Flagelul bacterian

Flagelul (flagelum = bici) = organitul extracelular al mobilitii celulei procariote. Filament extracelular, filiform, ondulat Lungime variabil, 4-5 m - 70 m, diametrul 20 nm. Celulele fr flageli se numesc atrihe. Dup numrul i modul de aezare a flagelilor:
monotrihe (cu un singur flagel); amfitrihe (cu doi flageli asezai la cei doi poli ai unui bacil);

Poziia flagelului
polar, subpolar sau ecuatorial

Structura flagelului
corpusculul bazal, localizat n nvelisurile celulare (3000-4000 rpm)-9 proteime; Crligul -1 prot; filamentul extern (flagelul propriu-zis) 1proteina - flagelina

Motilitatea si chemotaxia
fototaxia asigur deplasarea bacteriilor fotosintetizante spre zonele cu luminozitate optim; aerotaxia asigur deplasarea celulelor spre zonele cu concentraie optim a O2; termotaxia. Temperaturile fiziologice sunt atractante, iar cele prea mari sau prea sczute sunt repelente.

Viteza de deplasare- 10-100x > celula bacteriana Alte tipuri de mobilitate

ALUNECARE ROIRE SWARMING- PRTOEUS CONTRACTIE SI RELAXARE- SPIROCHETE

Fimbriile si pilii
Fimbriile structuri de tipul unor apendice filamentoase, rigide si neuniforme ca lungime , care se extind de la suprafaa celulei bacteriene Duguid, 1955 (fimbria -latin fibra, franjuri) Brinton, 1959 pil (latin, pilus = pr). Fimbriile - molecule proteice de fimbrilin, cu gr. mol. de 15-30 kDa, aezate totdeauna dup o simetrie helical. l000/celul. Daca sunt numeroase, au o dispoziie pericelular. Dac sunt puine, au localizare polar sau bipolar. Lungimea lor este foarte variabil (l-20 m), ceea ce sugereaz c au vrste diferite.
3 categorii structurale:
fimbrii rigide, cu diam. de 5-10 nm, cu un lumen de circa 2 nm (la enterobacterii) fimbrii flexibile, cu diam. de de 5-6 nm. fimbrii flexibile subiri spiralate, cu diam. de 4 nm sau mai puin, fr lumen (K88, K99, la E. coli).

comune la bacteriile Gram negative i mai rare la bacteriile Gram pozitive (Corynebacterium, Actinomyces), dar sunt diferite structural. Semnificaia biologic.
structuri din categoria adezinelor, adic mediaz interaciunea celul-suport. In ceea ce privete capacitatea de legare, cele mai multe adezine fac parte din familia lectinelor*.

Fimbrilina este codificat de gene cromosomale

Orice linie bacterian poate s existe alternativ n varianta fim+ sau fim- i s poarte simultan mai multe tipuri de fimbrii, cu specificiti diferite de legare Rata de mutaie a genelor care codific sinteza fimbriilor este foarte mare, astfel nct celulele fim+ trec n varianta fim- i invers, prin retromutaie.

variaia de faz i variaie antigenica. Variaia de faz nseamn c o structur dat este sau nu este produs. Variaia antigenic semnific faptul c aceiai structur se produce n variante biochimice diferite. Variaia antigenic este rezultatul acumularii lente a mutaiilor punctiforme n gena codificatoare ( drift antigenic)

Pilii Apendice filamentoase neflagelare, a cror sintez este codificat de gene localizate n structura unor plasmide denumite conjugoni sau plasmide sex. Celulele purttoare de pili au capacitatea potenial de a dona material genetic (sunt celulemascul). Numrul pililor pentru o celul 1 i l0, lungimea circa 20 m, diametrul extern 6 -l5 nm, iar cel intern de 2,5 nm. Structura
molecule identice de pilin procesul de conjugare bacterian. capacitatea de sintez a pilinei se pierde odat cu pierderea plasmidei de sex i este redobndit odat cu rectigarea plas midei. Pilii poart receptori de fagi.
Pe suprafaa pililor se gsesc receptori pentru fagii ARN masculi. Se numesc fagi masculi deoarece infecteaz numai celul ele cu potenialitate de donor de material genetic. Marcajul cu fagii ARN masculi este modalitatea de a-i distinge de alte structuri filamentoase. La extremitatea liber a pililor se gsesc receptori pentru fagii filamentosi.

Rolul pililor.

