evidenţiere. Cultivarea micetelor. Diagnosticul de laborator al micozelor. Examenul micologic Regatul fungic cuprinde un grup divers și bogat de organisme, de la drojdii microscopice la ciuperci. Din cele peste 100.000 de specii de fungi, doar aproximativ 200 sunt patogene pentru oameni și animale. Obiectul de studiu al Micologiei medicale reprezintă fungii microscopici care provoacă stări patologice la om. În ultimii ani infecțiile fungice umane devin din ce în ce mai frecvente, în special printre pacienții imunocompromiși. Prin urmare, este important să înțelegem caracteristicile microbiologice, patogeneza și clinica acestor boli. Micetele sunt eucariote cu un nivel mai ridicat de complexitate biologică decât bacteriile. Pot fi unicelulare sau pot să se diferențieze și devin multicelulare prin dezvoltarea unor filamente lungi, ramificate. Sunt purtătoare de spori, reproducându-se atât sexuat, cât și asexuat. Le lipsește clorofila plantelor, de aceea trebuie să dobândească substanțe nutritive din mediul extern. Bolile cauzate de fungi se numesc micoze. Aceste infecții variază foarte mult în manifestările lor, dar au tendința de a prezenta caracteristici subacute sau cronice, adesea recidivând în timp. Clasificarea sistematică: - Regnul Fungi - Phylum Ascomycota, Zygomycota, Basidiomycota, Chytridiomycota, Glomeromycota. Genurile importante din punct de vedere medical sunt incluse în Ascomycota (80%), cu câteva în Basidiomycota și Zygomycota. Clasificarea morfologică (mucegaiuri, levuri, ciuperci levuriforme, fungi dimorfi; septarea hifelor; tipul sporilor, etc) Clasificarea medicală (dermatofiți, fungi oportuniști, agenți patogeni sistemici) Clasificarea molecular-genetică Unitatea structurală și funcțională a fungilor este celula, cu o structură specifică și o compoziție particulară. Dimensiunea fungilor variază enorm. O singură celulă fără septuri transversale poate varia de la dimensiunea bacteriană (2-4 μm) la o structură vizibilă macroscopic. Celula fungică are caracteristici eucariote tipice, inclusiv un nucleu cu un nucleol, membrană nucleară și cromozomi liniari. Citoplasma conține un citoschelet cu microfilamente de actină și microtubuli care conțin tubulină. Ribozomi și organite, cum ar fi mitocondriile, reticulul endoplasmatic și aparatul Golgi. Are dimensiunile cuprinse între 10-15 µm. Caracteristici: 1) Absența capsulei (singura excepție: Cryptococcus neoformans). 2) Perete celular este mai îngroșat și mai rigid, absentează peptidoglicanul și acizii teichoici. 3) Conține: polizaharide (75%- chitină, celuloză) + proteine (20%) + lipide (5%). 4) În unele ciuperci se atestă prezența melaninei. 5) Membrana celulara prezintă componenți sterolici. 6) În zona citoplasmatică există organite membranare-reticul endoplasmatic, mitocondrii, ribozomi 80S, nucleu bine definit, aparat Golgi, vacuole și diferite incluziuni (ex: volutină). 7) Absența facilităților de locomoție (flageli, cili, pseudopode). 8) Disponibilizează de puține sisteme (spre deosebire de bacterii) pentru a ataca celulele gazdă. Celulele fungice au un perete celular rigid exterior membranei citoplasmatice. Structura chimică a peretelui celular din fungi este semnificativ diferită de cea a celulelor bacteriene: - nu conține peptidoglican, glicerol, acizi teichoici sau lipopolizaharide. - conține polizaharide complexe, cum ar fi manani, glucani și chitine în asociere strânsă între ele și cu proteine structurale. Manoproteinele sunt importante imunogene, inducând producerea anticorpilor specifici. Variațiile potențiale ale compoziției permit fungilor să evite detectarea lor de către gazda infectată. Alfa și beta-glucanii sunt polimeri ai glucozei prezenți pe toată suprafața