GENETICA

GENETICA
POPULATIILOR
POPULATIILOR
lucrarea
lucrarea
practica
practica
nr.9
nr.9
Asist
Asist
. Univ. Dr. FLORINA RAICU
. Univ. Dr. FLORINA RAICU
Obiectivele
Obiectivele
lucrarii
lucrarii
:
:

Cum
Cum
caracterizam
caracterizam
o
o
populatie
populatie
umana
umana
din
din
punct
punct
de
de
vedere
vedere
genetic;
genetic;

Legea
Legea
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg;
Weinberg;

Utilitatea
Utilitatea
intelegerii
intelegerii
si
si
aplicarii
aplicarii
legii
legii
HW in
HW in
genetica
genetica
medicala
medicala
si
si
evolutia
evolutia
biologica
biologica
a
a
speciei
speciei
umane
umane
;
;
Termeni cheie:
Termeni cheie:
Populatia
Populatia

grup de indivizi ce apartin aceleiasi

grup de indivizi ce apartin aceleiasi
specii, ocupa acelasi teritoriu, se incrucisa randomic
specii, ocupa acelasi teritoriu, se incrucisa randomic
(
(
panmictic
panmictic
)
)
Structura genetica a populatiei
Structura genetica a populatiei
: totalitatea
: totalitatea
genelor din acea populatie (
genelor din acea populatie (
genofond/gene
genofond/gene
-
-
pool
pool
),
),
frecventa alelelor acestor gene si modul in care
frecventa alelelor acestor gene si modul in care
sunt distribuite alelele intre indivizii populatiei.
sunt distribuite alelele intre indivizii populatiei.
Echilibrul
Echilibrul
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
In cazul unui caracter raspunzator pentru un anumit fenotip pute In cazul unui caracter raspunzator pentru un anumit fenotip putem m
implica una sau mai multe gene. implica una sau mai multe gene.
Pentru o singura gena, in cazul unui individ, avem doar 2 alele Pentru o singura gena, in cazul unui individ, avem doar 2 alele
posibile. posibile.
Intr Intr- -o populatie insa putem avea mai multe alele; o populatie insa putem avea mai multe alele;
Frecventa alelelor unei gene este diferita intr Frecventa alelelor unei gene este diferita intr- -o populatie data; o populatie data;
Frecventa alelelor poate fi calculata daca se cunoaste modul de Frecventa alelelor poate fi calculata daca se cunoaste modul de
transmitere al respectivului caracter/ gena si numarul de alele transmitere al respectivului caracter/ gena si numarul de alele
prezent in populatie. prezent in populatie.
Frecventa alelelor este importanta deoarece pe aceasta baza pute Frecventa alelelor este importanta deoarece pe aceasta baza putem m
calcula frecventa genotipurilor din populatia data; calcula frecventa genotipurilor din populatia data;
Determinarea genotipului este importanta in determinarea fenotip Determinarea genotipului este importanta in determinarea fenotipului ului
(de ex., cazul purtatorilor (de ex., cazul purtatorilor sanatosi sanatosi bolile recesive) bolile recesive)
FENOTIP FENOTIP GENA GENA ALELE ALELE FRECVENTA FRECVENTA
ALELE ALELE
FRECVENTA FRECVENTA
GENOTIP GENOTIP
Echilibrul
Echilibrul
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
Godfrey Harold Hardy Godfrey Harold Hardy
Wilhelm Weinberg Wilhelm Weinberg
Realatia matematica dintre frecventele alelelor si
Realatia matematica dintre frecventele alelelor si
frecventele genotipurilor dintr
frecventele genotipurilor dintr
-
-
o populatie a fost
o populatie a fost
enuntata de matematicianul G.H. Hardy si medicul
enuntata de matematicianul G.H. Hardy si medicul
german W. Weinberg in anul 1908.
german W. Weinberg in anul 1908.
Principiu:
Principiu:
In anumite
In anumite
conditii,
conditii,
frecventa alelelor
frecventa alelelor
dintr
dintr
-
-
o populatie
o populatie
va ramane
va ramane
constanta de la o
constanta de la o
generatie la alta.
generatie la alta.
Numarul
Numarul
de
de
indivizi
indivizi
dintr
dintr
-
-
o
o
categorie
categorie
Frecventa
Frecventa
=
=
Numarul
Numarul
total de
total de
indivizi
indivizi
dintr
dintr
-
-
o
o
populatie
populatie