CRETEREA I MULTIPLICAREA BACTERIILOR

Creterea rezultatul mririi coordonate a constituienilor structurali ai unui organism uni- sau pluricelular, ca o consecin a sintezelor specifice, echilibrate, pe baza compuilor nutritivi existeni n mediu.
creterea peretelui celular dezechilibrului ntre suprafaa i volumul celulei

Multiplicarea bacteriilor
diviziune direct (simpl) nmugurire spori de propagare Diviziunea directa (simetrica/asimetrica): Proteinele de diviziune (FtsZ i PBP) se agreg n zona ecuatorial a celulei i se asambleaz
structur multimeric inelar - inelul Z = septalsom, divisom sau septator. Majoritatea proteinelor Fts au un domeniu ancorat n membrana celulei, iar celelalte domenii se gsesc n citoplasm sau n spaiul periplasmic.

Toate proteinele reglatoare ale procesului de diviziune sunt proteine termosensibile

Etapele diviziunii: - selecia situsului de diviziune, ntre nucleoizii recent segrega i; - asamblarea aparatului citoplasmatic, formarea inelului Z. Localizarea sa la mijlocul celulei este controlat prin dou mecanisme:
mecanismul nchiderii nucleoidului ; sistemul min, care controleaz poziia inelului Z.

-citochineza - depolimerizarea controlat a inelului format de proteinele Fts i creterea centripet a stratului de peptidoglican. Reglarea diviziunii timpul de generatie segregarea cromosomilor

Dinamica (evoluia) unei culturi bacteriene

Culturi discontinue Culturi continue

Tipuri de nutriie a microorganismelor

Criterii de clasificare:
capacitatea de a face biosinteza metaboliilor eseniali; sursa dominant de energie utilizat n procesele de biosintez; natura substratului folosit ca sursa reductoare.

Dup natura sursei de C:

Autotrofe Heterotrofe

Dupa sursa dominant de energie:

Fototrofe (fotosintetizante) utilizeaz energia fotonic (luminoas); Chemotrofe (chemosintetizante) - reacii de oxido-reducere ale substratului chimic organic sau anorganic.
Dupa natura substratului folosit ca surs reductoare (donator de H+ sau de e-) microorganismele chemotrofe:
litotrofe (litos, grec = piatr), adic utilizeaz ca donori de e-, diferite substane anorganice (H2, H2S, So, S2O32- (tiosulfat), Fe2+, NO2-, NH3), pe care le oxideaz (la ap, sulfat, Fe3+ i respectiv NO3), n reacii exergonice cuplate cu sinteza ATP; organotrofe, ca donori de e- folosesc diferii compui organici.

Dupa natura sursei de carbon, a sursei de energie i a substratului donor de potenial reductor (H sau e-)
nutriia fotolitotrof; sursa de carbon este CO2, cea de energie este radiaia luminoas, iar donorul de H este un compus anorganic (H2S, S0, H2, H2O).
bacterii fotosintetizante din familiile Chromatiaceae, Chlorobiaceae, i grupul Cyanobacteria, care fac fotosinteza dup mecanismul molecular al fotosintezei plantelor superioare;

nutriie fotoorganotrof; sursa de carbon este un compus organic (acizi grasi, acizii organici sau aminoacizi, glucide, alcooli i chiar compui aromatici), care are rol i de donor de potenial reductor (H+), iar sursa de energie este radiaia luminoas.
bacterii purpurii nesulfuroase din familia Rhodospirillaceae.

nutriie chimiolitotrof; sursa predominant de carbon este CO2. Potenialul reductor este furnizat prin reaciile de oxidare a unor compui anorganici (NH3, NO2, H2S, S0, Fe2+, H2), care au rolul de donori de protoni (H+).
Exclusiv la nitrat- i nitritbacterii, ferobacterii, bacteriile acetogene i metanogene sau cele care oxideaz CO;

nutriia chimioorganotrof; sursa de carbon o constituie compuii organici, care au i rol de donor de potenial reductor. Prin oxidarea lor se elibereaz energia necesar proceselor de biosintez. Majoritatea bacteriilor sunt chimioorganotrofe:
Bacillus, Clostridium, Pseudomonas, Lactobacillus, precum i toate bacteriile patogene sau potenial patogene.

Autotrofia - capacitatea unor organisme de a face sinteza materiei organice din substane anorganice.

Nutriia autotrof

microorganisme care utilizeaz CO2 ca unic sau principal surs de C, pe care l reduc la aldehid 3 -fosfogliceric. sursele de azot sunt compui simpli: NH4+, NO2- sau chiar N2 molecular.

