Documente Academic
Documente Profesional
Documente Cultură
Genomul uman –
noțiuni introductive
46. De atunci, s-au acumulat multe cunoștințe despre cro locus specific, omologii pot avea secvențe identice sau dife
mozomii umani, structura și compoziția lor normală, iden rite; aceste forme diferite ale unei gene poartă numele de
titatea genelor pe care le conțin, precum și despre numeroasele alele. Unul dintre cei doi cromozomi omologi ai unei perechi
și variatele anomalii cromozomiale. se moștenește de la tată iar celălalt de la mamă. În general,
Cu excepția celulelor care se transformă în gameți cei doi cromozomi ai unei perechi de autozomi nu se deoseb
(celulele liniei germinale), toate celulele care contribuie la esc între ei microscopic. La femei, cromozomii de sex, cei
formarea structurilor corpului sunt denumite celule soma doi cromozomi X, nu se deosebesc între ei. La bărbați, însă,
tice (soma, corp). Genomul prezent în nucleul celulelor cromozomii de sex diferă între ei. Un cromozom al perechii
somatice umane conține 46 de cromozomi, are 24 de tipuri este X, identic morfologic celor doi cromozomi de la femeie,
de cromozomi diferite morfologic și este organizat în 23 de pe care bărbatul îl moștenește de la mama sa și îl transmite
perechi (Fig.2-1). Dintre cele 23 de perechi de cromozomi, fiicelor sale; celălalt cromozom al perechii, cromozomul Y,
22 sunt deopotrivă la bărbați și la femei fiind numiți auto este moștenit de la tată și este transmis numai fiilor săi. În
zomi și numerotați în ordinea descrescătoare a mărimii lor, Capitolul 6, în care vom explora bazele cromozomiale și
de la cei mai mari către cei mai mici. Perechea 23 include doi genomice ale bolilor umane, vom expune câteva excepții de
cromozomi de sex diferiți: cromozomul X și cromozomul Y la regula simplă și aproape universală că femeile au cromo
la bărbați și doi cromozomi X la femei. Un aspect fundamen zomii de sex XX și bărbații XY.
tal al genomului uman este acela că fiecare cromozom poartă Pe lângă genomul nuclear, o mică dar importantă parte
un set diferit de gene dispuse într-o succesiune liniară de-a a genomului uman se găsește în mitocondria din cito
lungul moleculei sale de ADN. Cromozomii unei perechi plasma celulei (vezi Fig.2-1). Cromozomul mitocondrial,
(denumiți cromozomi omologi sau omologi) conțin ce va fi descris mai jos în acest capitol, prezintă un număr
informație genetică echivalentă între ei; astfel că, ei au carac de particularități care-l deosebesc de restul genomului
teristic aceleași gene în aceeași ordine. Totuși, la nivelul unui uman.
Celula somatică
...CTAGCAATTCTTATAATCGTACGCTAG
TCTTATGGAAACTGTGAATAGGCTTATAACAGGAG
GTCTTAGCCATTCGAATCGTACGCTAGC...
Secvență a genomului uman
Figura 2-1 Genomul uman, înscris atât în cromozomii nucleari cât și cei mitocondriali. Vezi Surse și
mulțumiri..
CAPITOLUL 2 — Genomul uman – noțiuni introductive 5
Purine Pirimidine
NH2 O
C C
N CH3
N C HN C
CH
HC C C CH
N O N
N
H H O
Adenină (A) Timină (T) _ 5' Bază
O P O CH2 O
_
O C C
H H
H H
O NH2 3' C C
OH H
C N C
HN C N CH Fosfat Dezoxiriboză
CH
C C C CH
H2N N O N
N
H H
Guanină (G) Citozină (C)
Figura 2-2 Cele 4 baze azotate ale ADN și structura generală a unui nucleotid ADN. Fiecare dintre cele
4 baze se leagă cu dezoxiriboza (prin legături de hidrogen indicate prin culoarea magenta) și cu un grup
fosfat pentru a forma nucleotidul corespunzător.
GENELE DIN GENOMUL UMAN Deși catalogul definitiv al genelor umane rămâne un obiectiv
dificil de realizat, se recunosc două tipuri generale de gene, acelea
Ce este gena? Câte gene avem? Aceste întrebări au răspunsuri al căror produs de sinteză este o proteină și acelea al căror produs
mult mai dificil de găsit decât pare. este un ARN funcțional.
Termenul genă, introdus pentru prima dată în 1908, a fost • Numărul de gene codificatoare de proteine – recunoscut
utilizat în multe contexte diferite de la prima descriere a carac ca o caracteristică a genomului va fi prezentat în Capitolul
teristicilor esențiale ale „unităților ereditare“ făcută de Mendel 3 – este estimat între 20.000 și 25.000. În această carte, se
cu peste 150 de ani în urmă. Pentru medici (și, de asemenea, folosește un număr aproximativ de 20.000 de gene, dar
pentru Mendel și alți geneticieni din vremea sa), o genă poate fi cititorul ar trebui să știe că această cifră este imprecisă și
definită prin efectul vizibil asupra unui organism și funcția de posibil subestimată.