O
O
populatie
populatie
aflata
aflata
in
in
echilibru
echilibru
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
nu
nu
evolueaza
evolueaza
;
;

O
O
astfel
astfel
de
de
populatie
populatie
este
este
considerata
considerata
un
un
caz
caz
IDEAL;
IDEAL;

Hardy
Hardy
si
si
Weinberg au
Weinberg au
ajuns
ajuns
independent la
independent la
concluziile
concluziile
lor
lor
analizand
analizand
freceventa
freceventa
alelica
alelica
la
la
generatii
generatii
succesive
succesive
Legea
Legea
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
este
este
adevarata
adevarata
doar
doar
daca
daca
sunt
sunt
indeplinite
indeplinite
urmatoarele
urmatoarele
conditii
conditii
:
:

1.
1.
Populatia
Populatia
este
este
numeroasa
numeroasa

2.
2.
Imprecheri
Imprecheri
randomice
randomice

3.
3.
Nu
Nu
apar
apar
mutatii
mutatii

4.
4.
Nu
Nu
exista
exista
migratie
migratie
/flux genetic
/flux genetic

5.
5.
Nu
Nu
apare
apare
selectia
selectia
naturala
naturala
O
O
astfel
astfel
de
de
populatie
populatie
:
:

se
se
afla
afla
in
in
echilibru
echilibru
genetic;
genetic;

este
este
o
o
populatie
populatie
ideala
ideala
;
;

frecventa
frecventa
genelor
genelor
nu
nu
se
se
schimba
schimba
de
de
-
-
a
a
lungul
lungul
generatiilor
generatiilor
Conditii
Conditii
pentru
pentru
legea
legea
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
alela
alela A
Ochi
Ochi
negri
negri
alela
alela a

Ochi
Ochi
albastri
albastri
Prin
Prin
conventie
conventie
:
:

Alela
Alela
cea
cea
mai
mai
comuna
comuna
(
(
A
A
)
)
apare
apare
cu
cu
frevcventa
frevcventa
p
p

Alela
Alela
mai
mai
putin
putin
comuna
comuna
(
(
a
a
)
)
apare
apare
cu
cu
frevcventa
frevcventa
q
q
Deci
Deci
,
,
intr
intr
-
-
o
o
populatie
populatie
de 100 de
de 100 de
indivizi
indivizi
:
:
p + q = 100
p + q = 100
sau
sau
p + q =1 (FRECVENTA ALELELOR)
p + q =1 (FRECVENTA ALELELOR)
Genotipurile
Genotipurile
posibile
posibile
in
in
populatie
populatie
: AA + 2Aa +
: AA + 2Aa +
aa
aa
= 100%
= 100%
Frecventa
Frecventa
genotipurilor
genotipurilor
: p2 + 2pq + q2 = 1 (
: p2 + 2pq + q2 = 1 (
ecuatia
ecuatia
HW)
HW)
Echilibrul
Echilibrul
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
in
in
cazul
cazul
genelor
genelor
autozomale
autozomale
Exemplul
Exemplul
:
:
ochi
ochi
negri
negri
vs.
vs.
ochi
ochi
albastri/verzi
albastri/verzi

Cel
Cel
mai
mai
des,
des,
noi
noi
putem
putem
observa
observa
doar
doar
fenotipul
fenotipul

Alela
Alela
A
A
(
(
dominanta
dominanta
)
)

Alela
Alela
a
a
(
(
recesiva
recesiva
)
)

Grupa
Grupa
noastra
noastra
are 18
are 18
studenti
studenti
:
:

17 cu
17 cu
ochi
ochi
negri
negri

1 cu
1 cu
ochi
ochi
verzi/albastri
verzi/albastri
Pasul
Pasul
1
1
Se
Se
calculeaza
calculeaza
frecventa
frecventa
genotipului
genotipului
homozigot
homozigot
(
(
aa
aa
)
)
De
De
ce
ce
?
?

