Structura Acizilor Nucleici

Importana biomedical a acizilor

nucleici: baza chimic a ereditii
Un clugr din secolul XIX pe nume Gregor
Mendel a introdus pentru prima oar noiunea de
gen: unitate de baz responsabil pentru deinerea
i transmiterea a unei caracteristici unice.
Iniial s-a crezut c proteinele car informaia
genetic, pn la mijlocul secolului XX, cnd s-a
descoperit c ADN-ul este baza ereditii, datorit
faptului c este capabil de auto-replicare.

Acizii nucleici sunt

ADN-ul i ARN-ul
ADN
Sediul principal al
localizrii ADN-ului
este nucleul celulelor.
Sedii secundare sunt:
mitocondriile i
cloroplastele (n celula
vegetal).

ARN
Diferitele tipuri de
ARN sunt localizate n
nucleu, citoplasm,
mitocondrii, ribozomi.

Dogma Central a geneticii moleculare

DNA

Acid dezoxiribonucleic

Propus de ctre Francis Crick n

1958 pentru a descrie fuxul
informaiei genetice n celul.
Informaia depozitat n ADN este
transferat ARN-ului, care mai
departe o transfer proteinelor.

RNA

Protein

Acid ribonucleic

Dogma Central propus de Crick a

suferit numeroase revizii n ultimii 47
de ani.

Dogma Central a Geneticii

ARN

ADN
Transcriere

proteine
Traducere

transcrierea = transferul informaiei genetice de la

ADN la ARN (sintez de ARN pe matri de ADN)
traducerea = transferul informaiei genetice de la
ARN la proteinele functionale, a cror secven de
aminoacizi este codificat n structura ADN-ului.
replicarea = transferul informaiei genetice de la
celula mam la celulele-fiice prin copierea ADN-ului
parental cu formarea a dou molecule de ADN cu
structur identic ADN-ului parental

Dogma Central Revizuit

Recombinarea=
reaaranjarea materialului
genetic
Recombination
Mutation/Repair

Mutaii/Reparare =
lezarea ADN cu alterarea
informaiei genetice/
corectarea leziunilor ADN
Revers- transcrierea =
transferul informaiei
genetice de la ARN la ADN

Ce sunt acizii nucleici

(ADN and ARN)?
Acizii nucleici sunt polinucleotide (produi de policondensarea
aunor uniti denumite nucleotide).
Nucleotidele reprezint unitatea monomeric a acizilor nucleici i
sunt compuse din:
- o baz azotat heterociclic:
- purine: adenin (A) i guanin (G)
- pirimidine: citozin (C) i timin (T) pentru ADN
citozin (C) i uracil (U) pentru ARN
- o pentoz:
- dezoxiriboza (este prezent n ADN)
- riboza (este prezent n ARN)
- fosfat

STRUCTURA BAZELOR
AZOTATE

Pirimidinele
Citozina
NH2

Timina

Uracil

4
5

H3C

NH

NH

NH
1

NH

NH

Atomii heterociclului pirimidinic sunt numerotai de la 1 la

6 (astfel ncat atomii de N din ciclu s primeasc indicele
minim).

Bazele azotate prezint fenomenul

de tautomerie
NH

NH2

NH2

NH

NH

forma amino

forma imino

Citozina

C
HN

forma lactam

OH

forma lactim

Bazele azotate prezint fenonemul

de tautomerie
Formele mai stabile:
Forma lactam este mai stabil dect forma
lactim
Forma amino este mai stabil dect forma
imino

n acizii nucleici exist formele lactam i

amino

Purine
Adenina

Guanina

NH2

6
1

N
2

N
3

NH

HN
H2N

NH

Atomii heterociclului purinic sunt numerotai de la 1

la 9 (astfel ncat atomii de N din ciclu s primeasc
indicele minim).