Bacteriile autotrofe (fotolitotrofe si chimiolitotrofe) au capaciti mari de biosintez. Ele sintetizeaz toi metaboliii n ecesari, pornind de la surse anorganice de carbon i azot. Energia necesar reducerii CO2 la compui organici este eliberat prin oxidarea unor compui anorganici: CO, NH3, NO2, Fe2+, H2 S, So, S2O32-, H2 sau este chiar energia luminoas. Energia eliberat prin oxidarea compuilor chimici anorganici sau cea luminoas este stocat n ATP i utilizat pentru reaciile de reducere.

Fotosinteza
biosintez.

Fotosinteza este procesul biologic de transformare a energiei luminoase, n energie de legtur chimic, utilizabil n reac iile de

clorofile. autotrofe, capabile s utilizeze CO2 ca singur surs de carbon Energia luminoas este convertit ntr-o serie de reacii, n energie chimic sub forma ATP i a potenialului reductor sub forma NADPH.

Bacteriile fotosintetizante sulfuroase verzi (familia Chlorobiaceae, g. Chlorobium) sunt strict anaerobe i folosesc H2S ca donor de e-.

Fotosinteza bacterian
sulfuroase (Thiorhodaceae =

Bacteriile fotosintetizante purpurii sunt nesulfuroase(Athiorhodaceae = Rhodospirillaceae).

Chromatiaceae)

Bacteriile sulfuroase purpurii (Chromatiaceae) oxideaz H2S, la So elementar, pe care-l depoziteaz n spaiul periplasmic. Dup epuizarea H2S, So este oxidat la SO42-. Ele oxideaz i ali compui ai S, n special tiosulfatul (S2O32-), H2 i chiar substraturi organice (acizi dicarboxilici, acizi grasi, piruvatul). Ultimii au rolul nu numai de donori de e-, ci sunt utilizai si ca surse secundare de carbon, sursa principal rmnnd CO2.

Bacteriile sulfuroase purpurii se gsesc n zonele anoxice iluminate ale mediilor aquatice unde se acumuleaz H2S, precum i n izvoarele sulfuroase care conin H2S de origine biologic sau geochimic. Bacteriile purpurii nesulfuroase (Rhodospirillaceae) n absena luminii oxideaz H2, sau diferii compui organici (acizi
organici, alcooli, glucide, compui aromatici), pe care i utilizeaz att ca donori de e- ct i ca surse de carbon. In anoxie realizeaz un metabolism anaerob sau de tip fermentativ, iar n aerobioz au un metabolism respirator. S-au denumit nesulfuroase deoarece s-a considerat c nu pot utiliza H2S ca donor de potenial reductor pentru reducerea CO2.

Bacteriile fotosintetizante posed un pigment fotosintetic particular, denumit bacterioclorofil, repartizat n mici uniti elementare denumite cromatofori, dispersai n citoplasma bacterian. Centrul de reacie al bacterioclorofilei este echivalent fotosistemului I de la plantele superioare i de la cianobacterii.

Nutriia chimiolitotrof
Nutriia chimiolitotrof, cunoscut exclusiv la bacterii, reoxideaz anumii compusi minerali i i reintegreaz n circuitul natural.
Substratul anorganic oxidat are rolul de surs de e(potenial reductor), pentru reducerea CO2, utilizat ca surs de carbon. Acceptorul final de e- este O2.
De obicei implic procese respiratorii aerobe.

Chimiolitotrofele au caten transportoare de easemntoare cu acelea ale chimioorganotrofelor i genereaz fora protonmotrice care determin sinteza ATP.

Bacteriile care oxideaz hidrogenul (hidrogen-bacteriile) Pseudomonas, Alcaligenes etc. - cresc cu H2 i CO2 ca unic surs de energie i respectiv C, n prezena O2. Sunt litotrofe facultative Asimilarea reductiv a CO2 pe calea ciclului Calvin (calea ribulozo-fosfatului), dup urmtoarea reacie global:

H2 este oxidat, iar O2 este acceptorul final de e-, dup reacia global:

Organismele care folosesc un compus anorganic ca surs de energie i un compus organic ca surs de carbon se numesc mixotrofe. Hidrogen-bacteriile conin totdeauna n echipamentul lor enzimatic, una sau dou hidrogenaze*, enzime care leag H2 i l oxideaz, fie pentru a produce ATP sau l utilizeaz ca potenial reductor pentru creterea autotrof. Bacteriile carboxidotrofe Folosesc CO ca unic surs de energie i l oxideaz sub aciunea carbon-monoxid-dehidrogenazei (enzim cu Mo), la CO2, pe care l fixeaz n reaciile ciclului Calvin. Electronii care deriv din oxidarea CO intr n catena transportoare, la nivelul creia se sintetizeaz ATP. Bacteriile carboxidotrofe aerobe (Ps.carboxydomonas, Alcaligenes carboxydomonas) cupleaz oxidarea CO, cu respiraia insensibil la CO, dup reacia global:

