Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Capcelea
Transcripia i processingul
1. Transcripia
1.1 Principiile transcripiei
1.2 Unitatea transcripional
1.2.1 Particularitile unitii de transcripie de clasa I
1.2.2 Particularitile unitii de transcripie de clasa II
1.2.3 Particularitile unitii de transcripie de clasa III
1.2.4 Particularitile unitii de transcripie din ADNul mitocondrial
1.3 Etaplele transcripiei
1.4 Aparatul de transcripie
Activarea ARN-polimerazei I
Activarea ARN-polimerazei II
Activarea ARN polimerazei III
1.5 Produsul transcripiei
2. Modificri Co- i Posttranscripionale ale moleculelor de ARN
2.1 Processingul ARNm
2.1.1 CAParea
2.1.2 Polyadenilarea
2.1.3 Splicingul ARNm
2.1.4 Rolul medical al splicingului
2.1.5 Editarea ARN
2.2 Processingul ARNt
2.3 Processing-ul ARNr
Transcripia i processing-ul
2. Transcripia
Transcripia reprezint prima etap crucial n expresia genelor; este procesul de
copiere a IG codificate n ADN prin sinteza unor molecule de ARN necesare pentru sinteza
proteinelor.
1.1 Principiile transcripiei
a) Transcripia se realizeaz matricial
una din cele dou catene polinucleotidice de
ADN servete model pentru sinteza unei catene
de ARN; catena codogen este netranscris, iar
catena anticodogen servete matri n timpul
transcripiei;
b) Se
desfoar
dup
principiul
complementaritii catena sintetizat de
ARN este complementar matriei i, astfel,
identic catenei codogene (cu excepia: T din
ADN este nlocuit cu U n ARN)
c) Transcriia se realizeaz antiparalel
catena matri de ADN este citit n direcia
3'5', iar sinteza catenei de ARN se
desfoar n direcia 5'3';
d) Transcripia
se
realizeaz
unidirecionat fiecare gen are o
secven semnal SIT+1 de la care ncepe
transcripia de la 3' la 5' spre semnalul
Figura 1.
terminatorului.
Gena ARNr18S;
Spacier necodant;
Gena ARNr5,8S;
Spacier necodant;
Gena ARNr28S;
Terminator.
1.2.2 Particularitile unitii de transcripie de clasa II
Genele de clasa II sunt gene structurale nucleare ce codific proteine ce asigur
structura i funcia celulei date. Sunt numeroase (circa 30 000 perechi gene) i extrem de
heterogene, unele cu expresie continu genele housee keeping, altele cu expresie
dependent de esut sau perioad ontogenetic. La general, unitatea de transcripie de clasa II
include o singur gen structural i cuprinde urmatoarele secvene:
Enhancer / Silencer;
Exon/intron/exon/intron..exon
Produsul transcripiei
preARNr 45S
preARNm
preARNsn
preARNr
preARNt
preARNsn, sc, si,
ARN policistronic
+++
ciupercile de pdure)
ARN polimeraza I
ARN polimeraza II
ARN polimeraza III
ARN polimeraza mt
Gen ARNr 5S
Gen ARNt
Gene microARN
Gene ARNr, ARNt i
structurale
Activarea ARN polimerazei III se realizeaz diferit dac se transcriu gene ARNt
sau gene ARNr 5S sau gene micro ARN. Analizm primele dou variante:
-
Aparatul de transcripie
a genelor de clasa II
Aparatul de
transcripie a genelor
de clasa III
Unitatea de
transcripie
Promotor
Gene ARNr 18S, 5,8S i
28S separate prin spacieri
Terminator
Promotor
Gena ARNr5S sau ARNt
Terminator
Enzim
Uniti de
polimerizare
Factori de transcripie
generali
Factori de transcripie
esut specifici
ARN polimeraza I
Promotor
Exoni/introni
Terminator cu situs PolyA
Enhanceri
Silenceri
ARN polimeraza II
UBF, SL1
Factori de transcripie
inductibili
10
2.1.1 CAParea prelucrarea captului 5' al ARN prin adugarea unui GTP ntr-o
legatur nespecific 5'ppp5' de ctre Guanilat transferaza. n plus Guanina adugat i primele
dou nucleotide sunt metilate. CAPul este adugat dup iniierea transcripiei, cnd sunt
polimerizate primele 20-30 ribonucleotide.
Splicingul este realizat n mai multe etape, de ctre spliceosom, dup principiul
complementaritii
(ARNsn
din
componena ribozimelor U1-U6 conin
secvene
complementare
anumitor
secvene din introni), programat
necesitilor celulare.
(a)
U1 se fixeaz la 5'GU al
intronului; U2 se fixeaz la A situsul
buclei;
(b)
Trimerul U5/U4/U6 se fixseaz
la U1 i U2; U5 identific AG3' al
intronului; Se cliveaz captul 5' al
intronului i U2/U6 asigur formarea
lasoului.
(c)
Clivarea 3' al intronului, unirea
exonilor ntr-un ARNm matur, iar
intronul este eliberat i supus degradrii.
Figura 16. Aparatul de splicing
12
Tipuri de splicing:
(a) Splicing constitutiv se nltur toi intronii i exonii sunt unii n ordinea nscris n
gen;
(b) Splicing prin omiterea unor exoni;
(c) Splicing prin utilizarea unor situsuri de splicing alternative;
(d) Splicing prin omiterea unor introni.
Unele gene conin promotori altenativi sau cteva situsuri PolyA.
Datorit splicingului alternativ pe baza uneia i aceleai gene se pot obine diferite
izoforme ale proteinei (exemplul 1) sau diferite proteine cu funcii diferite (exemplul 2).
13
14
Exonii A, B, C, D
sunt comuni si pentru
Calcitonin i pentru CGRP,
iar urmtorii doi exoni sunt
selectai difereniat n cele
dou tipuri de celule. n
plus, gena CT are dou
situsuri
alternative
de
poliadenilare.
16
n enterocite ARNm este supus editrii i astfel se sintetizeaz o proteina apoB mai scurt,
2152 de aminoacizi apoB-48. Aceast apoB-48 este gsit doar n lipoproteinele produse
de enterocite i secretate n sistemul limfatic.
ARNm pentru receptorii serotoninici are 5 situsuri de editare din A n I, ce explic
polimorfismul receptorilor serotoninici, funciile fiziologice diverse ale receptorului
serotoninic n comportament sau reflecia simurilor, mecanisme diferite ale patologiei
mentale, rspunsul diferit la factorii de stress, reacia diferit la preparatele antidepresante,
etc.
Semnificaia medical a editrii ARN uman este demonstrat pe asocieri cu numeroase
boli neurologice incliznd depresia sinucidal, epilepsia, schizophrenia, scleroza
amiotrofic lateral, etc.
17