Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Curs Biochimie Generala, Anul I
Curs Biochimie Generala, Anul I
AMINOACIZI
!!! Aminoacizi – Caracteristici generale
un radical (R) a
care confera specificitate R
fiecarui aminoacid
G A V I L P H W F Y S T C M R K D E N Q
R:
R: R: R: R: R: R: R:
R: grupari hidrofobe grupari
grupari grupari contine grupare grupare Grupare grupare
alifatice Hetero-
aromatice hidroxil Sulf guanidil NH2 COOH amidica
ciclice
N Triptofan, Trp, W
NH
Histidina, His, H
NH
Prolina, Pro, P
H
N
O O
acid a-amino b-fenil propionic acid a-amino b (para hidroxi fenil) acid a-amino b-indolil propionic
propanoic; para hidroxifenil alanina
!!!
Aminoacizi proteici standard – Clasificare si Nomenclatura
OH
Tirozina, Tyr, Y
OH
OH
Treonina, Thr, T
Serina, Ser, S
O
acid a-amino b-hidroxi propionic acid a-amino b-hidroxi butiric acid a-amino b (para hidroxi fenil) propanoic;
para hidroxifenil alanina
Aminoacid aromatic
!!! Aminoacizi proteici standard – Clasificare si Nomenclatura
6 Monoamino dicarboxilici – R: contine o grupare COOH
Acid glutamic, Glu, E
Acid aspartic, Asp, D
COOH
COOH
Acizi guanidino
8 Diamino monocarboxilici – 9
monoamino monocarboxilici –
R: contine o grupare NH2
R: gruparea guanidil
> O
tei la 280 nm.
O
Din cei 20 de aminoacizi standard, 19 prezinta activitate
optica (exceptie: glicina).
>
!!! Aminoacizi proteici standard: esentiali si neesentiali
1 Esentiali (8) 2 Nesentiali (12) Sursele de aminoacizi esentiali
sunt proteinele din alimentatie
• NU pot fi produsi in organism • pot fi sintetizati in organism
• trebuie furnizati prin • esential la sugar si neesential Alimente care contin proteine
alimentatie la adult: complete:
(contin aminoacizii esentiali):
Valina (Val V) Histidina (His) ouale, pestele, carnea de gaina,
Izoleucina (Ile I) curcan, rata, vita, oaie si porc,
Leucina (Leu L) • conditional esentiali (cand branza, laptele, iaurtul si soia
Lizina (Lys K) organismul e confruntat cu o
Metionina (Met M) stare de boala, stres, etc.):
Alimentele care contin
Treonina (Thr T) Arginina (Arg) Prolina (Pro) proteine incomplete:
Triptofanul (Trp W) Cisteina (Cys) Serina (Ser) (in care lipsesc unul sau mai
Fenilalanina (Phe F) Glicina (Gly) Tirozina (Tyr) multi aminoacizi esentiali):
Glutamina (Gln) cerealele, orezul, spaghetele,
painea, fasolea, broccoli,
VIL KM ∏ • neesentiali: (DANE) cartofii si arahidele
Aceste alimente nu asigura
Alanina (Ala A) un aport adecvat de
KM
Asparagina (Asn N) aminoacizi si orice proteina
Acid aspartic (Asp D) fara unul din aminoacizii
∏ Acid glutamic (Glu E) esentiali are o valoare
biologica redusa.
!!! Aminoacizi proteici rari
Se gasesc in canitate mica in organism; incorporati in lanturile polipeptidice in urma
biosintezei proteice sau modificati dupa incorporare
Denumire: Se indica succesiv aminoacizii sub forma de radicali acil (serinil-alanil...), Ser–Gly–Tyr–Ala–Leu
de la extremitatea amino terminala (cap N-terminal) spre cea carboxiterminala Pentapeptida:
(cap C-terminal), ultimul aminoacid fiind denumit ca atare (valina). serinilgliciltirozilalanilleucina
!!! Peptide – Caracteristicile legaturii peptidice
• Legatura CO-NH este o legatura covalenta, ce poate fi reprezentata prin 2 forme de rezonanta (Izomer
I si II). In realitate, legatura CO-NH are un caracter partial de legatura dubla (hibrid de rezonata), fiind
rigida si plana.
- Lungimea legaturii simple C N este 1.45 Å (Izomer I)
- Lungimea legaturii duble C N este 1.25 Å (Izomer II) Hibrid de
- Lungimea legaturii peptidice C N este 1.32 Å (Hibrid) rezonanta Izomer II
Izomer I
• Legatura peptidica CO-NH se gaseste in acelasi plan, Izomer I: Legatura peptidica se gaseste intre carbonul carbonilic
iar carbonul CH (sau Ca) se poate roti, putand sa apara si oxigenul carbonilic; legatura dintre azotul iminic si carbon
in planuri diferite. corbonilic este simpla; Izomer II: invers.
• Conformatia catenei polipeptidice este data de - unghiul Φ: dintre Ca si N(H) (planul legaturii peptidice)
valoarea unghiurilor diedrale: - unghiul Ψ: dintre Ca si C(=O) (planul legaturii peptidice)
• Intr-o catena polipeptidica nu pot exista multe combinatii ale unghiurilor Φ si Ψ deoarece pot aparea
impiedicari sterice intre atomii implicati in legatura peptidica si gruparile laterale ale aminoacizilor.
• Gly contine doar un atom de H in catena laterala si de aceea permite mai multe valori posibile pentru
unghiurile Φ si Ψ (de aceea se gaseste adesea in locurile in care catena polipeptidica face o intoarcere
din scurt). Pro este aa cu cele mai multe constrangeri conformationale, datorita catenei sale ciclice.
!!! Peptide cu importanta fiziologica:
- unii hormoni
- unele antibiotice
- alte peptide
Glutation reductaza
GSSG + NADPH + H+ 2GSH + NADP+
Glutation Nicotinamid adenin Glutation Nicotinamid adenin
oxidat dinucleotid fosfat redus dinucleotid fosfat
(redus) (oxidat)
PROTEINE
Resturi de aminoacizi
COMPLEXITATE
SIMPLITATE
Motive structurale
Structura proteica
Complexe
- proteina-proteina
- proteina-ADN/ARN
- proteina-molecule mici (nucleotide, hem, etc.)
- proteina-ioni metalici (ex. Ca)
!!! Niveluri de organizare a proteinelor
• Structura tridimensionala
(conformatia) a proteinelor:
aranjamentul spatial al
atomilor intr-o proteina
NR STRUCTURA DEFINITIE
CRT PROTEINELOR
1 PRIMARA Ordinea resturilor de aminoacizi dintr-o catena polipeptidica.
2* SECUNDARA Aranjamentul spatial local rezultat in urma interactiilor dintre atomii de pe catena
principala a lantului polipeptidic care participa la formarea legaturii peptidice.
3* TERTIARA Aranjamentul spatial tridimensional, rezultat in urma interactiilor dintre atomii de pe
catena laterala (radicalii R) a lantului polipeptidic.
4* CUATERNARA Rezultatul interactiunii dintre catenele polipeptidice independente (cu structuri
primare, secundare, tertiare bine definite), care intra in structura aceleiasi proteine.
• Fiecare proteina are o secventa de aminoacizi unica, codificata genetic, care ii confera o
structura si o functie proprie; fiecare proteina este specifica fiecarei specii in parte, iar uneori
poate fi specifica unui organ sau tesut particular.
• Prin compararea proteinelor cu functie similara la diferite specii, se observa adesea ca au o
secventa asemanatoare de aminoacizi. Comparatia secventelor aceleiasi proteine de la diferite
specii genereaza informatii despre evolutia acestei proteine.
• Secventa unei proteine poate prezenta o anumita flexibilitate in cadrul aceleiasi specii
(polimorfism): ex. 20-30 % din proteinele umane prezinta usoare variatii ale secventei de
aminoacizi. Unele dintre aceste variatii nu au efect asupra functiei proteinei respective (mutatii
conservative): ex. inlocuirea unui aa hidrofob cu altul (Val Ile). Exista variatii de secventa, de
la modificarea unui singur aminoacid pana la deletia unui fragment polipeptidic, care afecteaza
functia proteinei respective, conducand la aparitia maladiilor genetice (mutatii
neconservative): ex. Asp Pro
Structura tridimensionala a proteinelor
2.1 Elemente cu structura secundara organizata
2.1.1. Helix
Helix de dreapta
- rotire in sensul acelor de ceasornic
2 - format din L-aminoacizi
3.613 (a-helix): intalnit la majoritatea proteinelor
Structura secundara a proteinelor
310: observat ocazional in proteine
2.1. Elemente cu structura secundara organizata
2.1.1. Helix [Helix 3.613 (a-helix)] 4.416 (Helix π): rar intalnit in proteine la capatul C-terminal.
2.1.2. b-structura pliata (Paralel/Antiparalel)
2.1.3. Bucle 2.27 (Ribbon): nu a fost observat in natura
2.1.3.1. Turns
2.1.3.1.2. b-turn 4 aa g-helix: nu a fost observat in natura
2.1.3.1.6. Hairpin 1-6 aa
2.1.3.2. Loops (Ω loops) 6-16 aa
2.2. Elemente cu structura secundara dezorganizata Helix de stanga
2.2.1. Random coil - rotire in sens invers acelor de ceasornic
- format din D-aminoacizi
1. Care sunt diferentele intre b-structura
pliata si a-helix? - Nu a fost observat la proteine
- Intalnit la polimerul artificial poliprolina, care formeaza
in solutie un helix de stanga cu 3 aa per tur de spira si
pasul helixului de 9.4.
!!! a-helix 3.613 (Linus Pauling, 1951)
Structura secundara este un aranjamentul spatial local rezultat in urma
interactiilor dintre atomii de pe catena principala a lantului polipeptidic care
Reprezentare
participa la formarea legaturii peptidice.
schematica a
a-Helixul este un element al structurii secundare organizate intalnit centrului
la majoritatea proteinelor (continutul proteinelor in a-helix variind de la helixului
0 la 100%). Este descris ca un segment de catena polipeptidica alcatuita
doar din a-l-aminoacizi care se rasuceste spre dreapta, in sensul acelor
de ceasornic (in medie cu aceleasi unghiuri Φ = -470; Ψ = -570) in jurul
unui cilindru central imaginar, dinspre care se proiecteaza spre exterior
gruparile R. Aceasta structura este stabilizata prin legaturi de hidrogen In realitate,
paralele cu axa structurii, ce se stabilesc intre oxigenul carbonilic al unui atomii din
aminoacid “n” si hidrogenul iminic al unui aminoacid “n+4”; aceste centrul
legaturi inchid bucle/ture de spira de 54 A, alcatuite din 13 atomi, 3.6 helixului se afla
aminoacizi (rezulta o distanta axiala pe aminoacid de 1.5 A). in contact
Punte de hidrogen
i i+1 i+2 i+3 i+4 i+5
*
2 3
4
5 6 8 10 11 12
7 9
13 *
1
Bucla = Tur de spira = 13 atomi = 3.6 aa = 0.54 nm (5.4 Å)
Reprezentare
Care este lungimea (in milimetri) a unui lant polipeptidic format din 100 de aminoacizi, ribbon
care formeaza o structura de tip a-helix 3.613?
!!! b-structura pliata (b-pleated sheet) 1951, Pauling & Core
b-structura pliata paralel b-structura pliata antiparalel
Structura secundara este un aranjamentul spatial
local rezultat in urma interactiilor dintre atomii de pe Catenele polipeptidice au Catenele polipeptidice au orientare
catena principala a lantului polipeptidic care participa la orientare in aceeasi directie in directii opuse
formarea legaturii peptidice. Puntile de H asemeni unor Puntile de H asemeni unor drepte
drepte concurente (se paralele
B-structura pliata este un element de intalnesc in acelasi punct)
Proteine fibrilare: fibroina, proteina
structura secundara organizata asemanatoare unei Prezinta de regula mai mult produsa de viermele de matase, are
pagini de hartie pliate ca un evantai. Poate implica de 5 segmente de catena 100% structura b-pliata antiparalela.
polipeptidica 80% din proteinele globulare au
2 sau mai multe segmente de catena polipeptidica acest tip de structura
(in medie au 6 resturi de aa), care pot fi in acelasi Segment repetitiv: 6.5 Å Segment repetitiv: 7 Å
plan sau usor rasucite una fata de cealalta. Mai putin stabila Mai stabila
Catenele adiacente pot fi paralele (cele doua
segmente prezinta capetele N in aceeasi parte), sau
antiparalele (capatul N-terminal al unui segment
corespunde capatului C-terminal al unui alt
segment). Acestea sunt stabilizate prin punti de
hidrogen perpendiculare pe axa structurii ce se
stabilesc intre oxigenul carbonilic al unui aminoacid
aflat pe o catena polipeptidica si hidrogenul iminic
al unui alt aminoacid aflat fie pe aceeasi catena
polipeptidica (intracatenar) fie pe un alt lant
polipeptidic, iar grupurile R sunt de o parte si de COOH
alta a lantului polipeptidic. NH2
!!! b-turn = b-bend = Reverse turn
• Bucla scurta, care permite catenei polipeptidice sa isi schimbe
brusc directia, formata din 4 resturi de aminoacizi (aminoacizi
formatori de b-turn: G, P), unde oxigenul carbonilic al primului
rest de aminoacid formeaza o punte de hidrogen cu hidrogenul
iminic al celui de-al patrulea rest de aminoacid. Aceste bucle
leaga adesea secvente succesive cu structura b-antiparalela. Proline
• Frecvent intalnit la suprafata proteinelor; Frecvent intalnit in
proteinele globulare
• Exista 2 tipuri mai frecvente de b-turn, care difera prin unghiurile diedrale Φ si Ψ de la nivelul catenei
polipeptidice
- tipul I: cel mai frecvent si contine adesea in pozitia 2 Pro
- tipul II: contine adesea in pozitia 3 Gly
b-turn/b-Hairpin
Hairpin
• este un tip special de “turn”, alcatuit din 1-6 resturi de
aminoacizi
• conecteaza elemente de structura secundara ce
interactioneaza intre ele:
Ex. b-Hairpin = bucle (ce pot fi de tip a/b/g/d/p-turns)
care conecteaza elemente de tip b-structura pliata
antiparalela (poate contine bucle de tip b-turns, cu 4
resturi de aa)
!!! Loop = Ω loop
• Contin aproximativ 6-16 resturi de aminoacizi, a caror lungime totala este mai mica de 10 Å
si fac legatura intre 2 elemente de structura secundara.
