GENA

Gena are trei caracteristici de bază:
• - unitate funcţională • - unitate mutaţională • - unitate de recombinare

Visual

Structura genei
• 5’ – 3’ catena sens, codificatoare • 3’ – 5’ catena antisens, matrice pentru ARNpm

Structura genei • Promotorul (200pb) • Unitatea functionala • Terminatorul .

PROMOTORUL • cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN . prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT • cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT) • cutia GC. cu secvenţa consens GGGCGG situata la circa 90 p.b. în amonte faţă de SIT . .

TGA) ce reprezintă semnalul de oprire a sintezei proteinei. situsul de poliadenilare . TAG.T 5’UTR (untranslated region) conţine o secvenţă (prezentă la toate genele) 5'-CCAGCCATG-3'.• • • • S. codonul iniţiator ATG dupa ultimul exon din zona centrala transcrisa a genei exista o secventa 3’UTR necodanta (transcrisa dar netranslata) Ea începe cu unul din codonii stop (TAA.I. Gene structure Protein coding sequence 5‘UTR 3‘UTR promotor exon 1 exon 2 exon n-1 exon n .

STOP protein sequence protein 3D structure .A 1 … A n .Pentru ca ARNpm sa devina ARNm: • matisare • + CAP • poliadenilarea capatului 3’ • acoperirea cu un strat proteic protector Gene Structure TRANSCRIPTION 5’ SPLICING 3’ pre-mRNA mRNA TRANSLATION AUG .

.

. fiind alcatuita din exoni si introni.Unitatea functionala are o structura discontinua.

EXONI • Numarul exonilor variaza de la o gena la alta (intre 2 si mai mult de 50) .

INTRONI .

.

Genes per chromosome .

XO) .• Genele alele sunt situate în aceleaşi locusuri în perechile de cromosomi omologi – unul de la forma părintească masculină şi altul – de la cea femenină (cu excepţia genotipurilor XY.

.INTERACTIUNILE DINTRE GENE • • • • • Interactiunea intre genele alele se manifesta prin relatii de dominanta recesivitate codominanta letalitate sau semiletalitate Penetranta reprezinta frecventa de manifestare in fenotip a unei gene dominante.

. • A si B sunt codominante • A si B sunt dominante faţă de 0 • Alela 0 este nefuncţională. B şi O. adică nu codifică sinteza niciunei glicoziltransferaze.Trei alele situate pe 9q34 sunt implicate în determinismul genetic al sistemului AB0: A.

Epistazia .Interactiunea intre genele nealele A.

.

mare de recombinari (crossing – over) Recombinari putine sau absente (valori scazute ale fractiei de recombinare) A B .Inlantuirea genica (linkage) Gene sintenice = gene cu loci pe acelasi cromozom A B Nr.

Frecventa de recombinare • θ este raportul intre numarul de descendenti recombinanti si numarul total de descendenti • Unitatea de masura a distantei genetice este denumita Morgan 1 centiMorgan (cM) = distanta genetica in care se produc recombinari cu o frecventa de 1% 1cM ~ 1.000.000 pb (1. .000kb) Ex: un cromozom cu 1-3 recombinări per meioză prezintă deci 100-300 cM.

5 Cu cat θ este < 0.5 cu atat distanta dintre cei 2 loci este mai mica.Cum aflam daca 2 gene sunt situate pe acelasi cromozom? Cromozomi diferiti Acelasi cromozom θ = 0. .5 θ < 0.

.

.

Recombinarea creeaza noi haplotipuri Intre 2 perechi de gene alele (A/a si B/b) exista 2 posibilitati de dispunere. respectiv a si B)  repulsie sau trans (A si B. respectiv a si b) A b A B a A B b a b a B . numite faze de inlantuire:  cuplare sau cis ( A si b.

. 0.5) Logaritmul zecimal al probabilităţilor relative (deci al raportului de probabilitate) sau scorul LOD simbolizat prin Z(θ): Z(θ)= log10 [L(θ)/L(θ0.1 a lui θ/ probabilitatea datelor dacă locii sunt neînlănţuiţi = L(θ) /L(θ0.1) este egală: probabilitatea datelor dacă locii sunt înlănţuiţi la valoarea 0.DETERMINAREA SEMNIFICAŢIEI REZULTATELOR ANALIZELOR DE ÎNLĂNŢUIRE: SCORUL LOD Probabilitatea relativă la o anumită valoare a lui θ (de ex.5)] .

