Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
REFERAT
Bacterii
TIMIȘOARA 2020
Bacterie
Bacteriile sunt microorganisme procariote și
alcătuiesc domeniul Bacteria (sinonim Eubacteria). Prezintă de cele mai multe ori o lungime de
câțiva micrometri, dar sunt foarte diverse din punct de vedere morfologic, regăsindu-se sub
formă sferică, alungită sau spiralată (elicoidală). Bacteriile au fost printre primele forme de viață care
au apărut pe Pământ și sunt prezente în majoritatea habitatelor existente. Se regăsesc
în sol, apă, izvoare termale, deșeuri radioactive,[4] chiar și la adâncimi mari din scoarța terestră.
Bacteriile trăiesc în relații de simbioză sau sunt uneori paraziți ai plantelor și animalelor. Majoritatea
acestora nu au fost caracterizate, iar aproximativ doar jumătate dintre încrengăturile bacteriene
cuprind specii care pot fi crescute în laborator.[5] Știința care se ocupă cu studiul bacteriilor se
numește bacteriologie și este o ramură a microbiologiei.
Într-un gram de sol se regăsesc aproximativ 40 milioane de celule bacteriene, iar într-un
mililitru de apă dulce se regăsesc aproximativ 1 milion de celule bacteriene. Un calcul ar indica
faptul că pe Pământ există circa 5×1030 bacterii,[6] așadar acestea alcătuiesc o biomasă cu mult mai
mare decât cea corespunzătoare plantelor și animalelor la un loc.[7] Bacteriile sunt organisme vitale
în multe cicluri ecologice, având rolul de circulare al nutrienților, precum este cazul fixării azotului din
atmosfera terestră. Un alt exemplu este descompunerea cadavrelor, bacteriile fiind responsabile de
etapele de putrefacție ale acestui proces.[8]
În ecosistemele care au ca habitat izvoarele hidrotermale sau izvoarele reci,
bacteriile extremofile joacă un rol esențial în aducerea aportului de nutrienți necesari pentru viață,
prin transformarea unor compuși precum hidrogenul sulfurat și metanul în energie. În octombrie
2012, datele adunate de către cercetători au sugerat faptul că bacteriile prosperă în Groapa
Marianelor, care este cel mai adânc punct de pe suprafața Pământului, fiind aflat la o adâncime de
11 kilometri.[9][10] Alți cercetători au dedus prin studii similare faptul că bacteriile se dezvoltă chiar și în
interiorul rocilor la o adâncime de 580 de metri sub fundul oceanic cu o adâncime de 2,6 kilometri,
din apropiarea coastei nord-vestice a Statelor Unite.[9][11] Conform unuia dintre savanți, „Microbii pot fi
întâlniți oriunde – sunt organisme extrem de adaptabile la orice condiții, și pot supraviețui oriunde se
află.”[9][12]
Nu de mult a fost demontat mitul conform căruia numărul de celule bacteriene din corpul
uman îl depășește pe al celulelor umane în raport de 10:1. Aproximativ 39 de bilioane (39·1012 sau
3,9·1013) de celule bacteriene se află în microflora normală a unei persoane de referință de gen
masculin, ce cântărește 70 kg și are o înălțime de 170 cm, numărul total de celule umane fiind de 30
de bilioane (30·1012). Așadar, deși numărul de bacterii este mai mare, acesta este doar cu 30% mai
mare, nu cu 900%.[13]
Cel mai mare număr de bacterii se regăsește în flora intestinală și de asemenea un mare
procent este reprezentat și de microflora pielii.[14] Vasta majoritate de specii bacteriene care trăiesc
în corpul uman sunt considerate ca fiind inofensive, datorită mecanismelor de apărare specifice
organismului, precum este sistemul imunitar. Există și bacterii care sunt chiar benefice, în special
cele ce aparțin florei intestinale. În ciuda acestui fapt, unele specii sunt patogene și, odată pătrunse
în organism, produc diverse boli infecțioase, printre care se
numără holera, sifilisul, antraxul, lepra și ciuma bubonică. Cele mai comune patologii infecțioase
bacteriene fatale sunt infecțiile respiratorii, tuberculoza fiind cauza de deces a aproximativ 2
milioane de persoane în fiecare an, cu precădere în Africa Subsahariană.[15]
În țările dezvoltate, antibioticele sunt utilizate în tratamentul infecțiilor bacteriene, dar au
aplicații și în domeniul agriculturii, ceea ce a dus la apariția unei probleme serioase, și anume
fenomenul de rezistență la antibiotice.[16] Bacteriile sunt extrem de folositoare în industrie,
în epurarea apelor, în obținerea de produse lactate fermentate (precum brânza și iaurtul), în
recuperarea aurului, paladiului, cuprului și a altor metale în industria minieră,[17] în biotehnologie și în
procesul de fabricație al unor antibiotice și al altor compuși chimici.[18]
Deși erau considerate ca făcând parte din regnul Plantae, alcătuind clasa Schizomycetes, în
prezent se consideră că bacteriile sunt organisme procariote. Spre deosebire de celulele eucariote,
care sunt specifice organismelor vegetale și animale, bacteriile nu prezintă nucleu celular și rareori
prezintă organite celulare delimitate de membrană. Chiar dacă în mod tradițional se considera că
termenul de bacterie făcea referire la toate procariotele, a fost dezvoltată o nouă clasificare
științifică, după descoperirea în anii 1990 a faptului că procariotele reunesc două grupuri distincte de
organisme care au evoluat de la un strămoș comun. Cele două domenii au primit denumirile
de Bacteria și Archaea.[1]
Cuprins
1Istoria bacteriologiei
o 1.1Etimologie
2Origine și evoluție
3Morfologie bacteriană
o 3.1Mărimi și forme
o 3.2Grupări și asocieri
4Structură celulară
o 4.1Structuri intracelulare
o 4.2Structuri extracelulare
o 4.3Endosporii
5Metabolism
o 5.1Respirație și fermentație
o 5.2Nutriție
6Creștere și reproducere
o 6.1Reproducerea
o 6.2Creșterea
7Comportament
o 7.1Mobilitate
o 7.2Comunicare
8Genetică
9Clasificare și identificare
10Filogenie
11Interacțiuni cu alte organisme
o 11.1Comensale
o 11.2Prădătoare
o 11.3Mutualiste
o 11.4Patogene
12Importanță tehnologică și industrială
Istoria bacteriologiei
Antonie van Leeuwenhoek a fost primul microbiolog și prima persoană care a observat bacteriile utilizând
un microscop.
Bacteriile au fost observate pentru prima dată în anul 1676 de către savantul danez Antonie
van Leeuwenhoek, utilizând un microscop format din două lentile, pe care l-a construit însuși el.
[19]
Ulterior, acesta a publicat rezultatele observațiilor sale într-o serie de scrisori trimise către Royal
Society of London.[20][21][22] Dintre toate studiile lui Leeuwenhoek, descoperirea bacteriilor este de
departe cea mai remarcabilă. Bacteriile observate se aflau la limita structurilor pe care microscopul
acestuia le putea observa și, în plus, următorul secol niciun alt om de știință nu a repetat această
experiență.[23] Leeuwenhoek a observat de asemenea și protozoarele, pe care le-a
denumit animalculum, iar descoperirile sale au fost din nou privite prin prisma noilor descoperiri din
domeniul teoriei celulare.
Christian Gottfried Ehrenberg a introdus termenul Bacterium în anul 1828.[24] De fapt,
termenul era folosit pentru un gen de bacterii alungite și nesporulate,[25] spre deosebire de
termenul Bacillus, introdus în anul 1835, care era folosit pentru un gen de bacterii alungite și
sporulate (formatoare de spori).[26] În anul 1859, Louis Pasteur a demonstrat faptul că dezvoltarea și
creșterea microorganismelor este cauza procesului de fermentație și că această creștere nu este
nicidecum cauzată de o generație spontană. Împreună cu Robert Koch, Pasteur a fost un susținător
timpuriu al teoriei microbiene a bolilor.[27]
Robert Koch, un pionier al microbiologiei medicale, a studiat îndeaproape patologii
precum holera, antraxul și tuberculoza. În urma studiilor pe tuberculoză, Koch a demonstrat relația
cauzală între un microb și boala produsă de acesta, primind astfel în anul 1905 Premiul Nobel
pentru Fiziologie sau Medicină.[28] Postulatele lui Koch reprezintă un set de patru criterii care ajută să
se stabilească dacă un organism este agentul etiologic al unei boli, fiind în uz chiar și astăzi.[29]
Pacienți bolnavi de holeră, boală care este cauzată de Vibrio cholerae (vibrionul holeric).
Ferdinand Cohn este considerat a fi unul dintre fondatorii bacteriologiei, studiile sale datând
din 1870. Acesta a fost primul care a clasificat bacteriile pe baza morfologiei lor.[30][31]
Deși în secolul al XIX-lea se cunoștea faptul că bacteriile sunt cauza multor boli, la acea
vreme nu exista niciun tratament antibacterian eficient.[32] În 1910, Paul Ehrlich a dezvoltat
primul antibiotic, prin modificări structurale ale coloranților care colorau Treponema
pallidum (spirocheta care este agentul etiologic al sifilisului). Astfel, acesta a obținut noi compuși
bactericizi, selectivi pentru agentul patogen.[33] Ehrlich a primit în anul 1908 Premiul Nobel pentru
studiile sale din domeniul imunologiei și a fost un pionier al utilizării metodelor de colorație pentru
detectarea și identificarea bacteriilor. Pe baza lucrărilor sale, a fost dezvoltată colorația Gram și
ulterior colorația Ziehl-Neelsen.[34]
Un mare pas înainte în domeniu bacteriologiei a fost descoperirea din anul 1977 a lui Carl
Woese, care a concluzionat faptul că arheele prezintă o linie evolutivă diferită de cea a bacteriilor.
[3]
Această nouă taxonomie filogenetică a fost demonstrată prin secvențierea ARN-ului ribozomal de
tip 16S și a dus la divizarea organismelor procariote în două domenii evolutive și respectiv
începerea utilizării unui sistem de clasificare biologică bazat pe trei domenii
(Archaea, Bacteria, Eukaryota).[1]
Etimologie
Termenul bacteria este forma de plural a cuvântului neolatin bacterium, care este forma
latinizată a termenului grecesc βακτήριον (bakterion),[35] forma de diminutiv a βακτηρία (bakteria),
care înseamnă „baston”.[36] Această denumire provine de la faptul că primele bacterii care au fost
descoperite aveau formă de bastonaș (bacil).[37][38]
Origine și evoluție
Strămoșii bacteriilor care trăiesc în ziua de azi erau microorganisme unicelulare, cel mai
probabil primele forme de viață de pe Pământ, și au apărut acum aproximativ 4 miliarde de ani. Timp
de 3 miliarde de ani, majoritatea organismelor vii erau microscopice, iar bacteriile și arhebacteriile
erau formele dominante de viață.[39][40] Deși au fost identificate bacterii fosile, precum
sunt stromatolitele, acestea nu oferă niciun detaliu distinctiv legat de morfologia lor, ceea ce duce la
imposibilitatea de a examina istoria evolutivă a bacteriilor. Totuși, secvențele de gene pot fi folosite
pentru reconstrucția filogeniei bacteriene, iar aceste studii indică faptul că bacteriile au evoluat din
ramura arhebacterii/eucariote.[41]
În prezent se pune întrebarea dacă primele organisme procariote care au apărut au fost
bacteriile sau arheele. Unii oameni de știință sunt de părere că domeniul Bacteria este mai vechi
decât domeniul Archaea și că domeniul Eukarya a derivat de la acesta,[42] în timp ce alții consideră
că domeniul cel mai vechi este Archaea.[43] Se crede că cel mai recent strămoș comun al bacteriilor
și arhebacteriilor este un organism hipertermofil care a trăit acum 2,5-3,2 miliarde de ani.[44][45] În
schimb, alți savanți susțin faptul că ambele domenii sunt relativ recente (de aproximativ 900 de
milioane de ani)[46][47] și că au evoluat pornind de la o bacterie Gram-pozitivă (cel mai probabil
o actinobacterie), care a dat naștere cladei Neomura prin înlocuirea peretelui de peptidoglican cu un
perete glicoproteic.[48][49]
Bacteriile au luat parte la a doua divergență evolutivă majoră, anume cea a arhebacteriilor și
eucariotelor. În cazul organismelor eucariote, evoluția a avut loc prin asocierea endosimbiotică a
bacteriilor.[50][51] Acest fenomen a însemnat ingerarea de către celulele proto-eucariote a
unor simbionți alfa-proteobacterieni, ceea ce a dus la transformarea acestora în organite
precum mitocondrii sau hidrogenozomi, încă prezente în celulele eucariote. Ulterior, unele celule
eucariote care deja conțineau mitocondrii au ingerat organisme de tip cianobacterii, ceea ce a dus la
formarea cloroplastelor la alge și la plante.[52][53] Acest fenomen este cunoscut sub denumirea
de endosimbioză primară.[54] Prin fenomene ulterioare de endosimbioză secundară, au apărut
organisme autotrofe eucariote, organisme cheie în dezvoltarea vieții marine.[55]
Morfologie bacteriană
Mărimi și forme
Bacteriile prezintă o mare varietate de forme și dimensiuni, iar forma este un criteriu
important de clasificare și identificare a bacteriilor, aceasta variind în funcție de vârstă și de factori
ereditari specifici, uneori depinzând chiar și de mediul de cultură. Celulele bacteriene măsoară
aproximativ o zecime din lungimea unei celule eucariote și au o lungime de 0,5 până la 5 micrometri.
Există și unele excepții, cum este cazul a două specii care sunt vizibile cu ochiul liber: Thiomargarita
namibiensis are jumătate de milimetru în lungime,[56] iar Epulopiscium fishelsoni poate ajunge chiar
la 0,7 mm.[57] Printre cele mai mici bacterii se numără speciile din genul Mycoplasma, care măsoară
doar 0,3 micrometri, comparabil cu dimensiunea celor mai mari virusuri.[58] Unele bacterii pot fi chiar
mai mici în dimensiune, însă asemenea specii nu au fost încă studiate îndeajuns.[59]
Majoritatea speciilor bacteriene prezintă ori formă sferică, fiind în acest caz coci (din
grecescul kókkos, „sămânță”), ori formă cilindrică sau alungită, de bastonaș, fiind în acest
caz bacili (din latinescul baculus, „băț”). ] La coci se pot deosebi și mai multe varietăți, fiind ovoidali,
lanceolați sau reniformi, iar bacilii pot avea capete drepte (Bacillus anthracis), rotunjite (Escherichia
coli) sau ascuțite (Fusiobacterium fusiforme). Unele bacterii se aseamănă cu o virgulă, fiind în acest
caz vibrioni, iar altele prezintă formă spiralată sau elicoidală, asemănător formei literei S, având
spire neregulate sau regulate, fiind în acest caz spirili sau spirochete. Mai pot avea formă de
filament, care ajunge la zeci de microni lungime, fără a prezenta diviziuni transversale. Există de
asemenea pe lângă aceste forme principale de observație și forme specifice și anume speciile
pedunculate și cele filamentoase (neramificate, pseudoramificate și ramificate). Au fost descrise și
câteva specii cu forme neobișnuite, precum sunt bacteriile stelate.[61] Principalii factori care
determină această mare varietate de forme bacteriene sunt peretele celular și citoscheletul, iar
forma are o importantă influență asupra capacității bacteriei de a procura nutrienții din mediu, de a
se atașa de suprafețe, de a se deplasa prin medii lichide și de a scăpa de prădători.[62][63]
Diferitele mărimi pe care le prezintă procariotele, în comparație cu cele ale altor organisme și biomolecule.
Grupări și asocieri
Multe specii bacteriene trăiesc solitare, ca celule izolate, dar unele se asociază în anumite
formate specifice: speciile de Neisseria se asociază în diplococi (în
pereche), Streptococcus formează lanțuri lungi, iar Staphylococcus se grupează sub formă de
ciorchine de strugure. Cocii formează tetrada și sarcina, care sunt grupări constituite din patru,
respectiv opt bacterii. Tetrada se formează prin înmulțirea într-un singur plan, dar în două direcții, iar
sarcina prin înmulțire în două planuri distincte. Gruparea în palisadă este proprie bacililor și are loc
atunci când aceștia sunt dispuși în paralel. Bacteriile se pot grupa chiar și în număr mari mare,
formând structuri multicelulare, precum sunt filamentele alungite de Actinobacteria, agregatele
de Myxobacteria și hifele complexe de Streptomyces.[64] Aceste structuri multicelulare sunt adesea
observate doar în condiții specifice. De exemplu, în mediile sărace în aminoacizi, speciile
de Myxobacteria detectează prezența celulelor apropiate printr-un proces denumit detectare de
cvorum, migrează una către cealaltă și se agregă, formând structuri ce ating lungimi de 500 μm și
care sunt alcătuite din aproximativ 100.000 de celule.[65] În aceste structuri, fiecare bacterie va
îndeplini un anumit rol; de exemplu, aproximativ una din zece celule migrează către partea
superioară și se diferențiază într-un myxospor, o formă specializată, în stare latentă, mult mai
rezistentă la uscăciune și la alte condiții neprielnice de mediu.[66]
Bacteriile se pot atașa de suprafețe și pot forma agregate cunoscute sub denumirea
de biofilme, sau formațiuni chiar mai mari în dimensiune. Biofilmele și asocierile mai mari pot măsura
de la câțiva micrometri în grosime până la o jumătate de metru, și pot fi formate din mai multe specii
bacteriene, protiste și arhee. Bacteriile care viețuiesc în biofilme prezintă un aranjament complex al
componentelor celulare și extracelulare, formând și structuri secundare, precum microcoloniile, care
au rețele complexe de canale ce permit o mai bună difuzie a nutrienților.[67][68] În mediul natural, de
exemplu pe sol sau la suprafața plantelor, majoritatea bacteriilor sunt atașate de suprafețe în
biofilme.[6Biofilmele prezintă o importanță în domeniul medical, deoarece aceste structuri se
formează în urma unor infecții bacteriene cronice sau în infecții localizate la nivelul dispozitivelor
medicale implantate. Bacteriile care conviețuiesc în biofilme sunt mult mai dificil de distrus, în
comparație cu bacteriile izolate.