celulei Chitina, compusă din lanțuri lungi de N-acetilglucozamină, oferă un suport structural rigid celulei fungice Pe lângă rolul lor structural, acești carbohidrați din peretele celular îndeplinesc funcții celulare complexe, de multe ori acționând simultan și inhibând diferite procese ale răspunsului imun al gazdei. Pe lângă peretele celular, o altă diferență importantă față de celulele mamiferelor și ale bacteriilor este compoziția sterolică a membranei citoplasmatice. În celulele mamiferelor, sterolul membranar dominant este colesterolul; în fungi este ergosterolul, bacteriile nu conțin steroli în membrana citoplasmatică. Fungii sunt de obicei haploizi în conținutul lor de ADN, deși nucleele diploide se formează prin fuziune nucleară în procesul de reproducere sexuată. Fungii care cauzează infecții la om pot fi diferențiați pe baza caracterelor morfostructurale în:
Fungi filamentoși (mucegaiuri)
Levuri și ciuperci levuriforme Fungi dimorfi Fungii filamentoși (mucegaiurile) constau din celule filamentoase tubulare unite între ele; aceste filamente se numesc hife. Hifele au funcții multiple asociate cu creșterea, nutriția și reproducerea. La majoritatea tipurilor de mucegai hifele conțin pereți transversali numiți septuri, care le împart în unități celulare uninucleate distincte - hife septate. Structura acestor septuri variază între specii și poate conține pori și pereți incompleti care permit mișcarea nutrienților, a organitelor și a nucleelor între celulele adiacente. La unele clase de fungi hifele nu conțin septuri și apar ca celule lungi, continue, cu multe nuclee - hife neseptate/coenocitice. Când condițiile de mediu sunt adecvate, hifele cresc pentru a forma o masă filamentoasă numită miceliu (tal), vizibilă cu ochiul liber. Miceliile fungilor filamentoși constau din hife interconectate care cresc la vârfurile lor și se ramifică subapic. Creșterea apicală poate atinge viteze mai mari de 1 µm / s. Porțiunea miceliului care crește în mediu sau substrat organic și asigură obținerea substanțelor nutritive se numește miceliu vegetativ; porțiunea ce crește pe suprafața mediului este miceliul aerian, constituit din hife reproductive (fertile), care poartă spori de reproducere. Reprezentanți – Mucor, Aspergillus, Penicillium. Genul Mucor (Clasa Phycomycetes) Implică organisme pluricelulare, mai este numit și mucegaiul clavelat. Hifele au un aspect filamentos și tubular (lungimea de 5-50 µm; diametrul 2-10 µm) - creșterea lor este în sens apical, până la câțiva centimetri în înălțime. Unele hife sunt împărțite în compartimente de pereți transverși și poroși. Hifele septate au cel puțin 1 nucleu per compartiment. 1. Hifele aseptate, prezintă nuclei liberi în protoplasmă. Creșterea și ramificarea hifelor formează miceliu, organizat într-o parte vegetativă (hife vegetative sau hife de substrat, sunt anucleate, localizate pe / în substrat pentru a obține nutrienții) și într-o partea reproductivă- hife aeriene. Fungii Mucor se multiplică și pe cale sexuată. Ei sunt larg răspândiți în natură. Deseori sunt decelați în pîine, legume, pe suprafețele obiectelor umede, în gunoiul de grajd, sol, apă. Peste 15 specii patogene de Mucor pot cauza boli la om- mucoromicoze: leziuni în plămâni și ficat, care prin evoluția clinică simulează tuberculoza, keratite, otomicoze, dermatomicoze, procese infecțioase generalizate. Ascomicetele sunt niște fungi cu bursă având miceliul multicelular. Se multiplică prin ascospori (sexuat) și prin conidii (asexuat). Din clasa dată face parte genul Aspergillus. Fungii din acest gen au un miceliu septat și conidiospor unicelular, pe capătul lui superior se situează în evantai o serie de stergime scurte, de la care deviază