şi articulare şi
la lichidele din seroase şi toate însumează aproximativ 200 ml sau 1,5 % din greutatea corporală.
În acelaşi compartiment sunt înglobate şi secreţiile glandelor digestive. Acestea, aproximate la un total zilnic
de 6-8 l, se resorb aproape complet la nivelul diverselor segmente ale tubului digestiv.
d) Compartimentul hidric din ţesutul conjunctiv dens (cartilaje şi oase) reprezintă aproximativ 10% din
greutatea corporală. Apa acestui compartiment se deplasează lent şi are schimburi foarte reduse cu restul
lichidelor organismului.
APORTUL DE APĂ ÎN ORGANISM poate avea provenienţă:
Exogenă - din digestia apei ca atare sau sub forma apei conţinute în alimente (2000ml/24 ore).
Endogenă: din oxidarea principiilor mediate în cadrul metabolismului intermediar.
Ex. din metabolismul a 100 g proteine rezultă 46 ml apă; din 100 g lipide rezultă 107 ml apă și din
100 g glucide rezultă 55 ml apă.
Există o interdependenţă între cantitatea de apă formată şi cea eliminată.
Eliminarea apei se face pe cale pulmonară, cutanată, digestivă şirenală.
a) prin perspiraţie insensibilă (saturarea cu vapori de apă a aerului expirat) se pierd zilnic
aproximativ 400 ml apă. Această cantitate este mult depasită în stări patologice însoţite de febră.
b) prin perspiraţie sensibilă (evaporare transcutanată) se pierd zilnic între 200-500 ml apă.
Intensitatea pierderilor prin perspiraţie insensibilă şi sensibilă nu poate fi reglată.
c) prin eliminări hidrice digestive: sunt minime la omul normal. Prin fecale se elimină
aproximativ 150ml/24 ore.
d) prin eliminări hidrice renale: sunt egale în medie cu 1500 ml/24 ore (cu variaţii între
700-1700ml/24 ore. Ele reprezintă elementul reglabil şi cel mai nobil al pierderilor lichidiene.
Această eliminare de apă este reglată pe cale hormonală de către hormonul antidiuretic (ADH) şi
prin aldosteron.
EXCESUL DE APĂ
Când aportul de apă depășește capacitatea de excreție renală în organism se creează condiții
pentru exces de apă în organism. În mod normal, această situație nu are loc datorită bunei
funcționări a hipofizei posterioare, rinichilor și adrenalelor (glande suprarenale).
Condiții în care apa din organism se acumulează în exces:
- secreție mare de hormon antidiuretic (vasopresină) produs de hipofiza posterioară;
- insuficiență corticosuprarenală;
- insuficiență renală acută;
- boală de inimă congestivă severă;
- ciroza ficatului
- ingerarea exagerată de lichide.
Pierderea în exces a apei, deficitul de apă sau deshidratarea pot duce la stări grave, la
coma și exitus. Ele pot apărea în:
-secreții sudorale excesive (efort fizic exagerat, temperaturi mari), în probleme
digestive grave (vărsături sau diaree prelungite),
-diureza exagerată (diabet zaharat decompensat, diabet insipid, infecții renale
grave)
-pneumopatii cu polipnee accentuată
- aport insuficient de apă
- come prelungite în care e perturbat mecanismul setei.
Proprietățile apei (1)
• Apa este un compus chimic al hidrogenului şi al oxigenului, cu formula chimică H2O.
• La temperatura obișnuită, apa se prezintă ca un lichid incolor, transparent, gust și miros.
Densitatea maximă a apei este la 4 grade Celsius (1 g/cm3).
• Apa este un solvent foarte bun atât pentru săruri, cât și pentru glucide și pentru gaze.
Dacă apa nu ar fi un solvent foarte bun pentru gaze, atunci nici animalele acvatice și nici
animalele terestre nu ar putea respira.
