Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
com
Istoricul articolului:
Ficobiliproteinele (PBP) sunt proteine fluorescente de diferite culori, inclusiv fucsia, violet-albastru și cyan, care permit captarea energiei luminoase în complexe fotosintetice auxiliare numite ficobilizomi (PBS). PBP-urile au câteva caracteristici structurale
Primit la 31 octombrie 2021
și fizico-chimice foarte bine conservate. În contextul PBS, funcția PBP este de a capta energia luminoasă în intervalul 450-650 nm și o furnizează fotosistemelor permițând fotosintezei. Pe lângă funcția de recoltare a energiei, PBP-urile s-au dovedit, de
Primit în formă revizuită 18 februarie 2022
Acceptat 19 februarie 2022 asemenea, că au activități biologice multiple, inclusiv antioxidante, antibacteriene și antitumorale, făcându-le un accent interesant pentru diferite aplicații biotehnologice în domenii precum biomedicina, bioenergia și cercetarea științifică. În zilele
Disponibil online pe 23 februarie 2022 noastre, principalele surse de PBP sunt cianobacteriile și algele micro și macro din filul Rhodophyta. Datorită activităților biologice diverse ale PBP-urilor, acestea au atras atenția diferitelor industrii, cum ar fi cea alimentară, biomedicală și cosmetică.
Acesta este motivul pentru care au fost generate un număr mare de brevete legate de producerea, extracția, purificarea PBP-urilor și aplicarea acestora ca produse cosmetice, biofarmaceutice sau aplicații de diagnostic, arătând un impact ecologic mai
mic în prerii naturale de macroalge și un timp de cultură mai mic sau o productivitate mai mare în cianobacteriile pentru a satisface piețele și aplicațiile care necesită cantități mari din aceste molecule. În această revizuire, rezumăm principalele
Cuvinte cheie:
caracteristici structurale ale PBP, biosinteza și aplicațiile biotehnologice ale acestora. De asemenea, abordăm tendințele actuale și perspectivele viitoare ale pieței PBP. acestea au atras atenția diferitelor industrii, precum cea alimentară, biomedicală și
PBP-uri
Structura proteinei cosmetică. Acesta este motivul pentru care au fost generate un număr mare de brevete legate de producerea, extracția, purificarea PBP-urilor și aplicarea acestora ca produse cosmetice, biofarmaceutice sau aplicații de diagnostic, arătând un impact
Molecule bioactive ecologic mai mic în prerii naturale de macroalge și un timp de cultură mai mic sau o productivitate mai mare în cianobacteriile pentru a satisface piețele și aplicațiile care necesită cantități mari din aceste molecule. În această revizuire, rezumăm
Biotehnologie principalele caracteristici structurale ale PBP, biosinteza și aplicațiile biotehnologice ale acestora. De asemenea, abordăm tendințele actuale și perspectivele viitoare ale pieței PBP. acestea au atras atenția diferitelor industrii, precum cea alimentară,
biomedicală și cosmetică. Acesta este motivul pentru care au fost generate un număr mare de brevete legate de producerea, extracția, purificarea PBP-urilor și aplicarea acestora ca produse cosmetice, biofarmaceutice sau aplicații de diagnostic, arătând
un impact ecologic mai mic în prerii naturale de macroalge și un timp de cultură mai mic sau o productivitate mai mare în cianobacteriile pentru a satisface piețele și aplicațiile care necesită cantități mari din aceste molecule. În această revizuire,
rezumăm principalele caracteristici structurale ale PBP, biosinteza și aplicațiile biotehnologice ale acestora. De asemenea, abordăm tendințele actuale și perspectivele viitoare ale pieței PBP. purificarea PBP-urilor și aplicarea lor ca produse cosmetice,
biofarmaceutice sau aplicații de diagnostic au fost generate, arătând un impact ecologic mai mic în prerii naturale ale macroalgelor și un timp de cultură mai mic sau o productivitate mai mare în cianobacteriile pentru a satisface piețele și aplicațiile care
necesită cantități mari din aceste molecule. În această revizuire, rezumăm principalele caracteristici structurale ale PBP, biosinteza și aplicațiile biotehnologice ale acestora. De asemenea, abordăm tendințele actuale și perspectivele viitoare ale pieței PBP.
purificarea PBP-urilor și aplicarea lor ca produse cosmetice, biofarmaceutice sau aplicații de diagnostic au fost generate, arătând un impact ecologic mai mic în prerii naturale ale macroalgelor și un timp de cultură mai mic sau o productivitate mai mare în cianobacteriile pentru a
Cuprins
1. Introducere.........................................................................................................................................................................................................................1507
2. Caracteristicile structurale ale PBP.................................................................................................................................................................................................. 1509
2.1.Subunități și heterodimeri (Ab)...................................................................................................................................................................................... 1513
2.2.Trimere(Ab)3........................................................................................................................................................................................................................................................................... 1513
2.3.hexameri (Ab)6.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 1514
2.4.Tije și miez....................................................................................................................................................................................................................... 1514
3. Maturarea ficobiliproteinei.......................................................................................................................................................................................................... 1514
3.1.Biosinteza ficobilinelor..................................................................................................................................................................................................... 1515
3.2.Legarea ficobilinelor de PBP.................................................................................................................................................................................1516
3.3.Alte modificări post-traduce........................................................................................................................................................................... 1516
4. Caracteristicile spectroscopice ale PBP............................................................................................................................................................... 1516
4.1. Ficoeritrina.....................................................................................................................................................................1516
4.2. Ficoeritrocianina...........................................................................................................................................................1517
4.3. Ficocianina.......................................................................................................................................................................1517
⇑Autor corespondent la: Grupo Interdisciplinario de Biotecnología Marina (GIBMAR), Centro de Biotecnología, Universidad de Concepción, Concepción 4030000, Chile..
Adrese de email:jdagnino@udec.cl (J. Dagnino-Leone),cristinapinto@udec.cl (CP Figueroa),alevallejos@udec.cl (ML Castañeda),molatorre@udec.cl (AD Youlton),
andreadonoso@udec.cl (A. Vallejos-Almirall),andagurto@udec.cl (A. Agurto-Muñoz),jpavon@udec.cl (J. Pavón Pérez),cagurto@udec.cl (C. Agurto-Muñoz).
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.02.016
2001-0370/- 2022 Publicat de Elsevier BV în numele Rețelei de Cercetare a Biotehnologiei Computaționale și Structurale. Acesta este un
articol cu acces deschis sub licența CC BY-NC-ND (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
4.4.Aloficocianina...................................................................................................................................................................................................1518
5. Perspectivele biotehnologice ale PBP............................................................................................................................................................................1518
5.1.Activități biologice................................................................................................................................................................................................1518
5.1.1. Activitate antioxidantă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1518
5.1.2. Activitate antiinflamatoare. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1520
5.1.3. Activitatea anti-boală metabolică. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1520
5.1.4. Activitate anticanceroasă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1520
5.1.5. Activitate anti-neurodegenerativă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1521
5.1.6. Activitate anti-microorganisme. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1521
5.2.Aplicatii biotehnologice...............................................................................................................................................................................1521
5.2.1. Producția de PBP din surse naturale. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1521
5.2.2. PBP recombinante. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1521
5.2.3. Extragerea PBP-urilor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1521
5.2.4. Purificarea PBP-urilor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1522
5.2.5. Încapsularea ficoliliproteinelor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1522
5.2.6. Utilizarea biomedicală a PBP-urilor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1522
....
