GENA

Gena are trei caracteristici de bază:
• - unitate funcţională • - unitate mutaţională • - unitate de recombinare

Visual

Structura genei
• 5’ – 3’ catena sens, codificatoare • 3’ – 5’ catena antisens, matrice pentru ARNpm

Structura genei • Promotorul (200pb) • Unitatea functionala • Terminatorul .

cu secvenţa consens GGGCGG situata la circa 90 p. în amonte faţă de SIT . prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT • cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT) • cutia GC.b. .PROMOTORUL • cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN .

situsul de poliadenilare . TAG. codonul iniţiator ATG dupa ultimul exon din zona centrala transcrisa a genei exista o secventa 3’UTR necodanta (transcrisa dar netranslata) Ea începe cu unul din codonii stop (TAA.• • • • S. TGA) ce reprezintă semnalul de oprire a sintezei proteinei.I.T 5’UTR (untranslated region) conţine o secvenţă (prezentă la toate genele) 5'-CCAGCCATG-3'. Gene structure Protein coding sequence 5‘UTR 3‘UTR promotor exon 1 exon 2 exon n-1 exon n .

A 1 … A n .STOP protein sequence protein 3D structure .Pentru ca ARNpm sa devina ARNm: • matisare • + CAP • poliadenilarea capatului 3’ • acoperirea cu un strat proteic protector Gene Structure TRANSCRIPTION 5’ SPLICING 3’ pre-mRNA mRNA TRANSLATION AUG .

.

.Unitatea functionala are o structura discontinua. fiind alcatuita din exoni si introni.

EXONI • Numarul exonilor variaza de la o gena la alta (intre 2 si mai mult de 50) .

INTRONI .

.

Genes per chromosome .

• Genele alele sunt situate în aceleaşi locusuri în perechile de cromosomi omologi – unul de la forma părintească masculină şi altul – de la cea femenină (cu excepţia genotipurilor XY. XO) .

INTERACTIUNILE DINTRE GENE • • • • • Interactiunea intre genele alele se manifesta prin relatii de dominanta recesivitate codominanta letalitate sau semiletalitate Penetranta reprezinta frecventa de manifestare in fenotip a unei gene dominante. .

adică nu codifică sinteza niciunei glicoziltransferaze. B şi O. .Trei alele situate pe 9q34 sunt implicate în determinismul genetic al sistemului AB0: A. • A si B sunt codominante • A si B sunt dominante faţă de 0 • Alela 0 este nefuncţională.

Interactiunea intre genele nealele A. Epistazia .

.

mare de recombinari (crossing – over) Recombinari putine sau absente (valori scazute ale fractiei de recombinare) A B .Inlantuirea genica (linkage) Gene sintenice = gene cu loci pe acelasi cromozom A B Nr.

000.Frecventa de recombinare • θ este raportul intre numarul de descendenti recombinanti si numarul total de descendenti • Unitatea de masura a distantei genetice este denumita Morgan 1 centiMorgan (cM) = distanta genetica in care se produc recombinari cu o frecventa de 1% 1cM ~ 1.000kb) Ex: un cromozom cu 1-3 recombinări per meioză prezintă deci 100-300 cM. .000 pb (1.

Cum aflam daca 2 gene sunt situate pe acelasi cromozom? Cromozomi diferiti Acelasi cromozom θ = 0.5 θ < 0. .5 Cu cat θ este < 0.5 cu atat distanta dintre cei 2 loci este mai mica.

.

.

numite faze de inlantuire:  cuplare sau cis ( A si b. respectiv a si B)  repulsie sau trans (A si B.Recombinarea creeaza noi haplotipuri Intre 2 perechi de gene alele (A/a si B/b) exista 2 posibilitati de dispunere. respectiv a si b) A b A B a A B b a b a B .