Enzima care oxideaz CO conine Mo Bacteriile care oxideaz CO acetogene catalizeaz aceiai reacie, cu o enzim (CO-dehidrogenaz) ce conine Ni, enzim care se gsete i la bacteriile sulfat-reductoare. CO este consumat de bacteriile metanogene care au CO-dehidrogenaz cu Ni i de bacteriile fototrofe care hidrolizeaz CO cu H2O i rezult H2 + CO2. In afar de oxidarea bacterian, CO poate fi oxidat de monooxigenaze, fr s fie folosit pentru creterea bacterian.

Bacteriile metanogene
Unele bacterii metanogene oxideaz H2 i utilizeaz e- i energia rezultat pentru reducerea CO2, la compui glucidici i CH4. Sunt organisme strict anaerobe. Bacteriile metanogene din g. Methanobacterium, Methanosarcina, Methanospirillum) produc metan printr-o reacie definitorie i caracteristic grupului: reducerea CO2 ntr-o reacie n care H2 este utilizat ca donor de e-. H2 este oxidat ntr-o reacie productoare de energie:

Circa l/3 din cantitatea de CH4 produs n natur se formeaz prin aceast reacie, restul avnd originea n grupul metil al acetatului. Metanobacteriile sunt chimiolitotrofe, deoarece se dezvolt ntr-un mediu care conine o soluie mineral apoas i o atmosfer format din CO2 i H2. Mecanismele reducerii CO2 pentru sinteza compuilor organici nu se cunosc. Bacteriile metanogene produc CH4 nu numai prin reducerea CO2, ci i prin oxidarea unor substraturi organice, precursoare directe ale CH4:

Bacteriile care oxideaz sulful i compuii si 2 clase de bacterii chimiolitotrofe care oxideaz compuii redui ai S: cele care cresc la pH neutru cele care cresc la pH acid. Unele dintre acidofile pot folosi i Fe2+ ca donor de e-. Compuii cu S cei mai folosii ca donori de e- n nutriia chimiolitotrof sunt: In aceste reacii se elibereaz cantiti mari de E. O parte genereaz fora proton-motrice, utilizat n sinteza ATP. In reaciile de oxidare a H2S, So i S2O32-, unul dintre produse este H+. Se formeaz H2SO4 i pH scade chiar sub valoarea 1. Prin oxidarea H2S (forma cea mai redus a S) se formeaz So foarte instabil. Unele bacterii care oxideaz H2S depun So sub forma incluziilor citoplasmatice. So constituie rezerva de energie, deoarece dup epuizarea H2S, celula i obine energia prin oxidarea So din incluzii. Bacteriile sulf-oxidante (Beggiatoa, Thiobacillus) sunt chimiolitotrofe facultative, deoarece se pot dezvolta i organotrof n prezena unor substraturi organice. Beggiatoa, Sphaerotilus formeaz flocoane laxe si produc fenomenul de umflare a nmolului activ atunci cnd devin preponderente fa de bacteriile zoogleale. Unele bacterii sulf-oxidante cresc numai in condiii de mixotrofie. Ca surs de energie folosesc H2S i un compus organic. Bacteriile care oxideaz compuii fierului Oxidarea aerob a Fe, de la starea feroas (Fe2+) la cea feric (Fe3+) este o reacie furnizoare de energie pentru unele bacterii (g. Gallionella, Thiobacillus ferrooxidans) Bacteriile care oxideaz compuii Fe, oxideaz i compuii S i sunt acidofile obligate. . Compuii Fe i ai S sunt oxidai de Sulfolobus (Archaea), n izvoarele termale acide, n izvoarele de min, la temperaturi de pn la l00o. Oxideaz Fe2+, H2S, So i diferii compui organici. Crete autotrof i heterotrof.

