Ce este Biofizica?

Biofizica este o tiin fundamental care aplic legile, tehnicile si metodele fizicii n studiul biologiei, deducnd tehnici i metode noi de investigare ct i legiti specifice acestui domeniu. Biofizica este tiina care studiaz fenomenele fizice implicate n funcionarea sistemelor biologice, utiliznd tehnici i concepte fizico chimice, precum i aparatul matematic asociat acestora pentru cercetarea lumii vii. Biofizica studiaz i influena factorilor fizici externi asupra sistemelor biologice (radiaii ionizante i neionizante, temperatur, ultrasunete, cmp magnetic i electric, gravitaie, etc.).

Istoricul Biofizicii

Leonardo da Vinci
Studiaz zborul psrilor
Studiaz mecanismele mersului (nlocuind cu cercuri elastice muchii de pe schelet); Studiaz hemodinamica. Explic funcionarea ochiului pe principiul camerei obscure. Descoper rolul de lentil a cristalinului i explic formarea imaginii pe retin. Explic perceperea reliefului ca efect al vederii binoculare.

Giovanni Alfonso Borelli

Cercetri de biomecanic.

Descrie funcia scheletului ia muchilor.

Consider procesele fiziologice rezultnd din principii fizice i mecanice.

Luigi Galvani
Studii privind excitabilitatea muchiului (laba galvanoscopic )

Alessandro Volta
unul din fondatorii electrofiziologiei si electrochimiei a inventat n anul 1800 prima baterie electric din istorie, aa-numita pil voltaic (era o coloan vertical compus dintr-o succesiune de 1 disc de cupru/1 disc de hrtie mbibat n soluie salin/1 disc de zinc. La extremitile coloanei era ataat cte un fir metalic ntre care se producea un curent electric continuu de joas intensitate).

Thomas Young
fizician si medic englez

a propus n optic teoria tricromatic a vederii colorate valabil i n prezent n toate aplicaiile (TV color, etc). a iniiat studiile de hidrodinamic a circulaiei sanguine;

Hermann Helmholtz
studiaz contracia muscular, msurnd cu precizie remarcabil viteza de propagare a influxului nervos, a perceperii sunetelor muzicale studii de acustic a tuburilor rezonante, a cavitilor acustice rezonante, a transmiterii sunetului (stetoscopul) studii de matematic i de fizic aplicat;

Julius Robert von Mayer

stabilete legea conservrii i transformrii energiei, elabornd principiul I al termodinamicii. Acest principiu a fost dedus de la o observaie cu caracter medical care se refer la diferenele de oxigenare a sngelui n zone climatice diferite, fenomen ce depinde de arderile energetice din organism;

Wilhelm Conrad Rntgen

n 1895 descoper razele X Duce la apariia unei noi specialitii medicale radiologia, studiind aciunea radiaiilor X asupra organismului prin efecte mutagene si efecte radiobiologice.

1902 - apare primul periodic dedicat Biofizicii 1939 - apare Buletinul Biofizicii matematice (la Chicago USA). 1947 - apare la Amsterdam Biochemica et Biophysica Acta. 1956 - apare n n SUA un alt jurnal de prestigiu Biophysical Journal. 1961 - se nfiineaz Societatea de Biofizic a Uniunii Societilor de tiine Medicale din Romnia . 1989 decembrie - apare Societatea Naional de Biofizic pur i aplicat .

Atomi i molecule n biosisteme

Atom = cea mai mic fraciune indivizibil dintr-o substan ce pstreaz proprietile acesteia (n limba
greac atomos nseamn indivizibil ).

Teoria atomic a lui Dalton (sec. XIX)

Materia const n particule bine definite numite atomi. Atomii sunt indestructibili. n reaciile chimice, ei se

rearanjeaz, nu se scindeaz. Toi atomii unui anumit element au mas i proprieti identice. Atunci cnd atomii diferitelor elemente se combin formnd compui, apar particule mai noi i mai complexe. ntr-un compus dat, atomii sunt prezeni ntotdeauna n acelai raport numeric.

