MUTATII

curs

 Jean-Baptiste Lamarck (1744-1829) a propus n 1801 teoria motenirii caracterelor dobndite induse de mediul nconjurtor, cunoscute ca transformare sau transmutaie. Idee a fost ignorat sau criticat dur n timpul vieii sale. Astzi, Lamarck este asociat cu teoria discreditat a ereditii (dar lamarcksismul a persistat ntre 1930/1940).

 Charles Darwin (1809-1882) a artat ca adevratele variaii adaptative rezult prin mutaii ntmpltoare i selecie natural (1859,Originea speciilor). Contrar lui Lamarck, motenirea trsturilor dobndite nu rezult prin influena mediului nconjurtor. De-a lungul vieii Darwin a redescoperit rezultatele controversate ale lui Mendel privind importana relativ a mutaiei i seleciei.

 Notiunea de mutatie a fost elaborata in anul 1901 de catre Hugo de Vries care este autorul binecunoscutei teorii mutationiste. Mutatia poate fi definita ca fenomenul prin care se produc modificari in materialul genetic ce nu sunt provocate de recombinarea genetica sau de segregare. Ele pot aparea in mod spontan si atunci sunt denumite mutatii naturale, sau pot fi induse experimental, fiind deci vorba de mutatii artificiale. Intre aceste doua tipuri de mutatii nu sunt deosebiri de ordin calitativ.

 Salvador Luria i Max Delbrck (1943) a concluzionat c o populaie de E. coli care pornete de la o singur bacterie ar trebui s exprime modele diferite privind rezistena T1. Conform teoriei adaptrii, acestor bacterii le este indus rezistena cnd T1 este adugat; proporia celulelor rezistente ar trebui s fie aceeai pentru toate culturile cu acelai fond genetic. Conform teoriei mutaiilor, aceste evenimente ntmpltoare confer rezisten la T1; culturile duplicate cu acelai fond genetic trebuie s exprime rezistente la T1 in proporie diferit.

 Mutatiile pot fi definite (E.Mayr-1963) si ca "modificari discontinue cu efect genetic". Ele pot afecta diferite unitati ale materialului genetic. Variabilitatea genetic este determinat, pe de o parte, prin recombinare genetic i pe de alt parte, prin mutaii. Tipuri de variabilitate l rolul lor in evoluie Din punctul de vedere al semnificaiei lor n relaiile organismului cu mediul, ca i n procesul evoluiei (deci ca fenomen individual), variaiile se pot mpri n dou mari categorii:

 a) variabilitate care afecteaz structura genotipului i, din aceast cauz, se pot transmite la descendeni; b) variabilitate care afecteaz doar caracterele fenotipice, genotipul rmmnd neschimbat; asemenea variaii nu se pot transmite la descendeni. Din prima categorie fac parte mutaiile, n sensul cel mai larg al acestei noiuni, i recombinrile genetice. Variabilitatea genetic determinat prin recombinarea genetic consta n realizarea unor combinaii genetice noi prin rearanjarea sau redistribuia materialului genetic care provine de la genitori.

EREDITATE

GENETICA

VARIABILITATE

ADN

RECOMBINARE GENETIC

MIGRAII

STOCARE EXPRIMARE Meioz

Recombinare intracromosomic Recombinare intercromosomic

genice

Codon

Transcripie (nucleu)

MUTAII

cromosomice

ARNm Fecundare

Recombinare genomic

genomice

Translaie (ribosomi)

mitocondriale Peptid

TRANSMITERE

REPLICAREA ADN (semiconservativ)

Mitoza (celule somatice) DIVIZIUNEA CELULEI Meioza (celule germinale)

Transmiterea informaiei n succesiunea generaiilor celulare Ovare Ovule Fecundare Zigot Testiculi Spermatozoizi
Transmiterea informaiei n succesiunea generaiilor de organisme

 In procesul recombinrii pot fi implicate uniti genetice diferite, adic genomul, cromosomul sau gena, astfel nct vom avea recombinare genomic, cromosomial i genic. Recombinarea genomic se produce n momentul fecundrii. Variabilitatea genetic se realizeaz prin recombinarea genomic, dar numai cu condiia esenial ca genomurile care se ncrucieaz s fie ct mai diferite. In cursul formrii gameilor, se produc fenomene genetice specifice diviziunii meiotice.

 Pot avea loc 2 tipuri de recombinare: o recombinare intercromosomial, n care sunt implicai cromosomi omologi ntregi i o recombinare intracromosomiala, la care particip segmente din cromosomii omologi. La baza variabilitaii pot sta configuraii genetice nou-realizate prin schimburi reciproce de segmente cromatidice ntre cromosomii omologi si are loc n profaza meiozei primare.

 Schimburile ntre cromozomii omologi pot duce la schimbul de fragmente, sau de catene ntregi de ADN. n meioz, n special, aceste schimburi se produc frecvent ntre cromozomul de origine matern i patern, astfel nct genele cromozomilor din celulele fiice (gamei), sunt recombinri heterogene ale fragmentelor. Rezultatul implic un amestec de caractere ereditare ale celor doi prini i constituie patrimoniul noului individ. Schimburile garanteaz meninerea fiecrei gene, a fiecarui locus sub form de alel homozigot, sau heterozigot.

 Prin mutaie se nelege o modificare anormal i ereditar a materialului genetic, (alterri ale mesajului genetic). Mutaia poate fi definit i ca fenomenul prin care se produc modificri n materialul genetic, modificri ce nu sunt provocate de recombinarea genetic. Ele pot aprea n mod spontan i sunt denumite mutaii naturale, sau pot fi induse experimental, fiind vorba de mutaii artificiale. Mutaiile pot fi definite i ca ,, modificri discontinue cu efect genetic,

 Mutaia poate produce o schimbare detectabila a fenotipului unei celule sau individ. Mutaiile care apar ntr-o celul somatic se pot transmite prin mitoz celulelor fiice, deci pot constitui punctul de pornire pentru formarea unei linii celulare anormale care are posibilitatea de a putea modifica structura i funcia unor esuturi sau a unor organe. Mutaiile aprute n celulele somatice nu se transmit prin gamei generaiilor urmtoare, ceea ce nseamn c toate celulele individului care se dezvolt din zigotul mutant vor fi, la rndul lor, purttoare ale mutaiei. In funcie de mrimea materialului genetic interesat gen, cromosom, genom se pot descrie 3 tipuri de mutaii, corespunztoare fiecrei uniti genetice de interes

 mutaii genice ce pot interesa ntreaga gen, mai mult nucleotide sau unul singur - perechea de nucleotide este cea mai mic unitate de mutaie mutaii cromosomice sunt modificri structurale ale cromosomilor ce constau n pierderea, ctigul sau rearanjarea unor segmente din cromosom; mutaii gemomice sunt modificri ale numrului diploid 46 de cromosomi ntregi, afectnd fie 1-2 perechi cromosomi aneuploidie, fie toi cromosomii, prin adugarea a 1-2-3 seturi haploide poliploidie.

