mari, 14 octombrie 2014

Genetica curs 2
Clasificare tipuri de secvente ADN repetitiv

- ADN inalt repetitiv = este reprezentat de secvente de ADN f scurte repetate in

tandem. Formeaza aproximativ 10% din genom. Repetarile in tandem reprez repetari
adiacente ale unei secvente formate din 2 sau mai multe nucleotide, se clasifica in:

- ADN satelit format dintr-un mare de repetari in tandem, se pot gasi in regiuni
heterocromatice, pericentromerice si la nivelul telomerelor si reprezinta un subtip de
ADN alfa-satelit cu rol de legatura a heterocromatinei centromerice

- VNTR (variabile numeberr tandem repeats)/ SSR ( simple sequence repeat)

VNTRs (variable number tandem repeats)

- secvente mici, repetate in tandem, ce formeazaa "miniblocuri" dispersate in toti

cromnozomii

- marimea si dispozitia lro variaza dee la o pers la alta

- 2 tipuri:
- ADN minisatelit - cuprinde secvente polimorfe; sunt localizate la niv telomerelor si
este reprez de ADN telomeric de o enzima specializata numita telomeraza si care
are rol in lineajul genetic, splicing si imprinting

- ADN microsatelit - reprezentat de numarul repetarilor intr-un anumit locus si cel

mai bine caracterizat este crom Y. Prezinta o importanta clinica in identificarile de
persoane sau in studiile populationale

- ADNul moderat repetitiv

- este reprezentat de secvente scurte de ADN si reprezinta 35% din genom

- unele secvente de ADN repetitiv se gasesc doar intr-un loc pe un anumit

cromozom, altele sunt dispersate in intregul genom, iar altele se gasesc la nivelul
intronilor

- majoritatea secventelor moderat repetitive sunt transcrise in ARN si formeaza

frecvent familii de secvente inrudite, unele cu functie cunoscuta: pentru ARNr, ARNt,
histone, receptori olfactivi; altele cu functie recent identificata ( de ex: secventele SINEs
sau LINEs)

LINEs/ SINEs (long/ short interspersed nuclear elements) - elemente

transpozabilee

1
 mari, 14 octombrie 2014
- secvente LINEs codifica pentru o transcriptaza inversa care permite ca un
transcript ARN sa poata fi copiat "invers" intr-o secventa complementara de ADN

- elementel SINEs reprezentati in special de familia Alu

- familia de elemente transpozabile Alu - reprezinta cele mai abundente elemente

transpozabile din genomul uman; sunt implicate in diferite forme de cancer

- au o lungime de aprox 300 pb, se gasesc in genomul uman in cca 1,7 milioane
de copii (13% din genom)

- elementele SINEs - reprezentati in special de familia Alu:

-familia de elemente transpozabile Alu- reprezinta cele mai abundente

elemente transpozabile din genomul uman;

- localizate in special in benzile G negative, bogate in GC

- sunt implicate in diferite forme de cancer

ADN mitocondrial

- Mitocondriile sunt organite celulare a caror functie este producerea de energie. Cu

toate ca majoritate ADN-ului se afla la nivel nuclear 98%, mitocondriile au si el ADN-ul
propriu. Acest material genetic este denumit ADN mitocondrial (ADNmt)

- Genomul mitocondrial are un ADN circular, bicatenar format din 16.569 pb

- Este format din doua catene: catena H (grea) si catena L (usoara)
- cele 2 catene se deosebesc prin continutul in baze azotate: una din catene este
bogata in G (catena H) iar cealalta este bogata in citozina (catena L)

- Intr-o regiune mica denumita bucla CR (control region)/ D (displacement loops) in

care se afla situsul de initiere al transcriptiei si replicarii, ADN-ul este alcatuit din trei
catene: catena H, catena L si o secvente ADN 7S

Genomul mitocondrial

- Genomul mitocondrial este compact si contine 37 de gene (28 pe catena H si 9 pe

catena L)

- 13 gene codifica enzime implicate in fosforilarea oxidativa

- 22 gene codifica ARNt (de transfer)
- 2 gene codifica ARNr (ribozomal)
- Genel ADNmt sunt aproape intotdeauna continue, unele chiar suprapuse

