Perspective i direcii noi de cercetare n ameliorarea cartofului

Sorin Claudian CHIRU, Floriana Maria TEFAN, Nicoleta CHIRU Institutul Naional de Cercetare-Dezvoltare pentru Cartof i Sfecl de Zahr Braov

12 decembrie 2012 Braov

Asigurarea cu alimente n condiiile unei variabiliti tot mai accentuate a climatului i a creterii presiunii factorilor abiotici devine tot mai nesigur.

De ce este necesar ameliorarea cartofului ?

Seceta va crete ca intensitate i frecven i mbuntirea produciei n aceste condiii se va putea realiza printr-o combinare a unor caracteristici specifice i a unor caracteristici de adaptare a noilor genotipuri de cartof.

Pentru perioada urmtoare se vor continua lucrrile de ameliorare clasic la nivel tetraploid pentru realizarea obiectivelor de ameliorare (producie, calitate, rezisten la factori biotici i abiotici).

Sursa: E. Bonneli, 2008

n paralel se vor executa cercetri de ameliorare genetic bazate pe introducerea markerilor moleculari ADN.

Sunt necesare noi metode de ameliorare mai performante, care s permit mrirea vitezei de selecie.

O nou abordare mondial const n tehnicile de fenotipare, n special a celei digitale, att pentru dezvoltarea caracteristicilor legate de markeri, ct i pentru selecia unor caracteristici complexe, ca producia i stresul abiotic. Se discut astzi despre capturarea digital a caracteristicilor pentru rezistena la secet, pentru variaii n viteza de cretere, pentru dezvoltarea de biomas, pentru diferenierea arhitectural a plantelor, pentru utilizarea nutrienilor, etc.

Prin utilizarea de echipamente senzoriale imagistice, prin robotic i tehnologii computerizate se pot obine modele de plante digitale 3D.

Astfel, caracteristici ca nlimea tufei, dimensiunile frunzelor, suprafaa foliar, unghiurile de inserie sunt determinate fr a fi afectate de subiectivismul ochiului amelioratorului.

n marile centre de cercetare ale cartofului sunt posibile tehnologii senzoriale nedistructive care permit controlul genetic al arhitecturii plantei.

La nivelul rii noastre este imperios necesar afirmarea valorii soiurilor de cartof cultivate. n acest fel, ara noastr poate deveni competitiv din punct de vedere al schimburilor de valori.

n cele ce urmeaz prezentm cteva dintre noile tehnici pe care dorim s le dezvoltm n urmtorii ani la INCDCSZ Braov n domeniul ameliorrii cartofului.

Studiile referitoare la utilitatea markerilor moleculari sunt absolut necesare i de mare actualitate n contextul ameliorrii moderne a cartofului.

Metodele bazate pe markeri moleculari mresc acurateea i specificitatea metodelor convenionale de ameliorare a cartofului.

 Paleta de utilizare i aplicare a markerilor moleculari este

larg. Astfel, sunt abordate problematici cum ar fi: selecia asistat de markeri; cartarea i clonarea genelor individuale; caracterizarea trasturilor cantitative (analiza QTL); examinarea i analiza diversitii genetice, etc.

O alt provocare tiinific modern privete integrarea de informaii proteomice i metabolomice. Aceaste noiuni ofer o imagine mult mai complet asupra cartofului, ca organism viu.

Selecia asistat de markeri (MAS) const n: identificarea unei legturi strnse ntre genele care controleaz caractere agronomice i markerii moleculari; utilizarea acestor markeri pentru a mbunti linii sau soiuri.

MAS ?
Avantaje ale utilizrii MAS: economie de timp prin substituirea experienelor de teren complexe, cu teste moleculare; eliminarea evalurilor fenotipice nesigure; combinarea mai multor gene simultan; evitarea transferului de gene nedorite sau vtmtoare; testarea pentru trsturi specifice, n cazul n care evaluarea fenotipic nu este posibil, etc.

Rolul PCR-ului n selecia asistat de markeri

PCR-ul sau polimerizarea n lan, este un mijloc rapid i simplu de a produce o cantitate relativ mare de ADN, dintr-o cantitate foarte mic de ADN.

Tipuri de markeri moleculari

Metode complexe care necesit timp i cantiti mari de ADN RFLP (Restriction fragment Length Polymorphism) Polimorfisme de lungime ale fragmentelor de restricie AFLP (Amplified fragment Length Polymorphism) Polimorfisme de lungime ale fragmentelor amplificate Metode rapide de lucru ce utilizeaz cantiti mici de ADN RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) Polimorfisme de ADN amplificate aleator SSR (Simple Sequences Repeat) Markeri microsatelit acetia prezint un polimorfism ridicat
La INCDCSZ Braov s-au folosit markeri moleculari de tip SSR pentru a detecta variaia somaclonal la plantule regenerate din calus.

Regiunile din genom care conin gene ce sunt asociate cu o trstur anume (producie, rezisten la boli, etc.) sunt cunoscute sub numele de QTL (quantitative trait loci) sau loci ai caracterelor cantitative. O dat ce o regiune a ADN-ului este identificat ca avnd o contribuie la un fenotip, aceasta poate fi secveniat. Secvena ADN-ului oricrei gene din aceast regiune poate fi apoi comparat cu o baz de date a ADN-ului pentru gene a cror funcie este deja cunoscut.

Analiza QTL

Sursa: Kloosterman, 2010

Analiza genomic se dovedete limitat dac lum n considerare c genomul este constant ani de zile. Proteomul ns: variaz cu tipul celulei i depinde de istoricul acesteia; rspunde la stimulii mediului nconjurtor i la tratamentele chimice.

Analiza proteomului

Prin studierea proteomului sunt posibile:

clarificarea mecanismelor care guverneaz procesele moleculare; caracterizarea reelelor complexe de proteine i a perturbaiilor acestora; descoperirea proteinelormarkeri pentru detectarea i diagnosticul bolilor.

n timp ce analiza genomic i studierea proteomului nu detaliaz diferitele aspecte dintr-o celul de exemplu, profilurile metabolice pot oferi o imagine instantanee a fiziologiei acelei celule.

Analiza metabolomului

Avantaje ale studierii metabolomului:

determinarea fenotipului cauzat de o manipulare genetic, cum ar fi eliminarea sau inserarea unei gene; perspectiva de a prezice funcia unor gene necunoscute n raport cu perturbrile metabolice survenite; studierea interaciunilor organismmediu; evaluarea funciilor organismului i a sntii acestuia la nivel molecular; detecia oricrei modificri fenotipice dintr-un organism modificat genetic destinat consumului uman sau animal.

 Aceast lucrare:

red o perspectiv a posibilitii

de aplicare n programele de ameliorare a cartofului a markerilor ADN i a analizelor proteomice i metabolomice;

Sursa: E. Ritter, 2008

abordeaz noiuni de analiz a

materialului ereditar sau a ADNului, ca alternativ de utilizare a metodelor clasice de apreciere a valorii genetice a indivizilor.

Sursa: C. Brown, 2008

V mulumim pentru atenie !