6. Perspective de viitor..........................................................................................................................................................................................................1522
7. Finanțări...............................................................................................................................................................................................................................1523 Declarație de contribuție a
autorului CRedit................................................................................................................................................................................ 1523 Declarație de interese
concurente..................................................................................................................................................................................1523
Referințe..........................................................................................................................................................................................................................1523
1. Introducere prin patru inele pirolice. Are, de asemenea, un ion de magneziu asociat
cu inelele pirolice prin legături covalente coordonate și un lanț de
Cea mai mare sursă de energie de pe planeta noastră vine de la soare hidrocarburi cunoscut sub numele de fitol (Fig. 1A)[5,6]. Toate
sub formă de lumină, sub formă de particule indivizibile numite fotoni. O organismele fotosintetice conțin clorofilăA,întrucât toate au derivat
altă modalitate de a defini lumina este energia electromagnetică, care poate dintr-un strămoș comun[7]. Până în prezent, au fost descrise șase tipuri
fi detectată de ochiul uman la intervale de la 400 nm la 700 nm, aproximativ. diferite de clorofile (a, b, c1, c2, d și f), variind în grupele de radicali
Acest interval este folosit de mai multe organisme pentru a efectua atașate la atomii de carbon din inelul lor de porfirină, rezultând spectre
fotosinteza.[1] diferite de absorbție între diferitele clorofile. . Toate Chl diferite pot
Fotosinteza este un proces biologic de oxid-reducere, în care absorbi eficient energia luminii între 400 și 500 nm și între 650 și 720
energia chimică este obținută din compuși anorganici ca substrat și nm. În ciuda varietății mari de Chls, toți au o absorbție slabă a energiei
energia electromagnetică a luminii, captată cu ajutorul pigmenților luminii cu lungimea de undă în intervalul de la 500 la 650 nm, o zonă de
specializați. Energia captată de acești pigmenți este transformată și gol cunoscută în mod obișnuit sub numele de „Green Gap” (Fig. 1B)[
stocată în diferiți compuși, în principal carbohidrați, ca energie chimică 4,8–10].
[2]. Aproximativ 45% din fotosinteza de pe Pământ se realizează în
Clorofila (Chl), principalul pigment fotosintetic, este asociată cu medii acvatice[7], în principal de microalge. Cu toate acestea, în aceste
complexe multiproteice cunoscute sub numele de centre de reacție ale medii, iradierea și distribuția spectrală a luminii nu sunt uniforme din
fotosistemelor[3,4]. Chl este alcătuit dintr-un inel de porfirină format cauza unei serii de fenomene fizice precum reflexia,
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 1. (a)Structura moleculară a clorofileiA. (b)Spectrul de absorbție al clorofileiAdinAgarophyton chilense. (Clorfilă o moleculă creată cu pimol din PDB:5B66. Spectrul de absorbție al Chl
a realizat de autori, date nepublicate).
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 2.Structura dePorphyridium purpureumficobilizom. Pe roz și roz deschis sunt afișate PE. În mov și violet deschis sunt afișate computerul. În turcoaz și turcoaz deschis sunt afișate
APC. (Imagine de ficobilizom creată cu pymol din PDB: 6xwk). (Pentru interpretarea referințelor la culoare din legenda acestei figuri, cititorul este trimis la versiunea web a acestui
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
articol.)
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 3.Spectrul de absorbție al PBP din rodofite. Spectru PE ref[29]. Spectru PC ref[30]. Ref. spectru APC[31]
au contribuit la explicarea eficienței ridicate a transferului de energie în structuri de proteine arată că PBP-urile sunt compuse din două
acest complex[17–18], aceste studii demonstrează că nu este necesar
doar să se cunoască tipul și numărul de cromofori prezenți în PBS, ci și
organizarea structurală sau arhitectura componentelor sale, deoarece
acestea joacă un rol important. Un alt factor important în transferul de
energie în PBS este geometria și proprietățile spectroscopice ale
cromoforilor, împreună cu mediul proteic.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
subunități, constând din două lanțuri polipeptidice cunoscute
caAșib. Aceste subunități prezintă structuri de bază similare, cu 6-8
zone elicoidale separate prin bucle și un pliu asemănător globulinic.
[33]. Din punct de vedere funcțional, fiecare subunitate poate avea
una până la trei molecule de ficobilină atașate la scheletul
polipeptidei în resturi de cisteină foarte conservate (50, 60, 81 și
150), dar reziduul Cys 81 prezintă întotdeauna o ficobilină legată.
[34].Fig. 4prezintă o aliniere structurală a APC (PDB: 6YX7), PC (PDB:
6XWK), PEC (PDB: 2C7L) și PE
(PDB: 1B8D) și cu elementele lor de structură secundară ale fiecărui
PBP. Din această aliniere, restul de cisteină care este întotdeauna
cromoforilat este evidențiat cu verde. Alături de cele de mai sus,
elicele alfa ale fiecăreia dintre subunitățile diferitelor PBP sunt
afișate ca cilindri roșii. Numărul deA- elice ale fiecărei structuri au
fost obținute din informațiile raportate în PDB de către autorii
structurilor cristalografice respective. Alinierea structurală a fost
realizată cu
serverul PDBeFold și vizualizarea aliniamentului a fost realizată cu
Jalview. Selecția structurilor utilizate în această aliniere a fost făcută
pe baza criteriului celei mai bune rezoluții a structurii cristalografice.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 4.Alinierea structurală aAșibsubunități ale APC, PC, PEC și PE. Reziduul verde arată reziduul de cisteină care este întotdeauna croforilat. (Pentru interpretarea referințelor la culoare
din legenda acestei figuri, cititorul este trimis la versiunea web a acestui articol.)
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
tabelul 1
Informații fizico-chimice, compararea secvenței și asamblarea biologică a PBP-urilor prezente în banca de date de proteine (PDB). CB înseamnă cianobacterii, RA înseamnă alge roșii. În aldine sunt
prezentate structura utilizată pentru analiza secvenței și RMSD.
Ficobiliproteină specie Subunitate Reziduuri Molecular Izoelectric % secvență RMSD Biologic cod PDB
Masa (Da) Punct Identitate/amino (A) asamblare
asemănarea acizilor
Fico eritrina Gloeobacter Violaceus A 164 17658.04 6,73 23,7/52,5 2, 18 (Ab)6 2VJH
(CB) b 177 18427,16 7,52
Phormidium rubidum A 164 17643,87 5,84 25/44,5 2,06 (Ab)6 5NB4,5NB3, 5AQD, 5FVB
A09DM (CB) b 184 19336.16 6,57
Agarophyton chilense A 164 17751,88 5.42 27/48,6 2, 13 (Ab)6 1EYX
(RA) b 177 18604.18 5.15
Griffithsia monilis (RA) A 164 17668,86 5,69 24,5/46,8 2, 13 (Ab)6 1B8D
b 177 18481,94 5.10
Palmaria palmata (RA) A 164 17638,79 5.40 24,6/47,6 2, 14 (Ab)6 5B13
b 177 18408,00 5.42
Polysiphonia urceolata A 164 17836.07 5,70 25/50,5 2, 14 (Ab)6 1LIA,1F99
(RA) b 177 18721,38 5.15
Porfiridiu A 164 17805.05 5.42 27,2/51,1 2, 12 (Ab)3 3 V57, 3 V58
cruentum (RA) b 177 18554.18 5.43
Phyco Erythro Mastigocladus A 162 17563,74 6,82 27,5/44,4 2,00 (Ab)3 2C7L,2C7K, 2C7J
cianina laminosus (CB) b 172 18486,95 6,72
Ficocianina Acaryochloris marina A 162 17375,43 5.28 26,9/52,6 2,01 (Ab)3 5 CARE
(CB) b 172 18022.41 4,94
Cyanidium caldarium A 162 17505,66 5,81 27,6/54 1,91 (Ab)6 1PHN
(CB) b 172 18252,74 4,96
Gloeobacter Violaceus A 162 17662,90 7,74 23,7/53,2 2,03 (Ab)6 2VML,2VJR
(CB) b 172 18459,99 5.46
Leptolyngbya sp (CB) A 162 17585,87 5,83 24,6/45 1,78 (Ab)6 4L1E,2UUN
b 172 18066,54 4,80
Microchete A 162 17228,34 6,56 24,6/52,6 1,66 (Ab)6 1CPC
diplosifon (CB) b 172 17920,38 5.10
Phormidium rubidum A 162 17308,34 4,64 24,7/52,2 1,88 (Ab)6 6XWK,2UUL
A09DM (CB) b 172 18124,49 5.35
Pseudanabaena sp A 162 17222,29 5,79 22,9/51,4 1,82 (Ab)6 5TOU
(CB) b 172 17842,27 5.40
Arthrospira platensis A 162 17601,87 5,83 25,7/45,5 1,82 (Ab)6 1HA7,1GH0, 2UUM
(CB) b 172 18093,57 4,96
Sinechococ A 162 17442,70 5.36 27/52,3 1,77 (Ab)6 3L0F,4ZIZ, 4Q70, 5MJP,
elongatus (CB) b 172 18186,67 5.12 5MJM, 5O7M, 4Z8K, 5MJQ,
5UVK, 4H0M, 1JBO
Sinechocystissp.PCC A 162 17586,60 5.35 26,9/49,7 2,07 (Ab)3 4F0T
6803 (CB) b 172 18126,47 4,98
Sinechococul termic A 162 17456,72 5.36 26,4/52,3 1,74 (Ab)3 3O18,3O2C, 1KTP, 4N6S,
vulcanus (CB) b 172 18186,67 5.12 4GY3, 1I7Y, 1ON7, 4GXE
Agarophyton chilense A 162 17576,64 5.15 25,4/53,7 1,90 (Ab)6 2BV8
(RA) b 172 18162,25 4,65
Galdieria Sulphuraria A 162 17506,65 6,57 27,6/54 1,84 (Ab)6 3KVS
(RA) b 172 18224,69 4,96
Polysiphonia urceolata A 162 17569,78 5,81 27,5/56,7 1,85 (Ab)6 1F99
(RA) b 172 18000,54 4,92
Aloficocianina Arthrospira platensis A 161 17220,67 5.07 37/64,2 1,48 (Ab)3 1 TOATE
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 5.Nivelul structural al PBP-urilor. (a) SubunitateA, (b) subunitateb. (c) heterodimerAb.
