Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Ce sunt enzimele?
Nomenclatura enzimelor
Caracteristici generale ale enzimelor
Clasificarea enzimelor
Structura enzimelor
Specificitatea enzimelor
Mecanismul catalizei enzimatice
Cinetica enzimatica
Cofactori (coenzime, grupari prostetice).
Definiţie
Biocatalizatori proteici care măresc viteza reacţiilor chimice, dar numai pentru reacţiile termodinamic
posibile
Coordonează toate procesele metabolice
Catalizează un număr redus de reacţii, foarte frecvent numai una; se caracterizează printr-o înaltă
specificitate
Sunt implicate în majoritatea reacţiilor biochimice din celule, fiind importante în diagnostic şi tratament
Scurt istoric
Reactiile enzimatice au fost folosite din timpurile celemai vechi pentru fabricarea vinului, otetului, a berii
si a branzei.
Lavoisier (1789) a facut un bilant de materiale ale fermentatiei aratand ca oxigenul,hidrogenul si
carbonul din zahar se regasesc in alcool si in bioxidul de carbon ce iau nastere.
Payen si Persoz (1833) au izolat prin precipitarea cu etanol prima enzima-amilaza.
Un moment istoric DEOSEBIT de important este recunoasterea clara de catre Berzelius in 1835 a
caracterului catalitic al reactiilor enzimatice precum si a rolului essential pentru viata animalelor si a
plantelor jucat de aceste reactii.
In anul 1940 cercetatorul american E. Howell a facut in acelasi domeniu o si mai mare descoperire,
cercetand substantelevitale propriu-zise si anume ENZIMELE, a dovedit ca ele sunt purtatori ai vietii din
orice organism viu, fiind deci si material vie din alimentele noastre.
Enzime
Caracteristici
Enzime- clasificare
1) Oxidoreductazele
Lactat dehidrogenaza
2) Transferazele
- enzime ce catalizează reacţii de transfer ale unor grupe de atomi (C-, N-, P-) ce pot fi şi grupări
funcţionale de la un substrat la altul, fără ca aceste grupări să existe libere în timpul procesului;
3) Hidrolazele
- enzime ce catalizează scindarea diferitelor legături covalente din molecula substratului cu participarea
moleculelor de apă;
Uree+HOH->CO2+NH3 ( ureaza)
4) Liazele
- catalizează clivarea legăturilor de tip C-C, C-S, C-N cu rearanjarea ulterioară a valenţelor;
5)Izomerazele
- enzime ce catalizează formarea unor noi legături chimice C – C sau C– O, S, N în majoritatea cazurilor
utilizându-se energia stocată în legăturile macroergice ale moleculelor de ATP.
2 categorii:
1. formate numai din AA; structură exclusiv proteică. Ex proteaze, lipaze, ribonucleaze
COFACTORI:
A. Gruparea prostetică
Componenta neproteică legată de apoE prin legături ferme, stabile, neputându-se desprinde de aceasta.
Ex FMN, FAD
B. Coenzima
Derivat al unei vitamine, componenta neproteică legată de apoE prin legături labile
Sunt necesari pentru pentru activitatea a numeroase enzime. După modul de legare a şi rolul ionului
metalic, enzimele sunt:
- metaloenzime ce conţin o cantitate bine definită de ion metalic funcţional, fiind strâns legat de apoE
- enzime metaloactive, a căror activitate creşte în prezenţa ionului metalic, care leagă metalul slab, iar
cantitatea acestuia nu este strict delimitată
Metaloenzime:
- Co-enzime: cobalamin-enzime;
- Se-enzime: glutationperoxidaza
Apoenzime-enzima care devine active numai la unireacu anumite substante de natura non-proteica
Coenzima sau cofactor- substanta de natura proteica ,ce-I confera activitate enzimatica apoenzimei
Unele enzime necesită pentru a fi active prezenţa coenzimelor, altele a gruparilor prostetice sau a ionilor
metalici
In reacţiile catalizate de enzime ce necesită prezenţa coenzimelor, acestea sunt considerate al doilea
substrat, fiind numite cosubstrat
O regiune a componentei proteice în care resturile de AA sunt aranjate astfel încât să permită o
interacţiune adecvată cu substratul, numit la modul generic ligand
Atracţii electrostatice
Legături de hidrogen
Interacţiuni hidrofobe
După fixarea S la centrul activ al E numeroase resturi laterale ale AA din vecinătatea ligandului
catalizează transformarea acestuia.