Teoria atomic modern

Atomii sunt alctuii din particule
subatomice: protoni, neutroni si electroni. Prezint un nucleu n care se gsesc protoni si neutroni (nucleoni) n jurul lui graviteaz electronii Structura intern a unui atom este corelat cu proprietile lui.

NUCLEUL ATOMIC
Protonii sunt localizai n nucleu, Sarcina electric de +1, Masa aproximativ 1 unitate atomic de mas
u.a.m. 1 u.a.m. =1.67 x 10 -24 g

Elementele difer ntre ele prin numrul de

protoni, ex. Hidrogenul are 1 proton; Heliul are 2. Neutronul este localizat tot n nucleu Nu are sarcin electric

 Numrul atomic reprezint numrul de protoni din

nucleul atomilor acelui element i se noteaz de obicei cu Z . Este caracteristic i unic pentru fiecare element. Poziia elementelor chimice n sistemul periodic al elementelor este determinat de numrul atomic Z, motiv pentru care acesta se mai numete i numr de ordine. ntr-un atom neutru (fr sarcin electric), numrul electronilor este ntotdeauna egal cu cel al protonilor Masa atomic (numit i greutate atomic) reprezint suma numrului de protoni i neutroni din nucleu Atomii aceluiai element pot avea un numr diferit de neutroni, deci numere de mas diferite (dar acelai numr atomic Z). Ei se numesc izotopi (n limba greac izotop nseamn acelai loc).

Izotopi

Orbitali
Un orbital reprezint spaiul ocupat
de un electron n 90% din timp. Orbitalii au forme i niveluri energetice caracteristice i conin maxim 2 electroni Orbitalul s este sferic, localizat in vecintatea nucleului. Orbitalii px, py, si pz au forma alungit, de-a lungul axelor x, y, i z

 Nivelele de energie (straturi) pe care le

pot ocupa electonii, sunt (ncepnd de la nucleu spre exterior) K, L , M, i N Uneori este reprezentat i ocuparea acestora cu electroni: 1s2, 2s2, 2p1, etc. Aceast configuraie ne spune c primul strat are 2 electroni pe orbitalul s, iar cel de al doilea are 2 electroni pe orbitalul s plus 1 electron pe orbitalul p. Distribuia electronilor pe orbitalii unui atom reprezint structura sau configuraia electronic.

Orbitali

Orbitali p

Formule structurale
Orbitalii 1s ai fiecrui atom de H
sunt completai doar pe jumtate. Formnd molecula de H2 ei pun n comun aceti electroni, completndu-i astfel reciproc structura de dublet a orbitalului 1s Mai simplu, o pereche de electroni poate fi reprezentat printr-o liniu H-H

Logica molecular a strii vii.

Organismele vii au n constituia lor:

Ioni de dimensiuni foarte mici (microioni): Na+, K+, Cl- (implicai ndeosebi n excitabilitate), Ca2+ (implicat in contracia muscular), Mg2+ (cu rol n procesul de bioluminiscen), H+ (secretat de mucoasa gastric i generator de tensiuni protonmotrice n anumite microorganisme), HCO3- , HPO42- , OHMicromolecule (neutre sau disociate): aminoacizi, mononucleotide, monozaharide, acizi grai, etc. Macromolecule (proteine, acizi nucleici, polizaharide, lipide) Complexe macromoleculare

Molecule
Moleculele - compui ai cror
elemente se combin ntr-un raport bine definit Formulele moleculare reprezint atomii ce particip, i numrul lor (exprimat n numere ntregi) Zahrul (glucoza) are n fiecare unitate structural 6 atomi carbon, 12 atomi hidrogen i 6 de oxigen. Formula - C6H12O6

Wp

r0 r

Condiiile de formare a moleculei se realizeaz cnd forele de atracie dintre atomi sunt egale cu cele de respingere, iar energia potenial a ansamblului este minim

Fore interatomice si intermoleculare

Forele interatomice
Legtura ionic
Legtura covalent Legtura coordinativ Legtura metalic

Legturi ionice
Se formeaz atunci cnd atomii devin ioni,
prin pierdere sau ctig de electroni.

