GENA

Gena are trei caracteristici de bază:
• - unitate funcţională • - unitate mutaţională • - unitate de recombinare

Visual

Structura genei
• 5’ – 3’ catena sens, codificatoare • 3’ – 5’ catena antisens, matrice pentru ARNpm

Structura genei • Promotorul (200pb) • Unitatea functionala • Terminatorul .

prezinta secvenţă TATAAAA situată la circa 30 pb în amonte de SIT • cutia CAAT (5’ GGCCCAATCT 3’) situată în amonte de caseta TATA (la circa 75 pb de SIT) • cutia GC. .PROMOTORUL • cutia TATA (Hogness) determina primul nucleotid ce va fi transcris in ARN . în amonte faţă de SIT . cu secvenţa consens GGGCGG situata la circa 90 p.b.

TGA) ce reprezintă semnalul de oprire a sintezei proteinei. codonul iniţiator ATG dupa ultimul exon din zona centrala transcrisa a genei exista o secventa 3’UTR necodanta (transcrisa dar netranslata) Ea începe cu unul din codonii stop (TAA. TAG.I.T 5’UTR (untranslated region) conţine o secvenţă (prezentă la toate genele) 5'-CCAGCCATG-3'. Gene structure Protein coding sequence 5‘UTR 3‘UTR promotor exon 1 exon 2 exon n-1 exon n .• • • • S. situsul de poliadenilare .

Pentru ca ARNpm sa devina ARNm: • matisare • + CAP • poliadenilarea capatului 3’ • acoperirea cu un strat proteic protector Gene Structure TRANSCRIPTION 5’ SPLICING 3’ pre-mRNA mRNA TRANSLATION AUG .A 1 … A n .STOP protein sequence protein 3D structure .

.

Unitatea functionala are o structura discontinua. . fiind alcatuita din exoni si introni.

EXONI • Numarul exonilor variaza de la o gena la alta (intre 2 si mai mult de 50) .

INTRONI .

.

Genes per chromosome .

XO) .• Genele alele sunt situate în aceleaşi locusuri în perechile de cromosomi omologi – unul de la forma părintească masculină şi altul – de la cea femenină (cu excepţia genotipurilor XY.

.INTERACTIUNILE DINTRE GENE • • • • • Interactiunea intre genele alele se manifesta prin relatii de dominanta recesivitate codominanta letalitate sau semiletalitate Penetranta reprezinta frecventa de manifestare in fenotip a unei gene dominante.

. • A si B sunt codominante • A si B sunt dominante faţă de 0 • Alela 0 este nefuncţională.Trei alele situate pe 9q34 sunt implicate în determinismul genetic al sistemului AB0: A. adică nu codifică sinteza niciunei glicoziltransferaze. B şi O.

Epistazia .Interactiunea intre genele nealele A.

.

Inlantuirea genica (linkage) Gene sintenice = gene cu loci pe acelasi cromozom A B Nr. mare de recombinari (crossing – over) Recombinari putine sau absente (valori scazute ale fractiei de recombinare) A B .

.000 pb (1.000kb) Ex: un cromozom cu 1-3 recombinări per meioză prezintă deci 100-300 cM.Frecventa de recombinare • θ este raportul intre numarul de descendenti recombinanti si numarul total de descendenti • Unitatea de masura a distantei genetice este denumita Morgan 1 centiMorgan (cM) = distanta genetica in care se produc recombinari cu o frecventa de 1% 1cM ~ 1.000.

5 θ < 0.Cum aflam daca 2 gene sunt situate pe acelasi cromozom? Cromozomi diferiti Acelasi cromozom θ = 0.5 Cu cat θ este < 0. .5 cu atat distanta dintre cei 2 loci este mai mica.

.

.

respectiv a si B)  repulsie sau trans (A si B. respectiv a si b) A b A B a A B b a b a B . numite faze de inlantuire:  cuplare sau cis ( A si b.Recombinarea creeaza noi haplotipuri Intre 2 perechi de gene alele (A/a si B/b) exista 2 posibilitati de dispunere.

5) Logaritmul zecimal al probabilităţilor relative (deci al raportului de probabilitate) sau scorul LOD simbolizat prin Z(θ): Z(θ)= log10 [L(θ)/L(θ0.1) este egală: probabilitatea datelor dacă locii sunt înlănţuiţi la valoarea 0.1 a lui θ/ probabilitatea datelor dacă locii sunt neînlănţuiţi = L(θ) /L(θ0.5)] . 0..DETERMINAREA SEMNIFICAŢIEI REZULTATELOR ANALIZELOR DE ÎNLĂNŢUIRE: SCORUL LOD Probabilitatea relativă la o anumită valoare a lui θ (de ex.