lanțuri de spori- conidii. În examenul microscopic al aspergiilor, amplasarea exosporilor în partea fructificantă, amintește jeturi de apă turnată din stropitoare, de aici și denumirea de mucegai stropit. Peretele celular ai acestor ciuperci este o structură complexă compusă în principal din polizaharide. Principalele polizaharide implicate include: α- glucani (în principal α-1,3-glucan, dar și cantități mici de α-1,4-glucan), β-glucani (β-1,3- glucan cu ramuri β-1,6- ), galactomannan și chitină). Galactomannoproteinele, proteinele ancorate, proteinele de suprafață și alte proteine se găsesc, de asemenea, în peretele celular. A. Oryzae A. Niger A. Flavus formează Prezintă conidiofor cu conidioforii drepţi cap conidial sferic şi şi capul conidial două rânduri de sferic cu un fialide dispuse pe singur rând de toată suprafaţa fialide. Este veziculei. numită „arsenalul enzimelor” Penicillium este o ciupercă saprofită, cunoscută în mod obișnuit ca mucegai albastru sau verde. Corpul vegetativ este micelial. Miceliul este ramificat în profuzie cu hife septate, compuse din celule cu pereți subțiri care conțin de la unul până la mai mulți nuclei. Fiecare sept are un por central, prin care se menține continuitatea citoplasmatică. Unele micelii cresc mai adânc în substrat pentru a absorbi materialul alimentar, iar altele rămân pe substrat și cresc o pâslă miceliană. În partea superioară conidioforul este ramificat. La capetele lui se formează sterigme de la care deviază serii de conidii moniliforme. Levurile sunt ciuperci unicelulare care cresc de obicei într-o formă celulară sferică sau ovală, dar în funcție de specie se pot întâlni forme elipsoidale, triunghiulare, fuziforme. Se înmulțesc prin înmugurire sau diviziune binară. La înmugurire celula-mamă formează o excrescență exterioară (mugure). Pe măsură ce mugurele se alungește, nucleul celulei se divide și un nucleu migrează în mugure. Peretele celular formează ulterior un sept între mugure și celula-mamă, iar mugurele se desprinde în cele din urmă. O celulă de drojdie poate produce în timp până la 24 de celule fiice prin înmugurire. Ciupercile levuriforme (ex.: Candida) au aceleași caractere ca și drojdiile, dar produc muguri ce nu reușesc să se desprindă; acești muguri formează un scurt lanț de celule numit pseudohifă (pseudomiceliu). Unii fungi, mai ales speciile patogene, prezintă dimorfism - două forme de creștere. Fungii dimorfi pot crește fie ca fungi filamentoși, fie ca levuri. Formele asemănătoare mucegaiului produc hife vegetative și aeriene; formele de drojdie se reproduc prin înmugurire. Dimorfismul în fungii patogeni este dependent de temperatură: la 35-37 ° C fungul este levuriform și la 25 °C are aspect de mucegai. Dimorfismul din fungi este reversibil și are importanță în virulența fungilor. De ex: C. albicans se atașează la celulele epiteliale umane ca o drojdie, dar necesită pseudohife pentru a invada țesuturile. Înmulțirea fungilor este un proces extrem de important pentru că el contribuie esențial la menținerea distribuției lor în biotopuri specifice. Fungii se pot înmulți pe cale: vegetativă asexuată sexuată Forma asexuată se numește anamorfă, iar elementele sale reproductive sunt denumite conidii. Forma sexuată se numește teleomorfă și structurile sale de reproducere sunt numite spori (de exemplu, ascospori, zigospori, basidiospori). Reproducerea asexuată implică divizarea mitotică a nucleului haploid și este asociată cu producerea prin înmugurite a conidiilor, asemănătoare sporilor sau, alternativ, prin separarea elementelor hifale. În reproducerea sexuată nucleii haploizi ai celulelor donatorului și acceptorului fuzionează pentru a forma un nucleu diploid, care apoi se