1) este egală: probabilitatea datelor dacă locii sunt înlănţuiţi la valoarea 0..5) Logaritmul zecimal al probabilităţilor relative (deci al raportului de probabilitate) sau scorul LOD simbolizat prin Z(θ): Z(θ)= log10 [L(θ)/L(θ0.5)] . 0.DETERMINAREA SEMNIFICAŢIEI REZULTATELOR ANALIZELOR DE ÎNLĂNŢUIRE: SCORUL LOD Probabilitatea relativă la o anumită valoare a lui θ (de ex.1 a lui θ/ probabilitatea datelor dacă locii sunt neînlănţuiţi = L(θ) /L(θ0.

unde R este numărul de recombinanţi şi NR este numărul de nerecombinanţi. Cel mai bun scor este dat de valoarea maximă a lui Z. un scor LOD mai mare decât 0 este o dovadă în favoarea înlănţuirii.1.θ)NR] / 0. pe baza formulei de mai sus.5 va fi totdeauna egal cu zero.5NR+R = log10 [θ1(1. în felul următor: Z(θ)= log10 [θR(1.067 Scorul LOD la θ=0.10)= log10 [0. în timp ce un scor LOD mai mic de 0 (deci negativ) pledează contra înlănţuirii.5)] este egală cu 0..53+1 Pentru o frecvenţă de recombinare θ=0.θ)NR iar probabilitatea absenţei înlănţuirii [L(θ0.90)3] / 0. Probabilitatea unei înlănţuiri [L(θ)] este egală cu θR(1. .54 =0. Dacă de ex.5NR+R. din patru descendenţi unul singur este recombinant scorul LOD se calculează.θ)3] / 0.101(0.Pentru analiza de înlănţuire în familiile mici.θ)NR] / 0. calculul scorului este: Z(0.5NR+R. probalităţile se calculează pe baza distribuţiei binomiale a probabilităţii: Z(θ)= log10 [θR(1.

5% ADN) + un genom mitocondrial (simplu şi mic.U.M.000 gene .5%).F IAŞI STRUCTURA GENOMULUI UMAN GU = un genom nuclear (complex. 25. 0. 99.

6 Kb Număr de molecule de ADN diferite Asocierea cu proteine Procentul de ADN codant Număr de gene 23 (la celulele XX) sau 24 (la celulele XY) Mai multe clase de histone şi proteine nehistonice 10 %  35.Caracteristici Genom nuclear Genom mitocondrial Mărime 3200 Mb 16.000 gene O moleculă circulară de ADN Neasociat cu proteine 97 % 13 gene codifică polipeptide. 9-L) Absenţi Exclusiv maternă Introni Ereditate Prezenţi în cele mai multe gene Mendeliana pentru genele de pe autosomi şi cromosomul X. paternală pentru secvenţele de pe Y .22 ARNt şi 2 pt ARNr 37gene (28-H.

. • Codul genetic mitocondrial diferă puţin de cel nuclear • contigue. ADN este alcătuit din trei catene.M. • neasociat cu proteine.U.F IAŞI GENOMUL MITOCONDRIAL • • ADNmt – câteva mii de copii per celulă = 0. cunoscută ca ADN 7S.569 pb). bucla D. prin sinteza unei piese scurte adiţionale la catena H. • fără introni. Într-o mică regiune. • circular. • compact: 97%=secvenţe codante • • 37 de gene: Cele două catene ale ADN mitocondrial au o compoziţie bazică diferită: o catenă "grea" (H) este mai bogată în guanină iar cealaltă catenă "uşoară" (L) în citozină.5% Genomul mitocondrial diferă de genomul nuclear: • mic (16. • fără ADN repetitiv.

la care transpoziţia este realizată prin intermediul ARN .TRANSPOZONII La om elementele transpozabile sunt de tip: • transpozoni. secvenţe de ADN copiate prin transpoziţie mediată de ADN • retrotranspozoni.

‘ repetitii inversate’ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile Secventa de inserat contine: -o regiune unica codanta pt.Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb. enzima transpozaza si -o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic .

le sectioneaza si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase ‘lipicioase’ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .Integration of IS element in chromosomal DNA. Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.

se copiaza.replicative 1.de copii ale Tn in genom. Mecanism: copy .paste .TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non .iar copia este inserata la alt nivel  creste nr. Tn original ramane la locul sau.

Transpozitie replicativa (Copy-and-paste) • Elementul transpozabil este copiat.tinta Integrare Donor Recipient . Element transpozabil Replicare Segm. copia se insera in segmentul cromozomial tinta.