2
 mari, 14 octombrie 2014
- Genele ADNm nu contin introni
- atat in procesul replicarii cat si in procesul transcriptiei, ADNmt se comporta ca o
unitate

- mitocondriile nu poseda sisteme eficiente de reparare a ADN-ului

- ADNmt nu formeaza complexe cu histonele, fiind extrem de vulnerabil la actiunea
agentilor mutageni

- ADNmt nu este asociat cu proteine si nu contine ADN repetitiv

- Nr copiilor de ADN variaza de la o ;itocondrie la alta fiind intre 2 si 20
- codul genetic mitocondrial difera putin de cel nuclear, are 60 de codoni sens ( 61
codoni sens in cel nuclear), 4 codoni non-sens dintre care 2 sunt codoni sens in ADN-
ul nuclear; codonul stop UGA din ADN-ul nuclear este codon sens in cel mitocondrial

- ADNmt se transmite exclusiv pe cale materna, de la mama la toti descendentii;

barbatii bolnavi nu transmit boala.

ARNnc = noncodant

- ARNnc formeaza 4/5 din transcriptom

- este reprezentat de ARN cu functii clasice in sinteza de proteine ( ARNr, ARNt,
ARNsn, ARNsno si ARN telomeraza)

- ARN cu functii exclusiv reglatoare:

- secvente scurte/mici (20-100 nucleotide) (ARNmi, ARNsi, ARNa, ARNti)

- secvente lungi/mari (peste 200 nucleotide) ARN Ln sau ARNlinc

Tipuri de ARN

-ARN mesager= se sintetizeaza in nucleul celulelor si reprezinta copia secventelor

codante ale unei gene. ARN mesager precursor sufera un proces de maturare nucleara
ce cuprinde 2 procese distincte - modificarea extremitatilor ARNm precursor (care creste
stabilitatea acestuia) si procesarea ARNm precursor (decuparea ARN intronic si legarea
ARN exonic)

- ARN de transfer = exista mai multe tipuri de ARNt fiecare poarta unul din cei 20 de
aa. Are o conformatie speciala, specifica functiei sale. Reprezinta 10-15% din
cantitatea totala de ARN celular. Prezinta 3 bucle mari, fiecare cu un alt rol. Intre 2

3
 mari, 14 octombrie 2014
bucle mari se afla o bucla mica. Are rol in decodificarea materialului genetic si
formarea lantului polipeptidic.

- ARN ribozomal = intra in compozitia ribozomilor si ajuta la desf sintezei proteice (

translatiei). Se asociaza cu proteinele, formand un monosom, iar prin unirea 2
monosomi se form un ribosom la nivelul caruia se va desfasura sinteza de proteine

- ARN mic nuclear ARNsn= este implicat in procesarea altor clase de ARN cum ar fi
ARN-ul matur sau in reglarea factorilor de transcriptie

- ARN mic nucleolar ARNsno = se gasesc in nucleoli avand diferite functii - participa la
biogeneza si maturarea ARNr sau ARNt si la reglarea matisarii alternative (= splicing
alternativ) ale unor gene
Numarul de transcripte care se pot forma de pe o gena este 5,7

- microARN= sunt molecule mici de ARN (21-22 nucleotide), cu rol in reglarea genica,
blocand translata sau stimuland degradarea ARNm

- ARN XIST = este implicat in inactivarea unuia din cei 2 cr X la sexul feminin
- ARN din particulele de recunoastere a semnalului ARN srp - (80-500 nucleotide);
fixeaza polipeptidele in curs de sinteza si dirijeaza in diferite compartimente celulare
(RE)

- ARN - telomeraza ARNtel - implicata in replicarea telomerelor, avand activitate de

revers transcriptaza care adauga secvente repetitive la ADN telomeric

- ARN interferent - cu rol in reglarea genica, blocand translatia sau degradang ARNm
- ARN antisens - este transcris de pe catena opusa a unei gene si interactioneaza fie
cu promotorul genei fie cu ARNm formandu-se o structura bicatenara care va fi
degradata enzimatic

- ARN necodant lung cu rol in reglarea genica