 Mutaiile genice Unitatea elementare a ereditatii este gena. Ea reprezinta o particula materiala diferentiata in materialul genetic care controleaza sau conditioneaza manifestarea uneia sau a mai multor caracteristici ereditare ale unui organism. Pozitia ocupata de gena in cromozom se numeste locus. Ca urmare a mutatiei, o gena poate prezenta mai multe variante, denumite alele din care numai cate una singura exista in fiecare cromozom. Rezulta ca in organismele diploide pentru fiecare caracteristica exista doua gene alele, in timp ce in organismele haploide exista o singura gena alela. Alelele se unesc prin fecundare (in zigot, cu structura 2n) si se separa prin diviziune reductionala (in gameti, n).

 Mutaiile genice reprezint modificri ale structurii i funciei genei. Ele constau ntr-o modificare survenit n secvena normal a nucleotidelor care intr n structura genei. Gena poate fi definit modern ca fiind un segment polinucleotidic al moleculei de ADN care deine, sub form codificat, informaia genetic necesar sintezei unei proteine cu structur i funcie specific.

 Genele aprute prin modificarea genelor normale sunt numite gene mutante. De regul, genele normale sau slbatice sunt dominante (predomin n prima generaie). n rezultatul procesului de mutaie, una si aceeasi gen poate aprea sub mai multe forme discrete, cunoscute sub denumirea de alele. Alelele sunt expresii difereniate ale unui caracter. n cazul n care gena a suferit mai multe procese mutaionale n acesti loci se pot gsi gene polialele. n funcie de plasarea lor n autozomi sau heterozomi, genele pot fi autozomale sau heterozomale.

 n cazul plasrii lor n heterozomi, genele manifest fenomenul de sex-linkage, transmindu-se cu frecven mai mare la unul dintre sexe. Dup funcia lor, genele sunt divizate n: gene structurale, gene reglatoare si gene operatoare. Genele structurale codific diferite proteine cu rol structural sau enzimatic. Genele operatoare declanseaz sau nu activitatea genelor structurale. Genele reglatoare controleaz si dirijeaz activitatea genei operatoare si a genei structurale.

 Genele sunt localizate n cromozomi, aranjate liniar dea lungul cromozomulu. Pornind de la aceast idee, a fost elaborat concepia clasic, conform creia gena are trei caracteristici de baz: funcional (determin caracteristicile ereditare); mutaional (structura chimic a genei se schimb prin mutaie, ceea ce duce la apariia caracterului nou); de recombinare (n cadrul procesului de crossing-over are loc un schimb de gene corespunztoare ntre cromatidele nesurori ale cromozomilor omologi).

 n funcie de modul cum se produce aceast modificare, mutaiile genice se produc prin: -substitutie, substituiri ale unei perechi de nucleotide prin alta, -prin adiie sau adugarea uneea sau mai multor perechi de nucleotide sau prin -deleii (pierderi) ale unei perechi de nucleotide.

 Mutatiile prin substituie pot fi realizate prin tranziie i transversie.

 n cadrul tranziiilor, o baz azotat este nlocuit cu o alt baz din aceeai categorie. De pild, o baz purinic este nlocuit printro alt baz purinic, adic A-TG-C. Deoarece o baz purinic dintr-un lan nucleotidic al ADN este legat de o anumit baz pirimidinic (complementar) din cellalt lan. aceast nlocuire va atrage i nlocuirea bazei pirimidinice corespunztoare din lanul complementar.

 n cazul transversiilor, o baz purinic este nlocuit cu alta pirimidinic (sau invers) (cu nlocuirea deci i a bazei complementare). Deci se pot produce urmtoarele substituiri prin transversii A-TC-G; A-TT-A; G-CC-G; G-CT-A. Prin urmare, n ambele cazuri, n ultim instan o pereche de baze este nlocuit prin alt pereche ceea ce determin transformarea unui codon (a unui triplet) n altul, fapt care duce la modificri n sinteza lanurilor polipeptidice.

 In urma unei substituiri rezult dou feluri de codoni: -unii sunt similari celor trei codoni non-sens i mutaiile se numesc non-sens, alii codific alt aminoacid, mutaiile avnd sens fals. Mutaiile prin substituie sunt relativ frecvente. Substituia duce la modificarea unui singur codon (sens sau non sens). Schimbarea unui codon sens va determina unul din urmatoarele efecte:

 Mutaia neutr -diferit: Substituirea bazei pereche rezult prin substituirea unui aminoacid cu proprieti chimice similare (funcia proteinei nu este alterat). Mutaie non-sens oprirea sintezei proteinei, n cazul n care noul codon format prin substituie este un codon non sens sau stop;

 Asemntoare/mutaii discrete: n urma substituiei bazei pereche rezult acelai aminoacid. Se pstreaz structura iniial, normal a proteinei deoarece codonul rezultat prin substituie este sinonim, cu cel modificat; Mutaii prin schimbarea scheletului: Deleia sau inseria (nedivizibile cu 3) determina translaia unui aminoacid incorect, un codon stop prematur (polipeptide scurte) sau citirea complet, incorect, pana la codonul stop (polipeptide lungi).

 Mutaii punctuale constau n substituie, supresie (lips) sau adiia de baze. Se realizeaz prin: depurinare (pierderea purinelor) dezaminare (citozina metilat trece n timin pe catena sens i G-A pe catena antisens) erori de replicare sau de reparaie.

 Tipuri de mutatii-mecanisme de producere Substitutia unui nucleotid CTGGAG CTGGTG

 Inversia unui nucleotid prin alt nucleotid va duce la modificarea unui codon i lectura sa n sens invers. Consecinele inversiei sunt aceleai ca i la substituie. Prin deleie se inelege lipsa uneea sau mai multor perechi de nucleotide din molecula de ADN. Natura anomaliei produse va depinde de numarul de perechi de nucleotide implicat n deleie. Deci prin deletie se pierde material genetic. Deletiile (pierderile), ca si aditiile (adugirile) unei perechi de baze, schimb complet secventa aminoacizilor, deci structura proteinei, deoarece modific citirea codonilor pornind de la punctul n care s-a produs mutatia.