5NR+R = log10 [θ1(1. calculul scorului este: Z(0.5)] este egală cu 0.101(0.067 Scorul LOD la θ=0.5NR+R.θ)NR] / 0.90)3] / 0. pe baza formulei de mai sus. .Pentru analiza de înlănţuire în familiile mici. unde R este numărul de recombinanţi şi NR este numărul de nerecombinanţi. Probabilitatea unei înlănţuiri [L(θ)] este egală cu θR(1.θ)3] / 0.. probalităţile se calculează pe baza distribuţiei binomiale a probabilităţii: Z(θ)= log10 [θR(1.5 va fi totdeauna egal cu zero.θ)NR] / 0.5NR+R. Dacă de ex. în timp ce un scor LOD mai mic de 0 (deci negativ) pledează contra înlănţuirii. un scor LOD mai mare decât 0 este o dovadă în favoarea înlănţuirii. Cel mai bun scor este dat de valoarea maximă a lui Z.θ)NR iar probabilitatea absenţei înlănţuirii [L(θ0.1.54 =0.10)= log10 [0.53+1 Pentru o frecvenţă de recombinare θ=0. din patru descendenţi unul singur este recombinant scorul LOD se calculează. în felul următor: Z(θ)= log10 [θR(1.

5%).5% ADN) + un genom mitocondrial (simplu şi mic. 25. 99.F IAŞI STRUCTURA GENOMULUI UMAN GU = un genom nuclear (complex.U. 0.M.000 gene .

22 ARNt şi 2 pt ARNr 37gene (28-H.000 gene O moleculă circulară de ADN Neasociat cu proteine 97 % 13 gene codifică polipeptide.Caracteristici Genom nuclear Genom mitocondrial Mărime 3200 Mb 16. 9-L) Absenţi Exclusiv maternă Introni Ereditate Prezenţi în cele mai multe gene Mendeliana pentru genele de pe autosomi şi cromosomul X.6 Kb Număr de molecule de ADN diferite Asocierea cu proteine Procentul de ADN codant Număr de gene 23 (la celulele XX) sau 24 (la celulele XY) Mai multe clase de histone şi proteine nehistonice 10 %  35. paternală pentru secvenţele de pe Y .

M. • Codul genetic mitocondrial diferă puţin de cel nuclear • contigue.5% Genomul mitocondrial diferă de genomul nuclear: • mic (16. cunoscută ca ADN 7S. . • circular.U. • compact: 97%=secvenţe codante • • 37 de gene: Cele două catene ale ADN mitocondrial au o compoziţie bazică diferită: o catenă "grea" (H) este mai bogată în guanină iar cealaltă catenă "uşoară" (L) în citozină. ADN este alcătuit din trei catene. • fără ADN repetitiv.F IAŞI GENOMUL MITOCONDRIAL • • ADNmt – câteva mii de copii per celulă = 0. Într-o mică regiune.569 pb). bucla D. • neasociat cu proteine. • fără introni. prin sinteza unei piese scurte adiţionale la catena H.

la care transpoziţia este realizată prin intermediul ARN . secvenţe de ADN copiate prin transpoziţie mediată de ADN • retrotranspozoni.TRANSPOZONII La om elementele transpozabile sunt de tip: • transpozoni.

‘ repetitii inversate’ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile Secventa de inserat contine: -o regiune unica codanta pt.Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb. enzima transpozaza si -o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic .

Integration of IS element in chromosomal DNA. Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.le sectioneaza si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase ‘lipicioase’ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .

de copii ale Tn in genom.paste .TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non .replicative 1. se copiaza. Tn original ramane la locul sau.iar copia este inserata la alt nivel  creste nr. Mecanism: copy .

copia se insera in segmentul cromozomial tinta. Element transpozabil Replicare Segm.Transpozitie replicativa (Copy-and-paste) • Elementul transpozabil este copiat.tinta Integrare Donor Recipient .

• Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient .Transpozitia conservativa (Cut-and-paste) • Elementul se muta prin excizie si integrare.

ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor. Transcriere RNA Target Revers transcriere cDNA Integrare Donor . 2. ARN-ul este revers-transcris in cDNA.Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1.

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

cu nr. nu transpozeaza independent. au revers-transcriptaza si LTR • Retrotranspozonii nevirali. fara 3’LTR (long terminal repeats). inalt de copii: SINEs.cu nr. dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. Alu .Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere: • Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor. Ex. sunt de 2 tipuri: . fara revers-transcriptaza. au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta • Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate. fam.redus de copii (LINEs) .

.Insusiri legate de functia genelor • Specificitatea ordonarea particulara a nucleotidelor pe o anumita secventa din structura primara a moleculei de AND • Pleiotropiaex: sindromul Marfan).

.• Expresivitatea polidactilie. sindactilie si adactilie. aceste deformatii sunt printre cele mai intalnite anormalitati congenitale.

• Poligenia – în cazul înălţimii. culorii pielii si ochilor. spina bifida. diabetul zaharat. inteligenţei. Exista boli sau malformatii congenitale determinate poligenic. . Ex. luxatia congenitala de sold(displazia congenitala a articulatiei coxo-femurale) . ulcerul duodenal etc. greutăţii.

8. 0342:: 54207. %7.80 5.3907.94341$0020393.94.50890%33.:250 4:70/3970.80 .009::.5090097..9430..7424842./0 8. 080.3854.2.385443:: 473.4. 800..50900 7./4148147... ..3./0 ...

%#$!   %3 .7 .45.0  %3 473.45 5. 0890 3807.382 .70890 37 /0.30 .9.: 80.38549705.890 ..08343 705.93..425479..0 .45 . .2.7.95:7/0 97.9.45 .: 8..0%3 30342 0.45.4..9. .

. 3907.5039 .45.70 $02 939.3802039:.3/ 5.742442.939.70 4347 #0. 45 .9.- #05.-0890. 803807.3854.%7.45. 02039 97..9.3854.385490 705.890 W 02039:97..

9 802:9.70 4347 #0.43807..%7.3854.0 8 3907. :9 .. /70.38549.5039 .90 1.- $02039 939. /70.3/ 5.950 .80 3907.950 0203997. . .0399. 573 0.9...890 W 02039: 802:9..90 802:9.0399.70 W %3 38:8 89:8 . .

.38. %.078 97.709 3907..38549.38..742442.54 3807.700890.07897.7070 .38.38.70 4347 . %7.039. 42   :002039::24-089097.7070 # #0.783.93802039:.170. .5.05947 #097497.70...02.783#  # :089070..

38. #0..3/ .3854.747 24-9..759.385443002039097.4/0/-90 002039 990-0798   .900890# 20/.-0.80 03.7.078097.9.#097497.

.802.5.078 97.3.  1.98 .45 8 . %# 4390723.385443.94.0390.8%# W #097497.385490 3/0503/039..:383:70342.38.9.9...078 97.7.45$8  1.390/07097497. 70.2.9:30 29.7..: 70. 13/.73:549 310.3/0503/0398:39 /095:7 .89.-/097..759..078 97.: 80.7:8:747 /.38544330..3/.8025479.759. W #0974 580:/40300  580:/04030574..0:034. 7050.7:8:7003/4030.:70.:37 3..7.38.21070 W #0974. 3: 97...2 : .90 1.38540..759.9/0.38.08.70 70974.:37 70/:8/0.

.:..1.3  .3:29.71. 3:. 572.03047 W $50.70.9.90. 083/742:.9:7. 80.7..039./3897:.7. 47/43.90/01:3.79.240.9.:0/0  W !049745.38:870.5.049/047504.

W 5708.90./.0  .9.9 .90 83/.98:39573970.908.9.. 54/..390.3472.0890/01472.43039.00 2...39.90  .

 -1/.:47508 4.90.43039..  853. .W !403.-48. L3.07:/:4/03. :.44 102:7./0 84/ /85......0 /090723..09.43039..47 89.:. .9.-09: .9 :.7.0  /.905403.:2.1472.9.:L3gx2  70:9gx 39003x0 .43039.79.