q
q
2 2
este
este
homozigot
homozigot
recesiv
recesiv
(
(
aa
aa
)
)

Stim
Stim
cu
cu
siguranta
siguranta
acest
acest
lucru
lucru
doar
doar
daca
daca
ne
ne
uitam
uitam
la
la
ei
ei

q2
q2
= 1/18
= 1/18

q
q
2 2
= 0.0555
= 0.0555

(
(
altfel
altfel
spus
spus
o,5%
o,5%
dintre
dintre
studenti
studenti
sunt
sunt
aa
aa
)
)
Pasul
Pasul
2
2
Se
Se
calculeaza
calculeaza
frecventa
frecventa alelei
recesive
recesive
a
a
(
(
respectiv
respectiv q
)
)
q
2
= 1/18 = 0.0555
= 1/18 = 0.0555
q
= 0.0555
= 0.0555
q
= 0.2356
= 0.2356

(
(
altfel
altfel
spus
spus
23%
23%
dintre
dintre
alele
alele
sunt
sunt
alele
alele
a
a)

Pasul
Pasul
3
3
Se
Se
calculeaza
calculeaza
frecventa
frecventa
alelei
alelei
dominante
dominante
A
A
(
(
respectiv
respectiv
p
p
)
)
Stim
Stim
ca:
ca:
p + q = 1
p + q = 1

deci
deci
p = 1
p = 1

q
q
p = 1
p = 1
-
-
0.2356
0.2356
p = 0.7644
p = 0.7644
Pasul
Pasul
4:
4:
Stim
Stim
frecventele
frecventele
alelelor
alelelor
.
.
Putem
Putem
calcula
calcula
acum
acum
frecventa
frecventa
celorlalte
celorlalte
genotipuri
genotipuri
p
p
2 2
si
si
2
2
pq
pq

p
p
2 2
(
(
homozigot
homozigot
dominant) =
dominant) =

p
p
2 2
=0.584
=0.584

(
(
aproximativ
aproximativ
58 %
58 %
sunt
sunt
homozigoti
homozigoti
AA
AA
)
)

2pq
2pq
(
(
heterozigoti
heterozigoti
)=
)=

2
2
pq
pq
= 0.3554
= 0.3554

(
(
aproximativ
aproximativ
35 %
35 %
sunt
sunt
Aa
Aa
)
)

Pasul
Pasul
5:
5:
Verificarea dubla
(
(p
2
) + (
) + (2pq
) + (
) + (q
2
) = 1
) = 1
(0.584) + (0.3554) + (0.0555) = 1
(0.584) + (0.3554) + (0.0555) = 1
1 = 1
1 = 1
5,5% + 58,4% + 35,5% = 1
5,5% + 58,4% + 35,5% = 1

Uraaa
Uraaa
,
,
este
este
corect
corect
!!!
!!!
Exemplu:
Exemplu:
Boala
Boala
autozomal recesiva
autozomal recesiva
Incidenta 1:7189
Incidenta 1:7189
Deci q
Deci q
2 2
= 1/7189 = 0,00013
= 1/7189 = 0,00013
q= 0,00013 = 0,011
q= 0,00013 = 0,011
alela
alela
q
q
apare cu o frecventa de 1,1%
apare cu o frecventa de 1,1%
Deci p = 1
Deci p = 1
-
-
q = 0,989
q = 0,989
alela
alela
p
p
apare cu o frecventa de 98,9%
apare cu o frecventa de 98,9%
Genotipul p
Genotipul p
2 2
= 0,989
= 0,989
2 2
= 0,978 sau 97,8%
= 0,978 sau 97,8%
Iar
Iar
Genotipul 2pq = 2 x 0,989 x 0,001 = 0,0217
Genotipul 2pq = 2 x 0,989 x 0,001 = 0,0217
sau 2,17%(adica frecventa indivizilor afectati)
sau 2,17%(adica frecventa indivizilor afectati)

