Gena ETV6

ETS varianta 6
Proiect realizat de Nicolaeva Galina
Disciplina : Biologie Moleculară

Structura proteinei ETV6

 Caracteristica
genei ETV6

Această genă codifică un factor de

transcripție al familiei ETS. Produsul
acestei gene conține două domenii
funcționale: un domeniu N-terminal care
este implicat în interacțiunile proteină-
proteină cu el însuși și cu alte proteine ​
și un domeniu de legare a ADN-ului C-
terminal.  Modelarea structurală a ETV6 cu mutațiile
ETV6 L349P și N385fs ale liniei germinale. 
 Locus

Gena ETV6 umană este situată în poziţia "13.2" pe braţul scurt ("p") al

cromozomului 12, poziţia sa notată este 12p13.2. 
 Structura genei ETV6
Gena ETV6 conține 14 exoni și 13 introni.

Conține 12 promotori, printre care se enumeră următorii:

 GH12J011544 : Intrările promotorului în DB sursă sunt ENSR00001189441 , ENSR00000450587,

ENSR00000450588, distanța TSS -103.5 kb, are 35 TFs - POLR2A, BCL11A, MAZ, RCOR1, EBF1 ...

 GH12J011556 : Intrarea promotorului în DB sursă este ENSR00001189443, distanța TSS -94.5 kb, are
2TFs - CREB1, MLLT1

 GH12J011648 : Intrările promotorului în DB sursă sunt ETV6_1 și ETV6_2, distanța TSS +4,3 kb, are 159
TFs - KLF6, POLR2A, SP1, SIX5, JUND …

 GH12J011743 : Intrările promotorului în DB sursă sunt ENSR00000450626, ENSR00000450627 și

ENSR00000450628, distanța TSS +102,5 kb , are 82 TFs - SP1, POLR2A, CEBPG, BCL11A, ZNF207 ....

 GH12J011773 : Intrarea promotorului în DB sursă este ENSR00001189446 , distanța TSS +125,1 kb, are
10 TFs - POLR2A, EBF1, SPI1, MYC, MAX...
 Structura genei ETV6
Conține 121 enhanceri, printre care se enumeră următorii:

 GH12J011506 : Intrarea enhancer-ului în DB sursă este ENSR00001189439 de tip distal, distanța TSS -143.3
kb, are 2 TFs- CEBPB, CTCF

 GH12J011554 : Intrările enhancer-ului în DB sursă sunt chr12:11554067-11554236 de tip proximal, , distanța

TSS -95.4 kb, are 37 TFs - POLR2A, CTCF, REST, RCOR1, ZNF654 ....

 GH12J011604 : Intrarea enhancer-ului în DB sursă este ENSR00000965123 de tip proximal, distanța TSS -45.0
kb, are 2 TFs - JUNB, NANOG

 GH12J011663 : Intrările enhancer-ului în DB sursă sunt chr12:11663012-11667899 de tip distal, distanța TSS
+15.9 kb, are 3 TFs - ELF1, SPI1, POLR2A

 GH12J011701 : Intrările enhancer-ului în DB sursă sunt chr12:11701067-11701759 de tip distal, distanța TSS
+51.8 kb, are 1 TF – HLF
 Etapele expresiei genei ETV6 :
1) Identificare și transcripție (ARN – polimeraza II + NTP, TFII-D, TFII-A,
TFII-B, TFII-F, TFII-E, TFII-H)
2) Processing (splicing constitutiv, splicing alternativ, cap-are, poly- adenilare)
3) Transfer (pe ribozomii liberi - exportine)
4) Translație cu sinteza preproteinei (ARNm, ARNt, RNP80S, Peptidil-
transferaza, factori de translație: eIF, eEF, RF)
5) Maturizarea proteinei (chaperone)
Secvența reglatoare a genei ETV6 :
 Promotor netranscris
 Boxe specifice (ELF1, SPI1, EBF1…)
 12 promotori
 121 ehanceri
 Terminator- situs PolyA
 Funcția
genei ETV6

 La nivel molecular
Codifică un factor de transcripție al
familiei ETS.
 La nivel celular
Factorul de transcriepție ETV6
joacă un rol critic în hematopoieză
și în dezvoltarea embrionară.
 La nivel de organism
Asigură funcționalitatea normală a
organismului.

Hematopoieză
 Localizarea proteinei
Factorul de transcripție ETV6 este localizat în principal în nucleu și citosol.
Structura proteinei ETV6
 FUNCȚIE la nivel de moleculă și țesut
Proteina ETV6 reprezintă un represor transcripțional, ce se leagă la secvența de ADN
5'-CCGGAAGT-3’.
Factorului de transcripție ETV6 se leagă de ADN pentru a reprima sau scade
transcripția unor seturi de gene specifice transcrise de ARN polimeraza II.
Expresie omniprezentă în apendice (RPKM 7.0), măduva osoasă (RPKM 6.7) și alte 25
de țesuturi, ce asigură activitatea normală.
Proteina ETV6 este una din cele
22 proteine implicate în reglarea
genei celulelor stem
hematopoietice de către
Complexul GABP alfa/beta.
GABP este un regulator
global al sintezei ribozomilor.
 Rol medical
Mutațiile în gena ETV6 duc la producerea
unei versiuni defectuoase a proteinei sau
împiedică producerea acesteia.
Mutațiile liniei germinale în ETV6 sunt
responsabile pentru o trombocitopenie
familială și un sindrom de predispoziție la
leucemie.
Mecanismele prin care disfuncția ETV6
promovează trombocitopenia și leucemia
rămân neclare. Îngrijirea persoanelor cu
predispoziție la trombocitopenie și leucemie
asociată cu ETV6 include consiliere genetică,
tratamentul sau prevenirea sângerării
excesive și supravegherea dezvoltării
malignității hematologice.
 Concluzi
i
Atât gena ETV6, cât și proteina codificată de aceasta, au un
rol major în funcționalitatea normală a organismului, fiindcă
datorită prezenței factorului de transcripție ETV6 are loc
reglarea dezvoltării și creșterii diferitelor tipuri de celule, în
special fiind implicată în hematopoieză.
Cu toate acestea, gena ETV6 suferă frecvent diferite mutații
care pot provoca afecțiuni grave precum trombocitopenie și
predispoziție la leucemie, care trebuie depistate în cel mai
scurt timp pentru a fi luate toate măsurile necesare.
Bibliografie
https://medlineplus.gov/genetics/gene/etv6/#resources
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2120
https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=ETV6&keywords=ETV6
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33768492/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16530192/
https://www.uniprot.org/uniprot/P41212#function
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26522332/