Probabilitatea unei înlănţuiri [L(θ)] este egală cu θR(1.θ)3] / 0.5 va fi totdeauna egal cu zero.5)] este egală cu 0.θ)NR iar probabilitatea absenţei înlănţuirii [L(θ0.5NR+R.067 Scorul LOD la θ=0.5NR+R. din patru descendenţi unul singur este recombinant scorul LOD se calculează. Cel mai bun scor este dat de valoarea maximă a lui Z. în felul următor: Z(θ)= log10 [θR(1. unde R este numărul de recombinanţi şi NR este numărul de nerecombinanţi.10)= log10 [0.θ)NR] / 0.90)3] / 0.53+1 Pentru o frecvenţă de recombinare θ=0. un scor LOD mai mare decât 0 este o dovadă în favoarea înlănţuirii.101(0. calculul scorului este: Z(0. probalităţile se calculează pe baza distribuţiei binomiale a probabilităţii: Z(θ)= log10 [θR(1. în timp ce un scor LOD mai mic de 0 (deci negativ) pledează contra înlănţuirii.θ)NR] / 0. Dacă de ex.Pentru analiza de înlănţuire în familiile mici. . pe baza formulei de mai sus.54 =0..5NR+R = log10 [θ1(1.1.

000 gene .5% ADN) + un genom mitocondrial (simplu şi mic.5%). 0. 25.U.F IAŞI STRUCTURA GENOMULUI UMAN GU = un genom nuclear (complex. 99.M.

6 Kb Număr de molecule de ADN diferite Asocierea cu proteine Procentul de ADN codant Număr de gene 23 (la celulele XX) sau 24 (la celulele XY) Mai multe clase de histone şi proteine nehistonice 10 %  35.22 ARNt şi 2 pt ARNr 37gene (28-H.Caracteristici Genom nuclear Genom mitocondrial Mărime 3200 Mb 16.000 gene O moleculă circulară de ADN Neasociat cu proteine 97 % 13 gene codifică polipeptide. paternală pentru secvenţele de pe Y . 9-L) Absenţi Exclusiv maternă Introni Ereditate Prezenţi în cele mai multe gene Mendeliana pentru genele de pe autosomi şi cromosomul X.

• fără ADN repetitiv. • neasociat cu proteine. . cunoscută ca ADN 7S.5% Genomul mitocondrial diferă de genomul nuclear: • mic (16. bucla D. • fără introni.M. ADN este alcătuit din trei catene.569 pb). • circular. • compact: 97%=secvenţe codante • • 37 de gene: Cele două catene ale ADN mitocondrial au o compoziţie bazică diferită: o catenă "grea" (H) este mai bogată în guanină iar cealaltă catenă "uşoară" (L) în citozină.U. Într-o mică regiune. • Codul genetic mitocondrial diferă puţin de cel nuclear • contigue. prin sinteza unei piese scurte adiţionale la catena H.F IAŞI GENOMUL MITOCONDRIAL • • ADNmt – câteva mii de copii per celulă = 0.

TRANSPOZONII La om elementele transpozabile sunt de tip: • transpozoni. secvenţe de ADN copiate prin transpoziţie mediată de ADN • retrotranspozoni. la care transpoziţia este realizată prin intermediul ARN .

enzima transpozaza si -o zona centrala ce poate fi utilizata ca marker genetic .Secventa de inserat (IS) este flancata de 9 – 13 pb. ‘ repetitii inversate’ Repetitiile directe si inverse/inversate indica prezenta elementelor genetice mobile Secventa de inserat contine: -o regiune unica codanta pt.

Transpozaza (se leaga de capetele transpozonului original.le sectioneaza si alipeste Tn in alt loc al genomului) ADN polimeraza umple golurile dintre capetele ramase ‘lipicioase’ ADN ligaza inchide scheletul glucidofosforic .Integration of IS element in chromosomal DNA.

de copii ale Tn in genom.paste .iar copia este inserata la alt nivel  creste nr. Tn original ramane la locul sau. se copiaza.replicative 1. Mecanism: copy .TRANSPOZONII (Tn) comporta 2 tipuri de transpozitii: replicative si non .

Element transpozabil Replicare Segm. copia se insera in segmentul cromozomial tinta.tinta Integrare Donor Recipient .Transpozitie replicativa (Copy-and-paste) • Elementul transpozabil este copiat.

Transpozitia conservativa (Cut-and-paste) • Elementul se muta prin excizie si integrare. • Tn insusi – ca entitate fizica – se muta direct pe alt situs Element transpozabil Segment tinta Excisie & Integrare Donor Recipient .