Ionii cu sarcini contrare se atrag ntre ei,

formnd o legtur ionic i devenind o molecul

Legturile covalente
Atomii pun in comun electroni care umplu
efectiv stratul exterior al atomilor implicai in legtur.

ntr-o legtur covalent, norii electronici

care nconjoar nucleii atomici se suprapun.

 Atomii care formeaz legturi covalente tind s

pun n comun suficieni electroni ca s realizeze pe stratul exterior o structur de dublet sau octet.

Regula octetului (atomii tind s i realizeze o

configuraie de maximum 8 electroni a ultimului strat) se aplic i legturilor covalente.

Legturile covalente polare

Electronii tind s se distribuie mai mult la unul

dintre atomii implicati (ex H2O. ) Electronii se distribuie mai mult la atomul de oxigen, care capt astfel o sarcin negativ (oxigenul are o electronegativitate mai mare) Hidrogenul este srcit n electroni, cptnd o sarcin parial pozitiv. Molecula de ap este astfel polarizat

Caracterele generale ale legturii covalente

este o legtur de distan mic. Distana
dintre doi atomi este inferioar razei de interaciune interatomic; are caracter de saturaie. Odat format legtura dintre doi atomi, perechile electronice nu mai permit alte legturi; cristalele covalente sunt foarte dure (diamantul).

Legtura coordinativ
Legtura coordinativ este o legtur format din doi electroni pui n comun. Electronii sunt furnizai de acelai atom, pentru completarea nivelului energetic extern.
Exemplu oxigenul poate realiza dou legturi covalente dar poate fi i receptor pentru o legtur coordinativ

Legtura metalic
Legtura metalic este o legtur puternic realizat cu electroni pui n comun care genereaz i electroni liberi de conductibilitate

Forele intermoleculare
Forele ce se exercit ntre moleculele ce formeaz o structur biologic forele Van der Waals legturile de hidrogen
Aceste fore sunt mai mici dect forele intramoleculare, dar efectul lor devine semnificativ datorit numrului mare de interacii de acest fel. Energia mic corespunztoare acestor fore permite ruperea i formarea lor destul de uor, ceea ce condiioneaz funciile biologice ale biomacromoleculelor. Forele intermoleculare sunt de natur fizic, ele influeneaz proprietile fizice ale substanelor moleculare i sunt modificate prin dizolvare sau prin modificarea strii de agregare. Forele intermoleculare apar n urma interaciilor dintre dipoli sau dintre dipoli i ioni

Forele Van der Waals

sunt fore electrice ce se exercit ntre dipoli; sunt mult mai slabe dect forele ionice i scad
repede cu distana (cu puterea a aptea a distanei). F 1/ r7 intervin la distane intermoleculare mici (sunt neglijabile n starea gazoas). Legturile chimice sunt mult mai slabe dect ele, deci nu sunt implicate n modificrile structurii i proprietile moleculei.

Dipolul electric -

este un sistem format din dou sarcini electrice egale i de semn contrar, aflate la distanta d una fa de alta

Dipoli permaneni - au o structur dipolar n

absena oricrei fore externe. Aminoacizii, proteinele i lipidele au acest caracter datorit distribuiei de grupri de sarcin pe suprafaa biomoleculelor. Dipoli indui. Se consider un atom (sistem neutru din punct de vedere electric) n apropierea cruia se gsete un ion pozitiv. Ionul va exercita o for de atracie asupra electronilor i o for de respingere asupra nucleului atomului. Atomul se va deforma, adic se produce o uoar separare a sarcinilor pozitive i negative din atom, lund natere un dipol. Acesta se numeste dipol indus deoarece exist att timp ct ionul exist n jurul atomului.