Centrul activ ocupă o porţiune mică din enzimă şi este o entitate tridimensională
Cofactorii joacă un rol important atât în fixarea S cât şi în procesul catalitic
1890
1958
E+S->[ES]->P+E
S se leagă de E prin forţe relativ slabe; complexul ES
Apare sub forma unei despicături în apoE căptuşită cu AA hidrofobi , apa fiind exclusă în mare parte
Pe lângă resturile catalitice aflate în centru activ, care participă direct la transformarea S, apoE conţine şi
aşa-numitele resturi de specificitate, unde sunt prezenti aa cu rol în recunoaşterea S
Centrul activ prezinta: resturi catalitice (His 12 si His 119) si resturi de specificitate: intre aa 31-41 exista
5 aa bazici care recunosc ARN cu caracter acid
Aici se fixeaza efectorii alosterici care nu intervin direct in cataliza, dar pot influenta procesul catalitic
prin modificarea conformatiei spatiale a enzimei
SItusuri allosterice
Specificitatea enzimelor
specificitate de legatura:
Arg
Lys
Alte exemple:
Hexokinaza catalizeaza fosforilarea mai multor hexose (glucoza, fructoza, manoza, galactoza) in prezenta
ATP
Un caz aparte il reprezinta fosfolipazele ccare actioneaza asupra aceluasi substrat (fosfolipidele) dar cu
un punct de scindare diferit, fiind un amestec de specificitate de substrat de actiune
Ureaza, arginaza
3. Stereospecificitate
Specificitatea stereochimica. Existenta unor compusi biologici sub forma de izomeri determina
posibilitatea actiunii selective a unor enzime asupra unuia dintre ei
Enzima leaga substratul pe baza complementaritatii intre centrul activ si un fragment din molecula,
respectata numai in cazul unuia dintre izomeri
Stereospecificitate
Lactat dehidrogenaza (LDH) este o enzima care determina transformarea acidului L-lactic dar nu si pe
cea a acidului D-lactic
Determina transformarea unui compus optic inactiv, acidul piruvic, intr-un compus optic activ, acidul L-
lactic, realizand o sinteza asimetrica
Specificitate de actiune
Enzimele catalizeaza un anumit tip de reactie, in functie de modul de actiune asupra substratului
Acest tip de specificitate sta la baza clasificarii enzimelor si este datorat cofactorului care guverneaza
tipul de reactie in care se va angaja substratul.
De exemplu un anumit α-AA poate fi substrat pt mai multe enzime care au cofactori diferiti
Intr-o reactie S P, la un moment dat un anumit numar de molecule de substrat au energia necesara sa
atinga o stare reactiva, denumita stare de tranzitie, intermediara intre S si P si instabila
Aceasta poate fie sa se transforme in produsul P fie sa reformeze substratul si se situeaza la punctul
maxim al diagramei energetice ce caracterizeaza relatia intre S si P
Enzima formeaza cu substratul un produs intermediary reactive cu o viata scurta. Sub aceasta forma
intermediara, substratul intra in reactive sufera modificari electronice sub actiunea centrilor active ai
enzimei, rezultand produsul de reactie.
Cu cat este mai mare aceasta energie fata de energia medie cu atat sunt mai putine molecule capabile
sa realizeze tranzitia si reactia se desfasoara mai greu
Bariera de energie dintre energia starii de tranzitie si energia libera medie a lui S se numeste energie de
activare.
Energia de activare: necesara energizarii unui substrat pentru a atinge o stare de tranzitie incare exista o
mare probabilitate ca o legatura chimica sa se formeze sau sa se rupa in substrat.
Enzimele reduc energia de activare fara sa afecteze energia libera a reactive(∆G) astfel, enzimele cresc
viteza de reactive.
Enzimele actioneaza prin scaderea energiei de activare si nu prin cresterea energiei reactantilor,
combinandu-se cu substratul astfel incat sa permita trecerea acestuia in starea de tranzitie
Complexele formate ES si EP sunt intermediari avand energia punctelor minime in diagrama variatiei
energiei dintre S si P
Energia de activare este o bariera energetica pentru reactiile chimice, moleculele cu o energie de
activare mare fiind mai stabile. Fara aceasta bariera energetica complexele macromoleculare ar reveni
spontan la moleculele simple ce le compun si nu ar putea sa existe procesele metabolice si structurile
ordonate.
cataliza acido-bazică,
cataliza covalentă
Cataliza acido-bazica
Consta in procese de transfer de protoni intre gruparile acido-bazice ale enzimei si cele ale substratului
În calitate de catalizatori acido-bazici generali pot funcţiona grupările carboxilice sau aminice libere ale
resturilor aminoacizilor acizi sau bazici; gruparea tiol a cisteinei, gruparea imidazol a histidinei şi
gruparea hidroxil a tirozinei.
Cataliza acido-bazica
Viteza reactiilor catalizate de acizi sau baze este influentata de doi factori importanti:
Taria acizilor sau a bazelor: gruparea imidazol a histidinei are pka=6, actionand ca donor/acceptor la pH
fiziologic
Viteza cu care acidul sau baza cedeaza/accepta protoni; si din acest punct de vedere este eficienta His
In chimotripsina, aminoacizii Asp 102 si His 57 functioneaza ca grupe cu caracter acid si, respectiv
caracter bazic.
Cataliza covalenta
Formarea complexului enzimă-substrat presupune formarea unei legături puternice, de tip covalent
(punere in comun a electronilor), între S şi E
In acest tip de cataliza, atacul unei grupe electrofile sau nucleofile din situsul activ al enzimei asupra
substratului determina atasarea acestuia prin legaturi covalente la enzima.
Multe enzime formeaza legaturi covalente cu substratul, labilizandu-l fata de cel in forma nelegata
Cataliza covalenta
Accelerarea vitezei de reacţie prin acest mecanism s-ar datora inducerii unei tensiuni în molecula
substratului, ceea ce ar determina “activarea” sa.
Se presupune astfel că legarea specifică a substratului de molecula enzimei induce apariţia unei tensiuni
sau a unei deformări în legătura ce urmează a fi scindată
Deformarea survenită permite complexului enzimă-substrat să fie mai reactiv decât substratul singur şi
să se transforme mai rapid în produşii de reacţie.
Cinetica enzimatica
Factori care influenteaza activitatea enzimatica
pH-ul
Pentru enzimele din organismul uman, pH-ul optim de actiune este pH-ul normal al mediului in
care ele isi manifesta actiunea catalitica
Centrul activ al enzimelor contine grupe ionizabile, acide sau bazice, deci modificarea pH-ului
are ca efect modificarea gradului de disociere si, implicit, modificarea vitezei de reactie.
Pentru enzimele din organismul uman pH-ul optim este intre 5-9, dar exista enzime ce actioneaza si in
afara acestui interval. De exemplu, pepsina actioneaza la pH 1,5-2, fosfatazele alcaline la pH 9-10, iar
fosfatazele acide la pH 4,5-5.
Temperatura
Efectul temperaturii asupra activitatii enzimelor este rezultanta actiunii a doi factori opusi, cresterea
vitezei de reactie cu temperatura si denaturarea termica a enzimelor
Concentratia substratului
In reactiile cu un singur S, mentinand constanta [E], cresterea [S] determina marirea vitezei de reactie
pana cand se atinge o valoare maxima peste care oricat ar creste concentratia substratului viteza
reactiei enzimatice ramane nemodificata
Concentratia substratului
L. Michaelis si M. Menten au propus o teorie generala de actiune a enzimelor bazata pe ideea ca enzima
si substratul se asociaza reversibil pentru a forma complexul ES.
Ecuatia exprima faptul ca viteza unei reactii enzimatice este determinata de concentratia de substrat la
acel moment si de constantele Km si vmax.
