Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
CROMOZOMUL
CHROMA = culoare si SOMA = corpuscul
CROMOZOMUL eucariot este definit drept
organit nuclear intens colorat cu coloranti
bazici, vizibil microscopic in timpul diviziunii
celulare.
STRUCTURA: ADN + proteine asociate
FUNCTII: purtator de informatie genetica,
asigura continuitatea intre generatii si
recombinarea materialului ereditar
(variabilitate).
LOCALIAREA
CROMOZOMILOR
UMANI
CROMOZOM NUCLEAR
CROMOZOM
MITOCONDRIAL
NUCLEU
CROMOZOMII NUCLEARI
- molecule dublu-catenare, liniare,
neramificate, organizate in 22 crz.
autozomi, X si Y.
MITOCONDRIE
CELULA SOMATICA
CROMOZOMUL
MITOCONDRIAL
-molecule dublucatenare, circulare,
neramificate,
organizate in crz.
mitocondrial.
- o mitocondrie are 210 molecule ADN.
CROMOZOMUL NUCLEAR
RELATIA ADN-CROMATINACROMATIDA-CROMOZOM
Reprezinta cele 2 modalitati diferite de
organizare ale ADN-ului in INTERFAZA
(cromatina) si DIVIZIUNE (cromozomi).
ADN ul NUCLEAR
La Ek moleculele de ADN dublu catenare, liniare,
sunt asociate cu proteine histonice, nonhistonice si
mici cantitati de ARN, formand un complex
nucleoproteic numit CROMATINA NUCLEARA.
Interactiunile dintre ADN si proteine au un dublu rol:
- structural - in organizarea moleculei de ADN;
- functional - in mecanismele de expresie si represie
a genelor.
CROMATINA NUCLEARA
Este alcatuita din ADN + proteine (HISTONE,
NONHISTONE) + mici cantitati de ARN
HISTONELE:
Sunt sintetizate de histogene
Se clasifica in 5 clase (dupa nr. si tipurile de
aminoacizi):
H1 (histona cea mai mare, bogata in Lys)
H2A, H2B, H3, H4 (au o structura conservata in
evolutie, ceea ce demonstreza ca au un rol structural
important in organizarea supramoleculara a ADNului).
CROMATINA NUCLEARA
HISTONELE au un dublu rol:
1. Structural ( formarea nucleozomului);
2. Functional - reglarea expresiei genice prin
mecanisme complexe:
- acetilarea histonelor determina activarea unor
gene;
- metilarea histonelor produce represia genelor;
- fosforilarea H1 produce condensarea fibrelor de
cromatina.
CROMATINA NUCLEARA
PROTEINELE NON-HISTONICE:
Reprezinta un grup heterogen de
proteine;
Au rol:
- structural ( formeaza matricea
cromozomilor );
- functional (modularea activitatii
genelor).
STRUCTURA CROMATINEI SI A
CROMOZOMULUI
NUCLEOZOMUL
NUCLEOZOM - unitatea structurala primara a fibrelor de
cromatina alcatuita dintr-un segment de ADN de 146 p.b.
infasurat de 2X in jurul miezului histonic (format din 8 molecule
de histone: 2xH2A, 2XH2B, 2xH3, 2xH4).
Aspect de sirag de
margele pe o ata
NUCLEOZOMUL
FILAMENTUL CU
NUCLEOZOMI
SISTEMUL IERARHIZAT DE
IMPACHETARE AL FIBREI DE
CROMATINA
Al patrulea nivel:
CROMOZOMUL
ADN
NUCLEOZOM
CROMATINA INTERFAZEI
ADN + proteine (HISTONE si NONHISTONE) = CROMATINA
Se prezinta sub 2 forme distincte
morfo-functional: EUCROMATINA si
HETEROCROMATINA
CITOGENETICA
CLASICA
TEHNICI DE GENERATIA I
- cromozomi
colorati uniform;
- putine repere de
identificare;
- folosirea actuala
este limitata.