• Frecvent intalnite la suprafata moleculei proteice, pentru a participa la interactia dintre
proteine si alte molecule
• La nivelul acestor regiuni se gasesc uneori situsurile de legare a ionilor metalici si centrele
catalitic active ale enzimelor
Loops
!!! Elemente cu structura secundara dezorganizata Random coil
• Elemente fara o structura secundara organizata, localizate de regula la capetele N- sau
C- terminale, dar se pot gasi si in interiorul lantului polipeptidic.
• Pot fi reprezentate de secvente cu radical R ionizat la pH fiziologic (ex. resturi de aa cu
caracter acid, uneori repetitive)
• Au o flexibilitate mare in solutie
• Rol:
• asigura miscarea unor regiuni adiacente
• poate trece, in anumite conditii, de la forma dezorganizata la o forma organizata,
pentru a exercita o anumita functie biologica
• in anumite conditii pot lega o molecula specifica, avand o forma dezorganizata in
absenta ligandului si o forma organizata in prezenta acestuia
Random coil
• din aceasta categorie face parte familia • Evidentiat pentru prima data in structura
factorilor de transcriptie cu motiv Helix-Loop- parvalbuminei.
Helix cu aminoacizi bazici (basic Helix-Loop- • Acest motiv este numit si “EF hand” dupa
Helix = bHLH) helixurile E si F din structura parvalbuminei care
• un helix are rol de stabilizare a structurii si formeaza un astfel de motiv.
interactie cu alt helix • Configuratia acestui motiv aminteste de mana
• celalalt helix este de regula format din dreapta: Helix E (degetul aratator), Loop
aminoacizi bazici (+) si are rol in legarea la (degetul mijlociu indoit), Helix F (degetul mare).
ADN (-) • Regiunea “loop” contine aminoacizi care
• de regula proteinele cu motiv bHLH se leaga coordineaza ionul de Ca2+
la regiuni consensus din stuctura ADN numite • Ex: parvalbumina, calmodulina, troponina C
E-box
• in general, factorii de transcriptie cu motiv N
bHLH functioneaza ca dimeri C
• Ex: c-myc, Ngn2 etc.
!!! Motivul “Coiled coil” (a-helixuri superincolacite)
• 2-3 a-helixuri incolacite unul in jurul celuilalt, formand o structura stabila (superhelix)
• Aceste structuri se formeaza atunci cand aminoacizii cu resturi hidrofobe ai unui helix se
afla pe o parte interactionand cu aminoacizii cu resturi hidrofobe ai celuilalt helix
• Resturile hidrofobe se afla la interiorul structurii
• Ex: a-keratina, miozina
Superhelix
!!! Superstructuri secundare cu elemente b
Motivul hairpin b (b-ribbon sau unitate b-b) Motivul b-a-b
• Prezinta doua catene cu structura b, legate printr-o • Constituit din 2 segmente paralele de
bucla de tip “hairpin” de lungime variabla (2-5 aa). tip b-strand conectate prin “loops” de
• Pot fi: un a-helix.
• Antiparalele - varianta (a) • Motiv b-a-b:
• Paralele - varianta (b): de dreapta, deasupra • De dreapta: a-helix deasupra
planului, atomii din hairpin se rotesc in sens planului format de cele 2
invers acelor de ceasornic, frecvent intalnita segmente b-strand
- varianta (c): de stanga, dedesuptul • De stanga: a-helix dedesuptul
planului, atomii din hairpin se rotesc in sensul planului format de cele 2
acelor de ceasornic, rar intalnita segmente b-strand
• Varianta (a) este intalnita la inhibitorul natural al
tripsinei (proteina mica sintetizata in pancreas, cu rol
de a mentine precursorul tripsinei in stare inactiva;
activarea prematura a acestui precursor determina
aparitia pancreatitei; tripsina este o enzima
proteolitica care digera proteinele pancreasului)
!!! Structura tridimensionala a proteinelor
Structura tertiara a proteinelor Domeniu
3
Aranjament spatial tridimensional, rezultat in urma Motiv structural
interactiilor dintre atomii de pe catena laterala (radicalii (ex. HLH)
R) a lantului polipeptidic, care determina plierea elemen-
Element de
telor de structura secundara din catena polipeptidica in structura
domenii. Proteinele pot avea unul sau mai multe domenii, secundara (ex. a-
domeniile sunt legate intre ele de regula prin segmente helix)
flexibile de tip “loop”. Conformatia spatiala rezultata are
stabilitate maxima (conformatia nativa a proteinelor) si
poate fi globulara sau fibrilara.
Domeniul
Unitatea structurala si functionala a proteinei
- Codificat de regula de un exon al unei gene de la EK, se
impacheteaza independent adoptand de obicei o conformatie
spatiala globulara, compacta, stabila. Alcatuit de regula din mai
multe elemente de superstructura secundara (motive), care
contin cca 50-200 aminoacizi. Structura uni-domeniu
- Asociat cu o functie specifica; poate functiona izolat sau in Structura multi-domeniu
tandem cu alte domenii proteice: Ex. Receptorii hormonilor lipofili prezinta 4 domenii cu
functie clara in cadrul mecanismului lor de actiune:
• domeniu de recunoastere a hormonului lipofil
• domeniu de recunoastere a unei tinte nucleare
• domeniu de legare la ADN
• domeniu reglator
Domeniu Domeniu de Domeniu Domeniu de recunoastere
N reglator legare la ADN targeting nuclear a hormonului lipofil C
!!! Structura tertiara a proteinelor
Intre radicalii R se pot stabili interactii: 2 Necovalente
1. covalente (punti disulfurice)
2. necovalente (interactii ionice, punti de hidro-gen, Interactii ionice (cu formare de punti saline)
interactii hidrofobe si van der Waals Se stabilesc intre grupari R ionizate cu sarcina opusa
(Lys-Asp, Arg-Glu)
Lys+ Asp-
-(CH2)4-NH3+ . . . -OOC-(CH2)-
1 Covalente: Punti de hidrogen
Se stabilesc intre o grupare donor slab acida (D-H) si
Punti disulfurice un atom acceptor (A) care are o pereche de electroni
neparticipanti (Ser-Asn, Ser-Gln, Gln-Cys)
• 2 resturi de Cys de pe aceeasi catena sau de Ser Asn
pe catene polipeptidice diferite aflate fata in -(CH2)4-OH . . . O=C-(CH2)-
fata se oxideaza, conducand la formarea
NH2
puntilor disulfurice
• proteinele cu punti disulfurice confera Interactii hidrofobe
stabilitate si rigiditate moleculara Se stabilesc intre gruparile R hidrofobe care au
• proteinele cu punti disulfurice sunt mai tendinta de a se asocia in solutii apoase (Ala, Val,
rezistente la actiunea enzimelor proteolitice Leu, Ile). Sunt orientate spre interiorul structurii.
• proteinele fara punti disulfurice sunt mai Ala Ala
flexibile si isi pot schimba conformatia ca -CH3 CH3-
raspuns la modificarea unui factor din mediu Interactii van der Waals
Intre aminoacizi alifatici (Ala, Val)
Interactii cu schimb de electroni π (Phe-Phe)
!!! Structura tridimensionala a proteinelor
Proteine:
Monomer: o subunitate (o catena polipeptidica)
Oligomer: 2-cateva subuntati
Multimer: mai multe subunitati Proteine multimerice:
Protomer: unitate repetitiva in Mai multe catene polipeptidice
identice sau diferite
proteine multimerice
4 Structura cuaternara
• Nu este tipica tuturor proteinelor, reprezinta
modul in care mai multe subunitati (catene
polipeptidice identice sau diferite, cu conformatii
proprii), se asambleaza prin interactii necovalente
pentru a forma un edificiu supermolecular cu
functie biologica.
• Pentru exercitatea functiei biologice subunitatile
pot actiona: independent sau cooperativ; mono-
merul (o subunitate) nu este functional.
Hemoglobina:
Hemoglobina este un heterotetramer sau un
dimer format din protomeri ab
• 4 subunitati globulare proteice (globina)
cuplate cu cate o grupare prostetica (hem).
• Globina este constituita din: 2 lanturi a si 2 b
!!! Structura cuaternara a proteinelor - Avantaje
• Flexibilitate mai mare - Structura cuaternara a aparut mai tarziu in evolutie, pentru a
raspunde functional la modificarile conditiilor de mediu.
• Economie de material genetic (1 aa – 1 codon = 3 nucleotide):
• Homotetramer cu structura cuaternara avand 4 subunitati identice T de 100 aa
T T (4x100 aa =400 aa): T este codificat de o gena t formata din 300 nt (100 aa x 3 nt)
• Monomer fara structura cuaternara, cu o singura catena polipeptidica, avand 400
T T aa (100 aa x 4): necesita un material genetic format din1200 nt (400 aa x 3 nt)
1 Masa moleculara
• Denaturarea
Factor denaturant Efecte care produc denaturarea proteinelor prin distrugerea legaturilor
necovalente (legaturi de H, saline, hidrofobe, v. d. Waals)
Incalzirea peste 500C Ruperea urmatoarelor tipuri de legaturi din proteina: hidrofobe, de
hidrogen si van der Waals
Variatii mari de pH fata de cel fiziologic Modificari la nivelul legaturilor ionice realizate de aa de pe catena
laterala
Detergentii (Dodecil sulfat de sodiu – SDS) Ruperea interactiilor hidrofobe din proteina
Unele saruri (Guanidina hidroclorica – GuCl Distrug interactiile hidrofobe din proteina
5-10M, GuSCN, KSCN, LiBr)
Uree 5-10M Interactioneaza cu resturile de aa polari si catena polipeptidica,
stabilizand conformatii non-native in proteina
Factor denaturant Efecte care produc denaturarea proteinelor prin distrugerea legaturilor
covalente (puntile disulfurice)
Beta-mercaptoetanol (bME) Rup puntile disulfurice inter- si intracatenare din proteine, conform
Ditiotreitol (DTT) ecuatiei de mai jos:
Catena A-S-S-Catena B + bME (DTT) Catena A-SH + Catena B-SH
• O molecula (ion metalic, molecula mica, alta proteina) care se leaga revesibil de o
proteina se numeste ligand (interactia proteina-ligand e specifica). Acesta se leaga la
proteina intr-un loc numit situs de legare, care este complementar dpdv al marimii,
formei, incarcarii electrice, caracterului hidrofob sau hidrofil cu ligandul (o proteina
poate avea situsuri de legare separate pentru diferiti liganzi); uneori o proteina
trebuie sa-si modifice conformatia pentru a putea lega un ligand (intr-o proteina cu
mai multe subunitati, o modificare conformationala intr-o subunitate poate afecta a
si conformatia celorlalte subunitati)
Caz particular al proteinelor: enzimele. Molecula care interactioneaza specific cu o enzima se numeste substrat
(nu ligand). Substratul se leaga la enzima intr-un loc numit centru catalitic activ (nu situs de legare)
!!!
Proteine – Clasificare - Constitutie
Constitutiv: Proteine simple, Proteine conjugate
1. Proteine simple (Holoproteine)
2. Proteine conjugate (Heteroproteine) : o parte proteica (apoproteina) si o grupare neproteica
(prostetica), permanent atasata de proteina, care contribuie la functionarea ei
1. Fibrilare
• alcatuite din molecule foarte lungi
• ex. proteine cu rol structural, de protectie, de sustinere si motilitate
1.1. Keratina
1.2. Colagen
1.3. Elastina
2. Globulare
• alcatuite din molecule sferice, compacte
• ex. enzime, proteine transportoare, receptori
2.1. Mioglobina
2.2. Hemoglobina
!!! a-Keratina
• Prezenta la mamifere (in piele, par, unghii, coarne) fiind insolubila in apa.
