Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
10. Indicati factorii transcriptionali care se lega sub forma dimerica si monomerica de
ADN?
Receptorii orphan apartin clasei receptorii nucleari si sunt factori transcriptionali de tipul C4
care se leaga la ADN sub forma monomerica si dimerica. La fel si clasa PAX.
Sub forma monomerica se leaga la ADN urmatorii factori transcriptionali: proteinele cu
homeodomeniu, proteinele ETS, proteinele Forked, factorii transcriptionali T-BOX si MADS-
BOX, MEF2-Mynocyte Enhancer Binding actor.
Sub forma dimerica se leaga la ADN: receptorii nucleari, clasa Leu-Ziper, clasa HLH si clasa
HTH de la procariote.
11. Indicati factorii transcriptionali care depind de cofactori transcriptionali.
Exista factori transcriptionali care depind de cofactori transcriptionali: receptorii nucleari.
Receptorii pentru glucocoticoizi depind de cofactorul AP-1. De asemenea cofactorul TFIIB este
un factor bazal al receptorilor pentru progesteron si estrogeni. Iar proteinele TAF de la
Drosophila interactioneaza cu domeniul de legare al receptorilor RXR si al hormonilor tiroidieni.
12. Ce factori transcriptionali contacteaza fosa majora din ADN? Dar pe cea minora?
Factorii transcriptionali care contacteaza fosa majora din ADN sunt: factorii Leucin-
Zipper interactioneaza cu fosa majora a ADN-ului prin intermediul aminoacizilor de la
nivelul suprafetei interne din cadrul domeniului bazic N-terminal. Superclasa factorilor
transcriptionali HTH interactioneaza si ei cu adancitura majora a ADN-ului fiind
implicati AA de la nivelul helixului de recunoastere. Factorul TFIIA interactioneaza si el
cu fosa majora din ADN-ului. Proteinele cu homeodomeniu – homeodomeniu
Antennapedia se asociaza cu curbura majora a ADN prin intermediul helixul de
recunoastere.
Factorii transcriptionali care contacteaza fosa minora din ADN: clasa T-BOX, clasa
MADS-BOX, clasa HMG. Proteinele cu homeodomeniu – homeodomeniu Antennapedia
prin intermediul capatului N-terminal al bratului flexibil interactioneaza cu fosa minora a
ADN.
Factorii transcriptionali Forkhead stabilesc contacte atat cu fosa majora cat si cu fosa
minora a ADN-ului. La fel si clasa Rel.
13. Daca in celule exista urmatoarele proteine: Id, MyoD, Myf5, Rb, AP1, ce fac ele,
prolifereaza sau se diferentiaza? Explicati de ce.
Id este un inhibitor al diferentierii. Se leaga la Myo D si Myf5 la nivelul situsurilor de legare la
ADN si deci aceste proteine devin nefuctionale. AP-1 este functional. Iar Rb are in stare
nefosforilata si are afinitate de legare la AND la Myo D si Myf5. Din cauza ca in celula Id este
atasat la MyoD, Myf5, Rb nu se mai poate lega la cele 2 proteine. Dar va fii fosforilat de o
protein-kinaza C si astfel devine functional.
Concluzie: celulele care prezinta Rb fosforilat si AP-1 nelegat la Myo D si Myf5 intra in
diviziune deci vor prolifera. Iar diferentierea este blocata.
14. Ce factori transcriptionali sunt activati dupa fosforilare?
Factori transcriptionali sunt activati dupa fosforilare: proteinele ETS, factorii transcriptionali
Forkhead, proteina Lin-31.
15. Indicati un tip de factor transcriptional sechestrat in citoplasma in forma inactiva si
precizati mecanismul de activare.