Structură celulară
Fiecare celulă bacteriană prezintă o membrană celulară, care este alcătuită majoritar
din fosfolipide. Această membrană delimitează conținutul celular și funcționează pe post de barieră,
menținând în citoplasmă compușii esențiali ai metabolismului bacterian.[75] Spre deosebire
de celulele eucariote, bacteriile sunt lipsite de structuri celulare mari și nu prezintă nucleu
celular, mitocondrii, cloroplaste sau alte organite prezente la eucariote.[78] Totuși, unele bacterii
prezintă organite delimitate de structuri proteice citoplasmatice, care sunt specifice pentru diferitele
activități metabolice bacteriene,[79][80] cum sunt de exemplu carboxizomii și magnetozomii.[81] În plus,
celulele bacteriene posedă un citoschelet format din mai multe componente, care are rolul de a
controla localizarea proteinelor și acizilor nucleici de la nivel celular și de a dirija procesul
de diviziune celulară.[82][83][84]
Multe reacții biochimice importante, precum sunt cele generatoare de energie, au loc
datorită gradientului de concentrație de o parte și de alta a membranei, care creează o diferență
de potențial electrochimic. Lipsa unor membrane interne de la nivelul celulelor bacteriene presupune
faptul că aceste reacții, care includ chiar și procese de transport de electroni, au loc de-a lungul
membranei celulare, între citoplasmă și partea externă a celulei (spațiul periplasmatic).[85] Totuși,
bacteriile fotosintetizatoare prezintă o membrană plasmatică foarte pliată, impregnând celula cu
diverse straturi de membrane colectoare de lumină.[86] Aceste complexe utilizate în fotosinteză pot
forma chiar structuri lipidice denumite clorozomi, cum este cazul speciilor de Chlorobiaceae.[87]
Structura membranei citoplasmatice bacteriene este foarte asemănătoare din punct de vedere structural cu cea
vegetală și animală, cu mențiunea că aceasta nu prezintă colesterol.
Imagine prin microscopie electronică a unei celule de Escherichia coli, în care se observă aproximativ 100-200
de fimbrii cu rol în adeziunea de celulele epiteliale ale tractului urogenital.
Multe bacterii prezintă un strat S, alcătuit din molecule proteice cu structură rigidă, care
protejează partea externă a peretelui celular.[100] Acest strat conferă protecție chimică și fizică
suprafeței celulare și poate funcționa ca barieră de difuzie macromoleculară. Funcțiile straturilor S
sunt diverse și nu sunt în întregime înțelese, însă se cunoaște, de exemplu, faptul că pot fi factori
de virulență la speciile de Campylobacter și conțin enzime de la suprafață la specia Bacillus
stearothermophilus.[101]
Flagelii sunt structuri proteice filamentoase, care au 20 de nanometri în diametru și până la
20 de micrometri în lungime, a căror rol este motilitatea celulară. Mișcarea flagelilor este imprimată
de energia obținută prin procesul de transfer al ionilor. Acest transfer este la rândul său antrenat de
gradientul electrochimic care există de o parte și de alta a membranei citoplasmatice.[77]
Fimbriile sunt structuri proteice filamentoase, de obicei cu un diametru de 2–10 nanometri și
până la câțiva micrometri în lungime. Sunt distribuite la suprafața celulei bacteriene și se aseamănă,
la observarea prin microscopie electronică, cu firele de păr. Principala funcție cunoscută a fimbriilor
este adeziunea pe suprafețe solide sau pe alte celule, iar la unele specii patogene sunt factori de
virulență.[102] Pilii sunt anexe celulare, puțin mai mari decât fimbriile, care au rolul de transfer
al materialului genetic de la o celulă bacteriană la alta în cadrul unui proces denumit conjugare.
Aceste tipuri de pili pot fi întâlniți și sub denumirile de pili de conjugare sau pili de sex.[103] Pilii mai
pot fi implicați și în motilitate, caz în care sunt denumiți pili de tipul IV.[104]
Metabolism
Bacillus anthracis observat în frotiu din lichidul cefalorahidian, pe care s-a realizat o colorație Gram
litotrofe, când utilizează pe post donori de electroni compuși anorganici, de cele mai multe
ori pe bază de sulf;[124]
organotrofe, când utilizează pe post donori de electroni compuși organici.[125]
Bacteriile chemotrofe se folosesc de donori de electroni pentru conservarea energiei (în timpul
respirației aerobe, anaerobe și fermentative) și pentru desfășurarea reacțiilor biosintetice, în timp ce
bacteriile fototrofe utilizează donorii de electroni doar pentru procese anabolice.[122][123][125]
Respirație și fermentație
Organismele care respiră utilizează compușii chimici ca sursă de energie, preluând electronii
substratului redus și transferându-i la un acceptor terminal de electroni, iar toate reacțiile care au loc
sunt procese de oxido-reducere. În urma acestor reacții se obține energia necesară pentru
biosinteza de acid adenozintrifosforic (ATP) și pentru menținerea operantă a metabolismului.
La organismele aerobe, oxigenul este acceptorul final de electroni, iar organismele
anaerobe utilizează alți compuși anorganici drept acceptori de electroni, precum
sunt nitrații, sulfații sau dioxidul de carbon.[126] Au loc astfel procese biochimice deosebit de
importante, precum este denitrificarea, reducerea sulfaților și respectiv acetogeneza.[127][128] Un alt
proces important este fermentația, un proces de oxidare incompletă, total anaerobă, a cărui produs
final de metabolizare este un compus organic care, atunci când va fi redus, va deveni acceptorul
final de electroni. Exemple de produși ai fermentației sunt lactatul (în fermentația
lactică), etanolul (în fermentația alcoolică), butiratul, hidrogenul, etc. Fermentația este posibilă
datorită faptului că energia substratelor este mai mare decât cea a produșilor metabolici, ceea ce
permite microorganismelor să realizeze sinteza de ATP și să își mențină operant metabolismul.
Organismele facultativ anaerobe sunt cele care își pot comuta modul de respirație între fermentație
și alți acceptori terminali de electroni în funcție de condițiile de mediu în care se află.[129]
Nutriție
O colonie de cianobacterii fotosintetizatoare
Cunoașterea modului de nutriție a bacteriilor are importanță practică pentru cultivarea lor și
prepararea vaccinurilor. Creșterea, dezvoltarea și multiplicarea bacteriilor sunt condiționate de
pătrunderea nutrienților esențiali prin învelișurile celulare și eliminarea unor substanțe uzate
rezultate din catabolism. Nutriția se realizează prin mecanisme de tip absorbtiv. Bacteriile își pot
procura energia fie în urma procesului de fotosinteză, fiind bacterii fototrofe, fie prin descompunerea
compușilor din mediu în urma proceselor oxidative, fiind bacterii chemotrofe.[126] Bacteriile litotrofe
pot utiliza compușii anorganici ca sursă de energie, iar cei mai comuni donori de electroni anorganici
sunt hidrogenul, monoxidul de carbon și amoniacul (ceea ce conduce la nitrificare), fierul divalent și
alți ioni metalici în stare redusă, precum și sulful în stare redusă. Există și bacterii denumite
metanotrofe, care utilizează metanul gazos atât ca sursă de electroni, cât și ca substrat
al anabolismului carbonului.[130] La bacteriile aerobe cu nutriție fototrofă și chemolitotrofă, oxigenul
este acceptorul final de electroni, în timp în condiții anaerobe se utilizează compușii anorganici.