• Prezinta a-helix ca element de structura secundara, catena polipeptidica este bogata in resturi de
Cys - rezistenta, datorita puntilor disulfurice care se stabilesc intre catenele polipeptidice. Elastica
(revenind la forma initiala atunci cand nu se mai aplica forta exterioara).
Helix-Superhelix-Protofilament-Protofibrila-Microfiblila-Macrofibrila-Celula corticala
• a-HELIX (catena polipeptidica de a-keratina, terminata la capate
cu regiuni globulare cu un continut mare de Cys, care permite
formarea puntilor disulfurice intre catenele adiacente)
• SUPERHELIX DE STANGA (COILED-COIL) = 2 a-helixuri,
constituite dintr-o catena polipeptidica de tip I (aa acizi) si o catena
polipeptidica de tip II (aa bazici), rasucite unul in jurul celuilalt;
fiecare tur de spira are 5.2 Å in loc de 5.4 Å datorita superincolacirii
• PROTOFILAMENT = perechi de structuri coiled-coil (4 a-helixuri
in sect. transversala) conectate cap-coada
• PROTOFIBRILA = 2 protofilamente (in sectiune transversala au 8
a-helixuri)
• MICROFIBRILA = FILAMENT INTERMEDIAR = 4 protofibrile
(sectiune transversala 32 a-helixuri)
• MACROFIBRILA = mai multe microfibrile (filamente intermediare) medulla
cuticula
• CELULA CORTICALA = mai multe macrofibrile celula corticala
( ) =
!!! Colagen
Prezent la toate organismele multicelulare (reprezinta 25%
din totalul proteinelor unui mamifer), component al tesutului
conjunctiv, prezent in tegument, cartilaje, tendoane, ligamente,
discurile intervertebrale, vase de sange, intestin, oase, dinti,
cornee, fiind alcatuit din fibre cu rezistenta mare la intindere.
Colagenul este sintetizat, degradat si inlocuit continuu in
tesuturi; gradul de inretelare al colagenului creste odata cu
varsta. Scaderea productiei fibrelor de colagen are drept
consecinta aparitia ridurilor.
Circulatia mare
• Porneste de la ventriculul stang al inimii, apoi • leaga si transporta O2 (Oxihemoglobina) de
prin artera aorta se ramifica arterial la toate la plaman la inima (prin venele pulmonare)
organele si tesuturile. si apoi de la inima la toate tesuturile
• La tesuturi, prin capilare, sangele cedeaza organismului (prin artere)
oxigen si substante nutritive, se incarca cu
bioxid de carbon si cu deseurile rezultate din • elibereaza O2 in tesuturi pentru a realiza
metabolism, apoi, prin vene, se varsa in atriul respiratia aeroba, in scopul furnizarii
drept al inimii, unde se termina circulatia energiei necesare in procesele metabolice.
mare si incepe circulatia mica.
• dupa eliberearea O2 in tesuturi, Hb leaga si
Circulatia mica transporta CO2 (Carbohemoglobina) si H+
• Din atriul drept, sangele trece in ventriculul de la tesuturi la inima (prin vene) si de la
drept din care porneste circulatia mica. inima la plaman (prin artera pulmonara)
• Aceasta trece prin artera pulmonara, in
plamani. • in plaman, Hb elibereaza CO2 si H+, se
• In capilarele pulmonare, sangele cedeaza incarca cu O2 si procesul se reia.
bioxidul de carbon adus, se incarca cu oxigen,
pe care il transporta prin venele pulmonare
pana in atriul stang, unde se termina mica
circulatie.
!!! Structura Hemoglobinei
Globina
Globina
Perioada Tip hemoglobina Compozitie % la adult
numeroase, puternice
Hem
• intre subunitatile a1-b1 si a2-b2: cele mai
puternice (hidrofobe)
• intre subunitatile a1-b2 si a2-b1: puternice Globina
(punti de H, saline)
• interactii intre subunitati de acelasi fel (a1-a2,
Hemoglobina
b1-b2): putine, slabe
!!! Mecanismul oxigenarii si deoxigenarii Hb
1. Deoxihemoglobina (Conformatia T)
• forma stabilizata de un numar mare de interactii la nivelul subunitatilor neidentice;
• legarea O2 la Hb aflata in forma T determina modificarea conformationala a Hb la forma R;
• Modulator (efector) alosteric = compus care se leaga la alt situs decat situsul
functional al proteinei (ex. Hem) si induce o modificare conformationala in proteina,
care determina schimbarea functiei acesteia.
• Hb este o proteina alosterica.
!!!
Mecanismul oxigenarii si deoxigenarii Hb
Legarea/disocierea O2 la Mioglobina versus Hemoglobina
2. HbO2 transporta O2 de la plamani la tesuturi, pentru a le furniza energia necesara realizarii proceselor
metabolice. (HbO2 este transportata prin venele pulmonare pana la inima si apoi prin artere la tesuturi).
3. In tesuturi se desfasoara procese metabolice, in urma carora rezulta cantitati mari de produsi secundari
(ex. CO2), ce trebuie eliminati. Cand CO2 este eliberat in circulatie, are loc urmatoarea reactie, catalizata de
enzima carbonic anhidraza prezenta in sange: CO2 + H2O ⇌ H2CO3 ⇌ H+ + HCO3-
4. Cresterea concentratiei de CO2 din sange are drept rezultat si cresterea concentratiei de H+ (scaderea
pH-ului sangelui/cresterea aciditatii mediului).
5. Cresterea concentratiei de CO2 si a H+ din sange determina scaderea afinitatii Hb pentru O2 (Efect Bohr).
6. Oxihemoglobina (HbO2, forma R) elibereaza O2 la tesuturi devenind Deoxihemoglobina (Hb forma T).
7. H+ sunt modulatori alosterici ai Hb: se leaga la anumite resturi de aminoacizi din Hb, determinand
modificari conformationale in structura acesteia ce stabilizeaza forma T.
8. 2, 3 difosfogliceratul (2, 3 DPG) este un modulator alosteric al Hb, stabilizand forma T a acesteia.
!!! Mecanismul oxigenarii si deoxigenarii Hb
9. CO2 este modulator alosteric al Hb, stabilizand si legand forma T a acesteia.
CO2 rezultat in urma proceselor metabolice se gaseste sub mai multe forme:
• 85% este transportat prin sange sub forma de anion
bicarbonat (HCO3-) pana la plaman
• 5% este dizolvat in plasma
• 10% se leaga de forma T a Hb cu formare de
Carbohemoglobina (Carbamino-hemoglobina, HbCO2).
A nu se confunda cu Carboxihemoglobina (HbCO)!
Legarea CO2 la Hb: CO2 reactioneaza cu gruparile a-amino terminale sau resturile de Lys, Arg din lantul
proteic al Hb cu formare de carbamat (R-NH-COO-), care formeaza punti saline si stabilizeaza forma T a Hb.
10. HbCO2 transporta CO2 de la tesuturi la plamani, pentru a fi eliminat prin expiratie (HbCO2 este
transportata prin vene pana la inima si apoi prin arterele pulmonare de la inima la plamani).
11. Capilarele pulmonare au o concentratie ridicata de O2, determinand scaderea afinitatii Hb pentru CO2 si
H+. Astfel, CO2 si H+ disociaza de pe Hb, permitand Hb sa lege O2 (Efect Haldane).
14. CO2 rezultat din etapele 11 si 12 este eliminat din circulatie si ulterior din plaman prin expiratie
(plaman-trahee-laringe-faringe-cavitatea nazala si orala).
!!! Hemoglobina glicata (HbA1c)
• 1 oza: Monozaharide
• 2-10 oze: Oligozaharide
• > 10 oze: Polizaharide
MONOZAHARIDE
1. Reprezentare liniara neciclinca (Proiectii Fischer)
2. Reprezentare liniara ciclica (Proiectii Tollens)
3.Reprezentare ciclica plana (Proiectii Haworth)
• nucleu piranozic
• nucleu furanozic
4. Reprezentare conformationala
• baie (barca)
• scaun
!!! Monozaharide - Proprietati
• Formula generala: (CH2O)x
• Clasificare:
• In functie de numarul de atomi de C din molecula: trioze (3 C), tetroze (4 C), pentoze (5 C), hezoxe (6 C), ...
Gliceraldehida Dihidroxiacetona
(Aldotrioza) (Cetotrioza)
Cele mai simple monozaharide:
Glycerin Acetona
Incadrati in dreptunghi –
compusi frecvent intalniti in natura
!!!
!!!
1 2
2 2
1 1
!!!
!!!
!!!
!!! Monozaharide – Stereochimie – Proiectii Fischer
• O molecula cu n centrii chirali poate avea:
2n stereoizomeri.
• Gliceraldehida: 21 = 2 stereoizomeri (forma D si L) HO
O H
• Aldohexozele cu 4 centrii chirali: 24 = 16 stereoizomeri
H
HO H
(8 perechi de enantiomeri D si L)
ENANTIOMERI (D/L)
D-eritroza L-eritroza
• Stereoizomeri care sunt imaginea in oglinda a celuilalt.
Ex.: D-eritroza, L-eritroza / D-treoza, L-treoza D-treoza L-treoza
DIASTEREOIZOMERI
• Stereoizomeri care nu sunt imaginea in oglinda a
celuilalt; acestia difera prin distanta in spatiu dintre H OH
atomii (gruparile) care nu sunt legati direct. De cele mai HO H
multe ori au proprietati fizico-chimice diferite (rotatie,
punct de topire, solubilitate, constanta de aciditate).
EPIMERI
• Doua glucide care difera prin configuratia substituentilor
unui singur atom de C
- H2 O Cetonele reactioneaza cu un
alcool (sau cu apa) in raport de
1:1, formand un Semicetal
(Hidrat de cetona), care are
potential de a cicliza.
D-Glucoza Hidrat de Glucoza D-Glucopiranoza
(Reprezentare Fischer) (Semiacetal) (Reprezentare Tollens)
• ANOMERI = Formele a si b, care difera doar prin configuratia substituentului la atomul de C asimetric (C
anomeric). Acestia prezinta proprietati fizice si chimice diferite (punct de topire, solubilitate in apa,
rotatie specifica, viteza relativa de oxidare etc.)
C1- Atom de C asimetric
a-D-Glucopiranoza b-D-Glucopiranoza
Reprezentare
ciclica plana
Haworth
• 1 oza: Monozaharide
• 2-10 oze: Oligozaharide
• > 10 oze: Polizaharide
OLIGOZAHARIDE
a. Maltoza: a-D-glucopiranozil-(14)-a (sau b)-D-glucopiranozida;
b. Lactoza: b-D-galactopiranozil-(14)-a(saub)-D-glucopiranozida;
g. Celobioza: b-D-glucopiranozil-(14)-b-D-glucopiranozida;
d. /Zaharoza: a-D-glucopiranozil-(12)-b-D-fructofuranozida.
!!! • Oligozaharide
• Compusi care contin 2-10 resturi de monozaharide, legate printr-o legatura glicozidica:
• Dizaharide (oligozaharide alcatuite din 2 resturi de monozaharide)
• Trizaharide (oligozaharide alcatuite din 3 resturi de monozaharide)
...
• Oligozaharide alcatuite din 10 resturi de monozaharide
• Se gasesc mai mult in regnul vegetal decat in cel animal; cele mai multe oligozaharide nu se gasesc ca atare in
natura, ci sunt produsi de hidroliza ai unor polizaharide
a-D-glucopiranozil-(14)-D-glucopiranozida b-D-galactopiranozil-(14)-D-glucopiranozida
Dizaharide nereducatoare
(Daca OH anomeric este implicat in legatura glicozidica, iar glucida se afla la capatul terminal al polizaharidului – capat nereducator)
Cele doua oze participa la legatura glicozidica cu gruparile lor semiacetalice - aceste dizaharide nu contin
grupari libere la atomii de C anomerici, nu au caracter reducator, nu prezinta fenomen de mutarotatie.
!!! Dizaharide
ciclizeaza (D-Glucopiranoza sau D-Glucofuranoza)
C chiral
caracter reducator legatura glicozidica
• Cetonele (R1R2CO) reactioneaza cu un alcool R3-OH (sau cu apa) in raport de 1:1, formand un Semicetal (Hidrat
de cetona), in care atomul de C carbonilic leaga 4 substituenti diferiti si devine C chiral. Semicetalul poate cicliza.
Gruparea OH semicetalica libera (OH anomeric) confera glucidei un caracter reducator. Substitutia unei alte
molecule de tip R4-OH produce un Cetal. Daca a doua grupare OH din R4-OH face parte dintr-o molecula de
monozaharid, legatura formata intre cei doi compusi este o legatura glicozidica.
!!! Dizaharide reducatoare - Maltoza
Formata dintr-un rest de a-D-glucoza legata a 14 de un alt rest de a (sau b)-D-glucoza:
a-D-glucopiranozil-(14)-a (sau b)-D-glucopiranozida
(Gruparea OH anomerica, legata la C semiacetalic, ramasa libera poate exista fie sub forma a, fie sub forma
b, formand fie a-maltoza, fie b-maltoza; in solutie apoasa exista un echilibru intre anomerul a si b.
Gruparea anomerica libera este responsabila de caracterul reducator al maltozei)
• Gust dulce, are ⅓ din dulceata zaharozei.