TEHNICI DE GENERATIA II
Marcaj
cromozomial in
benzi.
(Lancet;2:1971)
- se folosesc
cromozomi
metafazici si
tratamente/coloratii
speciale.
- caracterizeaza
majoritatea
anomaliilor crz. cu
exceptia
microdeletiilor.
BENZILE CROMOZOMIALE
elemente specifice fiecarui cromozom
Structura heterogena a cromozomului:
Se identifica 550-850
benzi / genom
haploid.
TEHNICI DE GENERATIA IV
CITOGENETICA MOLECULARA
Principiu comun: hibridizarea moleculara intre o SONDA ADN
monocatenar si o TINTA (ADN genomic), reprezentata de
regiunea cromozomiala analizata de sonda.
SONDA ADN (fragment ADN monocatenar complementar unei
regiuni de cromozom)
- centromerice
- locus-specifice
- specifice unui cromozom
- telomerice
TINTA (fragmentul genomic analizat de o sonda)
- segmente ADN din crz. metafazici
- segmente ADN din cromatina nucleilor interfazici
- intregul cromozom
- intregul genom
TEHNICI DE GENERATIA V
TEHNICI DE CITOGENETICA MOLECULARA
BAZATE PE MICRORETELE
1. Microretele cu sonde non-polimorfice (CGH array)
2. Microretele cu sonde polimorfice (SNP)
- Permit o analiza cantitativa de inalta rezolutie a numarului de
copii (CNV) ale ADN la scara genomica.
- Identifica regiuni cromozomiale al caror numar de copii este
anormal: deletii sau amplificari.
ELEMENTE CARACTERISTICE
FIECAREI SPECII!
NUMARUL SI MORFOLOGIA
CROMOZOMILOR
IDENTIFICAREA CROMOZOMILOR
folosind tehnici de analiza cromozomiala conventionale
1.MARIMEA
2.POZITIA
CENTROMERULUI
3.MODELUL DE BENZI
(unic pentru fiecare
cromozom)
ELEMENTE MORFOLOGICE SI
FUNCTIONALE COMUNE TUTUROR
CROMOZOMILOR UMANI
1. CROMATIDELE
2. CENTROMERUL
3. TELOMERELE
CROMATIDELE
Sunt subunitati longitudinale identice, CROMATIDE-SURORI;
Sunt atasate una de cealalta la nivelul centromerului prin
intermediul unui complex multiproteic (coezine);
Fiecare cromatida este impartita de centromer in doua brate,
notate conventional p (bratul scurt) si q (bratul lung).
1 cromatida = 1 molecula ADN
CROMATIDA
(cromozom monocromatidic/nereplicat)
CROMOZOM
(cromozom bicromatidic/replicat)
CENTROMERUL
CENTROMER/ REGIUNEA
INTERNA A KINETOCORULUI
REGIUNEA EXTERNA A
KINETOCORULUI
- Atasarea microtubulilor
- migrarea in anafaza
HETEROCROMATINA
CENTROMERICA
BRAT CROMOZOM
CENTROMER si KINETOCOR
MARCAJUL C
evidentiaza heterocromatina constitutiva (in special la nivel
centromeric)
TELOMERELE
sunt structuri specializate, formate din ADN repetitiv si
proteine.
FUNCTIILE TELOMERELOR:
- mentin stabilitatea si integritatea structurala a cromozomului .
- asigura replicarea completa a capetelor cromozomilor.
- stabilirea arhitecturii tridimensionale a nucleului.
MARCAJUL NOR
evidentiaza satelitii
cromozomilor
BANDA
Acel segment cromozomial , clar diferentiat de segmentele
adiacente, avand o coloratie mai inchisa sau mai deschisa.