transmitere în succesiunea generațiilor determinată statistic. • În plus, de câteva decenii se știa clar că produsul final al
Pentru medicii geneticieni, o genă este recunoscută clinic în unor gene nu este o proteină ci un ARN transcris folosind
contextul unei variante observabile care determină o tulburare ca matriță secvența ADN. Există numeroase tipuri diferite
clinică distinctă. În prezent sunt recunoscute aproximativ 5.000 de astfel de gene ARN (denumite, de obicei, gene neco
de tulburări de acest tip (vezi Capitolul 7). dificatoare pentru a le deosebi de genele codificatoare de
Proiectul Genomul Uman oferă o bază mult mai sistematică proteine) și, în prezent, se estimează că mai există încă cel
pentru descrierea genelor umane, susținută mai degrabă pe puțin alte 20.000-25.000 de gene ARN necodificatoare în
analiza secvenței ADN decât pe criteriul clinic și studii familiale; genomul uman.
de fapt, acesta a fost unul dintre motivele pentru care a fost inițiat Prin urmare – în funcție de ceea ce înțelege fiecare prin
proiectul la sfârșitul anilor ’80. Cu toate acestea, deși secvențierea această noțiune – numărul de gene din genomul uman este
era completă în 2003, era evident că abilitatea noastră de a estimat între 20.000 și 50.000 de gene. Totuși, cititorul va aprecia
recunoaște caracteristicile unei secvențe care sugerează existența că acestă cifră se poate schimba, în funcție de evoluția definițiilor,
sau identitatea unei gene era limitată. Interpretarea secvenței posibilitățile tehnologice și precizia analitică, progresul infor
genomice umane și corelația variației ei cu biologia umană, atât matic și medicina digitală, precum și adnotarea mai completă a
în starea de sănătate cât și cea de boală, este o provocare constantă genomului.
a cercetării biomedicale.
A B
_
capătul 5’ O Legături 3.4 Å
_ 5' de hidrogen
O P O 3'
O C
Baza 1 G
H2C 5'
O
C C
H H
H H
3' C C
C
O H G
34 Å
_
O P O
O
Baza 2 T
H2C 5'
O A
C C
H H
H H
3' C C
O H C
_ G
O P O
O 3'
Baza 3
H2C 5' 5'
O
C C
H H
H H
3' C C
capătul 3’
OH H 20 Å
Figura 2-3 Structura moleculei ADN. A, O regiune a secvenței nucleotidice a unei catene ADN în care
se observă legăturile fosfodiester 3’-5’ asigurând continuitatea nucleotidelor învecinate. B, Modelul dublei
elice ADN conform propunerii lui Watson și Crick. „Treptele“ orizontale reprezintă legăturile dintre bazele
azotate pereche. Se crede că elicea este răsucită spre dreapta deoarece catena care merge de jos-stânga în
sus-dreapta înfășoară catena opusă. Secțiunea detaliată a figurii ilustrează cele două catene complementare
ADN, arătând perechile de baze AT și GC. Rețineți că orientarea celor două catene este antiparalelă. Vezi
Surse și mulțumiri.
citozina (C). Nucleotidele, fiecare dintre ele fiind compusă catenei complementare, iar G cu C. Natura specifică a
din bază azotată, grup fosfat și pentoză, polimerizează în informației genetice codificată în genomul uman corespunde
catene lungi polinucleotidice prin legături 5’-3’ fosfodiester secvenței de baze azotate C, A, G și T prezente în cele două
formate între dezoxiribozele adiacente (Fig. 2-3A). În catene ale dublului helix dispuse în fiecare dintre cromo
genomul uman, aceste lanțuri polinucleotidice există sub zomi, atât în nucleu cât și în mitocondrie (vezi Fig. 2-1).
forma dublului helix (Fig.2-3B) având lungimi mari de sute Având în vedere complementaritatea celor două catene
de milioane de nucleotide ca în cazul celui mai mare cromo ADN, cunoașterea secvenței de baze nucleotidice a unei
zom uman. catene permite automatic determinarea secvenței de baze
Structura anatomică a ADN poartă informația genetică nucleotidice a catenei pereche. Structura dublu-catenară a
înscrisă chimic, ceea ce permite transmiterea fidelă a moleculei ADN îi permite să se replice fidel prin separarea
informației genetice de la celula mamă la celulele fiice și de celor două catene, urmată de sinteza noilor catene comple
la o generație la alta. În același timp, structura primară a mentare în concordanță cu secvența originală a catenelor
ADN specifică secvența de aminoacizi din lanțurile polipep matriță (Fig. 2-4). De asemenea, ori de câte ori este necesar,
tidice ale proteinelor, așa cum se va descrie în capitolul complementaritatea bazelor permite o reparare eficientă și
următor. ADN prezintă caracteristici adecvate funcțiilor corectă a moleculei ADN cu erori de replicare.
sale. Modelul structurii originale a ADN, elucidat de James
Watson și Francis Crick în 1953, arată similar unei duble
elice (vezi Fig.2-3B). Structura elicoidală este asemănătoare Structura cromozomilor umani
unei scări în spirală răsucite spre dreapta în care cele două Structura genelor din genomul uman, precum și factorii
catene polinucleotidice orientate în direcții opuse sunt legate determinanți ai expresiei genice sunt specificați în ADN-ul
între ele prin punți de hidrogen între perechile de baze celor 46 de cromozomi umani din nucleul celulei somatice
azotate complementare: T unei catene se împerechează cu A plus ADN-ul cromozomului mitocondrial. Fiecare
CAPITOLUL 2 — Genomul uman – noțiuni introductive 7
cromozom uman este alcătuit dintr-o singură moleculă ADN proteine specializate din clase diferite. Exceptând perioada
dublu catenară, continuă; fiecărui cromozom îi corespunde diviziunii celulare, cromatina este distribuită în tot spațiul
o moleculă dublu-catenară, lungă, astfel că genomul nuclear nuclear prezentând un aspect relativ omogen la microscop.
are 46 molecule ADN liniare totalizând peste 6 miliarde de Atunci când celula se divide, genomul său condensat este
perechi de nucleotide (vezi Fig. 2-1). vizibil microscopic sub forma cromozomilor. Prin urmare,
Cromozomii nu sunt formați numai din ADN-ul dublu cromozomii sunt vizibili ca structuri distincte doar în timpul
catenar. În interiorul fiecărei celule, genomul este organizat diviziunii celulare, dar își păstrează integritatea și între
în cromatină, în care ADN-ul genomic se asociază cu diviziunile celulare.
