Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
1
Platforma Moodle: http://curs.pub.ro
Evaluare
Activitate individuală
20% din nota finală
(teme de rezolvat)
30% din nota finală,
din care:
Activitate de 15% - prezenta la toate laboratoarele (obligatorie!) +
laborator încărcare rezultate experimentale pe platforma
Moodle
15% - nota colocviu de laborator
50% din nota finală
Examen final - test grila de 45 de intrebari cu 3 raspunsuri din care
1 corect.
2
Ce este biochimia?
3
Biochimia descrie:
structura şi proprietăţile compuşilor materiei vii;
transformările acestor compuşi în organism;
relaţiile între diferitele etape metabolice.
4
Capitolul Conţinuturi Nr. de ore
Introducere.
1.1 Compoziţia chimică a sistemelor vii.
1. 4
1.2 Organizarea moleculara a sistemelor biologice.
1.3 Termodinamica proceselor biochimice
Apa în procesele biochimice.
2.1 Structura şi proprietăţile fizico-chimice ale apei;
2. 2
2.2 Rolul apei. Influenţa activităţii apei asupra reacţiilor chimice şi biochimice.
2.3 pH si solutii tampon
Proprietăţile fizico-chimice şi funcţionale ale glucidelor.
3.1 Glucide. Răspândire şi importanţă.
3. 3.2 Monoglucide. Structură, izomerie. Proprietăţi fizico-chimice. 6
3.3 Oligoglucide. Reprezentanţi.
3.4 Poliglucide. Reprezentanţi.
Proprietăţile fizico-chimice şi funcţionale ale proteinelor.
4.1 Proprietăţile fizico-chimice ale aminoacizilor.
4. 4.2 Clasificarea proteinelor. 4
4.3 Proprietăţile funcţionale ale proteinelor. Activitatea chimică a proteinelor.
4.4 Organizare structurala la nivel supramolecular.
Proprietăţile fizico-chimice şi funcţionale ale lipidelor.
5.1 Structura şi proprietăţile fizico-chimice a lipidelor.
5. 5.2 Acizii graşi, gliceride, lipide complexe. 4
5.3 Proprietăţile funcţionale a lipidelor. Interacţiuni hidrofobe.
5.4 Modificarea lipidelor prin hidroliză, degradarea oxidativă şi degradarea termică.
Enzime.
6.1 Natura şi structura enzimelor. Clasificarea, nomenclatura şi simbolistica.
6. 6.2 Proprietăţile fizico-chimice şi catalitice. Specificitate. Cinetica reacţiilor 4
enzimatice.
6.3 Coenzime. Nomenclatură şi clasificare. Structură. Proprietăţi.
Procese biochimice de transformare a polizaharidelor.
7. 7.1 Metabolismul glucidelor. Procese anabolice. Chimiosinteza. Fotosinteza. 4
7.2 Biosinteza oligoglucidelor şi poliglucidelor. Catabolismul glucidelor.
NR. TOTAL DE ORE 28
5
Bibliografie
6
Istoria biochimiei
10
Albert Lester Lehninger (17 feb. 1917–4 mar. 1986) - biochimist
american.
A fost profesor la University of Wisconsin–Madison, University of
Chicago si Johns Hopkins University din Baltimore.
Este autorul celor mai importante tratate de biochimie adunate sub
denumirea “Principiile biochimiei - Principles of biochemistry”.
11
Lehninger a enuntat o serie de axiome care stau la baza existentei si
functionarii organismelor vii:
13
Materia vie este formată din două grupe principale de substanțe:
- substanţe anorganice reprezentate de apa si saruri minerale;
- substanţe organice reprezentate de: glucide, lipide, protide, acizi nucleici, vitamine,
hormoni, pigmenţi, enzime.
Peste 99% din atomii prezenti in organismele vii sunt asigurati de numai 4 elemente:
carbon, oxigen, hidrogen si azot.
Hidrogenul si oxigenul sunt constituenti ai apei ce formeaza circa 60-70% din masa
celulelor.
Carbonul, hidrogenul, oxigenul si azotul sunt constituentii principali ai compusilor
organici de care depind procesele fundamentale ale vietii;
Pe langa acestea compusii organici din organismele vii mai contin sulf si fosfor.
Cele sase elemente chimice sunt esentiale pentru toate organismele vii.
