ARN mesager (mARN) constituie 25% din totalul ARN-lui.

Localizat -n nucleu i citozol.

Prezint copia sectorului de ADN i conine informaia despre structura catenei polipeptidice a proteinei.
Rolul:Transmite informaia de la ADN spre ribozomi, sediul de sintez a proteinei.
ARN ribozomal (rARN) constituie 60% din totalul ARN-ului.
Localizat- n ribozomii citoplasmei.
Rolul - formeaz scheletul ribozomilor. Joac un rol auxiliar n procesul de asamblare a proteinelor.
ARN de transport (tARN) constituie 15% din totalul ARN-lui.
Localizat: n citoplasm, ribosomi, mitocondrii.
Rolul: particip la activarea i transportul AA spre ribozomi i asamblarea lor n polipeptide.
ARN cromosomial activarea genelor ADN
ARN nuclear formarea scheletelor particulei proteice care transport ARN din nucleu n citoplasm
Structura secundar a ADN
3. lanurile sunt antiparalele (unul are direcia 53, altul
35 )
4. complimentaritatea (A i corespunde T; iar G-C).
5. Stabilitatea dublului helix este asigurat att de interaciunile
hidrofobe dintre BA, ct i de legturile de hidrogen ntre BA
(A=T formeaz 2 legturi de hidrogen, iar G C trei leg turi).
6. BA hidrofobe sunt situate n interiorul spiralei duble i aranjate
sub form de stive, pe cnd complexul pentozofosfat este
situat la exteriorul spiralei duble, bine interacioneaz cu apa,
de aceia molecula gigant de DNA se dizolva n ap .
7. Spiral este regulat (fiecare spir cuprinde 10 nucleotide).
Distana dintre BA nvecinate este de 0,34 nm, perioada de
identitate (pasul) 3,4 nm.
8. La pH=7 grupele fosfat sunt ionizate, poarta sarcini negative,
deaceia DNA prezint acid puternic.
9. Dublul helix este de tip plectonemical, dar nu paranemical
Legit ile lui Chargaff
1. Coninutul adeninei este egal cu al timinei, iar al
guaninei cu al citozinei (A=T, iar G=C)
2. n orice preparat de DNA independent de specie
suma bazelor purinice este egal cu cea a bazelor
pirimidinice (A+G=T+C)
3. Preparatele de DNA separate din diferite esuturi a
uneia i aceeia specie de organisme sunt absolut
identice privind componena nucleotidic .
4. Componena nucleotidic a DNA la aceeai specie nu
se modific odat cu vrst, nu depinde de regimul
alimentar i modific rile mediului.
5. dac A+T este mai mare dect G+T avem DNA de tip
AT
6. dac G+T este mai mare dect A+T avem DNA de tip
GT
7. t de topire este mai mica cnd predomin perechile A-
T
8. t de topire este mai mare cnd predomin perechile G-
C
9. la eucariote DNA mitocondrial este circular
Structura teriar
Reprezint superspiralizarea dublului helix la
care particip proteinele histonice i formeaz
cromatina
Unitatea structural a cromatinei este
nucleosomul
Nucleosomul este un octamer histonic
(2H2A; 2H2b; 2H3; 2H4) nfurat de
aproximativ de 2 ori de dublul helix cu o
lungime de 146 perechi de nucleotide.
ntre 2 nucleosmi se conin poriuni de ADN
alctuit din 20-60 perechi de nucleotide
asociate cu H1
Lanul polinucleosomic formeaz un superhelix
(solenoid), fiecare spir are 10 nucleosomi,
d=30nm i pasul de 10nm
Structura secundar i
teriar a ARNm
ARNm fiecrei gene i corespunde
molecula sa de ARNm, de aceea el este
foarte heterogen
Elementul de codificare al ARNm este
tripletul nucleotidic numit codon.
Fiecare codon corespunde unui anumit
AA
Structura secundar a ARNm o
caten curbat
Structura teriar se aseamn cu
un fir nfurat pe bobin, rolul creia
l ndeplinete o protein de transport
numit informer
Structura secundar a t-
RNA
are infiarea unei "frunze de trifoi" - se formeaz n
urma imperecherii complementare intracatenare a
nucleotidelor anumitor sectoare.
Sectoarele, care nu sunt ncadrate n formarea
legturilor de H formeaz lanuri sau bucle
1. Sectorul de acceptare (4 nucleotide, 3 din care au
aceeai succesiune- CCA cu hidroxilul 3OH liber la
care se fixeaz grupa COOH al AA.
2. Bucla anticodonic - format din 7 nucleotide.
Conine un triplet nucleotidic specific pentru fiecare t-
RNA numit anticodon. Anticodonul t-RNA dup
principiul complementarittii se mperecheaz cu
codonul respectiv din RNAm. Interaciunea codon-
anticodon determin ordinea aranjrii aminoacizilor
n catena polipeptidic.
3. Bucla pseudouridilic - const din 7 nucleotide (restul
acidului pseudouridilic este obligatoriu), particip la
interaciunea cu ribozomii.
4. Bucla dihidrouridinic - const din 8-12 resturi
nucleotidice ( resturi de dihidrouridin ),
interactiuneaz cu E- aminoacil-RNAt-sintetaza, care
contribuie la recunoaterea de ctre aminoacid a
ARN-t specific.
Structura teriar a tRNA
Are forma L
Include 2 segmente de dublu helix
situate perpendicular (fiecare
helix-10 perechi de baze)
n afara spiralei bazele formeaz
legturi de hidrogen. Interaciuni
apar ntre bazele
necomplementare (A-A; A-
C).Multe baze sunt aranjate n
stive (hidrofobe)
Structura teriar a tRNA
Are forma L
Include 2 segmente de dublu helix
situate perpendicular (fiecare
helix-10 perechi de baze)
n afara spiralei bazele formeaz
legturi de hidrogen. Interaciuni
apar ntre bazele
necomplementare (A-A; A-
C).Multe baze sunt aranjate n
stive (hidrofobe)
ARNr
Structura secundar e
prezentat prin sectoare spiralate
unite ntre ele cu ajutorul unei
catene curbate
Structura teriar prezint
scheletul ribosomului. Are forma
unui bastona sau ghem pe
suprafaa cruia sunt nfurate
proteinele ribosomului.
Proprietile fizico-chimice
ale acizilor nucleici
- masa molecular mare.
- proprietatile coloidale si osmotice,
tipice pentru toi compuii
macromoleculari.
- Proprietile lor hidrofile depind de
fosfai.
- viscozitatea i densitatea nalt a
soluiilor,
- capacitatea de denaturare.
- la pH fiziologic toti AN sunt polianioni
(-)
Dogma central a
geneticei moleculare
Postulatul de baz a geneticei moleculare a fost
formulat de Watson i Crick (Meselson, Stahl):
este transmiterea informaiei genetice de la ADN la
protein. Snt ncluse trei procese:
replicarea;
transcrip ia;
transla ia.
Primele dou procese au loc n nucleu, iar al treilea
n citozol.
Procesul de transcripie este reversibil. Enzima care
catalizeaz transcripia invers se numete revertaza
(reverstranscriptaza) i a fost descoperit la
oncovirui. Sinteza ARN-ului pe baza ARN se numete
replicarea ARN, ea are loc la virui, care nu au ADN.
Procesul de translaie este ireversibil i se numete
biosinteza proteinei.
Structura genelor- dimensiuni,
GS; GR
Gene- poriunile ADN ce conin informaia genetic
cu privire la sinteza unei proteine
Fiecrei gene i corespunde un lan polipeptidic- de
aici i conceptul: o gen un lan polipeptidic
GS- genele ce codeaz polipeptide i ARN. Poriunile
GS ce conin informaie (transductibile) exoni; iar
secvenele ce nu sunt traduse n ARNm introni
GR segmente de ADN, repetabile, relativ mici ce au
un rol reglator.
Rolul lor:
1. Pot fi semnale ce ne arat nceputul i sfr itul GS
2. Particip n iniierea i terminarea transcrip iei GS
Dimensiunile genelor f. variabile. Ex. Proteina ce
conine 350 AA--- 350X3=1050 nucleotide. tiind c
BA sunt localizate la 0,34 nm_----
0,34 nm X 1050=357 nm =0,36 m
Replicarea
Replicarea transmiterea informaiei genetice de la ADN
parental la ADN fiic .
Caracteristicile:
1. Se petrece n nucleu
2. Proces semiconservativ
3. se desfoar n trei etape : iniiere, elongare,
terminare
4. prezen a praimerului este obligatorie
5. replicarea este cuplat cu desfurarea DNA parental
(necesit energie)
6. replicarea decurge n ambele direcii cu aceeai
vitez .
7. Pe catena ntrziat se sintetizeaz fragmentele
Okazaki.
8. Este bazat pe mpachetarea complementar a BA
9. Catena-fiic este antiparalel cu catena parental dar
nu identic dup secvena nucleotidic
10. For a motrice a procesului este hidroliza pirofosfatului
11. angajeaza simultan intregul cromozom.


