Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
ştiinţifice
Anton Pann
Procesul cercetarii
Metoda stiintifica stiintifice
Identificarea problemei Selectarea ariei de interes
6
Interpretarea
datelor rezolva
problema: 4
confirma sau Cercetarea
5 da solutii
respinge Analiza datelor in
ipotezele: prin ipoteze
functie de ipoteze:
Alte probleme colectarea si
organizarea datelor
1
Tipuri de cercetare
1. masurarea variabilelor
2.Deductia si Sansa
Inductie si deductie
3.Evaluarea si Probabilitatea
4.Ipoteza
Teoria ghideaza cercetarea
Care este problema de
cercetat
Care sunt conceptele sau
variabilele de lucru
Ce rezultate ar trebui sa se
obtina
Ordinea
Metoda stiintifica utilizeaza observatia organizata
a entitatilor sau evenimentelor care sunt
clasificate sau ordonate pe baza proprietatilor si
a comportamentelor comune
O afirmatie sau o concluzie trebuie sa fie acceptata deoarece una sau mai
multe alte afirmatii sau premize (dovezi) sunt adevarate
proiectului in cercetare, =
studii analitice:
Design ABAB
Test, tratament, test, tratament
Design serial în timp
Stabileşte o linie de bază
Începe tratamentul
Măsoară rezultatele tratamentului
Design cu linii de bază multiple
Obţine un număr de linii de bază diferite
Fiecare linie de bază trebuie să fie independentă de altele
Tratează doar o variabilă odată
Etape proiect de cercetare
Faza de concepţie
1. Stabilirea TEMEI (PROBLEMA, NIŞA) de cercetat
2. Derularea STUDIULUI BIBLIOGRAFIC
3. Formularea IPOTEZEI / IPOTEZELOR
Faza empirica
5. Derularea experimentelor. Achiziţia DATELOR
Faza analitica
6. INTERPRETAREA rezultatelor
7. Formularea CONCLUZIILOR
Faza de diseminare
8. Redactarea raportului de cercetare, articol ştiinţific, teză
2
Medicina bazata pe dovezi
“este ştiinţa descoperirii, evaluării şi aplicării rezultatelor
cercetării medicale”
MBD este folosirea raţională şi judicioasă a celor mai bune
dovezi actuale din cercetarea clinică în îngrijirea fiecărui
pacient
Metode de tratament susţinute de dovezi clinice si de
cercetare.
Necesita integrarea celor mai bune dovezi din cercetare
pentru diagnostic si tratament cu experienţa clinica.
Ia in considerare ceea ce este optim pentru fiecare
pacient precum şi preferinţele acestuia.
Deciziile clinice rezultă din intersecţia celor trei
componente:
priceperea clinică (experienta clinica)
dovezile ştiinţifice (date din studii clinice)
preferinţele pacientului (accepta sau nu un anumit
tratament)
Întrebări clinice
Care este cea mai bună alegere terapeutică pentru pacientul meu?
Este acest tratament suficient de bine documentat teoretic?
Funcţionează acest program terapeutic?
Cât timp durează acest tratament?
Ce urmează după aceea?
Clinicienii...sunt extrem de utili in cercetare
Sunt în linia I a asistentei medicale
Au expertiza clinica necesara
Îşi cunosc bine pacienţii
Sunt formaţi pentru gândire ştiinţifica
Sunt obişnuiţi cu colectarea datelor
Ştiu sa identifice rezultate
Medicina bazata pe dovezi
1. Media
2. Mediana
3. Modulul
Media este o măsură deosebit de informativă a „tendinței centrale” a variabilei dacă este
raportată împreună cu intervalele sale de încredere. De obicei, suntem interesați de
statistici (cum ar fi media) din eșantionul nostru numai în măsura în care acestea sunt
informative despre populație. Cu cât eșantionul este mai mare, cu atât este mai fiabila
media sa. Cu cât variația valorilor datelor este mai mare, cu atât media este mai puțin
fiabilă.
Mediana. O măsură a tendinței centrale, mediana (termenul folosit pentru prima dată de
Galton, 1882) al unui eșantion este valoarea pentru care jumătate (50%) din observații
(atunci când sunt clasificate) se vor situa peste această valoare și jumătate va fi se află sub
această valoare. Când numărul de valori din eșantion este egal, mediana este calculată ca
medie a celor două valori medii. Când mediana și media nu sunt aceleași, se spune că
datele sunt înclinate și curba normală se va deplasa spre dreapta sau spre stânga.