Fig. 6.Nivelul structural al PBP-urilor (a) trimer (Ab)3vedere din față. (b) trimer (Ab)3vedere laterală.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fig. 7.Nivelul structural al PBP-urilor. (a) trimeri (Ab)3 față în față, (b) hexamer(Ab)6vedere laterală. (c) hexamer(Ab)6vedere din față.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
aproximativ 10 Å în diametru[13–14,25]. În cadrul unui trimer, distanța amer de la un trimer la altul folosind cromoforiiAsubunități care
dintre cromoforii a doi heterodimeri adiacenți este aproape de 20 Å, formează suprafața de legare.
permițând transferul de energie întreAșib subunități. Această Hexamerii și trimerii PBP-urilor asociază și formează structuri
caracteristică face din trimeri unitatea funcțională minimă a PBP și funcționale PBS, cum ar fi tija și miezul[13,25,44].
unitatea biologică a APC. (Ab)3trimerii au o curbură, unde suprafața
concavă este numită față și suprafața convexă este numită înapoi (Fig. 6
B).În cazul APC, trimerul este ansamblul său biologic funcțional. 2.4.Tije și miez
Structura trimerică a APC este sensibilă la temperatură și denaturanții
chimici, care îi modifică spectrul de absorbție și emisie. Cu toate Tijele PBS sunt structuri în formă de cilindru compuse din mai mulți
acestea, ambele spectre revin la starea nativă după îndepărtarea hexameri de PE sau pentru a forma acești cilindri, hexamerii interacționează
perturbatorului[35–37]. Împreună cu cele de mai sus, spectrul observat spate în spate folosindbsubunități pentru a forma suprafața de interacțiune
în condiții de denaturare corespunde cu cel alAbheterodimer, care nu PC (Fig. 8).
este afectat în condițiile testate[35]. Când se analizează suprafețele de Miezul PBS este format din trei cilindri, fiecare fiind format din trei
contact și interacțiunile care stabilizează structura trimerică a APC, o trimeri APC. Cilindrii care sunt în contact cu membrana au oA
zonă medie de 500 Å2cu 8 legături de hidrogen și 2 punți de sare de subunitatea înlocuită cu ApcD și absubunitatea înlocuită cu ApcF. O
contact între fiecare pereche de heterodimeri pot fi observate[38]. secundaAunitatea este înlocuită cu domeniul globular (domeniul PB) al
nucleului-membrană Linker (ApcE) [18,45]. Domeniile ApcD, ApcF și PB
sunt esențiale pentru transferul de energie către sistemele foto[46–49]
Fig. 8.Tija PBS. In albastruAsubunități. de PC. În violetbsubunități ale PC-ului. În magentaAsubunități ale PE. În fucsiabsubunități ale PE. În molecule verzi de PCB și PEB. Figura realizată cu pymol folosind
P. PurpureumStructura PBS (PDB id: 6KGX).
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
masa 2
Specificitatea substratului familiei bilin-lazelor. PCB = ficocianobilină. PVB = Phycoviolobilin. PEB = Ficoeritrobilină. PUB = Phycourobilin.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
cpcB PC-b Cys-153
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
situat în partea distală a tijelor PBS[17,24–25]. TheAsubunitatea PE este fost recunoscut până în prezent; PC prezent în algele roșii și
codificată de gena cpeA șibsubunitatea de către gena cpeB[14]. Au fost cianobacteriile, a căror expresie este constitutivă și provin din produșii
raportate trei tipuri de PE în cianobacterii sau alge. C-PE este subdivizat genelor cpcA și cpcB, corespunzătoareAșibrespectiv subunități ale
în C-PE-I și C-PE-II, R-PE și B-PE. Ele diferă în funcție de numărul și ficocianinei. Al doilea tip de ficocianine sunt cele prezente numai în
tipul de cromofori pe care i-au atașat. cianobacterii și au caracter inductibil printr-un sistem de adaptare
cromatică. Acestea sunt produsul genelor cpcA2 și cpcB2[72].
Tipul I (C-PE-I) conține 5 molecule PEB legate la reziduuriA-
84,A-140 sau 143,b-84 sau 82,b-50 saub-61, șib-155 sau 159. C-PE-II PC-ul este, de asemenea, clasificat în funcție de proprietățile lor spectroscopice
are 5 molecule PEB situate în aceleași poziții ca și C-PE-I și are o [69]. C-PC, prezent în majoritatea cianobacteriilor, are molecule de PCB
moleculă PUB legată deA-75 cisteină. R-PE are 4 molecule PEB atașate la atașate la reziduurile de cisteină la poziția 84 înAsubunitatea și
reziduuriA-84,A-140,b-84 șib-155 și o moleculă de PUB legată de cisteinele 84 și 155 alebsubunitate. Spectrul său de absorbție arată un
reziduurib-50 șib-61 respectiv. În cazul algelor roșii, B-PE are 5 maxim de absorbție unic la 620 nm și un maxim de emisie la 640 nm
molecule de PEB, 2 înAsubunitatea și 3 înbsubunitate în reziduuriA-84,A- [25,50]. R-PC are atașați diferiți cromofori, în funcție de originea
140,b- 84,b-155 șib-50 /b-61. ficobiliproteinei: R-PC-I este cel mai abundent, prezent în algele roșii și
a fost primul care a fost caracterizat spectroscopic. Această proteină
Spectroscopic, C-PE, B-PE și R-PE diferă prin numărul maxim de are o moleculă de PCB atașată la resturile Cis -84 aleAșibsubunitatea și
absorbție. C-PE prezintă doar un maxim de absorbție la 542 nm, în timp o moleculă de PEB atașată la reziduul Cys-155 albsubunitate. Spectrul
ce spectrele de absorbție R-PE și B-PE arată două maxime de absorbție; de absorbție al acestui tip de PC prezintă două maxime de absorbție,
cea mai mare la 566 nm, urmată de alta la 545 nm, corespunzătoare primul în mai puțin de 555 nm, atribuibil unei molecule de PEB și un al
moleculelor PEB și al treilea maxim de absorbanță mai scăzută la 495 doilea maxim mai mare, asociat cu moleculele PCB, la 619 nm. Această
nm, corespunzătoare moleculelor PUB prezente exclusiv înb proteină are o emisie maximă de 640 nm [25,73].
subunitatea R-PE. Emisia de fluorescență în diferitele tipuri de PE nu
prezintă diferențe mari cu o valoare maximă de emisie la 575 nm[68–
70].Tabelul 3prezintă un rezumat al caracteristicilor spectroscopice R-PC-II a fost primul PC cianobacterian raportat că posedă o
raportate pentru diferite PE. moleculă de PEB. Acest tip de ficocianină are o moleculă de PEB legată
de cisteina 84 înAsubunitatea, în timp cebsubunitatea are o moleculă
de PCB legată de cisteina 84 și o moleculă de PEB de cisteina 155.
4.2.Ficoeritrocianina Spectrul său de absorbție prezintă trei vârfuri la 533, 545 și 615 nm.
Emisia sa de fluorescență este de 646 nm[25,50].