împarte prin meioză clasică. Unii dintre cei patru nucleii haploizi rezultați pot fi recombinați genetic și pot suferi o divizare suplimentară prin mitoză. Sporii asexuați sunt produși de o celulă fungică prin mitoză și diviziunea celulară ulterioară; nu există nicio fuziune a nucleelor celulelor. Două tipuri de spori asexuați sunt produse de fungi: 1. Conidiosporul sau conidia, un spor unicelular sau multicelular care nu este închis într-un sac. Tipuri de conidii: Conidii produse în lanț la capătul unui conidiofor. Astfel de spori sunt produși de Penicillium și Aspergillus. Conidii formate din fragmentarea unei hife septate în celule unice, ușor îngroșate, numite arthroconidii (Coccidioides immitis). Blastoconidia se formează din mugurii celulei-mamă. Astfel de spori se găsesc în unele levuri, cum ar fi Candida albicans și Cryptococcus. Chlamydoconidia este un spor cu pereți groși format prin rotunjire și mărire în cadrul unui segment hifal (Candida albicans ) 2. Sporangiosporii, formați într-un sporangiu, la capătul unei hife aeriene numite sporangiofor. Sporangiul poate conține sute de sporangiospori. Astfel de spori sunt produși de Rhizopus, Mucor?. Sporii asexuați sunt formați de un singur organism. Când acești spori germinează, devin microorganisme identice genetic cu celula-mamă. Sporii sexuați produși de fungi caracterizează phylul (ascospori, zigospori, basidiospori). Cel mai frecvent spor sexuat este denumit ascospor. Patru sau opt ascospori pot fi găsiți într-o structură asemănătoare unui sac - ascusul. Organismele care cresc din spori sexuați vor avea caracteristicile genetice ale ambelor tulpini parentale. Identificarea clinică se bazează pe examinarea microscopică a spori asexuați, deoarece majoritatea fungilor prezintă doar spori asexuați în medii de cultură. Micetele sunt chemoheterotrofe și, asemănător bacteriilor, absorb substanțele nutritive. Diversitatea metabolică printre fungi este mare, dar majoritatea sunt capabili să crească cu surse foarte simple de carbon și azot. În natură, substanțele nutritive pentru fungii care trăiesc liber sunt derivate din materia organică în descompunere. Majoritatea fungilor sunt aerobi stricți, deși unii fungi pot crește în condiții anaerobe. Levurile sunt capabile de creștere anaerobă facultativă, care permite acestor ciuperci să supraviețuiască în diverse medii. În prezența oxigenului drojdiile efectuează respirație aerobă pentru a metaboliza carbohidrații în dioxid de carbon și apă; în lipsa oxigenului fermentează carbohidrații și produc etanol și dioxid de carbon. Fungii cresc de obicei mai bine într-un mediu cu un pH de aproximativ 5 (bacteriile -7,2 – 7,4) Majoritatea fungilor sunt mai rezistenți la presiunea osmotică decât bacteriile (cresc în medii cu concentrații relativ ridicade de zahăr sau de sare). Fungii pot crește pe substrate cu umiditate redusă, în general prea scăzută pentru a susține dezvoltarea bacteriilor. Fungii necesită mai puțin azot decât bacteriile pentru creștere. Fungii sunt capabili să metabolizeze carbohidrați complecși, cum ar fi lignina (componentă a lemnului). Particularitățile metabolice ale numeroșilor fungi face imposibilă obținerea unui mediu standard pentru toate speciile de interes medical. Cele mai adaptate medii sunt: Sabouraud cu cloramfenicol și gentamicină (inhibă dezvoltarea bacteriilor contaminante) Czapek-Dox agar (mediu semisintetic ce conține zaharoză, săruri de Fe, Mg, K, nitrat de Na ca unică sursă de azot) PDA (potato dextrose agar) Medii cromogene (cu substrat fluorogen sau cromogen pentru enzime fungice), permit izolare și identificarea simultană a levurilor izolate din diferite prelevate Bulion Sabouraud (pentru îmbogățirea și menținerea