Dipoli tranzitorii. n general, ntr-un atom

sau molecul electronii sunt distribuii simetric n jurul nucleului. La un moment dat, aceast simetrie poate s se modifice, formnd un dipol. Deoarece electronii sunt n continu micare, existena dipolului este condiionat de probabilitatea asimetriei i distribuiei electronice i dureaz att timp ct dureaz aceasta. Un astfel de dipol se numeste dipol tranzitoriu. Dac un astfel de dipol se afl n apropierea unei molecule, atunci poate induce n aceasta dipoli a cror orientare i moment s depind de dipolul tranzitoriu. n biomolecule se pot induce muli dipoli tranzitorii i efectul lor fiind cumulativ, forele dispersive pot avea mare importan.

Legtura de hidrogen
Caz particular al interaciei dipol-dipol O molecul format dintr-un atom de hidrogen i
un atom electronegativ prezint o legtur covalent cu caracter parial ionic. Se formeaz un dipol cu sarcina negativ spre atomul electronegativ i sarcina pozitiv spre atomul de hidrogen. Dac n apropierea acestui dipol se gsete un alt atom, atunci ntre atomul respectiv i dipol se realizeaz o legtur determinat de atracia dintre proton i electronii atomului. Legtura format dintre dipol i atom se numete legtur de hidrogen.

Legtura de hidrogen - caracteristici

distana dintre atomi este foarte mic este de natur electrostatic energia legturii de hidrogen este mai
mare dect energia legturii dipoldipol (Van der Waals) i este mai mic dect legtura covalent. Este mai lung dect legtura covalent i mai scurt dect legtura Van der Waals

Variaia cu distana a energiei poteniale datorat forelor intermoleculare Energia dat de forele de atracie este negativ Energia determinat de forele de respingere este pozitiv

Energia potenial total este rezultanta celor dou energii.

Prezena minimului de energie are mare importan n formarea structurii solidelor.

Macromolecule biologice

 n definirea unei macromolecule

se accept drept criteriu greutatea molecular. Se consider compui macromoleculari, substane a cror mas molecular depete 5000u.

 Macromoleculele pot fi sintetizate natural

(n celule) sau artificial, proces denumit polimerizare sau policondensare. De exemplu:
Prin polimerizarea sau policondensarea aminoacizilor se obin polipeptidele; Prin policondensarea glucozei rezult polizaharide de tip celuloz sau amidon.

Se numesc polimeri compuii

macromoleculari alctuii din grupe identicee de monomeri, care se repet: A-A-A-A-A Se numesc copolimeri compuii macromoleculari ai cror grupe de monomeri nu au o compoziie identic: A-C-B-A-C-D-A-B-D-.

 Biopolimerii sintetizai natural au

aceeai structur biochimic cu polimerii sintetizai artificial, dar se comport diferit din punct de vedere biofizic. Acest comportament diferit confer biopolimerilor naturali proprieti biofizice diferite fa de polimerii artificiali, oferind posibilitatea meninerii structurilor vii.

Proprieti biofizice generale ale biopolimerilor

Macromoleculele particip
structural la nivel de membran celular la realizarea opoziiei la difuzia liber. Sub aspect morfologic, macromoleculele stau la baza structurilor supramoleculare.

Proprieti biofizice generale ale biopolimerilor

Reaciile chimice in vivo au
consum de energie mult mai mic dect in vitro datorit existenei enzimelor ca biocatalizatori. Macromoleculele au capacitate informaional: cazul acizilor nucleici.

Tipuri de macromolecule
Proteine (heteropolimeri de
aminoacizi) Acizi nucleici (heteropolimeri de nucleotide) Polizaharide Lipide

Proteinele din lumea vie

Elemente structurale de baz: aminoacizii

Glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina Fenilalanina, tirozina, triptofan Cisteina, metionina

Serina, treonina Lisina, arginina, histidina Aspartat, glutamat Asparagina, glutamina Prolina

Aminoacid - grupare amino

- grupare carboxil - atom de hidrogen

- amprenta distinctiv - R

Rolul proteinelor
Cataliza enzimatic Micarea coordonat (actina,
miozina) Suport mecanic (colagenul) Imunoprotecie (anticorpii) Generarea i transmiterea potenialelor de aciune