Echilibrul
Echilibrul
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
in
in
cazul
cazul
alelelor
alelelor
codominante
codominante
Exemplul grupului
Exemplul grupului
sangvin MN:
sangvin MN:
In acest caz frecventa
In acest caz frecventa
alelelor este simplu de
alelelor este simplu de
calculat pentru ca in
calculat pentru ca in
cazul alelelor
cazul alelelor
codominante fiecare
codominante fiecare
genotip este distinct
genotip este distinct
fenotipic.
fenotipic.
Intr Intr- -o populatie de 100 eschimosi: o populatie de 100 eschimosi:
36 au grupa M (sunt MM) au 72 alele M 36 au grupa M (sunt MM) au 72 alele M
48 au grupa MN (sunt MN) au 48 alele M si 48 alele N 48 au grupa MN (sunt MN) au 48 alele M si 48 alele N
16 au grupa N (sunt NN) au 32 alele N 16 au grupa N (sunt NN) au 32 alele N
Total 120 alele M si 80 ale Total 120 alele M si 80 alele N le N
Frecventa alelei M (p) = 120/200 = 0,6 Frecventa alelei M (p) = 120/200 = 0,6
Frecventa alelei N (q) = 80/200 = 0,4 Frecventa alelei N (q) = 80/200 = 0,4
Echilibrul
Echilibrul
Hardy
Hardy
-
-
Weinberg
Weinberg
in
in
cazul
cazul
genelor
genelor
situate
situate
pe
pe
cromozomii
cromozomii
de
de
sex
sex
X
A
X
a
X
A
X
a
X
A
X
A
X
A
X
a
X
A
X
a
X
a
X
a
Frecventa genotipurilor pentru femei Frecventa genotipurilor pentru femei
X
A
Y
X
A
X
a
X
A
(P)
Frecventa genotipurilor pentru barbati Frecventa genotipurilor pentru barbati
X
A
Y
(P)
X
a
(q)
X
a
Y
(q)
Echilibrul Hardy-Weinberg
in cazul polialeliei
O gena poate avea mai multe alele diferite (de exemplu genele O gena poate avea mai multe alele diferite (de exemplu genele
pentru sistemul sangvin ABO trialelie cu codominanta) pentru sistemul sangvin ABO trialelie cu codominanta)
Frecventa alelei A = p
Frecventa alelei B = q
Frecventa alelei O = r
p
p
+ q + r
+ q + r
= 1
= 1
p
p
2 2
+
+
2pr
2pr
+
+
q
q
2 2
+
+
2qr
2qr
+
+
2pq
2pq
+
+
r
r
2 2
= 1
= 1
Prin calcul
matematic deducem
p=1- prop. de indivizi cu fenotip B+O
q=1- prop. de indivizi cu fenotip A+O
Fenotip Genotip Frecventa
genotipurilor
Frecventa
fenotipurilor
A AA
AO
p
2
2pr
p
2
+2pr
B BB
BO
q
2
2qr
q
2
+2qr
AB AB 2pq 2pq
O OO r
2
r
2

Exemplu:
Sistemul sangvin ABO Sistemul sangvin ABO
Intr-o populatie de 3977 indivizi gasim frecventele alelice
p = 0,27
q = 0,06
r = 0,67
Deci
p
2
(AA) = 0,27
2
= 0,0729
2pr (AO) = 2 x 0,27 x 0,67 = 0,3618
q
2
(BB) = 0,06
2
= 0,0036
2qr (BO) = 2 x 0,06 x 0,67 = 0,0804
2pq (AB) = 2 x 0,27 x 0,67 = 0,0324
r
2
(OO) = 0,67
2
= 0,4489
Grupul sangvin A: 0,0729+0,3618 =0,4347
Grupul sangvin B: 0,0804+0,0036=0,084
Grupul sangvin AB: 0,0324
Grupul sangvin O: 0,4489
Deci indivizi cu
A avem 43,47x3977/100=1728 indivizi
B avem 8,4x3977=334 indivizi
AB avem 3,2x3977=127
O avem 44,8x3977=1781
Factori ce modifica echilibrul
Hardy-Weinberg
Frecventa alelica a unei umite gene intr-un gene-pool poate fi
modificata de 5 elemente evolutive:
1. Mutatia
2. Migratia
3. Driftul genetic
4. Casatoriile neintamplatoare
5. Selectia
Echilibrul HW este un model ideal deoarece el este
adevarat doar in anumite conditii specifice.
Orice modificare de la conditiile legii HWconduce la
alterarea frecventei alelelor intr-o populatie.
Pe termen lung estimarile legii HW nu sunt reale
deoarece populatiile se afla in dinamica (conditie a
evolutiei).