STRUCTURA PENTOZELOR
DIN ACIZII NUCLEICI

Pentoze
Riboza
HO

5
CH2

Dezoxiriboza

OH

HO CH2

OH

OH OH

OH

Atomii de carbon ai pentozelor sunt numerotai de la

1 la 5.
Pentoza din ADN este dezoxiriboza, cruia i lipsete
gruparea hidroxil 2-OH.
Pentoza din ARN este riboza.

lipsete
2-OH

STRUCTURA
NUCLEOZIDELOR

Structura nucleozidelor:
baz + pentoz

Legtur
-N-glicozidic

Nucleozidele sunt
derivai ai bazelor
azotate care au o
pentoz legat de un
atom de azot din
heterociclu:
N9 pentru purine
N1 for pirimidine
printr-o legtur -Nglicozidic.

STRUCTURA
NUCLEOTIDELOR

Structura nucleotidelor

Nucleotidele sunt compose din nucleozide (bas + pentoz) i 1, 2, sau 3

grupri fosfat (se formeaz o legtur esteric ntre fosfat i 5-OH).
Mononucleotide (nucleozid-monofosfat)= nucleozid + 1 fosfat
Nucleozid-difosfat = nucleozid + 2 fosfat
Nucleozid-trifosfat = nucleozid + 3 fosfat

ntrebare
Urmtoarele afirmaii sunt corecte:
1. Nucleozidele sunt formate dintr-o pentoz, o
baz i o grupare fosfat.
2. Forma lactam este mai stabil dect forma
lactim i exist n citozin i uracil.
3. Gruparea fosfat din nucleozidmonofosfai se
leag printr-o legtur esteric de carbonul 5.
4. Timina difer de uracil printr-o singur grupare
metil.

Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide
(cnd pentoza = riboz)
Baza

Nucleozidul

Nucleotidul

Adenina
(A)

Adenozina (A)

Adenozin monofosfat
(AMP) sau adenilat
Adenozin difosfat
(ADP)
Adenozin trifosfat
(ATP)

Terminologie Ribonucleozide/Ribonucleotide
(cnd pentoza = riboz)
Baza

Nucleozidul

Nucleotidul

Adenina (A)

Adenozina (A)

Adenozin monofosfat (AMP)

Adenozin difosfat (ADP)
Adenozin trifosfat (ATP)

Guanina (G)

Guanozina (G)

Guanozin monofosfat (GMP)

Guanozin difosfat (GDP)
Guanozin trifosfat (GTP)

Citozina (C)

Citidina (C)

Citidin monofosfat (CMP)

Citidin difosfat (CDP)
Citidin trifosfat (CTP)

Uracil (U)

Uridina (U)

Uridin monofosfat (UMP)

Uridin difosfat (UDP)
Uridin trifosfat (UTP)

Timina (T)

Timidina (T)

Timidin monofosfat (TMP)

Timidin difosfat (TDP)
Timidin trifosfat (TTP)

Terminologie comparativ
Ribonucleotide

Dezoxiribonucleotide

Adenozin monofosfat
(AMP) sau adenilat

Dezoxiadenozin monofosfat
(dAMP) sau dezoxiadenilat

Adenozin difosfat
(ADP)

Dezoxiadenozin difosfat
(dADP)

Adenozin trifosfat

Dezoxiadenozin trifosfat
(dATP)

Terminologie Dezoxiribo-nucleozide/nucleotide
(cnd pentoza = dezoxiriboz)
Baza

Nucleozidul

Nucleotidul

Adenina (A)

Dezoxiadenozina (A)

Dezoxiadenozin monofosfat (dAMP)

Dezoxiadenozin difosfat (dADP)
Dezoxiadenozin trifosfat (dATP)

Guanina (G)

Dezoxiguanozina (G)

Dezoxiguanozin monofosfat (dGMP)

Dezoxiguanozin difosfat (dGDP)
Dezoxiguanozin trifosfat (dGTP)

Citozina (C)

Dezoxicitidina (C)

Dezoxicitidin monofosfat (dCMP)

Dezoxicitidin difosfat (dCDP)
Dezoxicitidin trifosfat (dCTP)

Uracil (U)

Dezoxiuridina (U)

Dezoxiuridin monofosfat (dUMP)

Dezoxiuridin difosfat (dUDP)
Dezoxiuridin trifosfat (dUTP)