Transpozitia conservativa (Cut-and-paste) • Elementul se muta prin excizie si integrare. • Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient .

Transcriere RNA Target Revers transcriere cDNA Integrare Donor . ARN-ul este revers-transcris in cDNA.Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1. ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. 2. care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor.

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. au revers-transcriptaza si LTR • Retrotranspozonii nevirali. fara revers-transcriptaza.Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere: • Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor. fara 3’LTR (long terminal repeats).redus de copii (LINEs) .cu nr. nu transpozeaza independent. inalt de copii: SINEs. sunt de 2 tipuri: .cu nr. Ex. au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta • Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate. fam. Alu .

Insusiri legate de functia genelor • Specificitatea ordonarea particulara a nucleotidelor pe o anumita secventa din structura primara a moleculei de AND • Pleiotropiaex: sindromul Marfan). .

• Expresivitatea polidactilie. sindactilie si adactilie. . aceste deformatii sunt printre cele mai intalnite anormalitati congenitale.

• Poligenia – în cazul înălţimii. spina bifida. . Exista boli sau malformatii congenitale determinate poligenic. ulcerul duodenal etc. diabetul zaharat. inteligenţei. culorii pielii si ochilor. luxatia congenitala de sold(displazia congenitala a articulatiei coxo-femurale) . Ex. greutăţii.

4. 800. %7.3..80 5...94.80 . .2.7424842..5090097. 0342:: 54207.:250 4:70/3970./4148147../0 8../0 .94341$0020393.50900 7.3907.50890%33.9430.009::..3854.385443:: 473. 8. 080..

7.. .9.382 ...%#$!   %3 .0  %3 473.890 .30 . 0890 3807.0%3 30342 0.4.: 8. .95:7/0 97.9..38549705.93.45.45.425479.70890 37 /0.45 .: 80.7 .45 .2.08343 705.45 5..0 .9.

%7.385490 705. 803807.3802039:.9.939.70 4347 #0.9.. 02039 97.3/ 5.70 $02 939.45.890 W 02039:97.3854.3854.-0890.45.. 45 ..5039 . 3907.742442.- #05.

:9 .3854. /70.5039 . 573 0.890 W 02039: 802:9.80 3907.950 0203997..38549. /70. .. .950 .0 8 3907.9 802:9.70 W %3 38:8 89:8 .9. .- $02039 939..%7.0399.0399..90 1.70 4347 #0.90 802:9..43807.3/ 5.

.078 97.700890.38.70.783.70 4347 ...38.170.. %.02. 42   :002039::24-089097..7070 .05947 #097497..742442.7070 # #0. .38.54 3807.039.783#  # :089070.07897.38.709 3907.38549. %7.93802039:.5.

#097497.3/ .759.-0.078097.9.747 24-9.80 03..38.900890# 20/. #0.385443002039097..3854.4/0/-90 002039 990-0798   .7.

 7050. 3: 97.38.078 97.9..759..9/0.89.:70.38540.9..45 8 . 70.45$8  1.73:549 310. %# 4390723.078 97.38.: 70..8%# W #097497.2.078 97.385490 3/0503/039.21070 W #0974.7.759..3/0503/0398:39 /095:7 .0:034.759.  1.7:8:747 /.5.-/097.0390. 13/.802...2 : .9:30 29.390/07097497.:383:70342.: 80.38.38544330.3..08.7.:37 3.98 ...:37 70/:8/0.70 70974.3/..385443.8025479..7.7:8:7003/4030.90 1. W #0974 580:/40300  580:/04030574.94..

:0/0  W !049745.7.70.03047 W $50. 3:..79.7. 80. 572. 47/43..9..3:29.039.:.71.90.5.9:7.38:870.1. 083/742:.049/047504.240./3897:.90/01:3.9.3  .

W 5708.00 2...39. 54/.3472.90.0890/01472.9 .90  .908.0  .390./.98:39573970.90 83/.9.43039.9...

1472.  853.43039.:L3gx2  70:9gx 39003x0 .07:/:4/03.44 102:7..905403.43039.0  /.-09: ..09.90. -1/. .W !403. :. L3.-48..47 89../0 84/ /85.43039.:47508 4.:...9 :.9.9.7.:2.79. ..0 /090723..

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful