Unele repere la rezolvarea problemelor

Maria Nicorici, conf. univ., facultatea de tiine ale naturii i Agroecologie USB Al. Russo, Bli, 2013

Important
Biologia moleculara studiaz mecanismul pstrrii i transmiterii informaiei ereditare. Problemele pentru acest capitol sunt caracteristice pentru dou tematici: acizii nucleici i codul genetic

Tipuri de probleme Determinarea consecutivitii nucleotidelor n ADN, ARN-i, anticodonii ARN-t, utiliznd principiul complementaritii. Calcularea numrului de nucleotide, raportul procentual n catena de ADN Calcularea numrului de legturi de hidrogen n catenele de ADN i ARN-i Determinarea lungimii i masei ADN i ARN-i Determinarea consecutivitii aminoacizilor conform tabelei codului genetic Determinarea masei ADN, genei, proteinei i numrului de aminoacizi, nucleotide Combinate

Exigene obligatorii n rezolvarea problemelor

Algoritmul rezolvrii va corespunde consecutivitii proceselor ce se realizeaz n celul; Rezolvare contient, fiecare aciune confirmat teoretic; nscrierile se efectueaz cu acuratee, catenele ADN, ARN-i, ARN-t se pun orizontal pe-o linie dreapt, simbolurile nucleotidelor bine determinate; Catenele ADN, ARN-i, ARN-t se plaseaz ntr-un rnd fr a fi transfer dintr-un rnd n altul; Rspunsurile la ntrebri se fixeaz la sfritul rezolvrii.

ADN Dou catene

ARN O singur caten

Structura nucleotidelor 1. dezoxiriboza (glucid) 1. riboza (glucid)

2. restul acidului fosforic

3. bazele azotate: - adenina G guanina C citozina - timina

2. restul acidului fosforic

3. bazele azotate : - adenina G guanina C citozina U-uracil

A-T; C-G Principiul complementaritii A-U, C-G ntre bazele azotate persist legturi de hidrogen = duble , G C triple

Regula Ceargaf =, G=C +G = +C ( 100% n ( 100 % ntr-o singur caten) dou catene

*baze azotate : 1. Purinice , G Funcii: pstrarea i transmiterea informaiei ereditare *** Catena de ADN: 1. diametrul (grosimea) - 2 (20A) 2. pasul unei elice (10 perechi de nucleotide) - 3,4 (34A) 3. distana dintre 2 nucleotide - 0, 34 (3,4A) 4. masa ADN - 610-12

2. Pirimidinice C, ,U Tipuri de ARN i funciile lor: 1. ARN-i (m) 5%, copiaz informaia de pe ADN i o transfer la ribozomi; 2. ARN-t 10%, transport amc; 3. ARN-r 85%, parte component a ribozomilor

Categoria 1 de probleme: stabilirea consecutivitii nucleotidelor n ADN, ARN-i, anticodonii ARN-t

O poriune de caten a moleculei de ADN posed urmtoarea consecutivitate a nucleotidelor: C----CC----G---G--G. Determinai consecutivitatea nucleotidelor ARN-i. Se d: ADN: C----C-C----G---G--G REZOLVARE: (nucleotidele ARN-i sunt selectate dup principiul complimentaritii fa de ADN: -U, G-C) ADN-I: C C C G G G ARN-i: G U U G G U U C C U C Rspuns: ARN-i posed urmtoarea consecutivitate a nucleotidelor

 n fragmentul moleculei de ADN cu urmtoarea consecutivitate a nucleotidelor: G-C-C-T-A-C-T-A-A-G-T-C. Determinai consecutivitatea nucleotidelor n ARN-i i anticodonii moleculei de ARN-T
Se d: ADN: G-C-C-T-A-C-T-A-A-G-T-C. Rezolvare: (nucleotidele se selecteaz dup principiul complementaritii -U, G-C sub ADN punem ARN-i, apoi ARN-t) ADN: G-C-C- - - C- - - - G-- C ARN-i: C-G -G-A-T- G- A- U-U-C- - G ARN-t: G-C-C- U- -C U- - G-U - C Rspuns: ARN-i are urmtoarea consecutivitate a nucleotidelor: C-G -G-A-T- G- A- U-U-C- - G Anticodonii ARN-t sunt: GCC.UC.U.GUC

Categoria a 2-a de probleme: calculul numrului de nucleotide i raportul lor % n catenele de ADN i ARN-i