NFKB este un factor transcriptional din clasa Rel sechestrat in citoplasma, sintetizat intr-o
forma inactiva. Activarea NFKB are loc in nucleu si realizeaza in doua maniere:
Fie prin degradarea IKB: IKB este inhibitorul lui NFKB fosforilata prin activarea unor
serin kinaze. O data fosforilata IKB este recunoscuta de enzimele associate cu ubiquidina
si cu ubiquinilaza pe lizinele N-terminale. Ubiquitinilarea determina o modificare de
conformatie careinduce disocierea NFKB- translocat in nucleu in timp ce IKB este
translocat la proteozom unde este degradata.
Activarea NFKB implica peptide fosforilate pe resturile de Tyr care sunt recunoscute de
domeniul SH2 al proteinelor de semnalizare celulara. Fosforilarea Tyr din domeniul
reglator N-terminal al IKB determina activarea lui NFKB care e elberat si translocat in
nucleu.
16. Indicati categorii de factori transcriptionali care coopereaza in procesul transcriptional.
Exemple de interactii.
18. Ce intelegeti prin intiparire genomica? Cand are loc? Prin ce mecanisme se realizeaza?
Intiparirea genomica descrie procesul de blocare a genelor autozomale, in functie de
originea lor gametica. Desi genomurile parentale contin aceleasi gene, procesul de intiparire
permite exprimarea unor gene numai din genomul matern sau din cel patern. Are loc in cursul
diferentierii celulare germinale. Se realizeaza prin procesul de metilarea ADN- ului.
19. Care sunt mecanismele de compensare a dozajului?
Mecanismele de compensare a dozajului sunt:
Absenta compensatiei caracterizeaza speciile la care cromozomii sexului sunt foarte mici
si poarta o fractie foarte mica de gene active.
Intensificarea exprimarii genelor intr-un singur cromozom X la Drosophila
Se caracterizeaza prin faptul ca majoritatea genelor associate cromozomului X de la
mascul sunt transcrise de doua ori mai intens decat acelasi cromozom X de la female.
Reducerea activitatii genelor in cromozomul X de la femele acest mecanism este folosit
in cursul evolutiei la doua grupuri dar intr-un mod diferit. La mamifere are loc
inactivarea cromozomului X in celulele somatice ale femelelor in timp ce la C. elegans
are loc o reducere a activitatii transcriptiei celor 2 cromozomi X a indivizilor
hermafroditi.
20. Ce este compensazomul?
Compensazomul este un complex hetreodimeric format din mai multe proteine (MSL1,
MSL2, MSL3, MLE, MOF) si are rolul de a acetila cromozomii vecini determinand transcrierea
intense a genelor respective. Aceste complexe se formeaza la sute de situsuri de-a lungul
cromozomului X la mascculi.
21. Enumerati rolurile localizarii ARNm.
Asigura un control translational local.
Asigura polaritatea embrionului sau a celulei.
Evita exprimarea gresita a unui ARN.
Evita formarea heterodimerilor in celule care exprima mai multe izoforme a unei
proteine.
22. Enumerati si definiti mecanismele de localizare a ARNm.
Mecanismele de localizare a ARNm sunt:
Transportul nucleocitoplasmatic implica exportul transcriptilor printr-o anumita
regiune a nucleului si localizarea lor in citoplasma.
Exportul din mitocondrii a fost demonstrat la Drosophila unde un ARN produs in
mitocondrii este exportat in citoplasma inconjuratoare si incorporat ulterior in granulele
polare
Controlul spatial al stabilitatii ARN-urilor este un mecanism simplu dar neeficient
pentru localizarea unui ARN. Presupune faptul ca ARN-ul localizat corespunzator este
tradus, iar cel localizat necorespunzator este degradat.
Ancorarea la componentele localizate anterior
Transportul directional este cel mai frecvent. Consta in transportul ADN-ului printr-un
microtubul dintr-o regiune celulara in alta.
Transportul dintr-un tip celular in altul este valabil pentru ARN-urile de la Drosophila
care sunt produse intr-un tip celular – celule nutritive (trofocite) transportate si localizate
in alt tip celular (ovocit).