În cromatină, molecula ADN cromozomială se asociază
5'
cu o familie de proteine cromozomiale numite histone. Acest
3'
G C complex interacționează cu un grup heterogen de proteine
G C
C G nonhistonice, proteine implicate în stabilirea unei structuri
A T spațiale și funcționale adecvate care să asigure comporta
G
A
C
T
mentul normal al cromozomilor și expresia corespunzătoare
T A
a genelor.
G
A
C
T
Se cunosc cinci clase majore de histone care joacă un rol
C
T
G
A
fundamental în împachetarea (compactarea) cromatinei.
Există câte două copii ale fiecărei histone H2A, H2B, H3 și
G
A T
C
H4 dispuse în miezul nucleozomului formând octamerul
T A T A
histonic în jurul căruia se înfășoară un segment de ADN
C 3' 5' G
G C G C dublu-catenar similar unui fir pe o bobină (Fig. 2-5). ADN-ul
asociat octamerului histonic are circa 140 de perechi de baze
A T A T
T A T A
A
G
T
C
A
G
T
C
se adaugă succesiv noi complexe ADN-octamer histonic
A
T
T
A
A
T
T
A
conferind cromatinei un aspect asemănător unui șirag de
T A T A
mărgele pe o ață. Fiecare complex ADN-octamer histonic
5' 3' 5' 3' este numit nucleozom (vezi Fig. 2-5) și reprezintă unitatea
Figura 2-4 Replicarea dublului helix ADN are ca rezultat formarea structurală de bază a cromatinei. Fiecare dintre cei 46 de
celor două molecule fiice, fiecare fiind formată dintr-o catenă veche și cromozomi umani conține între câteva sute de mii și mai mult
una nou sintetizată. de un milion de nucleozomi. Cea de a cincea histonă, H1, se
~30 nm ~10 nm 2 nm
Fiecare buclă
Celula în interfaza conține
timpurie ~100-200 kb
ADN
~140 pb
ADN
Regiune a
cromozomului Octamer
interfazic histonic
Nucleu Solenoid Fibra de cromatină Dublul helix
interfazic („șirag de mărgele pe o ață“)
fixează la ADN-ul „spacer“ și ADN-ul nucleozomului doar 37 de gene. Deși produșii acestor gene sunt activi în
formând legătura internucleozomală care conectează doi mitocondrie, majoritatea proteinelor din mitocondrie sunt,
nucleozomi succesivi. Cantitatea de ADN asociat miezului în realitate, produși ai genelor nucleare. S-au descris mutații
nucleozomic împreună cu ADN-ul „spacer“ conține aproxi mitocondriale în afecțiuni transmise exclusiv pe linie
mativ 200 pb. Pe lângă principalele tipuri de histone mai maternă dar și în cazul unor tulburări sporadice (Cazul 33)
există și un număr de histone specializate care pot înlocui (vezi Capitolele 7 și 12).
histonele H3 sau H2A conferind ADN-ului genomic carac
teristici specifice în regiunile cromozomiale respective. De
asemenea, histonele pot suferi modificări chimice producând Secvența genomului uman
schimbarea proprietăților nucleozomilor care le conțin. Așa Plecând de la cunoștințele generale despre structura și semni
cum se va prezenta mai detaliat în Capitolul 3, modelul tipu ficația clinică a cromozomilor și genelor pe care le poartă,
rilor principale de histone specializate și modificările lor oamenii de știință și-au concentrat atenția asupra identificării
poate varia de la o celulă la alta considerându-se a fi și localizării unor gene specifice din genomul uman. Din
răspunzător de împachetarea ADN și conformația accesibilă acest efort comun a fost inițiat Proiectul Genomul Uman
moleculelor reglatoare care determină expresia genică sau care a reunit sute de laboratoare din întreaga lume într-un
alte funcții genomice. consorțiu internațional pentru a determina secvența
Pe parcursul ciclului celular, după cum se va detalia mai completă a celor 3 × 109 pb (3.300 milioane de pb ale unui
jos în acest capitol, cromozomii trec prin faze succesive de set haploid de cromozomi) din ADN nuclear distribuită în
condensare și decondensare. Totuși, chiar și atunci când cele 24 tipuri diferite de cromozomi umani (22 de autozomi,
cromozomii sunt mai lacși, decondensați, în interfaza ciclu plus cromozomii X și Y).