Problema: n molecula de ADN nucleotidele cu T =22%. Determinai cantitatea % a nucleotidelor A, G, C n parte pentru molecula de ADN. Se d: -22% De aflat: % , G, C-? Rzolvare 1: Conform regulei CEARGAF +G = T+C, toate nucleotidele n ADN constituie 100%. deoarece T (timina) este complementar adeninei, reiese c, =22%. 22+22=44% ( +) 100- 44 =56% (G+C) deoarece guanina este complimentar citozinei, atunci cantitatea lor la fel este egal: 56 : 2 =28% (G, C) Rezolvare 2: Conform regulei CEARGAF +G = T+C, toate nucleotidele n ADN constituie 100% sau +G i +C cte 50 % deoarece T (timina) este complementar adeninei, reiese c, =22%, i consecutiv, 50 22 = 28% (G, C, deoarece sunt complimentare) Rspuns: =22%, G=28%, C=28%

 PROBLEMA: determinai cte nucleotide A, T, G se conin n molecula de ADN, dac n fragment au fost depistate 1500 nucleotide C, care constituie 30% din numrul total al nucleotidelor n acest fragment de ADN? Se d: C- 30% = 1500 nucleotide De determinat: numrul nucleotidelor: , , G -? Rezolvare: Fiindc C este complementar G, cantitativ ele sunt egale, atunci G=30% ce constituie 1500 de nucleotide. Conform regulii +G = +C, toate nucleotidele n ADN constituie 100% +G i +C cte 50 % corespunztor 50-30=20% (, ). Facem proporia: 30% - 1500 20% - ? 20X1500:30 = 1000 nucleotide (, ) Rspuns: n fragmentul moleculei de ADN se conin: G =1500 nucleotide, =1000 nucleotide, =1000 nucleotide.

Problem: o secven a unei catene de ADN conine: 150 nucleotide , 50 nucleotide , 300 nucleotide C, 100 nucleotide - G. Determinai: numrul de nucleotide n catena a doua cu , , G, C i cantitatea total a lor , , C, G n ambele catene a ADN. Se d: nucleotidele n 1 caten ADN: -150, -50, C-300, G-100. DE AFLAT: , , C, G n dou catene a ADN. Rezolvare: =, G=C, deoarece sunt complementare n catena a doua: -150, -50, G-300, C-100 Total nucleotide: (150+50)+(50+150)+G(300+100)+C(100+300)=1200 Rspuns: 1.nucleotide n catena a doua:-150, -50, G-300, C-100; 2. n dou catene sunt 1200 de nucleotide.

 Problem: ARN-i conine: A - 28%, G-16%, U- 24%. Determinai % nucleotidelor n dou catene a moleculei de ADN, informaia creia a fost copiat pe ARN-i Se d: nucleotide n ARN-i: -28%, U-24%, G-16%. De aflat: % , , C, G N ADN. Rezolvare: Determinm coninutul % al citozinei n ARN-i, considernd, c suma tuturor nucleotidelor n ARN-i constituie 100%: 100 - ( 24+28+16) = 32% (C) innd cont de principiul complementaritii ( =, U=, G=C, C=G), calculm % nucleotidelor n catena adn de pe care a fost scris informaia pe ARN-i. suma tuturor nucleotidelor n dou catene de ADN este egal cu 100%: =28:2=14%, G= 32:2=16%, =24:2=12%, C=16:2=8% Catena a doua de ADN este complementar primei, Prin urmare, cantitatea % a nucleotidelor n ea este urmtoarea: =14%, C=16%, =12%, G=8% n ambele catene de ADN coninutul % de nucleotide va fi: = 12+14=26%, = 14+12=26%, G=16+8=24%, C= 8+16=24% Rspuns: n dou catene de ADN % nucleotidelor: -26%, -26%, G24%, C-24%

Categoria a 3-a: calculul numrului legturilor de hidrogen ntre bazele azotate

Problem: dou catene de ADN sunt legate prin legturi de hidrogen. Determinai cantitatea legturilor de hidrogen n aceast poriune de ADN, dac este cunoscut c nucleotide adenilice - 12, iar guanilice - 20. Se d: -12, G-20 De calculat: numrul legturilor de hidrogen n ADN -? Rezolvare: =, G=C, deoarece sunt complementare ntre i sunt prezente legturi duble, prin urmare 122=24 legturi ntre G i C sunt prezente legturi triple de hidrogen, prin urmare 203=60 legturi total legturi de hidrogen: 24+60 = 84 Rspuns: 84 legturi de hidrogen.