• Se gaseste in semintele germinate, malt
(=un produs obținut din boabe de cereale încolțite,
uscate și măcinate, folosit la fabricarea alcoolului),
plante. Fermentata de drojdii, cu formare
de alcool etilic si CO2, proces care sta la
baza fermentatiei mustului de malt
pentru obtinerea berii.
• Maltoza se gaseste ocazional in stare
OH anomeric
libera in natura. in pozitie a sau b
• Este un produs intermediar al hidrolizei l
acide sau enzimatice a unor polizaharide
ca: glicogen, amidon.
• Usor digerabila de om.
Legatura glicozidica
!!! Dizaharide reducatoare - Lactoza
• Formata dintr-un rest de b-D-galactoza legata b 14 de un alt
rest de a (sau b)-D-glucoza:
b-D-galactopiranozil-(14)-a(saub)-D-glucopiranozida
(Gruparea OH anomerica ramasa libera poate exista fie sub forma a, b-lactoza
fie sub forma b, formand fie a-lactoza, fie b-lactoza)
(Consumul de branza predispune mai putin la intoleranta la lactoza, pentru ca mare parte din lactoza este
indepartata in procesul de fabricatie. In prezent, datorita dezvoltarii biotehnologiilor, este posibila
comercializarea laptelui fara lactoza.)
!!! Dizaharide reducatoare - Celobioza
a-D-glucopiranozil-(12)-b-D-fructofuranozida
(Ambele oze participa la formarea legaturii glicozidice cu
gruparea OH anomerica, de aceea zaharoza nu are caracter
reducator)
• Substanta solida, alba, cristalizata, cu gust dulce, se gaseste in diverse fructe, seminte, frunze, flori,
radacini; se gaseste in cantitate mare in trestia de zahar (20-27%) si in sfecla de zahar (12-23%), de
unde este extrasa pentru a fi utilizata ca cea mai comuna forma de indulcitor utilizata in
alimentatie (zaharul).
• Se descompune la t0= 1860C formand caramelul
• Dpdv al activitatii optice este dextrogira ([α]D20=+66,50). Sub actiunea hidrolizei acide (HCl) sau
enzimatice (zaharaza=invertaza), zaharoza se descompune intr-un amestec echimolecular al
subunitatilor componente, (a-D-(+)-glucoza si b-D-(-)-fructoza), numit zahar invertit, care este mai
dulce decat zaharoza. Termenul de zahar invertit vine de la faptul ca in urma hidrolizei zaharozei
amestecul rezultat isi modifica rotatia specifica spre stanga, pentru ca valoarea puterii rotatorii a
Fru (levogira) este mai mare decat cea a Glu (dextrogira):
In functie de numarul de oze:
• 1 oza: Monozaharide
• 2-10 oze: Oligozaharide
• > 10 oze: Polizaharide
POLIZAHARIDE
1. Celuloza: b-D-glucoza legate b 14;
2. Chitina: N-acetilglucozamina legate b 14;
3. Amidon: Amiloza (25%), a-D-glucoza, legate a 14,
Amilopectina (75%), a-D-glucoza, legate a 16
!!! Polizaharide
Clasificare dpdv constitutional Clasificare dpdv functional
• Homopolizaharide • Heteropolizaharide • Rol structural
• Glucani • Glicozaminoglicani • Celuloza
• Celuloza • Acid hialuronic • Chitina
• Chitina • Condroitin sulfat • Substantele pectice
• Amidon • Dermatan sulfat • Rol de rezerva
• Glicogen • Keratan sulfat • Amidon
• Fructozani • Heparina • Glicogen
• Inulina • Heparan sulfat • Fructozani
• Levan • Substante pectice • Rol de recunoastere
• Protopectinele • Glicoproteine
• Pectinele • Glicolipide
• Acizii pectinici
• Acizii pectici
...
Celobioza
Polimer de celuloza
60-70 de lanturi de glucoza sunt stabilizate prin legaturi de hidrogen intercatenare si interactii van der Waals
formand microfibrile de celuloza. Astfel, un lant de celuloza are un aspect de panglica, dar cand e stabilizat cu alte
lanturi de glucoza capata un aspect filiform (forma unui fir), cu rezistenta mecanica ridicata.
Buchete de microfibrile se agrega pentru a forma (macro)fibrile de celuloza. Macrofibrilele se agrega pentru a
forma fibre de celuloza, care sunt insolubile, puternice si alcatuiesc peretii primari si secundari ai plantelor superioare.
Celuloza Fibra de celuloza
legatura de H
intercatenara
(Macro)fibrila de celuloza
Microfibrila de celuloza
Lanturi de Glc legate b 14 legatura de H
Celuloza intracatenara
• Amidonul este alcatuit din doua tipuri de polizaharide (a-D-glucani) care se deosebesc prin
proprietăţile lor fizice şi chimice: Amiloza (~ 25%) și Amilopectina (~ 75%), continutul de amiloza si
amilopectina din amidon se modifica in functie de specia plantei si de zona in care se gaseste in planta.
Granulele de amidon
• Depozitate in citoplasma celulelor plantelor, granulele au structura stratificata, alcatuita din inele concentrice de
100-400 nm in care exista domenii unde lanturile de amilopectina formeaza structuri dublu helicale intre ele sau
cu lanturile de amiloza
• Granulele au forme si dimensiuni diferite (cele mai mari sunt in cartofi, iar cele mai mici cele de la orez); Forma:
ovala, sferica sau neregulata | Diametrul: 0.002 – 0.15 mm
• Granulele pot exista in: cloroplaste (unde amidonul e sintetizat si pastrat temporar) | amiloplaste (situs de
stocare indelungat)
Amidonul – proprietati:
• In stare pura, se prezinta ca o pulbere alba
• Este higroscopic (are proprietatea de a absorbi apa):
• Daca amidonul se introduce in apa si se incalzeste treptat, va ingloba apa si se
va ingroasa formand o solutie vascoasa; solutiile de amidon sunt dextrogire.
• Insolubil in apa rece
!!! Homopolizaharide - Glucani
AMILOZA AMILOPECTINA
• Alcatuita din lanturi lungi, neramificate de a-D-glucoza, • Alcatuita din lanturi de a-D-glucoza, conectate prin
conectate prin legaturi de tip a 14 (total 50-5000 legaturi de tip a 14, cu punti de ramificatie a 16 la
resturi de glc) fiecare 24-30 resturi de glucoza (total ~106 resturi de glc)
• Tinde sa existe sub forma de helix de stanga, cu aprox 6 • In granula de amidon lanturile de amilopectina formeaza
resturi de glucoza/spira. In interiorul helixului ramane un structuri dublu helicale intre ele sau cu lanturile de
canal gol cu diametrul de 5 Å amiloza. Structura dublu helicala a amilopectinei este
• In granula de amidon, amiloza formeaza cu amilopectina compacta, impiedicand patrunderea apei in interiorul
o structura dublu helicala. acesteia.
• Se solubilizeaza usor in apa calda si da soluţii cu • Se dizolva in apa numai prin incalzire sub presiune si da
viscozitate redusa, instabile. soluţii foarte vascoase
• Amilopectina da solutii deosebit de stabile
• In reactie cu iodul da culoare albastra. Moleculele de iod • In reactie cu iodul da culoare violet.
se aliniaza in interiorul helixului format de amiloza.
a 14
a 16
a 14
23-29
Aranjament de amiloza si
amilopectina in granula de amidon:
!!! Homopolizaharide - Glucani
Glicogenul – caracteristici generale
• Polizaharid de rezerva in regnul animal, alcatuit din resturi de glucoza
• Se gaseste in citoplasma tuturor celulelor organismului, sub forma de
granule sferice:
• Particule b, in toate celulele organismului cu exceptia ficatului, raza de 20-50 nm
• Particule a, in ficat, particule agregate mari, cu raza de ~ 200 nm
• Se gaseste in cantitate mare in ficat (3-6% din greutatea ficatului) si in
muschiul scheletic (1-2% din greutatea muschiului scheletic): Particule a
• granula de glicogen hepatic are ~ 60000 unitati de glucoza
• granula de glicogen muscular are ~ 6000 unitati de glucoza
• Colorate cu iod, granulele de glicogen au culoare violet-rosu
• In forma uscata, se prezinta ca o pulbere alba, solubila in apa calda.
Glicogenul - structura
• Particula de glicogen este ancorata de o proteina aflata la interior: glicogenina - o
enzima cu structura dimerica, fiecare subunitate al glicogeninei catalizeaza adaugarea Particule b
a 8 resturi de glucoza pe cealalta subunitate. Prima glucoza este ancorata prin C1 de
gruparea OH a unui rest de Tyr dintr-o subunitate a glicogeninei
Ramificatie a
lantului de glucoza Punct de ancorare
a lantului de glucoza
Capat nereducator
Miez proteic
(Glicogenina) Particule de glicogen colorate cu iod
Punct de ancorare
a lantului de glucoza
!!! Homopolizaharide - Glucani
• Donor de glucoza pentru realizarea lantului de glicogen este
UDP-glucoza
• Glicogenul are aceeasi structura chimica ca amilopectina,
formand insa ramificatii mai dense; lantul de glucoza este
format din resturi de a-D-glucoza legate a14, cu puncte de
ramificatie a16 la fiecare 8-12 resturi de glucoza
Glicogen - functie
Glicogenul hepatic
• Dupa o masa bogata in carbohidrati, glucoza aflata in exces in
sange este scoasa din circulatie si stocata in ficat sub forma
de glicogen. Cand glucoza este necesara pentru a furniza
energie organismului, aceasta este eliberata din glicogenul
hepatic si transportata prin sange la alte organe.
• Ficatul este singurul organ care functioneaza ca rezervor de
glucoza si pentru alte organe.
Glicogenul muscular a 16
• Glicogenul din muschi functioneaza ca rezerva imediata de
glucoza pentru celulele musculare, glucoza care e utilizata in
procesele metabolice si este consumata daca se fac exercitii
fizice intense. a 14
Glicogen
• Muschiul ia glucoza din sange pentru a reface glicogenul.
Muschiul nu poate elibera glucoza in sange, deci glicogenul
muscular e folosit doar in celula musculara
Iduronic acid
!!! Glicozaminoglicani (Mucopolizaharide)
Acid hialuronic
(D-glucuronic b13 N-acetil D glucozamina) b14 (D-glucuronic b13
N-acetil D glucozamina)
Denumirea sistemica
3 Acizi grasi saturati: +noic
• Denumirea sistemica da informatii legate de numarul atomilor de C din compozitia AG+noic
• acid n-octanoic (8C+noic)
• acid n-octadecanoic (8C+10C+noic)
• acid n-octacosanoic (8C+20C+noic)
Acizii grasi nesaturati: +enoic
• Denumirea sistemica da informatii legate de tipul de izomer (cis/trans), pozitia legaturii duble, numarul
atomilor de C, numarul de legaturi duble+enoic (=1 legatura dubla)
• acid cis 9-octadecenoic (18C)
• acid cis, cis 9, 12-octadecadienoic (18C)
!!! Acizi grasi saturati
*Cel mai frecvent intalniti in natura
**Acizi grasi esentiali (in alimentatia mamiferelor)
***De retinut AG marcati in verde
Nomencl Denumirea Denumirea Structura Stare Sursa
atura uzuala sistematica
16:0 palmitic* n-hexadecanoic CH3-(CH2)14-COOH solida - ulei de palmier, ulei de bumbac, seu,
untura, tesut adipos, ceruri naturale.
18:0 stearic* n-octadecanoic CH3-(CH2)16-COOH solida - seu, untura, slanina, carne grasa,
margarina.
Clasificare:
• Trigliceride simple:
• tripalmitil glicerol (tripalmitina): solida
• tristearil glicerol (tristearina): solida
• trioleil glicerol (trioleina): lichida
• trilinoleil glicerol (trilinoleina): lichida Tristearina Trioleina
(ester al glicerolului cu 3 (ester al glicerolului cu 3 molecule de acid oleic)
molecule de acid stearic)
• Trigliceride mixte:
• 1, 2 palmitoleil-3 stearil glicerol (dipalmitoleostearina)
• 1-palmitoleil-2, 3 stearil glicerol (palmitoleodistearina) Oleodipalmitina
• 1, 2 oleil-3 palmitil glicerol (dioleopalmitina) (ester al glicerolului cu 1 molecula
• 1-oleil-2, 3 palmitil glicerol (oleodipalmitina) de acid oleic si 2 molecule de acid
• 1 palmitoleil-2 linoleil- 3 stearil glycerol palmitic)
(palmitoleolinoleostearina)
2 Saponificarea
• Procesul de hidroliza alcalina a gliceridelor in urma caruia rezulta glicerol si sarurile acizilor grasi,
numite sapunuri (in industrie, metoda este folosita in scopul obtinerii sapunului). Sapunurile
formeaza emulsii cu grasimile si alte substante, proprietate datorita careia sunt intrebuintate la spalat.
• Hidroxizii utilizati frecvent sunt: NaOH, KOH; Sapunurile de sodiu sunt solide, iar cele de potasiu sunt
moi, ambele fiind usor solubile in apa.
4 Halogenarea
• Gliceridele nesaturate pot aditiona halogeni la dublele legaturi etilenice; pentru
fiecare dubla legatura se aditioneaza doi atomi de halogen→cantitatea de
halogeni aditionata este direct proportionala cu gradul de nesaturare a gliceridei.
Indicele de iod (II)
• Este o masura a gradului de nesaturare a acizilor din grasime, reprezinta numarul
de g de iod care se pot aditiona la 100 g de grasime, in anumite conditii de lucru
bine determinate (uleiurile cu un grad mare de nesaturare au indice de iod foarte
ridicat). Valoarea acestui indice ne permite sa tragem concluzii asupra structurii
acizilor grasi ce intra in constitutia gliceridei.
!!! Trigliceride – Proprietati chimice
5 Rincezirea
• Trigliceridele expuse timp indelungat actiunii unor agenti fizici (lumina, aer, caldura, umezeala) sufera un
proces de degradare chimica care modifica proprietatile organoleptice ale acestora (miros si gust
caracteristic, neplacut) facindu-le neutilizabile in alimentatie. Fenomenul poarta numele de rincezire si
consta intr-o hidroliza partiala in glicerol si acizi grasi, urmata de oxidarea ulterioara a acestor compusi.
Rincezirea hidrolitica
• Consta in hidroliza lenta a trigliceridelor care contin acizi grasi saturati de consistenta lichida sau
nesaturati (uleiurile vegetale nerafinate). Se realizeaza sub actiunea umezelii si a enzimelor (lipaze)
produse de bacteriile contaminante care determina descompunerea trigliceridelor in glicerina si acizii
grasi componenti. Ulterior, atat glicerina, cat si acizii grasi se oxideaza, formandu-se aldehide, cetone si
hidroxiacizi, cu miros şi gust neplacut.
• Principalul produs alimentar care se altereaza prin rancezire hidrolitica, este untul.
Rincezirea oxidativa
• Are loc sub actiunea oxigenului din aer si a luminii. In aceste conditii acizii grasi nesaturati liberi sau cei
din gliceride sunt oxidati la nivelul dublelor legaturi cu formare de peroxizi (autooxidare). Acesti peroxizi
sunt instabili si se descompun, dand nastere la o serie de reactii cu formare de hidroxiacizi, aldehide si
cetone cu gust si miros neplacut. Grasimile rancezite prezinta efecte negative asupra organismului:
• acizii grasi eliberati din trigliceride, care se degradează mai departe, au efecte negative supra membranelor
celulare, vaselor de sange, inimii
• glicerina eliberata din trigliceride se deshidrateaza, transformandu-se in acroleina, substanta hepato-toxica si
cancerigena.
• peroxidul format in timpul rancezirii oxidative, pe seama acizilor graşi nesaturati, se comporta in organism ca un
radical liber cu efecte nocive asupra tesuturilor organismului.
Acroleina
!!! Lipide
Glicerofosfolipide
• Acizi grasi
• Acizi grasi saturati
• Componente majore ale membranelor biologice
• Acizi grasi nesaturati • Derivate de la glicerol 3 fosfat:
• Mononesaturati • in pozitia C1 este esterificat cu un acid gras
• Polinesaturati
• Alte tipuri de acizi grasi (hidroxilati, ciclici)
saturat de tip C16 (acid palmitic) sau C18 (acid
• Eicosanoide stearic)
• Lipide cu glicerol • in pozitia C2 este esterificat cu un acid gras
• Gliceride
• Monogliceride
nesaturat cu 16-18 atomi de C (ex. acid oleic)
• Digliceride • in pozitia C3 gruparea fosfat este esterificata cu o
• Trigliceride grupare alcoolica a unui compus Z-OH
• Alchileter acilgliceroli
• Glicozil acilgliceroli
• Glicerofosfolipide
• Lipide care nu contin glicerol
• Sfingolipide
• Sfingomieline
Glicerol 3 fosfat
• Glicosfingolipide
• Cerebrozide
• Glucocerebrozide
• Galactocerebrozide
• Ceramid oligozaharide
• Gangliozide
• Sulfatide Z
• Alcooli alifatici si ceruri Glicerofosfolipida
• Steroizi
• Steroli
• Glicerofosfolipidele sunt
• Acizi biliari
denumite in acord cu acizii grasi
• Alcaloizi steroidici
care le compun din pozitiile C1
• Saponine R1= acid stearic
si C2, precum si a
• Unii hormoni secretati de glandele sexuale si placenta R2= acid oleic
substituentului gruparii fosfat Z=colina
• Lipide care contin alte clase de compusi
din pozitia C3 1-stearil 2-oleil 3-fosfatidilcolina
!!! Glicerofosfolipide (Fosfogliceride)
(PA*)
OH
(PS**)
(PE**)
(PC**)
12 (PI**)
112
(**)
(***)
Sfingozina
Ceramid
(capat
Acid
hidrofob)
palmitic
!!! Sfingolipide
2. Glicosfingolipide
Cerebrozide
• In molecula intra sfingozina, acid gras si hexoze
• Glucidele se leaga glicozidic de gruparea hidroxilica primara a
sfingozinei, iar acidul gras prin legatura amidica de gruparea NH2 a
acesteia.
Sfingolipide Legatura glicozidica
• Sfingomieline Hexozele pot fi de tipul:
• Glicosfingolipide • Glucoza
• Cerebrozide (glucocerebrozide)
• Glucocerebrozide creier si in tesutul nervos
• Galactocerebrozide • Galactoza
• Ceramid oligozaharide (galactocerebrozide)
membranele tesuturilor, altele b-D-Glucoza
• Gangliozide decat tesutul nervos.
• Sulfatide • Cateva resturi de
sau
oligozaharide b-D-Galactoza
(ceramid oligozaharide)
sange
sau
Oligozaharide
Acid Sfingozina
stearic
Antigen O
Ceramid - Glc – Gal – GlcNAc – Gal - Fuc
Grupele de sange umane O (sau 0), A, B, AB Ceramid
Antigen A GalNAc
Antigenele O, A, B sunt glicosfingolipide Ceramid - Glc – Gal – GlcNAc – Gal - Fuc Glucocerebrozide sau
(ceramid oligozaharide), iar diferenta intre
ele este data de compozitia oligozaharidelor Antigen B Gal Galactocerebrozide sau
din structura acestora Ceramid oligozaharide
Ceramid - Glc – Gal – GlcNAc – Gal - Fuc
Sfingolipide
Gangliozide
• Ceramid oligozaharide (unde hexoza poate fi: glucoza,
galactoza, glucozamina, galactozamina), care contin cel putin
un rest de acid sialic atasat de lantul neramificat al hexozelor.
• Se intalnesc in substanta cenusie a creierului, ganglionii
nervosi, splina, eritrocit, in constitutia membranelor celulare
Sfingolipide
• Sfingomieline (in special a celulelor nervoase)
• Glicosfingolipide • Resturile lor glucidice sunt situate la suprafata externa a
• Cerebrozide membranelor celulare, actionand ca receptori pentru hormonii
• Glucocerebrozide glicoproteici ai hipofizei si unele toxine bacteriene (toxina
• Galactocerebrozide holerei)
• Ceramid oligozaharide • Rol in cresterea si diferentierea tesuturilor.
• Gangliozide
• Sulfatide
Sulfatide
• Structura similara cerebrozidelor, in care gruparea OH din
pozitia 2 sau 3 a hexozei este esterificata cu o molecula de acid
sulfuric
• Acizii grasi din constitutia lor sunt de obicei acidul cerebronic
sau lignoceric
• Se intalnesc in substanta alba a creierului, sinapse, microzomi,
mitocondrii si in unele membrane specializate.
• De regula cerebrozidele din creier se gasesc sub forma de
sulfatide
Sfingolipide
Structura gangliozidelor GM1, GM2, GM3
!!! Lipide
• Acizi grasi
• Acizi grasi saturati
• Acizi grasi nesaturati Steroizi
• Mononesaturati
• Polinesaturati
• Alte tipuri de acizi grasi (hidroxilati, ciclici) • Toti compusii acestei clase deriva de la ciclul
• Eicosanoide ciclopentanperhidrofenantrenic
• Lipide cu glicerol
• Gliceride • Diferite clase se deosebesc intre ele prin:
• Monogliceride • Natura substituentilor nucleului tetraciclic
• Digliceride • Gradul de nesaturare al nucleului tetraciclic
• Trigliceride
• Alchileter acilgliceroli
• Glicozil acilgliceroli
• Glicerofosfolipide C D
• Lipide care nu contin glicerol
• Sfingolipide
• Sfingomieline Ciclopentanperhidrofenantren
• Glicosfingolipide A B - Ciclopentan: D
• Cerebrozide - Perhidro: saturarea legaturilor duble
• Glucocerebrozide - Fenantren: ABC, cu duble legaturi
• Galactocerebrozide
• Ceramid oligozaharide
• Gangliozide
• Sulfatide
• Alcooli alifatici si ceruri
• Steroizi
• Steroli
• Acizi biliari
• Alcaloizi steroidici
• Saponine
• Unii hormoni secretati de glandele sexuale si placenta Ciclopentan Fenantren
• Lipide care contin alte clase de compusi
!!! Steroizi - Nomenclatura
1. Un substituent aflat dedesuptul planului (pozitie a): evidentiat prin linie punctata
2. Un substituent aflat deasupra planului (pozitie b) este evidentiat prin linie ingrosata
3. Toti substituentii aflati la jonctiunea ciclurilor (CH3, H) trebuie indicati
4. Sterolii au gruparile angulare C18 si C19 deasupra planului
5. Atomul de H atasat de C5 poate fi orientat a sau b:
• Daca este orientat in pozitia a, inelele A si B sunt fuzionate in conformatie trans
(ex. hormonii steroizi).
• Daca este orientat in pozitia b, inelele A si B sunt fuzionate in conformatie cis
(ex. acizii biliari).
• In sterolii in care atomul de C5 prezinta o dubla legatura (C4=C5 sau C5=C6),
absenta H impiedica aparitia unei stereoizomerii intre inelele A si B (colesterol).
1. Colesterol
• Cel mai important sterol in tesuturile animale
• Prezinta o legatura dubla C5=C6, catena laterala cu 8 atomi de C
Steroizi • Sinteza
• biosintetizat in organism:
• in ficat: in cantitate mare
• Steroli • la nivelul tuturor tesuturilor: in cantitate mica
• Colesterol
• poate fi introdus in organism si prin alimentatie, deoarece
• 7-dehidrocolesterol
• Ergosterol toate celulele animale sintetizeaza colesterol:
• Acizi biliari • se gaseste in carnea de porc, vita, pui, peste, creveti,
• Alcaloizi steroidici galbenus de ou, branza, etc.
• Saponine
• Unii hormoni secretati de glandele
sexuale si placenta
O=C-O Colesterol
R
Colesterol esterificat
!!! Colesterol
Transport
• Celulele sintetizeaza colesterol endogen, iar cand au nevoie de o cantitate mai mare de
colesterol in procesele metabolice, acesta este preluat din ficat sau intestin
• Transportul colesterolului se realizeaza prin sange: ⅓ in stare libera, ⅔ esterificat in pozitia 3 cu
acizi grasi superiori saturati sau nesaturati
• Pentru ca transportul sa fie eficient, colesterolul este transportat prin sange si lichidele
interstitiale sub forma de lipoproteine =
• Particule discoidale, cu o compozitie complexa:
• La exterior prezinta proteine (apolipoproteine) si lipide hidrofile (ex. fosfolipide
polare, colesterol neesterificat)
• In interior contine lipide hidrofobe (ex. trigliceride si colesterol esterificat)
• Transporta lipidele in intreg organismal, unele lipoproteine transporta lipidele din sange si
lichidele interstitiale la toate celulele organismului (lipidele sunt eliberate in celule prin
exocitoza mediata de receptori), alte lipoproteine transporta lipidele de la celule si din
sange la ficat pentru depozitare sau pentru evacuarea lor in bila.
• Clasificare: in functie de raportul proteine: lipide pe care le contine (de la cele mai largi si mai
putin dense in proteine spre cele mai mici si mai dense particule), lipoproteinele se clasifica:
1. Low density lipoproteins (HDL):
• transporta lipidele (colesterolul nou format, fosfolipide, trigliceride) de la ficat catre toate celulele
organismului. Particulele LDL se numesc si “colesterol rau” deoarece atunci cand depasesc nivelul
acceptat normal in sange se depoziteaza pe peretii arterelor conducand la ateroscleroza
2. High density lipoproteins (HDL):
• elimina excesul de lipide (colesterol, fosfolipide, trigliceride) ramase neutilizate din celule si din
sange. Lipidele sunt transportate la ficat pentru depozitare sau pentru evacuarea lor in bila.
• particulele HDL sunt denumite si “colesterol bun” deoarece elimina lipidele din vasele de sange si
previne sau regreseaza ateroscleroza.