lui celular, ADN-ul împachetat în cromatină este mai com Timp de un deceniu și jumătate, susținute de progresele
pactat decât ar fi în forma sa nativă de dublă elice, neasociat majore ale tehnologiei de secvențiere a ADN, marile centre
cu proteine. Mai mult, filamentele lungi cu nucleozomi sunt de secvențiere au colaborat pentru stabilirea ordinii liniare a
ele însele condensate într-o structură elicală secundară, nucleotidelor ADN ale fiecărui cromozom prin secvențierea
fibra de cromatină, rezultată prin înfășurarea filamentelor unor segmente mici asamblate, ulterior, în secvențe con
în jurul unui „solenoid“ (din grecescul solenoeides, tub în tinue. În anul 2003, la finalizarea Proiectului Genomul
formă de cilindru) și considerată unitatea fundamentală de Uman, s-a publicat o secvență consens de „referință“ obținută
organizare a cromatinei (vezi Fig. 2-5). La rândul lor, sole prin secvențierea unor genomuri provenite de la mai multe
noizii se pliază în bucle și domenii atașate la intervale de persoane diferite și utilizată ca bază în analize comparative
aproximativ 100.000 pb (echivalentul a 100 kilobaze [kb], cu secvențele genomurilor individuale. Această secvență de
deoarece 1 kb = 1.000 pb) unui schelet proteic (matrice), referință se găsește în bazele de date accesibile public pentru
nonhistonic, din interiorul nucleului. S-a presupus că a facilita aplicarea în practica medicală a descoperirilor
aceste bucle sunt unități funcționale ale genomului, iar științifice. Secvența genomică este prezentată, de regulă, în
punctele de atașare la schelet ale fiecărei bucle sunt specifice direcția 5’-3’ doar pe una dintre cele două catene ADN
de-a lungul ADN-ului cromozomial. După cum se va pentru că secvența catenei complementare 3’-5’ poate fi
observa în continuare, unul dintre nivelurile de control al dedusă pe baza structurii complementare a moleculei ADN
expresiei genice depinde de modul cum ADN-ul și genele descrisă mai sus (Fig. 2-6).
se condensează în cromozomi și de interacțiunile acestora
cu proteinele cromatinei în procesul de organizare a ADN
în celulă. Organizarea genomului uman
Imensa cantitate de ADN poate fi observată după prelu Cromozomii nu sunt doar o colecție aleatorie de gene dife
crarea cromozomilor cu scopul de a separa ADN-ul de rite și alte secvențe ADN. Regiuni genomice cu caracteristici
scheletul proteic (vezi Fig. 2-1). Prin eliberarea ADN-ului similare tind să se grupeze, iar organizarea funcțională a
în acest mod, pot fi vizualizate atât bucle lungi de ADN cât genomului reflectă secvența și structura sa. Unele regiuni
și scheletul proteic cu forma identică a unui cromozom cromozomiale sau chiar cromozomi întregi au o densitate
tipic. genică mare (regiuni „urbane“), în timp ce altele au o densi
tate genică scăzută (regiuni „deșertice“) (Fig. 2-7). Conse
Cromozomul mitocondrial cințele clinice ale anomaliilor structurale genomice reflectă
După cum s-a amintit deja, un grup mic, dar important de natura specifică a genelor și secvențelor implicate. Prin
gene ale genomului uman se găsesc în mitocondriile cito urmare, anomaliile cromozomilor sau regiunilor cromozo
plasmei (vezi Fig. 2-1), Genele mitocondriale se transmit miale cu densitate genică mare tind să producă efecte clinice
exclusiv pe linie maternă (vezi Capitolul 7). Celulele umane mult mai severe decât defectele unor regiuni genomice simi
au sute sau mii de mitocondrii, fiecare având mai multe copii lare ca mărime, dar cu densitate genică mică.
ale unei molecule mici, circulare reprezentată de cromozo Ca urmare a cunoștințelor furnizate de Proiectul Genomul
mul mitocondrial. ADN-ul mitocondrial are o lungime de Uman, rezultă clar că organizarea ADN în genomul uman
numai 16 kb (reprezentând un segment minuscul compara este mult mai variată și complexă decât se credea anterior.
tiv cu lungimea celui mai mic cromozom nuclear) și conține Din miile de milioane pb ADN ale oricărui genom, mai
CAPITOLUL 2 — Genomul uman – noțiuni introductive 9
5´ ... G G A T T T C T A G G T A A C T C A G T C G A ... 3´
Dublu helix
3´ ... C C T A A A G A T C C A T T G A G T C A G C T ... 5´
1
2000 Cromozomi „bogați”
în gene
17
12 6 3
1000
16 14 7 5
9
X 4
10
20 8
15
500
22
13
21 18
Cromozomi
„săraci” în gene
Y
0
0 50 100 150 200 250
Mărimea cromozomului (Mb)
Figura 2-7 Mărimea și conținutul de gene al celor 24 de cromozomi umani. Linia diagonală punctată
corespunde densității medii a genelor din genom, aproximativ 6,7 gene codificatoare de proteine per
megabază (Mb). Cromozomii relativ bogați în gene sunt deasupra diagonalei și au tendința de a fi localizați
în partea stângă, superior. Cromozomii relativ săraci în gene sunt sub diagonală și au tendința de a fi
localizați în partea dreaptă, inferior. Vezi Surse și mulțumiri.
10 THOMPSON & THOMPSON GENETICĂ MEDICALĂ
puțin de 1,5% din genom codifică, de fapt, proteine. Se ADN satelit deoarece multe dintre familiile de repetiții în
credea că elementele de reglare care influențează sau tandem au putut fi separate ca benzi („sateliți“) distincte față
determină modele de expresie genică în timpul dezvoltării de restul ADN genomic prin centrifugare.
sau țesuturi ar reprezenta încă aproximativ 5% din secvența Familiile ADN cu secvențe repetate în tandem variază
genomică dar, recent, studiile asupra caracteristicilor croma în funcție de localizarea lor în genom și caracteristicile
tinei sugerează că o cantitate mult mai mare din genom poate secvențelor din care sunt formate. În general, astfel de
furniza semnale relevante pentru funcțiile genomice. Aproxi blocuri de secvențe repetate în tandem ating dimensiuni
mativ jumătate din lungimea totală a secvenței liniare mari de peste câteva milioane de pb și reprezintă un procent
genomice constă din așa-numita copie-simplă sau ADN cu semnificativ din cantitatea ADN a unui cromozom uman.