Ficoeritrocianina (PEC) este, până în prezent, singura ficobiliproteină R-PC-III are două molecule de PCB și un PEB, dar spre deosebire de
prezentă exclusiv în cianobacterii. Este o ficobiliproteină de culoare R-PC-I și R-PC-II, moleculele de PCB sunt ambele la resturile 84 și 153
violet-albăstruie, cu o moleculă de PVB la reziduul 84 al alebsubunitatea și molecula de PEB la restul 84 alAsubunitate. Are
Asubunitatea și două molecule de PCB la resturile 84 și 153 aleb două maxime de absorbție, pornit la 560 nm și al doilea de mai puțină
subunitate[68]. Una dintre principalele caracteristici ale intensitate la 603 nm. Maximul de emisie a acestei ficocianine este la
ficoeritrocianinei este că abundența sa este strâns legată de 648 nm[50].
intensitatea și tipul luminii în timpul creșterii sale, crescând semnificativ R-PC-IV diferă de alte tipuri prin faptul că are o moleculă PUB
în condiții de lumină slabă cu lumină verde.[71]. Prezența lor în PBS nu atașată la restul 84 alAsubunitatea și două molecule de PCB la resturile
este exclusivă PE, deși pot absorbi zone similare din spectrul luminii 84 și 155 alebsubunitate. Spectrul său de absorbție prezintă două
vizibile.[68]. Absorbanța maximă a ficoeritrocianinei este la 570 nm cu maxime, unul la 490 nm și celălalt la 592 nm. Maximul de emisie a
un umăr la 590 nm. Emisia sa de fluorescență are maximul la 625 nm acestei proteine este la 644 nm[25].
[68].Tabelul 4prezintă caracteristicile spectroscopice ficoeritocianina. În 2009, Blot și colaboratorii. a descris un al cincilea tip de
ficocianină, R-PC-V. Această proteină este caracterizată prin faptul că
are trei tipuri diferite de cromofori PUB la reziduul 84 alAsubunitate, o
moleculă PCB la restul 82 și o moleculă PEB la restul 153 albsubunitate.
4.3.Ficocianina
Tabelul 3
Proprietăți spectroscopice ale diferitelor ficoeritrine. PEB = Ficoeritrobilină. PUB = Phycourobilin.
Tabelul 4
Proprietăți spectroscopice ale diferitelor ficoeritrocianine. PCB = ficocianobilină. PVB = Phycoviolobilin.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
rezumatul proprietăților spectroscopice ale diferitelor ficocianine. cobilizom la fotosistemul I și respectiv fotosistemul II [48,49,77–78].
Tabelul 6prezintă un rezumat al proprietăților spectroscopice ale
diferitelor tipuri de trimeri aloficocianinei.
4.4.Aloficocianina Pe scurt, informațiile analizate arată că diferitele PBP au o serie de
caracteristici generale, cum ar fi structura și funcția lor. Prezența
Aloficocianina (APC) are o culoare turcoaz strălucitoare și se găsește acestor proteine în contextul PBS a permis diferitelor organisme să se
exclusiv ca parte a miezului PBS. Spectroscopic, este cea mai simplă poată popula și să supraviețuiască în condiții de mediu nefavorabile,
ficobiliproteină, deoarece are doar o moleculă de PCB la reziduul 81 alA oferind un avantaj speciilor care le posedă. Cu toate acestea, PBP-urile
șibsubunitate. Unitatea biologică a aloficocianinei este trimerică. APC au arătat mai multe activități decât captarea energiei. De exemplu, în
diferă de alte PBP deoarece are 2 gene de codificare pentruA cazurile de privare de azot, PBP-urile sunt folosite ca sursă de azot,
subunitatea, numită apcA și apcD, ale cărei produse genice sunt permițând sinteza altor proteine.[79]. Trunchierea PBS în Sinechocystis
cunoscute caAsubunitatea șiABrespectiv subunitate. Are, de asemenea, sp.PCC 6803prezintă alterare în utilizarea și reglarea fierului și
2 gene de codificare pentrubsubunitatea, numită apcB și apcF, bicarbonatului, are implicații și în profilul proteomic și funcțiile asociate
responsabilă pentrubșib[18]respectiv subunități. Atât ApcD, cât și ApcF membranei celulare[80–81]. ceea ce sugerează că PBS și PBP au mai
au o abundență mai mică și îl înlocuiesc peAșibsubunități în diferiți multe funcții decât să fie doar un complex ușor de recoltare
trimeri care formează miezul ficobilizomului.
S-a demonstrat din secvențierea completă a genomului
cloroplastidian alGracilaria avetistipiatatavar liui[74], Agarophyton Următoarea secțiune analizează multiple aplicații industriale ale PBP
chilense[75], șiGloeobacter violaceus[76], că genele aloficocianinei sunt asociate cu procesele sale biotehnologice.
codificate în clusterul apcEABC, cu toate acestea, genele apcD și apcF
sunt situate izolate în diferite zone ale genomului cloroplastidului[74].
5. Perspectivele biotehnologice ale PBP
Trimeri compuse numai deAșibpentru om (Ab)3complex, care sunt
cei mai comuni trimeri și au o absorbție maximă de 650 nm și o emisie PBP-urile au proprietăți biologice importante pentru oameni și
de fluorescență maximă de 660 nm. S-a raportat un trimer aloficocianin animale care motivează dezvoltarea de noi produse și procese
(Ab)3care include, de asemenea, o proteină linker cunoscută ca linker biotehnologice[82–83]. Recent, mai multe studii au raportat
core (Lc) de 8,9 kDa, prezența acestei proteine produce o modificare bioactivitățile PBP, care pot fi rezumate în microorganisme
spectroscopică în 2 nm în maximul de absorbție și 2 nm în maximul antioxidante, anti-inflamatorii, anti-metabolice, anti-cancer, anti-
emisiei[25]. neurodegenerative și anti-patogene. Detaliile diferitelor activități
biologice ale PBP-urilor sunt revizuite pe larg în lucrările anterioare[84–
Înlocuirea unuiAsubunitatea de cătreAsubunitatea B într-un trimer ( 88]. În această secțiune vom vedea pe scurt activitățile biologice ale
ABA2b3) prezintă proprietăți spectroscopice care diferă de trimer (Ab)3, PBP-urilor prezente în publicațiile din ultimii doi ani (Tabelul 8).
cu o schimbare a maximelor de absorbție la 654 nm și a maximelor de
emisie la 679 nm[22,25].
Trimerele care aub[18]subunitatea diferă de altele deoarece, pe 5.1.Activități biologice
lângă înlocuirea unuibsubunitate, are loc o schimbare a unui
Asubunitate pentru domeniul PB la linkerul miez-membrană (Lcm)
5.1.1. Activitate antioxidantă
[22]formând o (A2 Lcmb2b18) trimer. Theb[18]subunitatea se distinge și
Stresul oxidativ celular poate fi prevenit prin PBP, în special prin PC (
de altele prin dimensiunea sa, deoarece este formată din 169 de
Tabelul 8). PC poate inhiba activitatea oxidativă a diverșilor radicali,
reziduuri, spre deosebire de celelalte trei subunități de aloficocianină cum ar fi peroxil, hidroxil și superoxid, inhibând peroxidarea lipidelor
care sunt formate din 161 de reziduuri. Acest tip de trimer are un
[89–90]. Împreună cu cele de mai sus, PC poate inhiba acțiunea
maxim de absorbție la 654 nm și un maxim de emisie la 670 nm[25].
radicalilor peroxinitrit, reducând astfel deteriorarea ADN-ului[91].
Absența luiABșib[18]subunitățile din cianobacterii a demonstrat că
Recent, activitatea antioxidantă a C-PC a fost raportată în diferite
scad eficiența transferului de energie din domenii de aplicare, în ceea ce privește reducerea oxidativului hepatic acut.
Tabelul 5
Proprietăți spectroscopice ale diferitelor ficocianine. PCB = ficocianobilină. PEB = Ficoeritrobilină. PUB = Phycourobilin.
Tabelul 6
Proprietăți spectroscopice ale diferitelor aloficocianine. PCB = ficocianobilină.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Tabelul 8
Efectul biologic al PBP și aplicarea sa propusă. Studii raportate între 2019 și 2021.
