Transpozoni

Elemente genetice
mobile,care dovedesc
PLASTICITATEA
genomului
TRANSPOZITIA

 SCHIMBAREA LOCALIZARII UNEI SECVENTE DE

adn IN GENOM
 ARE LOC recombinarea genetica DESI NU SE
PRODUCE UN SCHIMB DE MATERIAL GENETIC

 1948 BARBARA McCLINTOCK descoperea “genele

saritoare” investigand porumbul
 1983 este rasplatita cu Premiul Nobel
ELEMENTUL MOBIL produce o ruptura
cromozomiala la nivelul situsului de insertie
al unei gene determinand mutarea locusului
acesteia = TRANSPOZITIE
 Genom dinamic

Adica un genom ce cu siguranta nu este:

- nici fix
- nici imuabil
Transpozonii pot fi o sursa majora de
modificari evolutive in genom

 Rearanjamentele creeaza secvente noi si schimba

functia secventei initale/tinta
 Uneori pot aparea maladii ca urmare a insertiei intr-o
gena functionala, efectul fiind asemanator mutatiilor

La om elementele transpozabile sunt de tip:

transpozoni si retrotranspozoni
Al treilea mecanism il reprezinta secventele de inserat.
I . SECVENTE DE INSERAT

Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 –

13 pb, ‘ repetitii inversate’

Repetitiile directe si inverse/inversate indica

prezenta elementelor genetice mobile
Transpozaza

Secventa de inserat contine:

- o regiune unica codanta pt. enzima
transpozaza si
- o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker
genetic, de ex. gena pt. rezistenta la
antibiotice)
II. TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri
de transpozitii: replicative si non - replicative

1. Tn original ramane la locul sau, se copiaza,iar copia

este inserata la alt nivel  creste nr.de copii ale
Tn in genom;
Mecanism:
copy - paste
 1. Transpozitie replicativa (~Copy-
and-paste)

 Elementul transpozabil este copiat; copia se

insera in segmentul cromozomial tinta.
Element
Replicare Segm.tinta
transpozabil
Integrare

Donor Recipient
2. Transpozitia conservativa

 Mecanism: cut and paste

 Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt
situs
 Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului
original,le sectioneaza – lasand in urma “sticky ends”
- si alipeste Tn in alt loc al genomului)
 ADN polimeraza umple golurile dintre capetele
ramase ‘lipicioase’
 ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic
 Transpozaza

 Se leaga:
- Specific de un situs
- Oriunde in ADN
 Secventele repetitive scurte directe si inverse
sunt importante in excizia transpozonilor de
catre transpozaza, dar si pt ADN polimeraza
2. Transpozitia conservativa (~Cut-
and-paste)

 Elementul se muta prin excizie si integrare.

Element transpozabil Segment

tinta
Excisie & Integrare

Donor Recipient
III. Retrotranspozonii
 Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent
la om

1. ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA.

2. ARN-ul este revers-transcris in cDNA, care este apoi
inserat in segmentul cromozomial acceptor.

Transcriere Target

RNA
Revers transcriere
cDNA
Integrare

Donor
Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la
mamifere:

 Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare

retrovirusurilor, dar nu pot infecta celule noi avand actiune
limitata la un singur genom; au revers-transcriptaza si LTR
 Retrotranspozonii nevirali, fara 3’LTR (long terminal repeats),
au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie
independenta
 Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate, fara revers-
transcriptaza, nu transpozeaza independent; sunt de 2 tipuri:
- cu nr.redus de copii (LINEs)
- cu nr. inalt de copii: SINEs; Ex. fam. Alu
Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror
mobilitate este ARN-mediata

Reverse transcriptase
encoded by the LINE-1 element

Little Alberts 6-34

© Garland
Retrotranspozomi umani:

Alu1 SINEs (short-interspersed sequences)

• ~300 bp long, repetate de 300.000-500.000X.

• Flancate de repetitii de 7-20 bp; dispersate in intregul genom in

medie o copie la 5000pb

• Unele sunt transcrise prin intermediul unui ARN .

• AluI SINEs depistat in neurofibromatoza ( inactivarea genei) .

 L-1 LINEs (long-interspersed sequences): elemente lungi
de spatiere

 Elemente de 6,5 kb (majoritatea prezinta deletii), repetate

de 50.000-100.000X (~5% of genom).

 Contin gene cu valoare functionala cum sunt cele ce

codifica polimeraza (pol) si transcriptaza;
 migreaza in genom prin intermediul ARN

 Unele cazuri de hemofilie apar prin insertia unui element

L1
 Elemente transpozabile SINE: familia Alu

1,090,000
copies

(1) marime: ~ 300 bp

(2) Reprezinta ~ 13% din genom

(3) Transpozitia implica prezenta

reverstranscriptazei in celula gazda si
formarea unui ARN intermediar.

(4) Apare in special in regiunile

bogate in –GC-
 Densitatea elementelor repetitive variaza in
diferite regiuni genomice
 Elementele LINE se acumuleaza in regiuni
bogate in AT
 Elementele Alu se acumuleaza in regiuni
bogate in GC.
Element Transpozabil: element genetic mobil al cromozomului care are
capacitatea de a-si modifica pozitia in genom.

• Sunt componente normale si ubiquitare ale genomului procariot si eucariot.

Procariote-transpozitie de la/catre cromozomul celulei, plasmidic, fagic.

Eucariote-transpozitie in cadrul aceluiasi cromozom sau pe un altul.

• Elementele transposabile produc modificari genomice; prin amplificarea si

dispersia lor, prin rearanjamentele induse de excizie/insertie au o contributie
importanta in evolutia genomului speciilor.

•Determina rearanjamente cromozomiale( deletii, inversii, duplicatii,

translocatii).
•Creste dimensiunea genomului (in special la plante), creste nr. de copii ale
elementului mobil in genom.
•Mutarea genelor sau a unor secvente genice in alte regiuni ale genomului;
•Crearea de pseudogene.
Alterari la nivel genic

 Inactivarea genelor prin insertii;

 Crearea unor secvente noi in cadrul genelor care pot
determina modificarea functiei .
 Alterarea secventelor reglatoare →modificari de
expresie genica
 Crearea de noi introni;
 Asamblarea de noi gene prin componentele purtate
de un element mobil.

Agenti mutageni biologici: modifica structura/

expresia genelor
 Duplicatii genice si exonice datorita elementelor repetitive

Defecte de aliniere in cursul meiozei

crossing over “inegal”

Little Alberts 9-5

Cromozom fara gene globinice
© Garland
Fig. 20.2, Integration of IS element in chromosomal DNA.