secvențe unice per genom, adică ADN a cărui ordine liniară Unele secvențe repetate în tandem sunt utilizate pentru
de nucleotide specifice este reprezentată doar o singură dată analiza citogenetică în clinică (vezi Capitolul 5). Blocurile
(sau cel mult un număr mic de copii) în genom. Această lungi de secvențe repetate formate din repetiții (cu unele
observație poate părea surprinzătoare având în vedere că variații) ale unei secvențe scurte, cum ar fi un pentanucleo
există doar patru tipuri diferite de nucleotide în ADN. Dar tid, se găsesc în regiunile genetic inerte ale cromozomilor
dacă luăm în considerare chiar și un segment genomic mic 1, 9 și 16 și reprezintă mai mult de jumătate din cromozo
cu o lungime de numai 10 baze combinând cele patru tipuri mul Y (vezi Capitolul 6). Alte familii de secvențe repetate
de nucleotide se obțin peste un milion de secvențe de nucleo în tandem au repetiții ale unei secvențe ceva mai lungi. De
tide posibile. Și, deși ordinea bazelor în genom nu este exemplu, ADN-ul alfa-satelit conține secvențe (unități) de
complet aleatorie, orice secvență particulară de 16 nucleo 171 pb repetate în tandem și se află localizat în regiunea
tide se estimează că există doar o singură data în oricare centromerică a fiecărui cromozom fiind esențial pentru
genom analizat. atașarea cromozomilor de microtubulii fusului de diviziune
Restul genomului este format din mai multe clase de în timpul diviziunii celulare.
ADN repetitiv și include ADN ale cărui secvențe sunt Pe lângă ADN cu secvențe repetate în tandem, în
repetate de sute sau milioane de ori în genom, repetițiile genom mai există o altă clasă importantă de ADN repeti
fiind identice sau cu mici variații. Deși majoritatea (dar nu tiv formată din secvențe asemănătoare, dar dispersate în
toate) celor 20.000 de gene din genom codifică proteine (vezi întregul genom și nicidecum grupate într-una sau mai
Cadranul prezentat anterior în acest capitol), ele fiind multe regiuni cromozomiale. Deși această descriere
reprezentate de ADN nerepetitiv, cu secvențe unice, secven generală se potrivește mai multor familii de ADN, există,
țele din clasele de ADN repetitiv contribuie la menținerea în special, două dintre acestea care merită o atenție
structurii cromozomului și sunt o sursă importantă de deosebită pentru că, împreună, repre zintă o parte
variație genetică între indivizi; unele din aceste variații pot semnificativă din genom și au fost implicate în boli gene
predispune la procese patologice în cadrul genomului, după tice. Printre elementele repetitive dispersate cel mai bine
cum se va prezenta în Capitolele 5 și 6. studiate se numără așa-numita familie Alu. Membrii
acestei familii au repetiții de secvențe cu o lungime de 300
Secvențele ADN unice per genom pb fiecare și, deși asemănătoare, nu sunt identice. În total,
Chiar dacă ADN cu secvențe unice reprezintă cel puțin există în genom peste un milion de copii reprezentând cel
jumătate din genom, multe dintre funcțiile sale sunt necu puțin 10% din ADN-ul uman. A doua familie de ADN cu
noscute pentru că, așa cum s-a menționat anterior, secvențele repetiții dispersate este numită LINE (prescurtatea din lb.
care codifică efectiv proteinele (regiunea codificatoare a engleză – Long Interspersed Nuclear Element) sau familia
genei) reprezintă doar o mică parte din întregul ADN cu cu elemente nucleare intercalate lungi (numită, uneori,
secvențe unice. Cea mai mare parte a secvențelor ADN unice L1). LINEs au o lungime de până la 6 kb și în genom se
au dimensiuni reduse (câteva Kb sau mai puțin) și sunt inter găsesc circa 850.000 de copii reprezentând aproximativ
calate printre secvențele variatelor tipuri de ADN repetitiv. 20% din ADN-ul uman. Ambele familii au copii nume
Organizarea genelor cu secvențe ADN unice este explicată roase în anumite zone ale genomului, iar în altele sunt
în Capitolul 3. foarte rare. Regiunile cu conținut bogat în GC tind să aibă
o abundență de elemente Alu fiind sărace în LINEs, iar
Secvențele ADN repetate multe dintre regiunile bogate în AT, din contră, tind să
Se cunosc mai multe clase de ADN cu secvențe repetate. aibă a abundență de LINEs și elemente rare Alu.
Pentru a determina tipul de secvențe repetate („repetiții“)
este util să se evidențieze dacă secvențele repetate sunt ADN-ul repetitiv și bolile genetice. Atât secvențele Alu
grupate într-una sau câteva regiuni cromozomiale sau sunt cât și LINEs sunt considerate drept cauză a mutațiilor
dispersate, intercalate printre secvențele unice de-a lungul implicate în boli ereditare. Cel puțin câteva copii ale fami
cromozomului. Se estimează că secvențele repetate grupat, liilor LINE și Alu produc copii ale propriilor secvențe care,
în bloc, reprezintă 10-15% din întregul genom și se ulterior, se pot integra oriunde în genom și inactiva prin
organizează în tandem prin aranjare una după alta, cap- inserție, ocazional, o genă cu semnificație medicală.
coadă, a secvențelor scurte cu număr variabil de nucleotide. Frecvența unor astfel de evenimente care determină boli
Diferitele tipuri de repetiții în tandem sunt numite generic genetice umane este necunoscută, dar poate reprezenta nu
CAPITOLUL 2 — Genomul uman – noțiuni introductive 11
mai puțin de 1 la 500 de mutații. În plus, rearanjările între în orice încercare de a înțelege contribuția geneticii la
diferitele repetiții LINE sau Alu produse de recombinari sănătatea umană.
anormale pot fi cauza unor mutații detectate în anumite
boli genetice (vezi Capitolul 12).