Categoria a 4-a de probleme: determinarea lungimii moleculei de ADN i ARN-i(m)

Problema 1: O poriune a moleculei de ADN const din 60 perechi de nucleotide. Determinai lungimea acestei poriuni de ADN, dac distana dintre nucleotide n ADN este de 0,34 nm. Se d: 60 perechi nucleotide De determinat: lungimea poriunii Rezolvare: lungimea = 0, 34 nm 600,34= 20,4 n Rspuns: 20,4 n Problema 2: Lungimea moleculei de ADN constituie 510n. Determinai numrul perechilor de nucleotide n acest segment. Se d: lungimea segmentului de ADN 510n De determinat: numrul perechilor de nucleotide Rezolvare: lungimea nucleotidei = 0, 34 nm , deci, 510:0,34 = 1500 de nucleotide Rspuns: 1500 de nucleotide

 Problema 3. Numrul nucleotidelor n catena de ADN este egal cu 100. Determinai lungimea acestei poriuni. Se d: 100 de nucleotide De calculat: lungimea poriunii Rezolvare: lungimea nucleotidei = 0, 34 n, dac ADN const din 2 catene, atunci pentru o caten - 50 perechi nucleotide. 500,34=17n Rspuns: 17n Problema 4. Numrul nucleotidelor n catena de ARN-i este egal cu 100. Determinai lungimea acestei poriuni. Se d: 100 de nucleotide De calculat: lungimea poriunii Rezolvare: lungimea nucleotidei = 0, 34 n, deoarece ARN-i const dintr-o singur caten. 1000,34=34n Rspuns: 34n

Probleme la: Biosinteza proteinei i a codului genetic

Pe o poriune ADN se construiete ARN-i
ARN-i trece n citoplasm ARN-i se unete cu ribosoma (2 triplete) ARN-t transport aminoacidul n CFR Codonul ARN-i este complementar anticodonului ARN-t

n CFR din aminoacizi se sintetizeaz protein ADN-ARN-PROTEINA 20 aminoacizi - 64 triplete ADN- ARN-i ARN-t 3 nucleotide =1 triplet =1 aminoacid = 1ARN-t

Categoria a 5-a de probleme determinarea consecutivitii amc conform codului genetic Problem 1: n catena de ADN consecutivitatea nucleotidelor este urmtoarea: GGGGG.. Determinai consecutivitatea nucleotidelor pe ARN-i, anticodonii ARN-t i aminoacizii din acest fragment a moleculei de protein. Se d: ADN: GGG de calculat: ARN-i, ARN-t i consecutivitatea aminoacizilor n protein Rezolvare: pe poriunea de ADN dup principiul complementaritii (-U, GC) construim ARN-i, apoi de la catena de ARN-i determinm ARN-t conform principiului de complementaritate ( -U, G-C) ADN : GGGGG ARN- i: CCUCCUCU ARN-t: UGGGUGGUUA imaginar mprim catena ARN-i n triplete i dup codul genetic determinm consecutivitatea amc n molecula de protein: ACC-TRE, UCA-SER, CUC-LEI, AU-ASP. Rspuns : a. ARN- i: CCUCCUCU b. ARN-t: UGGGUGGUUA c. consecutivitatea amc n molecula de protein: tre, ser, leu, asp

 Problema 2. n mol de ADN: GG -CC--GC-C Determinai consecutivitatea nucleotidelor corespunztoare segmentului ARN-i. Determinai consecutivitatea amc n polipeptid, sintetizat pe ARN-i. cum se va schimba consecutivitatea amc n polipeptid , dac n rezltatul mutaiilor al 5-a nucleotid din ADN este schimbat n adenin? Explicai rspunsul. Se d: ADN: GG -CC--GC-C DE determinat: consecutivitatea amc n polipeptid pn la i dup mutaie Rezolvare: determinm ARN-i dup principiul complementaritii ADN: GG -CC--GC- C ARN-i: CCU- UGG-UU-CG-GUU DUP TABELA codului determinm amc n protein: pro, trip, tir, gli, val n rezultatul mutaiei din ADN nucleotidul 5 va fi schimbat cu adenin. ADN: GG - C--GC- C ARN-i: CCU- UUC-UU-CG-GUU Dup tabela codului genetic determinm consecutivitatea amc n proteina modificat: pro, lei, tir, gli, val, Rspuns: pro, trip, tir, gli, val; pro, lei, tir, gli, val, deoarece s-a schimbat nucleotidul n ADN s-a schimbat nucleotidul n ARN-i i consecutiv s-a schimbat amc i structura proteinei.