Majoritatea organismelor litotofe sunt autotrofe, iar majoritatea organismelor organotrofe sunt
heterotrofe.[125]
În tabelul de mai jos se regăsesc majoritatea tipurilor de nutriție care fac parte din metabolismul
bacteriilor.
Tipuri de nutriție în metabolismul bacterian
Tipul de Sursa de
Sursa de carbon Exemple
nutriție energie
Compuși organici
Lumina (fotoheterotrofă) sau Cyanobacteria, Chlorobiaceae, Chloroflexi, Bacterii
Fototrofă
solară fixarea carbonului purpurii
(fotoautotrofă)
Compuși organici
Compuși (litoheterotrofă) sau
Litotrofă Thermodesulfobacteria, Hydrogenophilaceae, Nitrospirae
anorganici fixarea carbonului
(litoautotrofă)
Compuși organici
Compuși (chemoheterotrofă)
Organotrofă Bacillus, Clostridium, Enterobacteriaceae
organici sau fixarea carbonului
(chemoautotrofă)
Prin diversele procese metabolice de care dispun, bacteriile sunt folositoare pentru
stabilitatea ecologică și pentru societatea umană. Un exemplu este capacitatea acestora de a fixa
azotul gazos, utilizând enzima denumită nitrogenază.[131] Astfel, au loc procese importante din punct
de vedere ecologic, precum denitrificarea, fixarea sulfaților și obținerea de acetat.[127]
[128]
Metabolismul bacterian joacă un rol important în procesele de bioremediere, întrucât unele specii
sunt capabile să realizeze tratarea apelor reziduale, iar altele pot degrada hidrocarburi, substanțe
toxice și inclusiv deșeuri radioactive. Pe de altă parte, există și procese metabolice bacteriene care
pot duce la poluare, cum este de exemplu cazul bacteriilor reducătoare de sulfat, responsabile
pentru producerea formelor extrem de toxice ale mercurului (metil- și dimetilmercur).[132]
Creștere și reproducere
Animație reprezentând modul de diviziune prin fisiune binară sau sciziparitate.
Reproducerea
Spre deosebire de organismele pluricelulare, pentru organismele unicelulare creșterea în
dimensiune a celulei și reproducerea prin diviziune celulară sunt procese strâns legate. Bacteriile
cresc până la o anumită dimensiune, iar apoi se reproduc prin fisiune binară sau diviziune simplă,
care este o formă de reproducere asexuată.[133] În condiții potrivite, o bacterie Gram-pozitivă se
poate divide odată la fiecare 20-30 de minute, iar o bacterie Gram-negativă odată la 15-20 de
minute, iar după aproximativ 16 ore numărul de celule al unei colonii care a proliferat dintr-o singură
celulă poate atinge 5.000 de milioane. În condiții optime de viață, bacteriile sunt organisme care
cresc și se divid extrem de rapid, astfel că fiecare populație bacteriană se poate dubla, pentru
anumite specii, chiar și într-un timp de 9,8 minute.[134]
În urma diviziunii celulare are loc producerea a două celule fiice identice. Unele bacteriile,
deși prezintă și modul de reproducere asexuată prin diviziune directă, prezintă structuri reproductive
mult mai complexe care ajută la dispersarea celulelor fiice nou formate.[135] Exemple includ: formarea
corpilor de fructificație ce produc spori la speciile de Myxobacteria,[136] formarea hifelor la speciile
de Streptomyces și înmugurirea.[137] Multiplicarea prin fragmentare se întâlnește la bacteriile
filamentoase, cu dezvoltare hifală (Actinomycetes), în care alungirea se face prin adăugarea de
material nou numai la extremități și la locul de origine al ramificațiilor. După un timp are loc
fragmentarea în porțiuni scurte și egale.[137] Înmugurirea (engleză budding) presupune formarea pe
corpul celulei mamă a unei protuberanțe, de obicei de formă sferică, din care ulterior se vor dezvolta
una sau mai multe celule fiice, mult mai mici în dimensiune.[138]
Deși reproducerea asexuată este cel mai comun tip de diviziune întâlnit în rândul bacteriilor,
există și un anumit tip de reproducere sexuată, denumită parasexualitate bacteriană. Acest fenomen
are în vedere capacitatea bacteriilor de a schimba material genetic, prin intermediul unui proces
cunoscut sub denumirea de conjugare bacteriană.[72]
Creșterea
În laborator, bacteriile sunt crescute utilizând medii de cultură de diferite consistențe. Mediile
solide, precum sunt cele realizate din agar-agar, sunt utilizate pentru izolarea culturilor pure ale unei
anumite tulpini bacteriene. Spre deosebire de acestea, mediile lichide sunt utilizate atunci când este
necesară măsurarea creșterii sau când este necesar un volum mare de celule. Prin utilizarea
mediilor de cultură selective, care conțin anumiți nutrienți sau antibiotice, se poate realiza
identificarea anumitor organisme.[140]
Majoritatea tehnicilor de creștere în laborator a bacteriilor se bazează pe utilizarea unor
nivele crescute de nutrienți, având ca efect obținerea unui număr mare de celule, rapid și cu un cost
redus. Totuși, în mediul natural, nutrienții sunt adesea limitați, ceea ce înseamnă că bacteriile nu se
pot reproducere indefinit. Această limitare a nutrienților a dus la dezvoltarea evolutivă a diferitelor
strategii de creștere. Unele organisme pot crește extrem de rapid dacă primesc nutrienții necesari,
un exemplu fiind formarea coloniilor mari de alge și de cianobacterii în lacuri, în timpul verii.[141] Alte
organisme prezintă diverse adaptări la medii neprielnice, cum este de exemplu cazul speciilor
de Streptomyces care produc mai multe tipuri de substanțe antibiotice, cu rol de inhibiție a evoluției
microorganismelor concurente din mediu.[142]
În natură, multe organisme trăiesc în cadrul unor comunități (de exemplu, bacteriile se pot
asocia în biofilme), ceea ce le oferă o mai bună absorbție a nutrienților și o protecție față de factorii
de stres din mediu.[69] Aceste relații de simbioză pot fi în unele cazuri esențiale pentru creșterea unui
anumit organism sau a unui grup de organisme.[143]
Curba de creștere a unei culturi bacteriene și fazele corespunzătoare creșterii. Aceasta reprezintă evoluția unei
populații bacteriene care se multiplică prin diviziune simplă în funcție de timp
Comportament
Mobilitate
Multe specii de bacterii sunt mobile, iar mobilitatea acestora se realizează prin diverse
mecanisme, mai exact prin alunecare, prin contracție sau cu ajutorul flagelilor. Unele bacterii pot
aluneca pe suprafețe solide în urma secreției unor substanțe vâscoase, însă mecanismul exact al