mutatia
mutatia

migratia
migratia

selectia
selectia

driftul
driftul
genetic
genetic

casatoriile
casatoriile
neintamplatoare
neintamplatoare
Mutatiile spontane in ADN
creaza alele noi.
implicit noi genotipuri noi
sursa variabilitatii genetice
prin introducerea de noi alele
in genofondul unei populatii.
Ce
Ce
elemente
elemente
pot
pot
modifica
modifica
structura
structura
genetica
genetica
a
a
unei
unei
populatii
populatii
?
?

sunt
sunt
introduse
introduse
alele
alele
noi
noi
,
,
sunt
sunt
indepartate
indepartate
alele
alele
sau
sau
este
este
modificata
modificata
frecventa
frecventa
alelelor
alelelor
existente
existente
Indivizii
Indivizii
intra in
intra in
noi
noi
populatii
populatii

imigratia
imigratia
:
:
intrarea
intrarea
intr
intr
-
-
o
o
populatie
populatie

emigratia
emigratia
:
:
plecarea
plecarea
dintr
dintr
-
-
o
o
populatie
populatie

gene flow
gene flow

mutatia
mutatia

migratia
migratia

selectia
selectia
naturala
naturala

driftul
driftul
genetic
genetic

casatoriile
casatoriile
neintamplatoare
neintamplatoare
Ce
Ce
elemente
elemente
pot
pot
modifica
modifica
structura
structura
genetica
genetica
a
a
unei
unei
populatii
populatii
?
?
apar diferente in
supravietuire sau reproducere
Descendenta este realizata preponderent doar de
posesorii unui anumit genotip.
Creste frecventa genotipurilor cu fitness ridicat
Poate fi:
artificiala
naturala
conduce la adaptare

mutatia
mutatia

migratia
migratia

selectia
selectia

driftul
driftul
genetic
genetic

casatoriile
casatoriile
neintamplatoare
neintamplatoare
Ce
Ce
elemente
elemente
pot
pot
modifica
modifica
structura
structura
genetica
genetica
a
a
unei
unei
populatii
populatii
?
?
Formele
Formele
Selectiei
Selectiei

Selectia
Selectia
este
este
un concept statistic:
un concept statistic:

Nu
Nu
se
se
poate
poate
preciza
preciza
destinul
destinul
unui
unui
singur
singur
individ
individ
dar
dar
poate
poate
prezice
prezice
ce
ce
tip de
tip de
individ
individ
va
va
deveni
deveni
mai
mai
des
des
intalnit
intalnit
intr
intr
-
-
o
o
populatie
populatie
.
.

Au fost idetificate 3 tipuri de selectie naturala

Au fost idetificate 3 tipuri de selectie naturala

Selectie
Selectie
stabilizatoare
stabilizatoare
Actioneaza
Actioneaza
pentru
pentru
eliminarea
eliminarea
ambelor
ambelor
fenotipuri
fenotipuri
extreme
extreme

Selectie
Selectie
eliminatoare
eliminatoare
Actioneaza
Actioneaza
pentru
pentru
eliminarea
eliminarea
fenotipului
fenotipului
intermediar
intermediar

Selectie
Selectie
directionala
directionala
Actioneaza
Actioneaza
pentru
pentru
eliminarea
eliminarea
unui
unui
singur
singur
fenotip
fenotip
extrem
extrem
De exemplu, la
om copii cu
greutate
intermediara la
nastere au cea
mai ridicata rata
de supravietuire
Selectia
stabilizatoare
Creste frecventa
fenotipului
intermediar
In populatiile
africane de pasari,
predomina fie cele
foarte mari fie
cele foarte mici
Fenotipul
intermediar fiind
dezavantajat
Mai adaptati sa
manevreze semintele
mici
Pot sa deschida
seminte mari
Selectia eliminatoare
Selectia
directionala
Selectia prin expunere
la malarie
Modificarile genetice apar datorita
sansei
observata in populatii mici