 Deleia are importan variabil n funcie de lungimea lor: de la 1 la 2 nucleotide ele decaleaz cadrul lecturii; a 3 nucletotide, duce la absena unui codon i deci supresia (lipsa) aminoacizilor n proteinele exprimate; mai mari, ele pot suprima expresia uneia sau mai multor exoni sau a genei n ntregime.

De pild, o succesiune initial a codonilor poate fi: ATG, ACG, AGT, GCC, ATC... Dac din primul codon se pierde T, atunci secventa devine AGA, CGA, GTG, CCA, TC,. .. deci modificat complet. Deoarece substantele proteice pot avea rol enzimatic sau unul structural, o asemenea mutatie va putea afecta fie activitatea enzimatic, deci desfsurarea unor anumite ci metabolice cu consecintele ce decurg din ele, fie direct structurile. Experiente pe Drosophila, de pild, au artat c mutatiile genice pot afecta cele mai diferite caractere morfologice (dimensiuni, culori, chetotaxia, forma organelor etc), fiziologice, de dezvoltare, de rezistent la diferiti factori etc. Mutatiile genice reprezint cea mai important surs de noi caractere. Efectul lor genetic const, de fapt, n adugarea de noi alele (noi expresii) ale unui locus si, deci, mbogtirea patrimoniului ereditar al indivizilor si populatiilor.

 Mutaia odat aprut se transmite generaiilor urmtoare. Inseria sau adiia nseamn introducerea unui nucleotid n mesajul unei gene, din punctul de inserie lectura codonilor se va face decalat, fals, realizndu-se o protein cu secven anormal. Inseriile sunt de importan variabil n funcie de lungimea lor: -de la 1-2 nucleotide, ele decaleaz cadrul de lectur (codon); -de 3 nucleotide, conduc la adiia unui aminoacid n proteina exprimat; -cele de lungime mare pot modifica complet transducia exonilor. n intronii sau n exonii netradui se ntlnesc adesea inserii lungi, cu structur variabil, care sunt fr efect aparent asupra expresiei genei.

 Tipuri de mutatii Mutatii frameshift -mutatii cu schimbarea cadrului de lectura AAG AGT ATC ACT AAG lys ser ile thr lys + 1 nucleotid AAG GAG TAT CAC TAA G lys glu tyr his stop

 Mutatii non sens-substitutia unui nucleotid va produce un codon STOP ATG ACC GAC CCG A AA met thr asp pro lys ATG ACC GAC CCG T AA met thr asp pro STOP

 Reversia sau mutaia supresiva, este o mutaie care intereseaz o alt mutant, determinnd revenirea la fenotipul normal-slbatic. Reversia adevarat transform codonul mutant n normal iar reversia numit supresiv produce o a doua mutaie, diferit ca poziie de prima dar care corijeaz efectul ei. Duplicaii i hiperduplicaii sunt catenele polipeptidice alfa, beta, gama, delta, care se gsesc n hemoglobinele normale.

 Mutaii n genele de reglare Sinteza proteinelor codificate de genele de structur este reglat prin intervenia unor gene operatoare i reglatoare. Mutaiile n gena operatoare pot determina fie blocarea, fie activarea continu a transcripiei. Aceste mutaii determin, prin oprirea transcripiei, deficiena concomitemt a mai multor enzime, controlate de genele incluse n acelai operon.

 Mutaiile n genele reglatoare duc la schimbarea tipului sau ritmului de sintez proteic. Mutaii care controleaz expresia unei gene Sunt situate n zona reglatoare a genei de exemplu: - n promotor, - la nivelul codonului de iniiere a transcripiei sau la nivelul situsului de poliadenilare. Pot fi situate pe gene codante pentru proteine care intervin n reglarea expresiei, exemplu gene codante pentru factori de transcripie.

 Mutaii de replicare sau dinamice Sunt erori ale replicrii mitotice sau premeiotice care determin o alunecare a unor zone presupuse instabile ale genomului. Ele determin o amplificare (mutaie dinamic) sau o reducere a zonelor repetate. Persist mai multe generaii i cresc n cursul generaiilor. Se regsesc n anumite maladii genetice pentru care s-au observat fenomenul de anticipare i rezultatul instabilitii repetiiei di sau trinucleotidice. Exemplu, numrul de repetiii de trinucleotide este foarte variabil n genom de la un subiect la altul (polimorfism multialelic). Aceste repetiii de trinucleotide sunt utilizate ca markeri genetici. Totui cnd se depete un anumit numr de repetiii pe locus au efect patologic.

 Mutaiile genetice sunt responsabile de expansiunea secvenelor scurte (CGG) n boala X fragil (cu numr de repetiii peste 50). ntr-o prim generaie se observ o premutaie care conine un numr de repetiii peste normal. n generaia urmtoare crete numrul premutaia devine mutaie i apare boala la o vrst precoce. Aceste expansiuni i schimb talia mrimea n timpul transmiterii bolii de la prini la copii (cromozomul X). Aceste mutaii sunt dinamice i explic variabilitatea fenotipului, penetrana i variabilitatea bolilor genetice n care apar.

 Originea mutaiilor genice la om Mutaiile genice pot fi spontane sau induse. Primul tip, mutaiile spontane este determinat de factori necunoscui, imposibil de definit. Al doilea tip, mutaiile induse sunt produse prin aciunea unor factori cunoscui cum ar fi, fizici, chimici, biologici. Mutaiile spontane- ar putea fi determinate de radioactivitatea naturala ca, razele cosmice, radioactivitatea terestr permanent, iradierea intern. Dup Frezel, mutaiile spontane ar reprezenta 1,5% din totalul mutaiilor nregistrate la om. Exist evident variaii regionale- geografice determinate de soluri cu radioactivitate sporit sau de altitudine nalt, deci cantitate mai mare de raze cosmice. Frecvena unor afeciuni ereditare s difere de la o localitate la alta, n corelaie cu valoarea iradierii locale.

 Pn n prezent, aceast deducie n-a fost verificat prin cercetrile efectuate, n cursul istoriei unele regiuni cu iradiere crescut ar fi devenit celebre, prin abundena patologiei congenitale i genetice. O problem n studiu rmne creterea radioactivitii ambiante, determinat eventual de activiti umane ca cele din centralele nucleare, extracie de minereu radioactiv, explozii nucleare. Aceast problema se face cu doze mici care genereaz o cretere slab dar real a frecvenei bolilor dominante.

