Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Structura proteinelor
CODUL GENETIC
Orice informatie genetica este reprezentata conventional prin semne – simboluri (A,
G, C, T/U);
Codul genetic a fost descris de catre Robert Holley, Har Gobind Khorana si Marshall
Nirenberg in 1965 si a insemnat inceputul erei geneticii moleculare. Codul a fost
descifrat experimental folosind polinucleotide sintetice cu secventa cunoscuta de
ARNm si analizand secventa de aminoacizi a proteinei sintetizate artificial. De
exemplu, ARNm sintetic al poliuracilului a produs un polipeptid alcatuit numai din
fenilalanina, deci tripleta UUU codifica fenilalanina(Premiul Nobel pentru chimie in
1968).
• Codoni start alternativi pot fi GUG sau UUG; acestia in mod obisnuit
reprezinta valina si leucina dar in prezenta unor factori initiatori ai translatiei
sunt tradusi drept metionina si formil-metionina
Acestea se refera mai ales la desemnarea unuia sau doi codoni terminatori drept
codoni codificatori la nivelul genelor mitocondriale si al aminoacizilor nestandardizati.
• Daca intr-o celula prin mutatie se suprima sau se insera 1-2 nucleotide (sau
un alt numar care nu este multiplu de 3) se produce o decalare a cadrului de
lectura al genei care duce la aparitia altui codon.
• Toti codonii vor fi diferiti si se va sintetiza o proteina in care toti aminoacizii vor
fi diferiti de la locul in care s-a produs mutatia(numita frameshift)
1.
Repetitii trinucleotidice
2. Mutatii missense
3. Mutatii nonsens:
4.Deletia:
Tipuri de ARN-polimeraze
TRANSCRIPTIA LA PROCARIOTE
• Initierea;
• Elongatia;
• Terminarea.
Initierea
• σ – recunoaste promotorul;
• Ω – asambleaza ARN-pol.
• Beta si beta prim formeaza impreuna centrul activ al enzimei.
• 2 subunitati alfa;
• 1 beta;
• 1 beta prim;
• 1 omega
• Numai una dintre cele doua catene de ADN este folosita drept matrita, catena
numita antisens(3’→5’);
Faza de elongatie
• Ro dependent
• Situsuri ter
Mecanismul ro dependent
Mecanismul ro independent:
• Acul de par cu coada poli-U distruge legaturile spatiale intre ARN si ARN-pol;
TRANSCRIPTIA LA EUCARIOTE
ARN polimeraza I (nucleol) sintetizeaza ARNr 20S si ARNr 50S; ARN polimeraza II
sintetizeaza ARNm codificat in toate genele structurale si ARNsn; ARN polimeraza
III sintetizeaza ARNt, ARNsn si ARNr 5S.
Structura genei
• Regiunile de reglare:
1. Regiunea 5’-promotorul
2. Regiunea 3’
Cadrul deschis de lectura
5’-CCAGCCATG-3’
Structura promotorului
• Alte doua secvente sunt caseta CAAT si caseta GC. Acestea au rol in
modificarea expresiei genice prin controlul transcriptiei;
• Una dintre casete este situata in amonte si cealalta in aval fata de caseta
CAAT;
• CAAT box este recunoscuta de diferite molecule proteice, unele dintre ele
facilitand transcriptia;
Matisarea alternativa
• ARN-r
• ARN-t
• Aminoacizi
• Enzime
• Donatorii de energie
aminoacil-ARN-t
Faz de initiere
Faza de elongatie
Soseste al doilea ARN-t adaptor, care transporta un aminoacid care care se fixeaza
de ribozom in situsul A. In prezenta peptidil-transferazei din ribozom se stabileste o
legatura peptidica intre cei doi aminoacizi. Dupa legarea aminoacizilor, ARN-t initiator
paraseste situsul P ribozomal prin situsul de iesire E. Ribozomul avanseaza trei baze
pe secventa ARN-m. Prin avansare , al doilea ARN-t trece pe situsul P. Situsul A
este eliberat prin avansare, cuprinzand codonul urmator din secventa ARN-m.
Soseste al treilea ARN-t adaptor, care ocupa situsul A. Se formeaza o noua legatura
peptidica intre aminoacizii 2 si 3, dupa care ARN-t paraseste ribozomul. Lantul
polipeptidic in crestere strabate un tunel in interiorul subunitatii 50S;
Faza de terminare
Acest proces continua de nenumarate ori in directia 3’-5’ pana cand ribozomul atinge
un codon stop(UAA, UAG, UGA). Factorii eliberatori elibereaza lantul polipeptidic de
pe ARN-t, iar cele doua subunitati ribozomale vor fi reciclate. In timpul fazei de
elongatie proteina ia o forma functionala tridimensionala.
Mecanismele de reglare au fost studiate cel mai bine la bacterii. Exemplul clasic:
Modelul operonului descris de catre Francois Jacob si Jacques Monod la E.coli –
premiul Nobel 1965. Ei au demonstrat experimental si teoretic ca sinteza proteinelor
nu este constanta in timp ci variaza in functie de necesitatile celulei. Mecanismele de
reglare au la baza actiunea unor enzime si au fost descrise pentru procariote si
eucariote. Enzimele care intervin in reglarea sintezei proteice pot fi controlate prin 2
mecanisme:
back)
Acest control se realizeaza prin intermediul proteinelor reglatoare care se pot atasa
la ADN si pot bloca sau amplifica functia ARN-polimerazei;
- Corepresori(operonul trp);
- Inductori(operonul lac);
• Sinteza enzimei.
• Inhibitie non-competitiva;
• Inhibitie competitiva.
CONTROL PRETRANSCRIPTIONAL
5. Inactivarea cromozomului X
CONTROL TRANSCRIPTIONAL
CONTROL POSTTRANSCRIPTIONAL
• Controlul translational;
• Controlul degradarii mRNA;
Este limitat la eucariote si determina cum si cand este splitat sau procesat
transcriptul primar pentru a forma ARNm;
• Procesul de splicing
O proteina care este necesara in cantitati mari pe o perioada lunga de timp are un
ARNm foarte stabil.
Aceste proteine produc efecte profunde asupra altor celule si trebuie sa fie inactivate
imediat dupa ce au actionat, deoarece pot produce anomalii de dezvoltare.