Un alt tip important de ADN repetitiv observat în multe TRANSMITEREA GENOMULUI
regiuni diferite ale genomului este alcătuit din secvențe Bazele cromozomiale ale eredității constau în copierea geno
duplicate, deseori, cu un grad de conservare foarte ridicat. mului și transmiterea sa de la celula mamă celulelor fiice în
Duplicațiile care afectează segmente cromozomiale impor timpul diviziunii celulare și de la o generație la alta în timpul
tante, numite duplicații segmentare, pot avea sute de kb și reproducerii, când copiile individuale ale fiecărui părinte se
reprezintă cel puțin 5% din genom. Atunci când regiunile întâlnesc la noul embrion.
cromozomiale duplicate conțin gene, rearanjările între sec Pentru realizarea acestor forme asemănătoare dar dis
vențele genomice duplicate pot duce la deleția sau duplicația tincte de transmitere a genomului există două tipuri de divi
unei regiuni ADN ( respectiv, a genelor) fiind cauza unor ziune, mitoza și meioza. Mitoza este diviziunea caracteristică,
boli genomice (vezi Capitolele 5 și 6). obișnuită, a celulelor somatice prin care organismul crește,
diferențiază și asigură regenerearea tisulară. Prin diviziune
mitotică, din celula inițială, de obicei rezultă două celule
VARIABILITATEA fiice, fiecare având numărul de cromozomi și informația
GENOMULUI UMAN genetică identice cu ale celulei inițiale (celula-mamă). Se pot
produce zeci sau chiar sute de mitoze succesive într-o linie
După finalizarea secvenței de referință a genomului uman, celulară somatică. Spre deosebire de mitoză, meioza se
atenția a fost îndreptată spre descoperirea și catalogarea produce numai în celulele germinale. Meioza are ca rezultat
variațiilor de secvență între indivizi diferiți (incluzând atât formarea celulelor reproducătoare (gameți) fiecare având
indivizi sănătoși cât și pe aceia cu boli diferite) și între doar 23 de cromozomi: câte unul din fiecare pereche de
populații diferite din întreaga lume. După cum se va autozomi și un gonozom, fie un X sau un Y. De aceea, în timp
prezenta în detaliu în Capitolul 4, există multe zeci de ce celulele somatice sunt diploide (diploos, dublu) sau 2n
milioane de variații de secvență comune care sunt obser complementul cromozomial normal (46 de cromozomi),
vate cu o frecvență semnificativă în cadrul uneia sau mai gameții sunt haploizi (haploos, simplu) sau n (23 de cromo
multor populații; orice persoană are cel puțin 5 milioane zomi). Erorile diviziunii celulare pot produce anomalii cro
de astfel de variații de secvență. În plus, există nenumărate mozomiale de număr sau structură în celulele fiice, atât în
variante foarte rare, multe dintre acestea fiind observate celulele somatice cât și în cele ale liniei germinale, care, de
doar la una sau câteva persoane. De fapt, dacă luăm în regulă, au consecințe clinice importante.
considerare numărul de indivizi ai speciei noastre, practic
este de așteptat ca fiecare pereche de baze a genomului să fie
diferită la o anumită persoană într-un anumit loc din lume. Ciclul celular
Din acest motiv, secvența inițială a genomului uman este Ființa umană își începe dezvoltarea de la ovulul fecundat
considerată o secvență de „referință“ pentru specia noastră (celula ou sau zigot), o celulă diploidă care va produce prin
dar, în realitate, nu este identică cu secvența genomică a zeci sau chiar sute de mitoze succesive toate celulele corpului
niciunei persoane. (cifră estimată la circa 100 de miliarde). Evident, mitoza este
Conform estimărilor inițiale, două persoane selectate esențială pentru creștere și diferențiere, dar reprezintă doar
aleatoriu ar avea secvențe identice într-un procent de 99,9% o mică parte a ciclului celulei. Perioada dintre două mitoze
sau, cu alte cuvinte, un genom individual ar avea două succesive se numește interfază și este faza în care celula își
variante diferite (alele) ale secvenței genomice umane în petrece cea mai mare parte a ciclului său de viață.
aproximativ 3-5 milioane de poziții, cu baze diferite (ex. T După finalizarea mitozei, celula intră într-o fază numită
sau G) în copiile maternă și paternă moștenite pentru acea G1, în care nu are loc sinteza ADN (Fig. 2-8). Unele celule
poziție secvențială particulară (vezi Fig. 2-6). Deși multe trec prin această fază în câteva ore; altele pot rămâne timp
dintre aceste diferențe alelice implică doar o singură îndelungat în faza G1 zile sau chiar ani. De fapt, unele tipuri
nucleotidă, o mare parte a variației constă în inserții și deleții de celule, cum ar fi neuronii sau eritrocitele, nu se mai divid
(de regulă) ale unor secvențe nucleotidice scurte, variații ale deloc când sunt complet diferențiate și rămân permanent
numărului de copii ale elementelor repetate (inclusiv gene) într-o fază numită G0 („G zero“). Alte celule, cum ar fi hepa
sau inversii în ordinea nucleotidelor unei secvențe dintr-un tocitele, pot intra în faza G0, dar dacă se produc leziuni
anumit locus din genom (vezi Capitolul 4). hepatice, celulele revin în faza G1 și își continuă ciclul celular.