2.Retrotranspozitia – apare cel mai frecvent la om 1. ADN-ul elementului mobil este transcris in RNA. ARN-ul este revers-transcris in cDNA. Transcriere RNA Target Revers transcriere cDNA Integrare Donor . care este apoi inserat in segmentul cromozomial acceptor.

Retrotranspozonii: elemente transpozabile a caror mobilitate este ARN-mediata Reverse transcriptase encoded by the LINE-1 element Little Alberts 6-34 © Garland .

Alu . fara revers-transcriptaza. au revers-transcriptaza si LTR • Retrotranspozonii nevirali. nu transpozeaza independent. Ex.cu nr. au revers-transcriptaza fiind capabili de transpozitie independenta • Retro-pseudogenele = pseudeogene procesate.Exista 3 clase importante de retrotranspozoni la mamifere: • Retrovirusurile endogene au secvente asemanatoare retrovirusurilor.redus de copii (LINEs) . fara 3’LTR (long terminal repeats). dar nu pot infecta celule noi avand actiune limitata la un singur genom. sunt de 2 tipuri: .cu nr. fam. inalt de copii: SINEs.

.Insusiri legate de functia genelor • Specificitatea ordonarea particulara a nucleotidelor pe o anumita secventa din structura primara a moleculei de AND • Pleiotropiaex: sindromul Marfan).

• Expresivitatea polidactilie. aceste deformatii sunt printre cele mai intalnite anormalitati congenitale. . sindactilie si adactilie.

ulcerul duodenal etc. Ex. diabetul zaharat. culorii pielii si ochilor. inteligenţei. . greutăţii.• Poligenia – în cazul înălţimii. Exista boli sau malformatii congenitale determinate poligenic. luxatia congenitala de sold(displazia congenitala a articulatiei coxo-femurale) . spina bifida.

. 0342:: 54207..3.4.9430..50900 7.. 8.50890%33.385443:: 473. 800.80 .. 080.5090097.7424842..009::. %7./0 .80 5.. .2./0 8.3907.94./4148147.3854.94341$0020393..:250 4:70/3970.

382 .: 8.08343 705.7 .45 5..0%3 30342 0.890 .9.425479.45 ..9.9.70890 37 /0.. 0890 3807.0 .95:7/0 97. .4.7.45.45 ..45.%#$!   %3 .30 .38549705..2.0  %3 473. .93.: 80.

385490 705..45.%7.. 02039 97.70 $02 939.70 4347 #0.3854.9.45.742442.3802039:.890 W 02039:97..3/ 5. 803807.3854.- #05.939.5039 .-0890. 45 .9. 3907.

- $02039 939. .3/ 5.890 W 02039: 802:9.70 W %3 38:8 89:8 .70 4347 #0.80 3907.38549..950 0203997.9. /70.5039 .%7.90 802:9...90 1. 573 0.0399.. .950 .9 802:9. /70.3854. .43807.0399.. :9 .0 8 3907.

 .70.783.709 3907.02.742442.38..38.078 97.93802039:.54 3807.05947 #097497..783#  # :089070.38.7070 . %.38.5..38549.039. %7..170..7070 # #0..07897.700890. 42   :002039::24-089097.70 4347 .

-0.38..747 24-9.4/0/-90 002039 990-0798   .900890# 20/.7.3/ .759.9.078097.3854.80 03..#097497. #0.385443002039097.

: 80.:70.8025479.2.38540..078 97.90 1.5. 7050.759.7.385490 3/0503/039.7..70 70974..759.759.. 70.38.:37 70/:8/0.3/0503/0398:39 /095:7 ..38..3.94.38544330.802..45$8  1.21070 W #0974.9.. 13/.:383:70342..385443.-/097. 3: 97.9:30 29.38..0390.98 .: 70.3/.8%# W #097497.45 8 ..0:034.. %# 4390723. W #0974 580:/40300  580:/04030574.73:549 310.:37 3.390/07097497.9/0.2 : .  1.7.89.7:8:7003/4030.078 97.7:8:747 /.08.078 97..9.

1. 083/742:.79./3897:.3:29..5.:.03047 W $50.:0/0  W !049745.7..240.71.90. 80.9.7.3  .039.70.38:870. 3:. 572.9:7..90/01:3.9. 47/43.049/047504.

98:39573970.00 2..39.43039.908./. 54/.W 5708.0  .90.90  ..390.9 .9..90 83/..0890/01472.3472.9.

9.9..W !403. -1/.:. :..79.:2.0 /090723.  853.. ../0 84/ /85.07:/:4/03.43039.-09: .44 102:7.43039.43039.0  /.09.9 :.-48.90.7...:L3gx2  70:9gx 39003x0 .47 89..905403. ..1472. L3.:47508 4.

Sign up to vote on this title
UsefulNot useful