mutatia
mutatia

migratia
migratia

selectia
selectia
naturala
naturala

driftul
driftul
genetic
genetic

casatoriile
casatoriile
neintamplatoar
neintamplatoar
Ce
Ce
elemente
elemente
pot
pot
modifica
modifica
structura
structura
genetica
genetica
a
a
unei
unei
populatii
populatii
?
?
8 RR
8 pp
Inainte:
Dupa:
2 RR
6 pp
0.50 R
0.50 p
0.25 R
0.75 p
Cauzele
Cauzele
driftului
driftului
genetic
genetic
Populatia
Populatia
se
se
micsoreaza
micsoreaza
datorita
datorita
limitarii
limitarii
resurselor
resurselor
Efectul
Efectul
fondator
fondator
: un
: un
grup
grup
mic
mic
de
de
indivizi
indivizi
formeaza
formeaza
o
o
noua
noua
populatie
populatie
intr
intr
-
-
o
o
alta
alta
locatie
locatie
.
.
Bottleneck:
Bottleneck:
dimensiunea
dimensiunea
populatiei
populatiei
scade
scade
brusc
brusc
datorita
datorita
conditiilor
conditiilor
de
de
mediu
mediu
Bottleneck gatuitura
Defineste fixarea sau
eliminarea
accidentala,intamplatoare,
a unor alele in cadrul unei
populatii.

mutatia
mutatia

migratia
migratia

selectia
selectia
naturala
naturala

driftul
driftul
genetic
genetic

casatoriile
casatoriile
neintamplatoare
neintamplatoare
Ce
Ce
elemente
elemente
pot
pot
modifica
modifica
structura
structura
genetica
genetica
a
a
unei
unei
populatii
populatii
?
?

Casatoriile
Casatoriile
intre
intre
membrii
membrii
aceleiasi
aceleiasi
familii
familii
.
.

Consangvinizarea
Consangvinizarea
creste
creste
probabilitatea
probabilitatea
ca
ca
sa
sa
apara
apara
descendenti
descendenti
homozigoti
homozigoti
(
(
homozigotii
homozigotii
mostenesc
mostenesc
2
2
copii
copii
ale
ale
aceleiasi
aceleiasi
alele
alele
de la un ancestor).
de la un ancestor).
casatoriile
casatoriile
intamplatoare
intamplatoare
(
(
randomice
randomice)
casatoriile
casatoriile
neintamplatoare
neintamplatoare
(non/
(non/
randomice
randomice
)
)
APLICATII ALE LEGII HARDY WEINBERG
APLICATII ALE LEGII HARDY WEINBERG
1.
1.
Calcularea
Calcularea
frecventei
frecventei
heterozigotilor
heterozigotilor
purtatori
purtatori
de
de
gene
gene
mutante
mutante
recesive
recesive
.
.
S
S
-
-
a
a
observat
observat
ca
ca
atunci
atunci
cand
cand
alela
alela
recesiva
recesiva
este
este
rara
rara
(q
(q
este
este
foarte
foarte
mic
mic
)
)
exista
exista
un
un
numar
numar
mare de
mare de
purtatori
purtatori
in
in
populatie
populatie
.
.
2.
2.
Caracterizarea
Caracterizarea
populatiilor
populatiilor
pe
pe
baza
baza
frecventelor
frecventelor
lor
lor
alelice
alelice
.
.
Analiza
Analiza
acestor
acestor
frecvente
frecvente
indicand
indicand
gradul
gradul
de
de
inrudire
inrudire
genetica
genetica
intre
intre
populatii
populatii
geografic
geografic
diferite
diferite
.
.
3.
3.
Populatiile
Populatiile
evolueaza
evolueaza
deoarece
deoarece
la
la
nivelul
nivelul
lor
lor
apar
apar
schimbari
schimbari
ale
ale
frecventei
frecventei
alelice
alelice
.
.
Daca
Daca
frecventele
frecventele
observate
observate
difera
difera
semnificativ
semnificativ
de
de
cele
cele
asteptate
asteptate
teoretic
teoretic
,
,
atunci
atunci
in
in
populatia
populatia
respectiva
respectiva
s
s
-
-
a
a
produs
produs
o
o
modificare
modificare
evolutiva
evolutiva
.
.