!!! Colesterol
Colesterol total: < 200 mg/dl • Face parte din structura membranelor, participand la
LDL: < 100 mg/dl fenomenele de transport la nivelul acestora
HDL: > 60 mg/dl
• Regleaza vascozitatea fluidelor celulare (sange)
Raport normal stabilit intre
colesterolul total si HDL: • Participa la sinteza acizilor biliari: ~70% din colesterolul
3,5:1 hepaticacid colanicacizii biliari
Steroizi
• Steroli
• Colesterol
• 7-dehidrocolesterol 3. Ergosterol
• Ergosterol • Se gaseste la fungi
• Acizi biliari • Are in plus fata de colesterol 2 legaturi duble (C7=C8, C22-C23) si un
• Alcaloizi steroidici
substituent CH3 la C24
• Saponine
• Unii hormoni secretati de glandele • Prezenta legaturilor duble in inelul B, determina ruperea acestora prin
sexuale si placenta iradiere cu UV, generand Vitamina D2
!!! Acizi biliari
• Acizi grasi
• Acizi grasi saturati
• Acizi grasi nesaturati Acizii biliari
• Mononesaturati
• Polinesaturati
• Alte tipuri de acizi grasi (hidroxilati, ciclici)
• Eicosanoide Bila hepatica contine:
• Lipide cu glicerol
• Gliceride
• Monogliceride
• substante anorganice
• Digliceride • saruri biliare
• Trigliceride • acizi biliari
• Alchileter acilgliceroli
• Glicozil acilgliceroli
• Glicerofosfolipide
• Lipide care nu contin glicerol • acidul colic Acizi biliari primari:
• Sfingolipide sintetizati in ficat
• Sfingomieline
• acidul chenodeoxicolic
din colesterol
• Glicosfingolipide
• Cerebrozide
• Glucocerebrozide Acizi biliari secundari:
• Galactocerebrozide
• acidul deoxicolic sintetizati in intestin
• Ceramid oligozaharide
din acizii biliari primari,
• Gangliozide • acidul litocolic
• Sulfatide sub actiunea
• Alcooli alifatici si ceruri bacteriilor intestinale
• Steroizi
• Steroli
• Acizi biliari
• Alcaloizi steroidici
• Saponine
• Unii hormoni secretati de glandele sexuale si placenta
• Lipide care contin alte clase de compusi
VITAMINE
!!! Vitamine – Definitie si Nomenclatura
• Vitaminele sunt compusi organici necesari in cantitati Denumirea Denumirea chimica
alfabetica
minime in organismele vietuitoarelor, pentru a asigura
cresterea, dezvoltarea si reproducerea acestora. Vitamina A1 Retinol
• Majoritatea vitaminelor nu pot fi sintetizate de organism,
deci ele trebuie obtinute prin alimentatie. Vitamina B1 Tiamina
Vitamina B2 Riboflavina
• Denumirea alfabetica:
• Diferite grupe de vitamine au fost denominate cu Vitamina B3 Niacina
litere majuscule din alfabetul latin: Vitamina B5 Acid pantotenic
• A, B, C, D, E, K
• Compusii care apartin aceleiasi grupe de vitamine Vitamina B6 Piridoxina
primesc indici numerici: Vitamina B8 Biotina
• B1, B2, B3, B5, B6, B7, B9, B12
• Compusii care apartin aceleiasi subgrupe, capata Vitamina B9 Acid folic
litere mici pe langa indicele numeric: Vitamina B12 Cobalamina
• B12a, B12b, B12c
Vitamina C Acid ascorbic
Uneori literele se refera la unele proprietati ale vitaminelor:
• Vitamina K: germ. Koagulation (coagulare) Vitamina D2 Ergocalciferol
• Vitamina PP (B3): engl. Pellagra preventing factor
(factorul de prevenire a pelagrei) Vitamina D3 Colecalciferol
Vitamina D4 Dehidroergocalciferol
• Denumirea chimica
Comisiile de nomenclatura biochimica au stabilit Vitamina E Tocoferol
reguli pentru denumirea vitaminelor pe baza structurii
Vitamina K Fitomenadiona
lor chimice.
!!! Provitamine si Antivitamine
Provitamine
• Precursori inactivi, exogeni, ai vitaminelor, care in organism se transforma in vitamine active
Exemple:
• 7-dehidrocolesterol – prin iradiere la nivelul pielii se transforma in Vitamina D3
• Carotenii – in hrana sunt inactivi, dar se transforma in Vitamina A sub actiunea carotenazelor din intestin
Antivitamine
• Substante cu actiune antagonista vitaminelor, producand simptomele carentei vitaminei respective
• Mecanisme de actiune ale antivitaminelor:
(i) Analogie structurala cu o vitamina
• Competitia intre sulfamide (substante chimioterapice) si acidul p-amino benzoic (Vitamina B10) in sinteza
acidului folic (Vitamina B9)
(ii) Alterarea structurii vitaminei
• Tiaminaza rupe molecula Vitaminei B1
(iii) Inhibarea sintezei vitaminei
• 1,2-dibrom-4,5-diaminobenzolii actioneaza ca inhibitori ai sintezei vitaminei B12
Vitagene
• Substante cu un comportament similar vitaminelor, care intra in structura celulelor, sau servesc ca
sursa de energie
• Starile carentiale determinate de acesti factori se aseamana cu carenta vitaminica, cu deosebirea
ca exista diferente substantiale privind cantitatile necesare functionarii normale a organismului:
• Vitamine: necesarul de ordinul µg sau mg
• Vitagene: necesar de ordinul g
• Exemple: Aminoacizi esentiali (AAE), Acizi grasi esentiali (AGE) sau Vitamina F
!!!
Efecte produse de vitamine in organism - Se recunosc prin manifestari clinice si biochimice
Hipovitaminoza
• Aport insuficient (carenta) al unei vitamine Hipervitaminoza usoara
• Manifestari reversibile • Manifestari reversibile
- Avitaminoza Hipervitaminoza severa +
• Lipsa unei vitamine • Intoxicatii grave cu vitamina
• Manifestari grave, pot fi letale
Clasificare
Vitamine liposolubile Vitamine hidrosolubile
• Solubile in lipide si solventi organici • Solubile in apa si solventi polari
• In mare parte termostabile • Termolabile
• Stabile in mediu acid • Stabile in mediu acid
• Stabile in mediu alcalin • Instabile in mediu alcalin
• Pot fi depozitate in anumite organe, de • Nu pot fi depozitate de organismul animal
unde sunt utilizate atunci cand organismul o sub forma de rezerve (sunt retinute pe
cere termen scurt in diferite organe)
• Reprezentanti: • Reprezentanti:
- Vitaminele A, D, E, K - Vitaminele B
- Vitamina F (pseudovitamina) - Vitamina C
- Acidul lipoic
VITAMINE
LIPOSOLUBILE
!!! Provitaminele A
Carotenoizi
• Pigmenţi de culoare roşie, galbenă sau portocalie, care se găsesc în special în
fructele şi legumele de aceeaşi culoare
• Sunt importanti antioxidanti
• Clasificare:
• Caroteni
• Xantofile
Carotenii
• Au activitate de provitamina A
• Reprezentanti importanti:
• a-caroten
• b-caroten
• g-caroten
• Carotenii, compuşi organici larg răspândiţi în regnul vegetal şi animal, sunt substanţe
cristaline polienice care difera intre ei prin raportul dintre atomii de carbon si
hidrogen
• Structura polienica, prin numărul mare de duble legături conjugate, le conferă culori
diferite care variază de la galben la portocaliu şi respectiv de la roşu la violet.
!!! Provitaminele A
• β-carotenul
• Este cel mai important precursor al vitaminei A.
• Constituit din 2 cicluri β-iononice, unite prin unitati polienice
(cu multe legaturi duble)
• β-Carotenul pur este o substanţă cristalină, galben-portocalie, insolubilă în apă, solubilă în
solvenţi organici, optic inactivă, cu punct de topire de 1840C.
• Se găseşte în:
• Cloroplaste, împreună cu clorofila, sub formă de complecşi proteici hidrosolubili, sau
de picături lipidice. Toamna, după degradarea clorofilei, frunzele îşi modifică culoarea
în funcţie de conţinutul în caroteni.
• Lucernă, plante verzi, migdale, salată, măceşe, alune, arahide, spanac, varză, sfeclă
roşie, mango, papaya, pătrunjel, nucă, pepene galben, caise, măsline, tomate, ulei de
cătină, germeni de grâu, leguminoase, rădăcinoase, citrice, prune, usturoi, ceapă,
fasole verde, zmeură, pere, mere, smochine, creson, mazăre, bostan, dude, gutui,
avocado, castane, cireşe, banane, nap, castravete, ananas, coacăze, mei, ovăz, orez,
păpădie, struguri, ţelină, aloe
• O cantitate apreciabilă de β-caroten se găseşte în morcovi, unde reprezintă
aproximativ 30% din totalul carotenoizilor
• Necesar zilnic : (2-3 mg/zi - un morcov mediu)
!!! Provitaminele A
• α-carotenul
• Se deosebeşte de β-caroten prin faptul ca la una din extremităţi prezinta un ciclu α-iononic
• Se găseşte în:
• Plante alături de β-caroten, deşi în unele plante lipseşte (spanac, urzică, orz)
• Morcovi, dovlecei, roşii, fasole verde, coriandru
• γ-carotenul
• Conţine numai un singur ciclu β-iononic
• Considerat un însoţitor permanent al β-carotenului din plante,
unde se întâlneşte în cantităţi extrem de mici.
!!! Provitaminele A
Xantofilele
• Pigmenti galbeni
• Au structura similara cu a carotenilor, dar contin atomi de oxigen, spre deosebire
caroteni care au doar catena hidrocarbonata
• b-criptoxantina
• Singurul compus din clasa xantofilelor care are activitate de provitamina A
• b-criptoxantina are o structura similara cu a b-carotenului, cu deosebirea ca are
in plus o grupare OH in pozitia 3
• Se intalneste la: catina, portocale, papaya, mere, galbenus de ou, unt
!!! Vitaminele A (A1, A2, A3)
Vitamina A1
• Forma alcoolica (R-CH2-OH) - sau Axeroftol
• Forma aldehidica (R-CHO) - sau Retinen
• Forma acida (R-COOH) -
b-caroten
CH2OH=Retinol1 -C-OH
CHO=Retinal1 -C=O
COOH=Acid Retinoic1
!!! Vitamina A1
Surse
• Animalele erbivore primesc carotenoizii odată cu hrana şi îi transformă în retinol.
• Animalele carnivore primesc vitamina A din alimentaţia de origine animală.
• Pentru om, sursele de vitamine A exogene sunt sub formă de provitamină A, sau vitamină A din
hrana de origine animală.
• Cantitatea cea mai mare de vitamină A se găseşte în ţesutul adipos al ficatului peştilor marini
(care iau vitaminele A din planctonul marin). De aici este extrasă şi este pusă în vânzare sub
formă de untură de peşte, sau ulei de peşte.
• Ficatul animalelor şi al păsărilor conţine cantităţi apreciabile de retinol.
• Carnea, gălbenuşul de ou, produsele lactate conţin vitamina A1 în cantităţi variabile
Metabolism
• In hrana de origine animala vitamina A se gaseste in principal sub forma esterului retinil
palmitat, care este convertit in intestinul subtire in retinol.
• Absorbtia carotenoizilor are loc la nivelul intestinului subtire
• Carotenoizii si retinolul sunt transportati prin plasma la organele care le depoziteaza.
• Carotenoizii pot fi depozitati in tesutul adipos (80%), ficat (10%), alte tesuturi (glande
suprarenale, testicule, etc. - 10%).
este depozitat, in cea mai mare parte in forma esterificata, in ficat (95%) si la alte
tesuturi (rinichi, pancreas, oase, par, organe reproducatoare – 10%).
• Retinolul depozitat este eliberat pentru a fi utilizat de organele care au nevoie de el (piele, ochi,
glande sexuale)
Necesar zilnic
Rol
Acidul retinoic
• Factor de protecţie al ţesuturilor epiteliale: piele, cornee, mucoasele implicate în
digestie-absorbţie şi cele ale aparatului respirator şi urogenital
• Implicat in dezvoltarea embrionara
• Controleaza transcriptia unor gene, fiind implicat într-o serie de metabolisme
intermediare şi în interacţiunile cu alte vitamine si hormoni
Retinal
• Implicat în mecanismul vederii
• Reprezentanti importanti:
• Provitamina si Vitamina D2
• Provitamina si Vitamina D3
!!! Provitamina si Vitamina D2
Provitamina D2 (Ergosterol)
• Se gaseste la fungi, drojdii, protozoare, unde indeplineste un rol similar colesterolului
din celulele animale
• Are in plus fata de colesterol 2 legaturi duble (C7=C8, C22-C23) si un substituent CH3
la C24
• Deoarece are un rol esential in supravietuirea unor fungi si protozoare, este o tinta
importanta pentru unele medicamente:
• antifungice: Amfotericina B, Clotrimazol etc.
• antiparazitare: pentru combaterea parazitilor de tipul Trichomonas, Leichmania
• Este extras la scala industriala din drojdia de bere si utilizat pentru fabricarea
Vitaminei D2.
!!! Provitamina si Vitamina D2
Vitamina D2 (Ergocalciferol)
• Ia nastere prin expunerea la lumina ultravioleta (UV) a Provitaminei D2 (Ergosterol)
• Procesul nu este direct, ci se realizeza printr-o cascada de reactii chimice, ai caror
compusi intermediari sunt lumisterolul si tahisterolul
• Daca se continua iradierea ergocalciferolului, acesta este distrus, dand nastere unor
derivati toxici: toxisterol si suprasteroli I si II
• Daca temperatura creste peste 1200C, apar si pirocalciferolii
• Vitamina D2 poate fi folosita ca supliment, fiind aproape la fel de eficienta ca
Vitamina D3.