În prezent se știe că proporția din genom implicată în Ciclul celular este monitorizat de o serie de puncte de
variația genomică este mult mai mare decât cea estimată control care determină cronologia (succesiunea) fiecărei
inițial și reprezintă circa 0,5% între două persoane selectate etape a mitozei. În plus, aceste puncte de control monitorizează
la întâmplare. După cum se va explica în următoarele capi și verifică acuratețea sintezei ADN, precum și asamblarea
tole, fiecare dintre aceste tipuri de variații poate influența minuțioasă a unei rețele de microtubuli care facilitează
funcția biologică și, prin urmare, trebuie luate în considerare deplasarea cromozomilor atașați de filamentele ei. Dacă sunt
12 THOMPSON & THOMPSON GENETICĂ MEDICALĂ
Inițierea mitozei
Faza S Centrozomi
Interfaza
Celule în G2
Cromatina
decondensată Profaza
Citokineza
Telofaza Prometafaza
Anafaza Metafaza
Microtubuli
Figura 2-9 Mitoza. Sunt reprezentate numai 2
perechi de cromozomi. Pentru detalii suplimen
tare, consultați textul.
14 THOMPSON & THOMPSON GENETICĂ MEDICALĂ
Meioza
Meioza, procesul prin care celulele diploide dau nastere
gameților haploizi, este un tip de diviziune celulară specifică
celulelor germinale. Spre deosebire de mitoză, meioza constă
într-o singură replicare a ADN urmată de două diviziuni
celulare succesive și segregare cromozomială (vezi meioza I
Figura 2-10 Preparat citogenetic obținut dintr-o cultură de limfocite și meioza II din Fig. 2-13). Așa cum se prezintă în această
și colorat cu tehnica de bandare Giemsa (benzi G). Nucleul întunecat carte și este ilustrat în Figura 2-14, desfășurarea globală a
adiacent cromozomilor etalați aparține unei alte celule aflată în
evenimentelor din meioza masculină și cea feminină este
interfază, atunci când materialul cromozomial este răspândit în întreg
nucleul. Vezi Surse și mulțumiri. aceeași; cu toate acestea, momentul de debut al gametogene
zei diferă la cele două sexe și va fi descris detaliat mai târziu
în acest capitol.
Meioza I se mai numește și diviziune reducțională deoa
rece numărul de cromozomi se reduce la jumătate prin
nivelul constricției primare, o zonă de îngustare a croma împerecherea omologilor în profază și segregarea lor în
tidelor cromozomului determinată de formarea kinetocoru celule diferite în anafaza meiozei I. Meioza I este, de aseme
lui. Centromerul este recunoscut ca un reper citogenetic care nea, remarcabilă pentru că în această etapă se produce
divide cromozomul (cromatida) în două brațe: un braț scurt recombinarea genetică (numită și crossing over-ul meiotic).
numit p (de la petit) și un braț lung sau q. În acest proces, așa cum se arată pentru o pereche de cro
Figura 2-10 prezintă o celulă în prometafază ai cărei cro mozomi în Figura 2-14, segmente omoloage ale ADN-ului
mozomi au fost colorați cu metoda de colorare Giemsa sunt schimbate între cromatidele non-surori ale fiecărei
(benzile G) (vezi și Capitolul 5). Fiecare pereche de cromo perechi de cromozomi omologi, asigurându-se că niciunul
zomi prin colorare evidențiază un model caracteristic de dintre gameții rezultați în urma meiozei nu vor fi identici
benzi alternative, luminoase și întunecate, (benzi G) care se între ei. Consecințele teoretice și practice ale recombinării
corelează, în mare măsură, cu caracteristicile secvenței ADN sunt considerabile pentru multe aspecte ale geneticii și gen
subiacente, cum ar fi compoziția de baze (procentul perechi omicii umane și sunt rezumate în tabelul de la sfârșitul
lor de baze, GC sau AT) sau distribuția elementelor ADN acestei secțiuni.
repetitive. Prin aceste tehnici de bandare, toți cromozomii Profaza meiozei I diferă de profaza mitotică prin mai
pot fi individualizați și se determină natura multor anomalii multe aspecte care au consecințe genetice importante,
numerice și structurale, așa cum se prezintă detaliat în Capi deoarece cromozomii omologi trebuie să se asocieze și să
tolele 5 și 6. facă schimb de informație genetică. Unul dintre stadiile
Deși, deseori, experții pot analiza direct cromozomii timpurii, numit zigoten, are un rol esențial deoarece cro
metafazici la microscop, procedura uzuală presupune sepa mozomii omologi încep să se asocieze pe toată lungimea
rarea (decuparea) cromozomiilor dintr-o imagine digitală lor. Procesul de împerechere meiotică, sau sinapsis, este
sau microfotografie ordonându-i apoi în perechi conform adesea corect și aliniază secvențele ADN omoloage în
unor criterii standard (Fig. 2-11). Setul complet de cromo perechea de cromozomi. Cromozomii omologi, denumiți
zomi este numit cariotip. Acest termen este, de asemenea, acum cromozomi bivalenți, sunt menținuți împreună de
folosit pentru a se face referire la setul cromozomial standard o structură proteică cu aspectul unei panglici, numită
al unui individ („un cariotip normal de bărbat“) sau la o complex sinaptonemal, care este esențial pentru procesul
specie („cariotip uman“). Astfel, „cariotiparea“ este procesul de recombinare. Odată ce sinapsa este formată complet,
de obținere a cariotipului standard. recombinarea meiotică se produce în timpul stadiului de
Spre deosebire de cromozomii colorați observați la micro pahiten, după care complexul sinaptonemal se
scop folosind preparate cromozomiale sau în fotografii, dezintegrează.