Componentele necesare replic rii:
1. Matri - ADN bicatenar
2. Substrat: dATP, dTTP, dGTP, dCTP; ATP, GTP,
CTP, UTP
3. prezen a ionilor de Mg, Mn; Zn
4. Sistemul multienzimatic complex:
a. Helicaza-desfacerea dublului helix, treptat,
pe poriuni mici. Cele 2 catene rmn
separate ca urmare a interveniei proteinelor
de stabilizare (SSB).
b. Topoizomerazele I i II nltur
supertorsiunile ADN, rezolv problemele
topologice aprute n cursul desfacerii lui. (I
introduce supertorsiuni negative; II
scindeaz o leg. fosfodiesteric pe una din
catene i permite celor 2 catene s se
roteasc una fa de alta)
c. ARN primaz - sintetizeaz primerul n
direcia 5'- 3 .
d. ADN polimeraza ( ADNp I, II, III)-
sinteza catenei fiice n direcia 5' 3' .
ADN p III:
aciune polimerazic (5'- 3) -
sintetizeaz n direcia 5- 3' lanul
polidezoxiribonucleotidic, prelund
instrucii de la ADN-matri ,
- aciune exonucleazic (3'- 5 )
- ADN pII - rol neclar.
ADN pI - posed activitate 5'- 3
exonucleazic, nltur primerul i-l
nlocuie te cu fragmente de ADN
e. ADN ligaza- unete fragmentele
Okazaki de pe catena ntrziat.
Catalizeaz formarea unei legturi
fosfat diesterice ntre 3'-OH a unui
fragment de ADN i extremitatea 5'
monofosfat al altuia.
Mecanismul replic rii
3 etape: ini ierea, elongarea, terminarea
Originea replicrii este reprezentat de o secven
specific de nucleotide secven a ori.
Replisoma (complex proteic) recunoate punctul de
origine.
Iniierea parcurge dou etape:
a. Formarea furcii de replicaie- ataarea replisomului la
punctul de origine al replicrii i sub aciunea
helicazelor are loc desfacerea duplexului parental pe
anumite poriuni replicatori (la scindarea leg. de H
dintre BA - se utilizeaz min 2 mol. de ATP). La
desfacerea duplexului parental apar regiuni
superhelicoidale, care se regleaz cu ajutorul girazei
(topoizomerazei).
Topoizomeraza efectueaz rupturi monocatenare apoi
sudeaz legtura fosfodiesteric i favorizeaz
relaxarea structurii DNA
b. Sinteza primerului - sub aciunea
primazei se sintetizeaz o poriune
mic de ARN n direcia 5'- 3'.
Primerul este format din 5-10
ribonucleotide. Cruparea 3OH e un
ini iator al sintezei de ADN.
Elongarea
ADN polimeraza III unindu-se la captul 3' OH al primerului
ncepe sinteza ADN fiic. Reacia decurge prin atacul
nucleofil al grupei 3' OH al primerului asupra unui dRNTP
complementar catenei de ADN matri. Se formeaz
legtura fosfodiesteric i se elibereaz PP; hidroliza PP
determin polimerizarea propriu zis .
Elongarea decurge n direcia 5' 3, i parcurge cu aceeai
vitez pe ambele catene
Catena de baz se va sintetiza continuu, iar cea ntrziat -
discontinuu: va fi format din fragmente Okazaki
(dimensiuni de 1000 2000 nucleotide la procariote i 150-
200 la eucariote).
ADN polimeraza I exclude primerii i sintetizeaz
complementar ADN.
Fragmentele snt unite cu enzima ADN ligaza (necesit ATP
la eucariote i NAD la procariote).
Terminarea
Terminarea replicrii are loc
atunci, cnd cele dou bifurcaii
de replicare se ntlnesc ntr-o
regiune opus regiunii "ori".
Proteinele speciale semnalizeaz
oprirea repilcrii prevenind
ac iunea helicazelor.
Replicarea la eucariote
Particularit i:
ADN polimerazele:
- implicat n replicarea ADN nuclear- responsabil
de sinteza catenei ntrziat sinteza primerilor
rspunde de sinteza catenei lider. Ea manifest
aciune exonucleazic
implicat n repara ia ADN
- implicat n replicarea ADN mitocondrial, aciune
exonucleazic
Bifurcaia replicii este de 3000 baze pe minut
comparativ cu 16.000 la procariote
Pe o molecul de ADN exist mai multe origini de
replicare (3X104 - 3X105 separate prin perechi de
baze). n aceste origini multiple de replicare se
organizeaz bifurcaii- ce se deplaseaz biderecional
pe cromosomul eucariot n curs de replicare.
Fragmentele Okazaki 150-200 nucleotide
Telomer Telomeraza
Replicarea capetelor 5 ale catenelor este incomplet
(teoria lui Olovnicov, 1971), deoarece dup
nlturarea primerului ultimului fragment Okazaki,
ADN p I nu e e capabil s completeze aceste goluri.
Astfel la fiecare replicare, capetele ADN se scurteaz .
Aceasta nu afecteaz informaia genetic deoarece
catenele conin fragmente repetitive neinformative
telomere.