 Mutaiile induse sunt determinate de factoriageni mutageni care au capacitatea de a produce mutaii cu o frecven superioar mutaiilor spontane. Factorii mutageni la om sunt fizici cum ar fi radiaii ionizante, chimici cum ar fi agenii alchilani, acidul nitros, biologici probabil virusuri. Ei determin citirea greit a ADN n timpul replicrii determinnd -mutaie- principiul care st la baza aciunii unor citostatice -baze analoage

 Razele UV (260 nm) i radiaiile solare cu lungime de und mic determin formarea de dimeri de pirimidin prin legturi
C=C; T=T. ADN pol citete greit rezultnd mutaii

 Radiaii Ionizante Se caracterizeaz prin: energie mare, fragmenteaz ADN, avnd efect letal. 5-Bromouracil seamn cu T din ADN i se mperecheaz cu G-intercalat. Bromura de Ethidium - distorsioneaz topografia DNA.

 Ageni Alkilani- introduc grupri alkil (metil, etil) n bazele componente ale ADN i perturb citirea. UV (254-260 nm) determin formarea de dimeri anormali de purine i pirimidine pe care le ncorporeaz n catene de ADN.

 numarul de mutaii induse este direct proporional cu doza de iradiere aplicat; radiaiile ionizante produc mutaii chiar n doze mici, cci nu exist un prag la aciunea lor mutagen; efectul radiaiilor este cumulativ, indiferent de distribuia lor n timp, ceea ce conteaz este doza total primit, totui s-a observat c iradierea cronic are efect de 2- 3 ori mai mic ca iradierea acut.

 Omul este expus iradierii artificiale n aciunile de radiodiagnostic, n industria nuclear sau n urma diferitelor accidente. Orice procedur radiodiagnostic sau terapeitic este teoretic mutagen. Practic, lucrul este valabil pentru iradierile importante. In evaluarea riscului genetic la diferite radiaii trebuie s se in cont de ,doza de dublare, adic valoarea de iradiere dincolo de care proporia mutaiilor spontane se dubleaz. Este obligatoriu s asigurm o protecie perfect a individului i mediului fa de radiaii i s evitm orice iradiere excesiv.

 Efectul mutagen al substanelor chimice a fost descoperit n timpul celui de-al doilea rzboi mondial, de o echip de geneticieni englezi care au demonstrat aciunea mutagen a iperitei (substan toxic cu aspect de lichid uleios, folosit ca arm chimica n primul rzboi mondial n oraul Ypres). De atunci numrul cercetrilor ca i al substanelor chimice cunoscute a crescut enorm. In fiecare an se sintetizeaz 30 000 de substane noi, din care cel puin 15 sunt sigur mutagene. Din fericire, la om nu s-au putut demonstra efecte certe mutagene dect pentru un numr mic de substane.

 Substanele chimice mutagene pot fi grupate n dou categorii: substane ce interfereaz sinteza ADN; substane ce altereaz structura ADN. Apariia mutaiilor genice la om poate fi influenat de vrsta prinilor. Cu ct prinii sunt mai n vrst cu att riscul de a acumula mutaii i a le transmite copiilor este mare.

 Frecvena medie cu care se produce un eveniment mutaional particular, per celul sau individ i per generaie se numete rat de mutaie. Ea se apreciaz prin diferite metode fenotipice directe i indirecte, demografice bazate pe numrul subiecilor cu mutaie, depistai ntr-o anumit zon i perioad de timp. Frecvena indivizilor cu mutaie ntr-o populaie este diferit de cea de la natere, deoarece exprim echilibru dintre rata mutaiei genei i eficiena seleciei ce acioneaz pentru eliminarea ei.

 Consecinele mutaiilor genice Efectul primar al mutaiilor genice l reprezint modificarea secvenei aminoacizilor n moleculele polipeptidice sintetizate pe baza informaiei acestor gene. Efectul biologic al acestei modificri depinde de tipul de aminoacid substituit i de locul su particular n molecula polipeptidice. Efectul primar este urmat de o mulime de efecte secundare. Dup valoarea adaptativ i consecinele mutaiilor genice asupra structurii i funciei organismelor ele se pot mpari n mai multe grupe:

 mutaii neutre care produc polimorfismul biologic intraspecific, exemplificat prin grupele sanguine, serice; mutaii deviante (defavorabile) care antreneaza un handicap mai mult sau mai puin sever i creeaz fie o boal fie numai o predispoziie la boal, unele din ele sunt ,mutaii letale sau subletale deoarece influeneaz decisiv viabilitatea i reproducerea individului; mutaii evoluante cu valoare adaptativ mai mare ca normalul, ele ,produc indivizi mai bine adaptai, mai rezistenti la mediu.

 Efectul mutaiilor genice depinde i de tipul de celul afectat, germinal sau somatic. Mutaiile germinale se trensmit prin gamei la descendeni , cele somatice nu se transmit la urmai dar determin apariia unor clone anormale, n cazul n care aceste clone persist, nu sunt eliminate de organism i evolueaz, vor modifica structura i funcia unui esut sau organ. Mutaiile somatice se definesc ca totalitatea modificrile transmisibile care apar n genomul celulelor somatice. Ele pot fi genice sau cromozomale.

 Ca exemplu de mutaii somatice pot fi menionate, zonele albstrui din iris la persoanele cu ochi cprui sau bruni, apariia de hematii A sau B la persoane cu grupa sanguin AB- prin incapacitatea sintezei ambelor antigene. Mutaiile somatice prin clonele anormale pe care le produc i secundar prin modificrile morfo-funcionale ale organelor, au fost implicate n geneza cancerului i accelerarea procesului de mbatrnire al organismului uman.

 Mutaia unui situs de matisare n afara zonelor de episaj normal exist situsuri criptice care pot fi active. Pot fi situate n exon producndu-se episaj anormal al exonului sau n intron, o poriune din intron, regsindu-se n paralel, n produsul transcris matur. Cel mai adesea apare un codon STOP n aval. O substituie, poate altera un situs de legare. Astfel, situsul donator a intronului 3 a apoAII este transformat din GT n AT ntr-o familie de bolnavi, ceea ce-l face inactiv pentru excizia acestui intron. Exist n mijlocul exonului 3, o secven care poate servi ca situs donator alternativ dar, care este normal inactiv (situs donor criptic). n absena situsului donator normal, acest situs criptic va servi la excizia intronului 3. Dar cum acest situs criptic este situat la 65 nucleotide n amonte de acest situs normal, vor exista 22 aminoacizi ai exonului 3 care nu vor fi tradui.