REPERE SPECIFICE
-Centromerul
-Unele benzi
-Telomerele
REGIUNI
BENZI
SUB-BENZI
7q26.2
CARIOTIPUL (CARIOGRAMA)
NORMAL
Caracteristici:
- Numrul total de cromozomi este 46
- Aranjai n apte grupe de cromozomi notate convenional de la A la
G
- Autozomii sunt numerotai de la 1 la 22 n ordinea descresctoare a
mrimii
- Gonozomii sunt aezai separat, la sfritul cariotipului.
De exemplu,
46,XX sau 46, XY sau 46,XX/47,XXX sau 47,XY,+21
CLASIFICAREA SI
NOMENCLATURA
CROMOZOMILOR UMANI
IDENTIFICAREA CROMOZOMILOR SE FACE PE BAZA
MORFOLOGIEI CROMOZOMILOR
Se utilizeaza criterii precis stabilite
(ISCN).
SIMBOLUL SEMNIFICATIE
p
Bratul scurt al cromozomului
q
Bratul lung al cromozomului
cen
centromer
ter
terminal
A-G
Grupe cromozomiale
1 - 22
Numerele perechilor de autozomi umani
X, Y
Cromozomii sexului (gonozomi sau
heterozomi)
SIMBOLUL SEMNIFICATIE
mos
Mozaic cromozomial
/
Separa clonele celulare in mozaic
//
Separa clone celulare in himerism
h
Heterocromatina constitutiva
+/Inaintea numarului unui cromozom
indica adaugarea / pierderea unui
cromozom intreg
mat
Origine materna
pat
Origine paterna
IDENTIFICAREA
CROMOZOMILOR
LUNGIMEA CROMOZOMULUI
POZITIA CENTROMERULUI
MARI
MIJLOCII
MICI
metacentrici
A 1-3
E 16
F 19-20
submetacentrici
B 4-5
C 6-12, X
E 17-18
acrocentrici
D 13-15
G 21-22, Y
HETEROMORFISMUL
CROMOZOMIAL UMAN
Aceste variaii individuale nu au nici un efect fenotipic
nefavorabil i evident pentru individ NU AU EXPRESIE
FENOTIPICA.
Defineste variatiile morfologice ale unor regiuni cromozomiale
prezente la indivizi din populatia generala;
Sunt rare n populaie; (mai frecvente la cuplurile cu avorturi
spontane repetate sau in grupul persoanelor cu retard mental)
Se motenesc mendelian.
Regiunile cromozomiale variabile
morfologic sunt zone de heterocromatina
variabile ca marime si inactive genetic.
HETEROMORFISMUL
CROMOZOMIAL UMAN
Cromozomul marker este un cromozom
diferit morfologic de omologul su.
HETEROMORFISMUL
CROMOZOMIAL UMAN
La om, au fost evideniate patru tipuri de regiuni variabile:
1.Marimea variabila a regiunii heterocromatice a cromozomului
Y;
2.Regiunile pericentromerice ale tuturor cromozomilor
implicnd mrirea heterocromatinei adiacente centromerului.
3.Polimorfismul marimii si numarului satelitilor;
4.Situs-urile fragile induse de antifolati.
HETEROMORFISMUL
CROMOZOMIAL UMAN
De exemplu:
Constricia secundar prezenta pe bratul q al cromozomilor 1, 9
si 16 poate fi alungit (are o lungime dubl fa de omolog) sau
diminuat. Se noteaz astfel: 9qh+ sau 9qh-;
Variaii dimensionale ale braului q al cromozomului Y (10% din
brbaii normali clinic). De exemplu, Yq+ (mai mare dect q al
cromozomului 19) sau Yq- (mai mic dect q al cromozomului
22). Cromozomul Y foarte foarte mic favorizeaz nondisjunciile
n meioza patern.
Structural
Evolutie
tehnologica
Platforme integrate
multitest
Functional
Calitativ
Cantitativ
Analog
Digital
Examenul de cariotip
Cromozomii pot fi observai prin microscopie
optic doar n timpul diviziunii celulare, n
prometafaz i metafaz.