Modul este valoarea care apare cel mai des în setul de date. O măsură a tendinței
centrale, modul (termenul folosit pentru prima dată de Pearson, 1895) al unui eșantion
este valoarea care apare cel mai frecvent în eșantion.
Deviație standard. O măsură statistică a tendinței centrale, care este distanța medie pe
care un element de date se află probabil de la media setului de date.
Interval de încredere (CI)
Interval de încredere (CI)
Intervalele de încredere pentru statistici specifice (de
exemplu, mijloace sau linii de regresie) ne oferă o
gamă de valori în jurul statisticii în care statistica
„adevărată” (populație) se poate aștepta să fie
localizată (cu un anumit nivel de certitudine)
Sensibilitate, Specificitate
sensibilitate Pacienti Pacienti fara
cu boala boala
= a / (a+c)
Test
pozitiv
a b
specificitate Test
= d / (b+d) negativ
c d
sensibilitate = probabilitatea unui test pozitiv la pacienții cu
boală
Nivelul 1.
1.a. Sinteză sistematică a unor studii clinice randomizate (RCT)
1.b. Studiu clinic randomizat (RCT).
1.c. Studiu tip “toţi sau niciunul” (serie de cazuri: înaintea existenţei acestui
tratament mureau toţi pacienţii, acum mai scapă unii, sau înaintea existenţei
acestui tratament unii pacienţi mureau, acum scapă toţi).
Nivelul 2.
2.a. Sinteză sistematică a unor studii de cohortă.
2.b. Studii de cohortă individuale (sau RCT de calitate slabă, de exemplu cu
urmărire < 80%).
2.c. Studii ecologice.
Nivelul 3.
3.a. Sinteză sistematică a unor studii caz-martor.
3.b. Studiu caz-martor individual.
Nivelul 4: Serii de cazuri (sau studii de cohortă ori caz-martor de calitate slabă).
Aleator (randomizare)
Problematica clinica
Beneficiul minim semnificativ clinic (diferenta dintre
mediile celor doua tratamente)
Variabilitatea de raspuns a subiectilor
Numarul de subiecti
Riscul de tip I
Riscul de tip II
Stabilirea populatiei tinta
Ipotezelor de lucru
Obiective
Structura studiu
Alegerea esantionului de
studiu
tiparite / pe hartie
Electronice
Prin esantionare
In functie de durata
studiului
Transversala – se colecteaza la un moment dat
Fiabile
Valide
Sensibile
Specifice
Universale
Fără erori
Fiabilitate
Indiferent de tehnician/operator
Fals-pozitivi:
Fals-negativi:
Subiecţii bolnavi, prezentaţi ca sanatosi.
Obtinerea datelor fara erori
Variabile nominale
1. Variabile de tip categorii (sex, status marital,
religie, rasa, naţionalitate)
2. Variabile Binare, Bimodale sau Dihotomice
(întrebări la care se da raspuns prin Da/Nu,
mort/viu, prezent/absent, etc)
Tipuri de variabile
Variabile ordinale
Variabile clasificate in mai mult de doua categorii,
intre care exista o ordine naturala (evolutia,
clasificari, stadializari, etc)
Variabile din protocolul de studiu
¨ independente
¨ dependente
¨ intermediare
¨ de confuzie
Variabila Independentă
• Caracteristica pentru care se face o măsurătoare
care influenţează un eveniment sau rezultat
(variabila dependenta, efectul).
1. Tabel de frecventa
2. Histograma de frecventa
3. Histograma de frecventa relativa
4. Histograma
5. Poligon de frecventa
6. Poligon de frecventa relativa
7. Grafic cu coloane
8. Grafic “placinta”
9. Tabel “ Trunchi cu ramuri”
10.Box plot
Variabile nominale
Tabele de frecventa
Grafice: bare, placinta
Modul (cel mai frecvent)
Variabile ordinale
142 1 1 1/94=0.001
147 1 2 1/94=0.001
148 1 3 1/94=0.001
149 1 4 1/94=0.001
151 1 5 1/94=0.001
152 1 6 1/94=0.001
153 1 7 1/94=0.001
154 2 9 2/94=0.002
155 2 11 2/94=0.002
156 6 17 6/94=0.006
157 4 21 4/94=0.004
158 5 26 5/94=0.005
159 4 30 4/94=0.004
160 10 40 10/94=0.10
161 8 48 8/94=0.085
162 5 53 5/94=0.005
163 6 59 6/94=0.006
164 5 64 5/94=0.005
165 5 69 5/94=0.005
166 6 75 6/94=0.006
167 10 85 10/94=0.10
168 2 87 2/94=0.002
169 3 90 3/94=0,003
170 4 94 4/94=0,004
Grafic de frecventa tip modul
3
Freq.