CROMOZOMII DE SEX
Figura 2-11 Cariotipul unei persoane de sex masculin, colorat cu tehnica Giemsa (benzi G). Cromozo
mii corespund prometafazei și sunt aranjați într-o ordine standard în care apar numerotați de la 1 la 22 în
ordinea mărimii, cu cromozomii X și Y aranjați separat. Vezi Surse și mulțumiri.
Metafaza
Decondensarea
înaintea următoarei
interfaze
Interfaza
nucleară Cromatină Profaza
decondensată
Condensarea la
începutul mitozei
Replicarea cromozomilor
Interfaza
Profaza I
Meioza I
Meioza I
Meioza II
Metafaza I
Metafaza II
omologi se asortează independent (recombină) una față de Secvențe ADN Secvențe ADN
alta, astfel încât seturile de cromozomi originali paterni și de la bunic de la bunică
materni se distribuie în combinații cromozomiale aleatorii.
Numărul de combinații posibile dintre cele 23 de perechi de
cromozomi care pot fi prezenți în gameți este de 223 (mai
mult de 8 milioane). Cu toate acestea, datorită procesului de
recombinare, variația materialului genetic transmisă de la
Cromozomi
părinți la copil este de fapt mult mai mare decât această cifră. paterni
Ca rezultat, fiecare cromatidă conține, de obicei, segmente
derivate din ambii cromozomi ai fiecărei perechi de
GAMETOGENEZA ȘI Spermatogonie
46,XY
FECUNDAREA LA OM
Celulele germinale care suferă meioze (spermatocite primare
și ovocite primare) provin din zigot printr-o serie lungă de
mitoze succesive produse anterior inițierii meiozei. Gameții
masculini și feminini au istorii diferite, caracterizate prin Spermatocit
primar
modele distincte ale expresiei genice care reflectă originea 46,XY
dezvoltării lor ca embrion XY sau XX. Celulele germinale
umane primordiale pot fi recunoscute în a patra săptămână
de dezvoltare în afara embrionului propriu-zis, în endoder
mul sacului vitelin. De acolo migrează în timpul săptămânii Meioza I
a șasea până la creasta genitală și se asociază cu celule soma
tice pentru a forma gonadele primitive, care se diferențiază Spermatocite
secundare
ulterior în testicule sau ovare, în funcție de constituția cro
mozomilor sexuali ai celulelor (XY sau XX), după cum se 23,X 23,Y
prezintă în detaliu în Capitolul 6. Meioza este prezentă atât
în spermatogeneză cât și ovogeneză, dar există diferențe de
Meioza II
Meioza I
ulterioară. Autozomii și cromozomii X de la femeie nu
Oprit în profaza I
prezintă, de obicei, dificultăți în acest sens; dar ce se întâmplă până la maturitate
cu cromozomii X și Y în timpul spermatogenezei? Deși cro sexuală
mozomii X și Y sunt diferiți și nu sunt omologi în sens strict,
ei au segmente identice, relativ scurte, la capetele brațelor
scurte (Xp și Yp) și, respectiv, brațelor lungi (Xq și Yq) (vezi
Capitolul 6). Împerecherea și crossing-over-ul se produc în Ovocitul secundar
ambele regiuni în timpul meiozei I. Aceste segmente omo
Fusul de
loage sunt denumite regiuni pseudoautozomale pentru a diviziune meiotic
reda comportamentul lor de împerechere și recombinare
Primul globul polar
similar cu cel al autozomilor, în ciuda faptului că sunt pe
cromozomi sexuali diferiți.
Ovulație
Ovogeneza
Meioza II
PROBLEME
1. Pentru un anumit locus, o persoană poate avea două alele, A și a. a. La specia umană, la sfârșitul meiozei I, câți cromozomi are
a. Ce alele vor fi prezente în gameții acestei persoane? o celulă? Câte cromatide?
b. Când segregă A și a (1) presupunând că între locus și cen b. La sfârșitul meiozei II, câți cromozomi are o celulă? Câte
tromerul cromozomului nu are loc crossing-over-ul? (2) dar cromatide?
dacă între locus și centromer se produce un crossing-over? c. Când se va reface numărul diploid de cromozomi? Când
2. Care este principala cauză a anomaliilor cromozomiale se va reface structura tipică bicromatidică a cromozomului
numerice observate la om? metafazic?
3. Ignorând crossing-over-ul, știut fiind rolul său în creșterea 5. Analizați Figura 2-7 și estimați numărul de gene la un milion
variabilității genetice, calculează probabilitatea ca toți cromo de perechi de baze pentru fiecare din cromozomii 1, 13, 18,
zomii tăi să fie transmiși de la bunicul matern sau bunica 19, 21 și 22. Dacă cromozomii 18 și 19 suferă câte o anomalie
maternă. Ai putea fi bărbat sau femeie? cromozomială de dimensiuni egale care dintre acestea ar putea
4. Un cromozom care intră în meioză este alcătuit din două avea un impact clinic mai sever? Dar dacă ne referim la cro
cromatide surori fiecare dintre acestea fiind formată din câte mozomii 21 și 22?
o singură moleculă ADN.