!!! Provitamina si Vitamina D3
Provitmina D3 (7-Dehidrocolesterol)
• Se gaseste la mamifere
• Ia nastere din colesterol prin oxidare
• Are in plus fata de colesterol o legatura dubla C7=C8
• Se gaseste in piele
!!! Provitamina si Vitamina D3
Vitamina D3 (colecalciferol sau calciferol) – forma inactiva
Uneori termenul de calciferol se refera in mod colectiv la ergocalciferol si colecalciferol
• Vitamina D3 este produsa in mod natural in piele, prin expunerea la lumina ultravioleta
(UV) a Provitaminei D3 (7-Dehidrocolesterol)
• Procesul nu este direct, ci are ca intermediar pre-vitamina D3, care prin izomerizare se
transforma in Colecalciferol (forma inactiva a Vitaminei D3)
!!! Provitamina si Vitamina D3
Metabolism
• Colecalciferolul este hidroxilat la
nivelul ficatului, transformandu-se in
Calci(fe)diol (25-hidroxivitamina D3)
• Calcifediolul este ulterior hidroxilat in
rinichi, transformandu-se in Calcitriol
(1, 25 dihidroxivitamina D3), care este
forma activa a Vitaminei D3.
• Calcitriolul este transportat la intestin unde este implicat in mecanismele de absorbtie a Ca:
• stimularea transportului Ca prin peretele intestinal
• mobilizarea Ca in oase
!!! Vitamina D3
Surse
• Se găseşte în natură sub formă liberă, alături de provitamina D3, în untura de peşte,
ficat, lapte, gălbenuş de ou, unt, etc.
• Alimentaţia de natură vegetală aduce o cantitate foarte mică de vitamine D.
• O proporţie mai mare decât cea preluată din alimentaţie se formează din 7-
dehidrocolesterol, sub acţiunea razelor ultraviolete, la nivelul tegumentelor.
Necesarul zilnic
• Recomandat 5-20 µg
Rol
• Reglarea concentratiei si a raportului calciu/fosfati
• Procesul de mineralizare a osului
• Intarirea sistemului imunitar
• Posibila conexiune intre consumul de suplimente de vitamina D si scaderea riscului
de dezvoltare a unor cancere
VITAMINE
HIDROSOLUBILE
!!! Vitamina B1 (Tiamina)
Structura
• Tiamina este alcatuita din:
• 2 nuclee care au grefate pe ele substituenti
- un nucleu pirimidinic
(substituenti CH3 – poz. 2 , NH2 – poz. 4)
- un nucleu tiazolic
(substituenti CH3 - 4, CH2-CH2-OH - 5) VITAMINA B1
• nucleele sunt legate intre ele printr-o grupare (TIAMINA)
Structura
• Acidul ascorbic are o conformatie L
• Este γ-lactona acidului 2,3-dienol-L-gulonic
• Gruparea dienolica din pozitiile 2, 3 este responsabila de:
• caracterul acid al Vitaminei C
• proprietatile reducatoare care stau la baza activitatii
biologice a Vitaminei C
• Acidul ascorbic are gust acru si punct de topire 1920C
• Vitamina C se produce sub forma de ascorbat de Na si
• ascorbat de Ca (forme tamponate, care ii scad aciditatea).
Surse
!!! Vitamina C
Metabolism
• Majoritatea animalelor si plantelor pot sintetiza Vitamina C printr-o cascada de reactii
catalizate enzimatic, care convertesc monozaharidele la Vitamina C.
• La plante manoza sau galactoza sunt convertite la Vitamina C.
• La animale glucoza (eliberata din glicogenul hepatic) este convertita la Vitamina C.
• La reptile si pasari sinteza Vitaminei C se realizeaza in rinichi.
• Omul, maimuta, cobaiul, unele specii de pasari, reptile si lilieci nu poseda enzimele
necesare transformarii glucozei in Vitamina C si trebuie sa preia vitamina, esentiala
pentru organism, din alimentatie.
1. Baza azotata
• Poate fi un derivat de la o purina sau de la o pirimidina
• Baze azotate Purinice – Pur - R :
• Adenina (6-amino-purina) – Ade - A
• Guanina (2-amino-6-oxo-purina) – Gua - G
• Baze azotate Pirimidinice – Pyr - Y:
• Citozina (2-oxo-4-amino-pirimidina) – Cyt - C
• Uracil (2, 4-dioxo-pirimidina) – Ura - U
• Timina (2, 4-dioxo-5-metil-pirimidina) – Thy -T
2. Glucida – Pentoza:
• b-D-riboza Intra in structura Ribonucleotidelor ARN
• b-2-deoxi-D-riboza Intra in structura De(z)oxiribonucleotidelor ADN
9 9 1 1
1’ 1’ 1’ 1’
9 9 1 1
1’ 1’ 1’ 1’
!!! Nucleotide – Structura, Nomenclatura
3 3. Cand la Nucleozid se ataseaza una sau mai multe grupari Fosfat se formeaza o
NUCLEOTIDA.
• 1-mai multe grupari fosfat pot esterifica una dintre gruparile OH de la C2’ sau 3’ sau 5’ a
pentozei.
• Cel mai frecvent este esterificata gruparea OH de la C5’ a pentozei.
Pentoza
Baza
Fosfat
azotata
!!!
Nucleotide – Structura, Nomenclatura
RIBONUCLEOTIDE DEOXIRIBONUCLEOTIDE
Riboza Deoxiriboza
• Acizii nucleici sunt responsabili de dictarea ordinii in care aminoacizii se leaga intre ei
pentru a da nastere unei proteine specifice.
• Acizii ribonucleici (ARNm, ARNt şi ARNr) sunt moleculele implicate in realizarea directa a
sintezei proteice (translatiei).
• lungime (Å)
• masa moleculara (Da=1.67*10^(-27) Kg)
• numar:
• nucleotide (nt)
• baze (b) din compozitia nucleotidelor - pentru monocatene
• perechi de baze (pb) daca molecula este constituita din doua catene asociate
• Multiplul cel mai folosit este cel de kilobaze (kb) sau kilo-perechi de baze (kpb):
• 1kb = 1000 b
• 1kpb = 1000 pb
• Marimea ARN:
• ARN ribozomal (ARNr): 100 - 5000 b
• ARN de transfer (ARNt): 73 - 90 b
• ARN mesager (ARNm): nr depinde de marimea genei copiate
• Marimea ADN:
• Variaza in functie de regn si specie, de la 5000 pb la mai mult de un milion de pb.
ADN
!!! Acidul deoxiribonucleic (ADN)
An Savanti Descoperire
1944 Avery, Mac Leod, Mac Carty • Au demonstrat ca ADN este purtator al
informatiei genetice
1953 Watson, Crick, Wilkins, Franklin • Wilkins, Franklin: Studii ale moleculei de ADN
utilizand cristalografia cu raze X
• Watson, Crick: Descopera structura ADN dublu-
catenar complementar, utilizand informatiile
furnizate de studiile de cristalogafie si prezinta
un model de replicare a ADN
• ADN contine regiuni numite gene, care care detin informatia genetica necesara
pentru a sintetiza proteine in celule.
Citirea si
scrierea Legatura 3’, 5’ 3’
secventei de fosfodiesterica 5’
ADN se face in
directia 5’-3’:
5’-TGCA-3’
Extremitate 3’ libera
!!! Modelulul structural al ADN
Acidul deoxiribonucleic (ADN) propus de Watson-Crick (ADN-B)
a) Majoritatea moleculelor de ADN sunt alcatuite din 2 a) Bazele azotate (purinice si pirimidinice) sunt
catene polinucleotidice helicoidale, rasucite in jurul orientate spre interiorul helixului.
unei axe comune = ADN dublu catenar (ADN dc) b) Resturile de fosfat si deoxiriboza se afla la
1 b) Catenele sunt orientate in directii opuse (5’-3’ si 3’-5’) 2 exterior
c) Acest aranjament antiparalel, cu punti de H intre c) Planurile bazelor azotate sunt perpendiculare
bazele azotate ale catenei sens si bazele azotate ale pe axa helicala.
catenei antisens, produce o asociere stabila intre d) Planurile deoxiribozelor sunt aproape la unghi
catene. drept fata de cel al bazelor.
c) Baze azotate perpendiculare pe axa helicala d) Planurile
a) Baze azotate deoxiribozelor
catene
helicoidale
=Tur
de
curbura spira
(fosa)
minora
curbura
majora
genetica ce confera genotipul si fenotipul specific fiecarei celule
• ADN se intalneste la toate regnurile: virusuri, organisme unicelulare
(bacterii, protozoare), organisme pluricelulare (fungi, organisme
vegetale, organisme animale).
• ADN se gaseste in fiecare celula din organism (exceptie eritrocitul,
celulele cristalinului). legatura
• Secventa ADN este specifica fiecarui individ in parte.
glicozidica
• Ordinea secventei de nucleotide conteaza: 5’-ATGC-3’ nu este acelasi
lucru cu 5’-CGAT-3’.
DEOXIRIBONUCLEOPROTEINE
!!! Deoxiribonucleoproteine
Deoxiribonucleoproteine
• Complexe de ADN cu proteine
• Exemple: • Nucleozomi (ADN+histone)
• Protamine: inlocuiesc histonele in timpul spermatogenezei
Nucleozomi:
• Complexe in care ADN genomic este infasurat in jurul unui cluster de 8 proteine 2X(H2A, H2B, H3, H4) numite histone
• Nucleozomii sunt legati intre ei prin ADN linker formand o fibra ca un sirag de margele cu diametrul de ˜11 nm
• Nucleozomii formeaza impreuna cu histona H1 o structura mai compacta (fibra cu diametrul de 30 nm). Histona H1
se leaga la ADN linker in dreptul situsului de intrare si iesire al ADN.
• Fibra de 30 nm se aranjeaza sub forma unor bucle in jurul unor proteine structurale formand activa
transcriptional (eucromatina). Cand aceasta structura este impachetata mai compact formeaza cromatina inactiva
transcriptional (heterocromatina).
• Cromatina se asambleaza compact cu alte proteine structurale formand un cromozom in nucleul celulelor EK.
ADNdc Histone
pre-ARNm
Splicing (Maturare) Secvente Secvente Secvente
Enhancer/ Promotor 5’UTR/
ARNm matur
Citoplasma
Silencer 3’UTR
Translatie
Proteina
!!! Acidul deoxiribonucleic (ADN) - ADN la EK
ADN la EK
• Gene: regiuni asociate cu o anumita functie si codifica proteine
• Secventa START: ATG
• Secvente alternante:
• Exoni: secvente codificatore care vor fi transcrise in pre-ARNm, care va fi maturat in urma
procesului de splicing intr-un ARNm matur, ce va fi translatat ulterior intr-o proteina specifica
• Introni: secvente necodificatoare care vor fi transcrise in pre-ARNm, vor fi ulterior excizate prin
splicing, neregasindu-se in ARNm matur si nu vor fi translatate intr-o proteina
• Secventa STOP: TAA, TAG, TGA
• Regiuni necodificatoare (netranscrise in pre-ARNm), care pot include regiuni reglatoare
• Regiuni reglatoare: flancheaza regiunile codificatoare, avand rol de a controla expresia genei respective
• Secventa 5’UTR (UnTranslated Region) regiune situata in amonte de secventa genica (inaintea genei;
upstream), in apropierea acesteia si contine situsul de legare a ribozomului (Ribosomal Binding Site - RBS)
• Secventa 3’UTR (UnTranslated Region) in aval de secventa genica (dupa gena; downstream), in apropierea
acesteia, care contine secventa de terminare a transcriptiei
• Secventa Promotor: are rol de a initia transcriptia, pot fi unul sau mai multi si sunt de regula secvente
consensus aflate la distante bine definite de gena
• Secventa 5’ sau 3’ Enhancer: regiune situata la distanta mare fata de gena, cu rol de a activa transcriptia
• Secventa 5’ sau 3’ Silencer: regiune situata la distanta mare fata de gena, cu rol de a inhiba transcriptia
Regiuni necodificatoare Regiuni necodificatoare
Gena
intron 1 intron 2
exon 1 exon 2 exon 3
!!! Acidul deoxiribonucleic (ADN) - ADN la PK
ADN la PK
• Gene: regiuni asociate cu o anumita functie, care sunt transcrise in bloc intr-un ARNm care va fi “tradus”
(translatat) in proteinele coresunzatoare fiecarei gene. Inaintea fiecarei gene se afla o secventa UTR care
contine situsul de legare a ribozomului. Gena PK are urmatoarele particularitati:
• Secventa START: ATG (83%), GTG (14%), TTG (3%); ATT si CTG (rar)
• Secvente codificatore
• Secventa STOP: TAA, TAG, TGA
• Regiuni necodificatoare (netranscrise in ARNm), care pot include regiuni reglatoare
• Regiuni reglatoare: flancheaza regiunile codificatoare, avand rol de a controla expresia genelor
• Secventa 5’UTR regiune situata inaintea primei gene si contine situsul de legare a ribozomului
• Secventa UTR, regiune situata inaintea fiecarei gene (cu exceptia primei gene) si contine situsul de legare
a ribozomului
• Secventa 3’UTR dupa regiunea codificatoare si contine secventa de terminare a transcriptiei
• Secventa Promotor: pot fi unul sau mai multi, au rol de a initia transcriptia si sunt de regula secvente
consensus aflate la distante bine definite de gena
• Secventa 5’ sau 3’ Enhancer: regiune situata la distanta mare fata de gena, cu rol de a activa transcriptia
• Secventa 5’ sau 3’ Silencer: regiune situata la distanta mare fata de gena, cu rol de a inhiba transcriptia
• Regiunile codificatoare si reglatoare sunt organizate intr-o unitate functionala numita operon, aflat sub
controlul unui domeniu reglator numit operator (leaga factori de transcriptie, regland expresia genica)
Gena 1 Gena 2
!!! Tipuri de ADN
• ADN monocatenar (ADNmc)
• unele virusuri (Parvovirusuri)
• ADN dublu catenar (ADNdc)
• Circular
• unele virusuri, cromozomii de la PK, plasmide bacteriene, ADN
mitochondrial, ADN cloroplastic
• Liniar
• unele virusuri (Adenovirusuri, Herpes virus), cromozomii de la EK
ADNdc poate avea diferite geometrii:
ADN A ADN B ADN Z
• Se gaseste in celule in regiuni • Descrisa de Watson & Crick • Apare in secvente alternante de
dublu catenare hibride de tip • Forma cea mai frecvent purine si pirimidine (ex. GCGCGC)
ADN-ARN sau dublu catenare intalnita in celule in conditii • Forma mai alungita comparativ cu
ARN. Forma mai scurta si lata fiziologice formele A si B
comparativ cu forma B
ARN
!!! Acidul ribonucleic (ARN)
• ARN este o macromolecula polinucleotidica neramificata, lunga, formata din unitati repetitive numite nucleotide
legate intre ele prin legaturi 3’, 5’ fosfodiesterice, stabilite intre hidroxilul din poziţia 3’ al unei nucleotide si
gruparea fosfat din pozitia 5’ a nucleotidei urmatoare.
