Secolul XIV a fost marcat de un nou scandal în Biserica Apusului. După
moartea papei Benedict al XI-lea în 1304 ca papă a fost ales un cardinal francez Clement al V-lea (1304-1314) primul papă francez. Spre deziluzia tuturor în loc să se îndrepte spre Italia s-a hotărât să se înscăuneze la Lyon. Cu acest prilej l-a invitat aici pe regele Franţei Filip al IV-lea cel Frumos şi pe regele Angliei. După festivităţi el uită să plece la Roma şi îşi stabileşte reşedinţa la Bordeaux, apoi la Poitiers, apoi din 1309 la Avignon. Din 1309 pâna în 1378 reşedinţa papală s-a aflat la Avignon. Istoricii apuseni compară această perioadă cu perioada în care evreii s-au aflat în robia babilonică. Clement al V-lea a fost un om corupt şi a reuşit să risipească fondurile Cruciadelor în buzunarele rudeniilor sale. Pentru a-şi consolida poziţia mai numeşte încă zece cardinali dintre care nouă erau francezi. Tot el reuşeşte să desfiinţeze ordinul călugăresc al templierilor pentru a-i face pe plac regelui Filip, iar pe conducătorul acestora Jaques de Molary îl arde pe rug (mai târziu din rândul templierilor s-a format Adunarea Cavalerilor de la Malta rezultând mai apoi francmasoneria). După moartea lui Clement al V-lea vreme de doi ani Scaunul Papal a rămas vacant. Din cei 23 de cardinali care alcătuiau Consistoriul electoral adunat la Lyon 8 erau italieni, 1 spaniol şi restul francezi. Aceşti 8 doreau să fie ales un papă italian care să se întoarcă la Roma. Pâna la urmă biruie majoritatea franceză care pe 7 august 1316 îl aleg ca papă pe Ioan al XII-lea tot un francez, care păstoreşte până în 1334. Acest papă intră în conflict cu regele Ludovic Bavarezul urmaşul lui Filip al IV-lea al Franţei şi Ludovic îl declară pe Ioan al XII-lea depus alegându-l în 1318 ca papă pe Nicolae al V-lea. Prin această dublă alegere papalitatea a căzut în disgraţia poporului, ba chiar şi Ludovic cade şi după doi ani este obligat să-l alunge pe Nicolae al V-lea care părăseşte Franţa şi se instalează la Roma jucând rolul unui papă fără biserică până în 1330. Ioan al XII-lea revine la Avignon, iar după moartea sa este ales ca papă Benedict al XII-lea (1334-1342). Acesta a fost un om lipsit de tact politic şi adânceşte conflictul cu regele Ludovic. Nici urmaşul său Clement al VI-lea (1342-1352) nu s-a lasat mai prejos, iubitor al fastului şi luxului, a fost un rob supus regelui Franţei. El a înăsprit legile fiscale papale şi astfel ura poporului a crescut foarte mult. La moartea lui Clement al VI-lea a fost ales Inocenţiu al VI-lea (1352- 1362). Acesta a fost un om curat din punct de vedere moral şi a încercat să repare ce au stricat înaintaşii săi. Ar fi vrut să organizeze o Cruciadă împotriva turcilor, şi a încercat să înlăture abuzurile de la curtea papală şi a visat la unirea celor două Biserici. Moare fără a realiza ceva.