propulsării celulare este încă necunoscut. Mișcarea bacteriilor prin contracție (engleză twitching
motility) se realizează cu ajutorul unei structuri denumite pil de tipul IV,[148] iar mișcarea prin
alunecare (engleză gliding motility) se realizează printr-un mecanism diferit. În cazul mișcării prin
contracție, pilul se extinde, se atașează de substrat, iar apoi se retractă, ceea ce imprimă
deplasarea celulei.[149]
Cea mai bine studiată structură a mobilității bacteriene este flagelul bacterian, un organit
filamentos de natură proteică care asigură mobilitatea prin mișcări de rotație.[150] Flagelul bacterian
este alcătuit din aproximativ 20 de proteine, iar alte 30 de proteine sunt necesare pentru reglarea și
asamblarea acestuia.[150] Mișcarea de rotație a flagelului, care imprimă bacteriei o viteză de 30 până
la 70 de micrometri pe secundă, este asigurată de un mecanism care utilizează ca sursă de energie
gradientul electrochimic ce se stabilește de o parte și de alta a membranei.[151]
Flagelul bacterian este o structură extracelulară care prezintă mișcări de rotație. Structura sa este:
1-filament, 2-spațiu periplasmic, 3-cârlig, 4-articulație, 5-disc L, 6-ax, 7-disc P, 8-perete celular, 9-stator, 10-
disc MS, 11-disc C, 12-sistem de secreție de tipul III, 13-membrană externă, 14-membrană citoplasmatică;
Axul central și discurile alcătuiesc corpul bazal.
Bacteriile pot utiliza fragelii în diferite moduri pentru generarea mai multor tipuri de mișcări
celulare. Multe specii (cum este, de exemplu, E. coli) prezintă două tipuri de mobilități: mișcarea în
linie dreaptă și mișcarea de rostogolire, cea din urmă fiind folositoare pentru reorientarea celulei
bacteriene.[152] Speciile diferă între ele prin numărul și aranjamentul flagelilor de la suprafața celulei;
acestea pot prezenta un singur flagel (fiind specii monotriche), un mănunchi de flageli la o
extremitate (fiind specii lofotriche), câte un flagel sau câte un mănunchi de flagel la fiecare
extremitate (fiind specii amfitriche) sau pot fi acoperite în totalitate de flageli (fiind specii peritriche).
Speciile care nu prezintă flagel sunt denumite, în mod analog, specii atriche sau neflagelate.
La un grup specia de bacterii, spirochetele, flagelii sunt localizați în spațiul periplasmic, între cele
două membrane, și de aceea se numesc flageli interni. Aceștia produc o mișcare de rotație ce face
ca celula să se miște similar unui tirbușon.[150]
Bacteriile mobile pot prezenta mișcări de atracție sau de repulsie, determinate de diferiți
stimuli recepționați din mediu. Acest comportament este un răspuns comportamental și este
denumit taxie, fiind de mai multe tipuri, precum chemotaxia, fototaxia și magnetotaxia.[153][154][155] În
grupul aparte al mixobacteriilor, celulele individuale se deplasează împreună, formând „valuri” de
celule, care se agregă cu scopul de a forma corpii de fructificație caracteristici.[66][136] Deplasarea
mixobacteriilor are loc doar pe suprafețe solide, spre deosebire de E. coli, care se poate deplasa
atât în medii lichide, cât și în medii solide.
Unele specii de Listeria și Shigella se deplasează în interiorul celulei gazdă folosindu-se
de citoschelet, care este utilizat în mod normal pentru transportul intracelular al organitelor. Prin
inițierea polimerizării actinei la unul dintre polii celulelor lor, acestea pot forma o structură
filamentoasă care le împinge de-a lungul citoplasmei celulei gazdă.[156]
Comunicare
Cultură de bacterii bioluminiscente
Unele bacterii dispun de sisteme chimice generatoare de lumină. Acest fenomen, cunoscut
sub denumirea de bioluminiscență, se produce la speciile care trăiesc în asociere cu peștii, deci se
crede că lumina are scopul de a atrage pești și alte animale mari.[157] De asemenea, bacteriile se pot
asocia formând agregate multicelulare denumite biofilme, în care împărtășesc o varietate de
semnale moleculare necesare comunicării intercelulare și prezintă un comportament care este
coordonat la nivel multicelular.[158][159]
Genetică
Majoritatea bacteriilor prezintă un singur cromozom circular, a cărui dimensiune poate varia de la
160.000 perechi de baze (la bacteria endosimbiontă Carsonella ruddii)[161] până la 12.200.000
perechi de baze (12,2 Mpb, la specia Sorangium cellulosum).[162] Totuși, există multe excepții, câteva
exemple fiind unele specii de Streptomyces și Borrelia care conțin un singur cromozom linear,[163]
[164]
și unele specii de Vibrio care conțin mai mulți cromozomi.[165] În afara cromozomilor, bacteriile
dispun și de plasmide, molecule de ADN extra-cromozomial care conțin gene ce codifică diverse
funcții, precum rezistența la antibiotice, abilități metabolice și diferiți factori de virulență.
[166]
Genomul bacterian codifică, de obicei, câteva sute până la câteva mii de gene. Genele
bacteriene sunt alcătuite în general dintr-o singură catenă continuă de ADN. Deși s-a remarcat
prezența câtorva tipuri de introni la bacterii, aceștia sunt mult mai rar în comparație cu genomul
eucariotelor.[167]
Clasificare și identificare
Termenul de „bacterie” era utilizat în mod tradițional pentru desemnarea tuturor organismelor
procariote unicelulare și microscopice. Totuși, cercetările recente de sistematică moleculară au
indicat faptul că organismele procariote alcătuiesc de fapt două domenii separate, denumite
original Eubacteria și Archaebacteria, și denumite în prezent Bacteria și Archaea, care au evoluat în
mod independent de la același strămoș comun.[1] Arheele și eucariotele sunt mai înrudite între ele
decât sunt oricare dintre cele două cu bacteriile. Aceste două domenii, împreună cu Eukarya,
alcătuiesc baza unui sistem de trei domenii, care este cel mai utilizat sistem în mod curent în
microbiologie.[42] Din cauza introducerii relativ recente a metodelor de sistematică moleculară și a
creșterii rapide a numărului de secvențe genomice disponibile, se poate concluziona faptul că
procesul clasificării bacteriilor este un domeniu schimbător și care se extinde rapid.[5][186] Unii biologi
ar susține idea că arheele și eucariotele au evoluat din bacteriile Gram-pozitive.[49]
Celule de Streptococcus mutans vizualizate cu ajutorul colorației Gram. Fiecare punct violet reprezintă o celulă
bacteriană.
