Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Noiune despre enzime, natura chimic i rolul biologic al enzimelor. Diferena dintre aciunea enzimelor i
catalizatorilor nebiologici.
Dovezile naturii proteice a enzimelor. Structura enzimelor. Proenzimele (zimogenii). Noiune despre centrul activ i
centrul alosteric al enzimelor.
Izoenzimele i rolul lor.
Cofactorii enzimelor. Coenzimele i ionii metalici. Funciile de coenzime a vitaminelor i microelementelor.
Natura chimic (structura) vitaminelor B1, B2, B6, PP i rolul lor ca coenzime.
Mecanismul de aciune al enzimelor. Centrul activ al enzimelor i rolul lui n formarea i transformarea complecilor
intermediari dintre enzim i substrat. Rolul modificrilor conformaionale reciproce ale moleculei enzimei i
substratului la favorizarea catalizei (reaciei).
Nomenclatura (denumirea) i clasificarea enzimelor. Caracteristica general a claselor i subclaselor principale de
enzime. Numrul de cod al enzimei.
Enzimele
- cea mai imens
imens ii specializat
specializat clas
clas de proteine, care regleaz
regleaz i
i coordoneaz
coordoneaz decurgerea armonioas
armonioas a reac
reaciilor chimice.
- reprezint
reprezint catalizatori biologici,
biologici, care mresc viteza reac
reaciei chimice i
i rezult
rezult la sf
sfrit nemodifica
nemodificai cantitativ i
i calitativ.
calitativ.
- ac
acioneaz
ioneaz strict ntr-o anumit
anumit consecutivitate i cu o anumit
anumit specificitate.
- energia substan
substanelor reagente trece dintr-o form
form n alta cu o eficacitate mare. Se acumulez n ATP ce este utilizat
utilizat n
procesele vitale.
Natura chimic
Enzimele sint proteine i
i posed
posed toate propriet
proprietile
ile fizico-
fizico-chimice,
chimice, specifice acestor macromolecule (solubilitate
(solubilitate,,
propriet
propriet osmotice,
osmotice, sarcin
sarcin electric
electric net,
net, denaturare termic,
termic, reac
reacii chimice .a
.a.)
Activitatea lor e dependent de pstrarea structurii native a proteinei.
Dovezile experimentale:
1. Sunt alctuite din AA
2. Prezena macromolecule.
3. n apa formeaz substane coloidale cu proprietdtile sale specifice
4. Prezintd electroliti amfoliti
s. Sunt termolabili i anume: distrug
distrugerea lan
lanului polipeptidic prin fierbere n solu
soluii acide sau bazice (hidroliza) sau
denaturarea lor.
6. Enzimele, fiind proteine sunt supuse aciunii altor E care scindeaz proteinele Ex: Pepsina n mediu acid scindeaz
amilaza.
7. Cel mai solid argument este c in condii de laborator din AA
au fost sintetizate: ribonucleaza scindeaz acizii nucleici
lizozima - ce distruge capsulele microorganismelor.
1
Enzimele
Enzimele pot fi :
Proteine simple sau conjugate.
Cele simple sint alctuite numai din AA
Cele conjugate sint asociate cu compui ce au mase moleculare mici, dializabili i termostabili cofactor
Cind aceti compui organici sint strins legai n structura enzimei poart denumirea de grupari prostetice:
prostetice: cind, ins
imbinarea lor este usor disociabil-poart denumirea de coenzime.
coenzime .
Aceti biocatalizatori se numesc holoenzime, iar componena proteic - apoenzima de care depinde specificitatea.
Cofactori pot ti: cationii unor metale,
mai rar unii anioni,
substanele asemanatoare cu nucleotidele,
precum i vitaminele n forma lor activ
activ.
Clasificarea coenzimelor
Co vitaminice
Tiaminice
Flavinice
Nicotinamidice
Piridoxinice
Folice
Cobamidice
Biotinice
lipoice
Co nevitaminice
(nucleotidice; metaloporfirinice,peptidice)
Structura enzimelor
Masa moleculara a E e de mii de ori mai mare dec
dect masa molecular a substratului i deci E acioneaz nu cu toat
molecula dar cu o parte, un anumit sector- acest loc de aciune cu S se numete CA
CA - combinarea unical n spaiu i n timp a anumitor resturi de AA care asigur interaciunea cu S i transformarea
ulterioar a acestuia
2
moleculele E alosterice sint mai mari, mai complexe i sint oligomere pare;
c)au cinetica lor - viteza reaciilor n dependen de concentraia substratului are forma sigmoldal, dar nu hiperbolica,
cauzat
cauzat de urm
urmrile interac
interaciunii ntre
ntre protomeri ce leag
leag S n mod cooperativ (exemplu mioglobina i hemoglobina).
Conceptul
Conceptul coencidenei inductive
coincidena forat (Kochland)
3
care presupure o flexibilitate (modificare
(modificare conforma
conformaional)
ional) a CA ct ii o modificare (extindere
(extindere sau comprimarea
leg
legturilor , eliberarea dipolilor de ap
ap de ce se atinge repede starea de tranzi
tranziie)
ie) a S.
Din punct de vedere termodinamic,
termodinamic, aezarea cea mai potrivit
potrivit a S n
n raport cu E reduce la minimum gradele de
libertate n
n ce prive
privete micarea S, i
i mic
micoreaz
oreaz entropia,
entropia, ceea ce favorizeaz
favorizeaz atingerea uoar
oar a st
strii de tranzi
tranziie.
ie.
n enzima liber CA este preformat (tensionat) ceea ce nseamn c el are o configuraie spaial uor diferit de cea
necesar fixrii S. Substratul induce o modificare conformaional a CA, care favorizeaz fixarea S.
Proenzimele (zimogenii).
Unele enzime (proteine) se sintetizeaz
sintetizeaz n forma neactiv
neactiv de precursor, care se activeaz
activeaz n anumite condi
condiii.
Exemplu:
1) enzimele digestiei: pepsinogenul, himotripsinogenul, tripsinogenul, proelastaza, procarboxipeptidaza - scindeaza
proteinele in stomac ~i duoden.
2) coagularea singelui e determinat
determinat de cascada de reac
reacii cu activitate proteolitic
proteolitic;
3) hormonii proteici (insulina);
4) proteinele fibrilare (colagenul).
Unul din mecanismele de activare a proenzimelor este proteoliza limitata.
Proteoliza limitata - este scindarea (
(nl
nlturarea) unui sector al catenei n
n rezultat enzima se restructureaz
restructureaz i se
formeaz
formeaz CA.
Importanla biologic
biologic a prezen
prezenei formelor nea
neactive .
1. Protejaz
Protejaz de proteoliz
proteoliz proteinele celulelor produc
productoare de E.
2. Este o forma de rezerv
rezerv a E, care rapid pot fi activate i intervi
intervin n reac
reacie.
Nomenclatura (denumirea)
Sunt cunoscute mai mult de 2500 enzime fiecare E i ii are denumirea de la denumirea S n latin
latin cu adii
adiionarea
onarea
termina
terminaiei aza.
Amiloid -amilaza, ureaza.
S-au p
pstrat i denumir
denumirile vechi tradi
tradiionale pepsina, tripsina.
Este utilizat pe larg denumirea sistematic
Denumirea S+ tipul reaciei (malat DH;piruvat carboxilaza )
4
3. Organizarea enzimelor n celul (ansamblurile enzimatice, compartimentalizarea). Reglarea activitii enzimatice n
celul importana principiului de retroinhibitie.
4. Deosebirea privind componena enzimatic a organelor i esuturilor. Enzimele organospecifice. Modificarea
activitii enzimatice n diferite afeciuni (enzimodiagnosticul).
5. Metodele de obinere i purificare ale enzimelor. Cromatografia de afinitate.
6. Utilizarea enzimelor n practica medical. ntrebuinarea enzimelor imobilizate n medicin.
7. Unitile de activitate ale enzimelor.
8. Metodele de determinare a activitii enzimelor.
Termolabilitatea (-t)
Temperatura influeneaz pronunat activitatea enzimei. La t joase E sunt puin active.
Dac lum punctil de plecare 0 grade
s-a constatat ca majorarea t cu 10 grade dubleaza activitatea. Aa continu p pn la 40-50 grade. Majorarea de mai departe
duce la micorarea activitii. La 100 grade toate E organismului sunt inactive. Unele E a microorganismelor termofile sunt
active la T 80 grade.
Creterea vitezei reaciei odat cu creterea t este nterpretat prin prisma "energiei de activare". Pentru fiecare
enzim se poate stabili o t optim la care viteza ajunge valoarea maxima, mai departe viteza scade din cauza distruciei
enzimei, denaturarea proteinei.
Specificitatea
Deci fiecare E catalizeaz un anumit tip de reac
reacii sau transformarea unui anumit S.
1) Specificitatea de reacie:
reacie: E-catalizeaz un anumit tip de reacie ce st la baza clasificrii enzimelor: o hidroliza, o
reacie redox, formarea unei legturi, etc.
2) Enzimele cu o anumit specificitate de reac
reacie poate avea specificitate de substrat relativ sau absolut:
a. specificitate relativa - asigura transformarea unui grup de substante inrudite chimic i se intlnete n diferite
ipostaze:
ipostaze:
- transforma un numar mare de substrate (proteazele): chimotripsina - legatura peptidica, formata de COOH a
Phe, Tyr, Trp; tripsina - de COOH ai Lyz si Arg.
- transform mai puine substrate: alcooldehidrogenaza - dehidrogenaza un grup de alcooli monohidroxilici,
recunoscind gruparea OH (specificitatea de grup)
- lipazele digestive specific recunosc pozitia legaturii esterice intre glicerina i acizi grai:
b. specificitate absoluta. E recunoate un singur substrat Anhidraza carbonica, Ureaza.
3) Stereospecificitatea de substrat i de reacie. 0 enzima poate ataca numai un izomer D sau L.. Majoritatea
biomoleculelor poseda un atom de C asimetric i fiind chirali pot exista sub forma celor 2 enantiomeri. Ex: Amilaza
scindeaz legturile Alfa 1-4 glucozidice din amidon sau glicogen i nu influenteaz asupra legturilor beta din celuloza.
Ac
Aciunea pH asupra activiti
activitiii enzimatice
Fiecare enzim are un pH optim la care ii manifest activitatea maximal.
In CA al E se afl grupri ionizabile, acide sau bazice, acestea interacioneaz direct cu ionii H+ si OH-, rezultatul
fiind creterea sau scderea gradului lor de disociere, acionnd ca adevrai inhibitori ai enzimelor (amilaza n sucul gastric).
Ionii H+ si OH- au un efect denaturant asupra enzimelor - rup legturile, ce determin structura teriar.
Majoritatea enzimelor celulare au pH-ul optim n jurul pHului fiziologic de 7,4 cu excepii ca hidrolazele acide
lizozomale, pentru care este n jur de 5 sau monoaminooxidaza din membrana mitocondriala externa, circa 10. La enzimele
digestive pH-lui optim este cel al sediului lor de actiune: 1,5 2 al pepsinei, 7 al amilazei pancreatice, 8 al tripsinei, etc.
Deci mrind sau micorind pH-ul mediului, se poate regla activitatea catalitica a enzimelor. Dependena activitii
enzimatice de variaia pH-ului este deseori descris de o curb n forma de clopot.
Mecanismele de activare a E
Sunt : 1. nespecifice: temperatura , iradierea
2. specifice
- Se activeaz la majorarea concentraiei S cnd este insuficient
- La majorarea cantitii E (crete numrul
numrul de molecule de produs, n-tr-o unitate de timp)
- La introducerea coenzimelor cnd sunt insuficiente
- Introducerea ionilor metalelor Fe, Cu
- Modificarea chimica sau covalent a E.
- proteoliza limitata (pepsinogen - pepsin in HCI)
- Activarea prin efectori alosterici
- Autoasamblarea cuaternara .
- Aici se mai refer i re
reactivarea dar noi ne vom opri la mecanismele de inhibiie.
5
Reglarea covalent (fosforilare-defosforilare)
Activitatea unor E se modific prin fosforilare. Fosforilarea se face prin transferul unui rest fosfat de la ATP pe
gruprile hidroxil ale unor resturi de Ser, Tre; Tyr din componena lor.
Reaciile de fosforilare snt catalizate de kinaze specifice.
Este un proces reversibil
E-OH + ATP -------------- E-O-P +ADP
Defosforilarea are loc sub aciunea fosfotazei specifice
E-OP +H2O -------------- E-OH +H2PO3
Prot
Proteoliz limitat
Proteoliza limitata - este scindarea (
(nl
nlturarea) unui sector al catenei n
n rezultat enzima se restructureaz
restructureaz i se
formeaz
formeaz CA.
H+
Pepsinogen ------pepsin
-42AA
Autostructurarea cuaternar
Este caracteristic E ce posed structur cuaternar
Fiecare protomer n parte nu posed activitate enzimatic
La asamblarea lor se modific conformaia fiecrui protomer i corespunztor se modific i conformaia CA,
devenind astfel favorabil pentru fixarea i transformarea S
Inhibi
Inhibiia activitii enzimelor.
Deosebim:
Deosebim:
inhibiie specific
inhibiie nespecific (T, pH, agenisii denaturrii )
Inhibiiia st la baza aciiunii substanielor medicamentoase, agenilor toxici.
Retroinhibiie
Sistemele polienzimatice
Fiecare celul a organismului conine setul su specific de enzime. Unele se gsesc n toate celulele, altele sunt
prezente doar n anumite celule sau anumite compartimente celulare. Funcia fiecrei enzime, nu este izolat, ci strins legat
de funcia altor enzime. Astiel din enzime aparte se formeaza sisteme polienzimatice sau conveiere.
Func
Functia
tia sistemelor polienzimatice depinde de particularitatile de organizare a lor in celule.
Se cunosc urmatoarele tipuri de organizare a sistemelor polienzimatice:
- funcional,
- structural-funcional i
- mixt.
Tipurile
ipurile de organizare a sistemelor polienzimatice:
Organizarea funcional - enzimele sunt asociate n sisteme polienzimatice, care ndeplinesc o anumit func funcie. Produsul
reaciei prirmei enzime a lanului servete drept substrat pentru enzima urmtoare etc.
Ex.de organizare funcional - enzimele glicolizei, unde toate E participante se gsesc n stare solubil; Fiecare reacie
este catalizat de enzime aparte. Drept verig de legtura aici servesc metaboliii.
Organizarea structural-funcional consta n faptul ca enzimele formeaz sisteme structurale cu o anumit funcie.
6
Ex.- complexul polienzimatic piruvatdehidrogenazic, constituit din cteva enzime, care particip la oxidarea acidului
piruvic, sau sintetaza acizilor grai constituit din apte enzime legate structural, care n ansamblu ndeplinesc funcia de
sinteza a acizilor grasi.
Afar de complexele multienzimatice e posibila i o alt varianta de organizare structural-funcional. Astfel enzimele
se pot aranja n lan, fixindu-se de membrana biologic. Ex.enzimele lanului respirator mitocondrial, care particip la
transferul de electroni i protoni i la generarea de energie.
Tipul mixt de organizare a sistemelor polienzimatice reprezint o mbinare a ambelor tipuri de organizare, adic o parte
din sistemul polienzimatic are organizare structurala, iar cealalt
cealalt parte - organizare funcional.
Ex.- ciclul Krebs, unde o parte din enzime sunt asociate n complex structural (complexul 2-
oxoglutaratdehidrogenazic), ar alt parte se leag funcional prin metaboliii de legtur.
Deosebirea privind componena enzimatic a organelor i esuturilor. Enzimele organospecifice. Modificarea activitii
enzimatice n diferite afeciuni (enzimodiagnosticul).