INTRODUCERE ÎN MODELARE

MOLECULARĂ
Conf. univ. dr. Steluta Gosav
 Orbitalii moleculari de frontieră- HOMO și
LUMO
• Orbitalii moleculari de frontieră sunt caracteristici importante care indică
modul în care o moleculă interacționează cu alte specii chimice.
• Orbitalul molecular HOMO acționează ca donor de electroni în timp ce orbitalul
LUMO acționează ca acceptor de electroni.
• Energia Egap, obținută ca diferența dintre energia orbitalului LUMO și energia
orbitalului HOMO, caracterizează stabilitatea/reactivitatea chimică moleculară
fiind deci o măsură a conductivității electronice. Din acest motiv, E gap poate fi
considerat un parametru critic pentru evaluarea proprietăților electrice de
transport molecular.

• Energie Egap este utilizata pentru a caracteriza reactivitatea chimică,

polarizabilitatea optică, rigiditatea și flexibilitatea chimică a unui compus.
Energia Egap HOMO-LUMO reprezintă abilitatea chimică de a accepta sau a dona
electroni.
• O energie Egap mare reprezintă energii de excitare ridicate pentru multe stări
excitate, o bună stabilitate și o rigiditate chimică ridicată.
 Calculul energiilor orbitalilor de frontiera
• Calculul energiilor orbitalilor

• File → Open → Structure.hin (cea optimizată)

• Display →Balls and Cylinders
• Compute → Single Point (se verifică dacă valoarea gradientului
este zero)
• Compute → Orbitals → HOMO (se va introduce valoarea zero) →
Energy (se afișează valoarea energiei pentru orbitalii HOMO,
EHOMO)
• Compute → Orbitals → LUMO (se va introduce valoarea zero) →
Energy (se afișează valoarea energiei pentru orbitalii LUMO, ELUMO)
• În final se va calcula valoarea energiei, Egap = EHOMO - ELUMO
 Calculul energiilor orbitalilor de frontiera
Compute → Orbitals HOMO
 Calculul energiilor orbitalilor de frontiera
Compute → Orbitals LUMO
 REPREZENTAREA GRAFICĂ A ORBITALILOR HOMO și LUMO
Compute → Orbitals
- Se aleg opțiunile dorite și se dă PLOT
 Orbitalii moleculari de
frontieră

• Distribuția sarcinii electrice a

orbitalului HOMO este de-a lungul
întregii structuri moleculare
datorită prezenței dublei legături Figura 9. Distribuția de sarcină a orbitalilor moleculari HOMO și LUMO în
structura optimizată a compusului genisteină
C2 = C3 care permite o
delocalizare mai pronunțată a
sarcinii electrice la trecerea de pe
orbitalul molecular HOMO pe
orbitalul molecular LUMO.
• În cazul orbitalului molecular de
frontieră LUMO, distribuția
sarcinii electrice este situată numai
pe structura benzopiranului

Figura 10. Distribuția de sarcină a orbitalilor moleculari HOMO

și LUMO în structura optimizată a compusului daidzeină
 Exemplu - interpretare a orbitalilor
• Distribuția de sarcină a
orbitalilor moleculari de
frontieră a unei molecule
este influențată de gradul ei
de conjugare și
planeitate/non-planeitate.

• În cazul compusului
luteolină, se observă că
pentru ambele tipuri de
orbitali, HOMO și LUMO,
distribuția de sarcină
electrică este în principal
localizată pe zona Distribuţia de sarcină a orbitalilor
derivatului de tip fenil, pe moleculari HOMO şi LUMO în structura
inelul de tip piran și pe optimizată a compusului luteolină
gruparea carbonil.
Tabel pentru referat
 HARTA POTENȚIALULUI ELECTROSTATIC MOLECULAR
• Potențialul electrostatic molecular (MEP) oferă informații în ceea ce privește
efectul electrostatic net produs într-un punct din vecinătatea moleculei de
către distribuția totală de sarcină a moleculei, adică de electroni și nuclee.
• Potențialul electrostatic molecular poate fi calculat cu formula:

unde ZA este sarcina nucleului A aflat în punctul de coordonată RA, ρ(r’) este
densitatea de sarcină electronică în punctul de coordonată r’

• Potențialul electrostatic molecular este corelat cu momentul de dipol,

electronegativitatea, sarcina parțială și reactivitatea chimică a moleculei.
• Diagrama MEP tridimensională ilustrează polaritatea relativă a moleculei și
este foarte utilă pentru identificarea situs-urilor unde pot să apară atacuri
electrofile/nucleofile.
 REPREZENTARE MEP
Compute → Plot Molecular Properties Options
- Se aleg opțiunile dorite și se dă OK
REPREZENTARE MEP
 În cazul compusului
Harta potențialului electrostatic molecular genisteină/daidzeină, am găsit
cinci/patru regiuni negative situate în
jurul atomilor de oxigen care aparțin
grupării carbonil, grupărilor hidroxil
și inelului piranic, aceste regiuni
fiind locuri active pentru eventualele
atacuri electrofile.

Figura 11. Harta potențialului electrostatic molecular a compusului 5,7-dihidroxi-3-(4-

hidroxifenil)cromen-4-onă (genisteină)

Regiunile pozitive sunt localizate în

jurul tuturor atomilor de hidrogen și
sunt locuri active pentru eventualele
atacuri nucleofile. Figura 12. Harta potențialului electrostatic molecular a compusului 7-hidroxi-3-(4-
hidroxifenil)-4H-1-benzopiran-4-ona (daidzeină)
 Exemplu: Harta MEP a luteolinei - interpretare
• Harta MEP pentru luteolină indică faptul că regiunile cu potențial
electrostatic negativ sunt localizate în zona atomilor de oxigen care
aparțin grupării carbonil, grupărilor hidroxil și inelului piran. Aceste
regiuni sunt posibile situsuri active pentru atacul electrofil.
• Regiunile cu potențial electrostatic pozitiv sunt localizate în jurul
atomilor de hidrogen, acestea fiind situsurile cele mai probabile
pentru atacul nucleofil.
Tabel cu orbitalii de frontieră și harta potențialului
electrostatic molecular