PBP
Activitate biologică Sursa de PBP / Efect biologic Cererea propusă Referinţă
Spirulinasp. / Suplimentarea alimentară reduce stresul oxidativ din ficat și Diminuarea riscului de patologii legate de [115]
rinichi indus de o dietă îmbogățită cu peroxizi lipidici la șobolanii din tulpina stresul oxidativ din cauza consumului mare de
Wistar. ulei oxidant.
Spirulinasp. / Livrare prelungită de PC, încapsulat în poli(etilen glicol)-b- Atenuarea leziunii insulelor pancreatice induse [116]
(poli(acid l-glutamic)-g-polietilenimină nano-purtător, prin injecție de ischemie hepatică/reperfuzie.
subcutanată abdominală la șobolani.
Phormidium versicolor /Previne creșterea indusă de cadmiu a nivelurilor de Acțiune de prevenire a hepatotoxicității cauzate de [117]
ALAT, ASAT și bilirubină la șobolani. Creșterea nivelului de enzime cadmiu.
antioxidante.
Antiinflamator Spirulinasp. / Inhibă denaturarea albuminei, anti-proteinaza, hemoliza Dezvoltare potențială de medicamente. [95]
indusă de hipotonicitate și activitățile anti-lipoxigenază. Spirulina
platensis /Reduceți frecvența micțiunii și inflamația vezicii urinare la Contramăsuri pentru chimioterapia anticanceroasă [118]
șoarecii cu cistită indusă de ciclofosfamidă prin inhibarea receptorului a cistitei induse de ciclofosfamidă
COX-2 și a prostaglandinei E 4.
Spirulina platensis /Inhibă expresia COX-2 în timpul terapiei cu radiații a Reducerea contramăsurilor prin tratamentul C-PC în [94]
liniilor celulare de cancer de colon și în celulele colonice normale. Spirulina timpul radioterapiei pentru cancerul de colon.
platensis /Atenuează fibroza pulmonară prin inhibarea producției de Tratamentul fibrozei pulmonare idiopatice [119]
interleukină-1 beta, factor de necroză tumorală-Ași lipopolizaharidă.
Crește diversitatea bacteriană intestinală, bogăția și reduce bacteriile
proinflamatorii.
PC Anti-metabolic Arthrospira platensis /Peptidele triptice APC și C-PC inhibă activitatea enzimei Nutraceutice sau alimente funcționale [98]
boli DPP-IVin vitro,prin urmare, acționând ca peptide hipoglicemiante. Spirulina pentru gestionarea diabetului de tip 2.
platensis /Reduce acumularea de lipide în celulele L02 de steatoză și în ficatul Nutraceutice și terapeutice ale bolii hepatice grase [45]
șoarecilor NASH. Îmbunătățește capacitatea antioxidantă a ficatului prin nealcoolice.
activarea căii AMPK a hepatocitelor.
Spirulina platensis /InhibaA-amilaza sib-activitatea enzimelor Dezvoltarea potențială de medicamente pentru tratamentul [95]
glucozidazei. diabetului de tip 2.
Anti-cancer Limnothrixsp. / Reglează atât genele anti- și pro-apoptotice prin creșterea Tratamentul celulelor canceroase de prostată [102]
nivelurilor de Bax, Apaf-1 și activează caspaza-8, caspaza-9 și caspaza-3. (LNCaP) cu reducerea agenților chimioterapeutici
Scăderea expresiei Bcl-2, Mcl-1 și survivin. În combinație cu Topotecan, convenționali, cum ar fi Topotecan.
crește expresia receptorului morții FAS și a scindat PARP.
Spirulina platensis /Efect anti-proliferativ împotriva liniilor celulare HepG-2. Dezvoltarea potențială de medicamente pentru tratamentul [95]
Limnothrixsp. KNUA002 / Utilizarea PC-ului înainte de chimioterapia cancerului. Protecția PC a celulelor împotriva citotoxicității [120]
anticancer cu cisplatină inhibă apoptoza și funcția mitocondrială protejată induse de cisplatină ca terapie anti-cancer
prin prevenirea acumulării de ROS în institutul urechii House-Organ of Corti contramăsura
1cells tratat cu cisplatină. Menține nivelurile de Bax și Bcl-2 aproape de
controlul netratat.
Spirulinasp. / Ameliorează leziunile intestinale induse de radiații și reglează Contramăsuri pentru sindromul [121]
efectul asupra microbiotei intestinale de către TLR4/Myd88/NF-jcalea B gastrointestinal indus de radiații
Spirulina platensis /Amestecul clorofilină-PC plus iradierea cu laser cu diodă a Terapia fotodinamică antimicrobiană pentru [112]
redus biofilmul cariogen ex-vivo alStreptococcus mutansprin creșterea tratamentul cariilor ca abordare auxiliară
generației sale de ROS.
PC Anti-cancer Spirulinasp. / Induce apoptoza, a suprimat creșterea celulelor NSCLC prin Tratamentul cancerului pulmonar fără celule mici. [104]
reglarea în jos a TIRAP/NF-jActivitatea B
Spirulina platensis /Funcția anti-proliferativă și anti-migratorie prin reducerea Tratamentul cancerului pulmonar fără celule mici. [105]
RIPK1/NF-jActivitatea B în celulele NSCLC.
Spirulina platensis /Anti-proliferarea carcinomului esofagian cu celule Tratamentul carcinomului spinocelular esofagian [122]
scuamoase prin oprirea ciclului celular, apoptoza de inducție și capacitatea de
invazie de suprimare. Creșterea proteinei Bax, PARP și clivată-caspază-3, dar
a redus expresia ciclinei D1, CDK4, Bcl-2, MMP-2 și MMP-9. Spirulinasp. /
Nanoparticulele C-PC/CMC-CD59sp reglează în sus expresia p21 și apoi Nou sistem de administrare a medicamentelor cu efecte [123]
reglează în jos expresiile Ciclinei D1 și CDK4 la șoarecii nuzi BALB/c. Reglează antitumorale care conține C-PC ca moleculă bioactivă principală.
în sus expresia scindării caspazei-3, reglează în jos expresia bcl-2 și inhibă
expresia proteinei MMP-2.
Spirulina platensisLEB 52 / În fenotipul de rezistență la medicamente multiple Tratamentul fenotipului de rezistență la medicamente [124]
al celulelor eritroleucemice, C-PC modulează expresia COX2 și ABCB1 pentru multiple (MDR) al celulelor eritroleucemice.
celulele K562-Lucena într-o manieră dependentă de ROS și expresia ALOX5
pentru celulele FEPS într-o manieră independentă de ROS. Galdieria
sulphuraria /Extractul apos care conține C-PC are activitate antioxidantă și Candidat anticancer pentru tratamente terapeutice [125]
exercită activitate citotoxică în celulele adenocarcinomului uman A549.
anti-neuro- Spirulina platensis /PCB reduce leziunile cerebrale în celulele neuronale PC12 după PCB ca alternativă farmacologică terapeutică pentru [126]
degenerative ischemia cerebrală focală indusă de endotelină-1 la șobolanii Wistar. PCB a restabilit pacienții cu AVC ischemic.
nivelul de expresie a proteinei de bază a mielinei și a enzimei CNPază la șobolanii
ischemici.
Spirulinasp. / Previne activitatea de creștere indusă de streptozotocină a Agent terapeutic în gestionarea bolii Alzheimer [110]
colinesterazelor hipocampale, BAX și a nivelurilor de BCL-2 și ChAT.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
(continuare pe pagina următoare)
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Tabelul 8 (a continuat)
PBP Activitate biologică Sursa de PBP / Efect biologic Cererea propusă Referinţă
Antiinflamator Pyropia pseudolinearis /Peptidele produse din proteinele solubile în apă Prevenirea bolilor cardiovasculare și a [130]
(bogate în PE, PC, APC și Rubisco) au avut efect inhibitor asupra enzimei de hipertensiunii arteriale.
conversie a angiotensinei I
PE Antioxidant Pyropia yezoensis /PE a avutin vitroactivitate antioxidantă și citotoxicitate împotriva Prevenirea celulelor carcinomului hepatocelular. [131]
celulelor HepG2 (celule de carcinom hepatocelular)
Phormidium persicinum /C-PE reduce expresia nefrinei și podocinei într-un Prevenirea HgCl2-leziune renală acută indusă. [132]
model de șoarece de HgCl2-leziune renală acută indusă. Activare redusă a
IRE1Acalea și evită moartea celulară mediată de caspază. Colaconemasp. /
Antiinflamator Îmbunătățește activitatea profenoloxidazei și fagocitozei, dar inhibă ROS în Potențial imunomodulator în cultura de creveți pentru a [133]
hemocite de la creveții cu picioare albe.In vivo,PE induce genele imune și preveniVibrio parahaemolyticussau virusul sindromului
sporește parametrii imuni înnăscuți. Porphyridium purpureum /Peptida din punctului alb
Anti-metabolic PE reduce formarea celulelor spumoase, acumularea intracelulară de lipide și Prevenirea formării celulelor de spumă aterogenă. [134]
boli secreția de TNF-A
și IL-6 în linia celulară RAW 264.7 prin țintirea receptorilor de captare CD36,
SRA1 și Map Kinaza p38.
