P. 1
Genetica (Curs 4 Si 5)

Genetica (Curs 4 Si 5)

|Views: 77|Likes:
Published by mcris92

More info:

Published by: mcris92 on Dec 10, 2011
Copyright:Attribution Non-commercial

Availability:

Read on Scribd mobile: iPhone, iPad and Android.
download as PPT, PDF, TXT or read online from Scribd
See more
See less

12/29/2012

pdf

text

original

GENA

Gena are trei caracteristici de bază:
• - unitate funcţională • - unitate mutaţională • - unitate de recombinare

Visual

Structura genei
• 5’ – 3’ catena sens, codificatoare • 3’ – 5’ catena antisens, matrice pentru ARNpm

Structura genei • Promotorul (200pb) • Unitatea functionala • Terminatorul .

cu secvenţa consens GGGCGG situata la circa 90 p. în amonte faţă de SIT . . prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT • cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT) • cutia GC.b.PROMOTORUL • cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN .

situsul de poliadenilare .T 5’UTR (untranslated region) conţine o secvenţă (prezentă la toate genele) 5'-CCAGCCATG-3'. TGA) ce reprezintă semnalul de oprire a sintezei proteinei. codonul iniţiator ATG dupa ultimul exon din zona centrala transcrisa a genei exista o secventa 3’UTR necodanta (transcrisa dar netranslata) Ea începe cu unul din codonii stop (TAA.I.• • • • S. Gene structure Protein coding sequence 5‘UTR 3‘UTR promotor exon 1 exon 2 exon n-1 exon n . TAG.

Pentru ca ARNpm sa devina ARNm: • matisare • + CAP • poliadenilarea capatului 3’ • acoperirea cu un strat proteic protector Gene Structure TRANSCRIPTION 5’ SPLICING 3’ pre-mRNA mRNA TRANSLATION AUG .A 1 … A n .STOP protein sequence protein 3D structure .

.

fiind alcatuita din exoni si introni. .Unitatea functionala are o structura discontinua.

EXONI • Numarul exonilor variaza de la o gena la alta (intre 2 si mai mult de 50) .

INTRONI .

.

Genes per chromosome .

XO) .• Genele alele sunt situate în aceleaşi locusuri în perechile de cromosomi omologi – unul de la forma părintească masculină şi altul – de la cea femenină (cu excepţia genotipurilor XY.

INTERACTIUNILE DINTRE GENE • • • • • Interactiunea intre genele alele se manifesta prin relatii de dominanta recesivitate codominanta letalitate sau semiletalitate Penetranta reprezinta frecventa de manifestare in fenotip a unei gene dominante. .

Trei alele situate pe 9q34 sunt implicate în determinismul genetic al sistemului AB0: A. • A si B sunt codominante • A si B sunt dominante faţă de 0 • Alela 0 este nefuncţională. . B şi O. adică nu codifică sinteza niciunei glicoziltransferaze.

Epistazia .Interactiunea intre genele nealele A.

.

mare de recombinari (crossing – over) Recombinari putine sau absente (valori scazute ale fractiei de recombinare) A B .Inlantuirea genica (linkage) Gene sintenice = gene cu loci pe acelasi cromozom A B Nr.

000.000kb) Ex: un cromozom cu 1-3 recombinări per meioză prezintă deci 100-300 cM. .Frecventa de recombinare • θ este raportul intre numarul de descendenti recombinanti si numarul total de descendenti • Unitatea de masura a distantei genetice este denumita Morgan 1 centiMorgan (cM) = distanta genetica in care se produc recombinari cu o frecventa de 1% 1cM ~ 1.000 pb (1.

.5 Cu cat θ este < 0.5 cu atat distanta dintre cei 2 loci este mai mica.Cum aflam daca 2 gene sunt situate pe acelasi cromozom? Cromozomi diferiti Acelasi cromozom θ = 0.5 θ < 0.

.

.

numite faze de inlantuire:  cuplare sau cis ( A si b. respectiv a si B)  repulsie sau trans (A si B. respectiv a si b) A b A B a A B b a b a B .Recombinarea creeaza noi haplotipuri Intre 2 perechi de gene alele (A/a si B/b) exista 2 posibilitati de dispunere.