Daca v = vmax/2 , inlocuind in ecuatia Michaelis-Menten se deduce faptul ca Km = [S], deci constanta
Michaelis poate fi definita drept concentratia de substrat la care viteza de reactie este jumatate din
viteza maxima
Constanta Michaelis, Km, este un indice al afinitatii enzimei pentru substrat, variind invers proportional
cu aceasta
Pentru orice E se poate defini, alaturi de Km si v max, numarul de turn-over al enzimei, ca fiind numarul
de molecule de S convertite in produs de reactie pe molecula de E in unitatea de timp, atunci cand E
este saturata cu S
Ecuatia Lineweaver-Burk
Deoarece reprezentarea ecuatiei Michaelis -Menten este curba a carei interpretare este dificila, s-au
realizat reprezentari liniare ale dependentei vitezei de reactie de [S], folosite la interpretarea datelor
experimentale:
Enzimele alosterice
sunt alcatuite din
mai multe
subunitati
curba prezinta un
aspect sigmoid
Efectorii enzimatici sunt substante cu structuri chimice variate care aduse in mediul de reactie pot
influenta activitatea enzimei care catalizeaza reactia
Activatorii enzimatici sunt compusi care stimuleaza activitatea enzimelor. Acestia pot fi:
Activatori ai unor proenzime
Forma inactiva a enzimei se numeste proenzima sau zimogen, in care centrul activ al enzimei este
mascat
Prin eliminarea unei parti din molecula, centrul activ este demascat, enzima devenind activa
Proenzime sau zimogeni
Inhibitorii enzimatici
Inhibitorii enzimatici sunt compusi care influenteaza negativ activitatea enzimelor pe care o pot anula
definitiv sau temporar
Ei pot afecta situsul catalitic al enzimei sau orice alta regiune a moleculei, astfel influentand legarea
substratului de enzima
Actiunea inhibitorilor enzimatici este importanta pentru controlul proceselor biochimice, pentru a
intelege mecanismele de actiune a unor medicamente, droguri, otravuri, pentru a urmari etape dintr-un
proces metabolic.
Inhibitia enzimatica
Inhibitie reversibila, fiind determinata de compusii care interactioneaza cu enzima prin interactii
necovalente care poate fi:
competitiva
necompetitiva;
Inhibitie ireversibila
2. se datoreaza unor modificari covalente, permanente ale gruparilor functionale necesare catalizei,
transformand E in molecule inactive;
3.la inceput inhibitia este incompleta, dar creste pe masura ce apar modificarile chimice respective
Inhibitie ireversibila
Exemple de inhibitori ireversibili: substantele toxice, acidul iodacetic, metalele grele, compusii arsenicali
Acestia interactioneaza cu radicalii aa din centru activ al E, esentiali pentru structura si functia acesteia
Acidul iodacetic este inhibitor al ribonucleazei la pH=5,5; se obtine un produs alchilat al His 119 sau al
His12 si o forma in care ambele histidine sunt alchilate
Ionii metalelor grele ca Hg2+, Pb2+ sunt I irev pentru E ce contin sulf in centrul activ
Inhibitia reversibila
E+I EI
Inhibitori competitivi
I competitiv prezinta analogie structurala cu S, avand astfel afinitate pentru situsul catalitic al E
Apare o competitie intre E si S pentru ocuparea situsului catalitic. Legatura prin care se leaga I este de
aceeasi natura cu cea prin care se leaga S. Reactiile care au loc in acest caz sunt urmatoarele:
Este o inhibitie reversibila, deoarece prin cresterea [s] se indeparteaza I competitiv de la situsul catalitic,
legarea I competitiv la E fiind reversibila
Viteza de reactie atinge Vmax ca si cum I nu ar fi prezent, daca se mareste suficient de mult [S]
Exemple de I competitivi:
Succinat dehidrogenaza enzima ce transforma acidul succinic in acid fumaric, este inhibata
competitiv de acizii dicarboxilici: acid malonic, acid malic, acid oxalic, asemanatori structural cu
substratul acestei enzime;
Sulfanilaminda isi exercita actiunea bacteriostatica prin inhibitie competitiva. Sulfanilamida este
asemanatoare structural cu acidul p-aminobenzoic, pe care il poate inlocui in timpul sintezei acidului
folic de catre bacterii pentru care este factor de crestere. In lipsa acidului folic bacteriile mor.
Biosinteza prostaglandinelor este inhibata de anumiti acizi grasi, inhibitori competitivi ai acizilor cu
20 atomi de carbon folositi ca substrat.
Inhibitia uncompetitiva functioneaza cel mai bine cand [S] este mare, iar I nu tb sa fie asemanator S
Inhibitorul necompetitiv nu se leaga la acelasi situs cu substratul, nu prezinta asemanare
structurala cu acesta, deci efectul acestuia nu poate fi inlaturat prin cresterea concentratiei de
substrat
ioni sau molecule ce actioneaza la nivelul cofactorilor: CN-CO; pentru citocromi I intervin in lnatul resp.