Pentru obinerea cromozomilor n metafaza sunt
necesare celule care se divid n mod spontan sau
la care prin cultivare i tratamente in vitro poate fi
indus capacitatea de diviziune.
Examenul de cariotip
Mduva osoas, tumorile solide, vilozitile coriale
etc, conin celule cu capacitate spontan de
diviziune.
Diagnostic postnatal
(tulburari de dezvoltare/ anomalii congenitale,
disabiliti intelectuale, anomalii de sexualizare,
tulburri reproductive):
snge periferic,
biopsii cutanate
Indicaii
de analiz:
selecia esutului
de analizat
Diagnostic prenatal:
viloziti coriale,
lichid amniotic,
snge fetal
Diagnostic
oncologic i hematologic:
tumori solide,
mduva osoas +/- snge periferic
Relatia
citogeneticii
clasice cu
tehnologiile
moleculare
Studiile FISH:
Hibridizarea fluorescenta in situ (FISH)
permite investigarea unor secvente specifice
de acizi nucleici (ADN sau ARN) din
specimene fixate pe lama microscopica.
FISH a permis cresterea rezolutiei precum si
largirea gamei de structuri ce pot fi
investigate.
Studiile FISH:
-Rezolutie crescuta ~ 100-200 kb
-Posibilitatea de investigare a celulelor ce nu
se afla in diviziune (FISH interfazic)
-LIMITARI investigarea unor regiuni tintite,
nu a intregului genom
Studii FISH:
Array CGH/SNPs:
-Investigarea intregului genom intr-un experiment unic.
-Rezolutie pana la 0,2 kb.
-Investigarea celulelor ce nu se afla in diviziune.
-Detectia pierderilor heterozigotiei fara modificarea
numarului de copii (CN-LOH).
LIMITARI:
Nu detecteaza anomaliile genetice echilibrate din punct
de vedere al continutului genetic
- Nu detecteaza mozaicisme cu nivel redus
imagine scanata
Array CGH
profil aCGH
date brute
Combinarea
metodelor de
investigatie
genetica
Studiul
arhitecturii
nucleare
blocaj mitotic
soc hipoton
fixare
fibroblaste
celule epiteliale
limfoblati
Condiii de recoltare
RECOLTARE
Asepsie
Anticoagulare
Identificare
prob
TRANSPORT
Condiii de
mediu adecvate
Rapiditate
Studiul
cromozomilor
Bandri cromozomiale
Caracteristici
Benzi R
Tipul de bandare
Coninutul
azotate
structural, dispoziie
longitudinal
baze bogate n GC
Coninutul
de
metilcitozin
5- moderat
Benzi G
structural, dispoziie
longitudinal
bogate n AT
sczut
Transcripie
intens
redus
Densitate genic
redus
Insule CpG
numeroase
reduse numeric
Secvene repetitive
SINEs
LINEs
Replicare
la nceputul fazei S
Metode de analiz
microscopica
Studiile cromozomiale se realizeaza prin vizualizarea in microscopie
optica a cromozomilor etalati in placa metafazica, fixati si colorati.
Rezolutia microscopiei optice - 0,2 microni
Cromozomii umani au dimensiuni de ~ cativa microni lungime
Analiz
microscopica
Hemato-oncologie: analiza si cariotiparea a minim 20 de
metafaze.
Cariotip constitutional: evaluarea a minim 20 de metafaze,
cariotiparea a ~5-10 metafaze; indicatiile clinice cu
suspiciune de anomalie cromozomiala in mozaic
extinderea analizei microscopice la 30-50 de metafaze.
Cariotipul =
rezultatul final al investigaiei citogenetice clasice
n peisajul actual al geneticii moderne diagnosticul
citogenetic continu s reprezinte standardul de aur pentru o serie de
indicaii specifice.