Standardul DICOM n informatica medical i softuri aferente specializate
I. PREAMBUL
O dat cu introducerea tomografiei computerizate (CT), urmat apoi de alte modaliti de diagnosticare pe baza imagisticii digitale in anii 70, precum i de creterea numrului de utilizri n aplicaiile clinice, Colegiul American de Radiologie ( ACR ) mpreun cu National Electrical Manufacturers Association (NEMA), au recunoscut nevoia urgent i n continu cretere a unei metode standard pentru transferul de informaie ntre aparate fabricate de diferii productori ; pn atunci productorii foloseau standarde proprii care nu erau inter- compatibile. n 1983, ACR i NEMA au format un comitet pentru a crea un standard care s ndeplineasc anumite condiii clare. Acest format trebuia s uureze comunicaiile de informaii digitale medicale, indiferent de productorul aparaturii, s faciliteze dezvoltarea arhivrii i compresiei de imagini, precum i dezvoltarea sistemelor de comunicaii (PACS) care au interfaa legat i la alte aparate avnd informaii medicale, i s permit dezvoltarea unei baze de date care s poat fi accesat de oriunde de pe glob.
II. Standardul DICOM
Standardul Digital Imaging and Communications in Medicine a fost creat de National Electrical Manufacturers Association n scopul dezvoltrii distribuirii i vizualizrii imaginilor medicale,ca de exemplu : scanri CT, MRI i ultrasunete. Acest format este o versiune mai noua a standardului NEMA.
Acest standard, fa de vechea versiune a standardului ACR-NEMA include un numr mare de mbuntiri. Este aplicabil ntr-un mediu de reele, suport operaii folosind protocolul de comunicaii TCP/IP, dar i ntr-un media off-line, specificnd ca mediu standard, CD-R sau MOD i fiiere de sistem logice ca ISO 9660 si PC File System(Fat16). De asemenea,standardul DICOM specific cum aparatele care se presupun a fi n conformitate cu el reacioneaz la comenzi i schimburi de date prin conceptul de Service Classes, semantica comenzilor i datelor asociate. Este, de asemenea, structurat ca un document cu mai multe pri. Acest lucru permite i facilitez evoluia standardului ntr-un mediu care e n continu i rapid schimbare, prin simpla adugare de noi elemente n coninutul documentului. Directivele ISO au fost implicate n construcia standardului.
Un fiier DICOM conine att un header, ce reprezint date non-imagistice cunoscute i sub numele de metadata (care stocheaz informaii referitoare la : numele pacientului, studiul asupra acestuia privind istoricul i evoluia, precum i date referitoare la imaginea propriu-zis cum ar fi: mrimea i dimensiunile imaginii, numrul de bii pe care se face reprezentarea acesteia, modalitatea prin care au fost create datele precum i setrile echipamentelor folosite la nregistrarea imaginilor), ct i toate datele imaginii n sine (care poate conine chiar i informaii 3D).
Acesta este un format diferit fa de popularul format Analyse, care stocheaz informaiile imaginii ntr-un singur fiier(*.img), iar informaiile header-ului ntr-un fiier diferit(*.hdr).
O alt diferen ntre cele dou standarde const n faptul c imaginea DICOM poate fi comprimat (ncapsulat) pentru a reuduce mrimea ei. Fiierele pot fi comprimate utilizndu-se variante de format jpg., ct i variante ale formatului Run-Length Encoding (format identic cu compresia pachetelor de bii folosit n unele imagini de tip TIFF).
Pentru productori, standarul DICOM descrie n mod explicit cum cel care implementeaz trebuie s structureze o declaraie de conformitate pentru anumite opiuni. Pentru utilizatori, au fost introduse informaii explicite, nu doar pentru imagini sau grafice ci i pentru rapoarte, forme de und, print .a.; au fost stabilite i moduri de cutare i identificare a oricrei informaii, pentru a se evita astfel ambiguitile ce pot aprea la transmisia prin reele.