Telomerele sunt replicate de o E specific
telomeraza
Telomeraza - reprezint o ribonucleoproteid: ARN i
protein
Subunitatea proteic TRT (telomeraze revers
transcriptase) posed activitate catalitic
Telomeraza fiind o revertaz (ADN
polimeraza ARN dependent)
folosete ca matri propria
coenzim un fragment de ARN.
I etap are loc asocierea
telomerazei la captul 3 al catenei
lider din regiunea telomeric-
TTAGGG
II E extinde catena, utiliznd ca
matri ARN telomeric (se repet )
III Catena complementar a ADN
telomeric e sintetizat dup
principiul catenei nt rziate de ADNp
Repara ia ADN
Erorile n timpul replicrii sunt reduse
la minimum datorit DNA polimerazei
ce posed funcie endonucleazic
Tipuri de deterior ri:
1. Formarea de bre e
2. Modificarea BA
3. Pierderea de BA
4. Formarea dimerilor de pirimidin sub
ac iunea razelor ultraviolete
Repara ia ADN
Incizia dimerului sub aciunea
endonucleazelor
Peticirea sub aciunea ADN
polimerazei I
Excizia fragmentului lezat sub aciunea
exonucleazei
Sudarea sub ac iunea ADN ligazei
Reparaia prin
excizia dimerului
Repara ie prin fotoreactivare
Repara ie prin recombinare
Transcrip ia
biosinteza ARN pe matri de ADN
Particularit i:
Matri - DNA dublu helicoidal
(prezena catenei anticodogene de
ADN) (catena+),
Substrat - ribonucleozidtrifosfai (ATP,
GTP, CTP, UTP)
Sinteza are loc n direcia 5 3
Este asimetric copierea catenei
necodific toare
Este incomplet are loc copierea
doar a unei poriuni de ADN
(transcripton: promotor, operator, GS,
terminator)
Fora motrice a procesului e hidroliza
PP
Enzima - ARN polimeraza
ARN polimeraza
1. este o holoenzim
2. la procariote - este oligomer din 5 protomeri
(2 , , 1 i sigma ).
subunitile centre catalitice;
- fixeaz substratul;
1 se leag de ADN,
- are rol n recunoaterea secvenelor
matriei numit promotor, unde ader enzima
la eucariote :
1. RNApI sintetizeaza RNA ribozomal (28S si
18S)
2. RNApII sintetizeaza RNAm
3. RNApIII sintetizeaza RNAt, RNAr 5S i
molecule mai mici
3. Nu necesit prezen a primerului
4. Nu posed funcie nucleazic, doar
polimerazic
5. ADN polimeraza conine Zn2+ i necesit
prezena n mediu a ionilir de Mg2+, Mn2+
Etapele transcrip iei
Sinteza decurge n 3 etape: iniierea, elongarea,
terminarea.
Iniierea ncepe n anumite secvene de ADN numite
promotor (P 40 nucleotide).
Pe P deosebim 2 locusuri: de recunoatere (depistat cu
ajutorul sigmei) i locusul de legare lax a ARN
polimerazei. Locusul de recunoatere e situat la o
distan de 25 nucleotide de locusul de legare i 10
nucleotide de la punctul de ini iere (+1)
Toi P bacterieni au 2 secvene consens situate pe
catena codific toare:
Caseta Pribnow (-10) 5 TATAAT 3 responsabil de
iniierea denatur rii locale a ADN
Caseta -35 5 TTGACA 3 - la care are loc asocierea
primar a ARN polimerazei
subunitatea recunoate caseta -35 i se leag la ea.
E. alunec de-a lungul ADN i n jurul casetei -10
(Pribnow) deschide dublul helix formnd complexul
deschis de ini iere
ARN p catalizeaz formarea primei leg. fosfodiesterice
ntre nucleotidul +1 i +2 - disociaz, iar E-cor
continu sinteza.
Etapele transcrip iei
Sinteza decurge n 3 etape: iniierea,
elongarea, terminarea.
Iniierea ncepe n anumite secvene de ADN numite
promotor (P 40 nucleotide). ARN polimeraza
recunoate cu ajutorul sigma
Toi P bacterieni au 2 secvene consens situate pe
catena codifictoare:
1. Caseta Pribnow 5 TATAAT 3
2. Caseta 35 5 TTGACA 3
P la eucariote:
1. GC casete GGGCG
2. CAAT casete CCAAT
3. Caseta Hogness TATAT/AT
Primele 2 sunt responsabile de frecvena transcripiei (cnd
ncepe), a 3 - - implicat n iniiere semnal (unde).
Toate sunt responsabile de exacitatea iniierii
Pe P deosebim 2 locusuri: de recunoatere (depistat cu
ajutorul sigmei) i locusul de legare lax a ARN
polimerazei. Locusul de recunoatere e situat la o
distan de 25 nucleotide de locusul de legare i 10
nucleotide de la punctul de iniiere (+1)