Bacteriile care oxideaz amoniacul i nitritul

Cei mai comuni compui anorganici, utilizai ca donori de e- sunt NH4+ i nitritul (NO2-), fiind oxidai n aerobioz de bacteriile nitrificatoare, cu o larg distribuie n sol. NH3 rezultat n procesul de amonificare este oxidat de microorganisme, la nitrai, forma utilizabil a compuilor cu azot, de majoritatea plantelor i microorganismelor. Oxidarea NH3 la nitrai este un proces biologic complex, denumit nitrificare, realizat de bacterii chemolitotrofe obligat aerobe, care nu tolereaz prezena substanelor organice n mediul de cretere. Efectul lor pare a fi chiar toxic, deoarece inhib creterea autotrof. Oxidarea biologic a NH3 la nitrai se desfoar n trepte: -n prima etap, NH3 este oxidat la nitrii, de ctre nitritbacterii (Nitrosomonas, Nitrospira, Nitrosolobus):

In reacie, cei doi e- sunt necesari pentru reducerea unui atom de oxigen, la H2O. Amoniacul este oxidat de amonium-monooxigenaz (protein membranar). Se formeaz NH2OH (hidroxilamin) i H2O, iar hidroxilamin-reductaza (enzim periplasmic) oxideaz NH2OH la NO2-, elibernd 4 e- (nitritarea). n etapa a II-a, nitriii sunt oxidai la nitrai, de ctre nitratbacterii (Nitrobacter):

Nitrit- i nitrat-bacteriile triesc in asociaii strnse n sol i au rol important n fertilitatea acestuia. Bacteriile amonium-oxidante au capacitatea de a oxida i ali compui: CO, CH3OH, CH4, hidroxil-amina, propilenul, fenolul etc. Cele mai multe din aceste reacii sunt catalizate de AMO sau de metan-monooxigenaz (MMO). Cele dou enzime au proprieti comune. Oxidarea anaerob a NH4+. Organisme neidentificate, care triesc n apa menajer uzat, n condiii de anaerobie i cu un supliment de NO3- pentru stimularea denitrificrii, oxideaz NH4+ la N2:

Nutriia organic a chimiolitotrofelor ncorporarea CO2 n compusi organici, proces denumit fixarea CO2. Sursa de azot este NH3, NO3- sau N2. Din compuii anorganici simpli, ele sintetizeaz toate moleculele organice caracteristice organismelor vii. Cel puin o parte a carbonului celular poate fi obinut din surse organice, care sunt utilizate preferenial fa de CO2, dac ele constituie un amestec n proporii adecvate. Plasticitatea metabolic adaptativ a microorganismelor merge de la capacitatea de cretere autotrof, pn la cea de cretere heterotrof, n funcie de condiiile de mediu. In vitro, chmiolitotrofele au o capacitate limitat de a utiliza compusii organici ca surs de carbon i energie. Compuii organici pot nlocui numai parial CO2 ca surs de carbon, cel puin pentru izolatele proaspete de bacterii chimiolitotrofe, deoarece sunt inhibitori ai creterii datorit efectelor toxice: piruvatul are efect toxic; acetatul este cel mai bine utilizat dintre compuii organici, iar aminoacizii i zaharurile sunt asimilate ntr-o msur mai mic. Aminoacizii sunt inhibitori ai creterii. Mecanismul inhibitor al creterii, ca i n cazul bacteriilor heterotrofe este dezechilibrul cantitativ al aminoacizilor. Acest mecanism este sugerat de faptul c toxicitatea aminoacizilor individuali pentru chimiolitotrofele obligate poate fi rev ersat de ali aminoacizi sau de amestecul lor echilibrat. Chimiolitotrofele pstreaz o dependen parial de CO2, care este fixat n ciclul Calvin. Nutriia chimioorganotrof (heterotrof) Majoritatea bacteriilor nu au capacitatea de a folosi moleculele anorganice simple ca surs reductoare i potenial reductor. Din punct de vedere fiziologic sunt foarte heterogene sunt dependente de prezena n mediu, a compusilor organici pe care i folosesc ca surs de carbon pentru sinteza propriilor molecule i ca surs de energie n reaciile de catabolism aerob sau anaerob. Trecerea de la nutriia autotrof la cea heterotrof o realizeaz microorganismele prototrofe, care cresc pe un mediu minimal ce conine un compus organic (glucidic) ca surs de carbon i energie i o surs de azot anorganic. Din aceti compui, ele i sintetizeaz toi metaboliii eseniali. Bacteriile heterotrofe izolate din mediile naturale sunt prototrofe. Experimental, prin mutagenez, din tulpinile prototrofe se obin mutante auxotrofe, care necesit adugarea n mediul nutritiv a unuia sau mai multor factori de cretere, datorit pierderii cilor corespunztoare de sintez.