 Pe de alt parte numrul de nucleotide pierdute nefiind un multimplu de 3, va avea loc un decalaj al cadrului de citire, cel care antreneaz o traducere fals a primilor 10 aminoacizi ai exonului 4 i ntlnirea unui codon STOP prematur (Fig. 80). Proteinele ntrerupte nu se exprim i apolipoproteinemia AII este absent din plasma acestor bolnavi.

 Duplicrile se produc n tandem; o secven se gsete repetat de 2-3 ori ntr-un genom, n urma duplicrii. Aceast duplicaie permite fiecarei copii de secvene s evolueze pe cont propriu ceea ce crete ansa de producere a unor caractere noi. Transpoziiile rezult prin ncorporarea acizilor nucleici sintetizai din afara genomului: -fie prin ncorporarea unui virus; -fie prin transcripia invers a unui ARN celular, sau a unui virus prin intermediul unei reverstrancriptaze care produce un ADN complementar (ADNc) i o transpozaz care-l va ncorporaz n genomul celulei.

Transpoziia reprezint ncorporarea unei secvene de ADN nou ntr-o reciune de ADN genomic a unei celule.

Fig. Elemente transpozabile inserate.

n cursul evoluiei speciilor, genomul crete continuu, printr-o suit de duplicaii de gene i transpoziii.

 Transpozazele sunt grupuri de enzime codificate de elemente genetice mobile, cum ar fi transpozonii sau secvenele de inserie, care excizeaz i inser aceste elemente mobile. Transpozazele sunt proteine formate din 340-380 aminoacizi. Sunt implicate n recombinarea ADN n locuri specifice bacteriilor i altor organisme. Reverstranscripia la virusuri ARN din HIV atunci cnd ptrunde n snge este recunoscut de receptorul CD4 al limfocitului T4. Formarea complexului receptor-virus antreneaz fuziunea anvelopei virusului i a membranei limfocitului i prin urmare virusul ptrunde n citoplasm. Virusul conine o enzim reverstranscriptaz i un ARN viral purttor al informaiei genetice. Enzima catalizeaz retrotranscripia ARN viral n ADN i ncorporeaz acest ADN (provirus) n ADN limfocitului.

 Provirusurile produc noi particule virale prin transcripie i se traduc prin moartea celulei i distrugerea ADN-ului su. Particulele virale noi sunt eliberate pentru a transmite semnalul altor LT4. Numrul LT4 diminueaz pn cnd rspunsul imun al subiecilor devine insuficient (SIDA), ceea ce antreneaz infecii oportuniste i se termin cu moartea indivizilor afectai. Ciclul unui retovirus Particula de retrovius este compus dintr-un nveli proteic ce nconjur o capsul proteic sau capsida, patrimoniul genetic al retrovirusului sub form de ARN monocatenar, ce conine gena pentru reverstranscriptaz i gene ale proteinelor de nveli (anvelopa) (fig.84).

 Cnd infecteaz o celul numai capsida penetreaz i traverseaz membrana i elibereaz ARN n citoplasma, unde ele se exprim ca un mesager. Astfel reverstranscriptaza sintetizat este o enzim capabil de: transcripie invers a ARN din virus n ADN complementar (hibrid ARN, ADN); distrugerea ARN pentru a-l nlocui cu o a II-a caten ADN. ADN dublu catenar se transpune n ADN nuclear al celulei gazd, de unde el poate fi transcris n multiple copii de ARN viral.

 Transducia acestui ARN conduce la sinteza de proteine, care se asambleaz n jurul ARN, pentru a constitui o nou particul viral n numr foarte mare (amplificarea virusului). n final celula gazd moare i pune n libertate particule virale i ciclu rencepe. Duplicarea genei Numeroase situaii pot conduce la duplicarea fragmentelor de ADN. Aceste duplicri sunt facilitate de existena unei secvene repetitive directe (secvena identic n acelai sens, la mic distan pe aceeai caten ADN). ntr-o bucl de replicare, secvenele repetitive directe, pot conduce la apariia a dou lanuri inegale de ADN replicate i dup schimburile dintre cele dou catene la o repetiie a fragmentelor de ADN (fig. 85). Atunci cnd schimburile dintre catene se fac n aceeai cromatid dup replicare, repetiia n tandem a aceluiai fragment, se regsete pe unul singur din cele dou catene.

Atunci cnd schimburile dintre catene se fac n aceeai cromatid dup replicare, repetiia n tandem a aceluiai fragment, s e reg

 n cursul meiozei, schimburile se pot produce ntre cromatide ca ntr-un crossing-over normal, dar cu repartizare inegal pe catene a secvenelor repetitive. n acest caz secvena de origine patern i matern se regsete la o serie pe acelai lan ADN, conducnd la dou gene identice (numite paraloage). n fiecare din aceste cazuri ADN purttor de repetiii beneficiaz adesea de dou gene identice, codante pentru aceeai protein. Aceast dispoziie confer indivizilor care primesc acest patrimoniu genetic o mai bun rezisten la mutaii care pot surveni pe o gen, deci un avantaj selectiv n favoarea genelor duplicate.

 Pseudogenele sunt: -gene care n urma modificrii structurii lor nu pot fi transcrise i sau traduse n proteine i se numesc gene neexprimate. -gene care apar prin multiplicare n cursul evoluiei i au suferit evenimente genetice (substituie, inserie, deleie) care, mpiedic transcripia sau transducia. La o duplicare a genei apolipotroteina CI se formeaz o gen apoCI, care are 40 miloane de ani n genomul primatelor. Prin mutaie recent, se transform ultimul aminoacid din peptida semnal a proteinei exprimate prin acea gen n codon STOP. Transcripia conduce la un ARNm dar acesta nu poate fi tradus dect printr-o peptid semnal fr a fi urmat de proteine n serie.

 Conversia genelor Transcripia unei secvene de ADN din gen care reprezint o copie a aceleiai gene vechi, duplicaia (copie homoloag) are ca rezultat reconstituirea omologiei genelor duplicate. Secvenele genelor pot fi transformate prin schimbarea complet a exonilor printr-o transpoziie pornind de la alte gene. Transpoziia unui exon poate aduga un domeniu nou n structura unei proteine sau restaurarea unui domeniu, devenind multifuncional n cursul evoluiei.