• Catena de ARN are extremitatile 5’ si 3’ libere.
• In mod conventional secventa de polinucleotide este scrisa in directia 5’-3’.
• Bazele azotate din structura ARN sunt: Adenina, Guanina, Citozina, Uracil | Pentoza este riboza.
• Cu exceptia unor virusuri, moleculele de ARN sunt 5’
monocatenare, numarul de nucleotide din ARN
variaza de la 75 la cateva mii (nefiind o molecula
dublu catenara, ARN nu trebuie sa aiba un raport
echimolecular intre bazele complementare - ca in
cazul ADNdc)
• ARNm reprezinta copia informatiei genetice (a genelor) continute intr-o catena de ADN; o
molecula de ARNm poate fi produsa de o gena sau de un grup de gene.
• Secventa de nucleotide continuta intr-o molecula de ARNm este organizata in codoni (1 codon =
3 nucleotide) si este flancata de secvente aditionale necesare functionarii si reglarii translatiei.
Un codon codifica pentru un aminoacid specific, astfel incat ordinea codonilor din molecula de
ARNm da ordinea secventei de aminoacizi din proteina care va fi sintetizata.
• ARNm este de regula monocatenar si are o lungime variabila, in functie de lungimea genei (ADN)
pe care a transcris-o.
!!! Transcriptie – mecanism
• Open reading frame (ORF) sau Cadru deschis de citire reprezinta o regiune de ADN unde
teoretic poate incepe transcriptia in vederea sintetizarii unui ARNm si ulterior codificarii unei
peptide/proteine
• Un ORF nu codifica intotdeauna o proteina.
• Pentru a fi exprimat, un ORF trebuie sa aiba in apropierea situsului de start o secventa
.
Gena 1 Gena 2
Gena
!!! Transcriptie - Initiere: ARN polimeraza
1. Initierea - Consta in legarea unei enzime numita ARN polimeraza ADN dependenta si a unui factor de
transcriptie la o regiune specifica din ADN numita , in scopul sintezei ARNm pe baza mesajului
inscris in ADN.
ARN polimeraza ADN dependenta
• Enzima care sintetizeaza ARN pe baza informatiei inscrise in ADN
• Caracteristici: tiparul optim este un ADNdc, poate functiona ca tipar si ADNmc, nu este tipar hibridul
ADN-ARN si nici ARNmc sau ARNdc. Precursorii activati sunt: GTP, CTP, ATP, UTP, ionii metalici
divalenti: Mg2+ (in vivo) sau Mn2+
• La PK (bacterii), ADN este transcris de o singura molecula de ARN
polimeraza, de regula fara ajutorul factorilor de transcriptie.
• La EK, sunt necesari atat factori de transcriptie, cat si mai multe
5’ Catena sens 3’
tipuri de ARN polimeraza:
• Genele care codifica proteine sunt transcrise de ARN polimeraza II ARN
ADN
5’ 3’
• Genele care codifica pentru ARNr sunt transcrise de ARN polimeraza I 3’ 5’
• Genele care codifica pentru ARNt sunt transcrise de ARN polimeraza III Catena antisens
(Organitele celulare de tipul mitocondriilor si cloroplastelor au propriile
ARN polimeraze, care transcriu ADN in aceste structuri celulare)
Mecanism de actiune al ARN polimerazei
• Catalizeaza initierea sintezei si alungirea catenei ARNm conform reactiei:
(ARN)n + rNTP (ARN)n+1 + PPi
• Sinteza are loc in directia 5’-3’, gruparea 3’-OH terminala a catenei in crestere realizand un atac
nucleofil asupra gruparii fosfat a rNTP care urmeaza a fi adaugat conform mesajului tiparului. Sinteza
devine ireversibila prin hidroliza pirofosfatului (PPi) sub actiunea pirofosfatazei anorganice.
• ARN polimeraza nu necesita un primer la care sa adauge resturi rNMP, putand cataliza sinteza primei
legaturi fosfodiesterice.
!!! Transcriptie - Elongarea
2. Elongarea Se da urmatoarea secventa de ADNdc:
• ADNdc este desfacut de factorii de transcriptie, 5’ ATGCCATAA 3’
3’ TACGGTATT 5’
permitand astfel ARN polimerazei sa transcrie doar o Scrieti secventa de ARNm care se sintetizeaza in urma
singura catena de ADN in ARNm. Catena de ADN care procesului de transcriptie.
serveste ca matrita in sinteza ARNm este catena antisens Rezolvare 1 (situatie ce are loc in mod normal in celula).
ARN polimeraza va sintetiza o copie a informatiei
3’-5’, Catena care nu e transcrisa este catena sens 5’-3’. continute in catena de ADN 3’5’: ARNm 5’3’ devine:
• ADN este transcris de ARN polimeraza in ARNm dupa 5’ AUGCCAUAA 3’
urmatoarele reguli: A=U, GΞC, T=A si CΞG Rezolvare 2: shortcut la Rezolvarea 1.
In catena de ADN 5’ 3’ se inlocuieste T cu U, restul
3. Terminarea secventei ramanand acelasi:
• ARN polimeraza se misca de-a lungul ADN pana cand ADN: 5’ ATGCCATAA 3’
intalneste o secventa terminator. In acel moment ARN ARNm 5’ AUGCCAUAA 3’
Cati codoni sunt?
polimeraza elibereaza polimerul de ARNm si se detaseaza
de pe ADN.
!!! Transcriptie la PK
• La PK transcriptia se realizeaza in citoplasma.
• Durata de viata a unui ARNm la PK este scurta - cateva minute (pentru transcriptii foarte
lungi, translatia poate incepe la capatul 5’, in timp ce capatul 3’ al ARNm este inca transcris)
• Multe gene de la PK sunt organizate in operoni - genele dintr-un operon sunt transcrise ca
un ARNm continuu (ARNm policistronic) care va da nastere proteinelor codificate de genele
din operon
!!! Transcriptie la EK
• La EK transcriptia se realizeaza in nucleu.
• Durata de viata a unei molecule de ARNm la EK variaza de la cateva minute la cateva zile.
• Molecula de ARNm sintetizata de ARN polimeraza se numeste transcript primar (pre-ARN
mesager sau pre-ARNm) si este alcatuita din exoni (secvente codificatoare de proteine) si
introni (secvente care nu codifica proteine).
• Molecula de pre-ARNm este procesata inainte de a fi exportata in citoplasma pentru a fi
translatata in proteine.
• Procesarea pre-ARNm in ARNm matur consta in urmatoarele etape:
• 1. Adaugarea structurii “cap” -
• 2. Procesul de splicing
• 3. Clivarea unei portiuni 3’UTR si poliadenilare la extremitatea 3’
!!! Transcriptie la EK
1. Adaugarea structurii “cap” (Capping)
• Structura cap este o grupare
• Este atasata la primul nucleotid transcris
• Primul nucleotid transcris prezinta urmatoarele caracteristici:
• contine de regula o baza azotata purinica (m6A, A, G), dar poate fi si C, U
• este metilat la gruparea 2’-OH a ribozei
• Structura “cap” este adaugata inainte ca pre-ARNm sa fie complet sintetizat (dupa unele studii insa,
structura “cap” este adaugata dupa sintetizarea pre-ARNm)
, A)
Structura “cap”
• Rol:
• reprezinta un semnal pentru initierea translatiei
• structura m7G5’ppp are o conformatie rigida care, favorizand
stivuirea bazelor, promoveaza formarea unor complexe de initiere
stabile. Un mesaj cu un capat m7G5’pppN este mai eficient decat
unul nemetilat G5’pppN sau necapat 5’pppN
• blocheaza actiunea ARN exonucleazelor si fosfatazelor, care pot
ataca aceasta extremitate
!!! Transcriptie la EK
2. Splicingul intronilor: inlaturarea intronilor si sudarea exonilor
• In urma eliminarii intronilor din pre-ARNm rezulta ARNm matur (Exonii 1, 2, 3, 4).
• Splicingul poate avea loc fie inainte, fie dupa clivarea portiunii 3’ a transcriptului si poliadenilare
(dupa unele studii insa, inlaturarea intronilor are loc intotdeauna inainte de poliadenilare)
• In unele cazuri molecula de pre-ARNm sufera un proces de splicing alternativ, in urma caruia
sunt eliminati selectiv nu doar intronii, ci si anumiti exoni. Mecanismul de splicing alternativ are
drept rezultat producerea a diferite molecule de ARNm matur (ex. format din exonii 1, 2, 4, 5 sau
din exonii 1, 2, 3, 5 etc.) determinand producerea unor proteine cu secvente de aminoacizi
diferite, cu structuri diferite si uneori cu functii biologice diferite (izoforme proteice).
• Concept initial: O gena codifica o proteina.
• Concept actual: Genele pot codifica mai multe proteine deoarece in urma transcriptiei rezulta un pre-ARNm
matur care poate fi supus unui mecanism de splicing alternativ.
!!! Transcriptie la EK
3. Clivarea unei portiuni 3’ UTR si Poliadenilare la extremitatea 3’
• O parte din regiunea 3’UTR este inlaturata
• Coada poli A este adaugata de enzima poli A polimeraza la aproximativ 20 nt dupa
secventa 5’AAUAAA3’ din 3’UTR.
• Sunt adaugate:
• ˜ 100 A la drojdie
• ˜250 A la mamifere
• Rolul cozii poliA:
• ajuta la transportul ARNm matur din nucleu in citoplasma (prin membrana
nucleara)
• confera stabilitate transcriptului
• impiedica atacul exonucleolitic la capatul 3’
• interactioneaza cu proteinele ribozomale si alte proteine
• Exista si exceptii in care ARNm nu are o coada poliA.
!!! Transcriptie la EK
Structura ARNm matur la EK:
care blocheaza extremitatea 5’
• Regiunea “leader” (5’UTR)
• nu va fi translatata in proteine
• contine situsul de atasare la ribozom
• are o lungime variabila (30-sute de nt)
• Regiunea codificatoare
• va fi translatata in proteine
• prezinta o secventa START (AUG) si se termina cu o secventa STOP (UAA - ochre, UAG -
amber, UGA - opal)
• contine exonii sudati in urma procesului de splicing; rar contine introni
• lungime ˜300-3000 nt
• Regiune “trailer” (3’UTR)
• nu va fi translatata in proteine
• lungime ˜50-300 nt
!!! Transcriptie - mecanism
• ARNm:
• Monocistronic
• Policistronic
(Cistron=Gena)
PK
• o secventa de ribonucleotide bogata in purine centrata in pozitia -10 avertizeaza asupra
unui codon start
• codoni START: frecvent (AUG), mai putin frecvent (GUG), rari UUG, AUU, CUG
• codoni STOP: UAA, UAG, UGA
EK
• codonul START se afla in vecinatatea capatului 5’ al ARN, care are o structura cap
(m7G5’ppp)
• codon START: AUG
• codoni STOP: UAA, UAG, UGA
-10 +1