Anti-cancer Inhibă creșterea și induce apoptoza celulelor SKOV-3. Calea de semnalizare PE ca tratament potențial pentru cancerul ovarian [135]
ROS/JNK/Bcl-2, reglarea în sus a JNK, GADD45A, RAD23 și reglarea în jos a uman.
XBP1 și OS9 sunt critice în apoptoza indusă de PE în această celulă.
R-PE a modulat sistemul imunitar înnăscut și adaptiv prin TLR4/NF- Imuno-modulator în timpul terapiei de lungă durată [96]
jActivarea și diferențierea celulelor T CD4+ mediate de B într-un model cu glucocorticoizi în doze mari pentru boli autoimune
imunosupresor cu hidrocortizon. și cancer
PE anti- Porphyra haitanensis /C-PE inhibă proteina precursor a BACE1, prin urmare, Medicament terapeutic pentru complementar [111]
neurodegenerative reduce acumularea de amiloid-bproteine precursoare. PE recombinant / R- tratamentul bolii Alzheimer
anti- PE mărește abundența bacteriilor benefice în flora intestinală și reduce Modularea microbiotei intestinale pentru prevenirea [136]
microorganism bacteriile dăunătoare de la șoarecii purtători de H22. bolilor de rezistență și nutriție la animale.
daune cauzate de raze X (in vivostudiu)[92]sau pentru prevenirea Recent, PC-ul este un potențial candidat pentru anti-
stresului oxidativ în afectarea acută a rinichilor cauzată de HgCl2[93].
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
diabetici (tip 2) agenţi terapeutici naturali datorităin
vitroinhibarea metabolismului glucidic (A-amiloza si A-
glucozidază) și enzime dipeptidil peptidază IV (PC și peptidele sale
triptice)[95,97–98].
Activitatea anti-obezitate a fost identificată pentru PC prin inhibarea
activității lipazei pancreatice[99]. În plus, C-PC reduce acumularea
de lipide în celulele steatozei L02 și ficatul șoarecilor cu
steatohepatită nealcoolică (NASH) și îmbunătățește capacitatea
antioxidantă a ficatului [45].
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Optimizarea adecvată a condițiilor de creștere este esențială pentru Sunt disponibile abordări tehnologice pentru extracția industrială a
dezvoltarea industriei PBP și procesarea ulterioară a acesteia. Deoarece PBP din surse de alge. Cu toate acestea, selecția metodologiei depinde
producția și creșterea metaboliților în cianobacterii depind nu numai de de factori precum compoziția organismului, stabilitatea și rezistența
factori biotici, ci și de factori abiotici (lumina, temperatura, concentrația peretelui celular[139]. Pe lângă randamentul biosintezei PBP, ar trebui
de nutrienți, pH-ul, salinitatea și compoziția chimică a mediului pot luată în considerare și recuperarea PBP din biomasă. Sunt necesare
modifica metabolismul organismului) grade diferite de puritate, în funcție de aplicarea prevăzută a PBP.
Puritatea PBP-urilor este de obicei exprimată prin raportul Amax/A280[86],
[84]. Cultura condiționează creșterea producției de biomasă a
diferitelor microalge, cum ar fiSpirulina platensis,este unul dintre Pentru alimente și produse cosmetice, valorile de puritate raportate
instrumentele care sunt utilizate experimental și industrial pentru sunt cuprinse între 0,56 și 4,4.
acumularea de PBP. Printre factorii care au fost utilizați în aceste studii Procesele de extracție pot fi utilizate pentru a obține pigmenții
se numără obținerea de biomasă bogată în PBP în condiții foto, hetero eliberați din biomasa ruptă (extracție cu solvent organic, extracție cu
și mixotrofe.[140]. Optimizarea fotobioreactoarelor, compoziția medie solvent sub presiune, extracție lichid ionic și extracție cu dioxid de
și mediile de cultură sunt variabilele majore pe care cercetătorii le carbon supercritic[139]
folosesc pentru acumularea rapidă a biomasei și producția ridicată. Sunt disponibile mai multe tehnologii pentru ruperea pereților celulelor
[140–141]. microalgelor pentru a elibera pigmenții intracelulari, tratamente mecanice
(omogenizare la presiune înaltă (HPH), măcinare de mărgele, ultrasunete,
Cealaltă sursă principală de obținere a PBP, în afară de
cianobacteriile, sunt algele roșii. Acestea pot fi micro sau macro alge. câmp electric cu impulsuri, proces de congelare-dezghețare, șoc osmotic și
cuptor cu microunde), tratamente enzimatice și chimice. tratamente (de
De ani de zile s-au făcut diverse eforturi pentru a le cultiva și promova
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
exemplu, tampon fosfat), Cu toate acestea, este specific speciei și
celulei
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
structura peretelui[154]. Comparând diferitele tratamente, se pot găsi tumorale sau a altor boli la om. In acest
avantaje și dezavantaje clare pentru producție. Metodele mecanice nu
sunt selective și consumă cantități considerabile de energie, cu toate
acestea, sunt non-toxice, rapide și potrivite pentru producția la scară
largă. În schimb, tratamentele chimice și enzimatice sunt descrise ca
fiind mai puțin potrivite pentru extindere datorită costului lor ridicat,
stabilității scăzute, consumului de timp și toxicității.[141].
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
context, abordări similare au fost raportate recent. Un mediilor terestre sau acvatice, timpi lungi de recoltare și un consum
nanomedicament care conține C-PC încapsulat în carboximetil- considerabil de energie. Ca rezultat, o alternativă promițătoare și
chitosan etichetat cu CD59sp a fost dezvoltat pentru a trata viabilă din punct de vedere economic este obținerea acestor coloranți
cancerul de col uterin în in vivofemele de șoareci BALB/c nuzi și de la microbi. Există mai multe exemple de succes ale acestei strategii.
celule HeLa[123.165– 166]. Peng și colaboratorii și Yan Wen și
colaboratorii au încapsulat ficocianina într-o fibră electrofilată,
pentru a preveni cancerul de colon. Mai mult, adăugarea PC-ului la
medicamente anti-cancer bine stabilite ar putea îmbunătăți în mod
semnificativ terapia cancerului[100.102].
6. Perspective de viitor
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Extracţie
Metode de extracție și purificare [176] 7. Finanțări
Nostoc sphaeroides Kutzing
ficobiliproteină și ficoeritrina purificată Autorii ar dori să recunoască sprijinul Agencia Nacional de
Investigación y Desarrollo (ANID). Această lucrare a fost finanțată prin
Metoda de extracție și purificarepentru [177]
sphaeroizii Nostoc Kutzingficobiliproteină și
grantul FONDECYT Postdoctorado 3180614, Fondo de Fomento al
ficoeritrina purificată Desarrollo Científico y Tecnológico (FONDEF) cu numărul de grant
Metoda de extracție a ficobiliproteinei [172] ID19I-10295 și FONDEQUIP EQM180201. Opiniile exprimate și
Nostoc sphaeroides Kutzing Phycobiliprotein concluziile la care s-a ajuns sunt ale autorilor și nu sunt neapărat
atrage cu mulți fallers unitatea de reacție a [179]
atribuite agențiilor de finanțare.
descărcarii corona
Purificare Tehnologie pentru separarea și purificarea [180]
ficobiliproteinei deGracilaria tenuistipitata
soluție de natron de procesare profundă Declarație de contribuție a autorului CRedit
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Referințe
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
[32] Glazer AN. N. Ghiduri de lumină. Transfer direct de energie într-o antenă
fotosintetică. J Biol Chem 1989;264:1–4.