Timina (T)

Dezoxitimidina (T)

Dezoxitimidin monofosfat (dTMP)

Dezoxitimidin difosfat (dTDP)
Dezoxitimidin trifosfat (dTTP)

Funciile fiziologice ale nucleotidelor

Crmizi pentru sinteza acizilor nucleici
Compui macroergici care furnizeaz energia
necesar diferitelor procese biologice (ex. ATP,
GTP)
Reglatori alosterici ai diferitelor enzime (ex.ADP
e activator alosteric al ICDH din ciclul Krebs)
Donori de grupe metil (ex.S-adenozilmetionina)
Mesageri intracelulari ai hormonilor hidrofili
(ex. AMPc, GMCc)

Nucleotide naturale libere: AMPc

NH2
N
N
O

CH2

O P

AMPc

A d e n in e

N
N

R ib o s e
OH

3,5adenozin
monofosfatul ciclic
(AMPc) este mesager
secund imlicat n
transmiterea mesajului
hormonal din mediul
extracelular n
interiorul celulei.

STRUCTURA ADN
1. structura primar
2. structura secundar
3. structura teriar

James Watson
Francis Crick
1962 Nobel Prize

http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/300/5617/255
http://www.lecb.ncifcrf.gov/~toms/icons/Watson.Crick.Nature.jpg

STRUCTURA PRIMAR A
ADN-ULUI

Lanul polinucleotidic al ADN

(structura primar/covalent)

G u a n in e
N

HN
H2N

5' end HO

CH2

N
NH2

ADN este un
polidezoxiribonucleotid n care
gruparea 3OH a unui
dezoxiriobonucleotid este legat la
gruparea 5OH a dezoxiriobonucleotidului vecin printr-o legtur
fosfat diesteric.

Lanul polinucleotidic este

polar:prezint dou capete
distincte.

Captul 3este cel cu gruparea 3OH liber.

Captul 5este cel cu gruparea 5OH liber sau fosforilat.

C y to s in e

3linkage

O
O P O

N
CH2

5linkage

O P O
O

O
H3C

CH2

NH

NH

O P O

T h y m in e

O
OH
3' end

Lanul polinucleotidic al ADN este

ncrcat negativ la pH-ul
fiziologic.

Reprezentare simplificat a lanului ADN

G u a n in e
N

HN
H2N

5' end HO

CH2

N
NH2

C y to s in e

N
O
O P O

OH

Pentoza: linie orizontal

N
CH2

Baza: litera corespondent

Leg. fosfodiesteric:

linie oblic i P la mijloc

3 G
P

3 C
P

O P O
O

O
H3C

NH

NH

O P O

CH2

T h y m in e

O
OH
3' end

3
OH

Reprezentarea simplificat a catenei de ADN

O

G u a n in e
N

HN
H2N

5' end HO

CH2

Prin convenie o caten de

ADN se scrie n direcia
5- 3.

N
NH2

C y to s in e

N
O
O P O

N
CH2

ex. GCT nseamn 5GCT 3

O

O P O
O

O
H3C

NH

NH

O P O

CH2

T h y m in e

O
OH
3' end

ntrebare

Identificai care este

captul 3al acestui
oligonucleotid?
Scriei reprezentarea
simplificat a acestui
oligonucleotid.

STRUCTURA SECUNDAR
A ADN

Dublu helixul ADN

Watson i Crick au decoperit c structura secundar
a ADN este un dublu helix format din dou
catene de ADN asociate prin mperecherea bazelor
Inelele glucidice legate prin resturi fosfat constituie
scheletul extern al dublu helixului, n timp ce
bazele azotate hidrofobe sunt orientate spre interior
i perpendicular pe axa helixului.
ADN-ul uman conine aproximativ 3,5 x 109
perechi de baze.

Dublul helix al ADN

( structura secundar)
1. Stabilitatea ADNdc este
asigurat de:
- interaciunile hidrofobe dintre
bazele azotate suprapuse (stivuite)
de pe aceeai caten
- legturile de hidrogen ce se
stabilesc ntre bazele azotate de
pe o caten i cele
complementare de pe cealalt
caten.
1. Cele dou catene de ADN sunt
antiparalele.