fungilor) Principalele componente ale mediilor de cultură pentru fungi sunt: substanțele nutritive, factorii inhibitori, agenții revelatori (pentru mediile diferențiale cromogene), apa și agenții de solidificare (pentru medii solide). Factorii inhibitori sunt substanțe de pot supresa dezvoltarea unor categorii de microorganisme contaminante, indezirabile (antibiotice, coloranți – ex.: cristal violet pentru inhibarea bacteriilor, cicloheximidă pentru inhibarea dezvoltării fungilor contaminanți). Temperatura de incubare este în concordanță cu zona anatomică de proveniență a probei: 36-37 C pentru prelevatele interne și profunde sau de 30 C pentru prelevatele superficiale (piele și anexe). Aproape toate mucegaiurile sunt aerobe, iar majoritatea levurilor sunt facultativ anaerobe. Pe mediile de cultură fungii de interes medical se dezvoltă în 48-72 ore de incubare, uneori perioada de urmărire poate fi prelungită până la 7 zile Formele morfologice ale creșterea variază de la colonii asemănătoare superficial cu cele ale bacteriilor la structuri complexe, multicelulare, pigmentate/colorate. Diagnosticul de laborator al infecțiilor fungice poate fi efectuat prin metode microscopice, micologice, serologice. Probele sunt recoltate din locul afectat: prelevate superficiale – cutanate, sinusale, conjunctivale, unghiale, auriculare; spută, lavaj bronho-alveolar, urină, mase fecale, urină, biopsii, etc. În caz de suspecție de infecție generalizată se vor colecta și probe de sânge pentru hemocultură. Este obligatoriu pentru orice tip de prelevat, cu excepția sângelui Orientează diagnosticul spre o infecția fungică prin evidențierea unor formațiuni sau elemente caracteristice Permite informarea timpurie a clinicianului Se efectuează pe prelevate în stare nativă, cu sau fără colorare prealabilă. Pot fi identificate: levurile (cu sau fără muguri, intra- sau extracelulare, cu sau fără capsulă), fragmente hifale septate sau neseptate, uneori ramificate, structurile fructificatoare ale fungilor filamentoși, granulele (scleroții) – elemente sferice, dure, de cca 1 mm diametru, formate la nivelul micetoamelor. Preparat între lamă și lamelă, cu soluție de 20% KOH (scuame, fragmente unghiale, secreții linguale, vaginale). Digestia keratinei și distrugerea celulelor somatice facilitează observarea celulelor fungice. Decelarea fungilor este ameliorată prin adăugarea unui colorant – negru clorazol, cerneală Parker sau a unei substanțe fluorescente cu afinitate pentru glucanul din peretele fungilor (blankophor, calcofluor – în proporție de 0,1%). Preparatul se examinează la microscupul luminiscent când opacitatea preparatului s-a diminuat vizibil. Examenul microscopic Într-o picatură de sol. de bază(KOH,NaOH) 5-10% se introduce scuamele pielii ,raclajul unghiilor,țesuturile necrotizate,se încălzește atent la flacără timp de 1 min și se acoperă cu o lamelă. Materialul de consistență lichidă se cercetează într-un amestic de alool cu glicerină (glicerina -4 parți, alcool etilic-2părți, apă distilată- 4părți) sau în amestec din sol. Lugol cu glicerină. Frotiu colorat Gram. Pune în evidență hifele, pseudohifele, artrosporii și blastosporii de dimensiuni mari, dar este inadecvată pentru detecția celulelor levurice de dimensiuni mici, de ex.: Candida grabrata. Preparat colorat cu tuș de India. Pune în evidență levurile capsulate din genul Cryptococcus în sedimentul LCR, urinar, etc. Frotiu colorat May-Grunwald-Giemsa. Metodă de rutină pentru depistarea levurilor intracelulare de tip Histoplasma, dar poate fi utilizată și pentru microscopia directă a fungilor. Frotiu necolorat sau colorat cu albastru de metilen 3%. Pentru detectarea levurilor din hemoculturi. Frotiu pregătit