Filogenie
În ciuda organizării lor aparent simplă, bacteriile sunt capabile să formeze asociații complexe
cu alte organisme. Aceste relații simbiotice pot fi plasate în
sfera parazitismului, mutualismului sau comensalismului
Comensale
Datorită dimensiunii lor reduse, bacteriile comensale sunt ubicue și cresc atât pe animale,
cât și plante, în același mod în care se dezvoltă pe orice altă suprafață. În plus, creșterea lor poate fi
accelerată de căldură de și transpirație, astfel că populațiile mari de organisme comensale sunt
cauza mirosului corporal.[205]
Prădătoare
Bacteriile așa-zise „prădătoare” sunt cele capabile să omoare și să se hrănească cu alte
microorganisme.[206] Printre acestea se numără specii precum Myxococcus xanthus, a cărui celule se
adună, omoară și digeră bacteriile din mediu.[207] Alte bacterii prădătoare atacă microorganismele cu
scopul de a le digera și de a le absorbi nutrienții, cum este cazul Vampirovibrio chlorellavorus,
[208]
sau invadează alte celule și se multiplică în interiorul acestora, la nivel citosolic, cum procedează
speciile de Daptobacter.[209] Se crede că aceste bacterii au evoluat de la specii saprofage care se
hrăneau de pe microorganisme moarte, prin adaptări care le-au permis să prindă și să omoare alte
organisme.[210]
Mutualiste
Anumite bacterii formează asociații intime cu alte organisme, ceea ce este esențial pentru
supraviețuire. Una dintre aceste asociații mutualiste este transferul de hidrogen între specii. Acesta
are are loc între grupurile de bacterii anaerobe care consumă acizi organici, precum acidul
butiric și acidul propionic, și produc hidrogen, și arheele metanogene care consumă hidrogenul
obținut.[211] Bacteriile din această asociere nu sunt capabile să consume acizii organici când
hidrogenul se acumulează în mediul înconjurător. Doar asocierea cu arheele consumatoare de
hidrogen menține gazul în concentrații îndeajuns de mici, astfel încât să se permită creșterea
bacteriilor.
În sol, microorganismele sunt răspândire la nivelul rizosferei (zona care include
suprafețele rădăcinilor și solul care aderă la acestea) și au rolul de a realiza fixarea azotului prin
transformarea azotului atmosferic în fază gazoasă în compuși nitrogenați.[212] Acest proces este
folositor deoarece furnizează plantelor o formă ușor absorbabilă de azot, întrucât acestea nu pot fixa
azotul atmosferic în mod direct.
Multe alte specii bacteriene se regăsesc în relație de simbioză cu organismele umane și
animale. De exemplu, prezența celor peste 1000 de specii bacteriene în flora intestinală normală a
omului contribuie la desfășurarea unor procese precum imunitatea, sinteza de vitamine (cum
sunt acidul folic, vitamina K și biotina), convertirea glucidelor la acid lactic (speciile de Lactobacillus),
dar și fermentarea carbohidraților complecși care sunt nedigerabili.[202][213][214][215] Prezența bacteriilor
din flora intestinală normală inhibă creșterea bacteriilor potențial patogene, de obicei prin mecanism
competitiv, astfel că bacteriile benefice sunt comercializate sub formă de suplimente
alimentare probiotice.[216]
Patogene
Imagine prin microscopie electronică, ulterior colorată, ce prezintă celule de Salmonella enterica (cu roșu)
invadând celulele umane în cultură.
Doar o mică fracțiune dintre bacterii produc patologii la om: dintre cele 15.919 specii
înregistrate în baza de date a NCBI, doar 538 de specii sunt bacterii patogene.[217] Chiar și în acest
caz, câteva dintre speciile patogene sunt unele dintre principalele cauze ale bolilor și ale mortalității
în rândul oamenilor, cauzând boli infecțioase bacteriene precum: tetanosul, febra
tifoidă, difteria, sifilisul, holera, intoxicațiile alimentare, lepra și tuberculoza. În unele cazuri, agentul
etiologic al unei boli este descoperit doar după mulți ani, cum a fost de exemplu cazul ulcerului
gastroduodenal și descoperirea bacteriei cauzatoare Helicobacter pylori. Infecțiile bacteriene
afectează atât plantele, cât și animalele, ceea ce are consecințe în agricultură; un exemplu de boală
bacteriană a plantelor este ciuma de foc (sau focul bacterian), iar la animalele de fermă sunt întâlnite
paratuberculoza, mastita, salmoneloza și antraxul.[204]
Fiecare specie patogenă prezintă un spectru caracteristic de interacțiuni cu gazda umană.
Unele organisme, precum cele din genul Staphylococcus sau Streptococcus, pot cauza infecții
cutanate, pneumonie, meningită sau chiar septicemie, un răspuns inflamator sistemic ce produce
șoc, vasodilatație masivă și moarte.[218] Totuși, aceste specii fac parte și din flora normală a
organismului și trăiesc de obicei localizat la nivelul pielii sau a nasului, fără să cauzeze vreo boală.