[33] Apt KE, Collier JL, Grossman AR. Evoluția ficobiliproteinelor. J Mol Biol
1995;248(1):79–96.
[34] Scheer H. MicroReview Maturarea biliproteinei: atașamentul cromofor. Mol
Microbiol 2008;68:263–76.
[35] MacColl R, Eisele LE, Menikh A. Allophycocyanin: Trimeri, monomeri, subunities, and
homodimers. Biopolymers 2003;72(5):352–65.
[36] MacColl, R. Stabilitatea structurii cuaternare a aloficocianinei. 223, 24–32 (1983).
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
[52] Blot N și colab. Ficocianina tricromatică ficourobilinică din cianobacteriile
oceanice este formată post-translațional de o ficoeritrobilin liazizomerază.
J Biol Chem 2009;284:9290–8.
[53] Zhao KH și colab. Activitate nouă a unei ficobiliprotein liaze: Atât atașarea
ficocianobilinei, cât și izomerizarea la ficoviolobilină sunt catalizate de
proteinele PecE și PecF codificate de operonul de ficoeritrocianină. FEBS Lett
2000;469:9–13.
[60] Kronfel CM și colab. CpeF este bilin-liaza care leagă ficoeritrobilina dublu legată de
-ficoeritrina din cianobacteria Fremyella diplosiphon. J Biol Chem
2019;294:3987– 99.
[61] Carrigee LA şi colab. MpeV este o liază izomerază care leagă o ficourobilină
dublu legată de peb-subunitatea ficoeritrinei I și II în Synechococcus marin.
J Biol Chem 2021;296:100031.
[62] Saunée NA, Williams SR, Bryant DA, Schluchter WM. Biogeneza
ficobiliproteinelor: II. CpcS-I și CpcU cuprind bilin-liaza heterodimerică care
leagă ficocianobilina la
CYS-82 OF beta-ficocianină și CYS-81 din subunitățile aloficocianinei din
Synechococcus sp. PCC 7002. J Biol Chem 2008;283:7513–22.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
[74] Hagopian JC, Reis M, Kitajima JP, Bhattacharya D, de Oliveira MC. Analiza
comparativă a secvenței complete a genomului plastidului algei roșii Gracilaria [101]
tenuistipitata var. liui oferă perspective asupra evoluției rodoplastelor și a relației
lor cu alte plastide. J Mol Evol 2004;59:464–77.
[75] Lee J și colab. Reconstituirea istoriei evolutive complexe a plasmidelor mobile din
genomul algelor roșii. Sci Rep 2016;6:23744.
[76] Nakamura Y. Structura completă a genomului Gloeobacter violaceus PCC 7421, o
cianobacterie care nu are tilacoizi (supliment). DNA Res 2003;10 (4):181–201.
[77] Jallet D, Gwizdala M, Kirilovsky D. ApcD, ApcF și ApcE nu sunt necesare pentru
stingerea fluorescenței ficobilizomelor legate de proteina carotenoid portocaliu în
cianobacteria Synechocystis PCC 6803. Biochim Biophys Acta - Bioenerg 2012;181–
187:.
[78] Zhao KH și colab. Atașarea cromoforului în ficocianina. Aminoacizi funcționali ai
ficocianobilin-alfa-ficocianin liazei și dovezi pentru legarea cromoforului. FEBS
J 2006;273:1262–74.
[79] Hsieh-Lo M, Castillo G, Ochoa-Becerra MA, Mojica L. Phycocyanin and phycoerythrin:
Strategies to improve production andield and chemical stability. Algal Res
2019;42:101600.
[80] Liberton M, Chrisler WB, Nicora CD, Moore RJ, Smith RD, Koppenaal DW și colab.
Trunchierea ficobilizomului cauzează modificări proteomului pe scară largă în
Synechocystis sp. PCC 6803. PLoS ONE 2017;12(3):e0173251.
[81] Collins AM și colab. Localizarea pigmentului fotosintetic și morfologia membranei
tilacoide sunt modificate în mutanții ficobilizomului synechocystis 6803. Plant
Physiol 2012;158:1600–9.
[82] Venkatraman KL, Mehta A. Beneficiile pentru sănătate și efectele farmacologice ale speciilor
Porphyra. Alimente vegetale Hum Nutr 2019;74(1):10–7.
[83] MU., N., Mehar JG, Mudliar SN, Shekh AY. Progrese recente în microalgele bioactive
pentru alimente, furaje și produse de îngrijire a sănătății: potențial comercial,
spațiu de piață și durabilitate.Compr. Rev. Food Sci. Alimente sigure.18, 1882–
1897 (2019).
[84] Pagels F, Guedes AC, Amaro HM, Kijjoa A, Vasconcelos V. Phycobiliproteins from
cyanobacteria: Chemistry and biotechnological applications. Biotechnol Adv
2019;37:422–43.
[85] Piniella-Matamoros B, Marín-Prida J, Pentón-Rol G. Potențialul nutraceutic și
terapeutic al Phycocyanobilin pentru tratarea bolii Alzheimer. J Biosci 2021;46(2).
https://doi.org/10.1007/s12038-021-00161-7.
[86] Li W și colab. Ficobiliproteine: Structura moleculară, producție, aplicații și
perspective. Biotechnol Adv 2019;37:340–53.
[87] Bannu SM, Lomada D, Gulla S, Chandrasekhar T, Reddanna P, Reddy MC. Aplicații
terapeutice potențiale ale C-Ficocianinei. Curr Drug Metab 2020;20(12):967–76.
[88] de Andrade AF, Porto ALF, Bezerra RP. Microorganismele fotosintetice și moleculele
lor bioactive ca produs nou pentru vindecarea rănilor. Appl Microbiol Biotechnol
2022;106:497–504.
[89] Romay C și colab. Proprietăți antioxidante și antiinflamatorii ale Cficocianinei din
algele albastre-verzi. Inflamm Res 1998;47:36–41.
[90] Romay C, Gonzalez R, Ledon N, Remirez D, Rimbau V. C-Phycocyanin: A
Biliprotein with Antioxidant, Anti-Inflammatory and Neuroprotective Effects.
Curr Protein Pept Sci 2003;4:207–16.
[91] Bhat VB, Madyastha KM. Eliminarea peroxinitritului de către ficocianina și
ficocianobilina din Spirulina platensis: Protecție împotriva daunelor oxidative ale
ADN-ului. Biochem Biophys Res Commun 2001;285:262–6.
[92] Liu Q, Li W, Qin S. Efectul terapeutic al ficocianinei asupra leziunilor oxidative acute
ale ficatului cauzate de raze X. Biomed Pharmacother 2020;130:110553.
[93] Garcia-Pliego E și colab. Ficocianobilina este molecula responsabilă de acțiunea
nefroprotectoare a ficocianinei în leziunile renale acute cauzate de mercur. Food
Funct 2021;12:2985–94.
[94] Kefayat A, Ghahremani F, Safavi A, Hajiaghababa A, Moshtaghian J. Cphycocyanin:
un produs natural cu proprietăți de radiosensibilizare pentru îmbunătățirea
eficacității terapiei cu radiații pentru cancerul de colon prin inhibarea expresiei
COX-2. Sci Rep 2019;9:1–13.
[95] Prabakaran G, Sampathkumar P, Kavisri M, Moovendhan M. Extracția și
caracterizarea ficocianinei din Spirulina platensis și evaluarea efectului său
anticancer, antidiabetic și antiinflamator. Int J Biol Macromol 2020;153:256–63.
B978-0-444-63784-0.00009-6.
[100] Braune S, Krüger-Genge A, Kammerer S, Jung F, Küpper JH. Ficocianina din
arthrospira platensis ca potențial medicament împotriva cancerului: revizuirea
studiilor in vitro și in vivo. Viața 2021;11:1–14.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
Fernandes e Silva E, Figueira FdS, Lettnin AP, Carrett-Dias M, Filgueira DDMVB, Kalil S, et al. C- ischemia cerebrală focală indusă de endotelină-1. Clin Exp Pharmacol Physiol
Ficocianina: ținte celulare, mecanisme de acțiune și rezistență la mai multe medicamente în cancer. 2020;47:383– 92.
[107]Chiti F, Dobson CM. Plierea greșită a proteinelor, amiloid funcțional și boala umană.