2
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8
Grafic tip placinta
Variabile cantitative
Masura tendintei centrale (media, mediana, modul)
Masura dispersiei (deviatia standard, varianta)
Distributia normala / non-normala
BOX - PLOT
DE CE NE INTERESEAZA
TIPUL DE VARIABILA?
Metode de colectare
2. Colectare Sistematica
3. Colectare Stratificata
H1 = ipoteza alternativa:
ß + puterea = 100% ⟹
sunt complementare
(crescînd puterea, scădem probabilitatea de a
face o eroare de tip II şi invers).
Daca consideram experimentul (studiul) ca pe un test
prin care vrem să vedem dacă un tratament este sau
nu eficient avem urmatoarele caracteristici:
α ?= rata fals pozitivilor
(100% - α) = specificitatea
puterea = sensibilitatea (100% - ß)
ß ?= rata fals negativilor
RRR = RAR / ev in control (placebo) x 100 = 20/40 x 100 =0,5 x 100 = 50%
NNT (numarul de pacienti necesar a fi tratati) =
100/RAR, reprezinta numarul de pacienti necesar a
fi tratati pentru ca unul dintre ei sa obtina un
beneficiu
RRR = RAR / ev in control (placebo) x 100 = 20/40 x 100 =0,5 x 100 = 50%
Hipolipemiant Placebo
Supravietuitori Decedati Supravietuitori Decedati
998 (99,8%) 2 (0,2%) 997 (99,7%) 3 (0,3%)
RRR = RAR / ev in control (placebo) x 100 = 0,1/0,3 x 100 =0,333 x 100 = 33,3%
NNT = 100/RAR = 100/0,1 = 1000 barbati trebuiesc tratati timp de 5 ani ca sa supravietuiasca unul
RRR de 33,3% suna fantastic! …. Dar, pentru 1 supravietuitor la 5 ani trebuiesc tratati degeaba
999 de pacienti !!!
NNT ne ofera informatii despre:
Ce tratament?
Care sunt efectele adverse?
Care este costul?
(p=0,21)
Numar pacienti: 20 in fiecare brat
Pentru unul dintre brate intervalul de încredere 95% fiind [-
8,3%, 28,3%] – contine cifra 0
α =0,05, dar
uneori poate vrem să obţinem un p mai mic (atunci
când investim mulţi bani într-un studiu) sau
suntem dispuşi să acceptăm un p mai mare (într-un
studiu pilot, de exemplu).
p ~ 1/marimea esantionului.
4. Ce eroare de tip II ne
asumăm
cît suntem de dispuşi să ratăm evidenţierea unei
diferenţe care există în realitate
β =< 20%
puterea ≥ ?80%
β = ~ 1/marimea esantionului
puterea ~ marimea esantionului
5. De cât timp şi bani dispune cel
care face (sponsorizează) studiul
–http://www.cdc.gov/epiinfo/Epi6/EI6dnjp.htm
Statmate
–http://www.graphpad.com
WINPEPI
–http://www.brixtonhealth.com/pepi4windows.html
Google: “sample size”
Software pentru calcul marime esantion
Open Epi http://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main
http://www.openepi.com/OE2.3/Menu/OpenEpiMenu. /
Htm PowerSampleSize
Biomath G Power
http://www.biomath.info http://www.psycho.uni-duesseldorf.de/aap/projects/
Gpower
EpiTools epidemiological calculators.
http:/ /epitools.ausvet.com.au/content.php? Power analysis for ANOVA
page = home http://www.math.yorku.ca/SCS/Online/power
Java applets for power and sample size Statistical considerations for clinical trials and
http://home p a g e . s t a t . u i o w a . e d u / ~ r l e n t scientific experiments
h/ http://hedwig.mgh.harvard.edu/sample_size/size.html
Power/#Download_to_run_locally
Statistics calculators
StatPages http://danielsoper.com/statcalc3/default.aspx
http://statpages.org/
Laboratory animal science program
Free statistics http://web.ncifcrf.gov/rtp/lasp/intra/calculation.asp
http://www.freestatistics.info/index.php
WINPEPI (PEPI for windows)
Department of Biostatistics, Vanderbilt University http://www.brixtonhealth.com/pepi4windows.html
Charan and Biswas: Sample size calculations for different study designs, Indian
Journal of Psychological Medicine | Apr - Jun 2013 | Vol 35 | Issue 2
5
Evaluare si strategii de
masurare.
Efectul placebo.
Definirea unui fenomen de sanatate este o etapa de
cercetare pur descriptiva
1. Criterii primordiale:
- A fost alocarea pacienţilor pentru tratament aleatorie?