 Mutaii cromozomice nu afecteaz, n mod obinuit, structura genelor ci mai ales legturile dintre ele. Sunt restructurri ale cromozomilor n urma crora grupuri ntregi, mai mari sau mai mici de gene, sunt mutate de pe un cromozom pe altul. Deci ceea ce se modific este mai ales poziia reciproc i interaciunea genelor. Primele mutatii cromozomale au fost vizualizate in anii 1960 in celulele leucemiei.

 Un cromozom 22 anormal de mic a fost observat in celulele leucemiei, pe care l-au denumit cromozomul Philadelphia (1960). Cativa ani mai tarziu, folosind expunerea in banda a cromozomilor, a notat ca celulele tumorale nu numai ca au pierdut material genetic dar ca l-au si schimbat. In 1972 primele translocatii au fost descrise intre cromozomii 8 si 21, t(8;21) la pacientii cu leucemie mieloblatica acuta. In acelasi an, a demonstrat faptul ca, cromozomul Philadelphia a fost rezultatul unui schimb reciproc intre cromozomul 9 si cromozomul 22. A continuat sa identifice translocatii reciproce aditionale in cazul altor boli, translocatia t(14;18 )in limfomul folicular si translocatia t (15;17) in leucemia promielocitica acuta. Acesta a fost prima dovada ca bolile tumorale au avut o baza genetica.

 Dup mecanismul lor de producere, mutaiile cromozomice pot fi de mai multe categorii. - Deleiile constau n pierderea unui locus sau a mai multora de pe un cromozom. Duplicaiile i deleiile pot fi create printr-un crossing-over anormal n timpul meiozei. Marile deletii acoperind milioane de perchi de baze pot fi detectate utilizand cariotiparea; microdeletiile mici nu sunt intotdeauna vazute usor cu ajutorul acestei tehnici. De cele mai multe ori rezultatul unui asemenea fenomen (pierderea unui fragment de cromozom) este letal pentru organismul respectiv. Uneori ns funciile respective pot fi compensate de alte gene sau pot s nu aib efecte letale n cazul cnd au devenit inutile ca urmare a schimbrii unor condiii. De pild trecerea la modul de hran saprofit sau parazit nltur necesitatea unei serii ntregi de enzime.

 Inversiunile constau n inversiunea, cu 180, a unui segment de cromozom. Se poate produce prin ruperea cromozomului n dou locuri, dup care segmentul dintre rupturi se realipete la cromozom dar n poziie inversat. n acest fel se inverseaz, pe segmentul respectiv, ordinea genelor. Acest fenomen se produce mai ales n profaza fie a mitozei, fie a meiozei, cnd cromozomii lungi i subiri se mic activ n nucleu. n mod normal, cnd se produce mperecherea cromozomilor, genele omoloage se altur exact.

 Cnd se produce inversiunea, la mperecherea cromozomului cu inversiune cu un cromozom normal, se formeaz o bucl, pentru a permite alturarea genelor omoloage. In cazul unui organism heterozigot pentru o inversiune, genele segmentului inversat apar att de strns legate ntre ele nct nu sunt afectate de crossing over i se transmit n bloc i nu mai pot produce recombinri genetice. n felul acesta, inversiunea poate deveni un mijloc bun de pstrare a unei anumite combinaii a genelor, care se dovedete deosebit de avantajoas selectiv.

 In inversie nu se schimb cantitatea de material genetic din cromozom. Inversia nu altereaz expresia genelor numai dac captul inversiei se afl n interiorul genei. Duplicaiile sunt restructurri care afecteaz o pereche de cromozomi omologi: ntre ei se produce un schimb de segmente inegale, astfel c n timp ce pe un cromozom apare o deficien a unuia sau mai multor loci, pe cellalt cromozom aceti loci apar dublai. Uneori asemenea schimbri nu dau efecte fenotipice vizibile, alteori determin modificri de diferite naturi.

 Translocaiile constau n schimbri de segmente ntre doi cromozomi neomologi. Translocaia poate fi reciproc (schimb reciproc de segmente ntre cromozomi) sau simpl (un segment de pe un cromozom se transfer pe alt cromozom). i n cazul translocaiilor, ca i n cel al inversiunilor, la organismele heterozigote, n ceea ce privete translocaia, meioza este alterat din cauza dificultilor n mperecherea cromozomilor omologi. Aceasta poate produce anomalii. La om unele cazuri de mongolism se datoresc fenomenului de translocatie.

 Mutatii genomice Acestea constau n modificarea numrului cromozomilor, deci a garniturii cromozomice, prin modificarea numrului unuia, ctorva sau a tuturor cromozomilor. Aceste modificri reprezint fenomene reunite sub numele de poliploidie. Diferite forme de poliploidie rezult din anomalii n diviziunile celulelor germinale sau somatice si se pot datora celor mai diferite cauze ca, de pild, fuziunea de nuclei, diferite traumatisme, parazitism, substante chimice, ntepturi ale unor insecte, altoiri etc.

 Fenomenul este larg rspndit la plante, dar mult mai rar la animale. n mod obisnuit, majoritatea plantelor si animalelor sunt diploide, adic au o garnitur dubl de cromozomi n fiecare celul. n unele cazuri, de pild la unele insecte ce se nmultesc partenogenetic (deci prin ovule nefecundate), celulele primesc numai o garnitur simpl de cromozomi. Acestea snt organisme haploide iar garnitura lor cromozomic este monoploid. Monoploidia o ntlnim, de pild, la trntorii (masculii) din familiile de albine.

Ghid de nomenclatur genic

Intoducere
Gena segm. ADN ce contribuie la un anumit fenotip/funcie
Funcie necunoscut gena se caracterizeaz prin secven, transcriere sau omologie

Locus punct genomic, identificat cu ajutorul unui marker, ce poate fi localizat

Nu corespunde neaprat unei gene

Regiune cromozomial regiune genomic asociat cu un anumit fenotip/sindrom

Ex ANCR

Nomenclatura genic
1. Fiecare simbol genic trebuie s fie unic. 2. Simbolurile reprezint abrevieri sau prescurtri ale genei. 3. Simbolurile vor conine numai litere latine i cifre arabice 4. Nu se folosesc semne de punctuaie. 5. Nici un simbol nu se va termina cu litera G de la gene. 6. Simbolurile nu vor conine referine la o anumit specie, de exemplu- H/h ptr human.