 Problem 3. E tiut c toate tipurile de ARN se sintetizeaz pe matricea ADN. Fragmentul moleculei de ADN pe care se sintetizeaz bucla principal a moleculei de ARN-t are urmtoarea consecutivitate a nucleotidelor: GCGCGGC. Determinai consecutivitatea nucleotidelor a ARN-t, care se sintetizeaz pe aceast poriune, i aminoacidul, pe care l va transporta acest ARN-t n procesul de biosintez a proteinelor, dac al treilea triplet corespunde anticodonului ARN-t. Se d: ADN: GCGCGGC De determinat: 1. consecutivitatea nucleotidelor n ARN-t - ? 2. aminoacidul, pe care -l va transporta acest ARN-t n procesul de biosintez a proteinelor - ?

 Rezolvare: Deoarece ARN-t se sintetizeaz pe ADN, atunci construim dup principiul complimentaritii ARN-t (A-U, G-C) ADN: G C G C G G C ARN-t: U U C G C U U G C C U G Tripletul trei ( anticodonul ARN-t) CUU, corespunde codonului pe ARN-i G (dup principiul complementaritii), acestui codon conform tabelului codului genetic i corespunde aminoacidul glutamina, pe care l transport ARN-t. Rspuns: ARN-t: UUCGCUUGCCUG Aminoacidul: GLU

Categoria a 6-a de probleme determinarea masei proteinei, numrul de aminoacizi i nucleotide

Problema 1. O secven a moleculei de ADN conine 1230 resturi de nucleotide. Ci amc vor intra n compoziia proteinei? Se d: 1230 de nucleotide De calculat: numrul de amc Rezolvare: Un amc este format din 3 nucleotide, de aceea 1230:3= 410 amc. Rspuns: 410 mc. Problema 2. Cte nucleotide va conine gena ce codific proteina din 210
amc?

Se d: 210 mc De calculat: numrul de nucleotide Rezolvare: Un amc este format din 3 nucleotide, de aceea 2103=630 de nucleotide Rspuns: 630 de nucleotide

 Problema 3: determinai numrul de amc din protein, numrul tripleilor i al nucleotidelor genei, care codific proteina, dac n procesul translaiei au participat 30 molecule de ARN-t. Se d: 30 ARN-t De calculat: numrul amc, tripleilor i al nucleotidelor genei Rezolvare: 1ARN-t = 1 mc, de - aceea amc sunt 30 1 mc = 1 triplet, de - aceea triplete sunt 30 1 triplet = 3 nucleotide, de-aceea 303=90 nucleotide. Rspuns: mc 30, triplete 30 i 90 de nucleotide.

 Problema 4: masa molecular a polipeptidului = 40000. Determinai lungimea genei, dac masa molecular a unui amc este egal n mediu cu 100, iar distana dintre dou nucleotide n catena de ADN este 0, 34 . Se d: msa proteinei 40000, masa amc - 100, distana dintre dou nucleotide - 0,34 De calculat: lungimea genei Rezolvare: Deoarece proteina (polipeptidul) const din amc, calculm numrul de aminoacizi 40000:100=400 1 amc = 3 nucleotide, 4003=1200 de nucleotide Gena const din nucleotide. Lungimea genei: 12000,34=408nm Rspuns: Lungimea genei 408nm.

Probleme combinate
Problem: proteina const din 100 mc. Determinai de cte ori masa molecular a genei, care codific proteina, depete masa molecular a
proteinei, dac masa molecular a amc n mediu este 100, iar a nucleotidei 300. Se d: 100 mc, masa molecular a amc-110, masa molecular a nucleotidei 300.

De calculat: de cte ori masa gene depete masa proteinei Rezolvare: deoarece gena-este o poriune de ADN, format din nucleotide, atunci, determinm numrul lor: dac 1 amc = 3 nucleotide, atunci 1003=300 nucleotide. Masa molecular a proteinei: 100110=11000, Masa molecular a genei: 300300=90000 Masa molecular a fragmentului de gen, care codific aceast protein, depete masa molecular a proteinei: 90000 : 11000 = 8 ori Rspuns: de 8 ori

 Problem: ce lungime are molecula de ADN, n care se afl informaia structurii primare a insulinei. Molecula de insulin conine 51 amc, iar un nucleotid ocup 0,34 nm n catena ADN? Cte molecule de ARN-t este necesar de a transporta amc la locul de sintez? (este necesar a ti c 1 ARN-t transport ctre CFR iiun amc). Argumentai rspunsul. Se d: 51 mc, 1 nucleotid - 0,34 nm De calculat: lungimea ADN, numrul de ARN-t 1) pentru codificare a 1 amc sunt necesare 3 nucleotide, 51 3 = 153 nucleotide; 2) fragmentul ADN are lungimea 0,34 153 = 52 nm, 3) un ARN-t transpotr un amc, deaceea ARN-t 51 molecule Rspuns: lungimea ADN - 52 nm, numrul ARN-t - 51

