GENA

Gena are trei caracteristici de bază:
• - unitate funcţională • - unitate mutaţională • - unitate de recombinare

Visual

Structura genei
• 5’ – 3’ catena sens, codificatoare • 3’ – 5’ catena antisens, matrice pentru ARNpm

Structura genei • Promotorul (200pb) • Unitatea functionala • Terminatorul .

.b. în amonte faţă de SIT . cu secvenţa consens GGGCGG situata la circa 90 p.PROMOTORUL • cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN . prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT • cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT) • cutia GC.

situsul de poliadenilare . TGA) ce reprezintă semnalul de oprire a sintezei proteinei.I. TAG. codonul iniţiator ATG dupa ultimul exon din zona centrala transcrisa a genei exista o secventa 3’UTR necodanta (transcrisa dar netranslata) Ea începe cu unul din codonii stop (TAA.• • • • S. Gene structure Protein coding sequence 5‘UTR 3‘UTR promotor exon 1 exon 2 exon n-1 exon n .T 5’UTR (untranslated region) conţine o secvenţă (prezentă la toate genele) 5'-CCAGCCATG-3'.

Pentru ca ARNpm sa devina ARNm: • matisare • + CAP • poliadenilarea capatului 3’ • acoperirea cu un strat proteic protector Gene Structure TRANSCRIPTION 5’ SPLICING 3’ pre-mRNA mRNA TRANSLATION AUG .STOP protein sequence protein 3D structure .A 1 … A n .

.

.Unitatea functionala are o structura discontinua. fiind alcatuita din exoni si introni.

EXONI • Numarul exonilor variaza de la o gena la alta (intre 2 si mai mult de 50) .

INTRONI .

.

Genes per chromosome .

• Genele alele sunt situate în aceleaşi locusuri în perechile de cromosomi omologi – unul de la forma părintească masculină şi altul – de la cea femenină (cu excepţia genotipurilor XY. XO) .

.INTERACTIUNILE DINTRE GENE • • • • • Interactiunea intre genele alele se manifesta prin relatii de dominanta recesivitate codominanta letalitate sau semiletalitate Penetranta reprezinta frecventa de manifestare in fenotip a unei gene dominante.

B şi O.Trei alele situate pe 9q34 sunt implicate în determinismul genetic al sistemului AB0: A. adică nu codifică sinteza niciunei glicoziltransferaze. . • A si B sunt codominante • A si B sunt dominante faţă de 0 • Alela 0 este nefuncţională.

Interactiunea intre genele nealele A. Epistazia .

.

Inlantuirea genica (linkage) Gene sintenice = gene cu loci pe acelasi cromozom A B Nr. mare de recombinari (crossing – over) Recombinari putine sau absente (valori scazute ale fractiei de recombinare) A B .

Frecventa de recombinare • θ este raportul intre numarul de descendenti recombinanti si numarul total de descendenti • Unitatea de masura a distantei genetice este denumita Morgan 1 centiMorgan (cM) = distanta genetica in care se produc recombinari cu o frecventa de 1% 1cM ~ 1.000.000 pb (1. .000kb) Ex: un cromozom cu 1-3 recombinări per meioză prezintă deci 100-300 cM.

Cum aflam daca 2 gene sunt situate pe acelasi cromozom? Cromozomi diferiti Acelasi cromozom θ = 0.5 Cu cat θ este < 0.5 θ < 0.5 cu atat distanta dintre cei 2 loci este mai mica. .

.

.

numite faze de inlantuire:  cuplare sau cis ( A si b. respectiv a si B)  repulsie sau trans (A si B.Recombinarea creeaza noi haplotipuri Intre 2 perechi de gene alele (A/a si B/b) exista 2 posibilitati de dispunere. respectiv a si b) A b A B a A B b a b a B .

1) este egală: probabilitatea datelor dacă locii sunt înlănţuiţi la valoarea 0.5)] ..5) Logaritmul zecimal al probabilităţilor relative (deci al raportului de probabilitate) sau scorul LOD simbolizat prin Z(θ): Z(θ)= log10 [L(θ)/L(θ0. 0.1 a lui θ/ probabilitatea datelor dacă locii sunt neînlănţuiţi = L(θ) /L(θ0.DETERMINAREA SEMNIFICAŢIEI REZULTATELOR ANALIZELOR DE ÎNLĂNŢUIRE: SCORUL LOD Probabilitatea relativă la o anumită valoare a lui θ (de ex.