Legatura de
hidrogen în apă Asocierea molecule de apă prin
Dipolul unei molecule de apă legături de hidrogen
Reţeaua moleculară a apei în stare solidă prezintă un numar
aproape dublu de legături de hidrogen decât a apei în stare
lichidă. Acest lucru este explicat de faptul ca cei doi atomi de
hidrogen legaţi covalent de oxigen formează două legături de
hidrogen cu moleculele vecine.
Deoarece cele doua covalenţe din apă au o anumită orientare
(un unghide 105°), moleculele de apă sunt orientate în
cristalul de gheaţă dupa o schema tetraedrică. Din cauza
acestei aşezări a moleculelor, cristalul de gheaţă are o
structură afânată(cu goluri). Structura internă a gheţii explică
unele anomalii ale apei, de ex. densitatea gheţii mai mică
decât a apei lichide si creşterea volumului prin solidificarea
(îngheţarea) apei
Structura afânată a gheţii D.p.d.v. energetic, legăturile de hidrogen sunt mult mai slabe
decât cele chimice.
Pentru desfacerea unei legături de H se cheltuiesc 4.5
kcal/mol, în timp ce pentru desfacerea legăturii O-H se
cheltuiesc 110 kcal/mol.
Proprietățile fizice ale apei
• Legăturile de hidrogen sunt motivul pentru multe proprietăți speciale ale apei, precum faptul că
forma sa solidă este mai puțin densă decât forma sa lichidă, punctul de fierbere de 100 °C este
relativ mare pentru masa sa moleculară mică, și capacitatea termică, care este ridicată.
• Capacitatea termică mare face ca apa să poată primi sau ceda o cantitate apreciabilă de căldură
fără a-și modifica semnificativ propria temperatura.
Dacă în mediu intern nu ar fi apa care sa inmagazineze o cantitate mare de caldura fara a-și schimba
temperatura, caldura eliberată în numeroase reacții metabolice ar determina denaturarea multor
macromolecule celulare (proteine, enzime, acizi nucleici), contribuind astfel la modificarea structurii lor
tridimensionale, ceea ce ar antrena pierderea unor functii biologice importante.
• Apa are o mare căldura de vaporizare. Evaporarea unui litru de apă prin piele și prin mucoasa
căilor respiratorii face ca sa se piardă 580 kcal din căldura corpului.
Supraincalzirea corpului este preîntâmpinată de căldura mare de vaporizare a apei, fapt care
contribuie la asigurarea desfășurării normale a proceselor biologicc din organism.
• Conductibilitatea termică a apei este foarte mare, ceea ce contribuie la răspândirea căldurii din
regiunile situate în profunzimea corpului spre exterior.
• Apa este un solvent excelent pentru compușii ionici și pentru compușii polari, cu greutate
moleculară mică, de ex. alcooli, zaharuri, uree. Cu alte cuvinte, compușii ionici și compușii polari
neionici sunt ușor solubili în apă.
• Presiunea osmotică este o măsură a tendinței de molecule de apă să migreze dintr-o soluție
diluată într-o soluție concentrată printr-o membrană semipermeabilă. Această migrare a
moleculelor de apă este numită osmoză.
• O soluție care conține 1 mol de particule dizolvate în 1 kg de apă este o soluție mono-osmolară
(osmol).
• În plasma sanguină, concentrația totală normală a substanțelor dizolvate este constantă (275 -
295 osmol).
• Apa este o substanță amfoteră (numit și amfolit), ceea ce înseamnă că poate funcționa atât ca
acid, cât și bază, adică produce ionii H+ (H3O+) și ioni HO- prin ionizare (proces denumit
și autoprotoliză sau autoionizare). – vezi seminarul/laboratorul 3
H2O + H2O ↔ H3O+ + HO- echilibru de auprotoliză a apei
Ion ion
hidroniu hidroxil
Curs 2
• Sărurile minerale.