- A fost alocarea ascunsă?
- Au fost gupurile similare la începutul studiului?
- A fost urmărirea completă?
- Au fost pacienţii analizaţi în grupul în care au fost alocaţi (“intention-to-treat-
analysis”)?
2. Criterii secundare:
- Au fost pacienţii, clinicienii şi personalul implicat în studiu “orbi”?
- Cu excepţia intervenţiei experimentale, au fost grupurile tratate egal?
Sunt rezultatele studiului importante?
- Cât de mare a fost efectul tratamentului (risc relativ, reducerea relativă a
riscului, reducerea absolută a riscului, număr de pacienţi necesar a fi tratat)?
- Cât de precisă a fost estimarea efectului tratamentului (intervale de
încredere)?
JAKAVI Extended
15 mg or 20 mg treatment
oral BID phase
n=146
• Intermediate-2
or high-risk
MF 2-year and
• Resistant or Randomised (2:1) 3-year
refractory to, Crossover to analysis
or intolerant BAT JAKAVI
of available
treatment
• Splenomegaly
n=73
Week 48
Crossover Criteria1
(primary
• ≥25% increase in spleen volume from on-study nadir,
endpoint) which could include baseline volume or splenectomy
• Patients could cross over at any time if they had a
qualifying progression event
• BAT=best available therapy; BID=twice daily; COMFORT=Controlled Myelofibrosis Study with Oral JAK Inhibitor Therapy; JAK=Janus kinase.
• References: 1. Harrison C et al. N Engl J Med. 2012;366(9):787-798. 2. ClinicalTrials.gov 2015. Comfort-II Trial. NCT 009345.
https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT00934544
Atentie cand se face cross-over – se pierd pacientii
dintr-un brat - se pierde puterea statistica
Reducerea riscului in
studiile clinice
JAKAVI reduced the risk of death in patients with MF*
Years
No. at risk
J – 39,72% decese
BAT- 58,9% decese
JAKAVI 146 130 109 100 88 61 0
BAT
73 58 48 35 30 22 0
• CI=confidence interval; COMFORT=Controlled Myelofibrosis Study with Oral JAK Inhibitor Therapy; HR=hazard ratio;
JAK=Janus kinase.
• References: 1. Vannucchi AM et al. Haematologica. 2015;100(9):1139-1145. 2. Polverelli N et al. Abstract presented at: 21st
EHA Congress; June 9-12, 2016; Copenhagen, Denmark. Abstract P672.
Exemple de efecte surogat
Parametrii de eficienta:
≥10-4 to <10-
-2 n=1
Cumulative Survival
0,8 2
04
0,8 NR
n=4
0,6 5 0,6
15 MONTHS 69 MONTHS 48 MONTHS
0,4 0,4
0,2 0,2
0 0
0 6 12 18 24 30 36 42 48 54 60 66 72 78 0 6 12 18 24 30 36 42 48 54 60 66 72 78
Months Months
Ø Highest MRD level (≥10-2) was associated with
Ø Each increase in PB MRD level was associated
significantly shorter OS when compared with the
with significantly shorter PFS (p<0.0001).
2 lower MRD levels (p<0.0001).
*MRD was quantified by multiparametric flow cytometry (sensitivity of ≥10-4). Out of 817 patients, 290 patient samples were evaluated at final restaging.
CIT=Chemoimmunotherapy. CLL=Chronic Lymphocytic leukaemia. CT=Chemotherapy. FC=Fludarabine and Cyclophosphamide.
FCR=Fludarabine, Cyclophosphamide, and Rituximab. MRD=Minimal Residual Disease. NR=Not Reached. OS=Overall Survival. PB=Peripheral
Blood. PFS=Progression-Free Survival.
1. Böttcher S, et al. J Clin Oncol 2012; 30:980–988. 2. Hallek M, et al. Lancet 2010; 376:1164–1174.
Deep, durable response with ponatinib translates into higher
probability of increased PFS and OS, regardless of mutation
status or reason for prior TKI failure
sau
„brută” şi
„filtrată”
Restul
nu ne este de nici un ajutor în practică
studii ce conţin erori metodologice, şi din acest motiv concluziile
acestor studii au şanse mici să fie adevărate.
Surse filtrate de informatie
medicala
Evaluarea rezultatelor unui studiu
•PACIENTI
•INTERVENTIE
•COMPARATIE
•OBIECTIV(E)
•(TIMP)
Cum decidem daca sa citim
un articol?
1. daca studiul are un design corespunzator si a fost
analizat corect, daca rezultatele importante pentru
practica?