ADN dublu helix

(structura secundara)
3.

G-C are 3 legturi de H.

A-T are 2 legturi de H.

4.

Cele dou catene sunt

complementare (G is
complementar C, A is
complementare T).

5.

Nr. A = Nr. T
Nr. G = Nr. C

ntrebare
1. Scriei catena ADN complamentar cu urmtoarea
caten: ATTTTAAGCTAAGGCCCTTT
2. Calculai numrul de legtuiri de H existent ntre
cele dou catene de ADN complementare.
3. Specificai ce baz exist la captul 3al fiecrei
catene.

Dublu helix ADN

(structura secundar)
6.
-

Exist mai multe confomaii ale

ADN;
Conformaia B: descris de
Watson i Crick are orientare
dreapt, pasul dublu helixului
este 34 (3,4nm), diametrul de
2nm, iar nr. perechi baze per tur
este 10; cea mai rspndit.

Conformaia A: dublu helix de

dreapta dar mai compact, pasul
elicei este de 2,8nm, nr. perechi
baze per tur este 11.

Conformaia Z: dublu helix de

stinga, pasul elicei 4,56nm i nr.
perechi baze per tur este 12.

ntrebare
ADN
1. Este compus din nucleotide legate prin
legturi 4,5-fosfat diesterice
2. Are structur de polianion la pH fiziologic
3. Conine nr. egal de resturi de A i G
4. Conformaia A este un dublu helix de dreapta.

STRUCTURA TERTIAR A
ADN:
polinucleozomul

De la ADN la cromozomi
In eucariote ADN-ul este stocat n nucleu.
Deoarece nu este suficient sapiu iar molecula
ADN-ului este extrem de mare (lungimea ADN de
la o singur celula uman e 2m!!!), ADN-ul
trebuie compactat.
Exist cinci nivele de compactare a ADN care
conduce la o scdere de 10.000 de ori lungimii
ADN.

Nivelele de compactare
a ADN n nucleu
-Primul nivelr

Dublul helix de ADN se

nfoar n jurul unui octamer
proteic format din histonefiecare unitate de ADN
spiralat de 1,75 ori n jurul
unui compelx histonic se
numete nucleozom.

Histonele sunt proteine bazice

cu mas molecular mic (max.
20.000), bogate n aa bazici
(Arg pt.H2A, H2B i, Lys pt
H3, H4).

Nivelele de compactare
a ADN n nucleu
-Primul nivelr

n jurul octamerului histonic

(H2A H2B H3 H4)x2 este spiralat ADN-ul
nucleozomic fomat din 140 perechi de baze.
Nucleozomii sunt legai ntre ei prin ADN
intrenucleozomic sau ADN linker format
din 30 perechi de baze).Histona H1
itercaioneaz cu ADN linker, avnd rol n
superspiralizarea nucleozomilor.
Polinulceozomul seamn cu nite mrgele
pe a (=fibrile de cromatin de 10nm ).

Mrgele de ametist

Aparena de
mrgele pe a a
ADN

Nivelele de compactare
a ADN n nucleu
-al doilea nivel Polinucleozomul se
superspiraleaz pentru a
forma structura de solenoid.
Solenoidul conine 6-7
nucleozomi per tur.Pasul e de
10nm, diametrul de 30 nm.
Solenoidul formeaz fibrele
de cromatin de 30 nm.

Nivelele de compactare
a ADN n nucleu
-nivelele 3,4 i 5r
- Fibrele de cromatin se compacteaz
i mai mult form domenii n form de
bucl.
- Aceste domenii n bucl sunt
superspiralizate i organizate n
structuri distincte numite cromozomi.
- ADN -ul uman nuclear ( genomul)
const n 23 perechi de cromozomi.

Diferena dintre celulele diploide i

celulele haploide
Majoritatea celulelor eucariote conin
perechi de cromozomi i sunt astfel
denumite diploide.
Celulele care conin cromozomi nepereche
sunt denumite haploide.

Cromozomii genomului uman