Dacă de ex.5NR+R.θ)3] / 0.θ)NR] / 0.101(0.10)= log10 [0.067 Scorul LOD la θ=0. calculul scorului este: Z(0.5 va fi totdeauna egal cu zero. din patru descendenţi unul singur este recombinant scorul LOD se calculează. unde R este numărul de recombinanţi şi NR este numărul de nerecombinanţi.θ)NR iar probabilitatea absenţei înlănţuirii [L(θ0. pe baza formulei de mai sus.. probalităţile se calculează pe baza distribuţiei binomiale a probabilităţii: Z(θ)= log10 [θR(1. Cel mai bun scor este dat de valoarea maximă a lui Z.5NR+R.Pentru analiza de înlănţuire în familiile mici.1.θ)NR] / 0. un scor LOD mai mare decât 0 este o dovadă în favoarea înlănţuirii.54 =0. Probabilitatea unei înlănţuiri [L(θ)] este egală cu θR(1. în felul următor: Z(θ)= log10 [θR(1.90)3] / 0. . în timp ce un scor LOD mai mic de 0 (deci negativ) pledează contra înlănţuirii.5NR+R = log10 [θ1(1.53+1 Pentru o frecvenţă de recombinare θ=0.5)] este egală cu 0.

000 gene . 0.F IAŞI STRUCTURA GENOMULUI UMAN GU = un genom nuclear (complex.M.5% ADN) + un genom mitocondrial (simplu şi mic. 99.U.5%). 25.

22 ARNt şi 2 pt ARNr 37gene (28-H.6 Kb Număr de molecule de ADN diferite Asocierea cu proteine Procentul de ADN codant Număr de gene 23 (la celulele XX) sau 24 (la celulele XY) Mai multe clase de histone şi proteine nehistonice 10 %  35.Caracteristici Genom nuclear Genom mitocondrial Mărime 3200 Mb 16.000 gene O moleculă circulară de ADN Neasociat cu proteine 97 % 13 gene codifică polipeptide. 9-L) Absenţi Exclusiv maternă Introni Ereditate Prezenţi în cele mai multe gene Mendeliana pentru genele de pe autosomi şi cromosomul X. paternală pentru secvenţele de pe Y .

prin sinteza unei piese scurte adiţionale la catena H. • neasociat cu proteine.M. • compact: 97%=secvenţe codante • • 37 de gene: Cele două catene ale ADN mitocondrial au o compoziţie bazică diferită: o catenă "grea" (H) este mai bogată în guanină iar cealaltă catenă "uşoară" (L) în citozină.5% Genomul mitocondrial diferă de genomul nuclear: • mic (16. • fără ADN repetitiv. ADN este alcătuit din trei catene.F IAŞI GENOMUL MITOCONDRIAL • • ADNmt – câteva mii de copii per celulă = 0. • fără introni.569 pb). cunoscută ca ADN 7S. Într-o mică regiune.U. • Codul genetic mitocondrial diferă puţin de cel nuclear • contigue. . bucla D. • circular.

secvenţe de ADN copiate prin transpoziţie mediată de ADN • retrotranspozoni.TRANSPOZONII La om elementele transpozabile sunt de tip: • transpozoni. la care transpoziţia este realizată prin intermediul ARN .

enzima transpozaza si -o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic . ‘ repetitii inversate’ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile Secventa de inserat contine: -o regiune unica codanta pt.Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb.

Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.le sectioneaza si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase ‘lipicioase’ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .Integration of IS element in chromosomal DNA.

TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non .paste .replicative 1. Tn original ramane la locul sau. se copiaza.de copii ale Tn in genom.iar copia este inserata la alt nivel  creste nr. Mecanism: copy .

Transpozitie replicativa (Copy-and-paste) • Elementul transpozabil este copiat. Element transpozabil Replicare Segm. copia se insera in segmentul cromozomial tinta.tinta Integrare Donor Recipient .

• Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient .Transpozitia conservativa (Cut-and-paste) • Elementul se muta prin excizie si integrare.

Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1. Transcriere RNA Target Revers transcriere cDNA Integrare Donor . ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. ARN-ul este revers-transcris in cDNA. care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor. 2.

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

fam. nu transpozeaza independent.Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere: • Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor. fara 3’LTR (long terminal repeats).redus de copii (LINEs) . fara revers-transcriptaza. inalt de copii: SINEs. au revers-transcriptaza si LTR • Retrotranspozonii nevirali. dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. Ex. sunt de 2 tipuri: .cu nr. au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta • Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate. Alu .cu nr.

.Insusiri legate de functia genelor • Specificitatea ordonarea particulara a nucleotidelor pe o anumita secventa din structura primara a moleculei de AND • Pleiotropiaex: sindromul Marfan).

• Expresivitatea polidactilie. . aceste deformatii sunt printre cele mai intalnite anormalitati congenitale. sindactilie si adactilie.

Ex. luxatia congenitala de sold(displazia congenitala a articulatiei coxo-femurale) . inteligenţei. . ulcerul duodenal etc. spina bifida. Exista boli sau malformatii congenitale determinate poligenic. culorii pielii si ochilor. greutăţii.• Poligenia – în cazul înălţimii. diabetul zaharat.

3854.. 080.3..80 . 8.94.50890%33...4.3907. 0342:: 54207.9430..385443:: 473..50900 7.2.5090097.80 5./0 . .009::./4148147. 800... %7.7424842.:250 4:70/3970.94341$0020393./0 8.

7.95:7/0 97.: 80.9. 0890 3807.45 .45.9. .45 .382 .70890 37 /0..9.93..0 .%#$!   %3 .7 .: 8.45 5.890 .30 .2..08343 705.38549705.45..4. ..0%3 30342 0.0  %3 473.425479.

02039 97. 803807.3854.-0890.3/ 5.890 W 02039:97. 3907.45.- #05..3802039:.70 4347 #0.9.9.3854.939.5039 .45.. 45 .70 $02 939.%7.742442..385490 705.

890 W 02039: 802:9. .80 3907.3/ 5.43807..38549.950 0203997.9 802:9. /70.90 802:9. . /70..950 . . :9 .90 1.9.0399.3854.%7.- $02039 939. 573 0..70 4347 #0...0399.5039 .0 8 3907.70 W %3 38:8 89:8 .

.700890.039.170.38.7070 .93802039:.38.. %.02.. .7070 # #0.709 3907.38549..70.05947 #097497.70 4347 .5..783.742442.38.783#  # :089070.078 97.54 3807. 42   :002039::24-089097. %7.07897.38..

078097.-0.759..900890# 20/.747 24-9.7.3854..385443002039097.#097497.9.4/0/-90 002039 990-0798   .38.3/ . #0.80 03.

: 80.0:034.802.38.73:549 310.385490 3/0503/039.7.45 8 ..89.7.45$8  1.38.5.38540.7:8:747 /.70 70974.759..9.-/097. 7050.9/0.078 97.3/..0390.98 ...:383:70342..2 : ..759.:70.385443..90 1.9.390/07097497.. 70.:37 3.2.9:30 29.7.21070 W #0974..38544330..:37 70/:8/0.  1.3/0503/0398:39 /095:7 .94. 3: 97.759. 13/..078 97.08.8%# W #097497. %# 4390723.38.: 70.7:8:7003/4030.. W #0974 580:/40300  580:/04030574.8025479.078 97.3.

:.90/01:3.9:7../3897:.38:870.049/047504. 3:.90.3  .:0/0  W !049745.5.9. 47/43. 572.79. 083/742:..7.3:29.1.9.7.71. 80.240.039.70..03047 W $50.

9./.98:39573970.90  ..9.39.908.390...00 2.0890/01472.43039.3472.9 .90.W 5708.90 83/. 54/..0  .

:47508 4.79. .90.  853...7./0 84/ /85. :.47 89.:L3gx2  70:9gx 39003x0 .9.43039..:2. L3..9 :.-09: ...09.905403. . -1/..43039..43039.44 102:7.9.0  /.07:/:4/03.0 /090723.W !403.1472.:.-48.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful