Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Nomenclatur i clasificare
Clasificare
Dupa natura reactiilor pe care le genereaza pot
fi hidrolaze, esteraze, formilaze.
Exista si denumiri uzuale care nu se incadreaza
in aceasta categorie: tripsina, pepsina.
Fiecare enzima se caracterizeaza printr-un cod
format din 4 cifre separate intre ele prin puncte
ce au anumite semnificatii si care se scriu in fata
numelui fiecarei enzime.
Clasificare
Prima cifra indica clasa din care face parte enzima.
Dupa IUB, dupa felul reactiilor pe care le catalizeaza exista 6 clase
principale care la randul lor se impart in subclase pe baza specificitatii
de substrat a acceptorului utilizat.
1) E.C.1.-.-.- clasa oxidoreductazelor- catalizeaza reactiile de oxidoreducere prin transfer de proton sau electron.
2) E.C.2.-.-.- clasa transferazelor- catalizeaza reactiile de transfer ale
unor grupari, resturi de molecule de pe un substrat pe altul.
3) E.C.3.-.-.- clasa hidrolazelor- catalizeaza reactiile de hidroliza.
4) E.C.4.-.-.- clasa liazelor- catalizeaza reactiile de degradare in care
nu intervin procesele de hidroliza sau oxido-reducere.
5) E.C.5.-.-.- clasa izomerazelor- catalizeaza reactiile de izomerizare
si racemizare.
6) E.C.6.-.-. clasa ligazelor (sintetazelor)- catalizeaza reactiile de
sinteza.
Enzime
Enzime
Din punct de vedere chimic, enzimele de tip proteidic sunt formate din dou
componente : componenta proteic, apoenzima i componenta neproteic, cofactor
sau coenzim (dup modul de legare cu apoenzima).
Coenzima cnd se leag de apoenzim prin legturi slabe, disociabile i
Cofactor cnd gruparea prostetic se leag de apoenzim prin legturi covalente,
nedisociabile.
Exist i o grup de cofactori anorganici care mediaz trecerea proenzimei
dintr-o form inactiv ntr-o form activ.
Enzimele au mase moleculare care variaz n limite largi (9.000-1.000.000).
Ele prezint, ca i proteinele, structur primar, secundar, teriar i cuaternar, cu
importana major n activitatea enzimatic. Spre deosebire de apoenzime, cofactorii
sunt termostabili i au masa molecular mic.
Cofactorii sunt:
grupe prostetice care sunt legate de apoenzim;
coenzime (cofermeni) - care reacioneaz reversibil cu apoenzima;
cofactori anorganici (activatori) care fac, ca enzima s treac ntr-o form
activat.
In principiu apoenzima are rolul de a face legatura enzimei cu substratul asupra
caruia actioneaza, iar coenzima indeplineste activitatea catalitica.
Izolarea enzimelor
Pot fi izolate din celulele din care sunt elaborate sau din lichidele in care sunt
Extragerea enzimelor din celule este foarte dificila pentru ca de cele mai multe ori
acestea sunt legate chimic de protoplasma celulara. Se extrag mai inti
transformandu-se prin titruare cu nisip si uscare in pulbere cu solventi organici sau
solutii acide sau bazice diluate care prin precipitare sau evaporare se transforma in
enzime. Amestecul de enzime obtinut se supune purificarii cromatografice.
Structura enzimelor
Proprietati
Majoritatea sunt substante solubile in apa si solventi organici si
solutiile au caracter coloidal. Sarcina coloizilor variaza cu pH ul.
Sunt caracterizate ca si proteinele de punct izoelectric.
Substrate (S)
Enzyme (E)
Products
E-S Complex
Enzyme
Cinetica enzimatica
Reactiile spontane in care unul sau mai multi reactanti se transforma
instantaneu in produsi sunt rare. Reactantilor trebuie sa li se
furnizeze o cantitate de energie egala cu energia de activare.
Catalizatorii in general si enzimele in special accelereaza reactiile
posibile din punct de vedere termodinamic micsorand valoarea
energiei de activare.(E = Ea)
Datorita naturii duale a enzimei, reactia are loc in doua etape (I, II).
I- enzima se leaga de substrat(ESCO)
II- are loc reactia propriu-zisa (catalizare)
K+1
K+2
E + S ES produsi + E
K-1
K-2
Enzime
Vmax S
v0 =
K M S
Vmax = K2[ET]
Grupa
Reacia catalizat
Exemple
EC1
oxidoreductaze
oxidare/reducere
- Oxidaze
- Dehidrogenazes
EC2
Transferaze
Transfer de grupare
- Transaminzse
EC4
Hidrolaze
Liaze
Catalizeaz hidroliza
- Amilaze
diverselor legturi
- Proteaze
EC5
EC6
Izomeraze
Ligaze
molecular a substratului
- Glucozisomeraze
(convertesc glucoza n
fructoz )
- DNA ligaze
Schimb structura
Oxidoreductaze
NAD serveste drept coenzima pentru mai multe enzime cu rol important in
diverse procese de hidrogenare; catalizeaz reactii de oxido-reducere prin
transfer reversibil de hidrogen. Alcool dehidrogenaza catalizeaza atat
reacia de dehidrogenare a etanolului cu formare de aldehida acetica cat si
reactia de formare a etanolului din aldehida acetica.
3HC
alcooldehidrogenoza
H2
C
OH
3HC
EH2
H
NH2
CONH2
N
N
HC
HC
HC OH
HC OH
HC OH
HC
O
O
HC OH
O
HC
CH2 O P O P O CH2
OOH
NAD
N
N
HC
HC
HC OH
O
NH2
CONH2
HC OH
HC
HC OPO3H2 O
HC OH
O
O
HC
H2C O P O P O CH2
OH
ONADP
Dintre
coenzimele
flavinice
importante
sunt
FMN
(flavinmononucleotida) si FAD (flavinadenindinucleotida). Ambele
coenzime au drept compus in principal nucleul izoaloxazinic.
Componanta proteica (apoenzima)este de obicei o albumina.
CH3
CH3
H
C
H
CH2
C CH2 O
OH OH OH
N
N
O
H
C
P O
OH
OH
CH2
N
O
OH OH
NH
NH2
FAD
N
N
Dintre cele mai importante FMN: fermentul respirator al lui Warberg (in
drojdia de bere) = fermentul galben, OH
L- aminoacid-oxidaza.
H2C
OH
H
H
OH
OH
O
H
NH2
CH2
FMN
H3C
proteina
HO
C
NH
H3C
H3C
H3C
+2H
NH
H3C
NH
N
H
H
N
-2H+
H3C
proteina
HC
CH3
CH3
N
Fe
N
CH2CH2COOH
CH2CH2COOH
Cu
Cu
-1e-
Transferaze
H
C
R1
COOH
COOH
NH2
COOH
R1
H
C
COOH
NH2
SH
CH2
H2N
CH
H2C
2HC
OH
CH2N(CH3)3
COOH
Homocisteina
CH2
transferoza
acid folic
2HN
CH
CH3
2HC
OH
CH2N(CH3)2
COOH
Colamina
Metionina
Dimetiletanolamina
N
N
SH
CH
CH2
HC OH
O
HC O
PO3H2
CH
CH2
O
NH
H3C CH3 OH
H2C O P O P O CH2
OH OH
CH
CO
NH CH2 CH2 CO
Hidrolaze
Grupa hidrolazelor (E.C.3..)catalizeaza reactiile de hidroliza
(scindarea hidrolitica a proteinelor, lipidelor, glucidelor). Au rol
important in descompunerea macromoleculelor in molecule mai
mici.
Exista un mare numar de enzime de acest tip.
EXEMPLE
Liaze- sintetaze
EC4
Liazele sunt catalizatori care scindeaza
moleculele complexe in molecule mai
simple fara scindare hidrolitica sau oxidoreductoare.
O liaza cunoscuta este aldolaza
importanta in metabolismul glucidic,
fermentatia alcolica: determina scindarea
compuilor carbonilici. Actioneaza asupra
hexozelor pe care le transforma in trioze:
2HC
OPO3H2
aldoza sau
CH2
fructozo 1,6-difosfat
HC
HC
H2C
OH
liaza
2HC
C
H2C
CHO
OPO3H2
O
OH
HC
H2C
OH
OPO3H2
OH
OPO3H2
carbonica
H2CO3
H+ + HCO3-
Aceasta coenzima contine Zn2+ si se gaseste in cantitate mai mare in mucoasa gastrica
si rinichi.
Enolaza- catalizeaza reactia de formare a acidului piruvic din acidul 2fosfogliaric prin eliminarea unei molecule de apa.
COOH
COOH
COOH
enolaza
HC
OPO3H2
OPO3H2
CH3CHO
-H2O
H2C
CH3
CH2
OH
acid fosfoenolpiruvic
acid 2-fosfogliceric
acid piruvic
COOH
+
HOOC
CH
acid fumaric
H2O
fumarat
hidrataza
HO
2HC
COOH
C
H
COOH
acid L-malic
Izomeraze- racemaze
EC5
Izomerazele sunt enzime ce catalizeaza si intervin in metabolismul
intermediar (fermentatie elcoolica glicogen glucoza 1-fosfat glucoza
6-fosfat).
CH2O
OPO3H2
O
H2C
OH
O
fosfoglucomutaza
OPO3H2
ester glucozo-6-fosforic
ester glucozo1-fosforic
Ligazele
EC6
sunt enzime ce catalizeaza formarea unor legaturi
chimice noi intre 2 compusi.
A + B + ATP A B + AMP + P P
Izoenzimele