Nomenclatura genic
Caracterul iniial va fi ntotdeauna o liter Toate caracterele se scriu n aceiai linie Se evit referirile la:
Specifictatea tisular Greutatea molecular Localizarea cromozomial

Exemple
Gene implicate n boli monogenice ex. BBS1 "Bardet-Biedl syndrome 1". Gene neidentificate-asociate cu un markerimplicate n BMF ex. IDDM6 "insulin-dependent diabetes mellitus 6 Segm. ADN clonate cu funcie descris - COX8 "cytochrome c oxidase subunit VIII". Pseudogenes ex. IL9RP1 "interleukin 9 receptor pseudogene 1".

Exemple
Gene codificate pe catena opus antisens- suprapus pe o gen cunoscut ex. IGF2AS "insulin-like growth factor 2, antisense". Segmente funcionale ADN transcrise dar netranslatate ex. XIST "X (inactive)-specific transcript". Gene deduse din aspectul fenotipic celular ex. LOH18CR1 "loss of heterozygosity, 18, chromosomal region 1 Gene cu funcie necunoscut dar care prezint secvene similare ex. FAM7A1 "family with sequence similarity 7, member A1" etc.

Caracter /simbol

Semnificaie

AS
AP BP C

antisense
Protein asociat Protein de legare catalitic

FAM
N sau IN L LOH

Familie de gene cu secv similare

inhibitor like Pierderea heterozigozitii

MT sau M
OS P

mitocondrial
Catena opus pseudogen

Simboluri genice n publicaii

Se scriu cu majuscule i italice genele i alelele
Se precizeaz:
(mRNA)RP1 (gDNA) RP1 (cDNA) RP1

Fonturi standard - simbolurile ptr proteine

Segmentele ADN
Simbolurile pot fi obinute din baze de date (Genome Database) Sunt alctuite din 5 pri ex DXS9877E
1. D ptr ADN 2. 0,1,2, ...X,Y, XY -ptr cromozomi
0 segm cr. necunoscut XY reg pseudoautozomal

3. S -secv unice, Z secv repetitive pe acelai cromozom sau F familii de gene 4. Numr unic 5. E- pentru secv exprimate

Notarea mutaiilor genice

Mutaie i polimorfism
Definiii inechivoce, noiuni diferit interpretate: polimorfism Modificare care nu cauzeaz boal sau O modificare care se ntlnete cu o frecven de 1% n populaie mutaie Modificare cauzatoare de boal sau Orice modificare Pentru a preveni confuzia, se recomand folosirea unor termeni neutri: "sequence variant variant de secven "allelic variant variant alelic

Principii fundamentale
Se recomand descrirea variantelor la nivel bazal, deci la nivel de ADN Descrierea trebuie s se bazeze pe o secven de referin de ADN genomic sau codant (RefSeq database) Se vor folosi numai simbolurile oficiale acceptate de HGCN Detaliile modificrii trebuie precedate de simbolul nivelului descris: "c." pentru secvena de ADN codant (de ex.: c.76A>T) "g. pentru secvena genomic (de ex.: g.476A>T) "m." pentru secvene mitocondriale (de ex.: m.8993T>C) "r." pentru secvena de ARN (de ex.: r.76a>u) "p." pentru secvene proteice (de ex.: p.Lys76Asn)

 Pentru a evita confuziile, descrierile variantelor la nivel de ADN, ARN i proteine sunt unice: ADN: notarea nucleotidelor cu majuscule Numrul primului nucleotid modificat Simbolul mutaiei De ex. c.76A>T or g.476A>T RNA: notarea nucleotidelor cu litere mici Numrul primului nucleotid modificat Simbolul mutaiei De ex. r.76a>u Protein: notarea aminoacizilor cu simboluri de trei litere ncepnd cu o majuscul Numrul poziiei aminoacidului modificat Simbolul mutaiei Aminoacidul modificat De ex. Pro12Ala

Numerotarea nucleotidelor ADN codant:

Exoni: Nu exist nucelotid 0 Nucleotidul 1 codific A din codonul START Introni: La nceputul intronului, jumtatea situat in amonte: numrul ultimului nucleotid din exonul precedent urmat de semnul + i poziia n introni al nucleotidului descris De ex.: c.77+1G La sfritul intronului, jumtatea situat n aval: numrul primului nucleotid al exonului urmtor, urmat de un semn minus i poziia n aval n intron al nucleotidului descris De ex.: c.78-1G Secvene genice netranscrise: Nucleotidele situate nainte de codonul START, n amonte de secvena codant captul 5 sunt numerotate ncepnd cu primul nucleotid situat cel mai aproape i folosind semnul - (-1, -2, etc.) Nucleotidele situate dup codonul STOP, n aval de secvena codant captul 3' sunt numerotate ncepnd cu primul nucleotid situat cel mai aproape i semnul * (* 1, * 2, etc.)

Pentru a evita confuziile, descrierile variantelor la nivel de ADN, ARN i proteine sunt unice:

 ADN: notarea nucleotidelor cu majuscule Numrul primului nucleotid modificat Simbolul mutaiei De ex. c.76A>T or g.476A>T RNA: notarea nucleotidelor cu litere mici Numrul primului nucleotid modificat Simbolul mutaiei De ex. r.76a>u Protein: notarea aminoacizilor cu simboluri de trei litere ncepnd cu o majuscul Numrul poziiei aminoacidului modificat Simbolul mutaiei Aminoacidul modificat De ex. Pro12Ala

Numerotarea nucleotidelor ADN genomic:

Numerotarea nucleotidelor este arbitrar Se ncepe cu 1 la nivelul primului nucleotid din secvena din baza de date de referin, care trebuie s includ toate nucelotidele din secvena genic inclusiv promotorul la captul 5' Nu se folosesc semnele + sau -

Intervalul de nucleotide afectate este separat de semnul _ (ntre primul i ultimul nucleotid modificat) De ex.: c.76_78delACT Dac nu se cunoate poziia exact a modificrii, intervalul presupus este citat n paranteze De ex.: c.(67_70)insG

Se folosete semnul > Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. poziia nucleotidului susbtituit 3. simbolul nucelotidului substituit 4. semnul > 5. simbolul nucleotidului nou Ex. c.76A>C c.-14G>C c.88+1G>T c.89-2A>C c.*46T>A

Substituii:

Deleii
Se folosete prescurtarea "del" Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Primul nucleotid pierdut 3. Semnul _ pentru notarea intervalului 4. Ultimul nucleotid pierdut 5. Prescurtarea del 6. Eventual se poate aduga secvena nucleotidic pierdut Exemple: c.76_78del (c.76_78delACT) c.88-?_923+? c.(?_-30)_(*220_?)del