pentru imunofluorescență prin tratare cu anticorpi monoclonali cuplați cu fluorocromi (în special pentru detecția Pneumocystis jiroveci în prelevatele respiratorii) Preparat extemporaneu cu bandă adezivă, colorat cu albastru de metilen în lactofenol: metodă expeditivă de diagnostic tip ”one-step” al leziunilor cauzate de Pityriazis versicolor. Frotiuri obținute prin etalare sau amprentă (aspiratul bronșic, lavajul bronhoalveolar, biopsiile), care apoi se colorează Musto sau cu calcofluor și se examinează pentru decelarea elementelor particulare, care ar pleda pentru o zigomicoză, aspergiloză, etc. I. Izolarea culturii pure de fungi. Se efectuează prin inocularea prelevatului pe placa cu mediul solid (Sabouraud, Czapek), incubare la temperatura optimă (28 – 30 C), 48 ore. La necesitate se efectuează în prealabil îmbogățirea fungilor în bulion Sabouraud Pe Chromagar , un mediu diferențial pentru speciile Candida glabrata produce colonii care pal roz până la violet, spre deosebire de coloniile C. albicans , care apar de la verde la albastru-verde. II. Acumularea culturii pure (la necesitate) III. Identificarea culturii pure, bazată pe studierea caracterelor: - Morfologice (forma celulelor, morfologia hifelor, sporilor, etc) - De cultură (rapiditatea creșterii, caracteristica coloniilor, pigmentarea mediului sub colonie) - Biochimice Profilul biochimic cuprinde datele obținute prin efectuarea unei multitudini de teste: Capacitatea de fermentare a glucidelor Capacitatea de asimilare a surselor de carbon Capacitatea de asimilare a surselor de azot Testul de asimilare a nitratului de sodiu Testul de hidroliză a ureei Producerea de fenol-oxidază Producerea altor enzime (beta-galactozaminidaza, L- prolin-aminopeptidaza, etc.) Testul de depistare a necesităților nutritive speciale (se ulilizează setul de medii Trichophyton agar 1-7 pentru identificarea unor specii de dermatofiți care cer prezența în mediul de cultură a unor factori de creștere ca vitamine (tiamină, acid nicotinic, inozitol) sau aminoacizi (histidină). Testul de perforare a firului de păr in vitro (diferențierea speciilor de dermatofiți pe baza producerii organelor perforatoare) Testul de cultivare pe boabe de orez (diferențierea Microsporum audouinii de Microsporum canis) Testul de filamentare (identificarea preumtivă a tulpinilor de Candida albicans și Candida dubliniensis) Testul de termotoleranță/termostimulare (diferențierea speciilor de dermatofiți prin incubarea mediilor inoculate la 25⁰, 30⁰ și 37⁰ C. Testul de fluorescență la lumină UV (unii dermatofiți secretă pteridină, care produce fluorescență verde-gălbuie sau verde-pal). Cultivarea și identificarea fungilor prin metode clasice rămâne a fi ”standardul de aur” în diagnosticul infecțiilor micotice. În unele cazuri diagnosticul serologic permite o orientare rapidă a medicului în vederea instituirii unui tratament precoce. Diagnosticul serologic vizează atât detectarea antigenelor direct în produsul biologic (ex.: detectarea Ag Aspergillus, Candida, Ag polizaharidice capsulare ale Cryptococcus neoformans etc.), cât și aprecierea calitativă sau cantitativă a anticorpilor prezenți ca răspuns al unei infecții fungice (histoplasmoza, coccidiomicoza, aspergiloza). Reacții serologice utilizate – reacția de latexaglutinare, ELISA Controlul infecțiilor fungice invazive este dificil (imposibilitatea obținerii probelor adecvate; culturile devin pozitive în stadii tardive ale bolii) Procedurile bazate pe detectarea ADN-ului fungic în materialul biologic (PCR, Real-Time PCR) permit diagnosticul precoce și tratamentul infecțiilor fungice. Analiza PCR foarte rar oferă un rezultat fals-negativ și practic nu dă rezultate fals-pozitive.