III. SCOPUL STANDARDULUI DICOM Standardul Dicom faciliteaz interoperabilitatea dintre aparatele care se doresc a fi conforme cu el. n particular, acest standard realizeaz urmtoarele :
- adreseaz semantica comenzilor i datelor asociate ; pentru ca echipamentele s interacioneze, trebuie s existe legi dup care acestea sunt ateptate s reacioneze la comenzi, nu doar informaia care trebuia transferat ntre aparate ;
- adreseaz sematinca serviciilor fiierelor, formatele fiierelor precum i directoarele de informaii necesare pentru comunicaiile off-line ;
- este explicit n definirea cerinelor de conformitate pentru implementrile standardului; n particular, o declaraie de conformitate trebuie s conin suficient informaie pentru determinarea funciilor pentru care interoperabilitatea exist ntre aparate ;
- faciliteaz operarea ntr-un mediu de reele ;
- este structurat astfel nct noi servicii s poate fi adaugate, facilitnd suportul viitoarelor aplicaii medicale de imagistic digital ;
- folosete standardele internaionale existente i documenia sa se aliniaz acestora ;
Acest standard a fost dezvoltat avnd n vedere nevoile de diagnosticare pe baza imaginilor digitale radiologice, cardiologice i domenii conexe, dar este de asemenea aplicabil la o mare gam de imagini i informaii clinice non-imagistice.
IV. ASPECTE TEORETICE a) Introducere
Programul prezentat este prevzut cu anumite funcii necesare achiziionrii i prelucrrii imaginilor medicale, avnd totodat si particularitile sale.
b) Header-ul DICOM
Formatul DICOM necesit un preambul de 128 bytes (iniial sunt setai la zero), urmat de literele 'D', 'I', 'C', 'M'. n continuare urmeaz informaia headerului organizat n grupuri. Imaginea din Fig.1 prezint un fiier DICOM. n acest exemplu, primii 794 bytes sunt utilizai pentru header-ul formatului DICOM, care conine informaia legat de dimensiunile imaginii, ct i alte informaii despre scanare. Mrimea header-ului variaz n funcie de informaia stocat. Aici header-ul definete o imagine cu dimensiunile de 109x91x2 voxeli, cu rezoluia de 1byte/voxel. Datele imagine urmeaz imediat informaiilor headerului, fiind stocate n acelai fiier.
Fig.1-Fiier DICOM c) Luminozitate i contrast
n limbajul de specialitate, pentru a desemna luminozitatea i contrastul unei imagini se folosesc temenii de centru(C) i lime(W) a unei ferestre. Aceste valori sunt foarte importante pentru scanerele X-RAY/CT/PET care tind s genereze intensiti calibrate, astfel nct se poate utiliza o pereche specific C:W pentru fiecare imagine n parte (de ex : 400 : 2000 poate fi foarte indicat pentru a vizualiza esuturile osoase, n timp ce 50 : 350 poate fi ideal pentru vizualizarea tesuturilor moi).
Fig.2 ilustreaz conceptul schimbrilor aduse de aceste 2 variabile ntr-o imagine : sunt prezentate 3 ipostaze ale aceleiai imagini cu setri C:W diferite.
Fig.2 Imagini cu setri diferite
DicomWorks Este cel mai complex program, avnd o gama larg de funcii i setri. O scurt prezentare a meniului i a barei cu butoane a programului, omind funciile comune oricrui program(open,print,quit, import,export), este descris n continuare.
a) Meniul Patiens list - cuprinde funcii comune tuturor programelor, dar cu anumite particulariti specifice imagisticii medicale ; noutatea o reprezint posibilitatea de a face import si export din i ctre e-mail.
b) Meniul Database - este de fapt un subprogram care realizeaz i gestioneaz o baz de date cu imagini n format DICOM ; acest program are la rndul su diferite funcii de cutare, de salvare, etc
Acest meniu permite totodat salvarea unor imagini curente selectate ntr-o baz de date.