Duplicaii
Se folosete prescurtarea "dup" Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Primul nucleotid duplicat 3. Semnul _ pentru notarea intervalului 4. Ultimul nucleotid duplicat 5. Prescurtarea dup 6. Eventual se poate descrie secvena nucleotidic duplicat sau numrul nucleotidelor duplicate Exemple: c.77_79dup (sau c.77_79dupCTG sau c.77_79dup3) c.5dupT (sau c.5dup) c.(?_-30)_(*220_?)dup

Inserii
Se folosete prescurtarea ins" Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Primul nucleotid inserat 3. Semnul _ pentru notarea intervalului 4. Ultimul nucleotid inserat 5. Prescurtarea ins 6. Eventual se poate aduga i secvena nucleotidic inserat sau numrul nucleotidelor inserate Exemple: c.76_77insT

Del + Ins (indels)

Se folosete prescurtrile delins" Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Poziia primului nucleotid nlocuit prin deleie respectiv inserie 3. Semnul _ pentru notarea intervalului deleiei 4. Poziia ultimului nucleotid nlocuit prin deleie respectiv inserie 5. Prescurtarea delins 6. Nucleotidele inserate Exemple: c.112_117delinsTG (c.112_117delAGGTCAinsTG)

Inversii
Se folosete prescurtarea inv" Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Poziia primului nucleotid din secvena inversat 3. Semnul _ pentru notarea intervalului 4. Poziia ultimului nucleotid din secvena inversat 5. Prescurtarea inv 6. Eventual se poate aduga lungimea secvenei inversate Exemplu: c.203_506inv (sau 203_506inv304)

Variabilitatea secvenelor repetitive:

Ordinea descrierii modificrii: 1. c. sau g. pentru nivelul de ADN la care se refer descrierea 2. Poziia primului nucleotid din secvena repetitiv 3. Unitatea secvenei nucleotidice repetate 4. n parantez rotund intervalul valorii repetiiilor cu cele dou valori limit separate de semnul _ De exemplu: c.123+74TG(3_6)

Alte variante:
Conversii: con Descrierea translocaiilor la nivel molecular descrierea citogenetic urmat de descrierea poziiei punctelor de ruptur conform unei secvene de referin (Genbank, EMBL, DDJB) De exemplu: t(X;4)(p21.2;q35)(c.857+101_857+102)

Mai multe variante la aceeai persoan:

Dou secvene modificate n alele diferite enumerare n paranteze drepte diferite separate de semnul + De ex.: c.[76A>C]+[87delG] Dou secvene modificate n aceeai alel enumerare ntr-o singur parantez i separare cu semnul ; De ex: c.[76A>C; 83G>C] Mozaicism enumerare ntr-o singur parantez i separare cu semnul , c.[=, 83G>C]

Descrierea mutaiilor la nivel de protein (secven de aminoacizi)

Se folosete prescurtarea "p." pentru indicarea nivelului descris (p- protein) Se prefer utilizarea simbolurilor cu trei litere, prima liter fiind notat cu majuscule X se folosete pentru notarea codonilor STOP Numerotarea aminoacizilor indicarea poziiei variaiei: Primul aminoacid (Met) se numeroteaz cu +1 Secvena proteic se refer la produsul primar al translaiei Aminoacizii aprui n urma unor modificri care determin traducerea unor secvene suplimentare n amonte se indic cu semnul (de ex. Gln-2, Thr-1) Aminoacizii rezultai din traducerea unor secvene intronice se indic cu semnul + sau - n funcie de poziia exonului apropiat (de ex. Val4+1, Phe5-2) Aminoacizii aprui n urma unor modificri care determin traducerea unor secvene suplimentare n aval prin pierderea codonului STOP se indic cu semnul * (de ex. Gln*1, Ser*2)

One letter code

A B C D E F G H I K L M N P

Three letter code

Ala Asx Cys Asp Glu Phe Gly His Ile Lys Leu Met Asn Pro Alanine

Amino acid

Possible codons GCA, GCC, GCG, GCT AAC, AAT, GAC, GAT TGC, TGT GAC, GAT GAA, GAG TTC, TTT GGA, GGC, GGG, GGT CAC, CAT ATA, ATC, ATT AAA, AAG CTA, CTC, CTG, CTT, TTA, TTG ATG AAC, AAT CCA, CCC, CCG, CCT

Asparagine or Aspartic acid Cysteine Aspartic acid Glutamic acid Phenylalanine Glycine Histidine Isoleucine Lysine Leucine Methionine Asparagine Proline

Q
R S T V W X Y Z

Gln
Arg Ser Thr Val Trp X Tyr Glx

Glutamine
Arginine Serine Threonine Valine Tryptophan stop codon Tyrosine Glutamine or Glutamic acid

CAA, CAG
AGA, AGG, CGA, CGC, CGG, CGT AGC, AGT, TCA, TCC, TCG, TCT ACA, ACC, ACG, ACT GTA, GTC, GTG, GTT TGG TAA, TAG, TGA TAC, TAT CAA, CAG, GAA, GAG

 Substituii: Mutaii cu sens greit : de ex. p.Trp26Cys Mutaii non-sens: p.Trp26X Deleii: p.Lys2del p.Cys28_Met30del

Duplicaii: p.GLy4_Gln6dup Inserii p.Lys2_Met3insGlnSerLys Variabilitatea secvenelor repetitive scurte p.Gln6(3_6)

Mutaii cu decalarea cadrului de citire (frame-shift )

Se folosete prescurtarea fs Ordinea descrierii modificrii: 1. p. 2. Simbolul primului aminoacid care s-a modificat 3. Poziia primului aminoacid modificat 4. Fs De exemplu: p.Arg97fs Sau se folosete versiunea "fsX (cu notarea poziiei noului codon STOP) Ordinea descrierii modificrii: 1. p. 2. Simbolul primului aminoacid vechi modificat 3. Poziia primului aminoacid modificat 4. Simbolul primului aminoacid nou 5. fs 6. X (codon STOP) 7. Poziia codonului STOP De exemplu: p.Arg97GlyfsX16

Mai multe variante la aceeai persoan:

Dou variante diferite pentru acelai locus - descrierea celor dou alele n dou paranteze separate: [...] + [...] p.[Ala25Thr]+[=] p.[Ala25Thr]+[Ala25Thr] p.[Ala25Thr]+[?] Dou variante n aceeai alel descrierea celor dou variante n aceeai parantez: [... ; ...] p.[Ala25Thr;Gly28Val]

 In sfarsit s-a terminat!!!