Al doilea grup de elemente, care reprezinta circa 0.5% din masa celulelor sunt ionii
anorganici constituiti din metale alcaline (sodiu si potasiu), metale alcalino-
pamantoase (magneziu si calciu) si clor. Clorul se gaseste intotdeauna in forma
ionica in componenta celulelor.
Cele doua grupuri constituie grupul macroelementelor.
14
Al treilea grup este constituit din elemente prezente in cantitati foarte mici dar care sunt
esentiale in functionarea organismelor avand in special un rol biocatalitic in procesele
metabolice din organisme: fier, zinc, cupru, mangan, cobalt, etc. De asemeni iodul si
seleniul intra in aceasta categorie. Toti acesti compusi fac parte din grupul
microelementelor (sau oligoelemente).
Sub formă de atomi liberi pot exista numai gazele nobile, din grupa a VIII
principală. Stratul lor de valenţă este complet ocupat cu electroni.
Toate celelalte elemente tind spre configuraţii de gaz nobil, indiferent dacă
acest fapt se manifestă prin cedare sau acceptare de electroni sau prin punere
în comun de electroni.
18
Atomul de carbon
Hibridizarea
Tăria unei legături este cu atât mai mare cu cât întrepătrunderea orbitalilor este mai
mare.
Nu există nici o dovadă că legăturile covalente formate ar diferi în vreun fel din punct
de vedere energetic sau geometric.
Unghiul între legăturile C-H din molecula de metan este de 109 o 28’ şi nu de 90o după
geometria celor 2 orbitali de tip p care ar fi implicaţi.
Cele 4 legături C-H sunt identice. Acest lucru poate fi explicat doar dacă ne imaginăm
că toţi orbitalii din stratul 2 „se contopesc” formând 4 orbitali identici. 19
Din cei 3 orbitali de tip p şi 1 orbital de tip s sunt generaţi 4 orbitali hibrizi
care au ¼ caracter de orbital s şi ¾ caracter de orbital p. Aceşti orbitali nou
formaţi vor purta denumirea de orbitali hibrizi sp3 .
Cele de tip σ sunt formate de orbitalii hibrizi prin întrepătrundere frontală; cel
de al doilea tip de legături covalente se formează prin întrepătrundere
laterală a orbitalilor p nehibridizaţi şi sunt denumite legături π.
22
Dacă două dintre axe sunt ocupate de orbitali p nehibridizaţi, rămâne ca
ceilalţi doi orbitali, hibridizaţi, deci de energie egală, să ocupe axa rămasă
liberă. Ştiind că energia minimă a sistemului se atinge atunci când orbitalii de
energie egală sunt distribuiţi cât mai simetric în spaţiul disponibil este uşor de
intuit că cei doi orbitali hibrizi sunt situaţi în lungul aceleiaşi axe (colineari),
cu unghiul de 180o între ei. Cei doi orbitali nehibridizaţi formează între ei
un unghi de 90o. Acest tip de hibridizare se numeşte, după orbitalii atomici
implicaţi, hibridizare sp.
23
Legătura covalentă
24
Structura liniara (acidul stearic)
Structura ciclica(colesterol)
25
Ar putea exista viata avand la baza alt
element chimic?
Un candidat ar putea fi siliciul?
3. Atomii de baza ai materiei vii trebuie sa formeze cel putin trei legaturi
chimice, pentru a realiza un sistem de biopolimeri.
27
Avem nevoie de carbon si de ce altceva?
28
Reactiile biochimice necesita legaturi chimice specifice sau anumite grupari functionale.
Cele mai importante astfel de centre de reactie sunt prezentate in continuare:
Compusi organici
O O O R2 R2
R OH R C H R1 C R2 R C OH R SH R NH2 R1 NH R1 N R3
Grupari functionale
O O O
OH C R C C O SH NH2 NH3
Hidroxi Acil Carbonil Carboxil Tiol Amino
O O
O P O P O
O O
Fosfat Fosforil
29
Legaturi in compusi biochimici
O O O
O O
C O P O O P O P O
C O C C O C N C
O O O
30
31
Aplicatii:
D-Glucoza
OH
H2C
C O
O O
HO C H
CH2 C
OH HS CH OH H C OH
NH2
HO NH2 H C OH
T ir o z in a C is te in a H2C
OH
F ru c to z a
32