Alte organisme produc invariabil boli la om, precum sunt rickettsiile, care sunt paraziți obligatoriu
intracelulari ce pot crește și se pot reproduce doar în celulele altor organisme. Rickettsia
prowazekii produce tifosul exantematic, iar Rickettsia rickettsii produce febra pătată a Munților
Stâncoși.[219] Chlamydia, un alt gen de paraziți obligatoriu intracelulari, conține specii care cauzează
pneumonii, infecții de tract urinar, boli cu transmitere sexuală și poate provoca și cardiopatie
ischemică.[220] În final, există specii, precum Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia
cenocepacia și Mycobacterium avium, care sunt bacterii patogene oportuniste, cauzând boli doar la
pacienții imunodeprimați sau la cei cu fibroză chistică.[221][222]
Infecțiile bacteriene sunt tratate cu ajutorul antibioticelor, care
sunt medicamente bactericide (în cazul în care omoară bacteriile) sau bacteriostatice (dacă previn
creșterea bacteriană). Există mai multe tipuri de antibiotice, iar fiecare clasă inhibă un proces a cărui
desfășurare este diferită la agentul patogen și respectiv la gazdă. Exemple de antibiotice care
produc toxicitate selectivă sunt cloramfenicolul și puromicina, care inhibă ribozomul bacterian și nu
afectează ribozomul eucariot, cel din urmă fiind diferit din punct de vedere structural.[223] Antibioticele
sunt utilizate atât în tratamentul bolilor infecțioase umane, cât și în agricultura intensivă, pentru
promovarea creșterii animalelor, dar în acest caz utilizarea lor contribuie la dezvoltarea rapidă a
fenomenului de rezistență la antibiotice a populațiilor bacteriene.[224] Acest fapt are implicații
semnificative, deoarece speciile bacteriene patogene care prezintă rezistență crescută la antibiotice
produc boli care sunt extrem de greu de tratat și care au o rată mare a mortalității.[225] Prevenirea
infecțiilor bacteriene se poate face prin utilizarea metodelor de asepsie, precum sunt sterilizarea
înaintea injectării unui ac de siringă sau înaintea introducerii unor catetere. Dispozitivele chirurgicale
sau stomatologice trebuie să fie de asemenea sterilizate pentru a preveni contaminarea bacteriană a
acestora. Dezinfectanții sunt utilizați pentru distrugerea bacteriilor sau a altor agenți patogeni aflați
pe suprafețe, ceea ce reduce și mai mult riscul infectării.[226]
În tabelul de mai jos se regăsesc unele dintre infecțiile umane produse de către bacterii:
Not
Boală Agent patogen Principalele simptome
e
[227]
Bruceloză Brucella spp. Febră, adenopatie, endocardită, pneumoni
e.
[228]
Antrax Bacillus anthracis Febră, erupții cutanate, septicemie.
[229]
Holeră Vibrio cholerae Diaree, vomă, deshidratare.
[230]
Difterie Corynebacterium diphtheriae Febră, amigdalită, leziuni ale pielii.
[231]
Erizipel Streptococcus spp. Febră, eritem, prurit, durere.
Febră
Febră
înaltă, bacteriemie, cefalalgie, stupoare,
tifoidă [233]
Salmonella typhi, S. paratyphi tumefacția mucoasei
Febră
nazale, hepatosplenomegalie, diaree,
paratifoidă
perforații intestinale.
Legioneloz [234]
Legionella pneumophila Febră, pneumonie
ă
Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus
aureus,
Febră înaltă, expectorație gălbuie sau [235]
Pneumonie Klebsiella
sanguinolentă, durere toracică.
pneumoniae, Mycoplasma spp., Chlamydophil
a pneumoniae, Legionella spp.
Febră, oboseală, transpirații
Tuberculoz [236]
Mycobacterium tuberculosis nocturne, tuse cronică cu hemoptizie,
ă
scădere în greutate, necroză pulmonară.
[237]
Tetanos Clostridium tetani Febră, paralizie.
Importanță tehnologică și industrială
Multe substanțe chimice importante, precum alcoolul etilic, acidul acetic și acetona, sunt
produse ca parte a metabolismului specific bacterian. Unele specii bacteriene, în special bacteriile
lactice din genurile Lactobacillus și Lactococcus, au fost utilizate de mii de ani în combinație
cu drojdiile și mucegaiurile pentru obținerea alimentelor fermentate, precum
sunt brânza, murăturile, sosul de soia, varza murată, oțetul, vinul și iaurtul.[238][239]
Abilitatea bacteriilor de a descompune o mare varietate de compuși organici este
remarcabilă, și a fost utilizată în procesarea reziduurilor și în bioremediere. Bacteriile care pot digera
hidrocarburile din petrol sunt adesea utilizate pentru remedierea scurgerilor de petrol.[240] De
exemplu, după accidentul ecologic Exxon Valdez, au fost utilizați fertilizatori pe plajele din
împrejurimile strâmtorii Prince William cu scopul de a promova creșterea acestor bacterii.
Rezultatele au fost favorabile doar pe plajele care nu erau acoperite într-un strat prea gros de petrol.
De asemenea, bacteriile pot fi folosite și pentru bioremedierea reziduurilor toxice industriale.[241] În
domeniul industriei chimice, principala utilizare a bacteriilor este producerea de compuși
chimici enantiopuri, folosiți apoi ca medicamente sau substanțe agrochimice.[242]
Bacteriile pot fi utilizate în locul pesticidelor, în controlul biologic al dăunătorilor. În acest caz,
este comună utilizarea speciei Bacillus thuringiensis, o bacterie Gram-pozitivă care trăiește în sol.
Subspeciile acestei bacterii sunt folosite ca insecticide cu specificitate pentru lepidoptere, cu
denumirea comună de Dipel și Thuricide.[243] Datorită specificității lor, aceste pesticide sunt
considerate a fi ecologice, fără să prezinte un anumit efect asupra oamenilor, vietăților din mediul
natural, insectelor polenizatoare sau a celor benefice.[244][245]
Datorită abilității lor de a crește foarte repede și de a ușurinței relative cu care pot fi
manipulate, bacteriile sunt uneltele perfecte care pot fi utilizate în cercetarea în domeniul biologiei
moleculare, geneticii și al biochimiei. Prin producerea artificială a mutațiilor în ADN-ul bacterian și
examinarea fenotipurilor rezultate, oamenii de știință pot determina care este funcția
genelor, enzimelor și a căilor metabolice bacteriene, iar apoi pot aplica același raționament și la
organismele mai complexe.[246] Pentru înțelegerea proceselor biochimice de la nivel celular este
nevoie de un nivel mare de informații legate de cinetica enzimatică și de exprimarea genică, însă
astfel se pot concepe modele matematice valabile pentru întreg organismul. Acestea se pot realiza
pentru unele bacterii bine cunoscute, astfel că în prezent are loc producerea și testarea unor noi
modele metabolice pentru Escherichia coli.[247][248] Această înțelegere a metabolismului și a geneticii
bacteriene a permis utilizarea biotehnologiilor pentru a obține bacterii ce pot să producă anumite
proteine de uz terapeutic, precum sunt insulina, factorii de creștere sau anticorpii.[249][250]