Annu Rev Biochem 2006;75(1):333–66.
[108] Barbalace MC, Malaguti M, Giusti L, Lucacchini A, Hrelia S, Angeloni C.
Anti- Inflammatory Activities of Marine Algae in Neurodegenerative
Diseases. Int J Mol Sci
2019;20(12):3061.https://doi.org/10.3390/ijms20123061.
[109] Liu Y, Jovcevski B, Pukala TL. C-Ficocianina din Spirulina InhibăA- sinucleina si
amiloid-bFormarea fibrilei, dar nu și agregarea amorfa. J Nat Prod 2019;82:66–73.
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
[143] Souza JMC, Castro JZ, Critchley AT, Yokoya NS. Răspunsuri fiziologice ale algelor [172] Wen R, Sui Z, Zhang X, Zhang S, Qin S. Exprimarea genei ficoeritrinei Gracilaria
roșii Gracilaria caudata (Gracilariales) și Laurencia catarinensis (Ceramiales) în lemaneiformis (Rhodophyta) în E. coli și evaluarea bioactivității PE recombinant. J
urma tratamentului cu un extract comercial din alga brună Ascophyllum nodosum Ocean Univ Chin 2007;6(4):373–7.
(AMPEP). J Appl Phycol 2019;31:1883–8. [173]Qing, Q. . Compoziție care conține extract de polizaharidă ficobiliproteină și
[144] Godínez-Ortega JL, Snoeijs P, Robledo D, Freile-Pelegrín Y, Pedersén M. Creșterea și utilizarea compoziției care conține extract de polizaharidă ficobiliproteină. Patent
compoziția pigmentului în alga roșie Halymenia floresii cultivată sub diferite acordat N-CN 108472323 B, China (2019).
calități de lumină. J Appl Phycol 2008;20:253–60. [174]Zhao, H., Pu, Y., Wei, M., Li, W. & Qin, S. Material nou bazat pe coajă naturală de
[145] Lee MC şi colab. Îmbunătățirea creșterii, producția de ficoeritrină și compoziția diatomee și ficobiliproteină și aplicare. Patent acordat N-CN 110292635 B, China
pigmentului în alga roșie Colaconema sp. Prin condiții optime de mediu într-un (2021).
sistem interior. Bioresour Technol 2021;333:125199. [175]Ouada, H. Ben & Ammar, J. Metode pentru inducerea sintezei ficobiliproteinelor.
[146] Xu Y și colab. Modelul de cultivare indus a îmbunătățit producția de ficoeritrină în (2017).
alga roșie Porphyridium purpureum. Bioprocess Biosyst Eng 2020;43:347–55. [176]Jia, Y.et al.Metode de extracție și purificare a ficobiliproteinei Nostoc Sphaeroides
kutzing și a ficoeritrinei purificate. Patent acordat N-CN 107200774 B, China
[147] Sosa-Hernández JE și colab. Intensitatea luminii și concentrația de azot influențează (2020).
producția de biomasă și ficoeritrină de către porphyridium purpureum.
Mar Drugs 2019;17:1–12. [177]Jia, Y.et al.Metodă de extracție și purificare pentru sphaeroizii Nostoc cu
[148] Bryant DA și colab. Clonarea moleculară și secvența de nucleotide a Așib subunități ficobiliproteină și ficoeritrina purificată. Patent acordat N-CN 107200774 B,
ale aloficocianinei din genomul cianele de Cyanophora paradoxa. Proc Natl Acad China (2020).
Sci USA 1985;82:3242–6. [178]Hongying L.et al.Metoda de extracție a ficobiliproteinei din Nostoc sphaeroides
[149] Liu S și colab. Biosinteza trimerului aloficocianin cianobacterian fluorescent în kutzing. Cererea de brevet N-CN 106432480 A, China (2017).
Escherichia coli. Photosynth Res 2010;105:135–42. [179]Li Z, Yiliang P, Wenjun S. Phycobiliprotein desenează cu mulți fallers unitatea de
[150] Zhao KH și colab. Reconstituirea linkerului nucleo-membrană ficobilizom, LCM, prin reacție a descărcarii corona. Brevet limitat N-CN 206219594 U, China (2017).
legarea cromoforului autocatalitic la ApcE. BBA 2005;1706:81–7. [180]Heshan X, Zhenxiang C. Tehnologie pentru separarea și purificarea ficobiliproteinei
[151] Gambetta GA, Lagarias JC. Ingineria genetică a biosintezei fitocromului în bacterii. din soluția de natron de procesare profundă a gracilaria tenuistipitata. Cererea de
Proc Natl Acad Sci USA 2001;98(19):10566–71. brevet N-CN 106220728 A, China (2016).
[152]Huaxin C, Peng J. Proteină fluorescentă recombinantă de ficobiliproteină cu [181]Yu, J.et al.Metodă de extracție și purificare a ficobiliproteinei și a ficocianinei
schimbare mare de stokes și metoda de preparare a acesteia. Brevet N- purificate. Patent acordat N-CN 107011433 B, China (2020).
CN108841846 B, China (2018). [182]Baosheng G, Xiangfa W, Fang H, Haixia CH. Kit pentru depistarea precoce a cancerului
hepatic și metoda de preparare a acestuia. Cerere de brevet N-CN 109085362
A, China (2018).
1
J. Dagnino-Leone, Cristina Pinto Figueroa, Mónica Latorre Castañeda et al. Jurnalul de biotehnologie computațională și structurală 20 (2022) 1506–1527
[183] Xudong J, Wenjun L. Song QI. Bandă de reactiv de detectare care utilizează subunitatea de
ficobiliproteină fluorescentă recombinată și metoda de preparare a acesteia. Cerere de cortexul prefrontal medial al șobolanilor și taurina îl pot proteja. Acta Histochem
brevet N-CN 107064490 A, China (2017). 2018;120:586–94.
[184]Tianfeng C, Wenjie Z, Yanyu H. Purtător de medicament antitumoral și metoda de [190] Altunay N. O abordare de optimizare pentru determinarea rapidă, simplă și precisă
aplicare a acestuia. Patent acordat N-CN 104667289 B, China (2018). a indigo-carminului în probele alimentare. Spectrochim Acta Partea A
[185]Wenjun L.et al.Metoda de preparare a hidrogelului cu rețea dublă încărcat cu Mol Biomol Spectrosc 2021;257:119791.
ficobiliproteină. Patent acordat N-CN 109535448 B, China (2021). [191] Coros M și colab. Oxid de grafen redus termic ca adsorbant verde și ușor disponibil
pentru decontaminarea Sunset Yellow. Environ Res 2020;182:109047.
[186]Ruiz Canovas E.et al.Compoziții pentru protecția pielii care includ enzime de
reparare a ADN și ficobiliproteină. Patent acordat N-US 11071707 B2, Spania
(2021). [192] Guerrero-Rubio MA, López-Llorca R, Henarejos-Escudero P, García-Carmona F,
Gandía-Herrero F. Scaled-up biotechnological production of individual betalains in
[187]Yang J, Zheng Y. Proteza de valvă cardiacă, metoda de pregătire și metoda de
sterilizare in vivo a protezei valvei cardiace. Patent acordat N-CN 109999219 a microbial system. Microb Biotechnol 2019;12:993–1002.
B, China (2021). [193]Wehrs M și colab. Eficiența producției indigoidinei peptidei non-rizozomale
bacteriene se bazează pe starea metabolică respiratorie la S. cerevisiae. Microb.
[188]Coxam R, Davicco MJ, Leotoing L, Wauquier F. Phycocyanin Composition For Use In
Inhibiting Bone Resorbtion. Brevet acordat N-FR 3066919 B1, Franța (2020). Cell Factory 2018;171(17):1–11.
[194] Wang Z, Tschirhart T, Schultzhaus Z, Kelly EE, Chen A, Oh E și colab. Melanina
produsă de bacteria marina cu creștere rapidă vibrio natriegens prin biosinteză
[189] Noorafshan A, Hashemi M, Karbalay-Doust S, Karimi F. Doza mare de roșu Allura,
mai degrabă decât doza ADI, induce modificări structurale și comportamentale în heterologă: Caracterizare și aplicare. Appl Environ Microbiol 2020;86(5).https://
doi.org/10.1128/AEM.02749-19.