c) Meniul Display - prezint urmtoarele funcii :
setarea butonului stng al mouse-ului pentru a realiza diverse operaii : reglare de luminozitate/contrast, zoom, poziionarea imaginii, scroll; setarea butonului drept al mouse-ului pentru aceleai operaiuni; alegerea numrului de imagini care se doresc a fi vizionate simultan i sincronizarea imaginilor afiate; afiarea imaginii pe toat zona de lucru sau la rezoluia ei real exemplificarea este ilustrat in figura urmtoare :
Windowing facilitate cu ajutorul creia se aplic imaginii anumite perechi de valori luminozitate/contrast, pentru diferitele esuturi care trebuie evideniate : abdomen, pelvis, plmn, os, sinus, creier, etc
aceste valori pot fi introduse i manual i apoi memorate n funcie de aplicaii
Alte dou funcii din acest meniu sunt de mare ajutor n diagnosticarea ct mai precisa : Filters - aplic diverse modificri utile imaginii (schimbare de orientare, de evideniere a anumitor zone, etc) Measures - instrument care permite msurarea de : distane, unghiuri, raze, suprafee, distane intre dou paralele, introducerea de comentarii suprapuse peste imagine n zonele de interes
Alte funcii prezente n acest meniu permit : Statistics - permite realizarea de statistici pe baza observaiilor i a rezultatelor studierii unei imagini Mask - acoper o zon selectat din imagine Calibration - realizeaz corelaia ntre o distan msurat pe imagine i distana real pentru ca rezultatul msurrii pe imagine s fie convertit direct n dimensiunea real Clear measures - terge msurtorile fcute pe imaginea curent sau pe alte imagini
d) Meniul Tools - cuprinde mai multe instrumente de prelucrare a imaginilor medicale
Edit or Anonymize DICOM tags - modific informaia text (tag-urile) care se afl suprapuse peste imagine ;
Palette - permite crearea de colecii de imagini care urmeaz a fi exportate ; Cine-Loop i Cine-Loop setup - ofer posibilitatea de a vizualiza imaginile dintr-un director sub form de film ; Clean-up DICOM directory - permite administrarea eficient a directoarelor cu fiiere n format DICOM ; Preferences - ofer acces la o serie ntreag de opiuni i setri privitoare la multe dintre funciile programului ;
e) Meniul Help cuprinde amnunte despre productor, se poate updata programul de pe internet i altele ;
V. N LOC DE CONCLUZII Standardul DICOM aparine domeniului Informaticii medicale i este adresat schimbului de informaie digital dintre echipamentele medicale de imagistic i alte sisteme.
Standardul DICOM faciliteaz interoperabilitatea echipamentelor de imagistic medical prin specificarea : - pentru comuncaii online, un set de protocoale ce pot fi urmate de echipamente care sunt n conformitate cu standardul ; - sintaxei i semanticii de Comenzi i Informaii asociate, care pot fi inter-schimbate folosind aceste protocoale ; - pentru comunicaii media, un set de servicii de stocare media trebuiesc urmrite de echipamentele care sunt n conformitate cu standardul, precum i formatul fiierelor i structura directoarelor medicale care faciliteaz accesul la imagini i informaiile stocate pe mediile de schimb ; Se observ uor avantajele folosirii formatului DICOM fa de imaginile obinuite(jpg, bmp, etc)
La folosirea n scopuri didactice a unui fiier DICOM, studiu sau prezentri, informaia confidenial despre pacient poate fi nlturat, prin procedeul numit anonimizare ; se poate creea astfel o nou serie cu valori de studiu noi, acestea putnd fi salvate ntr-un fiier nou.
Standardul DICOM este capabil s organizeze imaginile n serii ; pentru a ncepe o nou serie de imagini, se aloc un identificator unic campului metadatelor SeriesInstanceUID.
Acesta, ca orice program ce ruleaz n Windows, are meniurile File, Edit i Help, dar i meniuri specifice Informaticii Medicale.
Standardul DICOM este n continu dezvoltare i este pstrat n concordan cu procedurile Comitetului pentru standarde DICOM. Sunt primite permanent propuneri de dezvolatare din partea membrilor comitetului DICOM, bazate pe cererile utilizatorilor standardului. Aceste noi cerine vor fi implementate n versiunile viitoare ale standardului. Una din condiiile eseniale de care se ine cont la crearea noilor versiuni, este compatibilitatea cu ediiile precedente.
VI. SIMBOLURI I ABREVIERI ACSE Association Control Service Element CT Computed Tomography DICOM Digital Imaging and Communications in Medicine HIS Hospital Information System OSI Open Systems Interconnection PACS Picture Archiving and Communication Systems RIS Radiology Information System TCP/IP Transmission Control Protocol/Internet Protocol