Diviziunea celulei Mitoza

Interfaza

2n2c 2n4c
2n4c 2n4c 2n2c 2n2c

6 . 10 -9 g 12 . 10 -9 g 12 . 10 -9 g 12 . 10 -9 g 6 . 10 -9 g 6 . 10 -9 g

Profaza Metafaza nafaza lofaza

Diviziunea celulei Meioza

Interfaza 2n2c 2n4c 6 . 10 -9 g 12 . 10 -9 g

Profaza 1
tafaza 1 nfaza 1 lofaza 1

2n4c
2n4c n2c n2c

12 . 10 -9 g
12 . 10 -9 g 6 . 10 -9 g 6 . 10 -9 g

Profaza 2
tafaza 2 nafaza 2 lofaza 2

n2c
n2c nc nc

6 . 10 -9 g
6 . 10 -9 g 3 . 10 -9 g 3 . 10 -9 g

 Problem: masa molecular a tuturor moleculelor de ADN n cei 46 de cromozomi a unei celule somatice umane constituie aproximativ 6 . 10 -9 mg. Determinai cu ct este egal masa tuturor moleculelor de ADN din nucleu n timpul ovogenezei nainte de diviziune, la sfritul telofazelor I i II a meiozei. Explicai rezultatele obinute. Se d: 46 de cromozomi = masa 6 . 10 -9 mg De calculat: masa ADN: nainte de a ncepe diviziunea, la sfritul T I i II. Rezolvare: 1) nainte de diviziune n procesul replicaiei ADN se dubleaz i masa este egal cu: 2 6 . 10 -9 = 12 . 10 -9 mg; 2) prima diviziune a meiozei este reducional, numrul cromozomilor se micoreaz de 2 ori, ns fiecare cromozom const din dou molecule de ADN (cromatide surori), prin urmare n telofaza I a meiozei masa ADN este urmtoarea: 12 . 10 -9 : 2 = 6 . 10-9 mg; 3) dup meioza II fiecare nucleu conine un set haploid de cromozomi, formai dintr-o singur cromatid (sau cromozomi monocromatici, haploizi), deci, prin urmare masa ADN n Telofaza II este egal cu: 6 . 10-9 : 2 = 3. 10-9 mg. Rspuns: masa ADN nainte de diviziune = 12.10 -9 mg, la sfritul T-I = 6.10-9mg, la sfritul T-II = 3.10-9mg.

Schimbul energetic
1. etapa pregtitoare (n tractul digestiv, lizosomi): substanele compuse sub influena fermenilor digestivi se scindeaz n substane simple cu eliminare de cldur: proteinele aminoacizi; lipidele- glicerin, acizi grai; amidonul-glucoza. 2. etapa anaerob glicoliza ( n hialoplazm) nu este legat de membrane, fermentativ; scindeaz glucoza: cu formarea a 2 C3H6O3 (acid lactic) + 2P 3. etapa aerob (hidroliza) se realizeaz n mitocondrii, membrana intern, cu participarea fermenilor, scindrii este supus acidul lactic: 2 C3H6O3 + 6O2 - 6CO2 + 36ATP 1 glucoz = 38 P (I etap - 2ATP + a II etap - 36ATP)

1)

Problema: n procesul glicolizei s-au format 42 molecule de acid piruvic. Cte molecule de glucoz au fost supuse scindrii i cte molecule de ATP se vor forma la oxidarea completa? Se d: 42 molecule acid piruvic De calculat: cantitatea de glucoz i de ATP n cadrul oxidrii complete. Rezolvare: n timpul glicolizei 1 molecul de glucoz scindeaz formnd 2 molecule de acid piruvic, prin urmare glicolizei au fost supuse: 42 : 2 = 21 molecule; 2) n timpul hidrolizei se formeaz 38 molecule ATP (2 ATP+36ATP); 3) n timpul oxidrii a 21 de molecule se formeaz: 21 38 = 798 molecule de ATP. Rspuns: 21 molecule glucoz, 798 molecule de ATP.

 Mulumec de atenie! Baft la rezolvarea problemelor! Nu ncetai s rezolvai probleme la orele Dvs.