mitoc
inhibitori ai grupelor -SH libere ale enzimei: acid iod acetic, p-clormercuribenzoat;
metale grele: argint, mercur, plumb, ce actioneaza la nivelul grupelor -SH ale enzimei;
Sunt proteine oligomere alcatuite din mai multe subunitati identice sau diferite, in numar par
Reactiile catalizate sunt endergonice si ireversibile; imprima sensul unic al cailor metabolice din
care fac parte
Intervin in prima etapa a unui lant de reactii, asigurand controlul intensitatii procesului si
ireversibilitatea lui
Fiecare monomer poseda un centru activ; fixarea S pe una din subunitati influienteaza legarea
lui pe celelalte prin fenomenul de cooperativitate
Pe langa centri activi, monomerii prezinta si centri alosterici de care se vor lega efectorii
alosterici
Efectorii alosterici sunt compusi cu masa moleculara mica, fara analogie cu S si care activeaza
reactiile enzimatice (efectori pozitivi) sau le inhiba (efectori negativi)
Efectorii alosterici sunt prezenti la locul de actiune al E variind doar concentratia lor
E alosterice sunt inhibate de produsul de reactie prin retroinhibitie sau inhibitie feedback
Efectori alosterici
Reglarea activitatii enzimatice
Trec din forma activa in inactiva si invers prin procese de fosforilare-defosforilare la nivelul
gruparilor OH ale unui rest de serina, mai rar treonina sau tirozina (nu fac parte din centrul activ)
Fosforilarea se realizeaza pe seama ATP, care transfera un singur rest de acid fosforic, cu
participarea unor kinaze
Trasnformarea inversa are loc prin hidroliza cu participarea unor fosfataze specifice
Reglarea activitatii enzimatice prin
fosforilare-defosforilare
Reglarea activitatii enzimatice prin activarea zimogenilor sau a proenzimelor la locul de actiune
(stomac, intestin subtire) sub actiune aunor factori locali (pH, enzime) sau autocatalitic
Sintetizate in forma activa, ele si-ar putea manifesta activitatea imediat, la locul de sinteza,
determinand aparitia unor boli grave
Transportul lor de la locul de sinteza la locul de actiune in forma activa ar putea avea consecinte
grave
Izoenzime
-amilaza-salivara, pacreatica
-valoarea diagnostic
LDH-3(2H2M)-in plamani
LDH-4(1H3M)-in rinichi
(H-este tipulde monomer intalnit in inima iar M este monomerul carcteristic izoenzimei hepatice
simusculare)
Enzimele intracelulare
In aceeasi celula, dar in compartimente diferite, pot exista enzime cu aceeasi specificitate de substrat
dar cu proprietati chimice si fizice diferite
-aspartat-aminotransferaza (GOT)
-malat-dehidrogenaza
-izocitrat-dehidrogenaza
-α-glicerofosfat-dehidrogenaza
↑CPK total
Electroconversie
Miopatii
Hipotiroidism
↑ASAT
Boli musculare
Boli hepatice
Infarct muscular
↑LDH
Anemiemegaloblastica
Anemiile hemolitice
Boli musculare
Staza hepatica
CK-MB
-miocardul contine MM si MB
-se normalizeaza in 3 zile-poate indica reinfarctizarea (troponina persista crescuta 10-14 zile)
Utilitatea CK-MB
TROPONINELE
-3 proteine distincte (I, C, T) exprimate in muschiul cardiac si scheletic-se pot diferentia prin tehnici
imunologice
Utilitatea troponinei
MIOGLOBINA-ms scheleticesimiocard
Dezavantaje:
COMPLEXE ENZIMATICE
-enzimele pot fi organizare in complexe enzimatice atunci cand produsul unei reactii este rapid preluat si
transformat de o alta enzima
Enzimele se pot gasi in special in alimente negatite precum:germenii de grau, laptele de vaca crud
(tolerat numai de cei cu ficat sanatos), galbenusul de ou de gaina, sucurile de legume, legumele si
zarzavaturile tinere, afinele, caisele, ceapa, ciresele si visinele, coacazele negre, morcovii, prunele,
rosiile, salata verde, sfecla rosie, spanacul, usturoiul, mierea, lucerna( care contine 8 enzime esentiale),
carnea si pestele etc. Aceste substante au un rol foarte bine determinat, fiecare actionand asupra unui
anumit component din alimente, neputandu-se inlocui un ape cealalta. Prin urmare, o cantitate
insuficienta sau absenta unei singure enzime poate determina imbolnavirea.
BOLI METABOLICE
-sunt numeroase boli metabolice, cauzate de absentaunei enzime sau functionareaproasta a unei
enzime in corpul uman.