Cele mai importante proteine

Enzime: hidrolitice, de transfer, oxidaze, dehidrogenaze, etc. Proteine de structur: keratin, colagen, fibre din testul conjunctiv. Proteine respiratorii: hemoglobin, mioglobin Proteine plasmatice: serumalbumine, globuline, fibrogen Anticorpi: proteine formate ca reacie la antigeni Hormoni Proteinele din lapte: cazein, lactoglobulin

Tipuri de proteine
Fibrilare filamente (colagenul,
cheratina, miozina, fibrina)

Globulare (insulina, proteinele

plasmatice, globulinele, enzimele)

Organizarea structural i conformaional a macromoleculelor biologice

structura primar structura secundar structura teriar structura cuaternar

Structura primar a hexokinazei

AASXDXSLVEVHXXVFIVPPXI LQAVVSIATTRXDDXDSAAA S I P M V P G W V L K Q V X G S Q A 61 GSFLAIVMGGGDLEVILIXL AGYQESSIXASRSLAASMXT TAIPSDLWGNXAXSNAAFS SX E F S S X A G S V P L G F T F X E A G A K E X V I K G Q I 151 T X Q A X A F S LAXLXKLISAMXNAXFPAGD XX XXVADIXDSHGILXXVNY TDAXIKMGIIFGSGVNAAYW CDSTXIADAADAGXXGGAG XMXVCCXQDSFRKAFPSLPQ IXYXXTLNXXSPXAXKTFEK NSXAKNXGQSLRDVLMXYK XXGQXHXXXAXDFXAANVE NSSYPAKIQKLPHFDLRXXX DLFXGDQGIAXKTXMKXVVR R X L F LI A A Y A F R L V V C X I X A I CQKKGYSSGHIAAXGSXRDY SGFSXNSATXNXNIYGWPQ SAXXS KPIXITPAIDGEGAA XXVIXSIASSQXXXA XXSAX

Structura primar

se refer la secvena aminoacizilor n lanul polipeptidic care se nlnuiesc n secvene bine determinate genetic. Proteinele sunt alctuite din aminoacizi legai ntre ei prin gruprile COOH i NH2 cu eliminarea unei molecule de ap pentru fiecare legtur.

Structura secundar - const n spiralarea sau plicaturarea lanului polipeptidic primar.

Legturile intermoleculare se realizeaz prin puni de hidrogen

Structura secundar A-helix

Structura secundar B pliat

Structura teriar - hexokinaza

Structura teriar
rezult din ndoirile structurii secundare i d forma moleculei proteice

Structura cuaternar este

Structura cuaternar hemoglobina

rezultatul asocierii specifice prin diferite tipuri de legturi a mai multor structuri teriare.

Acizi nucleici
Acizii nucleici sunt macromolecule complexe. ndeplinesc n principal dou funcii:
1. depoziteaz informaia genetic 2. particip la sinteza proteinelor

Acizii nucleici sunt reprezentai de: ADN ARN

suportul informaional ereditar

ADN

utilizeaz informaia ereditar purtat de ADN pentru a sintetiza proteinele

ARN

Polizaharidele
Sunt rspndite att n regnul vegetal, ct
i n cel animal, avnd o mare importan biologic. Polizaharide vegetale: amidonul i celuloza Polizaharide de origine animal: glicogenul. Polizaharidele se obin prin eliminarea a ,,n molecule de ap ntre mai multe molecule de monozaharide Servesc la stocarea glucozei, aliment de baz al celulei

Lipidele
Masele moleculare ale lipidelor individuale
sunt mici (750 1500 daltoni) comparativ cu celelalte clase de molecule, astfel c unele lipide se pot asocia spontan n structuri supramoleculare i uneori funcioneaz n sisteme macromoleculare. Din acest motiv pot fi considerate n mod arbitrar macromolecule. n mod deosebit sunt importante fosfolipidele membranelor celulare