1 a lui θ/ probabilitatea datelor dacă locii sunt neînlănţuiţi = L(θ) /L(θ0.5)] . 0.5) Logaritmul zecimal al probabilităţilor relative (deci al raportului de probabilitate) sau scorul LOD simbolizat prin Z(θ): Z(θ)= log10 [L(θ)/L(θ0..1) este egală: probabilitatea datelor dacă locii sunt înlănţuiţi la valoarea 0.DETERMINAREA SEMNIFICAŢIEI REZULTATELOR ANALIZELOR DE ÎNLĂNŢUIRE: SCORUL LOD Probabilitatea relativă la o anumită valoare a lui θ (de ex.

101(0. un scor LOD mai mare decât 0 este o dovadă în favoarea înlănţuirii. probalităţile se calculează pe baza distribuţiei binomiale a probabilităţii: Z(θ)= log10 [θR(1. din patru descendenţi unul singur este recombinant scorul LOD se calculează.53+1 Pentru o frecvenţă de recombinare θ=0. Probabilitatea unei înlănţuiri [L(θ)] este egală cu θR(1.θ)NR] / 0.90)3] / 0. pe baza formulei de mai sus.5NR+R.067 Scorul LOD la θ=0.5)] este egală cu 0.5 va fi totdeauna egal cu zero. în felul următor: Z(θ)= log10 [θR(1. Dacă de ex.54 =0.5NR+R. . calculul scorului este: Z(0.Pentru analiza de înlănţuire în familiile mici.1.θ)NR iar probabilitatea absenţei înlănţuirii [L(θ0. unde R este numărul de recombinanţi şi NR este numărul de nerecombinanţi.θ)NR] / 0..θ)3] / 0. în timp ce un scor LOD mai mic de 0 (deci negativ) pledează contra înlănţuirii.10)= log10 [0.5NR+R = log10 [θ1(1. Cel mai bun scor este dat de valoarea maximă a lui Z.

000 gene .F IAŞI STRUCTURA GENOMULUI UMAN GU = un genom nuclear (complex.M.5%). 99.U. 0. 25.5% ADN) + un genom mitocondrial (simplu şi mic.

paternală pentru secvenţele de pe Y .22 ARNt şi 2 pt ARNr 37gene (28-H. 9-L) Absenţi Exclusiv maternă Introni Ereditate Prezenţi în cele mai multe gene Mendeliana pentru genele de pe autosomi şi cromosomul X.6 Kb Număr de molecule de ADN diferite Asocierea cu proteine Procentul de ADN codant Număr de gene 23 (la celulele XX) sau 24 (la celulele XY) Mai multe clase de histone şi proteine nehistonice 10 %  35.000 gene O moleculă circulară de ADN Neasociat cu proteine 97 % 13 gene codifică polipeptide.Caracteristici Genom nuclear Genom mitocondrial Mărime 3200 Mb 16.

5% Genomul mitocondrial diferă de genomul nuclear: • mic (16. • fără introni. • compact: 97%=secvenţe codante • • 37 de gene: Cele două catene ale ADN mitocondrial au o compoziţie bazică diferită: o catenă "grea" (H) este mai bogată în guanină iar cealaltă catenă "uşoară" (L) în citozină. • fără ADN repetitiv. Într-o mică regiune. prin sinteza unei piese scurte adiţionale la catena H. . ADN este alcătuit din trei catene. bucla D.569 pb). • circular. cunoscută ca ADN 7S.F IAŞI GENOMUL MITOCONDRIAL • • ADNmt – câteva mii de copii per celulă = 0.U.M. • neasociat cu proteine. • Codul genetic mitocondrial diferă puţin de cel nuclear • contigue.

TRANSPOZONII La om elementele transpozabile sunt de tip: • transpozoni. la care transpoziţia este realizată prin intermediul ARN . secvenţe de ADN copiate prin transpoziţie mediată de ADN • retrotranspozoni.

enzima transpozaza si -o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic . ‘ repetitii inversate’ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile Secventa de inserat contine: -o regiune unica codanta pt.Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb.

le sectioneaza si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase ‘lipicioase’ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .Integration of IS element in chromosomal DNA. Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.

de copii ale Tn in genom.replicative 1. Mecanism: copy .paste .TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non . Tn original ramane la locul sau. se copiaza.iar copia este inserata la alt nivel  creste nr.

Element transpozabil Replicare Segm. copia se insera in segmentul cromozomial tinta.tinta Integrare Donor Recipient .Transpozitie replicativa (Copy-and-paste) • Elementul transpozabil este copiat.

• Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient .Transpozitia conservativa (Cut-and-paste) • Elementul se muta prin excizie si integrare.

care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor. ARN-ul este revers-transcris in cDNA.Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1. ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. 2. Transcriere RNA Target Revers transcriere cDNA Integrare Donor .

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

Ex. fara 3’LTR (long terminal repeats). Alu . nu transpozeaza independent.Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere: • Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor. dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. fam. au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta • Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate. fara revers-transcriptaza.cu nr.cu nr. sunt de 2 tipuri: . au revers-transcriptaza si LTR • Retrotranspozonii nevirali. inalt de copii: SINEs.redus de copii (LINEs) .

Insusiri legate de functia genelor • Specificitatea ordonarea particulara a nucleotidelor pe o anumita secventa din structura primara a moleculei de AND • Pleiotropiaex: sindromul Marfan). .

aceste deformatii sunt printre cele mai intalnite anormalitati congenitale. . sindactilie si adactilie.• Expresivitatea polidactilie.

luxatia congenitala de sold(displazia congenitala a articulatiei coxo-femurale) . inteligenţei. Exista boli sau malformatii congenitale determinate poligenic. . culorii pielii si ochilor. Ex. diabetul zaharat.• Poligenia – în cazul înălţimii. greutăţii. spina bifida. ulcerul duodenal etc.

.7424842..:250 4:70/3970../0 .3907.2.94.3854.5090097. 080.009::. .385443:: 473..9430.80 5.. 8. 800.3. 0342:: 54207..50900 7./0 8.80 ./4148147.50890%33.. %7.94341$0020393..4.

45 5.890 .: 80. 0890 3807.0  %3 473..08343 705.95:7/0 97..2.30 .9.7 .9.93.38549705. ..45 .45 .7.425479.: 8.%#$!   %3 .45.4.9.70890 37 /0.0%3 30342 0.45.382 . ..0 ..

.3802039:..939.3854.-0890.%7.3854. 45 .3/ 5.5039 .- #05. 02039 97.9.45.70 $02 939.742442.70 4347 #0.9. 803807..385490 705. 3907.890 W 02039:97.45.

950 .950 0203997.43807.- $02039 939.70 W %3 38:8 89:8 . .70 4347 #0..5039 . 573 0. /70. .0 8 3907. :9 .3/ 5.3854.80 3907.9.9 802:9.0399..90 802:9. ..38549..%7.90 1.0399. /70.890 W 02039: 802:9..

38549.709 3907...700890.70. .742442.02.783.38.170.039.783#  # :089070...07897.38.05947 #097497.7070 # #0.70 4347 .7070 .078 97..38. %7.. %.93802039:. 42   :002039::24-089097.38.5.54 3807.

9..385443002039097.4/0/-90 002039 990-0798   . #0.078097.7.900890# 20/.3854.747 24-9.-0..3/ .80 03.759.38.#097497.

9:30 29.: 70.2... %# 4390723.0:034. 3: 97.3/0503/0398:39 /095:7 .  1.8025479.:383:70342.:37 3.90 1.0390.9.:70..: 80..5..7.3. 70.3/...2 : . 13/.078 97.08.38544330.802.73:549 310.-/097.38..7.9. 7050.38.70 70974.45 8 .9/0.89.759.:37 70/:8/0.8%# W #097497.385490 3/0503/039.94.21070 W #0974.078 97.385443.078 97.390/07097497.....7.759.759.98 .38540.7:8:747 /..7:8:7003/4030.38. W #0974 580:/40300  580:/04030574.45$8  1.

7. 3:./3897:.1. 572.79.7. 47/43.90/01:3..:.38:870. 80.5.:0/0  W !049745.039.9.71.9.240..049/047504.90.9:7. 083/742:.70.03047 W $50..3  .3:29.

98:39573970.9 ..0  ..43039..W 5708.90  .00 2.90.3472.9.90 83/.390./.908.9. 54/.0890/01472..39.

47 89.9 :.43039.:2.-48.9. -1/.W !403.90.905403..  853..:.43039.9. .:47508 4..1472. L3...-09: .44 102:7.07:/:4/03./0 84/ /85. .7.0  /.0 /090723.79..43039.. :..09.:L3gx2  70:9gx 39003x0 .

You're Reading a Free Preview

Download
scribd
/*********** DO NOT ALTER ANYTHING BELOW THIS LINE ! ************/ var s_code=s.t();if(s_code)document.write(s_code)//-->