• Biomolecule organice
• Legături chimice ale biomoleculelor
• Organizarea moleculară a materiei vii
SĂRURILE MINERALE
- nu constituie o sursă de energie pentru organism, dar sunt indispensabile vieţii.
- reprezintă 3-5% din greutatea corpului, dintre care 4/5 se găsesc în schelet, iar restul în muşchi şi în
celelalte ţesuturi.
- Ex. cloruri, fosfaţi, azotaţi, carbonati de sodiu, potasiu, calciu, magneziu etc.
- sunt eliminate zilnic prin urină, deci ele trebuie readuse zilnic în organism prin alimente.
- pot exista sub două forme:
- săruri minerale solubile, pe care le găsim dizolvate în lichidele biologice şi în mediul apos al
celulei sau combinate cu proteinele din citoplasmă.
Ionii proveniţi prin disocierea sărurilor solubile se pot adsorbi pe suprafaţa micelelor coloidale
determinând încărcarea electrică a acestora sau pot interveni în diferite reacţii biochimice. Unii ioni
intervin în reglarea presiunii osmotice şi în permeabilitatea celulară.
Unele săruri solubile (ex. carbonați, fosfați) funcţionează ca sisteme tampon contribuind la menţinerea
şi reglarea echilibrului acido-bazic (K, Ca, Na, Mg – reglează alcalinitatea; P, S, C - aciditatea).
Prezenţa unor ioni este indispensabilă pentru activitatea unor enzime (ex. ioni de Fe, S, Mg etc.) sau
hormoni (ex. Zn, Cu Co, Mn, iod)
- săruri minerale puţin solubile sau insolubile, imobilizate sub formă de structuri, ex. în
schelet şi în dinţi.
• Prin dizolvarea în apă, sărurile minetale se disociază în ioni care posedă sarcină electrică pozitivă
(cationi) și negativă (anioni), de aceea se mai numesc și electroliți.
• Electroliți disociază în ioni, fie în urma unor reacții fizice (electroliți ionofori) sau a unor reacții
chimice (electroliți ionogeni).
• ELECTROLIȚI IONOFORI – alcătuiți din ioni și în stare pură (Ex. săruri).
• Un exemplu este clorura de sodiu (NaCl) care disociază în ioni de sodiu (Na+) încărcați pozitiv și (Cl-)
încărcați negativ, prin dizolvare în apă.
Electroliți ionogeni – sunt alcătuiți din molecule și dau naștere la ioni în urma reacției
chimice în soluție (Ex. acizi, baze)
• Acidul este un compus chimic care pune în libertate într-o soluție ioni de hidrogen
(protoni).
Ex. acid clorhidric, acid lactic – sunt acizi din corpul uman
• Compusul chimic care preia dintr-o soluție ioni de hidrogen și determină un exces de
ioni hidroxil (OH-), se numește bază.
Ex. amoniacul (NH3), bază din corpul uman.
• Contribuie la procese de morfogeneză (ţesut osos, ţesut cartilaginos, ţesut conjunctiv etc.);
• Servesc ca material plastic, intră în componenţa celulelor (Ca, P, Mg, F, Na, K);
• Sunt activatori sau inhibitori în diferite reacţii enzimatice;
• Asigură menţinerea echilibrului acido-bazic (K, Ca, Na, Mg – alcalinitatea; P, S, Cl - aciditatea) ;
• Asigură menţinera izotoniei şi izoioniei lichidelor organismului;
• Mineralele sunt responsabile și pentru echilibrul apei în organism, pentru transmiterea de impulsuri
în nervi și mușchi ;
• Influențează sistemele coloidaleale organismului, participând la metabolismul hidric (Na, K);
• Menţinerea stării fizico-chimice normale a coloizilor din organism şi a presiunii coloid-osmotice
(presiunea data de proteinele din plasma);
• Formarea sistemelor tampon fiziologice și realizarea sistemelor bioelectrice;
Rolul compuşilor minerali în organism (2)
• Intră în compoziţia unor efectori chimici: Co în vitamina B12, iod în hormoniii tiroidieni
• Intră în compoziţia unor hormoni (Zn, Cu, Co, Mn);
• Influențează secreţia fermenţilor aparatului digestiv, în special al stomacului;
• Influențează activitatea sistemului nervos central, ex. Mg grăbeşte procesul de inhibiţie, contribuind
la micşorarea excitaţiei nervoase;
• Influențează coagularea sângelui, și intervine în contracţia musculară (Ca);
• Contribuie la eliminarea din organism a diverselor substanţe toxice.
Mineralele se împart în două categorii:
• Minerale esenţiale (macrominerale, macroelemente): calciu, magneziu,
sodiu, potasiu, fosfor şi clor. Se gasesc in aproximativ toate celulele
organismului si sunt implicate in mentinerea homeostazei generale si
functionarea normala a organismului. Dezechilibrele acute ale acestor
minerale pot avea potential letal.
• Doi atomi de С se pot combina între ei sau cu alte elemente, conjugând două perechi de
electroni (4 electroni), cu formarea de legături covalente duble.
• Ex. legăturile dintre atomii de carbon care formează catenele hidrocarburilor din
biomolecule sunt nepolare.
H2O NH3
Hδ+ - Clδ-
• Deși, fiecare atom pune în comun câte un electron pentru a forma legătura, perechea de
electroni este atrasă mai mult către atomul mai electronegativ.
Ex. legăturile C-O, C-N, C-S sunt legături polare
• Aceste legături conferă biomoleculelor un înalt grad de reactivitate chimică, fiind mai
ușor supuse transformărilor în procesele metabolice.
Legătura covalent-coordinativă
• Legătura coordinativă este o legătură de tip covalent care se realizează prin intermediul unei
perechi de electroni (electroni neparticipanți) care provine de la un singur atom, cel de al doilea
atom participant la legătură fiind doar beneficiarul comun al acestei perechi de electroni.
• Atomul sau ionul care cedează perechea de electroni neparticipanţi se numeşte donor, iar atomul
sau ionul care acceptă această pereche de electroni se numeşte acceptor. De aceea, legătura
coordinativă se mai numește și legătură donor-acceptor.
Ex. 1: Structura ionului complex de NH4+ cu structură tetraedrică.
H H + H +
.. .. ..
N + H+
H .. N
H .. H sau H N H sau NH +
.. 4
H H H
H + H +
.. .. +
H O
..
+
H +H O H sau O H , sau H3O
..
H H
• Similar, in cazul interacţiunii dintre o amină (R—NH2) şi un acid
oarecare :
• Ionul format se numeşte ion complex, iar combinaţia astfel rezultată se numeşte
combinaţie coordinativă.
• Clorofila și hemoglobina, sunt combinații complexe cu structuri complicate care au în
compoziția lor, magneziu (clorofila) și respectiv fierul (hemoglobina).
Legături sau interacțiuni non-covalente
• Pot să apară între atomii anumitor grupe funcționale în cadrul unei biomolecule sau între diferite
biomolecule.
• Ele nu depind de electronii partajați, ci mai degrabă de forțele de atracție electrice între atomii
biomoleculelor.
• Sunt legături slabe, la formarea lor se degajă foarte puțină energie 4 - 20 kJ/mol, din care cauză
ele ușor pot fi rupte și reformate. Această caracteristică permite legăturilor non-covalente să
medieze interacțiunile dinamice dintre diferite biomolecule in celulă. Chiar dacă aceste legături
individual sunt slabe, când sunt în număr mare forțele lor de atracție sunt aditive.
• Această legătură este mult mai trainică decât cea covalentă, însă la contactul cu apa ea ușor se
rupe datorită fenomenului de disociere.
• În cazul biomoleculelor ionizate care deja posedă atomi ionizați pozitiv sau negativ,
legătura ionică apare în rezultatul atracției electrostatice dintre ei.